4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium berghei
molecule tags Motor protein
molecule keywords ACTIN-2
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
5FPMA 2ZF5O 1IG8A 2A40A 1NBWA 4PKHA 5BRHA 4M7XA 2BTFA 3QBXA 4Y0WA 3VGLA 3VF4A 1WUAA 4H0PA 4EAHD 4BQZA 3WEEB 2P9UB 1NGDA 2FSJA 3H6EA 3FE1A 3H3OB 1IJJA 2I7PA 3G25A 2KHOA 3H3NO 4A2AA 2Q97A 2GTDA 5E26A 1JCFA 4BRFA 2E2PA 1HJOA 3I33A 2E1ZA 4E1JA 2PBDA 3DWLA 3RSEB 3RSEA 4DQ8A 4WYBA 1HKGA 1QZ6A 1X3NA 1X3MA 4BREA 4BVOA 1ZXOA 4IWVA 4RWTA 4MLEA 4HTLA 1NGHA 1XQSC 4B9QA 2A42A 4XH5A 2CGJA 2QWNA 4DCHA 3FGUA 4CZGA 4EIAA 4BR4A 5AQJA 4CZEA 3DXKA 5AZJB 3ZX0A 4CZLA 2W40A 3FLCO 3LDQA 4BC4A 1TYQB 4BRPA 4BRLA 1G99A 2P9LA 4QS9A 1K8KA 5JMVA 3A0IX 1HPMA 5CE3A 5KPTA 4HWIA 4BROA 4H5VA 1GLEG 2GEMA 3F9MA 1HKCA 3CJBA 4AM6A 4MO4A 5AQMA 2ASPA 3BUZB 4B1ZA 4H0XB 1BG3A 3HZ6A 4RTFD 2ITMA 3GE1A 3I8BA 4FWPA 4BRNA 4FOEA 2QM1A 3SMSA 3VETA 4BG8A 4CD3A 3UE5A 3ZEUA 4WQ4C 4B1UB 5F1XA 4B1YB 2YHYA 4I6MB 4MLHA 3QDKA 3GL1A 2P9NB 3BF1A 3BP8A 4BR9A 3SLCA 4WQ5C 3CJCA 1DEJA 3LM9A 4IJNA 3VEVA 3CJ1A 4PKGA 5FPDA 4AM7A 2CGKA 3EN9A 5AQZA 4O5FA 1T6DA 3GOIA 4FO0A 4NO7A 1GLBG 4BC3A 3D2EA 2FF6A 3H45C 1NLVA 3U9DA 1T6CA 2FLOA 3KVGA 4JAXA 2PAVA 3D2EB 1NGIA 4JHDA 1MDUB 4CZFA 4PKIA 5AZIA 1YXQA 1NM1A 2P9PA 4BC5A 4BVPA 1SZ2A 3O5BA 1KXPA 1CZAN 1KAXA 3WEEA 1V4SA 3HTVA 1GLDG 3VEZA 1YVNA 4H0VB 3WUHA 3D2FA 4JD2A 3M3ZA 3C0BA 3WT0A 3LDOA 3LDPA 3H46O 3FFKB 3IFRA 1RFQA 2NLXA 2P9IB 4DHYA 3MN6A 2QWRA 3LM2A 1NGFA 5KPRA 2P9IA 1BA1A 1BWFO 4BC2A 3QB0A 5AFUA 5AQVA 3M6GA 3TU5A 4BRIA 1NGAA 5EX5A 2F9TA 2QXLA 4F9OA 1Q18A 2FF3B 2IVPA 3UKUB 3CIPA 4KBOA 5AQTA 2YCHA 2E88A 2D0PA 1NGEA 1V4TA 1D4XA 4H5NA 3W3DA 2Q1NA 2DPNA 2YI1A 3SMPA 4DB3A 5BR9A 4FWLA 3QMLA 1MA9B 4H0YB 3U4LA 1R59O 5AQQA 2VYPA 4CI6A 2IVOA 3O08A 4BRDA 3H1VX 1TUYA 3QFPA 5LY3A 2ZGZA 3IDHA 4CZKA 3MCPA 3QICA 4WQ4A 5AQNA 5AR0A 2BUPA 4BR2A 4CZHA 5EY4A 3WXKA 1LOTB 1GLFO 2HMPA 4K43A 5EXWA 3U9ZA 3VF2A 3ULEA 4PL7A 2D0OA 2GUPA 5KPZA 2HF4A 4QS7A 1SQKA 4H5WA 4FWNA 3O80A 4FWSA 2ASMA 4NB4A 2YJFA 5AQUA 3DXMA 3WQUA 5AQXA 2V7YA 3MN7A 3R8EA 1ATNA 3S41A 3A5MC 5LJWA 5AQFA 1ZBSA 1QHAA 4H0OA 1DGKN 3DJCA 3R9PA 1TUUA 3VPZA 4EHUA 2ZGYA 4XH4A 4B1WB 1ZC6A 4BRMA 2P9UA 3QFUA 3AY9A 3ENHA 4IZ9A 2NZTA 4ISFA 4PL8A 5F0XA 4H03B 4BR7A 2P9KA 3ZX3A 4CBWA 5AQGA 1QQMA 4FWRA 2UYTA 3WXLA 3SJHA 5AQWA 5BN8A 4FWKA 1P8ZA 5LJVA 5BPLA 1TYQA 2QWPA 4LC9B 3VERA 4FSVA 1QZ5A 3WXJA 3BF3A 4FWMA 4CJ7A 3ATUA 5AZJA 3D2FB 4JD2B 2YHXA 4ISEA 4FWQA 3EO3A 1NGCA 3ZX2A 1NGJA 2YHWA 3HM8A 1RGIA 3MK6A 3D7EO 2ASOA 5FPEA 3LL3A 4IXCA 4BRGA 3C7NA 3O4WA 3VEOA 5FPNA 1HKBA 2WUSA 3HSCA 3BEXA 3OHRA 3VF6A 2D4WA 4CBXA 2V51B 1Z6RA 3TPQA 3GG4A 4JNEA 4FPBA 1J6ZA 4EHTA 3LDNA 5B8HA 5I9EB 1EQYA 2CH6A 2I7NA 5BRDA 1MWKA 2IVNA 3VESA 3CHWA 5AQHA 4BRHA 1HX1A 2CGLA 5AQYA 5TKYA 1Y64A 4ISGA 3UB5A 5EOYA 1DKGD 5AQSA 2HOEA 1QQNA 5BN9A 2ZWHA 1C0FA 4FOIA 2E2OA 2VCPA 4XEIA 4YDUC 1XUPO 5AQIA 2A41A 4BGAA 4I6MA 5AQPA 4BGBA 2E2QA 3J8AA 4IO8A 3ZEUB 3HI0A 2P9KB 3EKSA 1BOTO 1GLCG 1ESVA 2GWJA 3ID8A 3DAWA 3UKUA 4B1VA 4GNIA 5BREA 5JLFA 1ATSA 3QBWA 1X9JA 5BPNA 1WOQA 2AP1A 4M63C 3GBTA 1T44A 3O1BA 5AQKA 3P4IA 3O8MA 3FZFA 1BO5O 2AA4A 2OANA 4BRCA 1NWKA 1OKJA 3VEXA 4CD1A 3L6QA 3O1WA 5KQDA 5AFUH 1BU6O 1BUPA 3DXMB 2EWSA 4K42A 2IIRA 2A6AA 1JCEA 3A5LC 2F9WA 4XH1A 3U8XA 4BRAA 3A8YA 3CQYA 4C23A 3IMXA 1E4GT 1YAGA 3DXKB 5AQOA 3ULEB 3FZMA 5JLHA 1GLJO 4FPAA 3FZHA 3KHYA 4BG9A 3AARA 3CJAA 1S3XA 2QWQA 2QW9A 1BDGA 3AAQA 5AQLA 1H1VA 4BR0A 3LDLA 5ADXH 3L4IA 4WQ5A 2P9PB 1U2VB 3HBTA 2E8AA 5AZIB 3VOVA 3EZWA 2P9SA 1RDWX 2V52B 2QWMA 2HF3A 4H5RA 2H3GX 3CQXA 5BPMA 5ADXA 2FSNA 5E84A 2Q0UA 3CERA 4A62A 4O8KA 2CH5A 3R6MA 4CZIA 3H1QA 1C0GA 1BA0A 4L3QA 2Q36A 4M7YA 1NGGA 4CZJA 4EFHA 5AQRA 1XC3A 4A2BA 3FR0A 2D1KA 1SAZA 3CJ7A 5ELZA 3MN9A 3CI5A 2Q2RA 3M1FA 4GY2B 2P9NA 4H0TB 3VGKA 4RCHA 3A5NC 4IJAA 1QQOA 1HLUA 4FL9A 3ENOA 2A3ZA 3ZETA 3AAPA 3WXIA 1NMDA 4BRQA 2NRHA 4BR5A 2W41A 4MO5A 5JICA 1GLLO 2YJEA 3ZETB 4H5TA 2Q31A 5BRFA 4Z94A 2FSKA 2V7ZA 3MDQA 3FZLA 4JHDB 3UKRA 3KZBA 3FZKA 5F2RA 3VEYA 3EKUA 1K8KB 1YUWA 3JS6A 2P9LB 4B1XB 3O6WA 1JCGA 4A61A 4CBUA 2A5XA 3EL2A 5KQ8A 2E1YA 4YDUA 2GWKA 1E4FT 3B8AX 2QWLA 4CZMA 4J8FA 1NGBA 1KAZA 2VWBA 3WQTA 3W0LA 4FWOA 3CETA 2J4RA 1ATRA 3JXUA 1U6ZA 4QS8A 1HUXA 3C7NB 3UKRB 3IUCA 2P9SB 3MN5A 2QWOA 1U2VA 5EVZA 4BRKA 3GDQA 4K41A 3VGMA 1KAYA 3A5OC 1MWMA 1S22A 1GLAG 2E20A 3MMVA 4K25A 3CJ9A 2GELA 3VENA 4BQLA 2Q0RA 3VEWA 4JN4A 1Z05A 2FXUA 3SK3A 3L0QA 1LCUA 2E2NA 3ATVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4OVLA 2OZMA 4LF8K 1IG8A 2O4IA 4B3SK 2YKMA 4Y0WA 3VGLA 3VF4A 4GVMA 4EAHD 1RDUA 4BQZA 3AO4A 2FSJA 3G25A 1RDAA 1RTJA 4CF1A 2GTDA 5CHIA 3L2UA 1JCFA 1B92A 1HJOA 3S9HA 2ZD1A 4CERA 4X65K 1XI1A 2PYLA 3RSEA 1HKGA 1U48A 2O8BB 1D5AA 2X6NA 4IWVA 4M3RA 2WFBA 4MLEA 1X9WA 3DRRA 4E7KA 3VQBA 4UY8O 4CZGA 3ZSWA 1IV0A 1NK7A 5AZJB 3ZX0A 3FLCO 4BRPA 4BC4A 1ASVA 3LP1A 3R3LA 2P9LA 4QS9A 3HT3A 1SL1A 1K8KA 2RN2A 3A0IX 3NF7A 3AO1A 4ILJA 4BROA 2QK9A 4H5VA 1GLEG 1DT9A 3F9MA 4FW2A 4X62K 4OPHA 1VQKN 1XNQK 4E7IA 3BUZB 4Z0UA 1RDBA 3SAFA 3GE1A 1Z25A 2UXBK 3OY9A 3VQQA 4BG8A 1S1VA 1NU0A 1LWFA 2YHAA 2FBXA 3CMAN 4AF1A 5AJ3K 1NK5A 3KD1E 2KLAA 4BACA 4I6MB 3OYKA 3IRXA 2ZE2A 5CZ2A 4LF9K 3F73A 1RT3A 3CJCA 2P51A 4DTXA 1B9FA 3CFOA 3VEVA 2GBZA 3CJ1A 4PKGA 3WNFA 5MLCQ 1ZBLA 3SV3A 3IKMA 4YOUA 4O5FA 3TTCA 3DYAA 4DG1A 4FO0A 3T69A 4DTSA 2XY6A 3SQ0A 1GLBG 4IFVA 3D2EA 3KLIA 1NLVA 3U9DA 3CCLN 2RPIA 4DQPA 3KVGA 1QVGM 2PAVA 1K6YA 4F2RA 4NCBA 2HHSA 5KRSA 3O9QA 1LWCA 4CEAA 1N33K 2OCEA 3PIOL 4OX9K 4BECA 2RKIA 3TAGA 3H08A 3WT0A 3FFKB 2P5GA 4C8OA 3F2KA 2QWRA 1IKXA 3VQ5A 5KPRA 2O8FA 1BA1A 2HNDA 5AFUA 4QOZB 4DV0K 4CEFA 3M6GA 1T05A 3AVAA 1NGAA 2F9TA 4F9OA 2G8HA 4DTJA 1Q18A 4CJQA 3HOSA 5J1EA 3CYMA 3UKUB 2YCHA 4B9NA 4FLXA 3S3OA 2GX9A 4B9UA 1D4XA 4NLCA 3W3DA 4DUYK 2DPNA 4CJVA 2QEXN 3IS9A 3PUFA 4FW1A 3MX5A 4NLBA 1TAQA 2NRXA 3DI6A 3HJFA 4FLUA 2IVOA 4Z4EA 4OGCA 3RMDA 3CYGA 5M1OA 1XWLA 4B9SA 2GUIA 5AR0A 2BUPA 4BR2A 1KVBA 4CZHA 4J2BA 4JI5K 2E4LA 2AJQA 1GLFO 2HMPA 3P39A 3I55N 1D9DA 1RTIA 3VF2A 2BANA 3ULEA 2D0OA 3AGRA 1SQKA 1RBRA 4FWSA 1L3UA 3ULDA 3DXMA 3WQUA 4F8RA 2KZMA 4CJ5A 4OPJA 2O8DA 1ATNA 4AHTA 1VQ6N 5LJWA 4H0OA 4KHPK 3MX2A 3K5OA 2RE2A 4XH4A 3KK7A 1M90O 4B1WB 3HVRA 4DR3K 2HHQA 2NZTA 4ISFA 1HRHA 4PL8A 1CLQA 3VQCA 4DU1A 4CK1A 3N4QA 4PWDA 5KRTA 1QQMA 1C0UA 1HYSA 3WXLA 4F3OA 3SJHA 5BN8A 3TTDA 4ICLA 4HCCA 4DV6K 1ITGA 1P8ZA 5FLXO 3J7YP 4CJ4A 2G8WA 1QVFM 3NCIA 3NE6A 3PY8A 3ATUA 3DLKA 5AZJA 4DFPA 4CF8A 2IC3A 4JD2B 4FLWA 2UU9K 2NUBA 3DLBA 3AA3A 4FLVA 1NGCA 3AVCA 4EZ9A 3ZX2A 3ZLJA 4BE2A 1RGIA 3TWHA 3D7EO 1F21A 4B3MK 4KO0A 4DTPA 3SBGA 5HL7L 3K5MA 1KTQA 3QINA 5JVHL 3VF6A 4CBXA 3GG4A 4ILGB 4FPBA 4EHTA 3NMUA 3LDNA 3K9JA 2I7NA 4DTNA 3IG1A 4CESA 5JVGL 2DFEA 4YOTA 4BRHA 4CK2A 1OVQA 1HX1A 4WE1A 3UB5A 4CE9A 3HVTA 1YTAA 1T03A 4FOIA 5AQIA 4FM0A 2A41A 3E9OA 1VSLA 4M3TA 3LAKA 3TTFA 4BGBA 2HHVA 2G8VA 2P9KB 4IOAL 3DLGA 1HNIA 1GLCG 1ZBFA 3UKUA 4ZHRA 3HYFA 3P83D 1ATSA 3QBWA 2G8KA 1WOQA 5AQKA 2G8UA 3FZFA 4CHZA 2OANA 1U45A 5C0YA 1HQUA 3O9SA 5AFUH 3U8XA 4JKCA 1RCHA 5GINA 3VQ9A 1T3VA 1VQPN 5JLHA 3CCMN 3E01A 1YT3A 4KH6A 1SS6A 2QW9A 4LSNA 1H1VA 3L4IA 4O8UA 1WN7A 3ZSRA 3EZWA 3DOLA 2V52B 3OBWA 3PO5A 3V9WA 2H3GX 3T1HK 3C65A 5E84A 2Q0UA 3EEQA 1ZBUA 1NK9A 3QEPA 4DR1K 2CH5A 4B9TA 4EP4A 1HNXK 1TKZA 4L3QA 2Q36A 1NGGA 2PY5A 5E41A 4FLZA 2IAJA 4U67L 3MN9A 3CI5A 3M1FA 4GY2B 3OYJA 4RCHA 3J7ZO 4IJAA 1BCOA 1QQOA 4FVUA 1HLUA 3V9ZA 1KLNA 3CC2N 3SUPA 2HNZA 3K2PA 4HUGA 4JS5A 1OH7A 3S3MA 4BRQA 2W41A 1C1BA 4CGJA 3BY5A 4F2SA 2O8CA 3FZLA 3E9PA 4Y1DA 3S5TA 5CR4A 3KZBA 2P1JA 4C8LA 3TSQA 1R0AA 4HUEA 3EKUA 4DR5K 1K8KB 3JS6A 2P9LB 4B1XB 4GW6A 3SBTA 4CBUA 3A2FA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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