4CFPA

Crystal structure of mltc in complex with tetrasaccharide at 2.15 a resolution
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
327
structure length
327
Chain Sequence
DTNGFDILMGQFAHNIENIWGFKEVVIAGPKDYVKYTDQYQTRSHINFDDGTITIETIAGTEPAAHLRRAIIKTLLMGDDPSSVDLYSDVDDITISKEPFLYGQVVDNTGQPIRWEGRASNFADYLLKNRLKSRSNGLRIIYSVTINMVPNHLDKRAHKYLGMVRQASRKYGVDESLILAIMQTQSSFNPYAVSRSDALGLMQVVQHTAGKDVFRSQGKSGTPSRSFLFDPASNIDTGTAYLAMLNNVYLGGIDNPTSRRYAVITAYNGGAGSVLRVFSNDKIQAANIINTMTPGDVYQTLTTRHPSAESRRYLYKVNTAQKSYRRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
molecule keywords MEMBRANE-BOUND LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE C
publication title Structure and Cell Wall Cleavage by Modular Lytic Transglycosylase Mltc of Escherichia Coli.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 104
structure length 327
sequence length 327
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 2013-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01464 SLT Transglycosylase SLT domain
A PF11873 Mltc_N Membrane-bound lytic murein transglycosylase C, N-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4cfpA02
1G7JC 4B4EA 4PGJB 2CWIA 2XBRA 153LA 1KXWA 1GB6A 1LZRA 2MEIA 5B06A 4J1BA 1QDRA 3W6CA 5LAFA 3SP3A 3WYHA 1A2YC 4ETBA 2MEHA 1LCNA 5ILCA 1IC7Y 4LYMA 4DDCA 1IC4Y 1W08A 1HELA 1UIBA 1JKBA 2HEEA 1IWUA 4TWSA 4WLDA 1NMMA 1LMPA 3QY4A 4NHSA 5APCA 1OUJA 1CKGA 1JWRA 1LZ9A 1HSXA 1DI5A 2YBNA 1B2KA 3A93A 3AB6A 2DBTA 5I54A 1CKHA 134LA 4NY5A 1TCYA 4OWCA 1GB9A 2C8OA 3ATNA 1LHKA 1B7RA 2W1LA 4N1CC 1B7OA 1IOQA 1HF4A 2BQJA 5KXRA 1EQ4A 1HEPA 4YM8A 4NFVA 4XJBA 2Q0MX 1C45A 4GLAA 4BAPA 1ZMYL 4QEQA 4CHXA 1GB7A 1C7PA 1OP9B 3AYQA 4HJZA 1GFGA 4H8YA 2LHMA 5FSTA 4OWEA 1TEWA 1GB2A 4H94A 5DN5A 1LSAA 1LZ8A 1LHLA 1LZTA 1LZGA 4C3WA 4L41A 4J7VA 1IP5A 5FCPA 4G4HA 4WLTA 1YROA 4H9CA 3WUAA 1JTTL 2MEEA 1I1ZA 1GB5A 4XADA 4TTDA 1LMTA 2YBJA 3HFMY 4ML7A 3FI7A 4OWAA 2EIZC 1LOZA 1XEIA 1QSAA 4NSHA 1CJ8A 1D0KA 1HERA 1LSYA 1REXA 1LSPA 3J6KA 4NHTA 1YANA 1IOCA 4YENA 5L3HA 1LZ1A 3WPLA 1LJEA 4CFOA 4YEMA 1YAOA 1WTMA 5F81A 1LMOA 4DD9A 1GBOA 5B05A 1GF8A 1LSNA 1XEJA 2ZNXY 1BHZA 5IDDA 1B5VA 2MEAA 5I53A 4IASA 2I25L 9LYZA 3WL2A 1HC0A 4HV1A 5IHGA 5FELA 1QIOA 2ZQ4A 3G3BB 4D9ZA 1OUIA 1IVMA 1F6RA 1YKZX 3T6UA 1GEZA 3N9CA 4UWUA 4WL7A 1KIPC 135LA 4LYTA 1IWVA 1GWDA 2FBDA 4DDBA 2BQAA 4H93A 1LPIA 4NSIA 3WXTA 4FDYA 4N5RA 4G4CA 3QNGA 4AXTA 4WLYA 1LSGA 3WULA 1WVVA 4OW1A 2ZQ3A 194LA 3ZVQB 1XGRC 3LHMA 1G7LC 1GFVA 1DKKA 4HSFA 5F9UA 1D9UA 4LFPA 4RDSA 2MEDA 1GFEA 1YKYX 1JUGA 1W6ZA 2F4AA 3AJNA 1GAYA 5JENB 3CB7A 1GBZA 4B1AA 1LZNA 1HENA 3B6LA 3CT0A 4R0FA 1D6PA 1GBWA 1OUHA 4LZTA 1VATA 1D6QA 1F6SA 2EKSC 1IOSA 2BQLA 1GEVA 1IP1A 4RW1A 3WUMA 1OUAA 2I6ZA 1GFAA 2FYDA 1IX0A 1HSWA 1UIFA 3A8ZA 1GBXA 4H9FA 3W6DA 4R6CA 2XTHA 1YL0X 4TX7A 4ETEA 2A7DA 3A94A 6LYZA 4ETAA 4PRUA 2D4IA 4DC4A 1DPXA 3CSQA 1HEQA 1BB7A 5LA5A 1MLCE 1IIZA 1A4VA 2DQFC 2H9JA 207LA 1WTNA 5E4PA 1YKXX 3WUNA 5KXSA 1GFTA 4HJVA 2D6BA 5LIOA 4LT2A 1JTOL 1BQLY 3GXRA 4H90A 5KKIA 1FLUA 1YAPA 3CT1A 5KXYA 4NEBA 4Z41A 3WPJA 1HFYA 1JITA 2BQIA 2LYOA 3HBDA 5A3ZA 1GFKA 4O34A 1NDMC 3TXBA 3TXDA 4GCDA 4QGZA 4XENA 1GD6A 5KXNA 1IR7A 3WVYA 4LYCA 5KXMA 5L9JA 1QUSA 1XGUC 4RW2A 2A7FA 1CKCA 3N9AA 4ZIXA 3WW6A 3ZEKA 4H9HA 1SLYA 5LAGA 3WW5A 2DQCY 3TMVA 5KJ9A 4EOFA 1GAZA 1ALCA 1WQRA 3KAMA 4N0JA 1LJKA 4OOTA 3T36A 1LSEA 1VAUA 4NGIA 4WG7A 4Z3MA 2F4GA 2MECA 4QY9A 1BGIA 5B1GA 1MELL 4NSGA 1J1PY 1CJ6A 4M4OA 1DI3A 2D4KA 1QSWA 2F2NA 5C6JA 3A67Y 4W96A 3B72A 1IORA 2YBLA 1YIKA 1FDLY 5KXLA 1HMLA 3AZ4A 4DT3A 4HPEA 1GE1A 5D5FA 2G4NA 4ANRA 2X0AA 4WM5A 4H8ZA 5APEA 5KXWA 3GXKA 4LYOA 2BQOA 4MSTA 2XJWA 1BB6A 1B7LA 2HU1A 1JSEA 4NIJA 4KPMA 1GF9A 4B4JA 1IP3A 1B5ZA 1LSMA 5F14A 5DN4A 3A6CY 1LSDA 1LZ5A 3A96A 1IO5A 2BLXA 1ZVYB 2BQCA 4WO9A 1INUA 1LZYA 1VDQA 3LYMA 1KXXA 3VWOA 1REYA 1JHLA 1WQNA 4WOAA 4H9AA 3B0OA 2VB1A 1FLYA 4FJRA 2BQGA 5KXXA 3A92A 2BLYA 1HEOA 2CDSA 1LYSA 4I8SA 4DYGA 1QTKA 3G3AB 1B5XA 1AKIA 4KXIA 4HJYA 2DQJY 1LJ3A 1IWZA 2YBIA 1XSFA 1IP7A 1B7NA 4H91A 5APFA 8LYZA 5KY1A 2Z38A 1C08C 4DD0A 1LYOA 1OUBA 4LT1A 4NHIA 1V7SA 1LMCA 2Z19A 1I56A 5FHWA 5B07A 1D0MA 4NWEA 1LZDA 3TXKA 2Z37A 3E3DA 3CSRA 4C5FA 2H9KA 5II3A 3CSZA 5K7OA 1GDXA 1RCMA 1ZVHL 4DD3A 4DD1A 3ATOA 1IWWA 4H92A 4XYYA 3OK0A 2EPEA 2N5ZA 1GB8A 4HPIA 4LT0A 4A7DA 1HFXA 3LYZA 1JKAA 1RE2A 5D5CA 3QE8A 4II8A 7LYZA 1IC5Y 1D0LA 1B9OA 1UIEA 1DKJA 2YDGA 4GLVA 3AGIA 4GN4A 1CKDA 1G7MC 5ILFA 1JSFA 1QQYA 1WQPA 1B7MA 1DZBX 1VDPA 1LJ4A 5LINA 4NGKA 1RJCB 1BB5A 1VFBC 2C8PA 1FKVA 4NWHA 2MEBA 1LSZA 4NGOA 1GF3A 1RFPA 3W6EA 4ZFPA 4CGEA 1B7PA 1V7TA 4NGZA 4PPOA 2ZYPA 1GHLA 2Y8PA 3RT5X 5KKJA 3A34A 2Z2EA 3WU8A 1UA6Y 5KXPA 2ZNWY 5LA8A 4NHPA 1FN5A 1JISA 5LVIA 1F10A 2EQLA 4LYBA 3TMXA 3WMKA 2I26L 3D3DA 1TAYA 3F6ZA 4XJIA 1UIDA 4ET8A 5KXTA 5LVJA 2DQIY 4TSCA 2BQHA 4UWVA 5B1FA 1OUEA 4NHQA 2RSCA 3M3UA 4HV2A 1N4FA 2ZIJA 2LZ2A 4GN3A 1GF0A 4H8XA 4AGAA 1AM7A 1UICA 4IATA 4PRQA 2IFFY 5HMVA 3A6BY 3LYTA 5E9RA 1EQEA 3LZ2A 1LHMA 5HMJA 4PHIA 1UBZA 5C6IA 4NGJA 2CJLA 1NWGA 4P2EA 4BS7A 2BQNA 1IY3A 1DQJC 1LHHA 4LGKA 4HTKA 3AW7A 1NF5A 1GB0A 1AZFA 1LZCA 2MEGA 3TXHA 1CKFA 4NGLA 4NG8A 4DD7A 1YL1X 2BQMA 1OUFA 3P68A 4G4BA 1DXJA 5T3FA 3M18B 1FLQA 4ET9A 5KXOA 4NGWA 3RZ4A 1H6MA 4N8ZA 5B59A 5FEKA 1OUDA 2BQFA 4CFPA 1JJ1A 2DQDY 4LT3A 1B0DA 4GN5C 3WU9A 3BKVA 1NBYC 2FBBA 3TXEA 154LA 1LYZA 2GV0A 2HECA 1LKRA 1JJ0A 3A91A 2MEFA 3A3RX 2LZTA 1GE0A 1J1XY 1LKSA 1OUGA 1E8LA 1LAAA 2ZWBA 3P4ZA 4OOOA 5IELA 2D4JA 5M1YA 5A3EA 1EL1A 1LHIA 1LSCA 4G49A 1LZSA 4U3XB 1B5UA 1FBIX 1NHEA 1LJHA 1UC0A 2HU3A 1C10A 1IP2A 1LZEA 1TBYA 2BAAA 4H1PA 1GE2A 3EXDA 3OJPA 5KXKA 5LYMA 1DI4A 1FLWA 1LJFA 1WQMA 4OWBA 2XBSA 2YSSC 1UACY 4XJGA 1NKHA 5HNCA 5LVHA 2HEBA 5KXZA 1BWIA 4WM3A 1IWTA 2DQGY 1T3PA 3J4GA 2DKVA 1JEFA 1T6VL 1BVKC 1JKCA 1G7IC 1B5YA 1PS5A 4XN6A 2YBHA 4WM4A 1GFUA 6LYTA 4M6DA 3K3TA 1JTPL 1HEWA 4GCFA 1VDTA 4UWNA 1HMKA 1G7HC 1PZYA 1I20A 1FKQA 1GE4A 1GF5A 1KIQC 132LA 4Z98A 1NBZC 3WU7A 3AGGG 1XGTC 2LYZA 2CGIA 4KT3A 4BADA 5F16A 1XGPC 3HBEX 3A90A 1YAQA 2PC2A 4IJ4A 3EBAB 2Z12A 2ZIKA 1UCOA 1IP6A 4HP0A 4HTNA 1NDGC 4MR1A 208LA 3RNXA 4B0DA 5LXWA 1BB3A 3AZ7A 4N9RA 1LSBA 1LTMA 4TUNA 5HNLA 3TMUA 3TXJA 1WVUA 4XJHA 133LA 3IWRA 1GB3A 1REZA 1CJ9A 1BVXA 3N9EA 4H9IA 4WG1A 4BAFA 4DWXA 4XJFA 3ULRA 1B5WA 1HFZA 1GE3A 1YAMA 4LYZA 4QDNA 1B7SA 5APDA 4G9SA 1GBYA 1BB4A 1IEEA 2G4PA 3P64A 4GCBA 3AGHA 2W1YA 1JIYA 1GXV2 2HEAA 4WO6A 5EBHA 5I4YA 2BPUA 4KL7A 4WM6A 2HTXA 1LHJA 4I0CA 4E3UA 4HTQA 2AUBA 3LN2A 1GFJA 4W94A 4GCEA 2B5ZA 4ETDA 2G4QA 1LJJA 3AW6A 4NSJA 4GCCA 4X3BA 3ZVQA 4ETCA 3LYOA 5L3IA 1ZV5L 2DQEY 3TXGA 5C6LA 1QDTA 2YBMA 3TXIA 4Z46A 4J0LA 5FDJA 5I4WA 2BQBA 4WM2A 5LVKA 1GF6A 1LJGA 1LZ4A 1F0WA 2W1MA 1XGQC 3B0IA 3W6AA 3WH1A 4NGVA 4RLNA 1RI8B 4EMNA 4DDAA 1WQOA 4ZEEA 1LZ6A 4MCKA 1GDWA 2IHLA 1HNLA 3AZ5A 1JPOA 3HBHA 4B49A 1JJ3A 5LYZA 3FE0A 1B7QA 1GFHA 1LJNA 4NGYA 1H87A 2W1XA 2BQDA 1REMA 5I4XA 4RLMA 2YVBA 2ZILA 2ZYCA 3D9AC 1C43A 4DD2A 1LMQA 4WL6A 1OUCA 4WMGA 1BWJA 1IP4A 5DM9A 193LA 1KIRC 2BQKA 1YILA 1AT6A 2D91A 4LFXA 3W6BA 4CJ2A 3WVXA 5HLLA 1SQ2L 1LZBA 3CQLA 2NWDX 1P2CC 1GBSA 1IY4A 1BWHA 1QUTA 1UIHA 1C46A 1UIGA 2DQAA 4WM1A 4PJ2C 1WQQA 3RU5A 1HHLA 1GPQC 4OWHA 1GFRA 5AMYA 1Z55A 2HEFA 4TSBA 2WARA 5DL9A 5HQ1A 3LZTA 5LVGA 2HUBA 3CT5A 2H5ZA 1YQVY 1IWYA 1LMNA 4NG1A 4J1AA 3IJVA 2BQEA 3WXUA 5DLAA 1OQMA 3P66A 4B4IA 1CJ7A 3W6FA 5I5QA 1LZAA 1IWXA 4H9EA 1O23A 1GF7A 1J1OY 1HEMA 3EO5A 5F9XA 1VEDA 1TDYA 4H9BA 4WLXA 2LYMA 1LSFA 1QTEA 3B0KA 4YEOA 2F30A 3MGWA 2Z39A 1LYYA 1GXXA 5J7CA 1CNSA 3IJUA 4XJDA 1UUZC 1NQIA 2HEDA 3EMSA 3RW8A 2Z2FA 3A95A 1LMAA 4YF2A 1UIAA 1VDSA 1KXYA 3A3QA 5LYTA 4YOPA 2Z18A 3TXFA 3BKHA 4N1EI 1LJIA 1IOTA 1IR8A 2FYCA 1AT5A 2DQHY 1DPWA 1EQ5A 1IR9A 1XFPL 3AZ6A 3W3EA 1XEKA 3TMWA 3WPKA 1JKDA 3P65A 1GF4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4B4EA 3NYAA 153LA 1GB6A 1LZRA 3C82A 3PDSA 218LA 1QDRA 3W6CA 1UIBA 1L04A 5KXXA 1NMMA 1LMPA 3C8QA 1JWRA 1C6MA 5I54A 2RBOA 4NY5A 4OWCA 2C8OA 3D4SA 3OE8A 4OO9A 1LHKA 1B7RA 2W1LA 1HF4A 1IOQA 239LA 4NFVA 4XJBA 1C45A 1ZMYL 4CHXA 1OP9B 5FSTA 5DN5A 1LZTA 1LHLA 4L41A 1L39A 1C61A 1YROA 3HTBA 4H9CA 2MEEA 1I1ZA 1L29A 1G06A 3FI7A 2EIZC 1XEIA 1QSAA 4I7SA 4CFOA 1LZ1A 1LMOA 4W59A 1LSNA 1L70A 181LA 2MEAA 9LYZA 4HV1A 1L48A 1L22A 2Q9DA 4UWUA 4LYTA 3CDRA 250LA 213LA 4NSIA 4FDYA 252LA 4OW1A 3F9LA 1XGRC 176LA 2HUKA 2MEDA 1W6ZA 4R0FA 3CT0A 2Z6BA 1VATA 2EKSC 1IP1A 148LE 3HU9A 3W6DA 2XTHA 1QS5A 4ETEA 1DYEA 3DMZA 1DPXA 219LA 139LA 1IIZA 5E4PA 138LA 1WTNA 1YKXX 5KXSA 160LA 1L40A 4H90A 5KKIA 5KXYA 4I7LA 1HFYA 163LA 1L65A 1JITA 1GFKA 3TXDA 3WVYA 4DQ7A 4LYCA 226LA 1XGUC 109LA 3WW6A 244LA 3ZEKA 5LAGA 3WW5A 3HUAA 5KJ9A 3KAMA 1WQRA 4I7TA 2RB2X 4WG7A 2HULA 1BGIA 5B1GA 1CV6A 4M4OA 230LA 1L99A 3A67Y 3AZ4A 2G4NA 2B6XA 5APEA 5KXWA 1XJTA 1C6EA 1LYEA 4KPMA 1LSMA 201LA 5DN4A 2OTZX 1LZ5A 3VWOA 1KXXA 173LA 1CU0A 1REYA 1L34A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G7J C;  4B4E A;  4PGJ B;  2CWI A;  2XBR A;  153L A;  1KXW A;  1GB6 A;  1LZR A;  2MEI A;  5B06 A;  4J1B A;  1QDR A;  3W6C A;  5LAF A;  3SP3 A;  3WYH A;  1A2Y C;  4ETB A;  2MEH A;  1LCN A;  5ILC A;  1IC7 Y;  4LYM A;  4DDC A;  1IC4 Y;  1W08 A;  1HEL A;  1UIB A;  1JKB A;  2HEE A;  1IWU A;  4TWS A;  4WLD A;  1NMM A;  1LMP A;  3QY4 A;  4NHS A;  5APC A;  1OUJ A;  1CKG A;  1JWR A;  1LZ9 A;  1HSX A;  1DI5 A;  2YBN A;  1B2K A;  3A93 A;  3AB6 A;  2DBT A;  5I54 A;  1CKH A;  134L A;  4NY5 A;  1TCY A;  4OWC A;  1GB9 A;  2C8O A;  3ATN A;  1LHK A;  1B7R A;  2W1L A;  4N1C C;  1B7O A;  1IOQ A;  1HF4 A;  2BQJ A;  5KXR A;  1EQ4 A;  1HEP A;  4YM8 A;  4NFV A;  4XJB A;  2Q0M X;  1C45 A;  4GLA A;  4BAP A;  1ZMY L;  4QEQ A;  4CHX A;  1GB7 A;  1C7P A;  1OP9 B;  3AYQ A;  4HJZ A;  1GFG A;  4H8Y A;  2LHM A;  5FST A;  4OWE A;  1TEW A;  1GB2 A;  4H94 A;  5DN5 A;  1LSA A;  1LZ8 A;  1LHL A;  1LZT A;  1LZG A;  4C3W A;  4L41 A;  4J7V A;  1IP5 A;  5FCP A;  4G4H A;  4WLT A;  1YRO A;  4H9C A;  3WUA A;  1JTT L;  2MEE A;  1I1Z A; 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 5LYZ A;  3FE0 A;  1B7Q A;  1GFH A;  1LJN A;  4NGY A;  1H87 A;  2W1X A;  2BQD A;  1REM A;  5I4X A;  4RLM A;  2YVB A;  2ZIL A;  2ZYC A;  3D9A C;  1C43 A;  4DD2 A;  1LMQ A;  4WL6 A;  1OUC A;  4WMG A;  1BWJ A;  1IP4 A;  5DM9 A;  193L A;  1KIR C;  2BQK A;  1YIL A;  1AT6 A;  2D91 A;  4LFX A;  3W6B A;  4CJ2 A;  3WVX A;  5HLL A;  1SQ2 L;  1LZB A;  3CQL A;  2NWD X;  1P2C C;  1GBS A;  1IY4 A;  1BWH A;  1QUT A;  1UIH A;  1C46 A;  1UIG A;  2DQA A;  4WM1 A;  4PJ2 C;  1WQQ A;  3RU5 A;  1HHL A;  1GPQ C;  4OWH A;  1GFR A;  5AMY A;  1Z55 A;  2HEF A;  4TSB A;  2WAR A;  5DL9 A;  5HQ1 A;  3LZT A;  5LVG A;  2HUB A;  3CT5 A;  2H5Z A;  1YQV Y;  1IWY A;  1LMN A;  4NG1 A;  4J1A A;  3IJV A;  2BQE A;  3WXU A;  5DLA A;  1OQM A;  3P66 A;  4B4I A;  1CJ7 A;  3W6F A;  5I5Q A;  1LZA A;  1IWX A;  4H9E A;  1O23 A;  1GF7 A;  1J1O Y;  1HEM A;  3EO5 A;  5F9X A;  1VED A;  1TDY A;  4H9B A;  4WLX A;  2LYM A;  1LSF A;  1QTE A;  3B0K A;  4YEO A;  2F30 A;  3MGW A;  2Z39 A;  1LYY A;  1GXX A;  5J7C A;  1CNS A;  3IJU A;  4XJD A;  1UUZ C; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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