4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
b'SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN-2
molecule tags Motor protein
source organism Plasmodium berghei
publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
3FZFA 3GDQA 3VEWA 3CJ7A 3MDQA 3O1BA 1HLUA 4QS7A 4CZJA 4EFHA 3S41A 4BR5A 1NGAA 2V52B 4O5FA 4BG9A 3FZHA 2YHXA 1BO5O 3H3NO 1C0FA 4XEIA 2QWMA 2BUPA 3UKRA 3U4LA 2A42A 5AQIA 1GLDG 3D2EA 3I33A 4B1YB 5F0XA 3UE5A 3A0IX 4XH4A 1U6ZA 2V51B 2CH5A 2QWQA 3H46O 3R8EA 2QW9A 1BA0A 3VEOA 4BRAA 3VF6A 5F1XA 1NM1A 1QZ6A 4JNEA 2NRHA 4DCHA 4FWSA 4AM7A 5BRFA 5LJVA 5AQZA 3DXMB 1K8KA 2E1ZA 2GEMA 5AQLA 4FSVA 2AA4A 1D4XA 2FXUA 1YVNA 1JCFA 3I8BA 1DKGD 3U9DA 4CI6A 4BREA 3ID8A 4FOIA 4CZKA 4I6MB 1LCUA 3DXKA 5B8HA 3H6EA 4BRNA 3EKUA 4RTFD 3UKUA 4MO5A 3BF1A 2IVOA 4FWOA 2A3ZA 3HBTA 3VESA 1BOTO 3CQYA 5BRHA 5BPLA 1NBWA 3CETA 2GWJA 3ATUA 4Y0WA 4IXCA 4MLEA 1NWKA 4H0VB 3FR0A 3FZKA 3VGMA 4DHYA 1WOQA 2Q31A 1T6CA 4FL9A 4BROA 4H0XB 2YHYA 4BRGA 1ATRA 2GUPA 1QQOA 3H3OB 3EKSA 4BVOA 3MCPA 4FWNA 3CJBA 2W41A 4ISGA 1E4GT 2P9KB 1K8KB 3LM9A 4CZHA 3FGUA 1RFQA 2QXLA 2Q36A 2FSKA 3LDPA 2GTDA 2OANA 1MDUB 3GL1A 3MN6A 3HSCA 4H5NA 1Z6RA 3WUHA 4K43A 3LDLA 1TYQB 5AQHA 3VGKA 5FPNA 4H0PA 2I7PA 4FPAA 4AM6A 2A41A 3F9MA 4C23A 3A5NC 4JD2B 3ATVA 4EIAA 2BTFA 4J8FA 4CBWA 1S22A 3ZX2A 2W40A 5ADXA 2YHWA 4K41A 5BN9A 2P9UB 3WQTA 1QQNA 5ELZA 5JLFA 1GLCG 3ULEA 1SQKA 4BC5A 3SK3A 3CHWA 3HI0A 4M7YA 5AZJB 4CZEA 4WQ5A 3JS6A 1X3NA 5JICA 1NGFA 4BR0A 4JN4A 4CZLA 5BR9A 2FSNA 2ASPA 5FPMA 2Q1NA 2CGLA 3ENHA 4CZGA 2ASOA 4BGAA 1GLEG 2V7YA 1IG8A 3VOVA 3R9PA 2CGKA 4BC2A 1BU6O 3VERA 2VCPA 1MWMA 3ZX3A 4GY2B 2Q97A 4BR9A 2PAVA 2A5XA 4EHTA 2YJEA 2H3GX 3BP8A 1Y64A 3LL3A 5AQNA 4WYBA 4H5RA 1X9JA 2ZWHA 3H1VX 5AQMA 2P9NB 3C0BA 4WQ4C 1YAGA 1CZAN 1V4SA 2IIRA 4MO4A 3AAPA 3U8XA 3DJCA 1G99A 2NZTA 3EZWA 3KZBA 4A61A 2EWSA 4WQ4A 2A40A 4YDUC 3LDQA 5BPNA 3A5OC 3SMPA 4A62A 2QWOA 4E1JA 3D2FB 3QMLA 2GELA 3MN5A 3ZETA 3GG4A 3LDOA 1NGDA 5F2RA 2F9WA 4JD2A 2E1YA 3WEEB 4CJ7A 5KPZA 5JLHA 5AQSA 1SZ2A 4KBOA 4ISFA 2UYTA 2P9PB 5JMVA 4B1XB 1LOTB 4B9QA 4BRCA 2Q0UA 3A5LC 3L6QA 2KHOA 4H03B 3CJ1A 4H0TB 1Z05A 4EHUA 3CERA 4F9OA 1BDGA 4CBUA 5AQYA 4BVPA 4RWTA 5AQJA 4MLHA 1XC3A 2I7NA 4CBXA 1BWFO 1KAZA 3U9ZA 3EL2A 3P4IA 5KQDA 4BRIA 2E88A 5AQVA 1ATNA 3CJAA 4FWRA 2P9LB 2WUSA 5AZIA 2CGJA 1GLBG 3AY9A 1HPMA 3VEVA 4CD3A 1DEJA 3AAQA 3H45C 3IUCA 1BUPA 3OHRA 2A6AA 1SAZA 1QQMA 3DXKB 4H5VA 5KQ8A 3B8AX 3QDKA 4FWLA 4BRMA 4FWKA 3GBTA 5AR0A 2P9SA 4QS8A 2ITMA 4B1WB 1ESVA 1HJOA 4I6MA 1JCEA 2IVNA 3DAWA 5AQWA 4HWIA 2FF6A 3QFPA 3VF4A 3WEEA 4A2BA 3KHYA 3WT0A 1TYQA 3O80A 3ZEUA 5AFUA 1BG3A 4PKHA 3W3DA 4QS9A 1T44A 3O6WA 1EQYA 5E26A 1HX1A 2D1KA 3EN9A 4ISEA 1JCGA 3LM2A 4B1VA 1QZ5A 1WUAA 4NO7A 3O5BA 3VEZA 4WQ5C 1KAXA 2QWLA 3CI5A 5BRDA 3QICA 3SLCA 3UB5A 1U2VA 1ATSA 2AP1A 5E84A 4BRLA 2FLOA 1T6DA 4FO0A 5AQQA 1HKGA 5EXWA 2YJFA 2QWRA 1H1VA 1NGCA 3O4WA 4B1ZA 3L4IA 3VETA 3M3ZA 1C0GA 2ZF5O 3SMSA 3HTVA 4BGBA 3C7NA 3MN7A 4XH5A 4IO8A 4NB4A 4BC3A 5ADXH 3M1FA 1MA9B 4FPBA 5KPTA 3QBWA 4XH1A 4IZ9A 5AQUA 4CZIA 3VGLA 5BPMA 4PKGA 4Z94A 2P9SB 4H0OA 1NGHA 2ZGYA 3FE1A 4M7XA 3WXJA 3WXIA 4IJNA 2VWBA 5EVZA 2QWPA 4H5TA 1GLLO 3QBXA 4JHDB 4BRHA 3D2EB 3WXLA 3G25A 3ZETB 4BG8A 2E2OA 2VYPA 2P9LA 3GOIA 4K42A 4JHDA 3ENOA 1HKCA 3GE1A 4PL7A 2P9KA 3J8AA 3VEXA 2D0PA 2E8AA 4M63C 2PBDA 1R59O 2E2QA 2YCHA 4H5WA 3BEXA 4HTLA 2CH6A 3R6MA 2J4RA 1HUXA 5AQGA 3IMXA 3C7NB 4B1UB 4FOEA 3ZEUB 1XQSC 3FZLA 5AQRA 3CIPA 4IWVA 3IDHA 4GNIA 4FWQA 3A5MC 3HM8A 3AARA 3UKRB 1X3MA 3FZMA 4PKIA 3BUZB 2FSJA 3VEYA 2HOEA 4BRQA 1TUYA 4O8KA 2HMPA 2GWKA 2HF3A 1ZXOA 1HKBA 1YXQA 1Q18A 1NGGA 3IFRA 4JAXA 4K25A 3O8MA 1U2VB 2F9TA 3JXUA 5AQFA 4BRFA 2NLXA 3A8YA 4FWPA 1IJJA 2HF4A 3FFKB 1J6ZA 1YUWA 3CJ9A 4BRDA 2DPNA 2D4WA 4IJAA 1NLVA 3MK6A 5AFUH 3ULEB 3ZX0A 2ASMA 1NGBA 3W0LA 2FF3B 2QWNA 5AQXA 1NGIA 4H0YB 5BN8A 1KXPA 2P9IB 3MMVA 3QFUA 3O1WA 4BRPA 4RCHA 1NGJA 2IVPA 4CZMA 1GLAG 5EX5A 3D2FA 3O08A 5CE3A 1TUUA 2E2PA 3BF3A 5I9EB 5EY4A 3UKUB 3VPZA 1MWKA 3WXKA 4EAHD 1BA1A 1V4TA 5LJWA 3RSEA 1RGIA 4A2AA 3M6GA 5BREA 4CD1A 4PL8A 2Q2RA 3WQUA 5KPRA 1E4FT 3CQXA 3MN9A 1S3XA 2YI1A 4BQZA 3RSEB 4LC9B 2D0OA 3EO3A 4BR4A 3CJCA 3D7EO 1RDWX 3HZ6A 3VENA 1DGKN 4DQ8A 2QM1A 5AZJA 3H1QA 3QB0A 3TPQA 1ZC6A 4BQLA 3SJHA 4BC4A 1KAYA 2Q0RA 5FPEA 4BRKA 3FLCO 2P9NA 5FPDA 3L0QA 5LY3A 1ZBSA 5AQTA 2P9PA 3TU5A 4BR2A 4FWMA 5AQPA 5TKYA 3KVGA 2P9UA 1GLJO 2E2NA 4YDUA 3VF2A 2P9IA 3DXMA 4L3QA 2V7ZA 3DWLA 1XUPO 2ZGZA 5AQOA 1GLFO 4BR7A 1OKJA 1NGEA 1QHAA 4CZFA 5AZIB 2E20A 1NMDA 5AQKA 1P8ZA 3LDNA 5EOYA 4DB3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3CJ7A 4CZJA 3E9LA 1C0FA 4N76A 1HPZA 2QWMA 2BUPA 4OGCA 3CM5A 1WSGA 1RBUA 5HROA 3L2RA 2QWQA 3H46O 2RPIA 2QW9A 4CJUA 3P38A 1LV5A 5M1FA 5F1XA 1ZBUA 2HBLA 2WOMA 4DTOA 3QEXA 4W5TA 4AM7A 5LJVA 3DLLL 5AQZA 4N41A 2OZSA 5A2QO 3DXMB 3PLAA 2FXUA 3PUFA 4KB0A 1YVNA 4U67L 4CGIA 3CCVN 1IBMK 3U9DA 3E66A 4B9UA 4F2SA 4CHOA 5B8HA 4BRNA 3SBGA 2O8DA 3BF1A 4QAGA 4CHNA 3V9UA 4NCBA 2GUIA 3SUOA 3VESA 3AVAA 3CCJN 3L2QA 3QNOA 3CQYA 5DM6L 4ILJA 1NBWA 1YVUA 4IXCA 4HVJA 5C0YA 3ZSOA 1EKEA 4H0VB 4DR1K 3OYAA 4ZTFA 3CQ8A 4WCEL 2X6NA 4FL9A 3CCSN 4DQPA 1S1XA 4FWNA 4PHTX 1RDAA 2W41A 4ISGA 1E4GT 3ULDA 2XY7A 2KFZA 3LM9A 3QNNA 1T7PA 2HHXA 3V1OA 1TL3A 2YHBA 1RDCA 3J7AP 4YOVA 4H5NA 2W6LA 3MN6A 3SQ1A 1EX4A 3LDLA 2LSNA 4H0PA 2KZZA 5C10A 3B6PA 2YNGA 3K2PA 3V9SA 4CK3A 5ADXA 2RKIA 3HOTA 5J2NA 2NNWA 4DU4A 2P9UB 3WQTA 2AJQA 4QOZB 4RW9A 3SK3A 3K58A 3T3FA 4Q5VA 3P31A 5JICA 1VSJA 4JN4A 4CZLA 2ASPA 5FPMA 5AJ3K 3MWTA 2Q1NA 4FLTA 4J2EA 1C0TA 4CZGA 1NJZA 4BGAA 4E7JA 1C1BA 2OYQA 3NMUA 1XHZA 4BC2A 4BWMA 3ZLJA 3MXMA 4BR9A 1ITGA 1HYSA 4E89A 1LWEA 5C2DA 3CD6N 1RDDA 1Y64A 3MEDA 4DMNA 3NH2A 3KLFA 3J81O 4FJ5A 1VQ6N 4PQUA 4OPKA 5JENA 3H1VX 2ITGA 2P9NB 1CZAN 2NUBA 4JI2K 3I8DA 4E7IA 4MO4A 1K73O 4AHRA 1IKXA 1NJXA 3PX6A 4X66K 3DJCA 2HHHK 3EZWA 3KKSA 1JXBA 1T8EA 1N32K 3QETA 3LDQA 1FKOA 5M1OA 1QS4A 1UWBA 1ZYQA 1T05A 2OZMA 3LZIA 3LPUA 1NGDA 2DTUA 3CMEN 2UXDK 1BCMA 4FLYA 4W5OA 2X78A 1S1UA 1SZ2A 4ISFA 3CFRA 4JI8K 4B1XB 4LF9K 4B9QA 2Q0UA 3QERA 3IAYA 3NVKA 1QSSA 3AVCA 2KHOA 4H0TB 3CJ1A 4IOAL 1BDGA 4KTWA 3HJFA 1YT3A 3BDPA 5GAEP 4GV3A 5J1EA 3K9KA 1FXXA 3J7YP 2KFNA 3PSFA 4I2QA 4BWJA 2C1GA 4BRIA 1ATNA 4FWRA 1HNIA 4N5SA 1L3SA 4E1MA 5KRTA 1GLBG 3AY9A 1MU2A 3V1QA 4CD3A 1DEJA 5KTQA 1BUPA 2VQEK 3S5TA 4C1NK 1LAWA 4E72A 1P90A 2XY5A 3T1YK 3SJJA 3CC4N 4Z4EA 3QDKA 1WB9A 3S3NA 5AR0A 4GMJB 2ITMA 1WNSA 1Q9YA 2HSTA 3KHYA 5AFUA 3O80A 3NGIA 5HL7L 1EQYA 3AVLA 3NGZA 3K57A 2D1KA 4ISEA 1WUAA 4FZZA 2BE2A 4DV0K 3THWA 4C8KA 3VEZA 4WQ5C 3TANA 1N6QA 1HNZK 3AVJA 4BE7B 3SLCA 5E84A 4BRLA 4CGHA 1T6DA 5HRRA 4BEBA 1FW6A 5AQQA 3DMJA 2O8CB 1H1VA 3O4WA 4JI0K 3M3ZA 3HTVA 1XWLA 3HT3A 2E4LA 4AH9A 3L2UA 3KK1A 4EP5A 4JI6K 1MA9B 4DQRA 5KPTA 1KLNA 3F73A 4XH1A 4IZ9A 5AQUA 4CZIA 3VGLA 3AO1A 4R5PA 4PKGA 4DTSA 4M7XA 3WXIA 2RN2A 3LWMA 1J53A 3OYMA 4CEDA 1QSYA 4DS4A 3ZETB 4BG8A 3SPYA 4O5BA 2IGIA 1KVBA 3ENOA 3ZCMA 4OKEA 2HMIA 4JI5K 3K5MA 2D0PA 4CGDA 2A1RA 3S3MA 4M63C 4AHVA 1K6YA 1R59O 4DV1K 3U3GA 2E5LK 4CFDA 2OTJN 5IT9O 1HUXA 5AQGA 3VQ9A 3ZEUB 1XQSC 2PZSA 5DMRA 2JWLA 3LWLA 3KLHA 1TUYA 2G8WA 4JKEA 3TSUA 1SL2A 3QO9A 3D45A 3VQ8A 1RILA 1XI1A 1TAUA 4CEEA 3WXMB 4K25A 1L3VA 4BDYA 1U2VB 1EO1A 3JXUA 2X74A 4CK2A 2NRZA 4FK0A 4BECA 1C0UA 4CF1A 1IJJA 2HF4A 1R0AA 4NCGA 1HNWK 3CJ9A 3RR8A 5C25A 2D4WA 2E6LA 3BZCA 2YNFA 4IJAA 1C0MA 4CHYA 4JKHA 1NGBA 1YITN 4BRPA 4DQSA 2BH1A 3M8PA 1IKWA 5I42A 4AHCA 3O08A 4UQGA 3T69A 5K14A 3OYBA 1MWKA 3VQBA 4FJJA 3MXIA 4EAHD 1WBDA 3VQEA 1V4TA 3AA2A 4CD1A 4KB1A 3QESA 3WQUA 4ZTJA 1NK4A 3EZ5A 1A5VA 3OYLA 4N47A 3CYMA 1TK8A 4GVEA 3P5JA 4BR4A 1QQCA 3HZ6A 5GADP 2D0CA 3BGRA 4JRQA 3SJHA 3VTIA 4CJSA 2Q0RA 3DRPA 4BRKA 2YX6A 3FLCO 4K0KK 5GAHP 5AQTA 3DRSA 1HR0K 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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