4C3WA

Vanadium(iv)-picolinate complexed with lysozyme
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
publication title Vanadium Complexes as Prospective Therapeutics: Structural Characterization of a V(Iv) Lysozyme Adduct
doi rcsb
molecule keywords LYSOZYME C
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2013-08-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4c3wA00
1B7NA 4GN3A 5F14A 4XN6A 1DKKA 4HV1A 1RJCB 2AUBA 3RZ4A 1OUHA 1HEOA 1QUTA 5KXYA 3A93A 1LZ6A 4Z41A 4N9RA 4WO6A 4ETBA 5C6LA 1RFPA 1T6VL 3A91A 4WM3A 4WM2A 1YQVY 1OUFA 4HSFA 1LMTA 3IWRA 1GB6A 1GE1A 5FEKA 1LHKA 1XGUC 1GEVA 3CT0A 4HPEA 1WVUA 1HMKA 4ETDA 5I4YA 1TEWA 1IWXA 5KKIA 3K3TA 3A94A 2ZILA 3AZ6A 5HNLA 3WW5A 4DT3A 4DD3A 4NSIA 3ATOA 1GDWA 5KXPA 4B4EA 1NQIA 1EQEA 2HEFA 1CKCA 5KXOA 1LYOA 5A3ZA 1C10A 1HEMA 1LAAA 4J7VA 1JJ0A 2FYCA 4QGZA 1OUAA 1YAOA 1HHLA 1GB7A 2BPUA 2Z19A 1QQYA 1UUZC 4ZIXA 5FELA 4DD2A 4G4BA 4GCFA 1D0KA 208LA 5C6JA 3WH1A 1LSZA 1YANA 4LZTA 3BKVA 4NIJA 3WUAA 2LYZA 4CHXA 6LYTA 1XFPL 4Z98A 1BWIA 1NHEA 4DDAA 5LYZA 3P68A 3TMXA 3TXFA 5HLLA 3W6FA 4NY5A 5IHGA 2Z12A 4UWUA 1LHLA 3WYHA 4WLYA 4GLAA 4AGAA 4DD9A 1JITA 3G3AB 5C6IA 2H9JA 2ZWBA 4H8ZA 2VB1A 1D6QA 4NHPA 4WOAA 4EOFA 1O23A 1LHIA 2I26L 1KXYA 3P64A 1B7LA 1LZBA 5B07A 1IIZA 1SLYA 4H9AA 3BKHA 3CSRA 3WVXA 3HFMY 1YKXX 1XGRC 1TDYA 4GCDA 4M6DA 1IO5A 2BQHA 4WL7A 1B5ZA 4LT3A 3A6BY 3AZ5A 1B9OA 4FDYA 4H9IA 5KJ9A 1D0LA 1JTOL 2PC2A 2MEBA 4J1AA 4P2EA 1IOTA 1I1ZA 3A90A 3TMUA 1XGQC 4HPIA 4N1EI 1ALCA 3AW7A 4LYTA 1BB5A 4ANRA 1GE3A 6LYZA 3QY4A 4NGZA 1G7MC 2LHMA 4PJ2C 4R0FA 1LZGA 5M1YA 1JJ3A 4PHIA 1B5UA 1UIHA 2LZ2A 5LVKA 1QTEA 2C8PA 1OUBA 4LGKA 1BHZA 1LZ1A 4NGJA 2ZYPA 1IP2A 2DQGY 1CJ7A 1QUSA 2C8OA 2W1XA 2FBDA 2D91A 1GB3A 4YENA 4IJ4A 2DQEY 4KPMA 4ZFPA 2BLYA 2DQJY 1LMCA 1REMA 4OWAA 2DKVA 4OWBA 5F9UA 2HEAA 2Z18A 4PPOA 3OK0A 5B05A 3T36A 1JUGA 1UIEA 1G7LC 2H5ZA 2RSCA 1JSEA 2HU1A 1EQ4A 4NWHA 1UIAA 3AGIA 2IHLA 1JSFA 5LXWA 3OJPA 4RDSA 1AKIA 2ZYCA 1H87A 1A2YC 1LYYA 1GF6A 2BQAA 4H94A 2CGIA 4WM5A 5II3A 1B7OA 1FBIX 5APDA 5B1GA 4HJYA 1JHLA 4MSTA 4NGWA 4XJFA 1C46A 3N9CA 1B7RA 1GE0A 1WQRA 3VWOA 1B7SA 1GFKA 1IC5Y 1F6RA 1DI5A 1YROA 2ZIKA 3LYMA 1GF8A 3A92A 1AZFA 4UWVA 1GFUA 4W94A 1WQPA 3AB6A 1B5VA 3AZ7A 3B0KA 1CJ9A 1OUEA 3W3EA 3CB7A 207LA 4HJVA 1YAPA 2XTHA 1LHJA 1IX0A 1GB8A 4E3UA 3A3QA 2F2NA 1OUJA 3AYQA 4TTDA 4RW2A 1XEJA 3IJVA 3WVYA 3P4ZA 2YBMA 2XBSA 3WULA 3A8ZA 2D4IA 4TSBA 5D5CA 3GXKA 1VEDA 1BGIA 4NHSA 1V7SA 3E3DA 5APFA 4ET8A 4NG8A 3ZVQB 3P65A 1GFEA 1LJFA 2W1LA 4X3BA 5KXWA 4XJDA 3A34A 1JPOA 4OWHA 4NSJA 1C45A 1CKFA 2BQLA 1CJ8A 4XYYA 1NDMC 5LAGA 1F0WA 2I25L 2MEDA 1LOZA 1UIFA 4RW1A 4BAFA 2BQOA 1REYA 2DQHY 3LN2A 4YM8A 1B7PA 4XJHA 2EKSC 1HEPA 3WPKA 5APEA 4NG1A 1GF3A 1GE4A 1NKHA 1CKHA 4LT0A 1I20A 1IP6A 4NSHA 1LSEA 1FLYA 2DQAA 1LZRA 1G7IC 5K7OA 1RE2A 3TXEA 4I0CA 7LYZA 1IWVA 4NSGA 1WVVA 4FJRA 1BVXA 3WU7A 4NHIA 3EXDA 1JWRA 4LYMA 2G4PA 5I5QA 5LYTA 3ULRA 5F16A 2ZNXY 4Z3MA 1HMLA 3TXHA 1RCMA 1IR8A 1TCYA 2XJWA 2ZQ3A 4XJGA 3TXKA 4G4CA 4G9SA 3W6BA 3M18B 1LKSA 1H6MA 2DBTA 1LCNA 1LTMA 4KXIA 1NDGC 4YF2A 1HEQA 2G4QA 1WQOA 5FCPA 5KY1A 2Z2FA 1NBYC 1ZMYL 2EQLA 4DWXA 1UICA 1J1OY 5KXZA 1LMAA 3N9AA 4OW1A 3MGWA 4YEMA 1LSGA 2MEEA 4QDNA 5DM9A 3WUMA 1KXXA 1HERA 1B0DA 5J7CA 5KXRA 3TXIA 4GN4A 4XJIA 5EBHA 3WXTA 5B59A 4H90A 1IOSA 4AXTA 1DI4A 1OQMA 1VDQA 4EMNA 4RLMA 1LSMA 5DL9A 4DD7A 5FDJA 2HTXA 2Y8PA 3HBEX 4ET9A 1JTPL 1LJNA 2BQJA 4DDBA 1LJEA 1GD6A 3N9EA 1UBZA 5LIOA 1UIDA 1A4VA 4BS7A 3A3RX 3W6CA 3AJNA 1IWYA 1MELL 3AZ4A 2Z39A 4N1CC 1D6PA 1JKAA 4GLVA 4CGEA 1GBOA 1GBZA 4LYBA 1LJ3A 3WL2A 5LVJA 1VAUA 1OUIA 4D9ZA 1BWHA 1EL1A 4G49A 3B6LA 1OP9B 3A96A 2Z37A 4CFOA 1IWTA 3D9AC 4KT3A 1T3PA 1G7HC 4YOPA 3RU5A 1TAYA 1IOCA 5KXLA 2G4NA 4U3XB 2A7FA 2WARA 4H9EA 132LA 1UA6Y 5KXMA 1YILA 2DQFC 2F4GA 1DKJA 1GB5A 2BQBA 2DQDY 1AT5A 1BQLY 1LJKA 1YKYX 2DQIY 4H9CA 5AMYA 4HP0A 1UIBA 4B0DA 1LYSA 1G7JC 4LFPA 3CQLA 2A7DA 1KIQC 4NHQA 1CKGA 1LJHA 2LYMA 2HEEA 4WM1A 1FN5A 1ZVYB 2HUBA 5A3EA 4NFVA 4M4OA 1VDTA 4H93A 5LINA 1GFJA 4BADA 3QNGA 4J0LA 1WQMA 4HV2A 1GXV2 1KXWA 1YL0X 1IORA 1VFBC 4NGLA 4KL7A 4DD1A 5HMVA 2LZTA 1WQNA 1W08A 2N5ZA 2BLXA 1GFRA 4J1BA 1UIGA 4N8ZA 193LA 2BQGA 1WTMA 1LMPA 3HBHA 4WG1A 2F4AA 1FDLY 1GBWA 1GHLA 1B5YA 5D5FA 4R6CA 1JISA 3FE0A 4A7DA 3A6CY 1IP3A 1YAQA 4WM4A 5HQ1A 4PGJB 1AT6A 1VATA 1DPXA 1NMMA 2HEBA 4QEQA 1LSFA 1QIOA 1GPQC 2BQKA 3CT1A 2MEGA 2Z38A 1LSYA 1YL1X 2YSSC 1LHMA 1LYZA 1B5WA 1UC0A 2LYOA 1LSCA 2Z2EA 1LZYA 1OUGA 4IATA 4WLTA 5KXSA 1BVKC 2B5ZA 1LZ5A 3J4GA 1JKCA 4TX7A 4DC4A 4CFPA 4LYCA 1LZNA 1IY3A 2IFFY 3LHMA 1LZSA 4TSCA 3LYTA 4WL6A 2YDGA 1GXXA 1HSWA 5LA5A 1LKRA 1LSAA 2BQMA 2NWDX 5L3HA 154LA 3WUNA 1GF7A 2FBBA 1FKVA 3WU8A 2F30A 4WG7A 4OWEA 4ETCA 1NBZC 3HBDA 1DXJA 2W1MA 1FKQA 1LHHA 4XADA 135LA 3TMWA 1LSDA 5I54A 2MEFA 3SP3A 4LT1A 5F9XA 2BAAA 1IVMA 1IR7A 1GBYA 1GE2A 5DLAA 3W6AA 1FLWA 4MR1A 5LVHA 2EPEA 5I4XA 4H1PA 2GV0A 1IOQA 1D9UA 1C08C 1INUA 3AGHA 3LZ2A 9LYZA 1HELA 3P66A 1QSAA 5KXNA 133LA 1LZ8A 1QDRA 1GFGA 4W96A 4OWCA 3WXUA 4NWEA 5B1FA 5LA8A 1QDTA 1JEFA 5LAFA 2MEHA 4WO9A 3A95A 1DPWA 4XENA 1LZDA 2H9KA 4GCCA 4L41A 1VDPA 4NGYA 1HENA 1IC4Y 1XGPC 4PRQA 1PS5A 2BQNA 3G3BB 3T6UA 5T3FA 3CSZA 5KXTA 1AM7A 4CJ2A 5HNCA 1FLUA 1GWDA 1IP4A 4HTNA 1XEIA 1HEWA 3AW6A 3EBAB 1BB4A 1NF5A 4MCKA 3RNXA 2MEAA 5FSTA 1V7TA 1LJIA 4H91A 1DI3A 4NEBA 4TWSA 5E4PA 1LZAA 1XSFA 1C43A 4GN5C 3J6KA 1WTNA 1LMOA 3W6EA 1JTTL 3M3UA 1I56A 1RI8B 3WPJA 1IC7Y 2CJLA 1YAMA 1QSWA 4DDCA 1HFZA 2ZIJA 5KXXA 1D0MA 2I6ZA 1LZ4A 5KXKA 5E9RA 4DYGA 4WMGA 1BB7A 2Q0MX 4WM6A 1IP5A 1FLQA 3A67Y 4G4HA 2YBLA 1UCOA 1XGTC 4DD0A 3LZTA 1LMQA 2YVBA 4HTKA 5FHWA 4GCBA 1LJ4A 2HU3A 4NGIA 2EIZC 4NGVA 1JKDA 5LVIA 1F10A 4B4JA 3TXGA 1N4FA 1UACY 4ETAA 3LYZA 3LYOA 1LZEA 2YBJA 2ZNWY 4N5RA 5APCA 4H92A 3WMKA 3TMVA 3EO5A 3ZEKA 3ZVQA 1HFYA 1TBYA 1BWJA 4OOOA 2YBNA 1GF5A 5B06A 3GXRA 4H9FA 1GB0A 3TXJA 3WPLA 3WU9A 2BQFA 1DQJC 4XJBA 2YBHA 3W6DA 4ZEEA 2XBRA 2YBIA 1IWZA 3TXDA 8LYZA 4H8YA 1J1XY 1GFTA 4H8XA 1OUDA 4UWNA 1IP7A 3CSQA 1ZV5L 3B0IA 1XEKA 3RT5X 4ETEA 4LT2A 1E8LA 3B0OA 5IELA 1B5XA 2X0AA 4LYOA 1GAYA 2DQCY 5DN5A 1IR9A 5LVGA 1JKBA 3FI7A 4YEOA 1Z55A 1P2CC 1CKDA 1IWUA 4LFXA 4PRUA 1IEEA 1MLCE 1VDSA 2FYDA 4WLXA 1GF0A 1LJJA 1B7QA 4ML7A 1REZA 4NGKA 1GDXA 4N0JA 4C3WA 5I4WA 1B2KA 1HFXA 4NGOA 4RLNA 1LZ9A 5HMJA 1LPIA 4B1AA 153LA 5ILFA 2BQDA 5DN4A 2BQIA 4HTQA 1ZVHL 1GFHA 1BB3A 1LSBA 3AGGG 1B7MA 1GF9A 1GFAA 4TUNA 4Z46A 1HNLA 1DZBX 1YKZX 3IJUA 1NWGA 3KAMA 1CJ6A 1EQ5A 4QY9A 4B49A 1IY4A 3QE8A 1JJ1A 1KIPC 4WLDA 1JIYA 2D6BA 5LYMA 1GBSA 5ILCA 1HSXA 2BQEA 1IP1A 3ATNA 134LA 5L9JA 1PZYA 1WQQA 2BQCA 2ZQ4A 1GF4A 5F81A 1HC0A 1F6SA 1GEZA 1GB2A 3TXBA 5I53A 4BAPA 1LSPA 5IDDA 1BB6A 4H9HA 2CWIA 1LZCA 1GB9A 4LYZA 1GBXA 1GFVA 4II8A 3EMSA 4B4IA 3RW8A 1YIKA 1LMNA 3CT5A 1LJGA 2D4KA 1SQ2L 1J1PY 4C5FA 1QTKA 2MECA 2HEDA 4IASA 1C7PA 1GAZA 1LSNA 1W6ZA 2HECA 3F6ZA 4HJZA 4NHTA 5JENB 5KKJA 1HF4A 1LZTA 3D3DA 4O34A 3B72A 4I8SA 4GCEA 4H9BA 3WW6A 1KIRC 5L3IA 1CNSA 2W1YA 194LA 1IWWA 1OUCA 2CDSA 2D4JA 4OOTA 1REXA 2MEIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1XEPA 4HV1A 1QUTA 4WO6A 4ETBA 1T6VL 4WM2A 118LA 5FEKA 3SBBC 1XGUC 4ETDA 131LA 3DN1A 2ZILA 3WW5A 1GDWA 5KXPA 1NQIA 1EQEA 247LA 5KXOA 178LA 1LWKA 2FYCA 2BPUA 2Z19A 3CDTA 1UUZC 5FELA 5C6JA 1G0QA 1L43A 1XFPL 3K2RA 4Z98A 5LYZA 5IHGA 4NY5A 138LA 2Z12A 2ANVA 4UWUA 249LA 198LA 1JITA 147LA 1EPYA 1XJTA 3G3AB 4H8ZA 1D6QA 241LA 4WOAA 4EOFA 1LHIA 1OV5A 4H9AA 216LA 3BKHA 1SWZA 1C6NA 3HFMY 3WVXA 1L83A 1TDYA 3A6BY 3AZ5A 2PC2A 206LA 4J1AA 4P2EA 1IOTA 3A90A 4N1EI 1LZGA 1JJ3A 1B5UA 1DYGA 1OUBA 4LGKA 1KY1A 3DMVA 1QUGA 1GB3A 4KPMA 4ZFPA 229LA 1LMCA 1REMA 4OWAA 2DKVA 4OWBA 5B05A 1C6KA 1G7LC 2RSCA 2HU1A 3OJPA 123LA 1C6FA 1A2YC 4H94A 4WM5A 5B1GA 4NGWA 1L14A 1YROA 234LA 1C60A 189LA 4UWVA 1OUEA 3W3EA 3CB7A 207LA 200LA 1L88A 1L0JA 251LA 3WVYA 2YBMA 4W55A 3GXKA 1VEDA 1BGIA 1ZYTA 1LJFA 1JQUA 3A34A 1G07A 4NSJA 1CKFA 2BQLA 5LAGA 214LA 152LA 4RW1A 2BQOA 1L33A 4XJHA 1L25A 212LA 1CKHA 3OE8A 1IP6A 3HTGA 4NSHA 140LA 2Z6BA 4S0WA 1BVXA 3WU7A 5I5QA 1L27A 4Z3MA 1L87A 1RCMA 2XJWA 2RBNA 4XJGA 1LKSA 1H6MA 2G4QA 1WQOA 5KY1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B7N A;  4GN3 A;  5F14 A;  4XN6 A;  1DKK A;  4HV1 A;  1RJC B;  2AUB A;  3RZ4 A;  1OUH A;  1HEO A;  1QUT A;  5KXY A;  3A93 A;  1LZ6 A;  4Z41 A;  4N9R A;  4WO6 A;  4ETB A;  5C6L A;  1RFP A;  1T6V L;  3A91 A;  4WM3 A;  4WM2 A;  1YQV Y;  1OUF A;  4HSF A;  1LMT A;  3IWR A;  1GB6 A;  1GE1 A;  5FEK A;  1LHK A;  1XGU C;  1GEV A;  3CT0 A;  4HPE A;  1WVU A;  1HMK A;  4ETD A;  5I4Y A;  1TEW A;  1IWX A;  5KKI A;  3K3T A;  3A94 A;  2ZIL A;  3AZ6 A;  5HNL A;  3WW5 A;  4DT3 A;  4DD3 A;  4NSI A;  3ATO A;  1GDW A;  5KXP A;  4B4E A;  1NQI A;  1EQE A;  2HEF A;  1CKC A;  5KXO A;  1LYO A;  5A3Z A;  1C10 A;  1HEM A;  1LAA A;  4J7V A;  1JJ0 A;  2FYC A;  4QGZ A;  1OUA A;  1YAO A;  1HHL A;  1GB7 A;  2BPU A;  2Z19 A;  1QQY A;  1UUZ C;  4ZIX A;  5FEL A;  4DD2 A;  4G4B A;  4GCF A;  1D0K A;  208L A;  5C6J A;  3WH1 A;  1LSZ A;  1YAN A;  4LZT A;  3BKV A;  4NIJ A;  3WUA A;  2LYZ A;  4CHX A;  6LYT A;  1XFP L;  4Z98 A;  1BWI A;  1NHE A;  4DDA A;  5LYZ A;  3P68 A;  3TMX A;  3TXF A;  5HLL A;  3W6F A;  4NY5 A;  5IHG A;  2Z12 A; 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 2DQC Y;  5DN5 A;  1IR9 A;  5LVG A;  1JKB A;  3FI7 A;  4YEO A;  1Z55 A;  1P2C C;  1CKD A;  1IWU A;  4LFX A;  4PRU A;  1IEE A;  1MLC E;  1VDS A;  2FYD A;  4WLX A;  1GF0 A;  1LJJ A;  1B7Q A;  4ML7 A;  1REZ A;  4NGK A;  1GDX A;  4N0J A;  4C3W A;  5I4W A;  1B2K A;  1HFX A;  4NGO A;  4RLN A;  1LZ9 A;  5HMJ A;  1LPI A;  4B1A A;  153L A;  5ILF A;  2BQD A;  5DN4 A;  2BQI A;  4HTQ A;  1ZVH L;  1GFH A;  1BB3 A;  1LSB A;  3AGG G;  1B7M A;  1GF9 A;  1GFA A;  4TUN A;  4Z46 A;  1HNL A;  1DZB X;  1YKZ X;  3IJU A;  1NWG A;  3KAM A;  1CJ6 A;  1EQ5 A;  4QY9 A;  4B49 A;  1IY4 A;  3QE8 A;  1JJ1 A;  1KIP C;  4WLD A;  1JIY A;  2D6B A;  5LYM A;  1GBS A;  5ILC A;  1HSX A;  2BQE A;  1IP1 A;  3ATN A;  134L A;  5L9J A;  1PZY A;  1WQQ A;  2BQC A;  2ZQ4 A;  1GF4 A;  5F81 A;  1HC0 A;  1F6S A;  1GEZ A;  1GB2 A;  3TXB A;  5I53 A;  4BAP A;  1LSP A;  5IDD A;  1BB6 A;  4H9H A;  2CWI A;  1LZC A;  1GB9 A;  4LYZ A;  1GBX A;  1GFV A;  4II8 A;  3EMS A;  4B4I A;  3RW8 A;  1YIK A;  1LMN A;  3CT5 A;  1LJG A;  2D4K A;  1SQ2 L;  1J1P Y; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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