4CI6A

Mechanisms of crippling actin-dependent phagocytosis by yopo
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMHVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAASTSLEKSYELPDGQVIAIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKTKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPGIVHRKC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title Yersinia Effector Yopo Uses Actin as Bait to Phosphorylate Proteins that Regulate Actin Polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Transferase/structural protein
total genus 114
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4ci6A03
5AQRA 1ATNA 2E88A 3JS6A 4QS8A 4CBUA 4B1VA 3FZHA 4O8KA 2Q97A 2KHOA 3G25A 4FWNA 2P9UB 1Y64A 1SZ2A 2P9UA 4QS7A 3WXIA 4RWTA 4PKHA 1YVNA 2H3GX 4H5WA 1JCEA 3WUHA 1HKCA 4IZ9A 4BC5A 4IXCA 2I7NA 3CI5A 4GNIA 5AQKA 4E1JA 3CETA 2YI1A 1NGBA 4BC4A 2P9IB 4CJ7A 4BR2A 4BRIA 2P9IA 3AARA 2P9KB 4B1UB 3BP8A 3ZETB 5KQDA 2ZF5O 3VGKA 3ZETA 2FSKA 3U9DA 2FXUA 2Q36A 3UKRB 4K42A 3J8AA 3SMPA 3UKRA 3CJBA 4A62A 1T44A 4A2BA 3UKUB 4XEIA 3IDHA 1HJOA 3GL1A 3UKUA 4FO0A 2NLXA 3O6WA 3BF3A 1ATRA 1J6ZA 1T6DA 3SMSA 3LDPA 3VF4A 2D0PA 1WUAA 2Q1NA 3MK6A 4FWOA 4EAHD 1BOTO 3BEXA 3HZ6A 3AAPA 3FE1A 5B8HA 2GUPA 4BG8A 2FSJA 1TUUA 3D2EB 1S3XA 3D2EA 3FFKB 2GWJA 5KPRA 1RDWX 1X9JA 2FF3B 1C0FA 5AQZA 1YAGA 5FPMA 3VF6A 3A5MC 3MN9A 2VWBA 5KQ8A 2CGLA 3DAWA 4I6MB 3L0QA 4JNEA 4NO7A 4I6MA 3CJ9A 4BR5A 4CI6A 2HF4A 3LDLA 3RSEB 3VOVA 3GBTA 3RSEA 4M7YA 4BC2A 1U6ZA 4H0OA 3WXJA 1IJJA 1NGCA 2QWRA 5AQTA 5AQLA 5AQQA 4BR9A 3QMLA 4FOIA 2PBDA 3VGLA 3KHYA 5AQYA 3VEOA 1P8ZA 1V4SA 3ZX2A 4DCHA 2E2QA 4K41A 4EHTA 1WOQA 4IJNA 2F9TA 3QDKA 2A3ZA 2W41A 1GLFO 4FL9A 2E1ZA 4CZLA 3HBTA 1H1VA 5AQFA 5AQNA 4BRCA 4ISEA 3DJCA 1BG3A 1KAXA 3HSCA 3C7NB 4MO5A 5I9EB 1QZ5A 3C7NA 2P9LB 4B1YB 4CZFA 4CBWA 1MWKA 2ZGZA 2P9LA 3IFRA 3OHRA 2ZWHA 5AZJA 5BPNA 3M1FA 5EX5A 1NGAA 2I7PA 3CQXA 1YXQA 5FPNA 1NM1A 4WYBA 4AM6A 1C0GA 4H0YB 4BC3A 3M6GA 2P9NB 1ZBSA 2GTDA 2E1YA 2A5XA 3R9PA 1Z05A 1HLUA 4EIAA 5BN8A 2Q0UA 3CJ7A 4MLHA 4HWIA 5EVZA 3S41A 1QHAA 1Z6RA 2YCHA 2D0OA 3VPZA 1MDUB 2OANA 4BQLA 5JLHA 2QW9A 3LL3A 4H0VB 4BRQA 3VEXA 2Q0RA 3R8EA 1NGEA 5E26A 3LDQA 1IG8A 4BRAA 3L6QA 1NGIA 4FWQA 1GLAG 2IVNA 4BGBA 3FLCO 4BRMA 1GLJO 2IIRA 3VENA 2AA4A 2E2PA 3VF2A 3VEYA 4GY2B 4J8FA 5F0XA 1OKJA 2ZGYA 3H3OB 4L3QA 3KZBA 3QBWA 2V7ZA 3CJ1A 4FPAA 4WQ5A 5AZIB 5FPDA 1HKGA 5AZIA 2CH6A 4CZIA 3H46O 4NB4A 4AM7A 5AQPA 5KPTA 1SAZA 4PL8A 4JD2A 2W40A 3WQUA 1HKBA 2PAVA 3H1QA 2CH5A 2GWKA 3UB5A 1Q18A 2HF3A 4DQ8A 3ULEB 3ATVA 4WQ5C 3ULEA 3MN6A 2Q2RA 3GDQA 4WQ4C 3EKSA 1NMDA 1BA0A 1NGDA 3EZWA 5AR0A 2VYPA 3O5BA 1MWMA 1KXPA 2QWOA 3MN7A 5BRFA 1EQYA 2V7YA 3IUCA 3LDNA 1HUXA 2D1KA 2WUSA 3DWLA 3CJAA 2BUPA 4BR7A 4BRHA 2YHXA 4M63C 2A42A 4H0XB 1K8KA 3FZFA 3L4IA 2Q31A 3LDOA 1GLCG 4H5RA 5LJWA 2ASOA 4RCHA 1LOTB 2E20A 4BGAA 3ZX0A 4XH4A 5ELZA 4BRPA 4BR4A 5BRDA 2VCPA 5AQGA 4CZHA 4CZKA 5F1XA 3ENHA 1NLVA 5ADXH 2P9SB 5CE3A 3DXMB 2E8AA 2A6AA 2P9SA 3FZMA 4A61A 3DXMA 4B9QA 3VERA 4Y0WA 2QWNA 3B8AX 3ZEUB 3SK3A 3ZEUA 3IMXA 2CGKA 1S22A 4EFHA 5FPEA 1G99A 3O1BA 2FSNA 4CD1A 3EKUA 4A2AA 2QM1A 4BRGA 4CD3A 5AQXA 1HX1A 4H5VA 1GLLO 3GG4A 5AZJB 4FWRA 2ITMA 4BRLA 1ESVA 4LC9B 5AQWA 2A40A 4KBOA 1GLDG 3I33A 3H6EA 3D2FB 3CERA 5AQMA 3D2FA 3R6MA 4BVOA 4K43A 2E2NA 4JAXA 3W0LA 4XH5A 4CZJA 3WXKA 3O1WA 4CZMA 4DB3A 4QS9A 3GE1A 4BVPA 5AFUH 3MDQA 5AQVA 1MA9B 2QWLA 4FWPA 4HTLA 3TPQA 4FWKA 5BPLA 5JICA 4FWLA 3O08A 1BDGA 5KPZA 3A5NC 4YDUA 3VESA 3VETA 1ZC6A 4JN4A 5EY4A 3KVGA 2YJEA 3EL2A 3ID8A 5BREA 2V51B 2QWPA 4RTFD 1JCFA 4BRDA 3QBXA 4MLEA 5AQUA 1QQOA 3O80A 4BRKA 3H45C 3WQTA 4K25A 5LY3A 3FZLA 2CGJA 3HTVA 5AQSA 4WQ4A 1E4GT 3FR0A 4IJAA 4CBXA 4YDUC 4F9OA 1XQSC 3JXUA 2QXLA 3H1VX 3FGUA 3LM9A 1QZ6A 3MMVA 4JD2B 2V52B 1BA1A 4MO4A 2FF6A 4H5TA 4BREA 3D7EO 5BN9A 3A8YA 2QWMA 2QWQA 3QFPA 3O4WA 4FWMA 3UE5A 3AY9A 2NRHA 1NBWA 1SQKA 5BRHA 2P9KA 3H3NO 3ATUA 1TUYA 1ATSA 2D4WA 5AQIA 1HPMA 1V4TA 5ADXA 2P9PB 3CJCA 2HMPA 2J4RA 3I8BA 2P9PA 3BUZB 3ZX3A 1RGIA 5BPMA 2A41A 5AQHA 4BRFA 1ZXOA 2HOEA 3A0IX 4FPBA 1NGHA 3U8XA 1K8KB 3LM2A 3P4IA 4FSVA 4H5NA 1RFQA 1XUPO 1BWFO 3VEVA 4PL7A 3QICA 2ASMA 4B1XB 2GEMA 3CQYA 5AQOA 1GLEG 3WT0A 4BQZA 4FWSA 2GELA 3A5OC 2YHYA 4H03B 4JHDB 4B1ZA 2YHWA 4JHDA 3ENOA 1BO5O 5JLFA 4IO8A 1NWKA 2F9WA 3BF1A 3EN9A 1NGFA 3WXLA 1U2VB 4BRNA 3QB0A 1X3MA 3MCPA 4B1WB 4M7XA 1U2VA 1NGGA 4BG9A 3F9MA 4O5FA 5AQJA 1KAYA 1QQMA 1DGKN 4H0TB 1T6CA 3W3DA 2EWSA 5JMVA 2UYTA 1TYQB 2IVOA 3AAQA 3SLCA 1TYQA 2IVPA 3QFUA 3VGMA 4CZEA 1KAZA 3U4LA 5AFUA 3CIPA 3CHWA 1BUPA 3VEWA 3HM8A 4CZGA 3FZKA 4EHUA 3DXKB 1LCUA 1E4FT 3DXKA 1BU6O 2YJFA 2ASPA 5LJVA 5F2RA 3TU5A 1X3NA 4FOEA 1JCGA 4PKIA 2FLOA 1YUWA 2E2OA 2DPNA 1GLBG 2NZTA 5E84A 4BR0A 1R59O 4PKGA 1QQNA 3A5LC 2AP1A 1CZAN 3HI0A 3O8MA 5EOYA 5TKYA 4H0PA 3WEEB 1DKGD 3VEZA 1XC3A 3MN5A 4XH1A 5BR9A 3WEEA 3M3ZA 1NGJA 4BROA 4ISGA 5EXWA 3EO3A 3SJHA 3U9ZA 2P9NA 3C0BA 3GOIA 4Z94A 2BTFA 1DEJA 4DHYA 1D4XA 4ISFA 4C23A 4IWVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ATNA 1D9DA 3JS6A 4B1VA 5LMUK 4LY7A 3L2VA 4UQGA 4FWNA 4C1NI 3DLLL 2P9UA 5KRSA 2OTJN 1YVUA 4PKHA 4BWJA 2VWKA 3SUNA 4BC5A 4E1JA 4JI1K 1WSIA 4KHSA 1HJRA 1NGBA 3ALYA 1KRPA 4BC4A 4CJ7A 3BZKA 5C42A 3OVNA 4BRIA 3VQ7A 1I39A 3KWGA 3ZETA 3DLRA 4K42A 3UKRA 3AO2A 4A62A 1SS6A 1VQPN 4KB0A 4DTMA 4W5TA 3V9WA 1W9HA 3O3FA 2RKIA 1QS4A 4J2DA 1ATRA 1T6DA 1WAFA 3LDPA 3MK6A 1VQKN 1BOTO 4C1NK 3BEXA 5B8HA 3AAPA 2EX3A 2YX6A 4HCBA 1TK8A 1JXEA 3D2EB 4N41A 4FM0A 1S3XA 1RDAA 2EHGA 3FFKB 4LFBK 4FJJA 4CEDA 2FF3B 1SUQA 1EETA 3ZT2A 3MN9A 2CGLA 4NCBA 3L0QA 4NO7A 3M8RA 4I6MA 5K14A 2DFHA 3RSEB 2VG5A 4M7YA 4BC2A 1NGCA 2X74A 5AQQA 4BR9A 5JS1A 3WNEA 3VEOA 3WNHA 4PUOA 3ZX2A 4K41A 1BI4A 1S9GA 5IWAK 1NJWA 1KLNA 3QDKA 2W41A 1GLFO 3AGKA 4CZLA 1H1VA 1KFSA 2HHQA 3SPZA 5AQNA 4BRCA 4B9NA 1L3SA 1BQNA 3HSCA 4AHVA 4HHTA 1K6YA 1N36K 1C0UA 4JKEA 1U45A 1QZ5A 1YJWN 4IBNA 2HMIA 4CBWA 3CD6N 1MWKA 2HHVA 2ZGZA 2P9LA 3N4QA 3KLEA 3TAQA 3L2UA 3OYGA 2NRVA 5AZJA 5EX5A 1NGAA 1ASUA 4CGHA 2VG6A 1BCOA 4C8NA 4RG8A 2P9NB 3VQDA 1XNQK 2W6LA 2WOMA 4JI5K 5D3GA 4EIAA 1KQSM 1HLUA 2O8CB 4MLHA 3HP6A 4E0DA 1Z6RA 1MDUB 5M1OA 4U7BA 3TI0A 1QE1A 2QW9A 3LL3A 3THYB 1YF5L 3ZSXA 3OYMA 1HYSA 3HPOA 3QNNA 2VWJA 4FLVA 4ILHA 4B3TK 5EU7A 3L6QA 4BRAA 2HHSA 1NKCA 4LSLA 4FWQA 4E7IA 2IVNA 3ZCMA 3FLCO 3TAMA 1S1XA 1GLJO 1WSJA 2AA4A 2E2PA 3OYHA 3VF2A 5F0XA 2ZGYA 4L3QA 3KZBA 3QBWA 1LV5A 1KTQA 5AZIB 2HHTA 1Y97A 2CH6A 2FBYA 4CZIA 4AM7A 3TAEA 1X9WA 5AQPA 4IFVA 4CJRA 1NNEA 1FXXA 1LW2A 4CJFA 3CFOA 1OVYA 4JD2A 1L3UA 1C0MA 3OTOK 3H1QA 4IG3A 1Q18A 3IRXA 4Z4CA 3VTHA 4DR2K 4WQ4C 1BA0A 4CHPA 5AR0A 2VYPA 2OPPA 4KHUA 1TK0A 3QO9A 5JVHL 4ICLA 2QWOA 3J7ZO 3MN7A 3PO5A 4DQSA 3PY8A 3IUCA 4ILGB 1XHXA 1LWFA 2BUPA 4BRHA 3VQ5A 3CG7A 4A57A 3L4IA 3ZT1A 3K5NA 4H5RA 1IKWA 5LJWA 1B9FA 1XHZA 5C24A 4XH4A 4MQ3A 4BR4A 4U67L 1YI2N 1X9MA 1N5YA 4FJ5A 3WXMB 2HW3A 3DXMB 4OKKA 2P9SA 1VQON 4B9QA 2FBTA 1RTIA 2QWNA 4I7FA 1NJXA 3AO4A 4RW9A 3IMXA 3E66A 3V6DA 5C12A 1S22A 5FPEA 4DTOA 3H08A 1BISA 4CD1A 3QEVA 3HK2A 1EO1A 4NYNA 3LP3A 5AQXA 1HX1A 3QERA 4H5VA 3CCVN 3DYAA 3K57A 4HVJA 2HBLA 2ITMA 3M8QA 1R0AA 1EX4A 2A40A 5C10A 4AF1A 3SQ0A 4AHTA 3TANA 3MXMA 4LF8K 3AVGA 3P5JA 4RW8A 3NF9A 3D2FA 3R6MA 1QQCA 4BVOA 2YNGA 2E2NA 3CC2N 3W0LA 4M3TA 3C65A 3SQ1A 3WXKA 1S5JA 1T7PA 5DM7L 3OYJA 4JS4A 3TPQA 3T69A 3DOLA 4FLYA 3QEIA 1RBTA 3VESA 3VETA 4E1MA 4JN4A 5EY4A 3KVGA 3ID8A 4KHNA 2HNDA 1VQ5N 2QWPA 4BRDA 4B8CA 3H45C 3WQTA 4K25A 3HYFA 3T19A 3FR0A 4IJAA 2NRXA 3NFAA 1D5AA 3LDSA 4CBXA 2PY5A 1HYVA 4OO1J 4YDUC 4CJ5A 3JXUA 3KLIA 3F9KA 3P31A 3E01A 1XNRK 1VHXA 1C6VA 4MO4A 4M41A 2QWMA 4C8OA 3UE5A 2G8HA 2E6LA 4B9MA 3H3NO 1VRTA 3HXMA 4B9LA 3DLGA 3OS2A 3CMEN 3QNOA 5AQIA 2HMPA 4CESA 3MCAB 4OPHA 2IAJA 4CJ4A 4FPBA 1NGHA 3U8XA 4IG0A 1N6QA 4FJ8A 1N34K 1BWFO 1O1WA 3VEVA 3C6AA 3QESA 4PL7A 2JWLA 4X66K 3QICA 2ASMA 4B1XB 2GEMA 3IG1A 4DTUA 1GLEG 2QKKA 4E7KA 4BQZA 1IBLK 3C6UA 3K5MA 2OCEA 4IO8A 5FRNA 4CF1A 3ZT3A 4LH5A 4M7XA 1RT6A 1NK5A 4JKHA 1VSKA 3EY1A 1YIJN 2O4GA 3Q7BA 2UYTA 4CJLA 4JKAA 4FK4A 4F9OA 3SLCA 2IVPA 1KAZA 4WFAL 2UXBK 1RT3A 1RDBA 2ZM6K 1VSLA 3HM8A 3VMFB 3WNGA 4CIFA 2W42A 4DR6K 5GIOA 2YJFA 2ASPA 1RILA 2DTUA 4M45A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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