4CBXA

Crystal structure of plasmodium berghei actin ii
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
369
structure length
358
Chain Sequence
b'SIALVVDNGSGMVKSGLAGDDAPKCVFPSIIGIPKECYVGDEAQNKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWRHTFFNELRVSPEEHPVLLTEAPLNPKTNREKMTQIMFESFDVPAMYVSIQAILSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHTVPIYEGYVLPHAINRTDMAGRDLTYYMMKLFTERGYTFTTTAEREIVRDIKEKLCYIALDYDEELKKSEERTEEVEEMYELPDGNLITVGSERFRCPEALFNPSLIGRECPGLHITAYQSIMKCDIDIRKELYNNIVLSGGTTMYNYIGERLTNEMTSLAPPSMKIKVIAPPERKYSVWIGGSILSSLSTFQKMWITKEEYDESGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Differences Explain Diverse Functions of Plasmodium Actins.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ACTIN-2
source organism Plasmodium berghei
molecule tags Motor protein
total genus 115
structure length 358
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-10-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4cbxA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4cbxA03
3MCPA 4H5NA 4H5TA 3MN5A 1KAXA 4I6MB 2A6AA 3FE1A 5BRDA 4BG9A 4K43A 2E2QA 3AAPA 2I7NA 5EX5A 1QQOA 3DXKB 2DPNA 4BRGA 2QM1A 3CJ1A 4H5RA 4NB4A 2IIRA 5F1XA 4XH1A 4H0XB 3D2EA 4ISEA 3F9MA 4ISGA 3RSEA 4M7XA 4BC5A 4B1VA 3KVGA 4EFHA 3CJAA 3R9PA 3JS6A 1NWKA 5EY4A 4IWVA 2ZWHA 5BREA 3LDOA 3CJ9A 1HX1A 4BR7A 4EHUA 3SK3A 1E4FT 5AQKA 1X3NA 2AP1A 3A5OC 4M7YA 4DB3A 2P9SB 3BUZB 4BC3A 3LM2A 1BO5O 3WEEA 3FR0A 5AQTA 3VEYA 2QWMA 2V7ZA 3VESA 2VYPA 4BQZA 3C7NA 4JAXA 4CZIA 4YDUC 1SQKA 1P8ZA 2V51B 3FZHA 2P9LA 4FPBA 3U8XA 3BF1A 1NGAA 3LM9A 1U2VB 3A5NC 5AQGA 4BC4A 3S41A 3A8YA 5AQLA 4AM6A 1Y64A 3VPZA 2CH5A 5FPMA 3ULEB 4H0TB 5AQHA 3KHYA 2ITMA 3QMLA 4BRQA 4FWPA 4O5FA 4EHTA 3ZEUA 4CZJA 2CGJA 3VF4A 2Q2RA 4FWQA 1Z05A 3ENHA 1HKCA 5F2RA 3U9DA 2YHYA 4XH5A 1NGFA 2E20A 1ATSA 4L3QA 2F9TA 3QICA 3TPQA 4YDUA 5FPDA 3ATUA 1D4XA 2P9IA 3VF2A 3DJCA 5LY3A 4FL9A 1S3XA 3CI5A 3CQYA 3SJHA 2HOEA 4BGBA 1V4SA 3AY9A 1GLBG 1HPMA 1QQMA 3VEVA 1BUPA 2D0OA 2QW9A 3H1QA 3D2FA 2A42A 2FSJA 1NBWA 1BA0A 2VCPA 1TYQB 4QS9A 3UKUA 2YHXA 2HMPA 1MWMA 4M63C 3HZ6A 3SMSA 4BRIA 3ZX0A 1TUUA 4CBUA 2E88A 1BOTO 3FLCO 2UYTA 5AQRA 4BG8A 3GE1A 4K42A 1KAZA 4PL7A 4IXCA 1KAYA 1T44A 3BF3A 4BR5A 5BPMA 3VOVA 1IJJA 3HI0A 2GTDA 1JCGA 1H1VA 4JD2B 1X9JA 4BROA 4CZHA 1GLAG 4O8KA 2A3ZA 4Z94A 4HWIA 4BRPA 3BEXA 2E2NA 5AZJA 2ASPA 2QWQA 3M3ZA 5JMVA 1BWFO 4BRCA 1BU6O 2Q31A 4FWMA 4IZ9A 5AQOA 3EKSA 3FZFA 3FZLA 1Z6RA 5AFUH 1BA1A 4IJNA 3EL2A 3WUHA 1HKBA 1ZXOA 4CBWA 2J4RA 5E84A 4H5WA 4JN4A 5AQQA 3LL3A 3H45C 5KQ8A 2P9KB 4ISFA 4EAHD 4WQ4C 2D4WA 2AA4A 3A5LC 4FO0A 3WQUA 2E1YA 5BPNA 4WQ5A 1DKGD 3L0QA 4C23A 2GELA 3JXUA 5AFUA 3FZKA 5KQDA 5F0XA 3MN6A 5FPNA 1E4GT 2GUPA 1NGDA 4KBOA 2E8AA 2CGKA 3UB5A 1R59O 4B9QA 2NRHA 5AQSA 4BRHA 1K8KB 1NM1A 2FF3B 4XH4A 1GLFO 4B1UB 4CD1A 4EIAA 2Q36A 2BTFA 5BPLA 2QWOA 3ID8A 1BG3A 1WUAA 2Q1NA 5TKYA 3VGMA 2V52B 2QXLA 3ZX2A 1NMDA 1Q18A 2VWBA 4WQ4A 1GLCG 1ATRA 3ZEUB 4BRFA 3QFUA 2YCHA 4LC9B 3UKRA 5AZIA 3ZETB 5BN8A 2YJFA 4IJAA 3M6GA 4FWKA 4BRDA 4B1ZA 2GWJA 4FWLA 4E1JA 4CZKA 5ADXH 3L6QA 4GNIA 3ENOA 3O6WA 3U9ZA 2EWSA 3KZBA 2V7YA 1CZAN 1G99A 1SZ2A 5AQWA 5AQMA 5BRHA 1XC3A 3IFRA 5LJVA 4BVOA 3CJ7A 2E1ZA 1S22A 5AQJA 3DXMB 4CZMA 3VGKA 4QS7A 2QWPA 1NGBA 3A0IX 2P9SA 1EQYA 3UKUB 1YXQA 3MN7A 4A2AA 2P9PA 4BVPA 4J8FA 4BRKA 1X3MA 4FWSA 3O8MA 2ZGYA 4CZFA 3J8AA 3ZX3A 4BRMA 5EXWA 1NGEA 3VEXA 3C0BA 1RGIA 1ESVA 5AQNA 2Q0UA 4BR2A 4FOEA 3WXKA 4CBXA 3DAWA 1J6ZA 3DWLA 1QZ5A 4DQ8A 2PAVA 3FFKB 4WQ5C 3ULEA 2E2OA 4QS8A 2YI1A 4MO5A 3ATVA 3EKUA 1C0GA 2P9NA 4CZEA 2KHOA 5CE3A 2QWNA 4F9OA 1LCUA 3UE5A 5I9EB 1NGIA 4A2BA 5BRFA 1QQNA 3GOIA 2CGLA 2YHWA 4BR9A 5LJWA 3MMVA 3D2EB 2HF3A 4BQLA 3RSEB 2P9UA 4H0OA 3SMPA 2I7PA 3CHWA 3OHRA 1YVNA 4CZLA 3CQXA 3GDQA 4PKIA 1WOQA 1U6ZA 5JICA 1ZBSA 3H6EA 3EN9A 3H46O 4JHDA 2W40A 3IMXA 4MLHA 4B1XB 1MA9B 1GLJO 3WXIA 3MN9A 3WEEB 3D7EO 2E2PA 4K25A 3O1WA 3VETA 1DGKN 1HUXA 5AQYA 4NO7A 3O08A 3QBWA 3C7NB 2FSKA 3MK6A 5AQFA 4Y0WA 5KPRA 3O4WA 4FOIA 3UKRB 4BRNA 2P9LB 3GG4A 3QBXA 5AZIB 2FLOA 5AQUA 3R8EA 1GLDG 2CH6A 3O80A 3G25A 4JD2A 5KPZA 2NZTA 3BP8A 1V4TA 1LOTB 4JNEA 3P4IA 4CD3A 3IDHA 2FSNA 2BUPA 3CJCA 4BREA 1ATNA 1KXPA 4I6MA 4B1YB 2P9KA 4IO8A 1OKJA 3LDNA 1MWKA 3O1BA 3H1VX 2ASOA 3VERA 5AQVA 3WXLA 4DCHA 5B8HA 2P9PB 3VF6A 3DXKA 4RTFD 3VGLA 3CERA 3AAQA 2IVPA 1T6DA 3H3OB 3H3NO 1HLUA 4CJ7A 2P9IB 1RFQA 2QWRA 1YUWA 3AARA 3CETA 4BRAA 3HTVA 4PKHA 2NLXA 4FSVA 1IG8A 1QZ6A 3QFPA 5AQZA 2HF4A 3CIPA 2GWKA 3SLCA 3D2FB 1K8KA 1NLVA 1XUPO 4MLEA 5EVZA 2A40A 4BR0A 1RDWX 3W0LA 1YAGA 4DHYA 3M1FA 4H0YB 2YJEA 1MDUB 5ADXA 1C0FA 3HM8A 5AQIA 2OANA 3LDQA 2P9NB 4BR4A 4FPAA 5ELZA 3U4LA 5BR9A 1HKGA 2ASMA 4K41A 3VEWA 4H0PA 1JCEA 4PL8A 2IVNA 3ZETA 4BC2A 4MO4A 1NGHA 5AZJB 1U2VA 3VENA 3IUCA 3B8AX 5JLFA 2WUSA 5JLHA 4RCHA 4B1WB 4BGAA 2ZGZA 3EO3A 3R6MA 2FXUA 3FGUA 4H03B 2P9UB 1NGCA 1TUYA 1SAZA 2Q97A 4FWRA 5EOYA 3HSCA 3WXJA 3TU5A 4RWTA 2A41A 4XEIA 4JHDB 3GL1A 3CJBA 2A5XA 3QB0A 1NGJA 3I33A 3I8BA 2W41A 1BDGA 5AR0A 3EZWA 3LDLA 5BN9A 5AQXA 4AM7A 1GLLO 3DXMA 4A62A 1GLEG 1XQSC 1DEJA 3FZMA 5E26A 3O5BA 4WYBA 3QDKA 3MDQA 4H0VB 4FWNA 1JCFA 4HTLA 3LDPA 3WQTA 3VEZA 5KPTA 2GEMA 2H3GX 4CZGA 3WT0A 5FPEA 2IVOA 4A61A 1NGGA 2FF6A 3VEOA 3L4IA 3W3DA 1QHAA 4H5VA 4BRLA 2Q0RA 1HJOA 2ZF5O 3A5MC 1TYQA 3HBTA 2F9WA 2QWLA 4CI6A 1ZC6A 1T6CA 2D1KA 4GY2B 3GBTA 2PBDA 5AQPA 4FWOA 2D0PA 4PKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4H5TA 4CVNE 3OYKA 1XWLA 2E2QA 3VQDA 1QQOA 3SBGA 3OYIA 3T3FA 4F2RA 4XH1A 3D2EA 4E7IA 2HHHK 4DQIA 4B1VA 1NWKA 2FBTA 3CYMA 3TAQA 1IH7A 4BE7B 4CJTA 4DR2K 1VQLN 2HNZA 1HX1A 3CPEA 4X64K 4DTOA 4EHUA 2UXCK 1X3NA 3SZ2A 2AP1A 4M7YA 2P9SB 1VSJA 2UUCK 3VEYA 3DRPA 4FK2A 3C7NA 1D9FA 3CM5A 3FZHA 4BDPA 3U8XA 3RR8A 3BF1A 3HP9A 3NAEA 4B3SK 1U2VB 3CF5L 3S41A 5AQLA 1C0UA 1VSMA 5AQHA 4CW7B 3QMLA 4BRQA 3OYEA 1NK0A 3NBPA 5HRPA 4KREA 2JWLA 1ZBLA 2CGJA 1C1CA 3VF4A 4N76A 3THWB 1Z05A 1HKCA 3HK2A 4XH5A 3S3OA 1O13A 2F9TA 1I3AA 1NU0A 4FJ5A 2YKMA 3QICA 1WSJA 4YDUA 2IGIA 3ATUA 1YI2N 4CHNA 1S3XA 2YNFA 3ISNC 2HOEA 2ZQBA 4BGBA 2E4LA 4YY3K 1QSYA 3NHGA 2QW9A 3H1QA 1OVYA 1JL2A 1TYQB 1MWMA 2YKNA 4JRQA 3HZ6A 4FW2A 1TUUA 4WF9L 4FVMA 2NRVA 4KTWA 1YHQN 3SV4A 2ZE2A 3QEPA 2D5RA 4BR5A 3BF3A 1GOCA 2O8BA 1IJJA 2GTDA 1H1VA 4BROA 1X9JA 3RR7A 1S1UA 3VQQA 1NJYA 3ZT2A 1BU6O 4BRCA 4A59A 1QSLA 5AQOA 4CK1A 1BA1A 1X1PA 3KK2A 3VQAA 4KTZA 4KHYA 3C95A 4CBWA 1JLEA 2ETJA 4C8OA 4LD0A 3DOLA 2WTUA 4ISFA 1IKXA 1RT5A 3A5LC 4AHCA 3LP0A 5IT9O 3L0QA 2F8TA 4IDHA 1HNIA 3JXUA 2X6SA 1BISA 1ZBUA 4DFKA 4B9SA 2DFEA 3BZCA 4NXNK 3M8RA 5F0XA 3DOKA 2E8AA 3NVMA 4DF8A 3CXCM 4K0KK 4B1UB 4XH4A 3L3VA 2VWJA 2BTFA 4CEDA 5BPLA 4FW1A 2QWOA 3ID8A 1WUAA 3VGMA 2G8UA 4UQGA 3OJUA 4IG3A 3AVBA 1Q18A 4JK9A 3QFUA 2YCHA 3NE6A 1S1VA 2YJFA 4IJAA 3T19A 2BH1A 4KH4A 4B8CA 4KAZA 3P5JA 4O8UA 4FWLA 4E1JA 3TAFA 1VSFA 4PA1A 1KFSA 2UU9K 5DM6L 4JI7K 3MWPA 4CGJA 2V7YA 4M3UA 2IC3A 1RBVA 1VAZA 5M1PA 5LMNK 2HW3A 5SZTA 5AQWA 3QO9A 1VRTA 1HMVA 4N56A 4HHTA 4DF4A 4ID5A 1VQ4N 2OZSA 4DR6K 4CZMA 3UKUB 2P9SA 1EQYA 4CECA 3MN7A 3LWMA 2P9PA 4BVPA 3HOTA 4GKJK 5D3GA 4FWSA 3IKMA 3O8MA 2ZGYA 3J8AA 4F4KA 3L2RA 3EZ5A 3ZX3A 4DTJA 3I55N 5EXWA 1KVCA 5AJ3K 4ELTA 1OVQA 1NGEA 3ZSXA 4FYDA 4LF5K 5AQNA 2HSTA 1XI1A 1WSEA 2OTLN 1U48A 1IG9A 4OPHA 1ILYA 5FLXO 5CR4A 3J7AP 1RCHA 3ZSWA 2E2OA 2YI1A 1BI4B 3EKUA 1T8EA 1C0GA 3C6HA 5CE3A 2IS3A 3PSFA 4DTMA 2QWNA 5LL6Z 3UE5A 3THWA 4DQQA 4OX9K 1QQNA 3THVA 3OYNA 4JK7A 1TAUA 3MMVA 4OGEA 5BR8K 3THXB 3SMPA 3C65A 4KKOA 3CCEN 4CZLA 3GDQA 1WOQA 5A2QO 2X6NA 2QEXN 3NH2A 1RBTA 4W5NA 3QINA 1A5WA 4BWJA 4O4GA 1GLJO 4EP5A 2KFNA 3WEEB 3KLIA 3D7EO 4K25A 4CE9A 4E0DA 2HHQA 3SI6A 3QBWA 2FC0A 5AQFA 3VQ7A 2UXBK 4LSNA 3WNHA 1RTIA 1VQNN 4BRNA 1RTHA 2P9LB 5T7BA 1L5UA 4CF0A 3QBXA 5AZIB 4CHOA 1JJ2M 2FLOA 4QAGA 3O80A 3NDKA 4JS4A 3G25A 3AVNA 2P1JA 3KIOA 5GIPA 4TSXA 1V4TA 4FJGA 1LOTB 2YNIA 4JNEA 4DV2K 5M1NA 4W5TA 3P4IA 3IDHA 2HHVA 4YOTA 5DM7L 1ASVA 4I2PA 4I6MA 4KV8A 1U45A 4FCYA 4IO8A 1OKJA 3LDNA 1BQMA 1TGOA 1T05A 4OLBA 3WXLA 2D0AA 5AQVA 4DCHA 2O8DB 3G6EN 4FXDA 4CFAA 3AAQA 1T6DA 3S3MA 2O8FB 4YOXA 5K14A 4AHUA 4CJ7A 2P9IB 3SV3A 1RFQA 3TARA 1YUWA 3QEVA 4BRAA 1HPZA 1RDUA 1IG8A 4C8KA 3QFPA 1C0TA 4GV6A 3PV8A 3SLCA 3D2FB 1XUPO 4DTRA 2BGGA 4KH6A 3ZT1A 1YIJN 1YAGA 4JV5K 3M1FA 3HXMA 4B9NA 3T7ZA 4YOYA 3LDQA 4YNQA 4IFEA 3AVCA 1J5OA 2P5GA 3A2FA 4FJKA 4PL8A 4CJEA 4BACA 1HQEA 1WSHA 4MO4A 4LFCK 3NF8A 3IUCA 5JLFA 4RCHA 4NLCA 3O4QA 3R6MA 3OYFA 2FXUA 4Y1CA 1NGCA 3OVNA 1TUYA 4B08A 3L2WA 5HLFA 3E9OA 3IRXA 4JKFA 1B9DA 3OTOK 4FWRA 3CQ8A 1RBRA 4JKAA 3HPHA 2A1SA 2OPPA 4IBNA 1NGJA 1CXQA 1FXXA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 1IV0 A;  4Z4H A;  2P9N A;  4CK3 A;  4JK8 A;  3ZYY X;  1LCU A;  5CHI A;  1N34 K;  3HPO A;  4CJ5 A;  5I9E B;  1NGI A;  3GOI A;  3UIQ A;  2YHW A;  3Q7B A;  4BR9 A;  3D2E B;  2HF3 A;  2FBV A;  1VQM N;  3VA0 A;  1LWC A;  3U3Y A;  3H46 O;  4MDB A;  2W40 A;  3IMX A;  4MLH A;  3QET A;  3VQP A;  3MXI A;  1WSG A;  3O1W A;  1DGK N;  4NO7 A;  1JLG A;  4Q5V A;  3CC4 N;  3C7N B;  2FSK A;  3MK6 A;  4Y0W A;  1NG9 A;  3O4W A;  2NRW A;  1QQC A;  5AQU A;  1GLD G;  3CYG A;  4IEE A;  5KPZ A;  4AHV A;  1CLQ A;  4IDK A;  4B3T K;  4HVJ A;  2G8F A;  4CD3 A;  2FSN A;  1YTU A;  4DG1 A;  3OY9 A;  3E01 A;  1KXP A;  4XJX A;  1UOC A;  1RT4 A;  4YOR A;  4B1Y B;  2P9K A;  2VGN A;  3L3U A;  3E9P A;  2GBZ A;  1MWK A;  1VSK A;  2ASO A;  1TAQ A;  1K6Y A;  5B8H A;  5J1E A;  2ZM6 K;  4Z4G A;  3ID6 A;  3VF6 A;  3DXK A;  1FK9 A;  1EX4 A;  1NOZ A;  4NYN A;  4CF9 A;  3OA9 A;  3AAR A;  3HTV A;  3KLH A;  4M42 A;  1KVA A;  2NLX A;  1WAJ A;  4J2B A;  4AHR A;  1UAX A;  4CEE A;  3K2P A;  1M1K O;  3OYG A;  3KKS A;  4YOV A;  1X9S A;  1K8K A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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