4CLBA

N-terminal bromodomain of human brd4 with ibet-295
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transcription
molecule keywords BROMODOMAIN-CONTAINING PROTEIN 4
publication title The Structure Based Design of Dual Hdac/Bet Inhibitors as Novel Epigenetic Probes.
doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 42
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-01-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4clbA01
4HBXA 2NXBA 4MR3A 5A82A 5DKCA 5DLXA 5A5OA 5ENBA 2DVRA 4A9IA 5C87A 4OUFA 4UIVA 5AMEA 4GPJA 5HCLA 5I1QA 3ONIA 5E9LA 5FE4A 2YYNA 5A83A 4OGJA 5EPSA 3MULA 3DWYA 1WUGA 5HQ6A 4QEVA 4YATA 4BW1A 4LR6A 5D7XA 5L96A 5HRXA 5HRWA 3HMEA 5D3TA 5F63A 5CS8A 4QSUA 2R0VA 3Q2EA 4A9FA 2GRCA 5E9IA 4F3IA 5LVRA 2I7KA 4NR7A 4YBTA 5CQAA 5TB6A 5DYAA 4Z6HA 5TCMA 1ZS5A 2G4AA 3IU5A 5DYUA 5H1TA 4Z1SA 4YADA 5F61A 4LZ2A 4N4HA 4YYNA 5DW2A 5IGKA 5CUCA 4E96A 3U5OA 5E7DA 4LYSA 5IIDA 5G4SA 5KTWA 5CQTA 5COIA 5D26A 5HJCA 3JVJA 4O74A 4J3IA 5F1HA 4O70A 5KU3A 5CQ6A 5A5RA 5L98A 5AD3A 3JVLA 5BT4A 4CL9A 4WIVA 4QSTA 5JWMA 5ENJA 4TTEA 3P1FA 4O71A 5A85A 4UIZA 2FSAA 5IG6A 3AADA 5HFRA 5LKUA 4LYIA 1WUMA 2OUOA 4HXRA 4TT2A 5CFWA 4N4FA 2KTBB 4LDFA 5KTXA 5I29A 4A9JA 3UV4A 3UVWA 4DONA 4IOOA 4A9NA 5J0DA 5FE8A 5F2PA 4TZ2A 2RI7A 4CFLA 4LZSA 4NR9A 5I7YA 4HBYA 2OO1A 4UITA 3O33A 3FKMX 4LC2A 4PY6A 5DW1A 4NYVA 4QYDA 5CQ5A 4O7EA 2DVQA 3QZVA 2DKWA 4IR4A 4NQMA 4QR3A 4YAXA 5C8GA 3MB4A 5FH8A 2L84A 4LZRA 4Q0NA 4HXKA 5I88A 4XUBA 4NQNA 5I83A 4OGIA 2YQDA 5II2A 4QNSA 5FE1A 5FH6A 5D25A 5CUAA 4IORA 3TLPA 5L8TA 5CP5A 4YYMA 2YELA 1X0JA 4NRCA 4CUUA 5E3DA 4PCIA 5FB1A 5DX4A 5D3HA 5DBMA 3UW9A 4YYJA 4YK0A 5E73A 5DKHA 5D24A 5H1UA 5DFDA 5F3AA 4YH4A 3U5NA 4PCEA 5FB0A 3U5KA 4TS8A 4O77A 5CU8A 5D3RA 4YYDA 3Q2FA 4YBSA 4CUSA 5D3JA 5FG6A 5FE7A 4XUAA 3GG3A 4KV4A 4NUEA 5FE2A 5EPRA 5EWHA 3I3JA 4KV1A 4N3WA 4TQNA 4A9EA 5CUGA 4NRBA 2WP1A 4MEOA 5ENEA 4QC3A 4J0RA 5ENFA 5LKXA 5EVAA 5CY9A 5HENA 5CRZA 4HBWA 3RCWA 4ZC9A 4IR6A 5DKDA 5C89A 4CFKA 4UYGA 5A7CA 5II1A 5D3NA 5FFYA 4N4IA 1JSPB 5EISA 5E3GA 4O7BA 3SVHA 3QZSA 2L85A 5FFWA 5CQ4A 5LUUA 5FDZA 4C66A 5ENGA 2YW5A 4QR5A 4ALHA 4UIWA 5F5ZA 3P1EA 4CLBA 4A9KA 5A5PA 4MEQA 3U5MA 4BHWA 4UIUA 2R0YA 3LQHA 5EK9A 4HXLA 5LKTA 5E9VA 3UVXA 4QC1A 5D3SA 3U5LA 4NYWA 5E9KA 4UYEA 2RO1A 4CURA 4QB3A 5E9MA 4QSXA 5F1LA 4C67A 5HQ7A 4A9LA 4HXPA 4J1PA 5H1VA 3O35A 4QSRA 2F6NA 4NUDA 5ENCA 1EQFA 3D7CA 4UYFA 5LKZA 4KCXA 4QSVA 4NRAA 5F25A 3DAIA 4J0SA 4YYKA 3UVDA 3MB3A 5LJ0A 5CGPA 4A9HA 4HXMA 5I40A 4PS5A 4WHWA 5ENIA 5IGMA 5A5NA 3HMFA 4ALGA 5H85A 4HXOA 5CQ7A 5KTUA 3LQIA 5EPBA 5FG5A 2LSPB 4NR6A 3G0LA 4UYDA 5CTLA 4YYHA 3QZTA 5I89A 3MXFA 4QUUA 5EQ1A 4TT4A 5DYXA 5A5QA 2E7NA 4NS5A 4Z1QA 4O7FA 4Z6IA 4YY6A 5EP7A 4XY9A 5F36A 5CZGA 5DY7A 2D82A 3JVMA 3NXBA 5C85A 2DWWA 2OSSA 4A9MA 5BT3A 4YYGA 4NXJA 5KO4A 4Z93A 2D9EA 2YDWA 5D3LA 2YEKA 4NR5A 3P5OA 5EWVA 4O76A 1F68A 5F62A 5E74A 3G0JA 3U5JA 5FE3A 2DVVA 2I8NA 4ZQLA 5EV9A 4MENA 5BT5A 5EWCA 5ACYA 5LJ1A 4BJXA 5CUBA 2MJVB 5ETBA 4Q0OA 5A81A 5EM3A 3UVYA 3P1CA 3IU6A 4N4GA 2L5EA 5FE6A 4CUTA 3LQJA 2R0SA 4RVRA 5EU1A 5HM0A 4AKNA 5L97A 4QSSA 4QSPA 4QBMA 3SVGA 5FE0A 4IOQA 5JI8A 2H60A 2RS9B 5CRMA 3S91A 4UIYA 5FBXA 5I80A 5EWWA 4NYXA 3O34A 1N72A 2F6JA 4MEPA 5FFVA 3O36A 5CQ3A 4QUTA 4TT6A 4YY4A 3ZYUA 5DFBA 5ENHA 5E0RA 5K29A 5KHMA 4CUQA 2YEMA 4YBMA 5EICA 4NR4A 4QY4A 1JM4B 5EA1A 4ZW1A 4YH3A 4UYHA 4WHUA 5DYCA 5I7XA 2N9GA 4QEWA 4Y03A 3UV5A 4O75A 2R10A 5HEMA 4MR6A 3MUKA 4O72A 4QSWA 5HELA 3O37A 5HRVA 5EWDA 5HQ5A 5D0CA 3LXJA 5IGNA 5FE5A 3UV2A 5CUDA 4BW3A 2DATA 5EGUA 4LYWA 4QYLA 4QR4A 5FH7A 2E3KA 3LJWA 4NUCA 4UIXA 5D3PA 5FE9A 4MR5A 4TU4A 3K2JA 4XY8A 1E6IA 4LRGA 3P1DA 5F60A 3HMHA 4IR5A 2RFJA 4BW2A 4BW4A 5A5SA 4HBVA 4TU6A 5LJ2A 5CUEA 3JVKA 5CQ8A 5C7NA 2RNWA 5DLZA 3SVFA 4QSQA 4NR8A 5C4QA 5IBNA 5EI4A 5HFQA 4QEUA 4TYLA 4CUPA 5AMFA 5E9YA 5G4RA 4YC9A 4QZSA 5LVQA 4FLPA 4X2IA 3U5PA 4HXNA 4HXSA 4PTBA 4A9OA 5DFCA 5ETDA 4MR4A 4O78A 2WP2A 5IGLA 4IR3A 4O7CA 5I86A 4O7AA 5L99A 4XYAA 5HLSA 4TZ8A 4YYIA 5CPEA 5L8UA 3MQMA 5AD2A 3AQAA 4PKLA 2DVSA 3S92A 2E7OA 5FG4A 2RNYA 4YABA 2RNXA 4UYFB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4HBXA 2NXBA 4MR3A 5A82A 5DKCA 5DLXA 5A5OA 5ENBA 2DVRA 4A9IA 5C87A 4OUFA 4UIVA 5AMEA 4GPJA 5HCLA 5I1QA 3ONIA 5E9LA 5FE4A 2YYNA 3VKGA 5A83A 4OGJA 5EPSA 3MULA 3DWYA 1WUGA 5HQ6A 4QEVA 4YATA 4BW1A 4LR6A 5D7XA 5L96A 1PUOA 5HRXA 5HRWA 3HMEA 5D3TA 5F63A 5CS8A 4QSUA 2R0VA 3Q2EA 4A9FA 2GRCA 5E9IA 4F3IA 5LVRA 2I7KA 4NR7A 4YBTA 5CQAA 5TB6A 5DYAA 4Z6HA 5TCMA 1ZS5A 2G4AA 3IU5A 5DYUA 5H1TA 4Z1SA 4YADA 5F61A 4LZ2A 4N4HA 4YYNA 5DW2A 5IGKA 5CUCA 4E96A 3U5OA 5E7DA 4LYSA 5IIDA 5G4SA 5KTWA 5CQTA 5COIA 5D26A 3D1BA 5HJCA 3JVJA 4O74A 4J3IA 5F1HA 4O70A 5KU3A 5CQ6A 5A5RA 5L98A 5AD3A 3JVLA 5BT4A 4CL9A 4WIVA 4QSTA 5JWMA 5ENJA 4AI6A 4TTEA 3P1FA 4O71A 5A85A 4UIZA 2FSAA 5IG6A 3AADA 3ERRA 5HFRA 5LKUA 3D1DA 4LYIA 1WUMA 2OUOA 4HXRA 4TT2A 5CFWA 4N4FA 2KTBB 4LDFA 5KTXA 5I29A 4A9JA 3UV4A 3UVWA 4DONA 4IOOA 4A9NA 5J0DA 5FE8A 5F2PA 4TZ2A 2RI7A 4CFLA 4LZSA 4NR9A 5I7YA 4HBYA 2OO1A 4UITA 3O33A 3FKMX 4LC2A 4PY6A 2EJNA 5DW1A 4NYVA 4QYDA 5CQ5A 4O7EA 2DVQA 3QZVA 2DKWA 4IR4A 4NQMA 4QR3A 4YAXA 5C8GA 3MB4A 4AKIA 5FH8A 2L84A 4LZRA 4Q0NA 4HXKA 5I88A 4XUBA 4NQNA 5I83A 4OGIA 2YQDA 5II2A 4QNSA 5FE1A 5FH6A 5D25A 5CUAA 4IORA 3TLPA 5L8TA 5CP5A 4YYMA 2YELA 1X0JA 4NRCA 4CUUA 3VKHA 5E3DA 4PCIA 5FB1A 5DX4A 4AKGA 5D3HA 5DBMA 3UW9A 4YYJA 4YK0A 5E73A 5DKHA 5D24A 5H1UA 5DFDA 5F3AA 4YH4A 3U5NA 4PCEA 5FB0A 3U5KA 4TS8A 4O77A 5CU8A 5D3RA 4YYDA 3Q2FA 4YBSA 4CUSA 5D3JA 5FG6A 5FE7A 4XUAA 3GG3A 4KV4A 4NUEA 5FE2A 5EPRA 5EWHA 3I3JA 4KV1A 4N3WA 4TQNA 4A9EA 5CUGA 4NRBA 2WP1A 4MEOA 5ENEA 1ZKRA 4QC3A 4J0RA 5ENFA 5LKXA 5EVAA 5CY9A 5HENA 5CRZA 4HBWA 3RCWA 4ZC9A 4IR6A 5DKDA 5C89A 4CFKA 4UYGA 5A7CA 5II1A 5D3NA 5FFYA 4N4IA 1JSPB 5EISA 5E3GA 4O7BA 3SVHA 3QZSA 2L85A 5FFWA 5CQ4A 5LUUA 5FDZA 4C66A 5ENGA 2YW5A 4QR5A 4ALHA 4UIWA 5F5ZA 3P1EA 4CLBA 4A9KA 5A5PA 4MEQA 3U5MA 4BHWA 4UIUA 2R0YA 3LQHA 5EK9A 4HXLA 5LKTA 5E9VA 3UVXA 4QC1A 5D3SA 3U5LA 4NYWA 5E9KA 4UYEA 2RO1A 4CURA 4QB3A 5E9MA 4QSXA 5F1LA 4C67A 5HQ7A 4A9LA 4HXPA 4J1PA 5H1VA 3O35A 4QSRA 2F6NA 4NUDA 5ENCA 1EQFA 3D7CA 4UYFA 5LKZA 4KCXA 4QSVA 4NRAA 5F25A 3DAIA 4J0SA 4YYKA 3UVDA 3MB3A 5LJ0A 5CGPA 4A9HA 4HXMA 5I40A 4PS5A 4WHWA 5ENIA 5IGMA 5A5NA 3HMFA 4ALGA 5H85A 4HXOA 5CQ7A 5KTUA 3LQIA 5EPBA 5FG5A 2LSPB 4NR6A 3G0LA 4UYDA 5CTLA 4YYHA 3QZTA 5I89A 3MXFA 4QUUA 5EQ1A 4TT4A 5DYXA 5A5QA 2E7NA 4NS5A 4Z1QA 4O7FA 4Z6IA 4YY6A 5EP7A 4XY9A 5F36A 5CZGA 5DY7A 2D82A 3JVMA 3NXBA 5C85A 2DWWA 2OSSA 4A9MA 5BT3A 4YYGA 4NXJA 5KO4A 4Z93A 2D9EA 2YDWA 5D3LA 2YEKA 4NR5A 3P5OA 5EWVA 4O76A 1F68A 5F62A 5E74A 3G0JA 3U5JA 5FE3A 2DVVA 2I8NA 4ZQLA 5EV9A 4MENA 5BT5A 5EWCA 5ACYA 5LJ1A 4BJXA 5CUBA 2MJVB 5ETBA 4Q0OA 5A81A 5EM3A 3UVYA 3P1CA 3IU6A 4N4GA 2L5EA 5FE6A 4CUTA 3LQJA 2R0SA 4RVRA 5EU1A 5HM0A 4AKNA 5L97A 4QSSA 4QSPA 4QBMA 3SVGA 5FE0A 4IOQA 5JI8A 2H60A 2RS9B 5CRMA 3S91A 4UIYA 5FBXA 5I80A 5EWWA 4NYXA 3O34A 1N72A 2F6JA 4MEPA 5FFVA 3O36A 5CQ3A 4QUTA 4TT6A 4YY4A 3ZYUA 5DFBA 5ENHA 5E0RA 5K29A 5KHMA 4CUQA 2YEMA 4YBMA 5EICA 4NR4A 4QY4A 1JM4B 5EA1A 4AKHA 4ZW1A 4YH3A 4UYHA 4WHUA 5DYCA 5I7XA 2N9GA 4QEWA 4Y03A 3UV5A 4O75A 2R10A 5HEMA 4MR6A 3MUKA 4O72A 4QSWA 5HELA 3O37A 5HRVA 5EWDA 5HQ5A 5D0CA 3LXJA 5IGNA 5FE5A 3UV2A 5CUDA 4BW3A 2DATA 5EGUA 4LYWA 4QYLA 4QR4A 5FH7A 2E3KA 3LJWA 4NUCA 4UIXA 5D3PA 5FE9A 4MR5A 4TU4A 3K2JA 4XY8A 1E6IA 4LRGA 3P1DA 5F60A 3HMHA 4IR5A 2RFJA 4BW2A 4BW4A 5A5SA 4HBVA 4TU6A 5LJ2A 5CUEA 3JVKA 5CQ8A 5C7NA 2RNWA 5DLZA 3SVFA 4QSQA 4NR8A 5C4QA 5IBNA 5EI4A 5HFQA 4QEUA 4TYLA 4CUPA 5AMFA 5E9YA 5G4RA 4YC9A 4QZSA 5LVQA 4FLPA 4X2IA 3U5PA 4HXNA 4HXSA 4PTBA 4A9OA 5DFCA 5ETDA 4MR4A 4O78A 2WP2A 5IGLA 4IR3A 4O7CA 5I86A 4O7AA 5L99A 4XYAA 5HLSA 4TZ8A 4YYIA 5CPEA 5L8UA 3MQMA 5AD2A 3AQAA 4PKLA 2DVSA 3S92A 2E7OA 5FG4A 2RNYA 4YABA 2RNXA 4UYFB
chains in the Genus database with same CATH topology
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