4CFLA

N-terminal bromodomain of human brd4 with ly303511
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Commonly Used Pi3-Kinase Probe Ly294002 is an Inhibitor of Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
molecule keywords BRD4 PROTEIN
source organism Homo sapiens
molecule tags Cell cycle
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cflA01
4CUPA 4TS8A 5F3AA 5C4QA 3SVFA 5H1TA 5CUBA 1X0JA 5DKHA 5J0DA 5KTXA 5D25A 2N9GA 5CQ6A 2WP2A 5CRZA 3P1CA 4UIZA 4J0RA 4NR5A 5H85A 5I7XA 5EPBA 4UYDA 2DKWA 4NRBA 4WHWA 4MEPA 4WHUA 4ZC9A 5EPRA 5CZGA 4HXPA 4A9OA 4QEUA 2L84A 4NYVA 5F1HA 5HEMA 2DVRA 5ENJA 5AMFA 3NXBA 5EQ1A 5FE6A 3Q2FA 2DWWA 5DYUA 4HXNA 3IU5A 4ALGA 5E9LA 3UW9A 4MR4A 4NR4A 5AMEA 4BW1A 4NRCA 4KV1A 3P5OA 4LZSA 2FSAA 5L96A 4YYIA 4NQMA 4Z1SA 4O74A 4PY6A 5CY9A 5F36A 5H1VA 3ZYUA 4IORA 2DATA 4O7FA 5FH8A 5C89A 5I89A 4NR6A 4QZSA 4YC9A 5L8UA 4CUUA 2DVSA 4J1PA 5CRMA 5I1QA 4NYXA 4QC3A 4CFKA 5ENGA 4HXRA 2DVVA 3LQIA 4OUFA 5EVAA 3HMHA 4QC1A 5A82A 5EICA 4A9MA 4QY4A 5FE1A 3S91A 5IGKA 4QSRA 4CL9A 4O78A 3O34A 3DAIA 5ENBA 5KTUA 5L99A 4YAXA 5BT4A 4LYWA 4QSSA 4A9HA 2OUOA 3HMEA 4MEQA 3JVKA 5FH7A 2L5EA 5EWWA 5L98A 5HELA 4TT2A 5COIA 3UVYA 4BW3A 2L85A 4NS5A 5FFYA 5E9MA 4O7EA 3U5MA 5EISA 4FLPA 4O72A 5DBMA 5ETDA 5II1A 2I7KA 4YH3A 4HBXA 5IBNA 2YDWA 3MB4A 5BT3A 4YY4A 4KCXA 3LJWA 4BJXA 4QSXA 5EI4A 5F63A 5D3HA 5KO4A 4QUUA 5A7CA 4ALHA 3UVDA 2H60A 5LKZA 4LYIA 3UV4A 4YABA 1JSPB 5EK9A 5I40A 5EA1A 4CUTA 4TYLA 5A5OA 4QYLA 5A5QA 2RI7A 4TU6A 3U5KA 5CP5A 4PKLA 2R10A 5E9VA 4LZRA 4IOQA 3P1FA 4NUEA 4HBWA 4F3IA 5D24A 5FE0A 5CS8A 4N4FA 4QSWA 5HCLA 5CQ8A 5FG6A 5I88A 5I80A 5KHMA 5CGPA 5FG4A 5ENIA 5IGLA 5CUEA 4A9JA 4Y03A 4Q0OA 5CQTA 4LZ2A 4UIUA 4ZQLA 5A81A 4Z93A 3P1EA 3UVXA 3ONIA 5E9KA 5K29A 4O70A 3LXJA 5CU8A 4NR8A 5CUCA 5DX4A 3U5NA 4QR3A 4NXJA 4O7CA 5LKTA 4MEOA 3DWYA 2KTBB 3QZTA 2D9EA 4Z6IA 1WUGA 5JWMA 5FFVA 2R0SA 4GPJA 4A9KA 5ENCA 5C87A 3U5PA 1N72A 5D0CA 5LUUA 5EWCA 1E6IA 5FDZA 5I83A 5EP7A 4X2IA 4YYNA 4IR5A 4RVRA 4ZW1A 5A83A 5CUDA 2DVQA 5HQ7A 5HRXA 5DLXA 4O7AA 3LQHA 4MR5A 5ENEA 5E9IA 4HXMA 5LKUA 4LYSA 5DFBA 4QR4A 4NR7A 5L97A 3QZVA 3LQJA 3UV5A 5ETBA 4UIXA 2MJVB 5CTLA 5F1LA 4TTEA 4CFLA 4TT6A 2RNXA 2YEKA 5CQ4A 5HJCA 4PCEA 5LKXA 5DYCA 5FB1A 5HFQA 3QZSA 5FG5A 4A9EA 4LR6A 2RFJA 4A9NA 3MXFA 5E9YA 5LJ0A 5E74A 4MR6A 5I7YA 4QNSA 4HXKA 5I86A 5EU1A 4OGIA 4CUQA 5FE5A 4YH4A 4YATA 3U5LA 2E7OA 5IG6A 4HBYA 5FBXA 4PCIA 4O75A 4UYFB 5DFDA 2G4AA 5CQ3A 4A9LA 4LRGA 5E7DA 4PS5A 5DW2A 5TCMA 5A85A 5DKDA 5EV9A 4QR5A 5E3DA 5CUAA 1EQFA 4E96A 5AD3A 3FKMX 3I3JA 4YBSA 4UYHA 5HQ5A 4QSTA 3SVGA 4HXLA 4XUAA 5EPSA 5FE3A 2E3KA 5C7NA 5LVQA 5DLZA 5HRWA 2NXBA 4O76A 3O37A 4XUBA 5HRVA 4BW2A 4N3WA 3P1DA 5LJ2A 5EWDA 2OSSA 4YYDA 4CURA 3AQAA 4YYMA 3U5JA 5FE8A 4DONA 5EWVA 4YYHA 4IR4A 4CLBA 2D82A 3UV2A 5DYXA 4YYJA 5D3LA 2F6NA 1ZS5A 4YBMA 4O77A 5HENA 2OO1A 4UITA 5KU3A 3K2JA 5ENHA 3RCWA 4HXOA 4KV4A 4Z6HA 4N4HA 5JI8A 5D3RA 5I29A 5DY7A 4NUCA 5D3JA 5BT5A 2LSPB 5FE2A 3IU6A 4QSUA 4XY8A 4XY9A 5FE7A 5TB6A 5H1UA 3HMFA 3D7CA 2WP1A 3UVWA 2RNWA 5E73A 4TU4A 3MQMA 3MUKA 4TZ2A 4IOOA 5DFCA 3S92A 4YBTA 5IIDA 3JVMA 4NUDA 5IGNA 3AADA 4A9FA 5FB0A 4TQNA 2R0VA 4TT4A 4UIVA 5DKCA 4UYGA 3JVLA 5D3PA 4UYFA 4MENA 4QEVA 5D3TA 3O35A 3MB3A 4J0SA 3SVHA 1F68A 4OGJA 5G4SA 4HXSA 4QEWA 5D26A 5A5NA 5HLSA 4QUTA 1WUMA 5CQ7A 5CUGA 5FE4A 3U5OA 5A5SA 2YYNA 4AKNA 4YYGA 2GRCA 4YYKA 4C66A 4QB3A 5LJ1A 5F5ZA 4IR3A 4UIWA 5ACYA 5HM0A 2I8NA 5F25A 4QBMA 4WIVA 5EGUA 4PTBA 5A5RA 5L8TA 3Q2EA 5A5PA 2YW5A 5EM3A 2YELA 5LVRA 3GG3A 4YK0A 2RS9B 4QSQA 2RO1A 5D7XA 5CQ5A 4NR9A 4XYAA 4O71A 5G4RA 5F61A 4C67A 4NRAA 4YY6A 5FE9A 4MR3A 4QSVA 5HFRA 5D3SA 5II2A 5HQ6A 4O7BA 2R0YA 4J3IA 5CQAA 5DYAA 5EWHA 5E3GA 3JVJA 2YQDA 4A9IA 3O36A 4LC2A 3MULA 3TLPA 5D3NA 4CUSA 5IGMA 4HBVA 5F60A 4UIYA 2F6JA 3G0JA 5C85A 5F2PA 4N4IA 2YEMA 5CFWA 4BW4A 5CPEA 5FFWA 4BHWA 4NQNA 5C8GA 5DW1A 2RNYA 3G0LA 5E0RA 4YADA 5ENFA 4Z1QA 5KTWA 5AD2A 5FH6A 1JM4B 4QSPA 4UYEA 4QYDA 4TZ8A 4NYWA 4Q0NA 4LDFA 5F62A 2E7NA 4IR6A 3O33A 4N4GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CUPA 4TS8A 5F3AA 5C4QA 3SVFA 5H1TA 5CUBA 1X0JA 5DKHA 5J0DA 5KTXA 5D25A 2N9GA 5CQ6A 2WP2A 5CRZA 3P1CA 4UIZA 4J0RA 4NR5A 5H85A 5I7XA 5EPBA 4UYDA 2DKWA 4NRBA 4WHWA 4MEPA 1ZKRA 4WHUA 4ZC9A 5EPRA 5CZGA 4HXPA 4A9OA 4QEUA 2L84A 4NYVA 5F1HA 5HEMA 2DVRA 5ENJA 5AMFA 3NXBA 5EQ1A 5FE6A 3Q2FA 2DWWA 5DYUA 4HXNA 3IU5A 4ALGA 5E9LA 3UW9A 4MR4A 4NR4A 5AMEA 4BW1A 4NRCA 4KV1A 3P5OA 4LZSA 2FSAA 5L96A 4YYIA 4NQMA 4Z1SA 4O74A 4PY6A 5CY9A 5F36A 5H1VA 3ZYUA 4IORA 2DATA 4O7FA 5FH8A 5C89A 5I89A 4NR6A 4QZSA 4YC9A 5L8UA 4CUUA 2DVSA 4J1PA 5CRMA 5I1QA 4NYXA 4QC3A 3D1DA 3ERRA 4CFKA 5ENGA 4HXRA 2DVVA 3LQIA 4OUFA 5EVAA 3HMHA 4QC1A 5A82A 5EICA 4A9MA 4QY4A 5FE1A 3S91A 5IGKA 4QSRA 4CL9A 4O78A 3O34A 3DAIA 5ENBA 5KTUA 5L99A 4YAXA 5BT4A 4LYWA 4QSSA 4A9HA 2OUOA 3HMEA 4MEQA 3JVKA 5FH7A 2L5EA 5EWWA 5L98A 5HELA 3D1BA 4TT2A 5COIA 3UVYA 4BW3A 2L85A 4NS5A 5FFYA 5E9MA 4O7EA 3U5MA 5EISA 4FLPA 4O72A 5DBMA 5ETDA 5II1A 2I7KA 4YH3A 4HBXA 5IBNA 2YDWA 3MB4A 5BT3A 4YY4A 4KCXA 3LJWA 4BJXA 4QSXA 5EI4A 5F63A 5D3HA 5KO4A 4QUUA 5A7CA 4ALHA 3UVDA 2H60A 5LKZA 4LYIA 3UV4A 4YABA 1JSPB 5EK9A 5I40A 5EA1A 4CUTA 4TYLA 5A5OA 4AKIA 4QYLA 5A5QA 2RI7A 4TU6A 3U5KA 5CP5A 4PKLA 2R10A 5E9VA 4LZRA 4IOQA 3P1FA 4NUEA 4HBWA 4F3IA 5D24A 5FE0A 5CS8A 4N4FA 4QSWA 5HCLA 5CQ8A 5FG6A 5I88A 5I80A 5KHMA 5CGPA 5FG4A 5ENIA 5IGLA 5CUEA 4A9JA 4Y03A 4Q0OA 5CQTA 4LZ2A 4UIUA 4ZQLA 5A81A 4Z93A 3P1EA 3UVXA 3ONIA 5E9KA 5K29A 4O70A 3LXJA 5CU8A 4NR8A 5CUCA 5DX4A 3U5NA 4QR3A 4NXJA 4O7CA 5LKTA 4MEOA 3DWYA 2KTBB 3QZTA 3VKGA 2D9EA 4Z6IA 1WUGA 5JWMA 5FFVA 2R0SA 4GPJA 4A9KA 5ENCA 5C87A 3U5PA 1N72A 5D0CA 5LUUA 5EWCA 1E6IA 5FDZA 5I83A 5EP7A 4X2IA 4YYNA 4IR5A 4RVRA 4ZW1A 5A83A 5CUDA 2DVQA 5HQ7A 5HRXA 5DLXA 4O7AA 3LQHA 4MR5A 5ENEA 5E9IA 1PUOA 4HXMA 5LKUA 4LYSA 5DFBA 4QR4A 4NR7A 5L97A 4AI6A 3QZVA 3LQJA 3UV5A 5ETBA 4UIXA 2MJVB 5CTLA 5F1LA 4TTEA 4CFLA 4TT6A 2RNXA 2YEKA 5CQ4A 5HJCA 4PCEA 5LKXA 5DYCA 5FB1A 5HFQA 3QZSA 5FG5A 4A9EA 4LR6A 2RFJA 4A9NA 3MXFA 5E9YA 5LJ0A 5E74A 4MR6A 5I7YA 4QNSA 4HXKA 5I86A 5EU1A 4OGIA 4CUQA 5FE5A 4YH4A 4YATA 3U5LA 2E7OA 5IG6A 4HBYA 5FBXA 4PCIA 4O75A 4UYFB 5DFDA 2G4AA 5CQ3A 4A9LA 4LRGA 5E7DA 4PS5A 5DW2A 5TCMA 5A85A 5DKDA 5EV9A 4QR5A 5E3DA 5CUAA 1EQFA 4E96A 5AD3A 3FKMX 3I3JA 4YBSA 4UYHA 5HQ5A 4QSTA 3SVGA 4HXLA 4XUAA 5EPSA 5FE3A 2E3KA 5C7NA 5LVQA 5DLZA 5HRWA 2NXBA 4O76A 3O37A 4XUBA 5HRVA 4BW2A 4N3WA 3P1DA 5LJ2A 5EWDA 2OSSA 4YYDA 4CURA 3AQAA 4YYMA 3U5JA 5FE8A 4DONA 5EWVA 4YYHA 4IR4A 4CLBA 2D82A 3UV2A 5DYXA 4YYJA 5D3LA 2F6NA 1ZS5A 4YBMA 4O77A 5HENA 2OO1A 4UITA 5KU3A 3K2JA 5ENHA 3RCWA 4HXOA 4KV4A 4Z6HA 4N4HA 5JI8A 5D3RA 5I29A 5DY7A 4NUCA 5D3JA 5BT5A 2LSPB 5FE2A 3IU6A 4QSUA 4XY8A 4XY9A 5FE7A 5TB6A 5H1UA 3HMFA 3D7CA 2WP1A 3UVWA 2RNWA 5E73A 4TU4A 3MQMA 3MUKA 4TZ2A 4IOOA 5DFCA 3S92A 4YBTA 5IIDA 3JVMA 4NUDA 5IGNA 3AADA 4A9FA 5FB0A 4TQNA 2R0VA 4TT4A 4UIVA 5DKCA 4UYGA 3JVLA 5D3PA 4UYFA 4MENA 4QEVA 5D3TA 3O35A 3MB3A 4J0SA 4AKGA 3SVHA 1F68A 4OGJA 5G4SA 4HXSA 4QEWA 5D26A 5A5NA 5HLSA 4QUTA 1WUMA 5CQ7A 5CUGA 5FE4A 3U5OA 5A5SA 2YYNA 4AKNA 4YYGA 2GRCA 4YYKA 4C66A 4QB3A 5LJ1A 5F5ZA 4IR3A 4UIWA 5ACYA 5HM0A 2I8NA 5F25A 4QBMA 4WIVA 5EGUA 4PTBA 5A5RA 5L8TA 3Q2EA 5A5PA 2YW5A 5EM3A 2YELA 5LVRA 3GG3A 4YK0A 2RS9B 4QSQA 2RO1A 5D7XA 5CQ5A 4NR9A 4XYAA 4O71A 3VKHA 5G4RA 5F61A 4C67A 4AKHA 4NRAA 2EJNA 4YY6A 5FE9A 4MR3A 4QSVA 5HFRA 5D3SA 5II2A 5HQ6A 4O7BA 2R0YA 4J3IA 5CQAA 5DYAA 5EWHA 5E3GA 3JVJA 2YQDA 4A9IA 3O36A 4LC2A 3MULA 3TLPA 5D3NA 4CUSA 5IGMA 4HBVA 5F60A 4UIYA 2F6JA 3G0JA 5C85A 5F2PA 4N4IA 2YEMA 5CFWA 4BW4A 5CPEA 5FFWA 4BHWA 4NQNA 5C8GA 5DW1A 2RNYA 3G0LA 5E0RA 4YADA 5ENFA 4Z1QA 5KTWA 5AD2A 5FH6A 1JM4B 4QSPA 4UYEA 4QYDA 4TZ8A 4NYWA 4Q0NA 4LDFA 5F62A 2E7NA 4IR6A 3O33A 4N4GA
chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4CUP A;  4TS8 A;  5F3A A;  5C4Q A;  3SVF A;  5H1T A;  5CUB A;  1X0J A;  5DKH A;  5J0D A;  5KTX A;  5D25 A;  2N9G A;  5CQ6 A;  2WP2 A;  5CRZ A;  3P1C A;  4UIZ A;  4J0R A;  4NR5 A;  5H85 A;  5I7X A;  5EPB A;  4UYD A;  2DKW A;  4NRB A;  4WHW A;  4MEP A;  4WHU A;  4ZC9 A;  5EPR A;  5CZG A;  4HXP A;  4A9O A;  4QEU A;  2L84 A;  4NYV A;  5F1H A;  5HEM A;  2DVR A;  5ENJ A;  5AMF A;  3NXB A;  5EQ1 A;  5FE6 A;  3Q2F A;  2DWW A;  5DYU A;  4HXN A;  3IU5 A;  4ALG A;  5E9L A;  3UW9 A;  4MR4 A;  4NR4 A;  5AME A;  4BW1 A;  4NRC A;  4KV1 A;  3P5O A;  4LZS A;  2FSA A;  5L96 A;  4YYI A;  4NQM A;  4Z1S A;  4O74 A;  4PY6 A;  5CY9 A;  5F36 A;  5H1V A;  3ZYU A;  4IOR A;  2DAT A;  4O7F A;  5FH8 A;  5C89 A;  5I89 A;  4NR6 A;  4QZS A;  4YC9 A;  5L8U A;  4CUU A;  2DVS A;  4J1P A;  5CRM A;  5I1Q A;  4NYX A;  4QC3 A;  4CFK A;  5ENG A;  4HXR A;  2DVV A;  3LQI A;  4OUF A;  5EVA A;  3HMH A;  4QC1 A;  5A82 A;  5EIC A;  4A9M A;  4QY4 A;  5FE1 A;  3S91 A;  5IGK A;  4QSR A;  4CL9 A;  4O78 A;  3O34 A;  3DAI A;  5ENB A;  5KTU A; 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