4CBUA

Crystal structure of plasmodium falciparum actin i
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
365
structure length
357
Chain Sequence
EDVQALVVDNGSGNVKAGVAGDDAPRSVFPSIVGRPKNPKDAFVGDEAQTKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRAAPEEHPVLLTEAPLNPKGNRERMTQIMFESFNVPAMYVAIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTEYLMKILHERGYGFSTSAEKEIVRDIKEKLCYIALNFDEEMKTSEQSSDIEKSYELPDGNIITVGNERFRCPEALFQPSFLGKEAAGIHTTTFNSIKKCDVDIRKDLYGNIVLSGGTTMYEGIGERLTRDITTLAPSTMKIKVVAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQQMWITKEEYDESGP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN-1
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Motor protein
total genus 119
structure length 357
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbuA03
1KAXA 3O8MA 3LDNA 3TPQA 3C7NB 3HBTA 3LDLA 2ZGYA 2P9LA 1V4TA 3CJAA 4H5WA 3VF6A 1ATSA 2P9IB 3UKRB 4ISFA 3BF3A 3IMXA 3QFUA 3WXKA 2PAVA 4BRCA 4CZFA 1IJJA 3D2FB 1WUAA 4FWSA 3CIPA 3MDQA 3BP8A 3SMSA 3LDQA 5JLHA 3VETA 5AQRA 2P9LB 3O80A 4H0PA 4IXCA 2IVNA 4WQ5C 2A3ZA 3O5BA 4MLHA 3BUZB 2A41A 2I7PA 3QDKA 3H45C 1MWKA 3S41A 2V51B 3VF2A 4B1VA 3UB5A 1NGCA 1P8ZA 2ASPA 2NZTA 4FL9A 3BF1A 4BR0A 2Q0UA 2YHYA 4CBUA 4BR2A 5LJVA 3SLCA 4BRIA 1BUPA 3FZMA 4CZGA 3VEXA 4BR5A 4FO0A 2E2PA 4J8FA 3CJ9A 2FSJA 2AP1A 2IVPA 3AAQA 3JS6A 4B1UB 4QS9A 2YI1A 1SZ2A 2J4RA 3FZKA 5LY3A 3VEYA 2W41A 4DHYA 4RTFD 5EY4A 1BU6O 2YJFA 2P9SA 2V7YA 4DCHA 3F9MA 3QICA 3J8AA 3O6WA 3RSEA 2QWMA 4H0OA 4MO5A 4MO4A 1V4SA 4CZKA 4BRLA 2P9SB 3KZBA 2GTDA 4GNIA 2HF3A 4JNEA 1YUWA 4BVPA 1BA0A 3MN9A 1NGBA 3RSEB 2E2QA 1X3MA 3CETA 3EN9A 1H1VA 3QMLA 4E1JA 1BG3A 2CH6A 4B1XB 3CHWA 3ATUA 4CZIA 4BQZA 4A61A 4CBXA 1C0FA 4BC2A 4EHTA 1D4XA 3VGKA 3U9ZA 4BRAA 5B8HA 3VEZA 5BN9A 4BG8A 3GE1A 3CQXA 4BRDA 5I9EB 1ZC6A 4KBOA 3JXUA 5EVZA 4BRFA 5BPNA 1NGDA 3AY9A 2P9KA 4L3QA 2YHXA 3IDHA 5AFUA 5BN8A 3L0QA 3O1WA 2EWSA 2F9TA 4CD1A 2GEMA 2W40A 3O08A 4FWMA 4BRQA 2KHOA 4EHUA 4BRNA 3KVGA 3UKUA 1QQOA 1S3XA 1RDWX 2P9KB 5AQOA 3ZX3A 2D0OA 3L4IA 3D2EA 5AQWA 1HKBA 5BRFA 3L6QA 4YDUC 5ADXA 5JLFA 3O4WA 4EFHA 2E20A 5KQDA 3VESA 5LJWA 3FLCO 1Z6RA 3UKUB 4FWKA 2FSNA 3EO3A 4F9OA 5BRDA 2CH5A 3VEWA 1CZAN 2OANA 4FPBA 5AQHA 3D2EB 5AQFA 2NLXA 1HX1A 3GG4A 3KHYA 4RCHA 5FPMA 4NO7A 3D7EO 4XEIA 4PL7A 3IFRA 3CQYA 5E84A 4BRKA 5BREA 4ISEA 1YXQA 3WT0A 1HLUA 2NRHA 4C23A 4CZJA 5AFUH 2HOEA 5KQ8A 3SMPA 1DEJA 2QWQA 3H6EA 2YCHA 3LDPA 4H5NA 5AQJA 2VWBA 1X9JA 4AM6A 3H1VX 1BDGA 4O5FA 3GBTA 4Z94A 2F9WA 2GWJA 2A6AA 3MN5A 4BRMA 5ADXH 2E2OA 3DAWA 3A5OC 1NM1A 5KPTA 3ULEA 5KPRA 1MDUB 2QXLA 2ZWHA 4JN4A 3P4IA 1NLVA 2QWPA 2WUSA 1JCFA 4PKHA 4BGBA 5BPMA 2A5XA 5FPEA 1S22A 4FWLA 5AR0A 2Q2RA 3SJHA 3ULEB 3R8EA 3FR0A 1BO5O 3GDQA 4EAHD 1GLCG 1GLAG 5ELZA 2IVOA 3FZLA 3ENHA 1LOTB 4BROA 2QWOA 2QW9A 4HWIA 1ATRA 1RFQA 5AQMA 1ZXOA 4Y0WA 1LCUA 2D1KA 1BOTO 4FWQA 1WOQA 2YHWA 3MN7A 3DXKA 5F1XA 1C0GA 2GELA 3CJ7A 1TYQA 4BR4A 3EKSA 2P9PA 2ZF5O 4RWTA 5AQKA 5AZIA 5JMVA 3FZFA 3DXKB 4B1ZA 1TYQB 5AQYA 4QS8A 3VEOA 2P9PB 2HMPA 4O8KA 1GLBG 4LC9B 4PL8A 5AZIB 2AA4A 3CERA 1QQMA 1E4GT 4BR9A 2P9NA 1T6CA 1GLEG 2CGKA 1MWMA 2Q0RA 3C0BA 4WQ4A 5AQPA 1HPMA 4H03B 1QZ5A 4PKIA 1X3NA 3LL3A 1NGGA 1NGEA 2P9NB 4IJNA 5JICA 4XH1A 4FWPA 4WQ4C 4H0YB 2UYTA 4B1YB 2GWKA 4BGAA 2IIRA 1ATNA 3IUCA 4M7XA 1NBWA 3B8AX 3TU5A 4BG9A 1E4FT 4B1WB 1ZBSA 1IG8A 4K43A 1GLJO 3MCPA 2E88A 4AM7A 3DJCA 4BQLA 1HKGA 4CD3A 1YVNA 3O1BA 4IJAA 5F2RA 1J6ZA 3VGLA 3U4LA 3ZEUA 2Q31A 4XH5A 2VCPA 4CBWA 3CJ1A 5FPDA 3HM8A 5AQLA 1JCEA 3VGMA 4CZHA 4FWNA 3M6GA 5FPNA 3ZEUB 1HJOA 3LM9A 3H1QA 2FF3B 2P9UB 4JAXA 4CZMA 4PKGA 4H5TA 4I6MA 5BRHA 1TUYA 3CJBA 1TUUA 4H0TB 2A42A 4FWOA 2Q97A 3VENA 1NGJA 4BRHA 2GUPA 1NGAA 4A2AA 3VERA 4FWRA 2FSKA 1HUXA 4I6MB 3VPZA 1MA9B 4H5RA 4MLEA 2ZGZA 3FE1A 3R9PA 3WXIA 4K41A 4NB4A 3WXLA 3QFPA 5AQXA 2PBDA 3ID8A 3ZETA 5AQNA 2FLOA 5EOYA 2FF6A 4WQ5A 3A5NC 3G25A 3VEVA 4M7YA 3VF4A 3ZETB 3W0LA 4BVOA 1Y64A 2H3GX 4CI6A 4BRGA 3CJCA 1HKCA 4K25A 3EKUA 3I33A 5AQIA 1NGIA 3BEXA 1QZ6A 1SAZA 2E8AA 5AQVA 3ZX0A 3A5LC 4BC5A 3VOVA 3LDOA 3WQTA 2CGLA 4H5VA 4FSVA 2ITMA 2V52B 3FZHA 3QBXA 3ZX2A 4QS7A 1RGIA 2QWNA 2D4WA 4HTLA 3HSCA 4K42A 3H46O 1U2VA 1BWFO 3A5MC 3SK3A 3WXJA 3GL1A 2YJEA 1KXPA 5AQGA 1T44A 2Q1NA 1T6DA 1Q18A 2QWRA 4IWVA 4XH4A 2ASOA 3WEEA 3QBWA 4A62A 3A8YA 1BA1A 5AQTA 1SQKA 1GLLO 2E2NA 1U2VB 2DPNA 2V7ZA 5TKYA 4CJ7A 3U9DA 5AQQA 2I7NA 4ISGA 1K8KA 1Z05A 3WEEB 2QM1A 1NWKA 3FGUA 4B9QA 1R59O 1NMDA 1EQYA 4FOEA 1XC3A 3AARA 3HZ6A 5AZJA 4DB3A 1K8KB 3DXMA 5AQSA 3ENOA 3OHRA 4H0XB 2HF4A 4M63C 3I8BA 4DQ8A 5EX5A 3MK6A 3CI5A 1KAZA 1GLFO 5AZJB 3AAPA 4IO8A 3W3DA 3HI0A 3ATVA 3DXMB 4BR7A 5E26A 3H3NO 2E1ZA 4CZLA 3WUHA 2D0PA 1QHAA 5F0XA 1QQNA 5EXWA 3H3OB 2QWLA 4BC4A 2ASMA 5KPZA 3EZWA 2VYPA 2P9UA 1DGKN 2BUPA 1XQSC 3A0IX 3HTVA 4YDUA 5AQUA 1DKGD 2A40A 3EL2A 1ESVA 3MN6A 4GY2B 3LM2A 3QB0A 3WQUA 4BC3A 2E1YA 1YAGA 3M3ZA 4CZEA 5BPLA 3DWLA 4IZ9A 4JD2A 3FFKB 4WYBA 1U6ZA 2FXUA 3M1FA 4FOIA 4JHDA 3UE5A 5BR9A 1NGHA 4BRPA 5CE3A 4A2BA 3U8XA 3R6MA 4BREA 5AQZA 1KAYA 3MMVA 4EIAA 1GLDG 4JD2B 2BTFA 4JHDB 3C7NA 4H0VB 2CGJA 3GOIA 1XUPO 4FPAA 1NGFA 1OKJA 1G99A 2P9IA 3UKRA 3D2FA 1JCGA 2Q36A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3NF9A 3B6OA 4EZ6A 3OYDA 1NNEA 3AGKA 3LDLA 5DM6L 3CJAA 3Q7BA 3ZLJA 2P9IB 3UKRB 1GOAA 1REVA 3BF3A 1B92A 3IMXA 3QFUA 4CZFA 1IJJA 3WNGA 3OYCA 4M3RA 1ZBUA 1VSHA 4OVLA 4DR3K 2O8EB 3PY8A 4W5TA 3QIPA 3O5BA 4MLHA 3BUZB 2I7PA 3H45C 3VQPA 2A1RA 2NZTA 1S5JA 4FL9A 2Q0UA 2YHYA 4OPKA 4BR2A 4M3WA 4BRIA 1VSIA 3DM2A 2NRTA 3AVFA 4CZGA 4KHSA 1QE1A 4H4OA 4KAZA 4M3TA 3RMBA 4M41A 2RN2A 4CIFA 4IEIA 5KGWA 3JS6A 4DTUA 5CYQA 2F8TA 4BE7B 1YTUA 1TGOA 5LY3A 1VSMA 1EKEA 4B3TK 4GVMA 2V7YA 4DCHA 1FK9A 3F9MA 4RW7A 3HYFA 3J8AA 4CFAA 3O3FA 4L8RB 1JLEA 3CYGA 4BRLA 3KZBA 2VG6A 2HF3A 3LANA 4O44A 1T7PA 3WNEA 3TAFA 2E2QA 1X3MA 4CEEA 2LSNA 3EN9A 1RDBA 4E19A 1NJWA 3CHWA 3OYJA 3MCAB 4BECA 4DV6K 4BQZA 4CBXA 1C0FA 3KWGA 3DRSA 2G8VA 4BDYA 1RBSA 2O4GA 3CQXA 1RDDA 3AA3A 4BG8A 4E0DA 1ZC6A 4FVUA 3KKRA 3AY9A 4PHTX 3NH1A 3DLLL 4CERA 2C1IA 4CGHA 2PYLA 2EWSA 2W40A 3K5MA 3RR7A 3DLEA 2KHOA 4EHUA 2HB5A 1QQOA 1S3XA 2P9KB 1IKYA 4I7FA 3ZX3A 2D0OA 2KTQA 4B8AB 1UOCA 5BRFA 4AHTA 4CF1A 5HRRA 5ADXA 1SL0A 3VESA 1Q82O 4Q5VA 2B4JA 3UKUB 2O8CB 1RBVA 3IRXA 4DKWA 4DQSA 3V9UA 5AQFA 3HT3A 3GG4A 3KHYA 4NO7A 3LDSA 2FC0A 4PL7A 1UWBA 4NYNA 3RMCA 4CJTA 4ISEA 2NRZA 1YXQA 1WSHA 4KTZA 4CZJA 3LZJA 3HP9A 4JI2K 2E5LK 5A2QO 1M90O 4YNQA 4F3TA 3H6EA 5AQJA 2RKIA 4JKCA 2X78A 1BDGA 4O5FA 2F9WA 2GWJA 2KFZA 1NK9A 3TSUA 2E2OA 4JLHA 3CPWM 3K9JA 3TI0A 1TKXA 3AO2A 2KLAA 4FLWA 3T1YK 4GV6A 2WUSA 4PKHA 4BGBA 2YV0X 5AR0A 3ULEB 5J2QA 1BO5O 5KTQA 1GLCG 2Y1JA 3K0SA 4JYAK 3FZLA 1LOTB 4BROA 4CJUA 4IFYA 1RT7A 3CCJN 2QW9A 1HNZK 3CCMN 1RFQA 3TAQA 5TKWA 1ZXOA 4Y0WA 2HHHK 3HPGA 1BOTO 3C6AA 2PFUA 2YHWA 3DXKA 3TTFA 1C0GA 2NRXA 1YJWN 4JV5K 1RBRA 2GELA 5IT9O 1L3TA 5AQKA 5AZIA 1TKTA 3RR8A 4C8KA 3KTQA 4WFAL 3NVMA 2HMIA 3BZCA 2E6LA 1X1PA 3QLHA 1XHZA 3KJVA 4YOYA 2P9PB 4KREA 4YOUA 1GLBG 3VQ7A 4DTRA 4M3ZA 4LF4K 4PL8A 5HP1A 2YX6A 3NFAA 4KI6A 3NH2A 2Q0RA 4WQ4A 4OPAA 4PKIA 5JS1A 5JVGL 2UUCK 1HPZA 4IJNA 3SBGA 3O9QA 5GINA 1RT1A 2G8IA 3NF7A 4BGAA 2XRIA 4M7XA 1Y97A 1RDUA 3TABA 3AVKA 3MCPA 4AM7A 3S3MA 3ZSYA 4BQLA 2PZSA 2VWKA 1FKOA 1VQKN 1EO1A 5F2RA 4KB0A 5JVHL 4H8KA 1WSIA 4XH5A 3PO5A 2VCPA 1W97L 3KK7A 1B9FA 1EX4A 4CZHA 3NVKA 4FWNA 2EX3A 5C25A 3PUFA 5FPNA 1JLQA 1HJOA 3BY5A 3SQ4A 2P9UB 3JAMO 4JAXA 3TAEA 4CZMA 2OTLN 4NYFA 3HJFA 1TUUA 5C2DA 3J81O 2WOMA 2Q97A 4DR6K 1TK8A 1J9AA 2GUPA 4CK2A 3SJJA 3PIOL 3V9SA 1HUXA 1C0UA 4I6MB 2VG5A 4KHUA 2ZGZA 1IKXA 3R9PA 4AHUA 2YNGA 4JI0K 3OYBA 1QVFM 3WXLA 4E3SA 2HHUA 4DMNA 1K73O 3LP0A 4DSJA 2FLOA 4OLBA 3A5NC 3VEVA 3SI6A 4BVOA 3W0LA 1FXXA 2QTDA 3MEDA 4CGJA 4K25A 4FJMA 3H08A 2E8AA 5AQVA 2AJQA 3ZX0A 4EP5A 3A5LC 2W6KA 4JI3K 4OX9K 1YVUA 1K8AO 4DU3A 3FZHA 5CZ2A 4FJGA 4CHPA 5MLCQ 3THYB 2Z1IA 4K42A 2XY5A 1DLOA 1W9HA 4IWVA 1T6DA 1Q18A 2QWRA 4XH4A 4LD0A 2UXDK 3DLHA 2NUBA 4DV2K 5AQTA 4FLXA 3HSTB 4JK9A 5GIPA 1EWQA 2DPNA 5TKYA 4FLUA 3TAGA 3F2KA 2HNYA 1NWKA 4NXMK 4OPHA 1YJNN 4ILGB 2QA4N 1GOBA 1EQYA 1C0TA 4FOEA 4ZHRA 2XY8A 1LWEA 1K8KB 3MECA 3OJSA 3ENOA 3RRGA 4M63C 5GAHP 3CI5A 4DFMA 1FJGK 3DLKA 1GLFO 3AAPA 4CF2A 3DOKA 5E26A 1J53A 3H3NO 1Q81O 2D0PA 3AO3A 4DV0K 4LF7K 3AO4A 3CYMA 1NJZA 3G6EN 1YF5L 3SPZA 1XMQK 4K8XA 2HHQA 4KKOA 1NG9A 3EZWA 4DR4K 5AQUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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