4C23A

L-fuculose kinase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
473
structure length
473
Chain Sequence
LVPRGSHEAVLAIDLGATSGRAIVGYLSENKLVMEEINRFSNLPIRVKGHLSWDIDFLLAKILESIRLANTSYKILSIGIDTWGVDFGLIDNEGKLLLQPVHYRDERTKGVLKEISEMTELEKLYSETGNQIMEINTLFQLFKARQESPDSFYKTNKILLMPDLFNYLLTGKFATEKSIASTTQLFDPRSQNWNQNILKLFELDSSLLPEIVSEGNVLGRIKEEYGLGDIPVVNVCSHDTASAIVSVPKTEGSLFISSGTWSLVGVELTSPILTTESFSYGFTNEVGKDGVITFLKNCTGLWIIEELRRSFERRGKAYSFDDIRTMVEKEKENLPLIDTESTEFATESDMHKTLTEYLAYHHETREWTDGQLFKIVYESLAETYRKAIELLEELTHKVYKRIYVIGGGARASYFNQMIADRTGKEVLTGLTEATAVGNIVVQLIAMGQLKGMEEAHHVIEEFLQLESYYSQKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords L-FUCULOSE KINASE FUCK
publication title Structural and Functional Analysis of Fucose-Processing Enzymes from Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 473
sequence length 473
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.51: L-fuculokinase.
pdb deposition date 2013-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A02
3GBTA 3WEEB 5JMVA 5JLHA 1GLCG 3QB0A 1T44A 5BN9A 5BR9A 5AQOA 2J4RA 3HZ6A 5AQRA 5AQVA 2D0PA 5F2RA 4AM7A 1CZAN 2QW9A 3DAWA 1YUWA 1JCGA 4BREA 4I6MB 4DQ8A 2P9KA 3ZX2A 2P9PA 2A5XA 1NGIA 2P9SB 3R8EA 1H1VA 2ASPA 1X3NA 2VYPA 4A62A 5CE3A 4CZLA 3B8AX 2ASOA 3VESA 3VGKA 3FFKB 3EL2A 1NMDA 2BUPA 3W0LA 4H03B 5FPEA 3HM8A 2HF4A 3H1QA 3HBTA 5BPNA 4BRNA 3WXKA 3UKUA 1KXPA 4B1WB 3L4IA 3HI0A 5I9EB 1QQNA 2FSNA 3H3NO 1YXQA 3VF6A 4ISGA 3WXIA 5JICA 3FZMA 1Z6RA 2I7NA 3CQXA 4QS9A 3WEEA 2V52B 4C23A 4K42A 4B1YB 1YAGA 2BTFA 2FSJA 1QZ5A 4QS8A 3D2FB 1TUUA 4WQ4C 5BRHA 2ASMA 3U8XA 2HF3A 2YHXA 3ZETB 5AQUA 4CD1A 4EFHA 3QBWA 3GOIA 2E2QA 4JNEA 3TU5A 2P9SA 3I33A 1G99A 3A5LC 5ELZA 5JLFA 3WXJA 2V51B 4ISEA 2NRHA 1WUAA 2V7YA 4IJNA 4FWKA 1KAZA 1IG8A 2E2OA 3DXKB 4FWNA 3EN9A 3FR0A 2D4WA 1IJJA 3CJ9A 4E1JA 3FLCO 3G25A 4QS7A 4WQ5C 2IIRA 4BC3A 4EHTA 1KAXA 1XC3A 2PBDA 3FZLA 2WUSA 4CZJA 3QBXA 3U9ZA 1SAZA 2YI1A 4WYBA 4J8FA 3AARA 1SZ2A 3D2FA 4JN4A 3C0BA 3GE1A 3S41A 1ATNA 1GLAG 4O8KA 2AP1A 3SLCA 1BUPA 3GL1A 5LY3A 3A5MC 3O1WA 3ZETA 1QHAA 4BR7A 1HPMA 1T6DA 2FXUA 3WQTA 3D7EO 4F9OA 2H3GX 1QQOA 3AAQA 2P9KB 3VOVA 2CGLA 5B8HA 4CBUA 4H5VA 3MN9A 5E26A 5AR0A 3C7NB 2YCHA 3DXKA 4IZ9A 4H0XB 2D1KA 4H0TB 3FE1A 3J8AA 2Q31A 1T6CA 4XH1A 1ZXOA 4XH4A 3WQUA 4Z94A 5LJWA 3UB5A 4BC4A 4NO7A 5AFUH 4KBOA 3QICA 3SJHA 3DWLA 4BC5A 3MK6A 2ZF5O 3CIPA 3D2EA 3O6WA 4JD2B 1OKJA 3VETA 4JHDA 1BA1A 3CJ1A 5AQYA 4CZGA 4BG9A 2QWPA 3O08A 1ESVA 5AFUA 4XH5A 5AQNA 3U4LA 4BR2A 3MN7A 1BWFO 4CZFA 1V4SA 2QWOA 3LDPA 1GLJO 4BRCA 5AQIA 1Q18A 2E1ZA 2A40A 4FL9A 5E84A 1TUYA 3R9PA 2ZGYA 3C7NA 1HJOA 3FZKA 3IUCA 3ZEUB 4CZIA 3IFRA 4FOIA 4M63C 4MLHA 4BR4A 2Q0UA 1KAYA 3VF4A 1S22A 5FPNA 1GLEG 1RGIA 4LC9B 4BRHA 2E88A 2QWMA 2NZTA 5AQZA 4BR9A 1DEJA 5BN8A 1X9JA 4DCHA 2P9UB 4NB4A 4FSVA 3WXLA 4BRLA 4JD2A 1XQSC 1C0FA 1Y64A 2QWRA 1ATRA 2P9IB 3HSCA 1BOTO 1JCFA 4YDUA 3O4WA 4FWMA 2A42A 5AQGA 3WT0A 1LOTB 4GNIA 2V7ZA 3ATVA 3BF3A 1NM1A 5BPMA 3VEOA 3MN5A 1QQMA 4O5FA 1BA0A 2Q2RA 3OHRA 2A6AA 3F9MA 5FPDA 4DHYA 1EQYA 4MO4A 5F0XA 5AQMA 3I8BA 3FZFA 3ZEUA 4H0OA 3LM2A 3VGLA 3LL3A 1V4TA 5BRFA 2QM1A 2FLOA 3L6QA 2Q97A 3A5NC 3CERA 1NWKA 3QMLA 4FWOA 4M7XA 2YJEA 3KZBA 4H5RA 4B9QA 4EHUA 3BP8A 3BF1A 5KQDA 1BU6O 2P9UA 5EX5A 3W3DA 1GLLO 2HMPA 1BG3A 2P9IA 4BRFA 1LCUA 2P9NB 3M1FA 3FZHA 3D2EB 2GWKA 1JCEA 1NBWA 4PKGA 4JHDB 4PKIA 4PL7A 2P9LB 4FWQA 4MLEA 1NGEA 3O5BA 1HX1A 4IWVA 5BPLA 1MDUB 5EOYA 4BGBA 4EIAA 3H45C 3H1VX 1U6ZA 3CJ7A 4A61A 3BUZB 4B1VA 4M7YA 5BREA 3RSEB 2GEMA 4FOEA 4XEIA 3U9DA 1RDWX 1MWKA 1NGCA 2E2NA 4L3QA 3IMXA 2FSKA 3WUHA 3ENHA 2FF3B 1C0GA 1XUPO 5AQTA 4CZEA 4EAHD 2Q1NA 3QFUA 4A2BA 1QZ6A 3SMPA 4MO5A 5KPZA 2Q0RA 2CH5A 3ENOA 3MCPA 3VEWA 4B1ZA 3KHYA 2CGJA 2P9NA 3VEVA 1K8KB 4CZMA 1R59O 4JAXA 2FF6A 2P9LA 3P4IA 3GDQA 4GY2B 4FWPA 2I7PA 1SQKA 5EY4A 4CBWA 2ZWHA 4CI6A 2E20A 1HLUA 2VCPA 5KPTA 1MA9B 3RSEA 3LDOA 4RWTA 1S3XA 3KVGA 2W40A 4WQ4A 4BQZA 5AQWA 3ZX3A 2GELA 1P8ZA 4CBXA 3VGMA 1NGBA 3LDNA 4K41A 2QXLA 2CGKA 4BQLA 2CH6A 1BDGA 4IO8A 5EXWA 1HUXA 4CD3A 4PKHA 3IDHA 2HOEA 2A41A 2OANA 1NGDA 2QWNA 4B1UB 2A3ZA 3ATUA 5AQPA 2W41A 4BROA 4BR0A 3M3ZA 2F9WA 1BO5O 3JXUA 4K25A 4BVOA 5AZJA 2QWLA 4H0PA 2E8AA 4B1XB 1K8KA 1D4XA 2VWBA 3VPZA 1GLBG 3MN6A 3VERA 4WQ5A 3MMVA 1MWMA 4BRIA 4BGAA 4CJ7A 3DXMA 2DPNA 1J6ZA 3AY9A 2GUPA 3EKUA 3CI5A 4BRGA 3EZWA 3ID8A 4H5TA 5F1XA 1ZBSA 4FO0A 3ULEB 4CZKA 1NGAA 1HKCA 3CJBA 2AA4A 3R6MA 3CJCA 3SK3A 5AQLA 1TYQB 4BVPA 3A0IX 5TKYA 2IVPA 3CHWA 3VEZA 1NGHA 5AQSA 3HTVA 3O1BA 1HKGA 2D0OA 3JS6A 4A2AA 3LDLA 5AQHA 1GLDG 4I6MA 1DKGD 3SMSA 3VENA 2UYTA 2GTDA 3H3OB 1NGJA 3BEXA 2IVNA 3EKSA 1GLFO 4FWLA 5AQKA 2ZGZA 5AZIB 4ISFA 5AQFA 5BRDA 3H46O 3M6GA 3ULEA 2YHWA 2E2PA 2NLXA 3ZX0A 4BG8A 2QWQA 5AQXA 2ITMA 3VEYA 1ZC6A 5AQQA 3UKRB 4DB3A 4YDUC 1U2VB 3A8YA 3VEXA 5LJVA 4PL8A 3CJAA 1NGFA 4BRAA 1TYQA 1NLVA 4BRPA 3UE5A 5AQJA 3GG4A 4FPBA 1HKBA 4Y0WA 5EVZA 4IXCA 3CQYA 3L0QA 3QFPA 2PAVA 3QDKA 3O8MA 3MDQA 5FPMA 3A5OC 2KHOA 4RTFD 4H0YB 2GWJA 2E1YA 2F9TA 3TPQA 1NGGA 4FWSA 4AM6A 4FPAA 3O80A 4HTLA 4BC2A 1X3MA 3LDQA 4H0VB 1WOQA 5AZJB 5ADXH 4FWRA 5AZIA 2P9PB 1RFQA 5KPRA 1E4GT 3DJCA 2YJFA 4BRQA 3DXMB 2YHYA 1Z05A 4BRDA 3LM9A 1YVNA 1ATSA 3CETA 3FGUA 4BRKA 4H5WA 4RCHA 5ADXA 3H6EA 3UKRA 3VF2A 4H5NA 4BR5A 1U2VA 4CZHA 5KQ8A 3UKUB 4K43A 2Q36A 3EO3A 4BRMA 3AAPA 1E4FT 4IJAA 4HWIA 2IVOA 2EWSA 1DGKN
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3GBTA 1K6YA 3O9QA 3NF6A 3MCAB 5JLHA 3QB0A 4FLYA 5LL6Z 4ILGB 4B3OA 1DTTA 3OVNA 2VG5A 2O8DB 3ISNC 2O8CA 4OJRA 4KHNA 2D0PA 5DMRA 2VG7A 3PUFA 3U3YA 4CF8A 2QW9A 3DAWA 3NHGA 4MFBA 4BREA 4IO9L 4O55A 3HYFA 1HMVA 3SAHA 3NF8A 2LSNA 1X3NA 4FJXA 3OJSA 2HBLA 4IG3A 2ASOA 1RBTA 2YNHA 3NFAA 3VESA 3MEDA 3N4QA 1JXEA 3AVMA 2YHAA 3EE9A 4CE9A 4E0DA 4B1WB 5KRSA 2FSNA 3H3NO 2YHBA 3THWB 1VQMN 4QS9A 2V52B 4CGDA 4PWDA 4C23A 4A59A 3EEQA 3PV8A 1D9FA 3MWTA 1TAUA 3C6TA 1BL3A 3PY8A 5TKWA 1QZ5A 3G4SN 3HSTB 4CEAA 3O4QA 4MDAA 3T69A 3U8XA 2YHXA 3ZETB 4CD1A 4EFHA 1ZBLA 4E7JA 4O0JA 4B9LA 1RT7A 3I33A 1EWRA 5FRMA 3A5LC 4Z4GA 3SPYA 4FJ5A 1N36K 4ISEA 2NRHA 2V7YA 5DK5A 4IJNA 3ULDA 3DXKB 1HNWK 1CXUA 3ZT3A 3K0SA 2HHVA 3CJ9A 4FJIA 3G25A 3OW2M 5C25A 5CZ1A 4DR2K 1KAXA 3K9JA 1TKDA 2HNYA 4YOXA 2FBXA 4CF9A 3T3FA 1RDCA 1SAZA 4J8FA 4CFBA 3D2FA 1NK5A 4FVUA 1KFDA 3GE1A 4PHTX 1L3SA 4M42A 4O8KA 4YOUA 1BUPA 4CJTA 2VGNA 2G8WA 3A5MC 3PIPL 3DLRA 3J7AP 3ZSZA 1T6DA 4F9OA 3VQ6A 3QERA 4JI5K 1JLFA 1S1XA 4PQUA 1YTAA 3TR8A 3C6UA 1N34K 3AVKA 3ZSVA 3ZT2A 4H5VA 2OA8A 2BDPA 3KLGA 4IZ9A 3HPOA 3NGIA 4CEBA 2OTJN 3J8AA 4XH1A 1UAXA 2HBKA 1SS6A 3R3LA 1Q86O 1RTHA 3SJHA 4NYFA 3B6OA 3D2EA 3O6WA 1OKJA 2Z1GA 1BA1A 2W42A 2YKNA 4CZGA 4BG9A 1ILYA 3K2PA 1ESVA 5D3GA 2WFBA 2ZD1A 3SUPA 3VQBA 5AQNA 3QEVA 3RR8A 2BH1A 3LZIA 1WNSA 1SL2A 4CZFA 1VQ9N 3QLHA 2QWOA 1Q18A 1HYZA 2NRZA 2A40A 4CF0A 4IOXA 3A2FA 1BQMA 1SUQA 2ITGA 3P5JA 4JEPA 1Z26A 4FZXC 4V19S 3T1AA 3G0ZA 3TAQA 1K9MO 4OPKA 3FZKA 3PSIA 4CHQA 4FOIA 3NH1A 4DTPA 4MLHA 3VF4A 3HO1A 2P5GA 4RW9A 4JRQA 2UXCK 3AO2A 4JLHA 4IFEA 1RGIA 4U67L 3K5MA 1KVCA 2E88A 4CJFA 2QWMA 1DEJA 5BN8A 4LH4A 3NVKA 3AVJA 4N76A 3WXLA 1T3VA 1BQNA 4Z4CA 2QWRA 1ATRA 2WONA 2P9IB 2YKMA 3RRHA 4JS4A 3VQ4A 1DLOA 4B3RK 4AHVA 1FW6A 3H08A 4DTMA 2A42A 1EO1A 3WT0A 4B9TA 1ZBIA 3L2UA 4ELVA 5C0YA 3J80O 3O9RA 3QNOA 2Q2RA 3OYHA 3TANA 3OS0A 2D0CA 4DHYA 4MO4A 1YHQN 1VSFA 3T7ZA 3FZFA 3SV4A 3CC4N 3NMUA 3VGLA 2FLOA 4Z4HA 2Q97A 4HTUA 3K5NA 1CZBA 1NWKA 3SYZA 4M7XA 1B9FA 2YJEA 5FLXO 1ASUA 3QEIA 1RT4A 4EHUA 2P9UA 1EKEA 5HROA 2X6SA 3MX5A 2NRTA 5FRNA 3KLHA 3NDKA 2HMPA 3VQQA 1KFSA 2GUIA 4R79A 4FLUA 3D2EB 2GWKA 1NBWA 1XMOK 3TTDA 4Z4EA 4PKIA 2FBYA 1RTJA 1X1PA 1KD1O 3V6DA 4CJKA 3VQ5A 1NK4A 1MDUB 5BR8K 1U6ZA 2D0BA 1EXQA 1W2BM 4CCHA 4B1VA 1L5UA 3DM2A 3RSEB 4C8MA 5J2NA 1QSSA 4FOEA 1ZBUA 3PX4A 3AVLA 4JKEA 3DLHA 4K8XA 4EP4A 3G10A 3T1HK 4WFBL 2G8UA 3WUHA 3ENHA 3TTFA 3CXCM 4ZHRA 4CZEA 3NAEA 3ZSXA 1OH5A 3SMPA 1K8AO 4CEEA 2Q0RA 3VEWA 4CF2A 2OYQA 4AHRA 3KHYA 3VEVA 1K8KB 2F96A 4JAXA 4FWPA 2I7PA 3HOSA 5EY4A 3OJUA 3I0SA 3OBYA 4ILHA 2Z1IA 4CI6A 4CHOA 4FJLA 4CJSA 4GVEA 5H1SQ 5HP1A 2VGMA 1MA9B 3AA4A 2FC0A 2W40A 4KAZA 1IBMK 1XNQK 5CHIA 3QESA 3ZX3A 3BZCA 3VGMA 2F8SA 3LDNA 4FLVA 5I3UA 4KHUA 4FZYA 4C8NA 2A41A 4F2SA 1NGDA 3QEPA 2A3ZA 3QIOA 4CJQA 1O1WA 4BVOA 4I2PA 5AZJA 1NKBA 2RHKA 1Q7YO 2E8AA 4B1XB 4Q5VA 1HNIA 3OYIA 1QVFM 4JKGB 4WQ5A 4Q0BA 1EETA 4ID1A 3OYAA 2GUPA 1UA1A 3EZWA 4IDHA 4GV9A 4H5TA 4FO0A 3CJBA 3DLEA 1FKOA 4JI3K 3SCXA 4NCAA 4FJNA 2NUBA 4DFKA 1T8EA 1C1CA 4DV2K 4BVPA 4I9LA 2IVPA 3MECA 4GV3A 4FK2A 5C15A 5M1NA 3RTVA 3KKSA 4JKFA 2YNFA 2QK9A 3V1OA 3L4QA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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