4CI6A

Mechanisms of crippling actin-dependent phagocytosis by yopo
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
370
structure length
358
Chain Sequence
b'VAALVVDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNSPAMHVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVSHTVPIYEGYALPHAILRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAAASTSLEKSYELPDGQVIAIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETVYNSIMKCDVDIRKDLYANTVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTIKTKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWISKEEYDESGPGIVHRKC'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords ACTIN
publication title Yersinia Effector Yopo Uses Actin as Bait to Phosphorylate Proteins that Regulate Actin Polymerization.
pubmed doi rcsb
source organism Yersinia enterocolitica
molecule tags Transferase/structural protein
total genus 114
structure length 358
sequence length 370
ec nomenclature
pdb deposition date 2013-12-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4ci6A02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4ci6A03
1EQYA 4CZHA 1KAYA 1QHAA 5AQSA 2V51B 3ZX2A 4WQ5A 2PBDA 4DHYA 2NZTA 1NM1A 3WUHA 3CERA 5F1XA 4BRAA 4CZIA 1D4XA 2UYTA 4B1YB 4BG9A 4BR4A 2P9IB 2Q97A 3BP8A 5EX5A 4EHUA 4F9OA 5KPRA 2KHOA 5AQHA 2P9SB 4A2BA 3DXMA 3EO3A 1RDWX 3MN5A 3ZEUB 4CZJA 1ESVA 2HMPA 3IFRA 2IVNA 4FWKA 4Y0WA 4JHDA 5BREA 3HZ6A 4PKIA 1S22A 3JS6A 3LM9A 5AQGA 3O1BA 1X3NA 5LJVA 1QZ5A 2E2NA 5EY4A 3EN9A 1U2VA 2A5XA 1Z6RA 3D2FB 1DGKN 3CJBA 3H3OB 4FPBA 3CQYA 4MO4A 4M63C 4YDUA 4MLHA 3DXKB 3R9PA 3SMPA 2P9IA 1NGEA 5JMVA 5AQZA 2IVOA 2QWNA 2P9SA 3QMLA 1MWKA 4XH1A 3A8YA 2ASPA 4WQ4A 2QXLA 4A61A 2A3ZA 3ID8A 1BG3A 1SQKA 3U9DA 4BGBA 1NLVA 4M7XA 3CI5A 2ASOA 3VEXA 4B1ZA 5BN8A 1ZC6A 4QS9A 4WYBA 3VPZA 3DWLA 3FZMA 2Q1NA 2ZF5O 4BR7A 5AQNA 4BRFA 4CD3A 3U9ZA 1T44A 2Q0UA 5B8HA 3UB5A 3WT0A 3VENA 5ADXH 1HUXA 4H0PA 4K25A 4BRIA 4BVPA 3ENHA 3CJAA 4FWOA 4BR0A 4FWQA 1HX1A 1ZXOA 4IXCA 3VETA 2YI1A 1WOQA 4WQ5C 3H46O 2CH6A 4AM7A 4H5NA 2VCPA 4HWIA 3VGKA 2FSJA 5AFUH 1BO5O 1X3MA 3WXJA 3U8XA 2Q31A 4B1XB 5FPEA 5LY3A 1DKGD 2QWPA 1ATSA 1RGIA 2E88A 3GE1A 4FL9A 3GDQA 4O5FA 5F0XA 1CZAN 4NO7A 5AQFA 5EOYA 5AQYA 3EZWA 2E2PA 1C0GA 3P4IA 4BRCA 1Q18A 3CJ7A 2WUSA 1T6DA 1GLEG 4FWLA 3LDLA 1TYQB 4H0VB 4IWVA 3BF3A 3CQXA 4YDUC 1H1VA 3UE5A 3O1WA 1NGBA 1E4FT 3M3ZA 2CGKA 3O5BA 4PL8A 2W41A 3G25A 5AQPA 4CBXA 3SLCA 5KPZA 2DPNA 2QWRA 1HKGA 3MN7A 5F2RA 2A6AA 2BUPA 4IJAA 4BVOA 2ZGYA 1DEJA 3D2EB 4I6MB 4WQ4C 5E26A 3ENOA 3KHYA 1ATRA 3O6WA 3QDKA 1NGJA 4BC2A 3QB0A 5JLHA 3W0LA 3WEEA 2NRHA 2EWSA 2ITMA 3FLCO 5AQOA 4H0YB 5AQXA 1GLFO 3CHWA 1NGDA 3WXLA 3I33A 3GBTA 4A2AA 2QM1A 1TUYA 5TKYA 3C7NB 4BROA 4JD2A 2A40A 5AQIA 5ELZA 3ATUA 3LL3A 4FPAA 2YHWA 5AQKA 5KQDA 2D4WA 3EKSA 2I7NA 4BC5A 2HF4A 3D2EA 4I6MA 4DQ8A 5AQRA 5BRFA 3SJHA 1XUPO 2YJEA 4RTFD 3VEZA 4JN4A 2FLOA 4CZMA 4BR2A 3A5NC 2P9LB 3KVGA 3L0QA 2CGJA 3VERA 3AAQA 3VEWA 1KAXA 3ZX0A 3ZEUA 4B1VA 3CJCA 1J6ZA 1NGHA 1T6CA 3B8AX 1R59O 4ISFA 4ISGA 4JNEA 2BTFA 4K42A 3AAPA 2FF3B 4H5TA 2V7YA 2CH5A 3CJ9A 3FGUA 3QFPA 4CZGA 3D2FA 1RFQA 4BG8A 2QWLA 4AM6A 1JCFA 4B9QA 3UKUB 1XQSC 3H3NO 4BQZA 3BEXA 3DXKA 4B1UB 5E84A 4FSVA 4BRKA 3CETA 1GLBG 2P9LA 1MA9B 1TUUA 3EL2A 3H45C 5AQWA 3HM8A 3HSCA 3QICA 4FWPA 4DCHA 3R6MA 5BPNA 3H6EA 4H0XB 1BU6O 4L3QA 3VOVA 1OKJA 5FPDA 1C0FA 4K41A 4H0OA 3BUZB 5AQMA 1G99A 1U6ZA 1NGCA 3MK6A 3MN6A 3MDQA 3W3DA 2VWBA 4ISEA 3VESA 3GL1A 1JCGA 3VEOA 2Q36A 2YCHA 4IZ9A 1HKBA 3WXKA 3LDQA 1Y64A 1JCEA 3IUCA 3UKRB 4CI6A 2P9NB 3AARA 3FZLA 3VF6A 2H3GX 3WQUA 3LDOA 5JICA 1E4GT 4FWMA 2ASMA 2E20A 4LC9B 4BR5A 3O08A 4H5RA 3VGMA 4J8FA 2D0OA 2E1ZA 4BC4A 2HOEA 3H1QA 4BRHA 1MWMA 2V7ZA 5AR0A 1MDUB 4H5WA 3FZFA 1QQMA 2A41A 3VGLA 5ADXA 3HBTA 4CBWA 3WQTA 2HF3A 2QWMA 2GEMA 3UKRA 3MN9A 2P9NA 4XH4A 1SAZA 5BRHA 4K43A 4MO5A 3CIPA 1QZ6A 3BF1A 4IJNA 4BGAA 3LDNA 2YHXA 2QWQA 1BDGA 5AZIB 3R8EA 4CZKA 1HPMA 2E2OA 2Q2RA 4PL7A 2QWOA 1U2VB 1TYQA 5BPMA 1HKCA 5LJWA 1QQNA 2AA4A 1V4SA 3A0IX 4XEIA 4EAHD 3LM2A 4FWNA 3SK3A 2E2QA 1HJOA 2IVPA 5AFUA 1NGFA 4DB3A 2W40A 1YVNA 1GLCG 1LOTB 2Q0RA 2P9UB 3GOIA 4E1JA 4KBOA 1X9JA 4BC3A 5I9EB 2P9KB 3I8BA 2FXUA 1NWKA 4FOIA 2J4RA 3TPQA 2GUPA 3OHRA 1IG8A 4BR9A 5BN9A 3A5OC 3RSEB 1GLLO 1YAGA 3ZX3A 2ZWHA 3VEVA 4A62A 3FZHA 5AZIA 4O8KA 3TU5A 4EHTA 3IMXA 1BWFO 1ATNA 2F9TA 3C7NA 4PKGA 2NLXA 2GWJA 3EKUA 4BRPA 3O80A 3QBXA 3WXIA 2E8AA 4GY2B 4QS8A 3HTVA 3A5LC 2P9UA 4BRDA 2FSNA 3F9MA 5KQ8A 5AQVA 4BRGA 2P9PB 1GLDG 2P9KA 5AQLA 1GLJO 3QFUA 4FWSA 5KPTA 3ULEB 5EVZA 1LCUA 3FR0A 2GTDA 2E1YA 4EIAA 1V4TA 4PKHA 1BOTO 3RSEA 1NGGA 5CE3A 4JAXA 3L4IA 5AQUA 4B1WB 1K8KB 1NBWA 3QBWA 3U4LA 1BA0A 1ZBSA 2VYPA 4CD1A 4QS7A 2CGLA 4CZEA 3O8MA 2D0PA 3ZETB 2ZGZA 1NGIA 2QW9A 5AQJA 4HTLA 3L6QA 4MLEA 3VF4A 1KAZA 1WUAA 2F9WA 4RWTA 2V52B 4BRMA 3VF2A 2P9PA 4FWRA 2D1KA 5FPNA 3FE1A 5BPLA 3UKUA 3ULEA 4H5VA 3M1FA 1KXPA 1P8ZA 2AP1A 4M7YA 3FFKB 4BREA 5FPMA 5JLFA 3FZKA 1YXQA 3CJ1A 2IIRA 3D7EO 3KZBA 1BUPA 1K8KA 3SMSA 4C23A 3IDHA 4CBUA 4BRQA 1Z05A 2A42A 5AQQA 5BRDA 3M6GA 4H0TB 2PAVA 5AZJB 1QQOA 3J8AA 3ZETA 3LDPA 1NGAA 3GG4A 3VEYA 2FF6A 4CZFA 3MCPA 4Z94A 4BQLA 3A5MC 4H03B 4CJ7A 1YUWA 5EXWA 1IJJA 3ATVA 2GWKA 3MMVA 3O4WA 3DJCA 4EFHA 2YHYA 4NB4A 2FSKA 3H1VX 3WEEB 1NMDA 3HI0A 2YJFA 4FOEA 1XC3A 1HLUA 4XH5A 2I7PA 4GNIA 1BA1A 5AQTA 1SZ2A 3JXUA 4FO0A 3DXMB 3C0BA 2OANA 4IO8A 4RCHA 4BRLA 4BRNA 4JHDB 2GELA 4JD2B 1S3XA 5BR9A 4CZLA 3AY9A 3S41A 5AZJA 3DAWA 1GLAG
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1EQYA 4CZHA 1QHAA 2V51B 1RDUA 4CHQA 2NZTA 3DYAA 3HP9A 5F1XA 3NE6A 1NK0A 2C1GA 4W5OA 1D4XA 2UYTA 4B9UA 4JKGB 3AO3A 4EHUA 2HBJA 4YOTA 4CHYA 3V9UA 4CIFA 3EO3A 1RDWX 3NBPA 3ZEUB 4CE9A 4FM0A 2P51A 4Y0WA 5KI6A 3OYJA 4JHDA 4KH5A 4FJ9A 3DRSA 5K14A 1UAXA 1RILA 3SV4A 4OX9K 1X3NA 3SUOA 1HQEA 5LJVA 1XMOK 3ZLJA 4JK8A 1QZ5A 3ZYYX 3EN9A 1VHXA 2A5XA 2O4GA 5FRMA 1LW2A 3MAQA 3K9JA 4FPBA 1LAVA 1S5JA 3O3FA 3O4QA 2DY4A 3T3FA 4O44A 3AO1A 1ZBFA 3DXKB 3CCQN 3ID6A 1NGEA 4A57A 3QMLA 3AVFA 3ITHA 1S9GA 4FLTA 4M42A 3O3GA 2ASPA 5C2DA 3VQ4A 4OGCA 3AVHA 3NAEA 3ID8A 2R7YA 1BG3A 3G71N 1NLVA 2Q3SA 3TTCA 4OLAA 1QS4A 3ZSQA 3DWLA 3FZMA 2Q1NA 5M1FA 2KKZA 2ZF5O 4ILJA 1YF5L 3U9ZA 3PIOL 1VQ4N 2F96A 4KB0A 5LMUK 2HBKA 3CMEN 1DLOA 4CGFA 1N6QA 4K25A 3KLGA 4CJ3A 4CHPA 2HVIA 4FWOA 1C0UA 2NRWA 4CFCA 4A5AA 2O8DA 1VSEA 3HPOA 4IXCA 4DU1A 3VETA 2YI1A 4PHTX 4W5QA 3OJUA 1WOQA 2ATQA 4AM7A 1QTMA 1TKDA 5AFUH 2O8BB 4CIEA 1X3MA 4H4OA 2Q31A 4FLYA 5EU7A 4QCLA 2Z1IA 1ATSA 1FXXA 1JLFA 1K9MO 3VQ8A 3GE1A 3GDQA 3V1RA 1CXUA 1C0GA 3P4IA 3O9SA 4BRCA 2OPRA 3RMBA 4F3OA 3CJ7A 4FVMA 3KK1A 4E89A 3MCAB 1WSHA 2VWKA 3LDLA 4M45A 4JKEA 2JWKA 4IWVA 3LZJA 2XY7A 3BF3A 3CQXA 3LAKA 3O1WA 3M3ZA 4Y1CA 3O5BA 4DV1K 2W41A 4DTJA 2P5OA 1HKGA 1K73O 2FBYA 2JGUA 1XC9A 4CERA 4E3SA 3ENOA 1J53A 1ATRA 3O6WA 5J2PA 1NGJA 4AQYK 5JLHA 3W0LA 3WEEA 1EXQA 2ITMA 4X62K 4EZ6A 1GLFO 3I33A 4QAGA 4RW9A 3GBTA 2QM1A 1VRUA 4EP5A 2JWLA 4JKCA 2C1IA 1TV6A 4JD2A 3L8BA 1NJWA 1OH5A 3ATUA 4AHCA 4BDPA 4FPAA 2ZD1A 3DMJA 5AQKA 3VN5A 4JKHA 1KRPA 4JRPA 4LF8K 1OVQA 4BC5A 2HF4A 4I6MA 4G1QA 2KTQA 2BE2A 2IOCA 4JN4A 5DK5A 1ILYA 3OYEA 4FJ7A 4MQ3A 5CY4A 3L0QA 1A5WA 5DMRA 2CGJA 2PY5A 3AAQA 3LAMA 5GAGP 2YNFA 3CJCA 3E9LA 3B8AX 1D9DA 1R59O 4ISFA 4JNEA 2BTFA 3AAPA 4FJ5A 2V7YA 1NU0A 4QOZB 2WFBA 1VSFA 4AM6A 4IO9L 4A59A 3HYFA 3PUFA 4JI7K 2HHVA 4KFBA 3EYZA 4CK3A 5BR8K 4CGHA 3CCLN 3CYMA 5E84A 4BRKA 3OYBA 4ID1A 3HO1A 1GLBG 5M1PA 1TUUA 3T1YK 3SBTA 4HHTA 3QICA 4FWPA 4DQRA 5BPNA 3R6MA 2HBLA 4JKDA 1HNWK 4DTUA 1HMVA 3IS9A 4H0XB 3CCVN 3T1HK 1IBLK 4O4GA 3VOVA 4DLEA 1IBKK 1YJNN 1OH7A 1C0FA 1X9SA 5IT9O 4H0OA 1G99A 3SBGA 1JKHA 1HNXK 5IWAK 4YFUA 1KD1O 3GL1A 2FBTA 4AHSA 4ELTA 3SQ4A 3LP2A 1SL0A 1N36K 1VQ8N 3WXKA 3OS2A 2PFUA 1JCEA 1I94K 3G0ZA 5HROA 4FJXA 1WAJA 3HK2A 3AARA 4MDAA 3FZLA 3VF6A 3WQUA 3AVBA 4AHTA 2XY6A 2HHSA 1DTTA 3LDOA 5JICA 4DMNA 4FWMA 4YOUA 2ZJRL 4LC9B 4BR5A 3SQ1A 1NK8A 3TAQA 3NVMA 2OPQA 1GOBA 3ZT4A 4IDKA 4DV2K 1O13A 1WSFA 3VQDA 1JLAA 3H1QA 1S6PA 4BRHA 3I8DA 3CCJN 2DFFA 5AR0A 3L2UA 5KGWA 2EHGA 3DLLL 4C1NK 2G8HA 2ZQBA 2B6AA 1LWFA 4M3YA 3NGIA 5J2NA 3MN9A 5KGXA 4XH4A 4CEFA 2KZMA 3BF1A 1I39A 1N32K 4G9ZA 4U67L 1D5AA 3R3LA 2QWQA 2E2OA 1TK8A 3THWA 2G8VA 1HR0K 1TYQA 1SUQA 1U45A 3A0IX 1RBVA 2E2QA 2IVPA 3KKRA 1ZBHA 3AVAA 1BL3A 4DTOA 4LSNA 1JLGA 4CEZA 5I9EB 2P9KB 4IG0A 4CJUA 2ZM6K 4B3SK 4YNQA 3OHRA 1P90A 1KQSM 2G8UA 5BN9A 3A5OC 3RSEB 1GLLO 1YAGA 3AA2A 4M3TA 1EWRA 3LP3A 2DTUA 4EHTA 3HXMA 1UWBA 4CJVA 2UUAK 3C7NA 2OTJN 4IG3A 3KK3A 3C6UA 3O80A 4GY2B 4QS8A 3HVRA 2P9UA 4BDYA 4ICLA 3E9OA 5AQVA 2P9PB 4O5BA 4E0DA 1LWCA 3TABA 4CF0A 3DRRA 1C6VA 3VQ6A 2JLEA 2GTDA 4Z4GA 1ZYQA 4PKHA 2X78A 2EX3A 5CYQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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