4CBUA

Crystal structure of plasmodium falciparum actin i
Total Genus 119
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
119
sequence length
365
structure length
357
Chain Sequence
EDVQALVVDNGSGNVKAGVAGDDAPRSVFPSIVGRPKNPKDAFVGDEAQTKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNELRAAPEEHPVLLTEAPLNPKGNRERMTQIMFESFNVPAMYVAIQAVLSLYSSGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTEYLMKILHERGYGFSTSAEKEIVRDIKEKLCYIALNFDEEMKTSEQSSDIEKSYELPDGNIITVGNERFRCPEALFQPSFLGKEAAGIHTTTFNSIKKCDVDIRKDLYGNIVLSGGTTMYEGIGERLTRDITTLAPSTMKIKVVAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQQMWITKEEYDESGP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
molecule tags Motor protein
source organism Plasmodium falciparum
molecule keywords ACTIN-1
total genus 119
structure length 357
sequence length 365
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbuA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbuA03
1KXPA 3SLCA 3ZX2A 2A40A 5KQ8A 2GELA 3O4WA 3O6WA 4CZKA 2QXLA 3ENOA 4BRMA 4H0XB 2E8AA 4BROA 4O5FA 3KZBA 2QWPA 2BUPA 2ITMA 1TUUA 5AQGA 3ENHA 5AQQA 3CI5A 2NZTA 3LM9A 5JICA 5AQUA 3VERA 1QQNA 1P8ZA 3AAQA 3QICA 2A41A 4BVOA 3A5LC 2NRHA 3HSCA 5BR9A 3CJBA 2QWRA 1NGBA 2ZGZA 3LL3A 5AQWA 5EXWA 2Q31A 1T6CA 3H45C 3EZWA 1HJOA 3QB0A 4IZ9A 1DEJA 5ADXA 2ASOA 3D2EB 4H0TB 3ATUA 1DKGD 2D4WA 3H6EA 1IJJA 1QQMA 1SAZA 3CERA 1QZ6A 4FPAA 3GL1A 2E1YA 4B1YB 5JMVA 5KPRA 5AQYA 5AZJB 4BR2A 3WXLA 5AZJA 3O1WA 4C23A 5BREA 1NBWA 3MN7A 1HPMA 2D0PA 5AQSA 5KPZA 1R59O 3HI0A 4PKHA 3ZX0A 2FSJA 1MWKA 3AARA 3EO3A 2UYTA 5AQKA 4Z94A 2ZF5O 2YI1A 4L3QA 1ATNA 2Q0UA 3QBWA 1SQKA 2Q36A 4DB3A 2P9KB 3IDHA 4EAHD 2P9KA 3FGUA 5AQPA 3FZHA 3VESA 3MK6A 3CJ9A 4CZEA 3L0QA 3SK3A 3DWLA 2P9NA 4AM6A 1S22A 3WXKA 2P9UB 3C0BA 3LDNA 1WOQA 4JHDB 3QMLA 3BF1A 2E2OA 3CJ7A 4K41A 1NWKA 4PKIA 4QS9A 2FSKA 1Z6RA 3U8XA 2E88A 1C0GA 2W41A 1ESVA 2Q0RA 1XC3A 3FFKB 3KVGA 5AQOA 1KAYA 3SJHA 1NMDA 4CZLA 5AQRA 3GG4A 4BGBA 1Y64A 1E4GT 4BQLA 5AQLA 2Q2RA 1ATRA 3UE5A 4CD1A 2ZGYA 4H03B 3AAPA 4KBOA 4GNIA 4CZHA 3FZMA 4FWSA 5AR0A 1HX1A 2Q97A 3DXKA 2IVPA 5TKYA 3AY9A 4BRHA 4FWNA 3RSEB 1RFQA 4FWOA 4M7YA 4BC2A 1TUYA 3KHYA 4CI6A 3QDKA 4FL9A 3JS6A 2QWNA 3CIPA 3W0LA 4A62A 3A5MC 4I6MB 1TYQA 4CZFA 4I6MA 5E26A 5JLHA 1U2VB 3ZETB 5LJWA 4EIAA 4FSVA 4BC3A 3WQUA 4A2BA 2A3ZA 4DHYA 4FWLA 2P9IB 3MN9A 3VETA 2V52B 2P9IA 4M63C 5FPDA 1NM1A 3IUCA 4RWTA 1GLJO 1S3XA 4IJNA 1EQYA 4MO4A 5BRFA 1RDWX 3EL2A 4A61A 4K42A 1ZBSA 2IVOA 2QWOA 2VYPA 2E2PA 1D4XA 1QHAA 1BDGA 4CBUA 2P9SA 3L4IA 1GLBG 2IIRA 1HKGA 4PKGA 3ZEUB 2HF4A 1XUPO 3ZEUA 3FZFA 3IFRA 3U4LA 3TU5A 3UKRB 3UKRA 5AQZA 1T44A 1YXQA 5CE3A 1KAXA 4BC4A 1E4FT 3H46O 1BU6O 1U6ZA 1GLFO 2BTFA 4MLHA 3GBTA 1YAGA 1RGIA 4BVPA 4BRAA 3DXMB 1K8KB 4B1VA 5BRDA 3DXMA 4LC9B 1K8KA 1HLUA 3D2EA 4BRIA 4FWQA 3JXUA 3EN9A 2P9LB 3WXJA 1BO5O 3F9MA 4BR7A 1NGIA 3LDQA 3VEXA 2F9TA 5AFUH 4BR4A 5F2RA 2E1ZA 4BRFA 3FLCO 3CJCA 3UKUB 1T6DA 2YHWA 3UKUA 3A0IX 3FR0A 3QFUA 4H5WA 3ID8A 1JCEA 4GY2B 4FPBA 2ASPA 2W40A 1BUPA 2ZWHA 2CH6A 4ISGA 1ZC6A 3W3DA 4DQ8A 4BRPA 1X3MA 3DJCA 1HKCA 3SMPA 3VF4A 2P9UA 2YHXA 5F1XA 3A8YA 4JHDA 4BR9A 1G99A 3EKSA 3MN5A 4WQ5A 1WUAA 3CJAA 5FPMA 5AQMA 4BG8A 4NO7A 4WQ5C 2FF6A 1HUXA 4H5VA 1GLLO 3IMXA 4ISFA 3EKUA 1X3NA 4H5TA 1NGDA 3ZX3A 5LY3A 2D1KA 4DCHA 4B1UB 3HZ6A 5AFUA 3LDLA 3C7NB 3FZLA 3C7NA 3MMVA 3P4IA 3H3NO 4CJ7A 1JCFA 2V7ZA 4F9OA 1V4TA 2QM1A 3RSEA 1ATSA 2I7PA 3VF6A 4CBWA 2D0OA 3VPZA 2VWBA 4H0OA 2OANA 4CZJA 2YJEA 2VCPA 2EWSA 2FLOA 4BR0A 2P9PB 5FPNA 4H5RA 4B9QA 4FOEA 1U2VA 3ZETA 5ELZA 4H0YB 2GWJA 2HOEA 1LCUA 4K25A 3VENA 1NGAA 1LOTB 4RCHA 5LJVA 2CH5A 4M7XA 5BN9A 3GDQA 1BA0A 4JNEA 4JD2B 4NB4A 3I8BA 5BPNA 1QZ5A 3WUHA 2FXUA 1Q18A 2A5XA 4BQZA 2DPNA 3OHRA 4BGAA 4XH1A 5EVZA 4MO5A 2Q1NA 4FWMA 3CQYA 2CGLA 2E20A 3VEWA 3VGKA 3ULEB 3D2FB 3QFPA 1MDUB 3D2FA 4BREA 3HBTA 5EY4A 1NGJA 1NGCA 4BRQA 4CZIA 2KHOA 1GLCG 3U9DA 4CBXA 2J4RA 1NGEA 3B8AX 4CZMA 2FF3B 5AQIA 4E1JA 4J8FA 4XEIA 5BRHA 3TPQA 1NLVA 2AP1A 5AQNA 3U9ZA 3VGLA 5BN8A 3D7EO 3QBXA 4O8KA 1DGKN 3WT0A 2P9LA 2ASMA 3CQXA 4B1XB 3L6QA 5AQXA 3M1FA 1GLAG 4XH4A 1NGHA 1KAZA 3LDOA 3VEVA 4RTFD 2HMPA 1NGFA 3LM2A 4EFHA 2QWLA 4IJAA 3R8EA 1BA1A 1QQOA 1SZ2A 3S41A 3WXIA 5JLFA 4EHUA 5AQHA 1HKBA 1XQSC 1Z05A 3FZKA 3HM8A 4H0VB 1H1VA 4K43A 1YUWA 3CJ1A 2A6AA 4H5NA 4A2AA 2E2NA 1MWMA 3VF2A 3FE1A 4BRNA 3M3ZA 5EX5A 1BG3A 3J8AA 1BOTO 3CETA 2GEMA 4ISEA 2IVNA 4QS8A 3R9PA 3VEOA 4QS7A 3A5OC 4Y0WA 4BR5A 1GLEG 4IO8A 2WUSA 3MN6A 4MLEA 3VEZA 4BG9A 1X9JA 2F9WA 4IWVA 4JN4A 1OKJA 3BEXA 3O08A 4AM7A 1J6ZA 3GOIA 2P9NB 3CHWA 3SMSA 1C0FA 2GTDA 1CZAN 5AQFA 5FPEA 3UB5A 4YDUA 3O8MA 2PBDA 2QWMA 4FOIA 4BRDA 4WQ4A 4BRKA 3VGMA 4YDUC 2HF3A 5KPTA 2YCHA 4WQ4C 3H3OB 4CZGA 3M6GA 5AQVA 2FSNA 3WQTA 2NLXA 4HTLA 4CD3A 2CGKA 2H3GX 3VEYA 2P9PA 5AQTA 4B1WB 1JCGA 1GLDG 4FWKA 4BC5A 4HWIA 3ATVA 3R6MA 3MCPA 3DXKB 5AZIB 5I9EB 5AZIA 3GE1A 3G25A 4XH5A 2QW9A 4FWPA 3BUZB 3O1BA 3O5BA 5AQJA 2E2QA 5KQDA 1NGGA 3H1QA 4PL7A 1V4SA 3O80A 2QWQA 3HTVA 2CGJA 3I33A 2V7YA 1MA9B 4JD2A 5BPMA 5ADXH 2I7NA 1TYQB 3H1VX 4H0PA 5BPLA 3DAWA 2AA4A 2PAVA 4WYBA 2A42A 3MDQA 4BRGA 4FO0A 4FWRA 3BP8A 3BF3A 1BWFO 2YHYA 2GWKA 3A5NC 5E84A 3WEEB 3WEEA 3ULEA 4IXCA 2GUPA 1IG8A 2YJFA 2V51B 1ZXOA 3LDPA 4JAXA 5B8HA 4EHTA 2P9SB 4B1ZA 5F0XA 4PL8A 4BRLA 3VOVA 5EOYA 1YVNA 4BRCA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1KXPA 3SLCA 2UXDK 2A40A 1S1VA 3RTVA 1VAZA 2XY8A 2QXLA 3ENOA 3T1HK 4DV2K 4O5FA 3KZBA 2QWPA 1QE1A 1TUUA 2HBJA 4FXDA 3LM9A 5JICA 3L3VA 4IDHA 1WSHA 2QK9A 3AO5A 4CGFA 3BDPA 2BDPA 3AAQA 3BZCA 3QICA 2A41A 2NRHA 3VA0A 4O55A 3LZJA 1YHQN 4IG3A 4DLEA 1HJOA 4IZ9A 1DEJA 2W6LA 2ASOA 3DLEA 1DKGD 3CYGA 3ZSQA 3H6EA 1KVCA 3VQCA 4JYAK 3CYMA 4F3OA 1QZ6A 4FPAA 4E7IA 1VSHA 4B1YB 4C1NI 4LF9K 5AQYA 2E4LA 4DKWA 5AZJA 4JLHA 5BREA 3WXMB 2D0PA 4U7BA 4F3TA 3NBPA 5KPZA 4DV7K 4PKHA 3E66A 2HHWA 4FVUA 1GOAA 4GV3A 3AARA 3EO3A 4Z94A 2YI1A 2IOCA 3KK7A 4CJVA 2P9KB 2VG5A 3IDHA 5AQPA 4E0DA 3F73A 4M42A 3AA4A 3K5NA 4KAZA 4DQRA 3L0QA 3SK3A 3S3OA 3DWLA 1S22A 3TTCA 4PY5A 1VSFA 4JKCA 3TTFA 3ZT1A 3C0BA 3DLGA 3EYZA 4YHHK 1EKEA 3N4QA 4PKIA 4QS9A 1Z6RA 4CK2A 2E88A 1C0UA 2Q0RA 4LH4A 4BGBA 1Y64A 1E4GT 1RDAA 3SAFA 1YTAA 1IKVA 3OYMA 2WTUA 4XJXA 4H03B 3CPEA 1F21A 1QSLA 3ISNC 3RRGA 4KTWA 3FZMA 4LF7K 4GV6A 2Z1IA 4FWSA 5AR0A 3VQ8A 3PV8A 1L3UA 4FLVA 2Q97A 3DXKA 1U47A 3HYFA 4BRHA 3OS1A 3S9HA 1KRPA 1JL1A 3SQ4A 4FK2A 3EZ5A 3IKMA 3SUQA 1TUYA 3KHYA 2BH1A 3AA2A 3DRRA 3QDKA 4WE1A 3JS6A 2QWNA 3CIPA 3W0LA 4QAGA 4CJ5A 4CK1A 4Y1CA 3SCXA 5JS1A 4I6MA 2B6AA 3AVNA 4FSVA 3HVTA 3R1XA 2A3ZA 1M90O 2KZMA 3MN9A 3VETA 4IOCL 5C0YA 4J2EA 5FPDA 1NM1A 2G8VA 3ZT4A 4MO4A 3LZIA 1RDWX 4K42A 1ZBSA 3AGKA 4OPHA 5FLXO 1QHAA 1BDGA 3E9OA 1QQCA 4YORA 4DTOA 1HKGA 4JI7K 4GW6A 1VQ8N 2YX6A 3U4LA 4C8MA 3MX2A 2RN2A 5LL6Z 4K0KK 1BQMA 3UKRA 1HR0K 1XHXA 5CE3A 4GMJB 2BTFA 2KLAA 4BVPA 4B9VA 1T7PA 1K8KB 3PLAA 5KRTA 1JLQA 3D2EA 4CECA 1NOYA 3EN9A 1GOCA 3WXJA 3CFRA 5FDLA 1R0AA 2PFUA 3KWGA 1NGIA 2O8EA 5F2RA 4DTNA 4KKOA 3KD1E 2E1ZA 4BRFA 4F4KA 3HL8A 3FLCO 3VQAA 3OYLA 4KTQA 2GX9A 3D0PA 1N5YA 4JS5A 4GY2B 4YY3K 1ZBFA 2W40A 4U67L 5I3UA 4JEPA 1BUPA 1KLMA 4ISGA 2NRVA 5J1EA 1X3MA 3V1QA 3TANA 4JHDA 1YF5L 4CEOA 4LFAK 2DFEA 4OO1J 1A5WA 4ID1A 5HOOA 3KD5E 5KTQA 3THXB 3F2KA 3CF5L 1S6PA 1XMOK 4KI6A 2Y1JA 1FKOA 4F2SA 1GLLO 3IMXA 3D45A 4LF4K 1SUQA 1VQ4N 4H5TA 3B6PA 4AH9A 3ZX3A 2NNWA 3RMBA 3K5MA 4B1UB 1BL3A 3V1RA 5HLFA 4KPYA 1VSIA 3FZLA 1OH8A 3ID6A 3H3NO 3F9KA 1V4TA 2I7PA 3VF6A 4DV1K 2FBVA 1OH6A 2D0OA 3HPOA 1C1CA 4C8OA 3O4QA 4CZJA 1VQPN 4N5SA 2YJEA 1N36K 2FLOA 1NK6A 4Q5VA 1RTIA 2P9PB 3O3GA 1QVGM 2OPRA 1Q82O 2HOEA 4DR1K 3MWPA 1NGAA 5J2PA 1LOTB 4RCHA 4FM2A 4FM1A 4CJFA 1NU0A 3K58A 4NB4A 1RT4A 4Z4HA 5BPNA 1NK4A 2PYLA 5SWMA 3QETA 4LF5K 1TKXA 2A5XA 4JKDA 3OHRA 4DF4A 1W97L 3AVKA 4L8RB 4FK4A 4MO5A 1NOZA 2E20A 3C6AA 1CZ9A 3ULEB 3KLFA 2JLEA 3AVAA 4BREA 2O8CB 5DM7L 2KHOA 1GLCG 1J9AA 3U9DA 4CIGA 3M8PA 1UA1A 1NGEA 1SL0A 1VQON 4E1JA 4OKJA 4DFKA 4PUOA 4FJ5A 1NLVA 5AQNA 3M5RA 1DGKN 3VMFB 2P9LA 4C8LA 3SAHA 3PX0A 3RMDA 4B9TA 3CQXA 1Q7YO 4N76A 4XH4A 1NGHA 3V9ZA 2QKKA 4IOXA 4CHQA 5FRMA 2HHTA 3P1GA 1SZ2A 3OYKA 4EHUA 3PX4A 5AQHA 3CC7N 3FZKA 3HM8A 4H0VB 3SV4A 2YHAA 4K43A 1REVA 4H5NA 4DV3K 4IG0A 1L3TA 1HNWK 3VF2A 4M3XA 3M3ZA 4EP5A 4ZTFA 3K2PA 4LFCK 4H4OA 4DLGA 2G8KA 2IVNA 4CJQA 4N47A 1NJZA 3VEOA 3CCRN 3CCMN 3NCIA 4BG9A 2XY7A 3LP3A 4JN4A 1C6VA 4YOVA 1U4BA 1J6ZA 3AO2A 3ZCMA 3OYAA 4CEEA 3VQ6A 4DMNA 1EP4A 1U48A 1C0FA 4BE1A 1CZAN 5FROA 4W5TA 2EX3A 1RT2A 2VQEK 4YDUA 5C15A 4FW1A 3EE8A 2P5OA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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