4C66A

Discovery of epigenetic regulator i-bet762: lead optimization to afford a clinical candidate inhibitor of the bet bromodomains
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
126
structure length
126
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Discovery of Epigenetic Regulator I-Bet762: Lead Optimization to Afford a Clinical Candidate Inhibitor of the Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
molecule tags Cell cycle
source organism Homo sapiens
total genus 43
structure length 126
sequence length 126
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-09-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4c66A01
5F36A 4NYWA 4N4FA 5E73A 3SVGA 2D82A 3DAIA 3JVLA 5ENJA 4Z1QA 5ETDA 4A9HA 4IOQA 4ZQLA 5FE1A 3O33A 3SVFA 2YEMA 4PCIA 2RO1A 3LJWA 5D3RA 2DATA 4O72A 5D3NA 5BT5A 5HEMA 3UV2A 3AQAA 3O36A 2YYNA 4IOOA 5F1LA 5IGLA 5CS8A 4LZSA 4MEOA 4BW1A 5EWVA 1EQFA 4TT2A 5FBXA 4A9KA 5C4QA 5CQAA 3QZTA 4HXLA 5CRMA 5FFVA 2RI7A 5CFWA 5A5QA 3P5OA 5I80A 4HBXA 5A5PA 2YW5A 5I40A 3U5JA 5EV9A 3SVHA 4YATA 4QC3A 4UIZA 5DKHA 2YEKA 4Z1SA 4QEVA 4MR4A 4WIVA 5CUEA 3MUKA 4CUTA 4TU6A 3Q2FA 4QUTA 4BW2A 4Y03A 3I3JA 4NXJA 1E6IA 5HENA 4HBYA 3AADA 2H60A 5CZGA 4MEPA 5KTUA 4QSSA 4A9MA 2RS9B 3U5NA 4HXMA 2RNWA 4QR5A 5FE7A 4XYAA 3U5LA 4KCXA 4UIXA 4YH3A 5DYCA 4YBSA 2DVRA 5C89A 5CQ4A 5EISA 5KHMA 5L8TA 4HXSA 4HXKA 5II1A 4FLPA 4HXOA 4QUUA 4NYXA 4Z6HA 5LKTA 2KTBB 4NR9A 4YC9A 4BW4A 5FH7A 4LR6A 4NQMA 4XUBA 5G4RA 4OGIA 5HJCA 5HQ5A 5A82A 4IR4A 4UITA 4NRBA 4LYSA 4N4HA 5ENEA 5L99A 5H1UA 5HCLA 5CUCA 5BT3A 5DY7A 5DYAA 5CUDA 4QR4A 3HMHA 4YAXA 3G0LA 3UW9A 4QSWA 4QZSA 5F62A 5HLSA 5HFQA 4A9LA 1N72A 5DBMA 4CFLA 4UIYA 5EWCA 5CU8A 5DFCA 5FB1A 5EPSA 5KTXA 5LJ0A 3LXJA 5TB6A 5CUAA 5LKUA 4CUUA 4QSRA 4NR6A 5CTLA 4A9JA 4J0SA 5A5RA 3O34A 4IR3A 5CUGA 4OGJA 3IU6A 4UYFB 5D3HA 3HMFA 4CUQA 5L96A 5F63A 5HELA 4AKNA 4NUDA 2DVQA 2E7NA 2NXBA 3G0JA 4O7EA 5IGNA 3QZVA 4PTBA 4NRCA 5D3SA 4PY6A 5JI8A 5L98A 5CRZA 2L84A 5AD2A 5E9IA 4QR3A 4UYEA 3QZSA 3U5KA 5FE3A 5AMFA 5FE8A 5FE0A 4NRAA 5FB0A 2DVVA 5D0CA 4UYDA 2OO1A 4ZC9A 5D7XA 2YDWA 4QC1A 4E96A 5E9MA 3UVXA 5EK9A 5H1VA 5DFDA 5FFWA 4QSXA 4YYDA 2DVSA 5D3LA 3D7CA 2MJVB 5FFYA 4Z6IA 4A9NA 4LDFA 5A7CA 4CUPA 4O77A 3Q2EA 4WHWA 4O74A 4WHUA 5LKXA 4QEWA 4QSTA 5ETBA 5IGMA 4NUCA 4A9IA 5I86A 4QYDA 4LZ2A 5CQ7A 4QB3A 5CGPA 5EM3A 5ACYA 4PS5A 4UYFA 5IBNA 4N4IA 5DYXA 4YYHA 4XY8A 5LKZA 5CQ8A 4TZ2A 5F5ZA 5E9KA 5LJ2A 4TT6A 5LJ1A 4CFKA 3UVDA 5I83A 5HFRA 5ENFA 4CUSA 2DKWA 4Q0OA 4J3IA 5DYUA 2RNXA 4YYNA 3MB3A 5K29A 4ALHA 5F60A 4PCEA 5CUBA 5L97A 5E9VA 4A9OA 5EA1A 5J0DA 2DWWA 4HXRA 4TZ8A 4YABA 4LC2A 5LUUA 2YQDA 2R10A 4MR5A 5DX4A 3UV4A 2R0SA 3UVYA 3MQMA 5C87A 4YY6A 4GPJA 5E0RA 4ZW1A 5FH8A 4LZRA 3RCWA 2I8NA 3P1EA 4OUFA 4UIWA 4C66A 5DW2A 5EVAA 4O78A 5A5NA 5C7NA 4O75A 5AD3A 1WUGA 1F68A 2R0YA 4NS5A 5CQTA 5LVRA 3JVMA 5ENCA 3ONIA 5CQ6A 2GRCA 3P1DA 4TS8A 2RNYA 5DLZA 5ENHA 2FSAA 4KV1A 3P1FA 4UIUA 2N9GA 5E3DA 5F61A 2L85A 5II2A 5CPEA 4QEUA 4UYHA 4XY9A 5EQ1A 4BW3A 2F6NA 4QSPA 4MR6A 4LYIA 1ZS5A 4HBWA 4RVRA 4HXNA 5TCMA 4O70A 4YK0A 5EWWA 4NR7A 4J1PA 5DFBA 4HBVA 2LSPB 2E3KA 5E7DA 4QSVA 4YY4A 5D3JA 4NUEA 5FG5A 5AMEA 4PKLA 5D3PA 1JSPB 3O37A 4TU4A 4TT4A 2OUOA 5FG6A 2F6JA 5EU1A 3LQHA 5EI4A 3S92A 4J0RA 5H85A 5HRVA 4YYGA 5HQ6A 3U5PA 4IR5A 4LYWA 5G4SA 5FE6A 4N3WA 5EGUA 5HQ7A 4YADA 4XUAA 3NXBA 5H1TA 5C8GA 5EPBA 4HXPA 5FE5A 4YYMA 4YYJA 4X2IA 5IIDA 4O7FA 4YYKA 5BT4A 3GG3A 4ALGA 1X0JA 4O7AA 4YH4A 5D26A 4DONA 4A9EA 5KTWA 3IU5A 5COIA 4CLBA 2G4AA 3U5MA 4A9FA 4BHWA 5ENIA 4NR8A 5EP7A 4QSUA 4QBMA 5A5OA 4TYLA 5CQ3A 2L5EA 4CL9A 5I89A 5I7XA 3LQIA 4YBMA 5HRXA 4CURA 3ZYUA 5ENBA 2D9EA 4NYVA 4UIVA 4MEQA 5EWHA 1JM4B 4BJXA 3TLPA 5I29A 3JVKA 5DLXA 3HMEA 4IR6A 5ENGA 4TQNA 2RFJA 5D24A 4MR3A 4Q0NA 4NR4A 5CP5A 3LQJA 5E9LA 4C67A 2I7KA 2WP2A 4MENA 5CY9A 1WUMA 2R0VA 5JWMA 5F2PA 5A83A 2YELA 3S91A 4IORA 5F25A 4QNSA 4YBTA 4QY4A 4KV4A 5D25A 5FE4A 5FH6A 4N4GA 4TTEA 4O7CA 4QSQA 5F3AA 5A5SA 4Z93A 3P1CA 3UV5A 5HM0A 2E7OA 4NQNA 4O76A 5EICA 5EWDA 5E74A 5FE9A 4O71A 5F1HA 3MB4A 5IG6A 3MXFA 3FKMX 5EPRA 5I7YA 5DKDA 4F3IA 5FDZA 5D3TA 5FE2A 5I1QA 5L8UA 3DWYA 2OSSA 5CQ5A 3U5OA 5E3GA 3O35A 5A85A 3UVWA 5E9YA 5I88A 4UYGA 4NR5A 2WP1A 4O7BA 3K2JA 4YYIA 5LVQA 5KO4A 3MULA 5IGKA 5KU3A 4QYLA 4LRGA 5FG4A 5DKCA 3JVJA 5HRWA 5C85A 5DW1A 5A81A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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