4C23A

L-fuculose kinase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
473
structure length
473
Chain Sequence
LVPRGSHEAVLAIDLGATSGRAIVGYLSENKLVMEEINRFSNLPIRVKGHLSWDIDFLLAKILESIRLANTSYKILSIGIDTWGVDFGLIDNEGKLLLQPVHYRDERTKGVLKEISEMTELEKLYSETGNQIMEINTLFQLFKARQESPDSFYKTNKILLMPDLFNYLLTGKFATEKSIASTTQLFDPRSQNWNQNILKLFELDSSLLPEIVSEGNVLGRIKEEYGLGDIPVVNVCSHDTASAIVSVPKTEGSLFISSGTWSLVGVELTSPILTTESFSYGFTNEVGKDGVITFLKNCTGLWIIEELRRSFERRGKAYSFDDIRTMVEKEKENLPLIDTESTEFATESDMHKTLTEYLAYHHETREWTDGQLFKIVYESLAETYRKAIELLEELTHKVYKRIYVIGGGARASYFNQMIADRTGKEVLTGLTEATAVGNIVVQLIAMGQLKGMEEAHHVIEEFLQLESYYSQKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and Functional Analysis of Fucose-Processing Enzymes from Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords L-FUCULOSE KINASE FUCK
molecule tags Transferase
source organism Streptococcus pneumoniae
total genus 167
structure length 473
sequence length 473
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.51: L-fuculokinase.
pdb deposition date 2013-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A02
2CGJA 3LDLA 3MDQA 4B1XB 3I33A 5E26A 2V51B 2YJFA 1OKJA 3H1QA 3SJHA 1TYQA 3H1VX 1HKCA 4WYBA 3H45C 4O5FA 1E4FT 4XH5A 2A42A 1LCUA 4H5NA 4PKIA 3CJ9A 4I6MB 4A2AA 4XH1A 4BGBA 1SQKA 2ZWHA 4EIAA 4BRDA 3VF2A 1HKBA 2ZGYA 3I8BA 4FWSA 3O8MA 4RWTA 3VF6A 4BRMA 2IVOA 3HM8A 2ASMA 4JHDA 4HWIA 1DGKN 5AQZA 3O08A 4M7XA 2E2NA 2P9KA 3SK3A 1MWMA 5EOYA 3BF3A 1MDUB 5EX5A 3M1FA 2E2OA 4B1VA 1U2VA 1GLFO 1C0FA 4WQ4A 3WQTA 1QZ5A 3VEVA 3D2FA 3FZKA 4H0VB 2ASOA 3G25A 1H1VA 1NBWA 3CJBA 3U8XA 4CZFA 3L4IA 4MLEA 4KBOA 1X3MA 4BVPA 3MN7A 1K8KB 3MMVA 5F0XA 4BG9A 3SMSA 5BPMA 5AFUA 3M6GA 4AM7A 4BRNA 3ID8A 2E2QA 1BG3A 1BUPA 1GLEG 4H0OA 5KPTA 2CGKA 2D1KA 4CZEA 2GTDA 3ZX0A 2Q36A 3C7NB 4PKHA 3TPQA 4GNIA 3WEEA 3CHWA 3HZ6A 2YHYA 5I9EB 2AA4A 3O4WA 3VF4A 3A5OC 3UKRA 1ZBSA 4FO0A 3WXIA 5BR9A 5E84A 2P9PA 1T44A 5BRDA 2CGLA 1NGCA 2IIRA 4BQLA 4CZIA 3H46O 4JD2B 4B1ZA 4CZMA 2QWMA 5BPNA 1KAYA 5LJWA 1TUUA 1HJOA 2P9NB 3CQXA 1NGAA 2VCPA 5AQNA 4DQ8A 3VOVA 1KXPA 3JXUA 2ASPA 2FXUA 3JS6A 5AQPA 1NGDA 3CIPA 1JCEA 1SZ2A 3ZX3A 2GWJA 1S22A 3WT0A 4BG8A 2J4RA 2FF6A 1KAXA 1WUAA 4CZJA 2GELA 3SLCA 3GL1A 4H03B 3VGLA 3S41A 5AQJA 2D4WA 1GLAG 4BC2A 3VERA 2YI1A 1QHAA 4BRPA 4XEIA 3B8AX 1BU6O 3J8AA 2P9SB 4BRCA 4CZLA 3WQUA 1NMDA 4WQ5A 4H5WA 1GLBG 2A6AA 2P9IA 4YDUA 5FPDA 3QICA 4CZKA 3CJ7A 5AZIB 1NGEA 4IWVA 3FZHA 4B9QA 3P4IA 4BROA 4K25A 5AQGA 4IJAA 4EFHA 1X9JA 1CZAN 2FSNA 4BC4A 3A5MC 2W40A 3FZMA 3VGMA 3W3DA 1QQNA 1K8KA 4H0XB 2ZGZA 3LL3A 4BRHA 3A0IX 4CI6A 1U6ZA 4A2BA 4MLHA 3UKUA 4BRLA 2A3ZA 2V52B 3WXKA 3FE1A 4JN4A 3C7NA 5EY4A 4E1JA 2YCHA 1NGBA 3LM9A 2FSJA 1V4TA 3FFKB 3A5LC 2QWQA 4H5VA 1TUYA 2QWLA 2QXLA 3CJAA 2W41A 3D2EB 4BR5A 2QWRA 3O5BA 4O8KA 4CBUA 1HX1A 3ZEUB 3FGUA 2Q31A 3CJ1A 5ADXH 1X3NA 4EAHD 5BRHA 3DXKB 2P9NA 4FWLA 4BRFA 4CZGA 3CJCA 3HSCA 1JCFA 5AQWA 3H3NO 3UB5A 3RSEB 1HKGA 2Q0RA 2FLOA 5JICA 4BR4A 3A8YA 1JCGA 5JMVA 1HPMA 3CI5A 4H5TA 4H0YB 3M3ZA 2P9LB 1E4GT 2P9SA 1RGIA 3O1BA 5KQ8A 5AQXA 3EL2A 4FWOA 3DJCA 3VENA 3QDKA 4BRQA 1NM1A 5TKYA 2Q0UA 3KZBA 5F1XA 2E88A 3ULEB 5AZIA 5BPLA 1GLCG 1NGHA 1HLUA 2EWSA 4QS9A 5KQDA 2H3GX 4EHUA 2F9WA 2QM1A 4IO8A 1HUXA 1S3XA 2FSKA 1GLLO 4L3QA 3U9DA 4JAXA 5CE3A 3L0QA 4K42A 2NLXA 3BEXA 3SMPA 2KHOA 1IJJA 1YAGA 3MN5A 1J6ZA 3OHRA 3AAQA 5AQVA 3VPZA 3ENOA 4IXCA 2VYPA 4BREA 4C23A 3GBTA 2UYTA 3WXJA 3DWLA 4ISEA 1XQSC 3FZLA 1P8ZA 4I6MA 4BVOA 4JHDB 3EZWA 4JNEA 1MA9B 4BRKA 5JLFA 3ATVA 3O6WA 2A5XA 3D2EA 1NLVA 5ELZA 1IG8A 4FWNA 2Q97A 5KPZA 1U2VB 4K43A 3ZEUA 1SAZA 4B1WB 3QFPA 5AR0A 3KVGA 3LDOA 3ENHA 3VETA 4K41A 2Q2RA 3DXKA 3VEZA 4PL7A 5LY3A 4XH4A 3DAWA 1YXQA 4DHYA 5AQHA 4BR2A 2ZF5O 1R59O 1QQOA 3VGKA 4BRGA 3UE5A 3WUHA 1ATRA 4F9OA 4LC9B 2E2PA 2VWBA 4BGAA 4IZ9A 5AQIA 3EKUA 4QS7A 3EN9A 2P9LA 5F2RA 3R8EA 3DXMB 3ZETB 5AQQA 5BREA 5LJVA 3IDHA 3IUCA 3LDPA 4RTFD 2CH6A 3O1WA 3AARA 3UKRB 4FWMA 4CBXA 2CH5A 2D0OA 2A40A 2HF3A 3MK6A 2ITMA 2DPNA 5AQMA 3ULEA 5EVZA 4A62A 3LM2A 2P9PB 4FWPA 3VEOA 2PAVA 4M7YA 4GY2B 1NGIA 1Z05A 5ADXA 1C0GA 4B1UB 2E20A 1LOTB 3L6QA 4JD2A 4NB4A 4FL9A 3F9MA 3CQYA 1GLDG 1NWKA 2I7PA 1BOTO 3LDQA 5AQSA 3W0LA 4BRIA 2PBDA 2Q1NA 3MN9A 4M63C 3AY9A 3CERA 3TU5A 5AZJB 3VEYA 1MWKA 2YHWA 3HTVA 2NZTA 3HI0A 2YHXA 2HMPA 4WQ5C 4FPAA 3CETA 5AQYA 1KAZA 1YVNA 1T6DA 2QWNA 4YDUC 4H5RA 5BN8A 5FPNA 1BDGA 4BR9A 2P9IB 3H6EA 5JLHA 5AQKA 1Z6RA 4H0PA 4B1YB 4BR7A 3QMLA 1NGGA 5EXWA 5KPRA 2P9UB 3GOIA 2NRHA 3U4LA 2E1ZA 4FWQA 2AP1A 2QW9A 3GE1A 2WUSA 4Y0WA 1ZXOA 5AQFA 4FWKA 4DCHA 3IMXA 3MCPA 1NGJA 4CJ7A 3VESA 3FLCO 2HF4A 4EHTA 2OANA 4J8FA 3BP8A 3QBXA 4ISGA 4BC5A 2V7YA 4CD1A 2F9TA 3QB0A 1ESVA 1TYQB 5AQLA 3ATUA 4HTLA 5AFUH 3UKUB 3ZX2A 2BUPA 1RFQA 4IJNA 5AQRA 4BR0A 3DXMA 3ZETA 5BRFA 4AM6A 3EKSA 4FWRA 2GEMA 3VEWA 2GUPA 1DEJA 1G99A 5FPEA 3C0BA 3VEXA 2QWOA 2E1YA 2E8AA 4CZHA 1ATNA 3O80A 3GG4A 3HBTA 4FOEA 4RCHA 2P9KB 3FZFA 5FPMA 1BO5O 5AQTA 1Q18A 4MO5A 3EO3A 3LDNA 4BRAA 5AQUA 4WQ4C 3R9PA 2HOEA 1DKGD 2YJEA 3U9ZA 3FR0A 1QZ6A 3D2FB 4A61A 1XC3A 1RDWX 4BQZA 1ZC6A 2IVNA 3A5NC 4PL8A 4FSVA 4Z94A 4CBWA 4DB3A 5AZJA 1GLJO 3RSEA 1D4XA 2D0PA 3IFRA 2GWKA 3WXLA 4ISFA 1Y64A 1EQYA 1NGFA 4FPBA 4QS8A 4BC3A 1QQMA 3BF1A 3H3OB 4H0TB 1T6CA 3R6MA 2A41A 4MO4A 4NO7A 5B8HA 2IVPA 1BA1A 3WEEB 1V4SA 1BWFO 2P9UA 2V7ZA 1YUWA 1ATSA 2I7NA 3QFUA 5AQOA 3KHYA 4PKGA 4CD3A 2QWPA 3AAPA 3GDQA 3QBWA 3BUZB 3MN6A 3D7EO 2BTFA 1XUPO 4FOIA 1WOQA 1BA0A 2FF3B 5BN9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2CGJA 3VQCA 3MDQA 4CFCA 4C8LA 3K5NA 2YJFA 3SJHA 1TYQA 1E4FT 2QKKA 1QE1A 1KC8O 1K73O 4XH5A 5KRSA 1IKXA 3VQ8A 4FM1A 1T03A 1EP4A 4BRDA 4CEDA 3VF2A 2ZGYA 2BE2A 3VF6A 5HRPA 1ZBFA 3HM8A 2ASMA 2HW3A 5AQZA 4MDBA 4M7XA 3Q7BA 3SK3A 5H1SQ 3UIQA 4B3SK 3M8RA 3LZJA 4DSIA 2E2OA 3S3MA 4NXMK 1GLFO 3V9UA 3NE6A 4RW4A 4IKFA 4YY3K 3G25A 3CJBA 4LF6K 3L4IA 1RBVA 4KBOA 4E7HA 1RT1A 3RRGA 1X3MA 1FKOA 4KB0A 4GKJK 3ZYYX 2LSNA 3SYZA 4GMJB 3G71N 2IGIA 3M6GA 2O8DA 1I3AA 1BIUA 1BG3A 1GLEG 2ATQA 3S3NA 1SKSA 4H0OA 5KPTA 2CGKA 2X6NA 3ZX0A 3KLHA 4GNIA 1JLFA 3RMBA 3HZ6A 4CF8A 2AA4A 3O9RA 3KJVA 4JYAK 3VF4A 3A5OC 1C1BA 3UKRA 2NRXA 2RF2A 1JL1A 4BACA 4IOAL 4JI1K 3R3LA 5SWMA 3P31A 3HOSA 2B4JA 2QEXN 4BQLA 1BCOA 3DRSA 4KH6A 4O4GA 2F8TA 2IAJA 4JKDA 3OY9A 4JI5K 1KAYA 4KV8A 5LJWA 1NK8A 1TUUA 3CQXA 5AQNA 4C1NI 2VCPA 4DQ8A 1MU2A 2ZJPL 1KXPA 2FXUA 5AQPA 1S1XA 1NGDA 3CIPA 1JCEA 1SZ2A 3ZX3A 3WT0A 4CZJA 2GELA 1OVYA 5JVHL 3J80O 1JKHA 4BC2A 4DQRA 1QVFM 3MX5A 3J8AA 2P9SB 2VWJA 4I2PA 1NMDA 4Z4HA 3K2PA 4W5OA 1A5VA 1GLBG 3EE9A 2P9IA 4YDUA 1HPZA 1BQNA 3OYDA 3QICA 3CCLN 3CJ7A 3AA5X 4CEOA 2KZZA 4M41A 4BROA 1CXQA 1I94K 2ZQBA 5AQGA 5CR4A 3THWB 4DTUA 4F2RA 1XI1A 3P1GA 4BC4A 2W40A 3FZMA 3QEWA 1TAQA 4CK1A 4JV5K 1K8KA 4H0XB 1JJ2M 3NMUA 4Z4IA 4CGDA 4BRHA 5JVGL 3VQEA 2NRVA 2B6AA 1YI2N 2WONA 2OPSA 3C7NA 5EY4A 3OYIA 4M3YA 4IOXA 2FSJA 3SUQA 3KLEA 4H5VA 1TUYA 4F8RA 1VQKN 1IV0A 3EZ5A 2QWRA 4KB1A 4OLBA 3KK2A 4K8XA 1KRPA 1X3NA 1N8RO 2XY5A 2A1RA 4BRFA 1LAVA 3I55N 3T19A 1XNRK 1JLBA 1JCFA 4Q5VA 3CCRN 4X66K 1KTQA 1Q9YA 3LPTA 4BR4A 3CPWM 3PY8A 1HPMA 2O8FA 4FVUA 4H5TA 3MEDA 4DTOA 1E4GT 2OCEA 2ZJQL 5AQXA 1HYSA 4WFNL 4CECA 1NM1A 1RCHA 3HSTB 3TSUA 5HROA 3AGRA 4JKHA 4EZ9A 1HLUA 2EWSA 1KCFA 4EHUA 4CEBA 1HUXA 2FSKA 3HVRA 1IKVA 1IO2A 4K42A 3RR7A 4C8OA 5JS1A 3WNGA 5M1KA 2QA4N 3SMPA 3MN5A 4A5AA 3QIPA 4IXCA 2VYPA 3P83D 4A57A 4BREA 3PIOL 1J5OA 4F3OA 4ISEA 4DR4K 3VQ7A 4C8MA 4G9ZA 4FLWA 1XQSC 3D6RA 1EETA 4BVOA 4JHDB 4OKKA 3ATVA 3O6WA 4Y1CA 3PLAA 3P5JA 1IG8A 1NMNA 3PUFA 1VQLN 3AVHA 2OZSA 1J54A 4F3TA 3KVGA 3ENHA 4DFMA 3VETA 4DSJA 4BDZA 4DV1K 4K41A 3U3GA 1QQCA 3VEZA 1TK5A 2VQFK 3TAEA 2HHHK 3DAWA 1YXQA 3ZT4A 4CIEA 3VQ6A 5AQHA 5EU7A 1JLQA 4WCEL 4DV7K 3K5OA 4RW8A 1QQOA 1VQ7N 2UXDK 4HHTA 3QEPA 3SQ2A 4DV4K 5CYQA 4LD0A 4B3TK 3LM2A 2P9PB 3ID6A 1BIZA 3RMAA 3VEOA 2OTJN 1XHXA 2HBJA 2PZSA 4GY2B 1KVAA 1QS4A 2XO7A 2HMIA 2PY5A 4B1UB 3AV9A 4CJEA 2E20A 1LOTB 3L6QA 4JD2A 3ZSXA 1NKBA 2UXCK 4FL9A 3AO3A 2I7PA 3CQYA 3LDQA 4M3ZA 1BOTO 2PBDA 1O1WA 1NOZA 1FXXA 4M63C 4J2BA 4CJKA 3CERA 4FJ9A 2ZJRL 1N6QA 3SBTA 3HI0A 2YHXA 1OH8A 3L2UA 1ZBUA 1BI4A 5AQYA 2QWNA 4YDUC 3OA9A 4B3RK 4DTJA 1HNZK 4B1YB 1L3VA 4Z0UA 1S1UA 1X9MA 3WNHA 5BR8K 1NGGA 2QK9A 3DRPA 1VQ5N 5KRTA 3LWLA 2QW9A 5AQFA 5DMRA 4FWKA 1L5UA 4FJNA 4CJ7A 4NCGA 1SL2A 4DKWA 5LL6Z 4LFAK 4PUOA 3QERA 2KFZA 2PYJA 2F9TA 3EE8A 3QB0A 4TSXA 1TAUA 4CGJA 4MQ3A 1RFQA 4BR0A 3ZETA 5BRFA 4FWRA 3VEWA 2GUPA 1DEJA 3V1OA 3OJUA 1U48A 3IKMA 1VQON 1WSJA 1Q9XA 1ATNA 3AO2A 3VQBA 2BGGA 1KD1O 3GG4A 3OYNA 2NUBA 4FJJA 3TARA 4RCHA 2P9KB 1KLNA 1BO5O 5AQTA 3O9SA 4FLUA 4KREA 3EO3A 1NK6A 5HBMA 3TI0A 4DFPA 3VQDA 2YJEA 1C0TA 4DR1K 4BQZA 1ZC6A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1S72 N;  2P5O A;  1ESV A;  4HTL A;  3UKU B;  2BUP A;  3DXM A;  4KI6 A;  4DS4 A;  3EKS A;  2GEM A;  3LAN A;  4H4O A;  4YHH K;  3TR8 A;  1YIT N;  1QSS A;  3CPE A;  5FPE A;  3HM9 A;  4OGC A;  4BWJ A;  2Y1J A;  3C0B A;  3VEX A;  4JRQ A;  2ETJ A;  4CZH A;  4ZTF A;  2W6L A;  4OPK A;  1WAJ A;  4CEZ A;  1U47 A;  1N32 K;  4N76 A;  1Q18 A;  4DV3 K;  3EYZ A;  3IS9 A;  3ASM A;  4YOV A;  3QNN A;  4N5S A;  1QZ6 A;  3D2F B;  3HK2 A;  2PFU A;  1XC3 A;  3KTQ A;  3DLH A;  3A5N C;  4DV6 K;  2DFE A;  4FSV A;  4Z94 A;  5AZJ A;  3OYJ A;  3OBW A;  4QS8 A;  3H3O B;  3BF1 A;  4JK8 A;  3SQ0 A;  2OPP A;  4DR6 K;  3AA2 A;  3R6M A;  2A41 A;  4RG8 A;  3S3O A;  1SL1 A;  3CC4 N;  1RBU A;  1BWF O;  4LH4 A;  2GX9 A;  4DR7 K;  3OYC A;  2I7N A;  1S6P A;  4PKG A;  2ZM6 K;  3AA3 A;  4YOX A;  1DTT A;  1C0M A;  4JKC A;  3GDQ A;  3MN6 A;  4U67 L;  4I9L A;  3D7E O;  2BTF A;  4CJS A;  5BN9 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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