4C66A

Discovery of epigenetic regulator i-bet762: lead optimization to afford a clinical candidate inhibitor of the bet bromodomains
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title Discovery of Epigenetic Regulator I-Bet762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Cell cycle
total genus 43
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4c66A01
3LQHA 4TZ2A 4TYLA 5EWVA 3SVHA 5IGNA 5ETBA 4UIXA 5LVRA 3I3JA 3ONIA 4HXNA 4YH3A 4NUEA 4CUPA 5EV9A 4QZSA 2GRCA 5E73A 4ZC9A 3RCWA 5FG6A 5HRXA 4QNSA 4YBMA 4QY4A 4X2IA 4ALGA 3SVGA 4MEQA 4O75A 5L96A 5K29A 2DATA 5F63A 5COIA 5HELA 5LJ0A 4YC9A 4N4HA 5HFQA 4NR8A 2RNWA 2D82A 4IR3A 4NYVA 5A81A 3P5OA 5JI8A 4YYHA 3Q2FA 4J1PA 2NXBA 4CL9A 3MUKA 4O7AA 5EGUA 4YYMA 5A5RA 5II1A 5KTXA 4TS8A 3DAIA 4NUCA 2YQDA 5DX4A 4PCEA 5CUGA 4DONA 2WP2A 4KV4A 5ENHA 5DFCA 3JVKA 5HJCA 5CGPA 4BW1A 1ZS5A 5CZGA 5LJ1A 3P1EA 4YH4A 4QSPA 4MENA 2RI7A 5F3AA 3P1CA 5D3LA 4XUBA 2DVRA 4UYGA 4TTEA 5BT4A 3UV2A 4CUUA 4LDFA 4QB3A 4UIVA 5A5PA 2YELA 5DLZA 5AD2A 5HM0A 5E7DA 2R10A 2WP1A 4XYAA 5I80A 4MR6A 5I88A 4TU6A 5EI4A 5E9YA 5CQAA 5H1TA 3Q2EA 4LZRA 5FFYA 5EWDA 4HXSA 4PCIA 5CUBA 5FFWA 3UV5A 4A9IA 5CS8A 5H1UA 4HXKA 4QEUA 5A5QA 3MXFA 4HXLA 3U5NA 5CQ3A 5FB1A 3AADA 4HBXA 4Z1QA 5FDZA 4NYXA 3LJWA 3SVFA 5G4RA 5FE4A 5EPBA 4BW4A 4BW2A 2MJVB 5HENA 5FG4A 3G0LA 5F60A 5E3GA 4YABA 5H1VA 5F5ZA 4A9JA 5F25A 4PTBA 5LUUA 5LKUA 5FB0A 4FLPA 5CPEA 4UYDA 4AKNA 4PS5A 5J0DA 2DWWA 4O72A 3U5JA 5D26A 4IORA 4J0RA 5L98A 5I83A 4TT2A 4QSSA 5CRZA 5D3NA 4NR5A 5CQTA 5CQ4A 3NXBA 4BJXA 5DFDA 5E3DA 3ZYUA 4MEPA 5L99A 4NXJA 4CFKA 4KV1A 2RFJA 5CUDA 4PY6A 2DVQA 5DLXA 2L84A 4YBSA 5F1HA 5CQ7A 5KTUA 4BW3A 2R0YA 5EK9A 4QSRA 4QC1A 2G4AA 3O34A 5HRWA 4QR5A 4WIVA 5DW1A 5FG5A 4Z6HA 4E96A 4RVRA 4NR4A 1JSPB 5A5OA 3UVWA 3S92A 4NS5A 5CTLA 3JVLA 5JWMA 5HQ5A 3JVMA 4HXRA 3K2JA 5E9VA 4LZ2A 1X0JA 4HBWA 4N3WA 5A85A 5FH8A 3U5MA 5D3SA 4NYWA 2RS9B 5E9KA 5I86A 4Q0OA 5D3PA 5I1QA 3UVYA 3UV4A 3D7CA 4MR5A 4HXPA 3UW9A 4A9HA 3P1DA 4QSQA 4CFLA 4QSXA 4NQMA 5D3TA 5DFBA 4NR6A 3O35A 5CU8A 5IIDA 4YY4A 5TCMA 4NRAA 5D7XA 4CUQA 4XY9A 4QYLA 3QZSA 5L8UA 4QSTA 5ENBA 4IR6A 5EU1A 4OGIA 2RO1A 4YYGA 4CUTA 5D25A 4YYKA 5FE5A 2R0SA 5ACYA 4QSVA 3HMEA 5D24A 2I7KA 4A9MA 5IGMA 4O78A 5LKXA 3HMHA 5HQ7A 3O33A 4J3IA 4N4IA 5ENGA 5EP7A 5C8GA 4C67A 5A83A 4LRGA 4HBVA 4TT6A 4QEWA 2I8NA 5ENJA 3U5OA 1EQFA 5DKCA 3MQMA 2YYNA 5ETDA 4F3IA 2DKWA 5FE9A 4O74A 5LJ2A 5CQ8A 5KTWA 5EA1A 2RNYA 5CFWA 3FKMX 4IR4A 5DKHA 2KTBB 4QEVA 1WUGA 5E74A 5ENFA 5CUAA 4J0SA 2E3KA 3G0JA 5A82A 5KU3A 5EVAA 5F2PA 4WHWA 5EWHA 4A9EA 4TU4A 4A9LA 4C66A 4KCXA 4ZQLA 5II2A 2F6JA 5CQ6A 3MB4A 4UIUA 4MR3A 4TQNA 4IR5A 4LC2A 4NQNA 4QSUA 4QR3A 2RNXA 4MR4A 4O7CA 5L8TA 4Z6IA 4UYFA 5FE0A 1N72A 4QSWA 2DVSA 4A9FA 5EICA 3MB3A 5CP5A 5L97A 4YATA 4HBYA 3U5LA 2OUOA 4NR9A 5C4QA 5HQ6A 4O7EA 5EQ1A 2FSAA 5AMFA 3IU5A 5CQ5A 2R0VA 4LR6A 3S91A 5CY9A 5EM3A 4UIZA 5H85A 4A9NA 5C89A 4IOQA 1WUMA 4CURA 5A7CA 3O37A 4N4GA 5DYCA 3U5KA 1F68A 4O70A 5I7YA 4YADA 3DWYA 5IBNA 4NR7A 5EPRA 1JM4B 5FE2A 5HEMA 5C85A 3HMFA 5D3RA 5FH6A 3AQAA 4NUDA 4YYIA 4PKLA 3LQIA 5I7XA 5BT3A 3U5PA 4ZW1A 2F6NA 4O7FA 5DYAA 5F1LA 5F36A 5D3JA 5DW2A 5E9LA 5AD3A 4O76A 5LKZA 5HCLA 4NRCA 2H60A 5CUEA 5FBXA 4YAXA 3LQJA 5I29A 5I89A 5I40A 4TZ8A 5FFVA 5G4SA 4XUAA 5KHMA 3UVXA 2D9EA 3P1FA 4A9OA 2YEKA 4QUTA 5TB6A 1E6IA 5BT5A 4A9KA 2L5EA 2E7NA 2L85A 4UYFB 4ALHA 4LYWA 5ENIA 4UIWA 5IG6A 5DY7A 4Z1SA 4UYEA 2OO1A 5CUCA 4CUSA 3QZVA 5ENEA 4CLBA 4WHUA 5LKTA 5F61A 5C87A 5LVQA 5EWWA 5A5NA 5IGLA 5FE3A 3MULA 4YYDA 5E9MA 3GG3A 5DBMA 5IGKA 4N4FA 5AMEA 5EISA 4YBTA 2YDWA 2N9GA 5HLSA 4HXMA 5HRVA 5EPSA 4HXOA 4YK0A 5A5SA 4TT4A 2OSSA 4O77A 3TLPA 5FE7A 4OUFA 5FE8A 4MEOA 4BHWA 5D0CA 4LZSA 4XY8A 5HFRA 5FE1A 2LSPB 2E7OA 4GPJA 4LYIA 4NRBA 4UYHA 5DYXA 5ENCA 4YYJA 3UVDA 4QC3A 5KO4A 2DVVA 5EWCA 4QR4A 4UIYA 4YY6A 4QYDA 5D3HA 3IU6A 4QBMA 4OGJA 4O7BA 4Z93A 4LYSA 5F62A 4O71A 5FH7A 2YEMA 5E0RA 4YYNA 5C7NA 4Q0NA 3JVJA 3O36A 4Y03A 4UITA 2YW5A 5DKDA 4QUUA 4IOOA 3LXJA 5DYUA 5CRMA 5E9IA 3QZTA 5FE6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3LQHA 4TZ2A 4TYLA 5EWVA 3SVHA 5IGNA 5ETBA 4UIXA 5LVRA 3I3JA 3ONIA 4HXNA 4YH3A 4NUEA 4CUPA 5EV9A 4QZSA 2GRCA 5E73A 4ZC9A 3RCWA 5FG6A 5HRXA 4QNSA 4YBMA 4QY4A 4X2IA 4ALGA 3SVGA 4MEQA 4O75A 5L96A 5K29A 2DATA 5F63A 5COIA 5HELA 5LJ0A 4YC9A 4N4HA 5HFQA 4NR8A 2RNWA 2D82A 4IR3A 4NYVA 5A81A 3P5OA 5JI8A 4YYHA 3Q2FA 4J1PA 3VKGA 2NXBA 4CL9A 3MUKA 4O7AA 5EGUA 4YYMA 5A5RA 5II1A 5KTXA 4TS8A 3DAIA 4NUCA 2YQDA 5DX4A 4PCEA 5CUGA 4DONA 2WP2A 4KV4A 5ENHA 5DFCA 3JVKA 5HJCA 5CGPA 4BW1A 1ZS5A 5CZGA 5LJ1A 3P1EA 4YH4A 4QSPA 4MENA 2RI7A 5F3AA 3P1CA 5D3LA 4XUBA 2DVRA 4UYGA 4TTEA 5BT4A 3UV2A 4CUUA 4LDFA 4QB3A 4UIVA 5A5PA 2YELA 5DLZA 3D1DA 5AD2A 5HM0A 5E7DA 2R10A 2WP1A 4XYAA 5I80A 4MR6A 5I88A 4TU6A 5EI4A 5E9YA 5CQAA 5H1TA 3Q2EA 4LZRA 5FFYA 5EWDA 4HXSA 4PCIA 5CUBA 5FFWA 3UV5A 4A9IA 5CS8A 5H1UA 4HXKA 4QEUA 5A5QA 3MXFA 4HXLA 3U5NA 5CQ3A 5FB1A 3AADA 4HBXA 4Z1QA 5FDZA 4NYXA 3LJWA 3SVFA 5G4RA 5FE4A 5EPBA 4BW4A 4BW2A 2MJVB 5HENA 5FG4A 3G0LA 5F60A 5E3GA 4YABA 5H1VA 5F5ZA 4A9JA 5F25A 4PTBA 5LUUA 5LKUA 1ZKRA 5FB0A 4FLPA 5CPEA 4UYDA 4AKNA 4PS5A 5J0DA 2DWWA 4O72A 3U5JA 5D26A 4IORA 4J0RA 5L98A 5I83A 4TT2A 4QSSA 5CRZA 5D3NA 4NR5A 5CQTA 5CQ4A 3NXBA 4BJXA 5DFDA 5E3DA 3ZYUA 4MEPA 5L99A 4NXJA 4CFKA 4KV1A 2RFJA 5CUDA 4PY6A 2DVQA 5DLXA 2L84A 4YBSA 5F1HA 5CQ7A 4AKHA 5KTUA 4BW3A 2R0YA 5EK9A 4QSRA 4QC1A 2G4AA 3O34A 5HRWA 4QR5A 4WIVA 5DW1A 5FG5A 4Z6HA 4E96A 4RVRA 4NR4A 1JSPB 5A5OA 3UVWA 3S92A 4NS5A 5CTLA 3JVLA 5JWMA 5HQ5A 3JVMA 3VKHA 4HXRA 3K2JA 5E9VA 4LZ2A 1X0JA 4HBWA 4N3WA 5A85A 5FH8A 3U5MA 3D1BA 5D3SA 4NYWA 2RS9B 5E9KA 5I86A 4Q0OA 5D3PA 5I1QA 3UVYA 3UV4A 3D7CA 4MR5A 4HXPA 3UW9A 4A9HA 3P1DA 4QSQA 4AI6A 4CFLA 4QSXA 4NQMA 5D3TA 5DFBA 4NR6A 3O35A 5CU8A 5IIDA 4YY4A 5TCMA 4NRAA 5D7XA 4CUQA 4XY9A 4QYLA 3QZSA 5L8UA 4QSTA 5ENBA 4IR6A 5EU1A 4OGIA 2RO1A 4YYGA 4CUTA 5D25A 4YYKA 5FE5A 2R0SA 5ACYA 4QSVA 3HMEA 5D24A 2I7KA 4A9MA 5IGMA 4O78A 5LKXA 3HMHA 5HQ7A 3O33A 4J3IA 4N4IA 5ENGA 5EP7A 5C8GA 4C67A 5A83A 4LRGA 4HBVA 4TT6A 4QEWA 2I8NA 2EJNA 5ENJA 3U5OA 1EQFA 5DKCA 3MQMA 2YYNA 5ETDA 4F3IA 2DKWA 5FE9A 4O74A 5LJ2A 5CQ8A 5KTWA 5EA1A 2RNYA 5CFWA 3FKMX 4IR4A 5DKHA 2KTBB 4QEVA 1WUGA 5E74A 5ENFA 5CUAA 4J0SA 2E3KA 3G0JA 5A82A 5KU3A 5EVAA 5F2PA 4WHWA 5EWHA 4A9EA 4TU4A 4A9LA 4C66A 4KCXA 4ZQLA 5II2A 2F6JA 5CQ6A 3MB4A 4UIUA 4MR3A 4TQNA 4IR5A 4LC2A 4NQNA 4QSUA 4QR3A 2RNXA 4MR4A 4O7CA 5L8TA 4Z6IA 4UYFA 5FE0A 1N72A 4QSWA 2DVSA 4A9FA 5EICA 3MB3A 5CP5A 5L97A 4YATA 4HBYA 3U5LA 2OUOA 4NR9A 5C4QA 5HQ6A 4O7EA 5EQ1A 2FSAA 5AMFA 3IU5A 5CQ5A 2R0VA 4LR6A 3S91A 5CY9A 5EM3A 4UIZA 5H85A 4A9NA 5C89A 4IOQA 1WUMA 4CURA 5A7CA 3O37A 4N4GA 5DYCA 3U5KA 1F68A 4O70A 5I7YA 4YADA 3DWYA 5IBNA 4NR7A 5EPRA 1JM4B 5FE2A 5HEMA 5C85A 3HMFA 5D3RA 5FH6A 3AQAA 4NUDA 4YYIA 1PUOA 4PKLA 3LQIA 5I7XA 5BT3A 3U5PA 4ZW1A 2F6NA 4O7FA 5DYAA 5F1LA 5F36A 5D3JA 5DW2A 5E9LA 5AD3A 3ERRA 4O76A 5LKZA 5HCLA 4NRCA 2H60A 5CUEA 5FBXA 4YAXA 3LQJA 5I29A 5I89A 5I40A 4TZ8A 5FFVA 5G4SA 4XUAA 5KHMA 3UVXA 2D9EA 3P1FA 4A9OA 2YEKA 4QUTA 5TB6A 1E6IA 5BT5A 4A9KA 2L5EA 2E7NA 2L85A 4UYFB 4ALHA 4LYWA 5ENIA 4AKGA 4UIWA 5IG6A 5DY7A 4Z1SA 4UYEA 2OO1A 5CUCA 4CUSA 3QZVA 5ENEA 4CLBA 4WHUA 5LKTA 5F61A 5C87A 5LVQA 5EWWA 5A5NA 5IGLA 5FE3A 3MULA 4YYDA 5E9MA 3GG3A 5DBMA 5IGKA 4N4FA 5AMEA 5EISA 4YBTA 2YDWA 2N9GA 5HLSA 4HXMA 5HRVA 5EPSA 4HXOA 4YK0A 5A5SA 4TT4A 2OSSA 4O77A 3TLPA 5FE7A 4OUFA 5FE8A 4MEOA 4BHWA 5D0CA 4LZSA 4XY8A 4AKIA 5HFRA 5FE1A 2LSPB 2E7OA 4GPJA 4LYIA 4NRBA 4UYHA 5DYXA 5ENCA 4YYJA 3UVDA 4QC3A 5KO4A 2DVVA 5EWCA 4QR4A 4UIYA 4YY6A 4QYDA 5D3HA 3IU6A 4QBMA 4OGJA 4O7BA 4Z93A 4LYSA 5F62A 4O71A 5FH7A 2YEMA 5E0RA 4YYNA 5C7NA 4Q0NA 3JVJA 3O36A 4Y03A 4UITA 2YW5A 5DKDA 4QUUA 4IOOA 3LXJA 5DYUA 5CRMA 5E9IA 3QZTA 5FE6A
chains in the Genus database with same CATH topology
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