4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN-2
publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium berghei
molecule tags Motor protein
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
4H5NA 2ZF5O 2GEMA 5AR0A 3VESA 4CJ7A 3UKRA 3RSEA 4PL7A 4CZKA 3U9ZA 1NLVA 3CJAA 2P9IB 3QFUA 3FFKB 3M6GA 5AQSA 4XH5A 4JD2A 4ISGA 1BO5O 1CZAN 4ISFA 2CGJA 5AFUH 4HTLA 4CBWA 2Q0RA 4H5VA 3SK3A 1IG8A 2I7NA 1HX1A 5ELZA 2DPNA 3FGUA 4BVOA 4A2BA 1IJJA 3FZKA 4H5RA 4K25A 2OANA 3QBXA 1MDUB 2PBDA 4BR9A 2UYTA 4EAHD 1YAGA 3O1BA 2YJEA 3MN9A 4ISEA 1NGIA 2WUSA 2KHOA 2YHWA 2P9UA 4MO5A 3H1QA 2VYPA 3G25A 1RGIA 3DXMB 1RDWX 3CJ7A 3H1VX 2P9IA 3L0QA 1MWKA 3MDQA 3EZWA 4CZIA 3VEYA 3D2FB 4NO7A 1GLLO 5FPMA 5AQXA 3KZBA 5I9EB 4YDUC 2QWLA 3QFPA 3CHWA 3EKUA 4FWQA 4BRMA 2ZGZA 4EHTA 2P9SB 3ZX3A 4XH1A 4WQ5A 1BU6O 5BRDA 1ATNA 4BRGA 1QQNA 3VGLA 2Q2RA 3IFRA 4CD1A 2QW9A 3A8YA 3D2EA 4IO8A 1TUYA 1NGEA 5JICA 2E1ZA 4BRLA 5KPRA 3GL1A 2ZGYA 1NGAA 1SZ2A 4A2AA 4BRIA 3IDHA 2P9KB 4FWPA 3O1WA 2E2PA 2E2QA 4O5FA 4EIAA 1H1VA 3O8MA 2FLOA 1DGKN 3JXUA 4A61A 1YUWA 4QS8A 2IVOA 2QWOA 2IVPA 5KQDA 4CZHA 5AQJA 2P9NA 3D2FA 3ZEUB 2CH5A 3WXJA 3VF6A 3FLCO 3MCPA 4JN4A 1GLBG 1HUXA 1WOQA 4BR5A 4BRQA 4BREA 3VEWA 2Q0UA 3GE1A 2HF3A 3CJ9A 5AQZA 1JCGA 3WEEA 1LCUA 2P9SA 2NZTA 3LDQA 1Q18A 4I6MB 4WYBA 4FWOA 1XC3A 1J6ZA 1ESVA 4BRCA 4MO4A 3M1FA 3HM8A 4MLEA 4PL8A 3QMLA 1GLDG 1Z6RA 4NB4A 4O8KA 5E26A 5AFUA 4FWNA 2P9KA 3P4IA 3MN5A 1ZBSA 4JNEA 3TU5A 3DAWA 1E4GT 4HWIA 3TPQA 4QS7A 5BN9A 4H0OA 4FPAA 1JCFA 3J8AA 2FF6A 3GG4A 3BP8A 5ADXA 4H5TA 2CGLA 3VGMA 4BR7A 3L6QA 2ASOA 3MN7A 4QS9A 5AQFA 3LDNA 4BRNA 3WQUA 5LY3A 4FWRA 5B8HA 1KXPA 4BC2A 3ZX2A 2D1KA 3L4IA 5FPNA 3CJCA 4EHUA 3C0BA 3VEOA 3VERA 3ZX0A 3WQTA 3WT0A 4I6MA 2HMPA 3GDQA 4BRDA 3KHYA 2GTDA 4WQ4A 1NGHA 2GWJA 1NGBA 5AQPA 1K8KB 1HKBA 4B1XB 5AQKA 3ENOA 4DB3A 4PKHA 5TKYA 4BG8A 2Q36A 5EVZA 4FOIA 3R8EA 2YCHA 1P8ZA 5E84A 4BROA 4H0TB 2YI1A 3ZETB 1GLJO 2VWBA 1DKGD 5EOYA 5AQMA 3HSCA 4Y0WA 3ENHA 3MN6A 4Z94A 4RTFD 4CZFA 3AAPA 2I7PA 3R9PA 4L3QA 4K42A 2ASPA 2IIRA 5F2RA 5KPTA 5EX5A 5AQGA 2V52B 1NGFA 3LDLA 4IJNA 1HJOA 2BUPA 5JLHA 5BPNA 1D4XA 1E4FT 1NWKA 4B1VA 5AQUA 1QQMA 5KQ8A 1V4TA 1K8KA 3VEXA 5BRFA 1S3XA 5AZJB 1WUAA 3H3NO 3LM9A 4IWVA 1U6ZA 2ASMA 2F9TA 2VCPA 1BDGA 5BREA 4KBOA 3ZETA 1GLEG 1BWFO 1YVNA 1NGDA 5LJWA 4IJAA 4M7XA 1C0GA 3LM2A 4DQ8A 3CQXA 3VEVA 3QB0A 4AM6A 2H3GX 2D4WA 1G99A 3VPZA 1BA1A 1MA9B 4BC3A 3VENA 1OKJA 2J4RA 3DXMA 2AP1A 5AQTA 1QZ6A 4GNIA 2YHXA 3QDKA 3I33A 1GLAG 1HKGA 3UKUB 2QWMA 4BG9A 4PKIA 4MLHA 5FPEA 2E8AA 4FSVA 4H03B 1MWMA 3CQYA 2AA4A 3CJBA 3DJCA 3H6EA 2E1YA 2V7ZA 3KVGA 4CZGA 4FWSA 4EFHA 3EL2A 2D0PA 1TYQB 2HF4A 2BTFA 3M3ZA 3FZLA 2ZWHA 4K43A 1HLUA 3SLCA 2QWRA 4FOEA 2P9LB 4CZLA 3AY9A 3H46O 4J8FA 4FO0A 5LJVA 5AQOA 2QM1A 4BR4A 3WXIA 1LOTB 4FWKA 1S22A 2ITMA 3SJHA 1QQOA 3U8XA 1BA0A 1NGCA 4H5WA 3UKRB 3DXKB 4B1ZA 5BPMA 2V7YA 1C0FA 2A5XA 2GWKA 4BC5A 3UKUA 3ZEUA 3AARA 3FZFA 4XEIA 2CH6A 4YDUA 3WXLA 1X9JA 4B9QA 1BUPA 2D0OA 3IUCA 3HI0A 4BR0A 4IXCA 2PAVA 1NBWA 4CD3A 2CGKA 4CBXA 3FZMA 3VF4A 2FSJA 2YJFA 5CE3A 1TYQA 4BQLA 3FR0A 4H0YB 1T44A 2QWQA 3IMXA 4WQ5C 1NMDA 1T6DA 2E20A 5AQLA 4BQZA 4BGBA 4CBUA 5F1XA 4B1WB 2E88A 1HPMA 5AQQA 4DCHA 1ATSA 3VEZA 4BRKA 5BPLA 2P9UB 1ZC6A 3O6WA 2YHYA 4BRHA 4CZMA 2W41A 1YXQA 3DXKA 2V51B 3O4WA 2IVNA 4BGAA 1DEJA 2EWSA 2FSKA 4H0VB 3A0IX 3CJ1A 1BG3A 5EXWA 3I8BA 3O80A 4E1JA 2A42A 4LC9B 5EY4A 4PKGA 3VETA 2W40A 5KPZA 2A3ZA 1X3MA 2QXLA 1GLCG 5ADXH 1R59O 3VF2A 1JCEA 1XQSC 5AQYA 3VGKA 3BEXA 1SQKA 3D2EB 4K41A 3H45C 3ID8A 3LDPA 1V4SA 2A41A 3MK6A 3F9MA 5AQHA 5BRHA 4BRAA 1NGJA 2FF3B 1QHAA 3BUZB 1KAXA 4F9OA 1XUPO 1U2VB 3SMPA 2P9PB 3SMSA 4H0XB 4FL9A 1Z05A 3C7NB 2E2OA 3EKSA 3O08A 4A62A 4BRPA 4RWTA 2P9NB 4JHDB 2GELA 1SAZA 3W0LA 3UE5A 1T6CA 3HZ6A 2A6AA 3D7EO 3EN9A 5JLFA 1TUUA 3CIPA 4IZ9A 5AZIB 4FWMA 3A5OC 5F0XA 3WEEB 4RCHA 3ULEB 3CI5A 3FZHA 2NRHA 1Y64A 4DHYA 3U4LA 5FPDA 4BR2A 3CERA 3MMVA 4CI6A 2E2NA 3R6MA 4BC4A 3S41A 4C23A 5AQVA 1NGGA 5AZJA 4WQ4C 2Q31A 2QWPA 3JS6A 3LDOA 4H0PA 5AQWA 1QZ5A 3BF1A 4XH4A 1U2VA 4CZEA 5BN8A 4BVPA 5BR9A 2P9PA 4CZJA 3ATUA 3C7NA 5AQIA 4GY2B 4JHDA 2FXUA 4FWLA 4FPBA 3OHRA 2QWNA 3A5MC 2Q97A 4M7YA 5AZIA 3HTVA 3H3OB 3CETA 4B1YB 5AQRA 3A5NC 3RSEB 3ULEA 4BRFA 1ATRA 4M63C 3GOIA 1NM1A 2HOEA 2NLXA 3AAQA 3EO3A 4JD2B 1HKCA 2A40A 3VOVA 3O5BA 1X3NA 4AM7A 5AQNA 1KAZA 5JMVA 3QBWA 3HBTA 4B1UB 1GLFO 2GUPA 1BOTO 3GBTA 3BF3A 3WUHA 1EQYA 3DWLA 2Q1NA 3LL3A 1KAYA 3W3DA 4JAXA 3ATVA 3U9DA 2P9LA 3FE1A 1RFQA 3A5LC 1ZXOA 3QICA 2FSNA 3WXKA 3UB5A 2F9WA 3B8AX
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2XY7A 4B8CA 2GEMA 1JLFA 4CJ3A 1T7PA 1Q9XA 3UKRA 4RW6A 2VG6A 5CZ2A 3RSEA 4PL7A 3BZKA 3U9ZA 3VQ6A 3HM9A 1VSEA 3KTQA 3FFKB 3DLLL 3CYGA 1CZAN 4IOCL 4HTLA 2Q0RA 4F8RA 3SK3A 2I7NA 5ELZA 2DPNA 3FGUA 3CFPA 2RKIA 3AVKA 4A2BA 4NYFA 4WCEL 3ZCMA 2OYQA 2Q3SA 1WSGA 1YAGA 4XJXA 1Z25A 2OTLN 5GIOA 1BCMA 2KHOA 2YHWA 4IFEA 2O8FA 1LWCA 3QEIA 2QXFA 3DXMB 4OGEA 3WNGA 1ASVA 2Z1JA 2ZM6K 3MDQA 4CZIA 4MDAA 3ENBA 4C8LA 5CYQA 1RTIA 2O8CB 4EP5A 4O55A 1GLLO 1ASWA 3I0SA 3CCUN 4YDUC 3CHWA 3EKUA 2G8KA 5FRMA 1VQ6N 4KKOA 3ZX3A 4CK2A 4WQ5A 1BU6O 2GV9A 1QQNA 3VGLA 5M1FA 4CD1A 3A8YA 4IO8A 1TUYA 1LW0A 4CJRA 4X64K 3OYIA 3GL1A 1NGAA 4LSLA 4BRIA 3IDHA 3AO1A 4FWPA 2E2PA 4EIAA 3THYA 1SKWA 1ZBFA 2I5JA 2R7YA 2ZJQL 2FLOA 1NK5A 4CGHA 3JXUA 1DT9A 3OYDA 3EYZA 2QWOA 1D9FA 4CZHA 4DFKA 2OPRA 2O8CA 1RBTA 2CH5A 4X66K 1XHXA 3VF6A 3O3GA 3SPZA 4LY7A 1HUXA 3OYEA 4BREA 4WFAL 3VEWA 4CIEA 3KD1E 2Q0UA 3GE1A 3QEPA 1YHQN 3WEEA 1LCUA 1Q18A 4I6MB 1WBDA 4FK4A 4FWOA 3T19A 2VGNA 2KTQA 5TKWA 4BRCA 4FJIA 2WONA 4ID1A 1SUQA 1YITN 4O8KA 1NOYA 4OJRA 1KLNA 4B9LA 4FM2A 3MN5A 3TU5A 1E4GT 4LH4A 4FPAA 2FF6A 3EZ5A 3BP8A 4YORA 4JKEA 3L6QA 2ASOA 5LL6Z 4CHPA 5AQFA 5GADP 4DTRA 5KGXA 3DLKA 3NHGA 4FWRA 4BC2A 1WSIA 3ZSZA 4LF6K 4KRFA 3C0BA 3VEOA 1T8EA 1B92A 1VQON 3RRHA 4I6MA 3GDQA 1YTAA 3HXMA 1NGHA 3TR8A 2YNFA 3MX2A 4ELVA 3VQPA 3ENOA 3AVLA 4PKHA 4AILC 4JEPA 2UXDK 1TGOA 3CFOA 5KI6A 2YI1A 3ZETB 5FLXO 5AQMA 3I8DA 3HSCA 4DSJA 1FKOA 1RDBA 1N5YA 4RTFD 2ZD1A 3MXMA 4CJ4A 3NGIA 5KRSA 4L3QA 3LAMA 3QIOA 4K42A 2IIRA 4ELUA 5AQGA 4IJNA 3L2UA 1YJNN 1HNZK 3P39A 4BE2A 1CZBA 1SV5A 4B1VA 5KTQA 3LM9A 3H3NO 2PY5A 4BE7B 1BDGA 2YX6A 1TK5A 3TTCA 5BREA 4KBOA 1C0TA 3ZETA 1BWFO 1K6YA 4IJAA 3OY9A 2B6AA 2HHXA 2WC9A 1RBVA 4DQ8A 5DM6L 2BH1A 3TSPA 3VEVA 4AM6A 2D4WA 3KK1A 4PHTX 3V9XA 1U04A 4FJ8A 1VQ9N 2J4RA 1IBMK 1I3AA 4GNIA 4M3ZA 1W0HA 3UKUB 4BG9A 5FPEA 2ZQBA 3K5OA 4ZTFA 4KV8A 4FSVA 4H03B 1MWMA 2YNHA 4GKJK 1U48A 2E6MA 4LH5A 3CJBA 4JI3K 3DJCA 3KK3A 4X62K 3BDPA 2V7ZA 3KVGA 4CZGA 5D3GA 4AHSA 3EL2A 2HF4A 3RRGA 2BTFA 3J7ZO 4LFAK 4FOEA 4B3TK 3AY9A 3H46O 4FO0A 5LJVA 4BR4A 4DV6K 1RT2A 1N6QA 3PX6A 4CJLA 2ITMA 3SJHA 4IG3A 3U8XA 1NGCA 3CQ8A 3NCIA 5I3UA 2WTUA 2V7YA 1C0FA 2DFEA 3UKUA 1KLMA 4XEIA 2CH6A 4YDUA 3SUOA 3SNNA 4ILHA 4CEBA 3HI0A 4PWDA 4KB0A 3MAQA 2JWLA 3SQ1A 4DQSA 4PY5A 1RBUA 4JKDA 3SV3A 4H0YB 2UUAK 1T44A 3IMXA 4N56A 1NNEA 5J1EA 2HMIA 5AQLA 2E88A 1HPMA 3KKSA 5AQQA 4DCHA 4DSLA 4BRKA 1ZC6A 3MX5A 2YHYA 3T69A 2RE2A 4DLGA 4MQ3A 3M8PA 3O9SA 1L3SA 4FZZA 2EWSA 3TTDA 4H0VB 2A1SA 2P5OA 5EXWA 3TAQA 2XY6A 4JRPA 4UY8O 1EXQA 2KW4A 4LC9B 4FJGA 4PKGA 3VETA 2W40A 2IC3A 4CF1A 4IKFA 5ADXH 3AGRA 4FJ5A 4JV5K 3VF2A 4DR4K 3F9MA 3HT3A 4IEIA 4YY3K 3VQBA 3P5JA 3WNEA 1KRPA 1U2VB 1TL3A 1EX4A 2P9PB 1EETA 3C7NB 3MXJA 3OYFA 4RW9A 2BE2A 1RTHA 3UE5A 1T6CA 2A6AA 1TUUA 4E7JA 5CZ1A 3G0ZA 1X9WA 4YHHK 2ZE2A 1JKHA 3HYFA 4RCHA 3CI5A 5C15A 1TK8A 4KHYA 2NRHA 4IOXA 3CERA 4KH6A 3MMVA 3LP1A 2NRVA 3LP2A 2E2NA 4AHCA 4CI6A 3S41A 2KQ2A 3K2PA 5AZJA 4WQ4C 3KLIA 3AO2A 3L2VA 3LDOA 2O8EA 4CJFA 1RT3A 3PLAA 4Q0BA 4HUFA 1QZ5A 1U2VA 2P9PA 4JS4A 3ATUA 3AVBA 3C7NA 5AQIA 2HVIA 5LMNK 4CEZA 4X65K 5JVHL 4OX9K 3SAFA 2F4VK 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 2QKB A;  3CFR A;  3MWT A;  3PUF A;  1KCF A;  5F0X A;  4ILJ A;  2RPI A;  4A59 A;  3FZH A;  2O8B A;  4DHY A;  4DS4 A;  1UA1 A;  3V1R A;  2IDO A;  1J5E K;  3R6M A;  1NGG A;  5GAG P;  3LWL A;  2Q31 A;  3TAM A;  1NK9 A;  2HHH K;  4ID5 A;  2B5J A;  1A5X A;  3A2F A;  3BF1 A;  4BVP A;  4CHQ A;  4CZJ A;  3TSU A;  4Y1C A;  4BDP A;  4FZX C;  4DQQ A;  4W5R A;  4GY2 B;  4M3W A;  4Y1D A;  3OHR A;  3C95 A;  3VQC A;  3L2R A;  1KQS M;  1LWE A;  5AZI A;  4FLY A;  2YV0 X;  2HST A;  3TAN A;  4KHN A;  3CET A;  4JI7 K;  3NMU A;  1W7A A;  4I9L A;  1VSI A;  3RSE B;  4M63 C;  1RT6 A;  1KFS A;  3B6O A;  3RMB A;  3EO3 A;  1HKC A;  3SBT A;  2BGG A;  2QKK A;  2P5G A;  5AQN A;  3QEX A;  1KAZ A;  4CEF A;  4DU1 A;  1K73 O;  3V4I A;  2YNI A;  1UAX A;  2FC0 A;  4LFC K;  3GBT A;  3WUH A;  3DWL A;  2Q1N A;  3OS1 A;  1SKS A;  1M1K O;  1YVU A;  4J2A A;  3W3D A;  1KTQ A;  2P9L A;  3PX0 A;  4WFN L;  3OYJ A;  5DMR A;  4DFJ A;  3QIC A;  3H08 A;  2FSN A;  3WXK A;  2DFH A;  1SL2 A;  2F9W A;  4GV3 A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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