4CI6A

Mechanisms of crippling actin-dependent phagocytosis by yopo
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMHVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAASTSLEKSYELPDGQVIAIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKTKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPGIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Yersinia Effector Yopo Uses Actin as Bait to Phosphorylate Proteins that Regulate Actin Polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Transferase/structural protein
molecule keywords ACTIN
total genus 114
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4ci6A03
1QZ5A 1GLEG 4CZGA 4FL9A 4CI6A 4XH4A 4AM7A 4JAXA 2P9NA 4BVOA 4FSVA 1RFQA 1IJJA 2YCHA 3D2EB 5KQ8A 2AP1A 2F9TA 3VESA 2FSJA 5EVZA 5LY3A 3FZKA 1TYQB 4H5WA 3DXMA 4H0XB 2WUSA 4FWLA 3AAQA 3A5MC 4DQ8A 3UB5A 3CHWA 4H5TA 1E4GT 1QQOA 3U8XA 5TKYA 1Y64A 3ATVA 4JHDA 4AM6A 2EWSA 4B1VA 2FSKA 2P9KA 3KHYA 3BUZB 2BTFA 2IVOA 3M1FA 2YHXA 5AQJA 5FPDA 4CZKA 1U6ZA 2HMPA 1KAYA 3MN5A 4FOIA 2P9IB 3U9ZA 1TUUA 4K41A 4F9OA 3CERA 3IUCA 2Q97A 1HUXA 2F9WA 5AQLA 3GE1A 1HKBA 3H46O 2D0PA 3FLCO 2OANA 3VOVA 5KQDA 4B1XB 1OKJA 1SQKA 3QB0A 3CJ9A 1NGFA 1BA1A 1YUWA 4WQ5C 3FGUA 4DHYA 2VYPA 4BRDA 4J8FA 3MDQA 1U2VA 4IZ9A 3L0QA 2A5XA 5AQHA 4FPBA 4IWVA 4I6MA 4JNEA 4MLEA 1JCGA 4JD2A 2YI1A 3LDOA 3P4IA 4H0OA 1JCFA 2A42A 3QMLA 2P9LB 3CI5A 3M3ZA 1HLUA 4B1UB 4CBXA 5LJVA 5AQNA 1NLVA 4BR2A 3ENOA 3O80A 5FPMA 3D2FB 4RWTA 4ISFA 5EXWA 4BRGA 3VF2A 4B1YB 3EO3A 1SZ2A 1ZXOA 2V52B 4B1ZA 3O1WA 2AA4A 5AZJA 4FPAA 3I8BA 1XUPO 3U4LA 2Q0UA 4BR0A 4O8KA 2ZGYA 3ZEUB 3MK6A 3LL3A 4XH5A 4E1JA 1GLBG 3C7NB 3CIPA 2V51B 5AQTA 1YXQA 1QHAA 2NRHA 3J8AA 3IMXA 4FOEA 3VEYA 4CBWA 5BPLA 4IJNA 5FPEA 3KZBA 3A5OC 3KVGA 4CD1A 1NGGA 1SAZA 3H3OB 4WYBA 5AFUH 3SMSA 2A41A 3AY9A 3LDLA 1ATSA 4WQ4A 2GEMA 5AZIB 3DXKB 4BRCA 3GDQA 1S22A 4QS9A 2HOEA 4A62A 3HSCA 1XQSC 5BN8A 4PKIA 1R59O 3LM2A 5AQFA 1KAZA 2FF3B 3LDQA 1GLAG 3QDKA 4FWQA 4ISGA 4A2AA 4BRLA 4CZIA 4CZMA 4GY2B 4PL8A 3DAWA 1MWMA 3VF4A 3ATUA 2FLOA 5CE3A 2H3GX 1E4FT 2ZF5O 3L4IA 4KBOA 2GWJA 2YJEA 3TPQA 1WOQA 3UKRB 4EAHD 1NGJA 2ASOA 2D1KA 3D2EA 4JN4A 5JICA 3OHRA 1RGIA 3VGKA 4LC9B 3DXKA 4M7XA 4PKGA 4O5FA 1GLCG 2FSNA 2QWMA 1NMDA 1QQNA 2VWBA 3HBTA 2QM1A 2E2PA 4CZLA 2E1ZA 3ZETB 1HPMA 1X3MA 4CJ7A 4MLHA 3BF1A 4YDUA 3WQUA 4K43A 2UYTA 1HKCA 3RSEB 3VGLA 3SJHA 5EX5A 2CH6A 3QBWA 4BRFA 3MN6A 1LOTB 1BOTO 3ID8A 2PBDA 4IJAA 5EOYA 4WQ5A 3C0BA 1XC3A 1K8KB 2W41A 1BDGA 2CGLA 4BR7A 2V7YA 1H1VA 3H1VX 1Z05A 1U2VB 3ZX0A 2NLXA 3DJCA 3C7NA 5JLFA 3DXMB 4BR4A 1KAXA 4K25A 3O6WA 3QBXA 3W3DA 3CJAA 4FO0A 3BP8A 2IVNA 4L3QA 4FWMA 4C23A 2E2QA 3ULEB 2QWPA 2P9NB 3WT0A 1ATNA 3EL2A 3R8EA 4RCHA 5AR0A 1DEJA 3CJ7A 3F9MA 4BRPA 5AQIA 3IFRA 2E2OA 3GG4A 1Q18A 3ZEUA 3FE1A 1NGDA 2E8AA 5BPNA 5E26A 4H5NA 2P9SA 1NM1A 4BRIA 1GLDG 1ATRA 4MO4A 4JD2B 4RTFD 5KPRA 5F1XA 2W40A 2J4RA 4HWIA 1C0FA 1S3XA 5AQKA 5BPMA 3GBTA 1IG8A 3D2FA 4BRQA 5AZIA 3FZFA 1WUAA 4PL7A 3BEXA 1GLFO 3IDHA 5AQWA 2KHOA 1K8KA 2IIRA 3UKUB 1HKGA 3QICA 1T6DA 2QW9A 3M6GA 4FWOA 3A0IX 2P9UA 4BGAA 4BRMA 2VCPA 1GLJO 3VEOA 3VF6A 4DCHA 5KPTA 1NBWA 5AQVA 5FPNA 3ZX2A 2GELA 5LJWA 4IO8A 2HF4A 1HX1A 2GUPA 3RSEA 1Z6RA 4H0TB 3FZHA 3R6MA 4H5VA 1YVNA 4M63C 5AQZA 3H45C 2ASPA 3JXUA 1X3NA 3SLCA 4FWKA 1ESVA 2Q2RA 3WUHA 2CGKA 5BN9A 4FWRA 3AARA 3G25A 2YHWA 4BREA 4WQ4C 5AQGA 4YDUC 4BRNA 2NZTA 2GWKA 2I7NA 2E2NA 3VEZA 5F0XA 1BG3A 3VEWA 5AQRA 5ELZA 2YHYA 3MMVA 1NGIA 2E20A 2ZGZA 5BREA 3ULEA 5AZJB 4BR5A 1ZBSA 1NGBA 2QXLA 3VERA 3L6QA 2QWQA 2IVPA 3A8YA 4PKHA 4QS8A 3EKSA 3CJCA 2DPNA 3FR0A 4BG8A 2ASMA 3VETA 1TYQA 2Q31A 4NO7A 1NWKA 1BWFO 1KXPA 3I33A 4QS7A 3H6EA 4A61A 3WQTA 1V4SA 4CZFA 5AQPA 3R9PA 1QQMA 3MCPA 1ZC6A 2QWLA 4NB4A 5BR9A 1NGCA 3JS6A 4BRAA 4K42A 4FWPA 3WXKA 5AFUA 3O4WA 1QZ6A 3UKUA 4BQLA 3MN9A 2GTDA 2ITMA 3UE5A 5AQOA 3WXJA 4FWNA 4EHTA 2CH5A 3D7EO 2Q0RA 3FFKB 3TU5A 1YAGA 3QFUA 1DGKN 2Q36A 3CJ1A 3WEEB 2A3ZA 4CBUA 1BO5O 4MO5A 2P9PA 3FZLA 2P9LA 1J6ZA 2Q1NA 3EZWA 4HTLA 3UKRA 3CETA 2I7PA 3VEXA 4CZHA 4CZEA 4EFHA 3O8MA 3HM8A 4BRKA 4BG9A 5AQMA 3S41A 1MWKA 3VGMA 5KPZA 2A40A 2FXUA 3HTVA 4BC4A 1C0GA 3ZETA 2D0OA 3DWLA 3O08A 3MN7A 1T44A 4BROA 3VEVA 4B1WB 2P9KB 2QWRA 3H3NO 4IXCA 4A2BA 4BC5A 5AQQA 5BRFA 2E88A 3CJBA 3CQXA 4H0PA 3O1BA 1CZAN 1EQYA 1P8ZA 3ZX3A 3LDNA 1LCUA 3GOIA 5AQXA 1D4XA 2P9IA 4FWSA 4XH1A 4BC3A 4EHUA 3ENHA 2D4WA 3LM9A 4GNIA 4EIAA 4BGBA 1G99A 5EY4A 3A5LC 3QFPA 4Z94A 3SMPA 1BA0A 5JLHA 4DB3A 4M7YA 4JHDB 2P9PB 1MA9B 1TUYA 4H0VB 2HF3A 5JMVA 4Y0WA 5B8HA 3GL1A 1X9JA 3HZ6A 4XEIA 4H0YB 3BF3A 3HI0A 2P9SB 4I6MB 4BQZA 1NGEA 3EKUA 2A6AA 3WXIA 4BR9A 3VENA 5BRHA 3H1QA 2ZWHA 1MDUB 2P9UB 1DKGD 2PAVA 2QWNA 3VPZA 3O5BA 3WEEA 2FF6A 4B9QA 1HJOA 2QWOA 4CZJA 3U9DA 5I9EB 1RDWX 3AAPA 1BU6O 2E1YA 3W0LA 4ISEA 4BC2A 4H03B 1BUPA 1T6CA 5ADXH 4CD3A 3B8AX 3FZMA 3EN9A 2CGJA 2BUPA 1V4TA 4BVPA 2YJFA 1GLLO 1NGAA 3CQYA 3WXLA 3A5NC 1JCEA 1NGHA 3LDPA 5AQYA 5AQUA 5E84A 3SK3A 4BRHA 5BRDA 5AQSA 5F2RA 2V7ZA 4H5RA 5ADXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CJEA 3OBWA 4XH4A 5HROA 1IJJA 2HBLA 5J1EA 5HP1A 2ZJPL 3I55N 2FC0A 2OCEA 4DF4A 2QA4N 4HUFA 1TYQB 4H0XB 4CJKA 3L4QA 4KTQA 3CHWA 4DR5K 1QQOA 1W97L 4CFCA 1ASUA 4JKFA 4CJVA 3OTOK 4AM6A 2HHWA 1W9HA 4B1VA 3QEPA 3KHYA 3BUZB 2WONA 2BTFA 4F2RA 3TSUA 2JWLA 3SUPA 5AQJA 2VGNA 4X64K 3CPWM 5C2FA 3PSFA 3ASMA 4DLGA 2I5JA 4DV7K 4EZ6A 2G8WA 3IUCA 2Q97A 5LMNK 4W5QA 1YTUA 3HXMA 3PX6A 4AHVA 4CEBA 3H46O 2D0PA 3AVIA 1A5XA 1OKJA 1SL2A 3MXJA 3EE9A 3FGUA 1HNXK 1S6PA 4CJ3A 1KTQA 3RR7A 2AJQA 4DTXA 2OPRA 3MEEA 4R79A 1UOCA 5DMRA 3KWGA 2Z1GA 3TAGA 4OKKA 1N8RO 2WFBA 1SS6A 4IWVA 4F2SA 4DSIA 1TGOA 1HR0K 4JD2A 4XJXA 3E66A 3LDOA 2KLAA 4FJGA 4JLHA 3CCRN 5FPMA 3VQEA 1TK5A 3NH1A 3D2FB 4BRGA 3VF2A 2DFFA 5KGXA 4LH4A 1ZXOA 4JK8A 3OA9A 4B1ZA 3LWMA 3O1WA 5AZJA 1BCMA 4ICLA 4O55A 4CHZA 3MWPA 3ZEUB 2A1SA 2V51B 5AQTA 2Y1JA 2YNGA 4DQRA 1WSEA 4RW9A 3KZBA 4AHCA 4DSJA 4E7KA 1T8EA 4WYBA 4CJPA 4WFBL 3I56N 2G8VA 4CJTA 2UXCK 3LDLA 4E89A 1NOYA 1TVRA 1LW0A 5AZIB 3BZCA 1S6QA 4BRCA 4KAZA 5CYQA 1YJWN 2HOEA 3IS9A 2PYLA 1HJRA 3IAYA 4PKIA 1YJ9N 4DTOA 4KH5A 4LFAK 1FXXA 2FF3B 3LDQA 4A2AA 4FWQA 5I3UA 5HRSA 2C1IA 4CZIA 3THXA 4GY2B 4O0JA 3O4QA 3S3OA 1MWMA 3VF4A 2FLOA 2QK9A 2H3GX 4DFJA 1E4FT 1VSKA 5HRPA 3HPOA 4FJKA 4B3RK 3TPQA 3S5TA 5CZ2A 4OO1J 4CF9A 1QHTA 4JN4A 3KK3A 2HHSA 5DM6L 2PYJA 1G15A 4O5FA 2ZE2A 3O9SA 4M42A 2ITGA 4DTPA 4L8RB 3OYDA 2QM1A 5GAGP 2OTJN 1QSSA 1VQ5N 2GV9A 2UYTA 4HCCA 3RSEB 3VGLA 3AVKA 4IO9L 2HBJA 3SJHA 1SL0A 4KTZA 4PUOA 1HRHA 1BOTO 5KGWA 4WQ5A 4EZ9A 2W41A 3THYA 2V7YA 1H1VA 3SI6A 3KWIA 3ZX0A 3K9KA 4E1MA 1HQEA 3O6WA 4YOUA 3QBXA 1NK9A 2W6KA 3MECA 4JEPA 4FJXA 3RMDA 4MQ3A 4FWMA 3L2RA 2F8TA 3ULEB 2QWPA 3EL2A 4CFDA 3Q7BA 4X65K 2KQ2A 4PHTX 3F9MA 4BRPA 1NG9A 1EXQA 4H5NA 1NM1A 5HOOA 3JSMA 3OS0A 3TSQA 3BZKA 1U48A 2JGUA 1KVBA 3NF9A 2HMIA 4ID5A 5E41A 2VG6A 4F4KA 4FJHA 2PY5A 3U3YA 1NK4A 5M1QA 4DG1A 3QLHA 4OX9K 1WUAA 1FK9A 3CM6A 4JI4K 3AVMA 1IBLK 5HBMA 2QI2A 4JYAK 2O8EB 4OKEA 3QICA 3OVNA 3TI0A 3PV8A 3AO3A 2VQEK 3VA3A 2UUAK 4BRMA 2P9UA 4KH4A 3O3FA 4DCHA 4FM2A 3ZX2A 3KLHA 3OYFA 2GUPA 3CCJN 4CK2A 4JKAA 3RSEA 5JS2A 5FRMA 1Z6RA 1C6VA 1T3VA 5J2MA 1NNEA 3O3HA 3CD6N 2OPQA 3KD5E 1IKWA 1VQPN 2ASPA 1WNSA 1HNIA 1BIZA 2CGKA 1CZBA 4Z4EA 3QETA 3SAHA 4KH6A 1VK0A 1JLAA 4KHPK 2DY4A 3ID6A 2BANA 4I9QA 4BRNA 1SUQA 3M8QA 4YHHK 4E0DA 3O3GA 1BG3A 4CF0A 2KZZA 1K6YA 3MMVA 3V9WA 4C1NK 4RW8A 5BREA 3L2QA 2HB5A 2YNHA 4CJFA 1NGBA 3VQCA 3L6QA 4PKHA 4QS8A 1A5VA 3THVA 5C15A 1FJGK 4FZZA 4M41A 4OJRA 4JI2K 3VQ7A 4Y1DA 4G9ZA 4IKFA 4V19S 2X6NA 4B9VA 4DV3K 4NXNK 3HPGA 4KI4A 1FKOA 1UA0A 3K59A 2GX9A 3OYMA 3LZJA 1QQMA 2YNFA 4CF8A 3E9LA 3P5JA 4M3XA 1RBVA 3JS6A 3PUFA 2R7YA 4CFBA 3O9QA 3O4WA 4JRQA 2ITMA 4CJ5A 1VSJA 4JKHA 4OLBA 4NYNA 4EHTA 3D7EO 4B9TA 4CEQA 4DU3A 5CHIA 2Q36A 3WEEB 3CJ1A 2A3ZA 3K2PA 4CBUA 1NK8A 1U49A 3ZSQA 4HTLA 3UKRA 1HNWK 4CGJA 4CERA 4CZEA 1VQLN 4KHYA 3O8MA 3DRRA 1BIUA 4H8KA 4KB1A 1RCHA 1MWKA 1TAUA 3CFOA 3HTVA 1C0GA 2O8EA 1EO1A 1IKVA 3O08A 3CM5A 2KFZA 4DSFA 1HYSA 2WC9A 2QWRA 3DRSA 4LSNA 1VQ7N 4H0PA 1EQYA 1RTDA 3LDNA 3GOIA 2YHAA 4CJQA 1M90O 4MDBA 3M5RA 3THYB 5JENA 4EHUA 2O8CA 1HPZA 1SV5A 3ZSXA 1JL1A 5EY4A 1S72N 4E72A 1RT4A 4FCYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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