4C23A

L-fuculose kinase
Total Genus 167
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
167
sequence length
473
structure length
473
Chain Sequence
LVPRGSHEAVLAIDLGATSGRAIVGYLSENKLVMEEINRFSNLPIRVKGHLSWDIDFLLAKILESIRLANTSYKILSIGIDTWGVDFGLIDNEGKLLLQPVHYRDERTKGVLKEISEMTELEKLYSETGNQIMEINTLFQLFKARQESPDSFYKTNKILLMPDLFNYLLTGKFATEKSIASTTQLFDPRSQNWNQNILKLFELDSSLLPEIVSEGNVLGRIKEEYGLGDIPVVNVCSHDTASAIVSVPKTEGSLFISSGTWSLVGVELTSPILTTESFSYGFTNEVGKDGVITFLKNCTGLWIIEELRRSFERRGKAYSFDDIRTMVEKEKENLPLIDTESTEFATESDMHKTLTEYLAYHHETREWTDGQLFKIVYESLAETYRKAIELLEELTHKVYKRIYVIGGGARASYFNQMIADRTGKEVLTGLTEATAVGNIVVQLIAMGQLKGMEEAHHVIEEFLQLESYYSQKN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and Functional Analysis of Fucose-Processing Enzymes from Streptococcus Pneumoniae.
pubmed doi rcsb
source organism Streptococcus pneumoniae
molecule tags Transferase
molecule keywords L-FUCULOSE KINASE FUCK
total genus 167
structure length 473
sequence length 473
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.51: L-fuculokinase.
pdb deposition date 2013-08-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00370 FGGY_N FGGY family of carbohydrate kinases, N-terminal domain
A PF02782 FGGY_C FGGY family of carbohydrate kinases, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4c23A02
4PL8A 5AQHA 5AQIA 1T6DA 4EIAA 2P9LA 2GWKA 4A2BA 3A5LC 1EQYA 5KQDA 3VF6A 1YVNA 3GG4A 4FOIA 3DAWA 3CJAA 4ISGA 1T6CA 3ENHA 2ASMA 5AQGA 1HPMA 2P9PA 2E2OA 4FO0A 5KQ8A 1S22A 4J8FA 5EOYA 4FWKA 1V4SA 1ESVA 3IDHA 3MK6A 3H1VX 3U9ZA 3HM8A 3GE1A 2GWJA 3GOIA 1BA1A 4BC4A 5AFUH 3ATVA 1BDGA 4I6MA 1KAYA 2E2PA 1TUUA 3UKUB 1J6ZA 1YUWA 1MWMA 3ZETA 1XQSC 3MMVA 3MDQA 1U2VA 2D0OA 4RTFD 2CH6A 3OHRA 1QQMA 2F9WA 3BP8A 3HBTA 2QWOA 3L6QA 3L4IA 1Y64A 5AQSA 4BGBA 4B1WB 3WT0A 2FXUA 5AQUA 3FZLA 3L0QA 3J8AA 3EN9A 3O1WA 2DPNA 2E20A 3CIPA 3VEOA 1NGJA 4BRGA 4BR5A 2E1YA 3VGMA 5JLHA 2P9KA 4EFHA 5F1XA 2P9NB 2HF3A 2P9LB 3FFKB 3R8EA 4JN4A 4FWSA 4DB3A 4PKHA 1E4GT 2E1ZA 3WXLA 2Q36A 2V7ZA 3AAQA 3O5BA 4BRKA 1GLCG 4FSVA 5EX5A 4BRFA 3LM9A 3UKUA 4PKIA 2IVNA 2ZGZA 2BTFA 4BRMA 4F9OA 3LDPA 5BPMA 3QFPA 3TU5A 3AY9A 5LJVA 2QWMA 2E88A 3H46O 3O8MA 2YHXA 1TYQB 3D2EA 3CJCA 4CBWA 5AQVA 4HTLA 3ZX0A 2QWPA 5KPRA 3U9DA 3M6GA 3LL3A 3ZX3A 1JCEA 2GTDA 1ATRA 1DKGD 5ADXA 1ZC6A 4E1JA 1MA9B 2NRHA 3WXIA 3SMSA 3ZEUB 2YI1A 3O08A 4K41A 3HZ6A 2IVOA 5F0XA 4AM6A 3VF4A 4BRIA 1NGAA 3VPZA 1U6ZA 2CGLA 3VEWA 3A5NC 4FPAA 4JAXA 4Y0WA 3SMPA 1NGEA 1BUPA 5B8HA 1BO5O 1NGDA 3EO3A 5AFUA 2F9TA 3I8BA 2Q0UA 1ZXOA 3ULEA 4EAHD 5AQWA 4B9QA 4H0OA 4RCHA 3VOVA 1QZ6A 2WUSA 4JHDA 4DCHA 3CJBA 3FZHA 5CE3A 3CI5A 5LY3A 2ZF5O 1JCFA 1DGKN 2FSJA 2CGKA 5FPEA 4M7YA 3EL2A 4CBUA 1GLEG 2PBDA 3MCPA 1HJOA 2QW9A 5AQQA 5AR0A 4NO7A 2EWSA 4BREA 3CQYA 1QZ5A 1NM1A 2H3GX 2D1KA 2OANA 3DXMB 3VEXA 3FZMA 2P9IA 1G99A 5F2RA 5AQRA 3CJ7A 4FWRA 1U2VB 3CETA 4XEIA 1BG3A 3H6EA 4H0YB 3RSEB 3B8AX 3O6WA 2CGJA 5FPNA 5AQJA 3IFRA 3D2FA 4WQ5C 2W40A 4FWPA 3A5OC 5BR9A 3ENOA 3CHWA 1P8ZA 1C0GA 4H5RA 4B1UB 1GLBG 3WEEA 3P4IA 4BG8A 4CZGA 3WQUA 1NGGA 3BEXA 3JXUA 2V51B 4WQ4C 3IMXA 4B1XB 4CD1A 2E2QA 1C0FA 5BPNA 1HUXA 3RSEA 4FWQA 3UB5A 2ASPA 3I33A 4BRAA 4BC3A 4IJAA 3CJ9A 3FZFA 4XH4A 4QS7A 4WQ4A 2YCHA 5AQPA 4BR7A 3H45C 5AZIA 5AZJA 3MN5A 1GLLO 1GLFO 3QDKA 4BRPA 3QFUA 4JHDB 5JMVA 5ADXH 4CZHA 3ZETB 4A2AA 2GUPA 3HI0A 2FF3B 4GY2B 3KHYA 5AQNA 2P9KB 3IUCA 4BR4A 5AQXA 4XH5A 2P9NA 1NBWA 3D2FB 3KVGA 4BROA 4IXCA 5AZJB 3VGKA 4FOEA 5AQOA 3U8XA 3GDQA 3H3NO 2J4RA 5E84A 3LDOA 4MLHA 2Q97A 2ZWHA 3SK3A 4DQ8A 3WXJA 3VETA 4BG9A 1SAZA 4H5NA 3G25A 4BRQA 3VGLA 4MLEA 4H5WA 4BC5A 1LOTB 2QWNA 3FE1A 2V52B 1KAXA 1E4FT 4BR0A 4QS8A 4B1ZA 3S41A 1Z05A 1CZAN 4WYBA 4FPBA 3MN7A 4BRHA 4CZEA 5JLFA 4JNEA 3F9MA 2GEMA 4CI6A 4B1YB 4IWVA 2Q2RA 1ATSA 3WUHA 1WOQA 1KXPA 3EKSA 1RGIA 1SZ2A 3QBWA 4BVOA 3DJCA 4IJNA 1IJJA 4H5TA 3WQTA 1TYQA 5LJWA 1ATNA 5AQMA 5AQTA 2PAVA 3A8YA 4BR9A 1HKCA 2VWBA 3FZKA 5FPMA 3VERA 4K43A 3ZEUA 4CJ7A 3WXKA 3VF2A 4CZKA 3C0BA 5EXWA 1HX1A 2D0PA 4FWMA 1H1VA 4FWOA 3A0IX 1V4TA 4Z94A 5BRHA 4RWTA 1XUPO 2A40A 5I9EB 3H1QA 4LC9B 3CERA 5AQFA 1BWFO 2A42A 1NLVA 4XH1A 4EHUA 2QWLA 1RFQA 2Q1NA 4YDUA 1NMDA 1NGBA 1TUYA 2NLXA 3LM2A 5BREA 3O1BA 3VEVA 4C23A 5KPZA 4BRDA 3BF1A 4BQZA 4CD3A 3QMLA 1X3MA 1HLUA 5EVZA 1Q18A 1BU6O 3AARA 2IVPA 3VENA 5TKYA 3VEZA 2ZGYA 3BF3A 2Q0RA 3GL1A 3MN9A 1RDWX 4BRLA 4K25A 4CZJA 2I7PA 1GLDG 4ISEA 3QB0A 3UKRA 3O80A 3R9PA 3W3DA 3CQXA 1JCGA 3EZWA 4KBOA 4CBXA 3WEEB 3MN6A 5BPLA 2BUPA 3D7EO 2NZTA 5KPTA 3VEYA 3FGUA 4FL9A 4IZ9A 4NB4A 1QHAA 4MO4A 4MO5A 4BQLA 4CZIA 5ELZA 1IG8A 3M3ZA 2HMPA 3JS6A 1HKGA 2A6AA 3O4WA 1R59O 4FWLA 4H5VA 1S3XA 1ZBSA 1OKJA 3DXKA 2P9SA 2E8AA 1QQOA 1K8KB 2VYPA 4JD2A 5EY4A 5FPDA 2HOEA 4PKGA 3FR0A 4M63C 1NGIA 5AQKA 4PL7A 3HTVA 3W0LA 2A5XA 2ASOA 3VESA 3EKUA 3D2EB 4H0PA 4HWIA 4EHTA 3ZX2A 5BRFA 2GELA 1MWKA 3M1FA 1X3NA 3HSCA 4H03B 4BRCA 4WQ5A 2KHOA 1YXQA 2YJEA 3C7NA 1XC3A 3SLCA 3TPQA 4FWNA 4A61A 1GLAG 2P9PB 5BN9A 4AM7A 1NGCA 5AQYA 3UE5A 4JD2B 3A5MC 5BN8A 3U4LA 3QBXA 4H0VB 5E26A 5JICA 3ULEB 1LCUA 2E2NA 4L3QA 4O5FA 3KZBA 3FLCO 2A41A 4B1VA 2AA4A 3ID8A 2FLOA 2VCPA 1WUAA 2QWQA 5AQZA 2CH5A 3C7NB 1NGHA 2FSKA 2QM1A 4CZFA 2QXLA 5AQLA 2HF4A 1D4XA 3QICA 2P9SB 3CJ1A 3LDNA 4BRNA 3DWLA 2P9UA 4O8KA 1NWKA 4K42A 2W41A 2V7YA 1KAZA 3AAPA 1BA0A 1X9JA 2AP1A 4QS9A 3UKRB 3LDLA 4BGAA 4BVPA 5AZIB 4CZLA 3DXMA 4IO8A 3SJHA 1MDUB 4I6MB 2ITMA 1SQKA 1T44A 4DHYA 4BR2A 4M7XA 2YHYA 3LDQA 2UYTA 2A3ZA 2P9UB 1HKBA 2QWRA 3GBTA 4A62A 2YHWA 1QQNA 3R6MA 4GNIA 4ISFA 1Z6RA 4H0TB 5BRDA 3BUZB 2IIRA 2YJFA 3ATUA 4H0XB 1GLJO 4BC2A 2Q31A 4YDUC 1NGFA 2P9IB 1YAGA 3H3OB 1DEJA 2D4WA 2FSNA 4CZMA 3DXKB 2FF6A 2I7NA 1BOTO 1K8KA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4PL8A 4FJ8A 5AQIA 4Z4GA 4A2BA 4JI3K 3D45A 4BY9C 2PYLA 3K0SA 1Y97A 1CXUA 3DAWA 1J5OA 4C8LA 3ENHA 1FXXA 4N47A 4XIUA 5I42A 4KREA 5EOYA 4FWKA 1C1CA 2OZMA 1V4SA 1HNWK 2UXCK 3U9ZA 3HM8A 3G71N 3GE1A 2GWJA 3GOIA 1BA1A 1BDGA 1HRHA 1EXQA 2O8CA 2E2PA 4CGFA 3MAQA 4MDAA 3ZETA 1MWMA 4KHUA 3MMVA 2FBXA 4K8XA 1RDCA 3HBTA 3J81O 4X64K 1JXEA 5AQSA 4B1WB 4BWJA 2KFNA 1S72N 4OLAA 3AGRA 4CEOA 3NH1A 1WAFA 2E1YA 5JLHA 2P9KA 2WONA 4B3OA 4DV0K 2HF3A 4DSJA 1BCOA 4HCBA 2YHAA 5C10A 1Q9YA 4LF8K 4E7JA 2JWLA 4DB3A 3C6HA 1L3UA 4JI2K 1E4GT 3C95A 1KQSM 1RT1A 4OX9K 1I3AA 3O5BA 4BRKA 4Q5VA 4FSVA 3HRGA 5EX5A 4BRFA 4KI4A 2IVNA 3M8QA 3TU5A 4C1NK 2E88A 3CCSN 4RW4A 3CJCA 5AQVA 3QEWA 3O4NA 3ZX0A 3MXJA 2QWPA 2QKBA 3DLEA 2FBYA 2VWKA 5M1FA 1RBTA 1M90O 1ATRA 1DKGD 3MEGA 5M1QA 4E1JA 3SYZA 2IOCA 1ZBUA 2YI1A 4AH9A 3B6OA 4FZXC 4F2SA 2ETJA 4E7HA 3QNOA 1NOZA 2G8UA 2NRXA 3SZ2A 2E6MA 1U6ZA 4HUEA 1ITGA 1Q82O 3VEWA 3B6PA 2NRZA 2NRWA 1NGEA 3CXCM 3EO3A 1QVGM 3PY8A 3RWUA 3ULEA 3CFRA 3OYAA 2ZE2A 5AQWA 1B9DA 1QZ6A 1XNQK 3NF9A 4JHDA 4DCHA 3FZHA 5CR4A 5CE3A 3OA9A 5SWMA 1YJ9N 1NG9A 2ZF5O 3ULDA 3CCMN 1DGKN 4KB0A 1EKEA 1UWBA 2FSJA 3P5JA 4DV3K 4CK2A 3EL2A 4YNQA 1K6YA 2BH1A 4CF1A 5K14A 3I8DA 3RRHA 4G1QA 4KTWA 3CQYA 1QZ5A 2OANA 3F73A 4FLYA 2E5LK 1GOBA 4HHTA 3KIOA 5BR8K 1VSKA 3L2RA 4FXDA 3CETA 1X1PA 1CZBA 1VHXA 2NRTA 4XEIA 1BG3A 3H6EA 1N8RO 3O6WA 3AA3A 4WCEL 3DMJA 1TAQA 4F8RA 4DR1K 4DQPA 3G0ZA 3PUFA 5KRSA 2ZQBA 3ENOA 1VSFA 2X78A 1HNVA 2HHVA 4H5RA 4B1UB 3LAMA 3RTVA 4CHZA 1RTDA 5C0YA 1ZBIA 3WQUA 3IMXA 1WBDA 3RMDA 3VQBA 1LWCA 3FFIA 1CZ9A 1NK5A 3EZ5A 1KTQA 2YNIA 1D8YA 1IKVA 4CJSA 3SQ2A 3KK3A 4JS4A 4DTSA 3DLHA 3N4QA 4QS7A 4KB1A 3THVA 3DM2A 2UUBK 5AQPA 4IG3A 4A59A 4NCGA 4CGIA 4EP5A 5AZJA 3VQDA 4BRPA 4JV5K 4DR2K 4CZHA 3ZT0A 3VN5A 4DSFA 3K5MA 3TTCA 3IG1A 4GY2B 3N4PA 5AQNA 2VWJA 2R7YA 3K2PA 3IUCA 5AQXA 4XH5A 3C65A 5FRNA 5EU7A 2P51A 2RE2A 4IXCA 2OPPA 3CCJN 4CFDA 3I55N 3GDQA 3NAEA 3HSTB 3VQ9A 5E84A 4MLHA 2Q97A 2ZWHA 3VQAA 3TSPA 3HPHA 4H5NA 3VGLA 1YI2N 4BC5A 2V52B 3AV9A 1Z05A 4WYBA 4BRHA 3S9HA 5JLFA 3F9MA 4FZYA 4CESA 1WOQA 4Q0BA 3CC7N 1QSLA 4NXNK 4JKAA 5T7BA 4BVOA 5FROA 2A1RA 3WQTA 1QHTA 2Z1GA 3OYNA 1ATNA 2YNGA 2PAVA 5HRNA 4BR9A 2F96A 1HKCA 2VWBA 4IBNA 4DR5K 4KHSA 3WXKA 3VF2A 5MLCQ 5EXWA 1RILA 2DY4A 1TKDA 2D0PA 3CM6A 4FWMA 5E41A 2UXBK 1H1VA 3A0IX 3ITHA 4LF5K 1XUPO 5C2DA 3H1QA 4ZTJA 3K57A 1BQNA 1BWFO 1VQ7N 1J53A 4PHTX 3VQ8A 1VSDA 5DK5A 5DM7L 4YDUA 3HK2A 3LM2A 3EE9A 2WOMA 2HNDA 1LWEA 1KVAA 3AVJA 4OGCA 1Q18A 1TL1A 2IVPA 4CVNE 1K8AO 1SUQA 2FC0A 3NCIA 4HCCA 3VEZA 3VMFB 3BF3A 3MN9A 1RDWX 3QIPA 3CCUN 4KRFA 2VGNA 3LP0A 1BI4A 1MU2A 2XRIA 3EZWA 4GV9A 4YOVA 1CLQA 3WEEB 4N41A 3LPTA 3ZSVA 4BDZA 5KPTA 1VAZA 1RTHA 5J1EA 4JI1K 3VEYA 1X9WA 3FGUA 3V1RA 3CM5A 4CJFA 3AO3A 3KJVA 1QHAA 3E9LA 4KFBA 4BQLA 4CZIA 2O8FB 2LSNA 1ASVA 4DF4A 2XY6A 4K0KK 2RKIA 1FJGK 4F2RA 2KQ2A 1DTQA 1TGOA 1OH5A 2F7TA 1WAJA 4ILGB 4JD2A 4FCYA 1NOYA 4WE1A 3TTFA 1D9DA 5FRMA 1KFDA 1HNZK 3MWTA 3QINA 1N5YA 1MWKA 3AVLA 2KHOA 2YJEA 4O8UA 3C7NA 1XC3A 4ID5A 3TPQA 1GLAG 3AVMA 3RMAA 2JWKA 4OPKA 4JD2B 3AVIA 3A5MC 5BN8A 1WSHA 3QBXA 4Z4HA 1Q7YO 2D5RA 3KZBA 2IS3A 4FYDA 2JGUA 4CGHA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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