4CLBA

N-terminal bromodomain of human brd4 with ibet-295
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title The Structure Based Design of Dual Hdac/Bet Inhibitors as Novel Epigenetic Probes.
doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4clbA01
3UVXA 4O7CA 5COIA 4YBTA 5I86A 4HXKA 5DY7A 5FDZA 3HMFA 2YDWA 4YBSA 4CL9A 5I80A 5A81A 5EP7A 4O77A 5F60A 4LZRA 4TZ8A 3IU6A 5CGPA 4HXRA 3O36A 5HFQA 4O74A 5E9IA 5A7CA 5IIDA 4O78A 3O33A 5L97A 4O7FA 4TS8A 4NRCA 4J0SA 2RFJA 4ALHA 1JM4B 2WP1A 2RNWA 4HBWA 5HELA 2OUOA 5IBNA 4XUBA 5KO4A 4NUCA 4Q0OA 5FE1A 5G4RA 2N9GA 4CUUA 4YYMA 5A5RA 5FB1A 4NRAA 5EWCA 3SVGA 5F3AA 3SVHA 4HXPA 5CQTA 4QEWA 5L99A 4UIXA 5EPSA 4QSWA 5FFYA 4QEUA 5BT4A 3IU5A 3LQJA 2DATA 5IG6A 5EK9A 5E9YA 5LKUA 5I89A 4ALGA 3G0LA 4TZ2A 5ETBA 2H60A 5C87A 2WP2A 5DBMA 4C67A 3UVYA 4PCIA 3AADA 3MQMA 5HFRA 3P1DA 4Q0NA 4TYLA 5CUGA 5DKDA 3UW9A 5K29A 4NR9A 5AD2A 4YY6A 5I7YA 5EV9A 3MULA 3RCWA 4OUFA 2R0YA 4YYIA 4QNSA 4A9KA 4HBYA 4YBMA 4Z1SA 4UITA 1F68A 4O70A 4BHWA 3UV2A 3LXJA 5ETDA 4YYGA 3P1CA 5LKTA 5A83A 5D3NA 2D9EA 5FFWA 5I29A 5CRZA 5IGNA 5DFBA 4YY4A 2OO1A 3HMEA 5F63A 2I8NA 4QZSA 5ENCA 4CLBA 5E3DA 2RO1A 5CU8A 4PCEA 4WHWA 4IR4A 5FE5A 5D3PA 5D3JA 5II2A 5A5SA 2LSPB 5DFDA 4QR3A 5F1HA 4QSUA 4QSPA 5EA1A 5FH8A 5E9VA 4NR4A 4UYGA 2DVRA 5HJCA 5G4SA 2R0VA 3LQHA 4O76A 4UYEA 3O35A 5KTUA 4F3IA 5E9LA 5AD3A 3ZYUA 4OGIA 4QYDA 5ACYA 4A9OA 5CQ3A 2DVSA 4LDFA 5CPEA 4TQNA 4BW4A 5HQ6A 4PKLA 4QR4A 5I1QA 5JWMA 5HENA 5LVQA 3FKMX 5CUBA 4YADA 5FG4A 5A5NA 5FE0A 5I40A 3MUKA 5DYCA 4O71A 3U5NA 5E9KA 5F1LA 4PS5A 5EWDA 5KTXA 5HEMA 4KV1A 4NR7A 4QSXA 5LKXA 5A5OA 5FFVA 3P1EA 4XY9A 4YAXA 5L8UA 5ENFA 5EQ1A 1JSPB 4QY4A 5CTLA 3U5OA 3DAIA 5FE4A 4CFKA 4Z6HA 5AMEA 3QZVA 4QC3A 5EWVA 4Z6IA 5D3HA 4A9EA 3D7CA 5ENIA 4WHUA 5CY9A 1EQFA 4CUSA 4YYKA 2YEKA 4MR4A 4ZQLA 5EGUA 3GG3A 2F6NA 4LYWA 5DLXA 5BT3A 4MEOA 4A9HA 4QSVA 4FLPA 4CFLA 4NYXA 4TT2A 4YYHA 5DKCA 5D26A 4YABA 2DKWA 5L8TA 4DONA 5A82A 5LJ2A 5I88A 5D3LA 5BT5A 2YEMA 4HBXA 4KV4A 5L96A 3I3JA 2E7NA 3TLPA 5C7NA 4UYFB 2E7OA 5CQAA 2F6JA 5F62A 4MEQA 5FG5A 3QZSA 5EVAA 5FE7A 4J0RA 4YATA 4BW1A 3O37A 3Q2FA 5DX4A 4YC9A 4O72A 4TT4A 5JI8A 4LYIA 3U5PA 5LJ1A 3JVLA 5F2PA 5EWWA 5F36A 5D3TA 5DW1A 5ENEA 5E9MA 2D82A 4NQNA 5F25A 5C8GA 5KU3A 4LZSA 4NR6A 5E73A 5FE8A 3JVJA 5CQ6A 3P1FA 4UYFA 5AMFA 5FBXA 4QUUA 5D0CA 4MR5A 5H1TA 4MR3A 4NUEA 4GPJA 5CUCA 5HCLA 5H1UA 4HXLA 5D25A 4QB3A 4N4FA 4NR8A 5ENJA 2MJVB 4QUTA 3UV5A 5HM0A 4NQMA 4QBMA 2L5EA 3SVFA 5HRWA 4UIUA 3MXFA 3O34A 5DLZA 4BW3A 5CUEA 4XUAA 4O7EA 4QEVA 4QYLA 4NS5A 2RI7A 4NXJA 4OGJA 5CQ4A 5CZGA 4HXNA 2YELA 4UYDA 4NYVA 5L98A 2DWWA 5HRXA 3ONIA 5EICA 4NUDA 5FH6A 5II1A 3UVWA 4A9IA 4IORA 2R0SA 2NXBA 4TTEA 4HXSA 3U5JA 5CFWA 5F61A 4QSQA 5LKZA 4A9NA 4J3IA 5E3GA 5CUDA 5LVRA 3S91A 5FG6A 4NYWA 3G0JA 1WUMA 3UVDA 5DYXA 5J0DA 4CUTA 5LJ0A 5DW2A 4HBVA 2RNXA 4YH3A 4BW2A 4A9MA 5TCMA 3HMHA 4LYSA 4QSSA 4E96A 5HQ7A 5FB0A 5EWHA 4IOQA 2R10A 5A5QA 4A9FA 4PY6A 2L84A 4HXOA 4TT6A 2DVQA 4CURA 4UYHA 5H85A 4IR3A 4QR5A 5CQ8A 5HRVA 5I83A 4MENA 4YYNA 5CQ5A 5DYUA 4XY8A 5A5PA 4CUPA 4PTBA 2RNYA 1E6IA 5E74A 4YH4A 3P5OA 3JVMA 5EPRA 3U5KA 2G4AA 3DWYA 1WUGA 5A85A 4UIWA 5EU1A 3LQIA 4N4IA 5CP5A 4YK0A 4LC2A 4UIZA 4O7BA 3U5LA 4NR5A 4UIVA 5DKHA 4QSTA 3QZTA 3LJWA 4A9LA 4MEPA 4LR6A 4O75A 3JVKA 4Z1QA 5E7DA 2FSAA 4YYJA 5ENBA 5LUUA 5C4QA 4N4HA 1N72A 4QSRA 5DYAA 3K2JA 5ENHA 5EPBA 4TU6A 2GRCA 2E3KA 4C66A 4BJXA 4QC1A 3AQAA 4IR6A 5IGMA 4J1PA 4LZ2A 2YYNA 4MR6A 4YYDA 5CUAA 5H1VA 4IR5A 5E0RA 4RVRA 5FE2A 2DVVA 5C85A 2KTBB 5D3RA 2YW5A 5DFCA 5KHMA 5D3SA 5IGKA 5D24A 4A9JA 5HLSA 4IOOA 5EI4A 4N3WA 4ZC9A 5CS8A 2L85A 3NXBA 5TB6A 4UIYA 4CUQA 4KCXA 5FE3A 4TU4A 4X2IA 5EM3A 4NRBA 4XYAA 4O7AA 5EISA 2I7KA 5FE6A 4WIVA 5FH7A 5KTWA 5CQ7A 4Z93A 4AKNA 1ZS5A 4LRGA 5CRMA 5HQ5A 5I7XA 5D7XA 4N4GA 3UV4A 3Q2EA 5IGLA 5F5ZA 1X0JA 4Y03A 4ZW1A 5FE9A 5C89A 3MB4A 3S92A 2YQDA 4HXMA 2RS9B 5ENGA 3MB3A 2OSSA 3U5MA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3UVXA 4O7CA 5COIA 4YBTA 5I86A 4HXKA 5DY7A 5FDZA 3HMFA 2YDWA 4YBSA 4CL9A 5I80A 3D1DA 5A81A 5EP7A 4O77A 5F60A 4LZRA 4TZ8A 3IU6A 5CGPA 4HXRA 3O36A 5HFQA 4O74A 5E9IA 5A7CA 5IIDA 4O78A 3O33A 5L97A 4O7FA 4TS8A 4NRCA 4J0SA 2RFJA 4ALHA 1JM4B 2WP1A 2RNWA 4HBWA 5HELA 2OUOA 5IBNA 4XUBA 5KO4A 4NUCA 4Q0OA 5FE1A 5G4RA 2N9GA 4AKHA 4CUUA 4YYMA 5A5RA 5FB1A 4NRAA 5EWCA 3SVGA 5F3AA 3SVHA 4HXPA 5CQTA 4QEWA 5L99A 4UIXA 5EPSA 4QSWA 5FFYA 4QEUA 5BT4A 3IU5A 3LQJA 2DATA 5IG6A 5EK9A 5E9YA 5LKUA 5I89A 4ALGA 3G0LA 4TZ2A 5ETBA 2H60A 5C87A 2WP2A 5DBMA 4C67A 3UVYA 4PCIA 3ERRA 3AADA 3MQMA 5HFRA 3P1DA 4Q0NA 4TYLA 5CUGA 5DKDA 3UW9A 5K29A 4NR9A 5AD2A 4YY6A 5I7YA 5EV9A 3MULA 3RCWA 4OUFA 2R0YA 4YYIA 4QNSA 4A9KA 4HBYA 4YBMA 4Z1SA 4UITA 1F68A 4O70A 4BHWA 3UV2A 3LXJA 5ETDA 4YYGA 3P1CA 5LKTA 5A83A 5D3NA 2D9EA 5FFWA 5I29A 5CRZA 5IGNA 5DFBA 4YY4A 2OO1A 3HMEA 5F63A 2I8NA 4QZSA 5ENCA 4CLBA 5E3DA 2RO1A 5CU8A 4PCEA 4WHWA 4IR4A 5FE5A 5D3PA 5D3JA 5II2A 5A5SA 2LSPB 5DFDA 4QR3A 5F1HA 4QSUA 4QSPA 5EA1A 5FH8A 5E9VA 4NR4A 4UYGA 2DVRA 5HJCA 5G4SA 2R0VA 3LQHA 4O76A 4UYEA 3O35A 5KTUA 4F3IA 5E9LA 5AD3A 3ZYUA 4OGIA 4QYDA 5ACYA 4A9OA 5CQ3A 2DVSA 4LDFA 5CPEA 4TQNA 4BW4A 5HQ6A 4PKLA 4QR4A 5I1QA 5JWMA 5HENA 5LVQA 3FKMX 5CUBA 4YADA 5FG4A 5A5NA 5FE0A 5I40A 3MUKA 5DYCA 4O71A 3U5NA 5E9KA 5F1LA 4PS5A 5EWDA 5KTXA 5HEMA 4KV1A 4NR7A 4QSXA 5LKXA 5A5OA 5FFVA 3P1EA 4XY9A 4YAXA 5L8UA 5ENFA 5EQ1A 1JSPB 4QY4A 5CTLA 3U5OA 3DAIA 5FE4A 4CFKA 4Z6HA 5AMEA 3QZVA 4QC3A 5EWVA 4Z6IA 5D3HA 4A9EA 3D7CA 5ENIA 4WHUA 5CY9A 1EQFA 4CUSA 4YYKA 2YEKA 4MR4A 4ZQLA 5EGUA 3GG3A 2F6NA 4LYWA 5DLXA 5BT3A 4AKGA 4MEOA 4A9HA 4QSVA 4FLPA 4CFLA 4NYXA 4TT2A 4YYHA 5DKCA 5D26A 4AI6A 4YABA 2DKWA 5L8TA 4DONA 5A82A 5LJ2A 5I88A 2EJNA 5D3LA 5BT5A 2YEMA 4HBXA 4KV4A 5L96A 3I3JA 2E7NA 3TLPA 5C7NA 4UYFB 2E7OA 5CQAA 2F6JA 5F62A 4MEQA 5FG5A 3QZSA 5EVAA 5FE7A 4J0RA 4YATA 4BW1A 3O37A 3Q2FA 5DX4A 4YC9A 4O72A 4TT4A 5JI8A 4LYIA 3U5PA 5LJ1A 1PUOA 3JVLA 5F2PA 5EWWA 5F36A 5D3TA 5DW1A 3D1BA 5E9MA 5ENEA 1ZKRA 2D82A 4NQNA 5F25A 5C8GA 3VKGA 5KU3A 4LZSA 4NR6A 5E73A 5FE8A 3JVJA 5CQ6A 3P1FA 4UYFA 5AMFA 5FBXA 4QUUA 5D0CA 4MR5A 5H1TA 4MR3A 4NUEA 4GPJA 5CUCA 5HCLA 5H1UA 4HXLA 5D25A 4QB3A 4N4FA 4NR8A 5ENJA 2MJVB 4QUTA 3UV5A 5HM0A 4NQMA 4QBMA 2L5EA 3SVFA 5HRWA 4UIUA 3MXFA 3O34A 5DLZA 4BW3A 5CUEA 4XUAA 4O7EA 4QEVA 4QYLA 4NS5A 2RI7A 4NXJA 4OGJA 5CQ4A 5CZGA 4HXNA 2YELA 4UYDA 4NYVA 5L98A 2DWWA 5HRXA 3ONIA 5EICA 4NUDA 5FH6A 5II1A 3UVWA 4A9IA 4IORA 2R0SA 2NXBA 4TTEA 4HXSA 3U5JA 5CFWA 5F61A 4QSQA 5LKZA 4A9NA 4J3IA 5E3GA 5CUDA 5LVRA 3S91A 5FG6A 4NYWA 3G0JA 1WUMA 3UVDA 5DYXA 5J0DA 4CUTA 5LJ0A 5DW2A 4HBVA 2RNXA 4YH3A 4BW2A 4A9MA 5TCMA 3HMHA 4LYSA 4QSSA 4E96A 5HQ7A 5FB0A 5EWHA 4IOQA 2R10A 5A5QA 4A9FA 4PY6A 2L84A 4HXOA 4TT6A 2DVQA 4CURA 4UYHA 5H85A 4IR3A 4QR5A 5CQ8A 5HRVA 5I83A 4MENA 4YYNA 5CQ5A 5DYUA 4XY8A 5A5PA 4CUPA 4PTBA 2RNYA 1E6IA 5E74A 4YH4A 3P5OA 3JVMA 5EPRA 3U5KA 2G4AA 3DWYA 1WUGA 5A85A 4UIWA 5EU1A 3LQIA 4N4IA 5CP5A 4YK0A 4LC2A 4UIZA 4O7BA 3U5LA 4NR5A 4UIVA 5DKHA 4QSTA 3QZTA 3LJWA 4A9LA 4MEPA 4LR6A 4O75A 3JVKA 4Z1QA 5E7DA 2FSAA 4YYJA 5ENBA 5LUUA 5C4QA 4N4HA 1N72A 4QSRA 5DYAA 3K2JA 5ENHA 5EPBA 4TU6A 2GRCA 2E3KA 4C66A 4BJXA 4QC1A 3AQAA 4IR6A 5IGMA 4J1PA 4LZ2A 2YYNA 4MR6A 4YYDA 5CUAA 5H1VA 4IR5A 5E0RA 4RVRA 5FE2A 4AKIA 2DVVA 5C85A 2KTBB 5D3RA 2YW5A 5DFCA 5KHMA 5D3SA 5IGKA 5D24A 4A9JA 5HLSA 4IOOA 5EI4A 4N3WA 4ZC9A 5CS8A 2L85A 3NXBA 5TB6A 4UIYA 4CUQA 4KCXA 5FE3A 4TU4A 4X2IA 5EM3A 4NRBA 4XYAA 4O7AA 5EISA 2I7KA 5FE6A 4WIVA 5FH7A 5KTWA 3VKHA 5CQ7A 4Z93A 4AKNA 1ZS5A 4LRGA 5CRMA 5HQ5A 5I7XA 5D7XA 4N4GA 3UV4A 3Q2EA 5IGLA 5F5ZA 1X0JA 4Y03A 4ZW1A 5FE9A 5C89A 3MB4A 3S92A 2YQDA 4HXMA 2RS9B 5ENGA 3MB3A 2OSSA 3U5MA
chains in the Genus database with same CATH topology
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