4C5FA

Structure of lytic transglycosylase mltc from escherichia coli at 2.3 a resolution.
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
WVKDTNGFDILMGQFAHNIENIWGFKEVVIAGPKDYVKYTDQYQTRSHINFDDGTITIETIAGTEPAAHLRRAIIKTLLMGDDPSSVDLYSDVDDITISKEPFLYGQVVDNTGQPIRWEGRASNFADYLLKNRLKSRSNGLRIIYSVTINMVPNHLDKRAHKYLGMVRQASRKYGVDESLILAIMQTESSFNPYAVSRSDALGLMQVVQHTAGKDVFRSQGKSGTPSRSFLFDPASNIDTGTAYLAMLNNVYLGGIDNPTSRRYAVITAYNGGAGSVLRVFSNDKIQAANIINTMTPGDVYQTLTTRHPSAESRRYLYKVNTAQKSYRRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
source organism Escherichia coli
publication title Structure and Cell Wall Cleavage by Modular Lytic Transglycosylase Mltc of Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE C
total genus 114
structure length 330
sequence length 330
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2013-09-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
A PF11873 Mltc_N Membrane-bound lytic murein transglycosylase C, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4c5fA02
4DD1A 2ZYPA 1HF4A 4ETEA 2W1XA 2BQEA 3AW7A 4GN4A 4ETBA 1IC7Y 2LYZA 3LHMA 3K3TA 1JWRA 4B1AA 4KPMA 5LINA 3RZ4A 3B6LA 1YILA 1GXV2 4R0FA 1BWJA 1HMLA 1B9OA 1LZEA 4NSHA 3IWRA 4ANRA 4ETAA 1CJ6A 3CT1A 4NSGA 1IO5A 1BGIA 5KY1A 5B1FA 1CKFA 1IC4Y 1RE2A 1GF8A 1HFZA 4N0JA 1GFJA 1G7HC 3AJNA 4H90A 4H8XA 4H8ZA 4RLMA 3AZ5A 5FHWA 1HC0A 1IP7A 1JKBA 4MSTA 1WQMA 4O34A 1IP3A 1LJ3A 1H87A 2LYMA 4XJHA 4NY5A 132LA 3CT0A 3BKHA 3LN2A 2BQBA 5F16A 4KL7A 5FDJA 4OOOA 5II3A 4J0LA 4XJDA 5I54A 4DT3A 3A91A 2FYDA 1D6QA 1LYOA 1LSEA 2HEFA 1LYZA 2X0AA 5F9UA 1XEJA 4QDNA 3W3EA 1FLYA 2C8OA 4HSFA 3W6BA 1SQ2L 3T36A 2Z38A 4IATA 1GXXA 2Y8PA 4WO6A 3RT5X 3G3AB 2ZWBA 4KXIA 3AGIA 4X3BA 3RU5A 1HHLA 4OWHA 2Q0MX 5KXNA 1B5WA 154LA 1GE3A 5B05A 1OQMA 3LYTA 3TXIA 1JKCA 2DBTA 2YBMA 3AZ6A 4NEBA 4HTQA 3P65A 153LA 5ILCA 1IIZA 4LT2A 3WU9A 1GDWA 4H9AA 1C08C 1LHJA 1I1ZA 3D9AC 1YQVY 4NSJA 1REYA 3GXRA 4MR1A 1LSMA 2F2NA 1NQIA 4PGJB 2HEAA 4NG1A 1NMMA 1A2YC 4G49A 3AZ7A 2H5ZA 4YF2A 5F14A 5KXLA 1IP2A 3MGWA 3TXEA 3WUAA 3WU8A 3WYHA 1BB6A 1GF4A 2Z19A 1DPXA 3CSZA 5FSTA 2HECA 1XEIA 1LCNA 1V7TA 4HJYA 1GEZA 4WOAA 1ALCA 3GXKA 1GBXA 1NF5A 2ZNXY 5LIOA 5LVIA 1GFGA 1LZ4A 1GB3A 1AT5A 2WARA 1ZV5L 4OWEA 4HTKA 1YAPA 1REZA 3F6ZA 1LTMA 4NSIA 1LHKA 5KXOA 1IP1A 1LKRA 1LSPA 3W6AA 5KXPA 1JTPL 1VDSA 1LKSA 3TMVA 1IORA 3B0KA 4H9HA 3AW6A 3LZ2A 4B0DA 1E8LA 1BVXA 3RW8A 1I20A 4LYCA 1NDGC 4DYGA 3A6BY 194LA 1GFAA 4YM8A 1OUBA 4TSBA 4N1CC 1B5XA 5E4PA 1T3PA 4DD0A 5I4WA 4LGKA 1EL1A 3ATNA 1YAQA 1QDRA 2C8PA 1WTNA 5B06A 1BB4A 8LYZA 1QSWA 5K7OA 4ET9A 5HMVA 3B0IA 4DDAA 1LJGA 2XTHA 1GE1A 4LYOA 4C3WA 1B7LA 4HPEA 4XYYA 4GCFA 1LZ1A 3A94A 2CDSA 2HU1A 2YSSC 2LYOA 2Z2EA 4DD9A 4YEMA 135LA 1IOCA 1LSAA 4G4CA 5AMYA 1T6VL 3WPLA 4EOFA 1LPIA 1JJ0A 2G4NA 5HLLA 1IOQA 1EQEA 1QTKA 4H9EA 3CQLA 5DL9A 1GB5A 3VWOA 1TCYA 1CJ7A 4WL7A 1IR8A 1W08A 4NHSA 4H93A 4GLVA 4HJVA 4II8A 1LJNA 4HPIA 4HV2A 4PRQA 3P68A 3A93A 1P2CC 1GFTA 2Z2FA 3WUNA 3ULRA 5FEKA 2HEDA 3AGGG 1CKCA 2MECA 1DQJC 1GB7A 4WM4A 1HMKA 5C6LA 1GB9A 1G7LC 3W6EA 1DI3A 1UIFA 3A96A 4H91A 1BVKC 5EBHA 2HUBA 2W1LA 1BWHA 1HEQA 1GFVA 1DKKA 4RW1A 4PHIA 1NBZC 4XJIA 3WUMA 1UIHA 2D91A 2BQDA 5D5CA 5J7CA 1CKGA 4LYZA 2RSCA 1QIOA 1IP5A 1C7PA 1JJ3A 4GCDA 3QY4A 4NWHA 3N9EA 3OJPA 5I4YA 5KXSA 1UBZA 3D3DA 1F10A 1OUCA 2DQJY 2ZQ4A 1IP6A 4BAFA 1I56A 5LAGA 4H94A 4WM1A 4DD7A 4DDCA 4OW1A 3AB6A 1XGTC 2MEFA 1TAYA 3A90A 4GLAA 5A3EA 4ZIXA 2H9JA 4LFXA 1B0DA 5C6JA 1TDYA 3IJUA 1JJ1A 1IOSA 4G9SA 1LZTA 3A95A 3J4GA 2MEAA 5KKJA 4WMGA 2DQFC 4QY9A 3ATOA 1YL0X 4WLYA 1HFYA 4DDBA 5KXWA 3FI7A 4HJZA 1YROA 1LZCA 2F4GA 4H92A 2YBLA 3AGHA 3EBAB 1JTTL 4LYTA 1NKHA 4ZEEA 1GF9A 1IWVA 1W6ZA 4OWCA 207LA 5DN5A 4CGEA 5FCPA 1YL1X 4NHIA 2DQEY 3G3BB 2I26L 1B7OA 1IWWA 1YANA 4C5FA 5JENB 1LMAA 1GWDA 4NWEA 1YKXX 1LSDA 4AGAA 1F6RA 5HNLA 5KXTA 5LVJA 1WQOA 3A6CY 5D5FA 1AM7A 1GHLA 1C43A 1LSBA 1WVVA 2A7DA 4NGKA 1FLUA 5I53A 2Z39A 5E9RA 1FBIX 3T6UA 1GBZA 3LYMA 4U3XB 1VDQA 3A34A 2ZNWY 4B49A 1FKQA 4IJ4A 1IR9A 4NHPA 1PS5A 4OWAA 2B5ZA 1LJIA 1G7IC 4XADA 4WG1A 4G4BA 2XBRA 3WPJA 4TSCA 1CNSA 4TWSA 4NGWA 2HEEA 4NHTA 5LYTA 6LYZA 1GB8A 4GN5C 1IWUA 4H8YA 4WM2A 1LHMA 1IWYA 2ZYCA 1DI4A 5I5QA 4XJFA 3WPKA 5KKIA 4PPOA 5LYZA 1LSZA 2BQCA 3ZEKA 4TUNA 1DPWA 2MEDA 4DWXA 1TBYA 1WVUA 4NGJA 3RNXA 5LA5A 1DI5A 1LMNA 4LZTA 5C6IA 1UIDA 4NHQA 2BPUA 4QGZA 3N9CA 2CJLA 1UIAA 4DC4A 4GN3A 4Z3MA 4M4OA 2IHLA 1RFPA 1UICA 2EQLA 2IFFY 4NIJA 1XSFA 2BLYA 4PJ2C 2H9KA 3A92A 5KXMA 4WG7A 208LA 4N9RA 1FLWA 1GBSA 1BWIA 1LHHA 5DLAA 3CT5A 1DKJA 1VFBC 1PZYA 2I6ZA 1B7NA 1GB2A 2D4KA 1XEKA 1LMOA 1LYYA 4YENA 1LHLA 5L3HA 1KXYA 3ZVQA 4AXTA 5L9JA 1GF5A 3AYQA 4H1PA 2BQAA 1LOZA 1LSCA 1WQPA 4R6CA 5B07A 4G4HA 1ZVYB 3QE8A 1REMA 1C46A 2BLXA 3CSQA 3EMSA 1BB7A 4XN6A 1AZFA 1D0KA 4LYMA 4XJBA 5APCA 1HEWA 1LZAA 1HSXA 1QUSA 4XENA 1B2KA 2LZ2A 3LZTA 2BQOA 3LYOA 1B7MA 1JEFA 1D0LA 3FE0A 1YIKA 4N8ZA 1EQ4A 4RW2A 5LA8A 1RJCB 1CJ8A 1J1PY 1AKIA 4ET8A 4NGYA 3W6DA 1Z55A 2MEIA 3LYZA 1OUGA 2DQDY 3N9AA 1BB5A 4ML7A 4E3UA 1C45A 2Z12A 5KXYA 1HEPA 4HP0A 3WULA 3A3QA 3A3RX 3B0OA 3EXDA 4Z98A 5HMJA 4CFPA 5B59A 1FDLY 3A67Y 1KIPC 1AT6A 1TEWA 3TMWA 2DQAA 5LXWA 2BAAA 1O23A 4CHXA 1CKDA 1NHEA 2BQLA 2ZILA 1JSEA 2ZQ3A 5DN4A 4GCCA 1LZGA 3HFMY 1QSAA 1ZMYL 5L3IA 1FLQA 3TXKA 1GF0A 3W6FA 1JIYA 1LAAA 1LZ8A 1CKHA 1J1OY 3EO5A 3KAMA 3CSRA 4HTNA 6LYTA 2AUBA 1F0WA 2BQGA 1IY4A 4Z46A 1GFRA 1GAYA 1OUJA 4UWVA 4WLTA 1JUGA 3TMUA 3B72A 5APDA 1LZDA 1VEDA 2DQIY 2BQMA 3TXDA 1IP4A 3WMKA 1DXJA 2F30A 2N5ZA 1B5YA 1GFEA 1UIBA 3P66A 2BQJA 4RLNA 1HEMA 4UWUA 1ZVHL 2ZIKA 1VDTA 1LMQA 1QQYA 2G4QA 4W94A 4WLXA 2EPEA 1GBOA 3WVYA 1OUAA 1GE0A 1MLCE 3J6KA 1HSWA 1B5ZA 1IX0A 5KXXA 1YKZX 5LVGA 1VDPA 3WXUA 4LYBA 4NGIA 1IWZA 3ZVQB 1FKVA 1UUZC 1GDXA 1C10A 5F81A 1NDMC 1G7MC 9LYZA 134LA 1DZBX 5DM9A 1XFPL 1IWTA 2BQNA 1YAMA 4NGZA 1BHZA 1JTOL 2BQFA 2CWIA 2D4IA 2Z18A 1QDTA 2PC2A 1WTMA 1GF7A 1IVMA 2D6BA 1UA6Y 1IR7A 4NGOA 1LSNA 1GBYA 4KT3A 2EIZC 1MELL 1JISA 3E3DA 1HENA 2FBBA 1UACY 5APFA 4EMNA 1A4VA 1GFHA 1LZYA 1HFXA 1LMPA 1UIEA 4I8SA 5HNCA 5KXZA 5LYMA 1INUA 1GAZA 2EKSC 2G4PA 1GB0A 1GB6A 1JPOA 4DD2A 1JKAA 1CJ9A 1JSFA 1GBWA 1G7JC 1H6MA 1IEEA 1J1XY 1LSYA 2DKVA 1D6PA 4IASA 4MCKA 1UC0A 4WM3A 5LVKA 1LMCA 1GPQC 3IJVA 3WW6A 1WQQA 2MEBA 2BQIA 2YBNA 3BKVA 3P4ZA 4GCEA 5F9XA 3SP3A 3TMXA 4OWBA 1OUFA 4M6DA 5HQ1A 1GE4A 5APEA 4DD3A 3TXBA 1WQNA 2YBHA 5IHGA 1LYSA 1D9UA 1REXA 3M18B 1B7RA 4N1EI 1HERA 4W96A 4WLDA 4XJGA 1KIRC 1NWGA 2ZIJA 133LA 1LZ9A 3TXGA 1N4FA 4B4IA 2FBDA 1GF6A 4BADA 1KXWA 2W1YA 4YEOA 1LZ6A 4HV1A 4LT3A 3HBHA 4J1AA 4WL6A 1B7SA 4NGVA 1RCMA 1GFUA 1UIGA 1BQLY 1IWXA 2HEBA 3OK0A 2GV0A 1NBYC 4GCBA 1GF3A 4YOPA 3TXHA 2LHMA 2BQHA 1LHIA 3HBEX 1QTEA 4CJ2A 4PRUA 2MEHA 1B5VA 4H9CA 1KXXA 4H9IA 2HTXA 4J7VA 4L41A 4NFVA 4TX7A 1XGRC 3TXJA 3WW5A 4ETCA 4BS7A 1GEVA 1SLYA 3HBDA 1JKDA 3A8ZA 4A7DA 1LZBA 193LA 1OUEA 1UCOA 5FELA 4H9FA 1LSFA 1OUDA 1WQRA 1BB3A 5LVHA 1HELA 4QEQA 1EQ5A 2W1MA 2FYCA 1QUTA 7LYZA 4WM6A 3QNGA 1GFKA 3WXTA 2YBIA 1RI8B 1JITA 1FN5A 1OP9B 4FDYA 1B5UA 1HEOA 4UWNA 1LZNA 1XGUC 1LZRA 3TXFA 4B4EA 2YBJA 1IOTA 4WM5A 4J1BA 1IY3A 2MEGA 1HNLA 4WO9A 5A3ZA 1LJHA 5B1GA 2DQCY 5M1YA 3P64A 2YVBA 2CGIA 2MEEA 5KXRA 2Z37A 1VATA 2I25L 1B7PA 1KIQC 4I0CA 1B7QA 4H9BA 3AZ4A 2XJWA 4ETDA 4LT1A 4BAPA 5I4XA 3WH1A 4LFPA 5IDDA 3W6CA 1LJEA 1OUHA 3WU7A 1LZSA 4LT0A 5KJ9A 2D4JA 1F6SA 2DQHY 4N5RA 1VAUA 2VB1A 2LZTA 2DQGY 1LZ5A 5T3FA 5IELA 1LJFA 4TTDA 2NWDX 1YAOA 2YDGA 3M3UA 1LJKA 3CB7A 1XGQC 1LMTA 1YKYX 2HU3A 1GD6A 4FJRA 1OUIA 1JHLA 1XGPC 2A7FA 4CFOA 1IC5Y 4RDSA 3WVXA 5ILFA 2F4AA 4B4JA 5KXKA 3WL2A 1V7SA 4NG8A 4ZFPA 1LSGA 2XBSA 1LJJA 4NGLA 5LAFA 1D0MA 4OOTA 4Z41A 1LJ4A 2BQKA 4D9ZA 1GE2A 4P2EA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
120LA 1L89A 1D9WA 3AW7A 4GN4A 7LZMA 4B1AA 5LINA 3B6LA 2RBQA 3SB6A 4ETAA 2F32A 1L66A 1CJ6A 1KW5A 259LA 1BGIA 1CKFA 1IC4Y 1RE2A 1SSYA 103LA 1DYDA 158LA 1LJ3A 4XJHA 1H87A 3W6EA 132LA 2BQBA 4J0LA 3G3VA 169LA 2FYDA 1D6QA 2X0AA 2B75A 1C6IA 2OU8A 1FLYA 2Z38A 1GXXA 2ZWBA 154LA 209LA 1OQMA 3LYTA 115LA 5I14A 2NTGA 228LA 3AZ6A 3P65A 3D9AC 1PQOA 3DKEX 4MR1A 4PGJB 2HEAA 1L93A 4G49A 2H5ZA 5KXLA 4HJYA 239LA 1L97A 4WOAA 1LI6A 1GBXA 1NF5A 205LA 2WARA 4HTKA 1QS9A 1YAPA 1LTMA 1IP1A 1LSPA 1P46A 1JTPL 3TMVA 2F47A 4H9HA 1E8LA 4LYCA 3DNAA 1PQKA 4DYGA 1D2YA 4TSBA 1T3PA 1QDRA 2B6WA 5HMVA 1B7LA 1L80A 1CU5A 1QTBA 3CQLA 1L58A 3VWOA 4LDOA 1IR8A 1W08A 4NHSA 151LA 4H93A 4GLVA 3P68A 3A93A 1GFTA 3ULRA 3DN0A 3GUPA 4WM4A 1L86A 1GB9A 1BVKC 218LA 1XEPA 1CV5A 3C82A 1IP5A 1C7PA 210LA 157LA 5I4YA 3D3DA 1F10A 4W52A 4OW1A 3HWLA 1XGTC 1DYBA 2MEFA 1TAYA 3A90A 5C6JA 1TDYA 3IJUA 4WMGA 1L82A 4QY9A 3HDFA 1HFYA 187LA 1C6CA 3EBAB 1L69A 233LA 5DN5A 1YL1X 1L03A 4C5FA 1LMAA 1GWDA 4NWEA 3C7WA 238LA 1LSBA 5I53A 3OE0A 2Z39A 4U3XB 4B49A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4DD1 A;  2ZYP A;  1HF4 A;  4ETE A;  2W1X A;  2BQE A;  3AW7 A;  4GN4 A;  4ETB A;  1IC7 Y;  2LYZ A;  3LHM A;  3K3T A;  1JWR A;  4B1A A;  4KPM A;  5LIN A;  3RZ4 A;  3B6L A;  1YIL A;  1GXV 2;  4R0F A;  1BWJ A;  1HML A;  1B9O A;  1LZE A;  4NSH A;  3IWR A;  4ANR A;  4ETA A;  1CJ6 A;  3CT1 A;  4NSG A;  1IO5 A;  1BGI A;  5KY1 A;  5B1F A;  1CKF A;  1IC4 Y;  1RE2 A;  1GF8 A;  1HFZ A;  4N0J A;  1GFJ A;  1G7H C;  3AJN A;  4H90 A;  4H8X A;  4H8Z A;  4RLM A;  3AZ5 A;  5FHW A;  1HC0 A;  1IP7 A;  1JKB A;  4MST A;  1WQM A;  4O34 A;  1IP3 A;  1LJ3 A;  1H87 A;  2LYM A;  4XJH A;  4NY5 A;  132L A;  3CT0 A;  3BKH A;  3LN2 A;  2BQB A;  5F16 A;  4KL7 A;  5FDJ A;  4OOO A;  5II3 A;  4J0L A;  4XJD A;  5I54 A;  4DT3 A;  3A91 A;  2FYD A;  1D6Q A;  1LYO A;  1LSE A;  2HEF A;  1LYZ A;  2X0A A;  5F9U A;  1XEJ A;  4QDN A;  3W3E A;  1FLY A;  2C8O A;  4HSF A;  3W6B A;  1SQ2 L;  3T36 A;  2Z38 A;  4IAT A;  1GXX A;  2Y8P A;  4WO6 A;  3RT5 X;  3G3A B;  2ZWB A;  4KXI A;  3AGI A;  4X3B A;  3RU5 A;  1HHL A;  4OWH A;  2Q0M X;  5KXN A; 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 2HTX A;  4J7V A;  4L41 A;  4NFV A;  4TX7 A;  1XGR C;  3TXJ A;  3WW5 A;  4ETC A;  4BS7 A;  1GEV A;  1SLY A;  3HBD A;  1JKD A;  3A8Z A;  4A7D A;  1LZB A;  193L A;  1OUE A;  1UCO A;  5FEL A;  4H9F A;  1LSF A;  1OUD A;  1WQR A;  1BB3 A;  5LVH A;  1HEL A;  4QEQ A;  1EQ5 A;  2W1M A;  2FYC A;  1QUT A;  7LYZ A;  4WM6 A;  3QNG A;  1GFK A;  3WXT A;  2YBI A;  1RI8 B;  1JIT A;  1FN5 A;  1OP9 B;  4FDY A;  1B5U A;  1HEO A;  4UWN A;  1LZN A;  1XGU C;  1LZR A;  3TXF A;  4B4E A;  2YBJ A;  1IOT A;  4WM5 A;  4J1B A;  1IY3 A;  2MEG A;  1HNL A;  4WO9 A;  5A3Z A;  1LJH A;  5B1G A;  2DQC Y;  5M1Y A;  3P64 A;  2YVB A;  2CGI A;  2MEE A;  5KXR A;  2Z37 A;  1VAT A;  2I25 L;  1B7P A;  1KIQ C;  4I0C A;  1B7Q A;  4H9B A;  3AZ4 A;  2XJW A;  4ETD A;  4LT1 A;  4BAP A;  5I4X A;  3WH1 A;  4LFP A;  5IDD A;  3W6C A;  1LJE A;  1OUH A;  3WU7 A;  1LZS A;  4LT0 A;  5KJ9 A;  2D4J A;  1F6S A;  2DQH Y;  4N5R A;  1VAU A;  2VB1 A;  2LZT A;  2DQG Y;  1LZ5 A;  5T3F A;  5IEL A;  1LJF A;  4TTD A;  2NWD X;  1YAO A;  2YDG A;  3M3U A;  1LJK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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