4CFLA

N-terminal bromodomain of human brd4 with ly303511
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Cell cycle
molecule keywords BRD4 PROTEIN
publication title The Commonly Used Pi3-Kinase Probe Ly294002 is an Inhibitor of Bet Bromodomains.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 45
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-11-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cflA01
5A81A 2OO1A 4LZ2A 4MR6A 5D7XA 4QEUA 4YH3A 5JI8A 5HENA 3O36A 5DKDA 2R0VA 5F62A 5EWCA 3Q2FA 5C4QA 5TB6A 5L8UA 4UYFA 5E3DA 4QSWA 4QBMA 3U5MA 5IBNA 5BT5A 5D3JA 4CUTA 4N4GA 3SVGA 4BW4A 5II2A 4YYGA 4TQNA 4X2IA 5CUGA 2G4AA 5F2PA 5HJCA 5AMEA 5DW1A 4LZRA 5ENHA 5KTWA 4OGJA 4IOOA 4IR4A 5F5ZA 4HXRA 4F3IA 2DKWA 4KV4A 4CLBA 5DY7A 3UVWA 5HFQA 5FFYA 5FE6A 2R0SA 2DVQA 4PKLA 4QSPA 3MULA 4O70A 5EPRA 5CS8A 5E9LA 5I80A 5I7XA 5HQ6A 4YYHA 2L84A 4O7CA 5LKZA 4AKNA 3P5OA 4KCXA 3U5PA 5CQ8A 5ENEA 5CUBA 3GG3A 3UVYA 5CGPA 5FE5A 3SVFA 5E9YA 4QSVA 4YBMA 3LXJA 5A5RA 4J3IA 5L97A 3LQJA 4C67A 4BW2A 4YYMA 3IU6A 2WP1A 4QR5A 2E3KA 5KHMA 5D3RA 5LKTA 4NRAA 5DX4A 4ALGA 2YEKA 2YYNA 4NR6A 4CUUA 3Q2EA 2YW5A 4UIWA 5ENGA 2RS9B 4GPJA 4QC1A 4N4HA 5EGUA 4HBVA 2YEMA 2D82A 5HCLA 4CURA 4HXSA 5L96A 4TT4A 4MR5A 5DBMA 5D25A 5EVAA 5DYAA 5FDZA 4QUUA 4CFLA 4TT6A 4A9JA 5LJ0A 5A5OA 2L5EA 5D26A 5ENJA 5ENBA 3FKMX 2F6JA 4NUCA 4YYDA 5A7CA 5EQ1A 4XY9A 4LRGA 4PY6A 2YELA 5C7NA 4IORA 4IR6A 5ENFA 3UW9A 5E9IA 2RFJA 5D3PA 5FG5A 1ZS5A 5EISA 2DWWA 3O35A 4MENA 4O72A 2OSSA 3ONIA 4O76A 5AD2A 3UV5A 4WHWA 5LJ1A 4O78A 3QZTA 5TCMA 4BW1A 2F6NA 4QNSA 3LJWA 5A83A 5IGLA 4MEQA 5DFBA 5CFWA 5C8GA 5HRWA 3S91A 5F1LA 5AMFA 4YC9A 4QSUA 4IR3A 5FE8A 3DAIA 5CQ5A 5FH6A 4HXPA 4E96A 4QEVA 2L85A 2DVRA 4O7AA 4NYWA 4KV1A 5HEMA 4YK0A 4LR6A 4HXKA 5I40A 5IG6A 5E74A 2NXBA 2DATA 5FE7A 3MB3A 3U5NA 5KTUA 4DONA 3G0JA 5F25A 5D3TA 5JWMA 4MR4A 5L98A 4UYFB 5H85A 4A9KA 5FE1A 5FE2A 4O7EA 4NR4A 5HELA 3HMFA 4Q0NA 5CTLA 5HRXA 3SVHA 5E73A 5EM3A 4YATA 5HQ5A 5I29A 3S92A 3HMEA 4Z1SA 5C89A 5D0CA 4ZQLA 3ZYUA 4NR9A 4A9LA 4BHWA 4UIUA 2RI7A 5CU8A 5H1VA 5CQ3A 5EI4A 4TU4A 4MEOA 5L99A 4HXLA 5CUAA 5J0DA 3JVLA 1X0JA 3U5LA 5HM0A 5EWHA 4UYDA 5BT4A 2I8NA 2D9EA 4NR8A 4YAXA 4UIXA 4NYVA 5FE0A 4UITA 4TU6A 5A5NA 4QSQA 4QUTA 2GRCA 4HBWA 4NRCA 5FH8A 4ZC9A 5EICA 5F36A 4YYNA 4Z6IA 4YY6A 5CQ6A 4LC2A 4YY4A 4NQMA 4YBTA 4LYSA 4A9OA 5G4SA 5EK9A 4NQNA 5I83A 4QC3A 4YYJA 4O77A 4QR4A 3HMHA 4TTEA 5FBXA 5F1HA 5E7DA 3JVKA 5FB1A 5ENCA 4HXMA 3U5OA 4YYKA 5EWWA 4TYLA 4LYIA 5I86A 4YADA 4CL9A 4NR5A 5A85A 5K29A 4QB3A 4HXNA 4LDFA 4TT2A 4O75A 4UIYA 5KU3A 3MUKA 3UV4A 5CQ4A 5F63A 4XUAA 5E9MA 4ALHA 4WHUA 4HXOA 4HBYA 3D7CA 3MB4A 4O74A 4Q0OA 5II1A 5CRZA 3LQHA 3UVDA 1F68A 4PCEA 1EQFA 5FH7A 5I7YA 4QSRA 5E9KA 1WUGA 5F60A 5DFCA 3MQMA 5LJ2A 2KTBB 2E7NA 5I89A 3U5JA 2RO1A 4FLPA 5ACYA 2N9GA 5ETBA 5F3AA 5DFDA 4CFKA 5DLXA 2RNYA 5DYUA 5D3NA 5DYCA 5A5SA 4TZ2A 3MXFA 4OGIA 5EU1A 4Z93A 5IGKA 4UIVA 5IGMA 4TS8A 5G4RA 3O33A 4NYXA 1JM4B 4A9HA 4NS5A 4YBSA 5HFRA 2DVSA 4PCIA 4QEWA 5EWDA 4ZW1A 5DKHA 5EP7A 2RNXA 4LYWA 5DYXA 5DW2A 4J0RA 5D24A 3RCWA 3O37A 5CUDA 4UYGA 5ENIA 3AADA 4QR3A 4YH4A 4CUSA 3JVMA 5CQTA 4OUFA 5CUCA 5H1TA 2OUOA 4N4IA 4A9IA 4CUPA 3P1EA 4NXJA 2DVVA 5KO4A 4NRBA 5I1QA 2R10A 4MR3A 4C66A 5A5QA 5CRMA 4QYLA 5H1UA 4Z1QA 5EV9A 4NUEA 2E7OA 3NXBA 5FG6A 5COIA 3TLPA 4CUQA 4NR7A 5D3HA 5LVRA 5HRVA 5LVQA 3DWYA 5AD3A 4MEPA 5EWVA 5FG4A 5CP5A 5FE4A 3O34A 4LZSA 5FB0A 4NUDA 3QZVA 3K2JA 5FFWA 5EPSA 5L8TA 4N4FA 4A9FA 5KTXA 5DLZA 4XYAA 3LQIA 5CQAA 5D3SA 3P1CA 4J1PA 4QY4A 2YDWA 3P1DA 3UV2A 5CZGA 5D3LA 4QSTA 4O71A 2RNWA 5LUUA 5IGNA 3UVXA 5CUEA 5CPEA 5EA1A 5E0RA 5BT3A 3I3JA 2MJVB 5DKCA 5A5PA 5EPBA 4J0SA 4TZ8A 4BW3A 3IU5A 4A9EA 1E6IA 4HBXA 5FE9A 4PS5A 5IIDA 1JSPB 5F61A 4IOQA 4O7BA 4QYDA 4UIZA 4QSSA 4YABA 4N3WA 4O7FA 2H60A 4XY8A 4Y03A 5C85A 3QZSA 4QZSA 2YQDA 2LSPB 4RVRA 5CQ7A 2FSAA 5HQ7A 2R0YA 5LKUA 5I88A 5CY9A 5LKXA 4A9NA 2WP2A 1N72A 4A9MA 3AQAA 4UYHA 4IR5A 2I7KA 3U5KA 5FE3A 5HLSA 3G0LA 4QSXA 5A82A 4XUBA 4BJXA 4YYIA 5C87A 1WUMA 5E9VA 5FFVA 4PTBA 3P1FA 5ETDA 4UYEA 4Z6HA 5E3GA 3JVJA 4WIVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5A81A 2OO1A 4LZ2A 4MR6A 5D7XA 4QEUA 4YH3A 5JI8A 5HENA 3O36A 5DKDA 2R0VA 5F62A 5EWCA 3Q2FA 5C4QA 5TB6A 5L8UA 4UYFA 5E3DA 4QSWA 4QBMA 3U5MA 5IBNA 5BT5A 5D3JA 4CUTA 4N4GA 3SVGA 4BW4A 5II2A 4YYGA 4TQNA 4X2IA 5CUGA 2G4AA 5F2PA 5HJCA 5AMEA 5DW1A 4LZRA 5ENHA 5KTWA 4OGJA 4IOOA 4IR4A 5F5ZA 4HXRA 4F3IA 2DKWA 4KV4A 4CLBA 5DY7A 3UVWA 5HFQA 5FFYA 5FE6A 2R0SA 2DVQA 4PKLA 4QSPA 3MULA 4O70A 5EPRA 5CS8A 5E9LA 5I80A 5I7XA 5HQ6A 4YYHA 2L84A 4O7CA 5LKZA 4AKNA 3P5OA 4KCXA 3U5PA 5CQ8A 5ENEA 5CUBA 3GG3A 3UVYA 5CGPA 5FE5A 3SVFA 5E9YA 4QSVA 4YBMA 3LXJA 5A5RA 4J3IA 5L97A 3LQJA 4C67A 4BW2A 4YYMA 3IU6A 2WP1A 4QR5A 2E3KA 5KHMA 5D3RA 5LKTA 4NRAA 5DX4A 4ALGA 2YEKA 2YYNA 4NR6A 4CUUA 3Q2EA 2YW5A 4UIWA 5ENGA 2RS9B 4GPJA 4QC1A 1PUOA 4N4HA 5EGUA 4HBVA 2YEMA 2D82A 5HCLA 4CURA 4HXSA 5L96A 4TT4A 4MR5A 5DBMA 5D25A 5EVAA 5DYAA 5FDZA 4QUUA 4CFLA 4TT6A 4A9JA 5LJ0A 5A5OA 2L5EA 5D26A 5ENJA 5ENBA 3FKMX 2F6JA 4NUCA 4YYDA 5A7CA 5EQ1A 4XY9A 4LRGA 4PY6A 2YELA 5C7NA 4IORA 4IR6A 5ENFA 3UW9A 5E9IA 2RFJA 5D3PA 5FG5A 1ZS5A 5EISA 2DWWA 3O35A 4MENA 4O72A 2OSSA 3ONIA 4O76A 5AD2A 3UV5A 4WHWA 5LJ1A 4O78A 3QZTA 5TCMA 4BW1A 2F6NA 4AI6A 4QNSA 3LJWA 5A83A 5IGLA 4MEQA 5DFBA 5CFWA 5C8GA 5HRWA 3S91A 5F1LA 5AMFA 4YC9A 4QSUA 4IR3A 5FE8A 3DAIA 5CQ5A 5FH6A 4HXPA 4E96A 4AKGA 4QEVA 2L85A 2DVRA 4O7AA 4NYWA 4KV1A 5HEMA 4YK0A 4LR6A 4HXKA 5I40A 5IG6A 5E74A 2NXBA 2DATA 5FE7A 3VKHA 3MB3A 3U5NA 5KTUA 4DONA 3G0JA 5F25A 5D3TA 3D1BA 5JWMA 4MR4A 5L98A 4UYFB 5H85A 4A9KA 5FE1A 4AKIA 5FE2A 4O7EA 4NR4A 5HELA 3HMFA 4Q0NA 5CTLA 5HRXA 3SVHA 5E73A 5EM3A 4YATA 5HQ5A 5I29A 3S92A 3HMEA 4Z1SA 5C89A 5D0CA 4ZQLA 3ZYUA 4NR9A 4A9LA 4BHWA 4UIUA 2RI7A 5CU8A 5H1VA 5CQ3A 5EI4A 4TU4A 4MEOA 5L99A 4HXLA 5CUAA 5J0DA 3JVLA 1X0JA 3U5LA 5HM0A 5EWHA 4UYDA 5BT4A 2I8NA 2D9EA 4NR8A 4YAXA 4UIXA 4NYVA 5FE0A 4UITA 4TU6A 5A5NA 3ERRA 4QSQA 4QUTA 2GRCA 4HBWA 4NRCA 5FH8A 4ZC9A 5EICA 5F36A 4YYNA 4Z6IA 4YY6A 5CQ6A 4LC2A 4YY4A 4NQMA 4YBTA 4LYSA 4A9OA 5G4SA 5EK9A 4NQNA 5I83A 4QC3A 4YYJA 4O77A 4QR4A 3HMHA 4TTEA 5FBXA 5F1HA 5E7DA 3JVKA 5FB1A 5ENCA 4HXMA 3U5OA 4YYKA 5EWWA 4TYLA 4LYIA 5I86A 4YADA 4CL9A 4NR5A 5A85A 5K29A 4QB3A 4HXNA 4LDFA 4TT2A 4O75A 4UIYA 5KU3A 3MUKA 3UV4A 5CQ4A 5F63A 4XUAA 5E9MA 4ALHA 4WHUA 4HXOA 4HBYA 3D7CA 3MB4A 4O74A 4Q0OA 5II1A 5CRZA 3LQHA 3UVDA 1F68A 4PCEA 1EQFA 5FH7A 5I7YA 4QSRA 5E9KA 1WUGA 3D1DA 5F60A 5DFCA 3MQMA 5LJ2A 2KTBB 2E7NA 5I89A 3U5JA 2RO1A 4FLPA 5ACYA 2N9GA 3VKGA 5ETBA 5F3AA 5DFDA 4CFKA 5DLXA 2RNYA 5DYUA 5D3NA 5DYCA 5A5SA 4TZ2A 3MXFA 4OGIA 5EU1A 4Z93A 5IGKA 4UIVA 5IGMA 4TS8A 5G4RA 3O33A 4NYXA 1JM4B 4A9HA 4NS5A 4YBSA 5HFRA 2DVSA 4PCIA 4QEWA 5EWDA 4ZW1A 5DKHA 5EP7A 2RNXA 4LYWA 5DYXA 5DW2A 4J0RA 5D24A 3RCWA 3O37A 5CUDA 4UYGA 5ENIA 3AADA 4QR3A 1ZKRA 4YH4A 4CUSA 3JVMA 5CQTA 4OUFA 5CUCA 5H1TA 2OUOA 4N4IA 4A9IA 4CUPA 3P1EA 4NXJA 2DVVA 5KO4A 4NRBA 5I1QA 2R10A 4MR3A 4C66A 5A5QA 5CRMA 4QYLA 5H1UA 4Z1QA 5EV9A 4NUEA 2E7OA 3NXBA 5FG6A 5COIA 3TLPA 4CUQA 4NR7A 5D3HA 5LVRA 5HRVA 5LVQA 3DWYA 5AD3A 4MEPA 5EWVA 5FG4A 5CP5A 5FE4A 3O34A 4LZSA 5FB0A 2EJNA 4NUDA 3QZVA 3K2JA 5FFWA 5EPSA 5L8TA 4N4FA 4A9FA 5KTXA 5DLZA 4XYAA 3LQIA 5CQAA 5D3SA 3P1CA 4J1PA 4QY4A 4AKHA 2YDWA 3P1DA 3UV2A 5CZGA 5D3LA 4QSTA 4O71A 2RNWA 5LUUA 5IGNA 3UVXA 5CUEA 5CPEA 5EA1A 5E0RA 5BT3A 3I3JA 2MJVB 5DKCA 5A5PA 5EPBA 4J0SA 4TZ8A 4BW3A 3IU5A 4A9EA 1E6IA 4HBXA 5FE9A 4PS5A 5IIDA 1JSPB 5F61A 4IOQA 4O7BA 4QYDA 4UIZA 4QSSA 4YABA 4N3WA 4O7FA 2H60A 4XY8A 4Y03A 5C85A 3QZSA 4QZSA 2YQDA 2LSPB 4RVRA 5CQ7A 2FSAA 5HQ7A 2R0YA 5LKUA 5I88A 5CY9A 5LKXA 4A9NA 2WP2A 1N72A 4A9MA 3AQAA 4UYHA 4IR5A 2I7KA 3U5KA 5FE3A 5HLSA 3G0LA 4QSXA 5A82A 4XUBA 4BJXA 4YYIA 5C87A 1WUMA 5E9VA 5FFVA 4PTBA 3P1FA 5ETDA 4UYEA 4Z6HA 5E3GA 3JVJA 4WIVA
chains in the Genus database with same CATH topology
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