4C23A

L-fuculose kinase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
473
structure length
473
Chain Sequence
LVPRGSHEAVLAIDLGATSGRAIVGYLSENKLVMEEINRFSNLPIRVKGHLSWDIDFLLAKILESIRLANTSYKILSIGIDTWGVDFGLIDNEGKLLLQPVHYRDERTKGVLKEISEMTELEKLYSETGNQIMEINTLFQLFKARQESPDSFYKTNKILLMPDLFNYLLTGKFATEKSIASTTQLFDPRSQNWNQNILKLFELDSSLLPEIVSEGNVLGRIKEEYGLGDIPVVNVCSHDTASAIVSVPKTEGSLFISSGTWSLVGVELTSPILTTESFSYGFTNEVGKDGVITFLKNCTGLWIIEELRRSFERRGKAYSFDDIRTMVEKEKENLPLIDTESTEFATESDMHKTLTEYLAYHHETREWTDGQLFKIVYESLAETYRKAIELLEELTHKVYKRIYVIGGGARASYFNQMIADRTGKEVLTGLTEATAVGNIVVQLIAMGQLKGMEEAHHVIEEFLQLESYYSQKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural and Functional Analysis of Fucose-Processing Enzymes from Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords L-FUCULOSE KINASE FUCK
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
total genus 167
structure length 473
sequence length 473
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.51: L-fuculokinase.
pdb deposition date 2013-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A02
2D0OA 2E2NA 4XEIA 1G99A 4BRIA 1SQKA 5LJWA 2F9WA 4B9QA 1KAYA 5E84A 4FWKA 4A62A 1RFQA 1HX1A 3ENHA 3VEYA 1JCGA 5AQMA 4PKHA 4DCHA 2AA4A 4CZJA 2E2PA 3ZX2A 1GLJO 1TYQA 3EL2A 4JD2B 3WXKA 3DXKB 4K42A 4ISGA 4BR2A 4FSVA 4LC9B 3WXLA 1GLEG 3GG4A 1K8KA 5EX5A 1NGJA 2A41A 4FWOA 2V52B 5BPLA 2NZTA 3A5MC 5AQTA 3HM8A 5AR0A 3WQUA 1GLCG 2H3GX 2ZF5O 3CETA 2DPNA 3A5OC 2VCPA 5ADXA 4WQ4A 1ZXOA 5AQGA 3P4IA 3VPZA 4A2AA 4BRNA 2D1KA 1BA1A 2QWQA 1Z05A 2A6AA 1KAZA 3MN5A 3GL1A 4H5NA 3DXKA 1MA9B 4IXCA 5BRHA 5AQJA 1JCEA 3IDHA 4XH5A 5AZIB 3SMPA 3M3ZA 2HF3A 4BR4A 3A0IX 1MWKA 4WQ4C 3LDOA 3R9PA 2QM1A 3QDKA 4A2BA 3L6QA 3GOIA 3ZEUA 3I8BA 4H0YB 3A8YA 5JLHA 3FR0A 5LY3A 3WXJA 3EO3A 3O80A 4JHDB 3MCPA 4I6MB 2V7ZA 4CBXA 1SZ2A 4HTLA 4O5FA 2ASPA 4FPAA 2A3ZA 3D7EO 3WUHA 3M1FA 4EIAA 3ID8A 1XQSC 3TPQA 3FZHA 4A61A 4BGBA 2I7NA 3DXMB 5AZIA 2PBDA 1X3MA 4BRAA 3UE5A 3FZFA 1GLFO 5AQLA 4CZKA 3QMLA 5EY4A 3ZETB 3OHRA 4K41A 4CZHA 1NGEA 4GNIA 5BRFA 4MO4A 1TUYA 2VYPA 3O1BA 3WT0A 3WXIA 5EVZA 5AQXA 4EHUA 3FZKA 1CZAN 3CQYA 4L3QA 1ESVA 1H1VA 5KQDA 3M6GA 1ZC6A 3CJBA 5AZJB 3SLCA 4JHDA 2PAVA 4I6MA 3KHYA 1NM1A 3HI0A 3HTVA 4BG9A 4BRPA 1Z6RA 4H5RA 2CH5A 5F2RA 5KPTA 5LJVA 4FWNA 3D2EA 3JXUA 3W3DA 5AFUA 1BU6O 2YJEA 3HBTA 2YHYA 3H1QA 3ZETA 3SK3A 5AQPA 5BN8A 4CZFA 4XH4A 1HKCA 3DWLA 4DB3A 3U8XA 1GLAG 4CZMA 3EN9A 4RWTA 1T6CA 3AARA 4M63C 4H5WA 1EQYA 2E20A 4AM6A 1WUAA 1SAZA 3DAWA 2NRHA 1BA0A 4BRDA 2FF6A 4FL9A 1BUPA 1QQMA 3VENA 4MLEA 3R8EA 1BWFO 5AQWA 5JMVA 4EFHA 2OANA 3O8MA 3CJ1A 3CQXA 1C0FA 3QB0A 3ATVA 1JCFA 2W40A 3DJCA 2QWLA 4JNEA 3EKUA 1NGDA 1GLBG 3FE1A 4B1YB 4IWVA 3W0LA 3LDNA 3EKSA 4FO0A 3O1WA 4CZIA 2Q36A 5AQQA 2E88A 5BN9A 4CD1A 4PL7A 2Q1NA 4CI6A 4Z94A 4BQZA 3H6EA 3O4WA 1RGIA 4NO7A 3VEWA 3GE1A 3ATUA 3D2FB 1E4FT 3J8AA 5ELZA 4JD2A 2VWBA 2CGKA 4QS7A 1KAXA 2D0PA 4B1ZA 2FSJA 1XUPO 2EWSA 4HWIA 2ZGYA 3MMVA 5KPRA 3VGLA 4M7XA 4JAXA 3F9MA 3QFUA 4BR0A 4F9OA 1U2VB 4BR5A 4H5TA 1S3XA 3LM9A 2HOEA 2E1YA 5AQZA 4FWRA 5BPMA 3S41A 4PKIA 3VESA 3H46O 1NMDA 3C0BA 1R59O 4H0PA 1GLDG 4NB4A 2YCHA 3CJ7A 1HPMA 1HJOA 1HKGA 3FGUA 4M7YA 3TU5A 2QWMA 1X9JA 5E26A 2Q0UA 1ZBSA 3D2FA 1LOTB 4PL8A 4ISEA 4IJAA 1NGFA 3H45C 2Q97A 5EOYA 4CZEA 5I9EB 1DKGD 3VEVA 5AQYA 4DHYA 3IUCA 4J8FA 1NGCA 5CE3A 3A5NC 1HUXA 1XC3A 2P9UB 5EXWA 2J4RA 2ASMA 1D4XA 3HZ6A 1U2VA 3FZLA 4FWMA 3VEXA 3FFKB 2D4WA 4K43A 3ENOA 4BRGA 4H0TB 3VF2A 3C7NB 2HMPA 2GWJA 3U9DA 4GY2B 2FSNA 4C23A 4EAHD 3GDQA 5AQSA 1MWMA 3B8AX 3G25A 4CD3A 2WUSA 2QW9A 2GELA 1BDGA 2P9SB 3WEEB 3VEZA 4CBWA 2GTDA 4FPBA 4FOEA 4Y0WA 2BTFA 2AP1A 3AAQA 4RCHA 4QS8A 2FF3B 3DXMA 4BC2A 5AQIA 1NGIA 4KBOA 3AAPA 2P9UA 4CBUA 2QWNA 3QFPA 4XH1A 2V51B 4BROA 3CJCA 1TYQB 2Q2RA 1ATRA 4BC3A 3MDQA 2GWKA 5AQNA 1IG8A 3LDLA 2YI1A 3C7NA 2CGJA 4FWPA 3H3NO 2P9NB 2FXUA 3EZWA 2QWRA 1KXPA 2ASOA 2NLXA 5F0XA 3SMSA 4WQ5A 1QZ5A 5AQKA 5AZJA 3A5LC 1YXQA 1YUWA 3FZMA 4BRLA 1QQNA 2YJFA 2IVNA 2A5XA 3O08A 3BF1A 3WEEA 2P9SA 2A40A 3QICA 3CIPA 5BRDA 3H3OB 3KVGA 1E4GT 2FSKA 4BR9A 3MK6A 5AQRA 1WOQA 4BQLA 5FPDA 3FLCO 3BEXA 3LDPA 4CJ7A 2E2OA 3BUZB 3QBWA 4BRKA 1IJJA 3H1VX 3BF3A 4BC5A 1RDWX 4WQ5C 1NBWA 4BG8A 2YHXA 3U4LA 1BG3A 2CH6A 5BR9A 3LL3A 1TUUA 1NGHA 1YAGA 3I33A 4B1VA 2P9NA 5ADXH 1S22A 5JICA 4FOIA 3VGMA 1YVNA 1LCUA 3MN6A 5B8HA 3QBXA 3VERA 2E2QA 4IO8A 3BP8A 1OKJA 1NWKA 3ULEB 2GUPA 3JS6A 4PKGA 3SJHA 5KQ8A 1DEJA 3ZEUB 1P8ZA 3KZBA 1Y64A 4BRHA 4K25A 4ISFA 4BRMA 4EHTA 5KPZA 3LM2A 1J6ZA 2QWOA 4H0VB 5TKYA 2IVPA 3UB5A 3O5BA 4O8KA 2V7YA 4BC4A 2UYTA 1C0GA 1ATNA 4MLHA 2P9IB 2E8AA 2IIRA 2QXLA 4JN4A 4BREA 5JLFA 4B1WB 2W41A 3VF4A 3ZX0A 2P9PB 5FPNA 4BRFA 2ITMA 4B1XB 4E1JA 4MO5A 4YDUA 4H0XB 2GEMA 3RSEB 4IZ9A 5AQUA 3ULEA 1HKBA 1Q18A 3ZX3A 1BOTO 1BO5O 4FWQA 5AQHA 1QZ6A 1ATSA 2HF4A 4CZLA 4BR7A 1GLLO 1MDUB 3UKUB 3CI5A 5BREA 3IFRA 1NGAA 3MN9A 3VOVA 4H03B 2ZGZA 3GBTA 4BVPA 4CZGA 1QHAA 2P9IA 4FWSA 2P9KB 4YDUC 3UKRB 2P9LB 3WQTA 1QQOA 2IVOA 5BPNA 3D2EB 2P9PA 4IJNA 4BGAA 1NLVA 3L4IA 3IMXA 2YHWA 1V4SA 5FPEA 2I7PA 4H5VA 3RSEA 4BRQA 2BUPA 3R6MA 1HLUA 4AM7A 3L0QA 2KHOA 3HSCA 1T44A 4DQ8A 1NGGA 3MN7A 5AQOA 5F1XA 4WYBA 4BRCA 3VETA 5FPMA 3UKUA 3AY9A 2QWPA 4RTFD 3CJAA 2A42A 3CJ9A 3LDQA 5AFUH 2Q0RA 3VGKA 3CERA 3VF6A 2ZWHA 4H0OA 3U9ZA 4BVOA 1NGBA 4FWLA 1X3NA 2FLOA 3UKRA 2P9KA 1K8KB 3VEOA 1T6DA 3O6WA 2P9LA 4B1UB 2Q31A 2E1ZA 1U6ZA 3CHWA 2F9TA 4QS9A 5AQFA 5AQVA 1DGKN 1V4TA 2CGLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4BRIA 2BDPA 4ID5A 4B9QA 3KKRA 4CF2A 4OLBA 3ENHA 3SQ1A 1LAWA 1K8AO 4PKHA 4DUZK 5I3UA 1B92A 4CZJA 1BGXT 3LPTA 3HPHA 3EL2A 3MEGA 3DXKB 2G8IA 4DR2K 4KAZA 3SV3A 5FRNA 2UUAK 4K42A 4JKAA 3WXLA 3KWIA 1CLQA 5EX5A 4KHQA 3L2UA 4FWOA 2V52B 4OKKA 2Z1GA 4ELTA 3PY8A 3OA9A 2VQEK 4KV8A 3VQQA 5AQGA 3VQ8A 2P5OA 1WSJA 1TK8A 2QWQA 1Z05A 4O8UA 3NGYA 3MN5A 3GL1A 5HOOA 3BY5A 1MA9B 2Y1JA 3CG7A 3TAMA 3VQ5A 3SV4A 4XH5A 3PLAA 3VA3A 2O8EB 1DTTA 3OVNA 3E9PA 4A2BA 3L6QA 3DMJA 3ZEUA 5HL7L 1G15A 2O8CA 4NLCA 4CJSA 3FR0A 2ZJRL 4LF5K 2FBVA 4GVEA 3ZSZA 4KHNA 3D6RA 3OYDA 4FPAA 3QEPA 1XQSC 5DMRA 4HHTA 1JLBA 5AZIA 2PBDA 1XI1A 2HMIA 2HW3A 2OPPA 3J81O 1RILA 2OPSA 4K41A 2O8BB 5FRMA 5JS1A 4MO4A 2VYPA 4DG1A 3WT0A 1Q8IA 1YVUA 2BANA 4EHUA 3SCXA 4NXNK 1WSIA 1U4BA 1Z25A 4ELVA 2Q3SA 1Z26A 1ZC6A 1X9SA 4CJ3A 3CJBA 1QVFM 3AVKA 1J5EK 2W6LA 3LAKA 1FXXA 4WCEL 3KHYA 1NM1A 3F9KA 2CH5A 1B9DA 3C94A 5F2RA 5KPTA 5LJVA 1BU6O 3KK1A 3H1QA 1KCFA 4CESA 2P51A 1YJ9N 3U8XA 1NK8A 2RHKA 2X74A 3EN9A 1TKZA 3D45A 4DFMA 3QIPA 3AA2A 4YNQA 3N4QA 2E20A 1WUAA 2NRHA 1S1VA 2FF6A 4M45A 1VSFA 3VENA 1QQMA 1BISA 3NFAA 1EWQA 2HNZA 1XHZA 4NCAA 1YIJN 4LF4K 3QO9A 4OPHA 3UIQA 3QB0A 3BGRA 3ATVA 3DJCA 1VQNN 3S3MA 3W0LA 3LZJA 1RDBA 3CM6A 3LDNA 4KPYA 2FC0A 4IFYA 4DV3K 4I7FA 2Q1NA 2D0AA 3O4WA 1RGIA 3HM9A 3ATUA 2G8FA 1E4FT 2Z1HA 3J8AA 5ELZA 2VWBA 4QS7A 2NUBA 3DYAA 3LP1A 4GVMA 1WSFA 4B1ZA 4PHTX 3AO5A 4H8KA 4HWIA 2EWSA 2FBYA 3OYEA 2ZGYA 5KPRA 1U49A 1VSMA 1XNQK 3VGLA 1N5YA 3V9WA 3PUFA 3F9MA 3QFUA 4DU1A 2HOEA 4DSFA 4DR1K 1RTJA 2ZE2A 1NMDA 4H0PA 3G71N 2YCHA 3KLIA 3K5MA 4DU4A 1GOBA 3ZSXA 2YKMA 1D9FA 2QWMA 5HRPA 5E26A 4CK3A 1LOTB 3DRPA 4ISEA 2HVHA 1IH7A 3WNFA 3T1YK 4JI1K 3CFOA 4DR3K 3O9RA 3MXIA 3H45C 5J1EA 5I9EB 4DHYA 4J8FA 4J2EA 1S1TA 3RVCA 1MU2A 1HUXA 1SKWA 3C6AA 1YHQN 2O8EA 1RT6A 2ASMA 4F2RA 3QINA 3OYBA 1JLQA 4C8LA 1KFDA 4DSLA 3U9DA 2FSNA 3AA4A 3GDQA 3K5OA 5AQSA 1MWMA 3G25A 3KLGA 1HJRA 3O3FA 2QW9A 3DLLL 2P9SB 1J5OA 3VEZA 4FOEA 1VSLA 2HVIA 2NNWA 4E7LA 2FF3B 1N32K 3M8PA 3CYMA 2VWKA 2QA4N 2GUIA 4XH1A 4E19A 4KHWA 2ATQA 5HP1A 4B9SA 3TTFA 2ZQBA 4CF0A 1NMNA 4A5AA 3QEVA 1NJZA 4DQIA 2P9NB 3LALA 3EZWA 4X62K 2QWRA 3IG1A 2NLXA 4WQ5A 1QZ5A 5AQKA 4JKBA 3SI6A 1IKVA 3CCVN 3FZMA 1QQNA 2YJFA 3O08A 4I2PA 1RDCA 4RW9A 1XC9A 4C8NA 5JVGL 4IDHA 4DTJA 3EY1A 1WOQA 1JLEA 4AHRA 1K6YA 2YHAA 5FPDA 3BEXA 4CJ7A 3QBWA 5SZTA 4M42A 4BRKA 1NK5A 2VQFK 2JWLA 2PYLA 2CH6A 5BR9A 3WNEA 1NGHA 4B1VA 1FK9A 1S22A 4NYNA 4YOVA 4PWDA 2E2QA 4W5QA 1OVQA 4FVUA 4O55A 3ULEB 3JS6A 4PKGA 4CJTA 4B9TA 1KVAA 2KTQA 4ISFA 5IT9O 4EHTA 3AO2A 4K8XA 3P38A 3V9XA 1LV5A 3L2WA 3AVCA 1ATNA 3T1HK 3NDKA 4JI8K 4JN4A 3SQ0A 1L3VA 3ZX0A 4BRFA 3PV8A 4LY7A 4B1XB 4YDUA 4N5SA 1HPZA 1C0UA 4K8ZA 3RTVA 5AQUA 4CCHA 4N41A 3TANA 2BE2A 4I9LA 3CPEA 3LP2A 3PO5A 3JSMA 3E01A 3OJSA 4FWQA 2G8HA 1ZBFA 1MDUB 3OS0A 4IOAL 3CI5A 1WAFA 5BREA 5AJ3K 4CK1A 4E89A 3HOTA 2KLAA 1EXQA 4KB1A 4BVPA 3P31A 4Q5VA 1QHAA 2X78A 1O1WA 2IC3A 4JK7A 4YOUA 3WQTA 1QQOA 1SS6A 4JV5K 2BH1A 2I7PA 4CHZA 3SNNA 4KO0A 4DTPA 4QOZB 4DV4K 1VQ7N 4HVJA 1X9MA 3HT3A 3L0QA 3NF6A 1Y97A 2KHOA 2RF2A 3I56N 2OYQA 1NGGA 2Z1IA 4DQPA 1TKXA 1C1CA 3MEDA 3OYNA 1RTIA 3CJAA 3CJ9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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