4CLBA

N-terminal bromodomain of human brd4 with ibet-295
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Structure Based Design of Dual Hdac/Bet Inhibitors as Novel Epigenetic Probes.
doi rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
molecule tags Transcription
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4clbA01
5CS8A 5CUDA 4MR5A 4HXPA 5D24A 5FE5A 3QZSA 5DW1A 5DW2A 2E3KA 4GPJA 3QZTA 4PKLA 4O74A 3G0JA 5EWVA 5FH7A 4J3IA 5DFBA 4NUCA 4A9IA 4IOOA 3UVWA 3JVMA 4QEWA 2MJVB 5D7XA 4TT6A 4BHWA 3SVGA 5CPEA 5I40A 4ZC9A 5E9KA 5HRXA 2OO1A 5C87A 4XY9A 4LYSA 5EK9A 2L84A 4TU6A 4UYFA 3UVDA 3UV4A 5I7YA 5D3NA 4Z1SA 5CGPA 5BT5A 5D0CA 4TZ2A 5HQ7A 3O37A 4MR4A 5DKDA 5EA1A 5F3AA 5E3GA 5FE2A 2YEKA 5DYXA 3MB4A 4J0RA 4RVRA 4QSQA 3LQIA 4CFLA 3SVHA 4Q0NA 5DFCA 5F1LA 5L99A 4NYXA 5DLZA 2RNYA 4QUTA 2YEMA 1WUMA 5EWHA 1ZS5A 5CFWA 4UYEA 4NQNA 4TYLA 5C4QA 5EWDA 4A9EA 5A5NA 4CUUA 5AMEA 5D3RA 5LJ2A 2DATA 4UYGA 3O36A 5I7XA 5KU3A 4NYWA 2YQDA 4NUEA 5CQAA 4FLPA 5HQ6A 3P1FA 4C66A 5CQ4A 2WP1A 2H60A 3QZVA 5A82A 2LSPB 4NR4A 5FE9A 4HBXA 4UIZA 3LQJA 2N9GA 5D3LA 5LJ0A 5IGKA 5FG4A 3JVJA 5C7NA 5HRWA 3S92A 1X0JA 4Q0OA 5HM0A 4LDFA 5CTLA 5ENGA 4MR3A 5CQTA 4XUAA 4O7AA 3DWYA 4PY6A 2GRCA 5F5ZA 5J0DA 4NR7A 4IR4A 3HMEA 4CUTA 5I89A 5A5SA 4NQMA 3U5LA 4MEQA 4CL9A 4J0SA 2L5EA 5ENIA 5HRVA 4BW4A 3ONIA 4HXKA 4NS5A 4LRGA 3LJWA 5FH6A 5LKZA 1N72A 4O76A 4HBYA 4A9HA 4UYFB 5COIA 4YYDA 5L96A 5I86A 5EWWA 5KTXA 5LVRA 5HJCA 2G4AA 3O35A 4A9OA 5ENBA 5CU8A 5D25A 4Z93A 4YBSA 4OGIA 5I1QA 5LKUA 4O78A 1WUGA 4OGJA 4A9KA 5CY9A 2F6NA 5ETBA 4A9MA 4HXRA 2I8NA 5FG6A 5DFDA 4YYJA 5H85A 2NXBA 1F68A 5CQ7A 2D9EA 4N4IA 5L97A 4ALHA 5FE7A 4YY4A 5FE6A 2I7KA 5E9LA 5C85A 5K29A 4NUDA 4BW2A 5CP5A 4QR4A 5F1HA 5LJ1A 4ALGA 4LR6A 4N4HA 4YYMA 5L8UA 4MEPA 5FFWA 3U5OA 4YABA 5E3DA 4QY4A 3UV5A 5DBMA 3HMFA 3FKMX 1JSPB 5EM3A 2D82A 5I88A 4QSVA 3U5PA 3IU5A 5EGUA 5IGNA 4YC9A 3RCWA 5FBXA 2DKWA 4YAXA 3UVYA 4CURA 5CRMA 3UVXA 4O75A 4IR6A 4TQNA 5H1TA 5EPRA 4YYGA 4UYDA 4YK0A 4BW3A 5G4SA 2DVQA 2YYNA 5CUCA 5A5OA 4LZSA 5LKXA 4PS5A 4XYAA 5DY7A 2RS9B 5II2A 5IGMA 5C8GA 5AD3A 3U5NA 4LZRA 4QC1A 3MQMA 4NR6A 5E9IA 4HXOA 4QEVA 1JM4B 5D3HA 3U5MA 2R0SA 4DONA 5ENHA 4QUUA 3O34A 4QEUA 4QC3A 3MUKA 4NXJA 2RNXA 4UIYA 3P1DA 4A9FA 4N4GA 3P1CA 5L8TA 4PTBA 4O7FA 4IOQA 2RFJA 5EV9A 4N3WA 4LZ2A 5FE1A 5HEMA 5FFYA 5I80A 5HQ5A 5IIDA 5EU1A 5F25A 5C89A 1E6IA 5EP7A 2DVSA 5KTUA 5IGLA 4O72A 3D7CA 4AKNA 4OUFA 5HCLA 5FB1A 3U5JA 5EICA 4YBTA 2YW5A 5F61A 4XY8A 3MXFA 2YELA 4NR5A 4CFKA 5CUBA 5D3JA 5EVAA 5DKHA 4CUPA 3S91A 4QNSA 3IU6A 3JVKA 4UIXA 2RO1A 4WHWA 5E9MA 2FSAA 5HENA 3JVLA 5E9YA 4TTEA 4KCXA 4YYKA 4QYLA 4UIUA 3P1EA 5KTWA 4Z6HA 5D3PA 4IR5A 5E74A 4UIVA 4CUSA 5BT4A 2R0VA 5LKTA 4E96A 5CQ5A 4YH4A 3LXJA 3GG3A 5F62A 4QSTA 4QSWA 5JWMA 4A9LA 2YDWA 3MB3A 4BW1A 4LYWA 3TLPA 2WP2A 5HFRA 4PCIA 5ENJA 5E73A 1EQFA 5CUAA 4IORA 5FH8A 4HBVA 5DX4A 5A5QA 5FDZA 3ZYUA 4WIVA 5LVQA 5HELA 4YATA 3DAIA 5AMFA 4A9NA 4ZQLA 5FFVA 5FB0A 4QR5A 4TZ8A 4YBMA 4NRCA 5HLSA 2F6JA 4CUQA 4O7EA 4C67A 3AADA 4NR8A 4MEOA 4O70A 4NR9A 5JI8A 4QSXA 5CUEA 3UV2A 5AD2A 5ACYA 4NRAA 3O33A 5FE3A 3P5OA 4ZW1A 3HMHA 4QSSA 5E0RA 5EQ1A 5TB6A 5CQ8A 5A81A 5G4RA 3SVFA 4UYHA 5DYCA 5E9VA 2OSSA 4QSPA 5FE8A 2DVRA 4YYIA 5CUGA 5HFQA 5D3TA 2L85A 5ETDA 5ENEA 3AQAA 4O77A 4LYIA 2DVVA 5FG5A 5H1VA 5I29A 5A5RA 2KTBB 4YYNA 5DYUA 5EISA 4TT2A 2RNWA 5A85A 5CZGA 4MENA 4YADA 3NXBA 5F2PA 4QYDA 2R10A 4HXNA 5DKCA 4QR3A 2R0YA 4Z1QA 4NRBA 5E7DA 4QSUA 4XUBA 4YH3A 5A5PA 5H1UA 3UW9A 4Z6IA 5I83A 2OUOA 4IR3A 5F63A 3G0LA 2DWWA 5DLXA 4HXSA 4O71A 5F36A 4PCEA 5CRZA 4A9JA 3I3JA 5A7CA 2E7NA 4NYVA 4F3IA 5EPBA 3K2JA 5EPSA 5F60A 4TS8A 4Y03A 2E7OA 4UITA 4X2IA 2RI7A 3MULA 5II1A 4KV4A 4J1PA 4WHUA 4UIWA 5D26A 4O7BA 4YYHA 5BT3A 4MR6A 5KHMA 3Q2FA 5DYAA 5IBNA 4KV1A 4QZSA 4QB3A 4HXMA 5FE4A 5A83A 5TCMA 5EI4A 5ENCA 4BJXA 4QBMA 5ENFA 5IG6A 5CQ6A 4TU4A 3LQHA 4TT4A 5L98A 5EWCA 4O7CA 3Q2EA 4N4FA 4QSRA 4LC2A 3U5KA 4HXLA 5CQ3A 5FE0A 5LUUA 4CLBA 5KO4A 4YY6A 5D3SA 4HBWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5CS8A 5CUDA 4MR5A 4HXPA 5D24A 5FE5A 3QZSA 5DW1A 5DW2A 2E3KA 4GPJA 3QZTA 4PKLA 4O74A 3G0JA 5EWVA 5FH7A 4J3IA 5DFBA 4NUCA 4A9IA 4IOOA 3UVWA 3JVMA 4QEWA 2MJVB 5D7XA 4TT6A 4BHWA 3SVGA 5CPEA 5I40A 4ZC9A 5E9KA 5HRXA 2OO1A 5C87A 4XY9A 4LYSA 5EK9A 2L84A 4TU6A 4UYFA 3UVDA 3UV4A 5I7YA 5D3NA 4Z1SA 5CGPA 5BT5A 5D0CA 4TZ2A 5HQ7A 3O37A 4MR4A 5DKDA 5EA1A 5F3AA 5E3GA 5FE2A 2YEKA 5DYXA 3MB4A 4J0RA 4RVRA 4QSQA 3LQIA 4CFLA 3SVHA 4Q0NA 5DFCA 5F1LA 5L99A 4NYXA 5DLZA 2RNYA 4QUTA 2YEMA 1WUMA 5EWHA 1ZS5A 5CFWA 4UYEA 4NQNA 4TYLA 3D1BA 5C4QA 5EWDA 4A9EA 5A5NA 4CUUA 5AMEA 5D3RA 5LJ2A 2DATA 4UYGA 3O36A 5I7XA 5KU3A 4NYWA 2YQDA 4NUEA 5CQAA 4FLPA 5HQ6A 3P1FA 4C66A 5CQ4A 2WP1A 2H60A 4AKIA 3QZVA 3VKGA 5A82A 2LSPB 4NR4A 5FE9A 4HBXA 4UIZA 3LQJA 2N9GA 5D3LA 5LJ0A 5IGKA 5FG4A 3JVJA 5C7NA 5HRWA 3S92A 1X0JA 4Q0OA 5HM0A 4LDFA 5CTLA 5ENGA 4MR3A 5CQTA 4XUAA 4O7AA 3DWYA 4PY6A 2GRCA 5F5ZA 5J0DA 4NR7A 4IR4A 3HMEA 4CUTA 5I89A 5A5SA 4NQMA 3U5LA 4MEQA 4CL9A 4J0SA 2L5EA 5ENIA 5HRVA 4BW4A 3ONIA 4HXKA 4NS5A 4LRGA 3LJWA 5FH6A 5LKZA 1N72A 4O76A 4HBYA 4A9HA 4UYFB 5COIA 4YYDA 5L96A 5I86A 5EWWA 5KTXA 5LVRA 5HJCA 2G4AA 3O35A 4A9OA 5ENBA 5CU8A 5D25A 4Z93A 4YBSA 4OGIA 5I1QA 5LKUA 4O78A 1WUGA 4OGJA 4A9KA 5CY9A 2F6NA 5ETBA 4A9MA 4HXRA 2I8NA 5FG6A 5DFDA 4YYJA 5H85A 2NXBA 1F68A 5CQ7A 2D9EA 4N4IA 5L97A 4ALHA 5FE7A 4YY4A 5FE6A 2I7KA 5E9LA 5C85A 5K29A 4NUDA 4BW2A 5CP5A 4QR4A 5F1HA 5LJ1A 4ALGA 4LR6A 4N4HA 4YYMA 5L8UA 4MEPA 5FFWA 1ZKRA 3U5OA 4YABA 5E3DA 4QY4A 3UV5A 5DBMA 3HMFA 3FKMX 1JSPB 5EM3A 2D82A 5I88A 4QSVA 3U5PA 3IU5A 5EGUA 5IGNA 4YC9A 3RCWA 5FBXA 2DKWA 4YAXA 3UVYA 4CURA 5CRMA 3UVXA 4O75A 4IR6A 4TQNA 5H1TA 5EPRA 4YYGA 4UYDA 4YK0A 4BW3A 5G4SA 2DVQA 2YYNA 5CUCA 5A5OA 4LZSA 5LKXA 4PS5A 4XYAA 5DY7A 2RS9B 5II2A 5IGMA 5C8GA 5AD3A 3U5NA 4LZRA 4QC1A 3MQMA 4NR6A 5E9IA 4HXOA 4QEVA 1JM4B 5D3HA 3U5MA 2R0SA 4DONA 5ENHA 4QUUA 3O34A 4QEUA 4QC3A 3MUKA 4NXJA 2RNXA 4UIYA 3P1DA 4A9FA 4N4GA 3P1CA 5L8TA 4PTBA 4O7FA 4IOQA 2RFJA 5EV9A 4N3WA 4LZ2A 5FE1A 5HEMA 5FFYA 5I80A 5HQ5A 5IIDA 5EU1A 5F25A 5C89A 1E6IA 5EP7A 2DVSA 5KTUA 5IGLA 4O72A 3D7CA 4AKNA 4OUFA 5HCLA 5FB1A 3U5JA 5EICA 4YBTA 2YW5A 5F61A 4XY8A 3MXFA 2YELA 4NR5A 4CFKA 5CUBA 5D3JA 5EVAA 5DKHA 3D1DA 4CUPA 3S91A 4QNSA 3IU6A 3JVKA 4UIXA 2RO1A 4WHWA 5E9MA 2FSAA 5HENA 3JVLA 5E9YA 4TTEA 4KCXA 4YYKA 4QYLA 4UIUA 3P1EA 5KTWA 4Z6HA 5D3PA 4IR5A 5E74A 4UIVA 4CUSA 5BT4A 2R0VA 5LKTA 4E96A 5CQ5A 4YH4A 3LXJA 3GG3A 5F62A 4QSTA 4QSWA 1PUOA 4A9LA 5JWMA 2YDWA 3MB3A 4BW1A 4LYWA 3TLPA 2WP2A 5HFRA 4PCIA 5ENJA 5E73A 1EQFA 5CUAA 4IORA 5FH8A 4HBVA 5DX4A 5A5QA 5FDZA 3ZYUA 4WIVA 5LVQA 5HELA 4YATA 3DAIA 5AMFA 4A9NA 2EJNA 4ZQLA 5FFVA 5FB0A 4QR5A 4TZ8A 4YBMA 4NRCA 5HLSA 2F6JA 4CUQA 4O7EA 4C67A 3AADA 4NR8A 4MEOA 4O70A 4NR9A 5JI8A 4QSXA 5CUEA 3UV2A 5AD2A 5ACYA 4NRAA 3O33A 5FE3A 3P5OA 4ZW1A 3HMHA 4QSSA 5E0RA 5EQ1A 5TB6A 5CQ8A 5A81A 5G4RA 3SVFA 4UYHA 5DYCA 5E9VA 2OSSA 4QSPA 5FE8A 2DVRA 4YYIA 5CUGA 5HFQA 5D3TA 3VKHA 2L85A 5ETDA 4AKHA 5ENEA 3AQAA 4O77A 4LYIA 2DVVA 5FG5A 5H1VA 5I29A 5A5RA 2KTBB 4YYNA 5DYUA 5EISA 4TT2A 2RNWA 5A85A 5CZGA 4MENA 4YADA 3NXBA 5F2PA 4QYDA 2R10A 4HXNA 5DKCA 4QR3A 2R0YA 4Z1QA 4NRBA 5E7DA 4QSUA 4XUBA 4YH3A 5A5PA 5H1UA 3UW9A 4Z6IA 5I83A 2OUOA 4IR3A 5F63A 3G0LA 2DWWA 5DLXA 4HXSA 4O71A 5F36A 4PCEA 5CRZA 4A9JA 3I3JA 5A7CA 2E7NA 4NYVA 4F3IA 5EPBA 3K2JA 5EPSA 5F60A 4TS8A 4Y03A 2E7OA 4UITA 4X2IA 2RI7A 3MULA 5II1A 4KV4A 4J1PA 4WHUA 4UIWA 5D26A 4O7BA 4YYHA 5BT3A 4MR6A 3ERRA 3Q2FA 5DYAA 5IBNA 4KV1A 5KHMA 4QZSA 4QB3A 4HXMA 5FE4A 5A83A 5TCMA 5EI4A 5ENCA 4BJXA 4QBMA 5ENFA 5IG6A 5CQ6A 4AKGA 4TU4A 3LQHA 4TT4A 5L98A 5EWCA 4O7CA 3Q2EA 4N4FA 4QSRA 4LC2A 3U5KA 4HXLA 5CQ3A 5FE0A 5LUUA 4CLBA 5KO4A 4AI6A 4YY6A 5D3SA 4HBWA
chains in the Genus database with same CATH topology
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