4CNOA

Structure of the salmonella typhi type i dehydroquinase inhibited by a 3-dehydroquinic acid derivative
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
251
structure length
247
Chain Sequence
KTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVLRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Insights into substrate binding and catalysis in bacterial type I dehydroquinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE
molecule tags Lyase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhi
total genus 92
structure length 247
sequence length 251
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 2014-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4cnoA00
3QRHA 4LNYA 1XDLA 2GVJA 2CZEA 2GPTA 4FNUA 3CEPA 3GIYA 1P1XA 4NX0A 2YW3A 1K7XA 1XBZA 4UNLA 2Y88A 4X22A 4MYXA 2Y89A 3NG3A 1QO2A 1LLZA 4ZVJA 1GWJA 3WJXA 3MWAA 5DCEA 1OX4B 3N2MA 4BI5A 3KFTA 3LRKA 4LUJA 7TIMA 5AHIA 2CLKA 3LBMA 1ZCOA 3UD6A 4PC8A 3KRSA 5CZTA 1ME7A 3NO5A 4XKYB 2JK2A 1J5TA 4FNPA 1OK6A 2ISSA 3RMJA 1F05A 1XBYA 3SW6A 3HBLA 3GZ3A 4N02A 2E1DA 4LVDA 2VEIA 4O19A 2C18A 4N4PA 2NWRA 3G0SA 3F03K 4HNUA 4PODA 3SGZA 1OFQA 2WSQA 4O57A 3W88A 1W5NA 3FKKA 4WQ6A 4LC6A 1HG3A 5U4NA 1H1ZA 1SZFA 3IGUA 3NQCA 5DBTA 4MZ1A 3UXAA 1K7EA 4ZMGA 1LZOA 3CIXA 2FPTA 3LHWA 4NZFA 3KVMA 2DP3A 3CPRA 4K38A 1OF6A 1ZFJA 3RU6A 3MI3A 3PM6A 4M6VA 3B06A 4MY9A 4E2BA 3KVKA 1IGSA 1YDNA 4CNPA 5LGZA 3S9YA 2R94A 1OX5A 2C0AA 3IEBA 1RVGA 3W9ZA 2WV8A 1AW2A 4WY0F 1EX5A 3W7LA 3PBVA 4ZQPA 5G1TA 1GVQA 4UFJA 3GKFA 3WFAA 3W1UA 3UWYA 5FEPA 2H8XA 2E6AA 3FIGA 3FEMA 3E96A 1TRDA 4OV4A 1JR1A 2J27A 4IMEA 2YW4A 3PUDA 1KM3A 3OA3A 2YR1A 3BLIA 4QAIA 3T55A 4IOTA 1TMHA 2QAFA 4L4MA 5KTLA 3FJLA 3LCXA 3M43A 3W2KA 1ZAIA 4ALDA 4XQ6A 1EB3A 3G1XA 2Z1BA 1KTNA 4N6FA 3FFSA 5BW6A 1YDOA 2FIQA 4K8EA 3NEVA 2YDAA 3UWWA 1KM5A 3NM1A 3P74A 1K7FA 1RQEA 1LORA 5EL1A 3B0UX 4RZ5A 3P8JA 4JY9A 2Y7FA 3VCRA 3ZFHA 2Y7EA 3FJ6A 3I7QA 4JX4A 3T40A 3W7GA 5BNKA 2OT1A 5LNRA 1XXXA 2HS6A 1TPFA 1U83A 2QCHA 4XTIA 1L2UA 1TCDA 2G97A 5AYXA 4KFNA 1F6PA 4WXYA 1KFLA 3LB0A 1LRNA 5LZLA 3QSTA 2WSRA 2E77A 1JJKA 1SPQA 5G1YA 5DCBA 1G6CA 4O1AA 1RR2A 4MLJA 1X8FA 3IIVA 2VFHA 4FO4A 1R30A 1JCYA 2G96A 1TPEA 3BO9A 4HHPA 3PAJA 4Z1CA 4YL2A 3NPUA 5AN7A 1GG1A 1Q6QA 5HR6A 2V5LA 1PL9A 2YPIA 3DH7A 1OFEA 1TTIA 3W1LA 1KLZA 1LCOA 1TV5A 3G1SA 3LCWA 5G2HA 1AMKA 5LHEA 4K37A 3L0GA 4ADSA 5TIMA 5CZ0A 1RQHA 1AL8A 4K39A 1L9WA 2Y70A 1R46A 4UFKA 1UB3A 1FWSA 3T78A 3W1XA 1KBJA 5D33A 3W07A 5SWUA 2YGYA 5G2IA 2P10A 2ISWA 1Z48A 2A5HA 5CPMA 3TQ0A 5HUPA 4OV9A 4RK8A 1QWGA 3E12A 2QJIA 4LRSA 4BK9A 2ZRVA 1A50A 2E09A 3UWZA 3M9YA 5J5RA 3OVPA 1H7NA 4RV8A 3EB2A 4CQ8A 2R8WA 4WUIA 5I3HA 2E6YA 1FDYA 3GDLA 3G18A 4JY8A 4L4LA 5KMYA 3S6DA 1YTKA 2I9EA 3UXDA 1IXNA 2VEKA 3L5LA 1ICQA 1H50A 5D2WA 3A5FA 2QR6A 3E49A 3STGA 4X9SA 1W8SA 3UWVA 5I3GA 1EUAA 4X3ZA 3HPSA 2ZRZA 5AC8A 3W2JA 1JUEA 4DF2A 4OU1A 4DXVA 5F1VA 2ZYFA 4YWIA 4PFMA 2PRLA 4POCA 2AGKA 4IJBA 4RZ6A 1VPXA 3LERA 3GNDA 3M41A 3ZWTA 2CLMA 1Z44A 2QCCA 3SECA 1G69A 3OEXA 4HT3A 4QISA 1VS1A 5TQLA 4A29A 3PWAA 3SGUA 2KZHA 2CW6A 3C52A 5DY2A 3P8IA 3C4UA 4O1BA 3CEUA 4CQAA 1GT8A 4RZ4A 3G3DA 3GYEA 4YCPA 1X6UA 2C3ZA 2OZ0A 1VYPX 3PVFA 1FY6A 4RXFA 3W86A 2XN1A 3QM3A 3BLFA 5FF4A 3HO8A 1JCNA 2VOMA 4JEQA 4ORMA 4JS3A 3R12A 4A2SA 3GKAA 4GXMA 5DBUA 3GXNA 1XDMA 4S1FA 4OWGA 5CPOA 4IMGA 1GZGA 3W72A 2QUVA 4A3UA 3B0VC 5DCDA 1W5QA 3WJZA 4AB4A 3W7CA 3G1DA 1PCWA 5EYWA 4NXKA 4IWWA 3KRUA 4BR1A 3M16A 1GYNA 3F1QA 2NX9A 1MSSA 4NQ1A 1UASA 3ELFA 4FNQA 3W83A 4O52A 1YXYA 4KWVA 4IUOA 5D02A 5DLCA 2V2DA 5K4XA 2NX3A 3CHVA 1VRDA 5EA9A 3W85A 3INPA 1W5OA 3KRZA 1H62A 3NQFA 1UUOA 3EXRA 3HB9A 3GK0A 4UTUA 1Q3NA 2WPBA 4JN6A 2CLLA 1L6WA 3TMLA 4ADTA 1JCJA 1GG0A 4UR7A 1ICSA 4FX8A 1EIXA 1VLIA 1ZALA 1GVFA 4NJGA 5L9FA 1ICPA 2EGZA 1LM1A 4CCEA 2QCFA 3O1NA 4DQWA 3LCHA 4JTUA 5AFDA 2R14A 3MYPA 4MJMA 3PG8A 3NL6A 1SW0A 5G4EA 1V5XA 2QUTA 4R53A 4Y6GA 1SW3A 1OFRA 4KWWA 1H7WA 1KM0A 3O15A 1X1ZA 5KSWA 3W7NA 5F1UA 1B4EA 3TC7A 3G1YA 1EP2A 1TPVA 3SSJA 2B7NA 3I68A 1LBFA 2CWNA 3Q58A 2YXGA 3HGOA 1LDCA 3FOKA 5DXYA 5A5WA 4IMCA 3BK0A 1XI3A 2C16A 4K7YA 3KOFA 3FLUA 4UIOA 1QCWA 3S5NA 1G4EA 3NAVA 3P84A 3GDMA 3STFA 4IXXA 2OX1A 3O07A 3SJ3A 3QQ1A 1OG0A 1B57A 3DFQA 3RFAA 4K8HA 4JTTA 3YPIA 3MI6A 3UWQA 4NNAA 1VHNA 2TPSA 1W5PA 2X16A 5I3JA 3EX6A 3G0UA 1H7OA 4IMFA 2Z6JA 5HNRA 4IPIA 2VFEA 2NUXA 4R33A 5KITA 1PCKA 1X1OA 2DZVA 1NF7A 1S5WA 3EEGA 3UZJA 1TSIA 1PVNA 3BG9A 2WNZA 3EX3A 2A7PA 2ZZ1A 4OQVA 1FWWA 3L2IA 3NPXA 3F4NA 4LVFA 1MEHA 2DZPA 1P0NA 3DAQA 3LGEA 3HGRA 4ZQNA 4AF0B 1P4CA 3DFTA 4MFDA 1JVNA 1FCVA 1XM3A 3IGXA 3EX1A 3HF3A 4Z1DA 1SO6A 3DBPA 4ZQMA 2A0NA 3P80A 1DJNA 4QNEA 4UTMA 2OCZA 4AWTA 1QO5A 1ML1A 3FYPA 3QF0A 2VC6A 2QCEA 1EWDA 1K8ZA 3TKFA 4UFMA 4U28A 3TW7A 4JX6A 1MO0A 2ISVA 4Z08A 1I45A 1Z41A 4MPQA 3QH2A 4GUJA 3N3MA 3LBCA 3N34A 3QPZA 2P1FA 4O11A 5LNUA 1Y0EA 2QJHA 5CZSA 4LT9A 1I8JA 3B8DA 1G7UA 2ZRXA 3ABOA 2B7PA 4C1KA 4BFAA 4JICA 3G0XA 3EX2A 4FF7A 1SR9A 4UC5A 5D04C 1FCUA 1HL2A 3W2NA 2Q3OA 1FXQA 2WSYA 2JKPA 2A7NA 3PUOA 4ICNA 2FFCA 1O95A 5D05A 4DEFA 3NR0A 4UTTA 1YTDA 2ZTJA 3Q2DA 3TH6A 1UBSA 2YFOA 3BW4A 3MBFA 1O4UA 3LXAA 2W0UA 1VH7A 3E0IA 4R7JA 2JBMA 2A4AA 2ZZ4A 3LCFA 2ZZ3A 4TIMA 2VEPA 1SO3A 4AEOA 3C2EA 4O28A 1F7BA 2JGYA 3UY8A 1D3HA 2DZTA 4DF1A 4O50A 5HMSA 5DY3A 2J6XA 3CT7A 3QYQA 1Q6OA 2PC4A 3W3OA 1LRTA 4EIVA 4FXSA 4AMAA 3NQVA 4LWWA 1NFBA 2DJXA 4LU0A 2GQ9A 3QW3A 4FEZA 3RLVA 2O7QA 1Q6RA 4HIBA 1TO3A 3HG2A 4NUWA 2ZA2A 4HSOA 1IIGA 4PL1A 1XFBA 5LNWA 1DVJA 1LOQA 1VJIA 1KM1A 3LLDA 1WBHA 2HMCA 3E9AA 3ANYA 2Z0IA 1YTEA 3NGJA 1BKSA 3DGRA 1B4KA 2QDHA 1LTDA 3OHIA 6TIMA 1H7RA 3C8FA 3QEZA 2WNNA 1S3HA 3N73A 3M5ZA 1R2TA 4A2RA 1PIIA 5KZMA 1W1ZA 2GJLA 5L6UA 3P81A 1CI1A 3LXCA 2VFFA 5LHFA 4Y96A 2LLEA 4RJEA 1A53A 2J9XA 3U2OA 4M6QA 3NQ7A 1TPB1 3TUUA 4FNSA 5H2ZA 3AJXA 2Y63A 4JTLA 4AAJA 2CLHA 4FX7A 1UUMA 2EAWA 3W73A 4I9AA 1THFD 5HWNA 4GC4A 2X2GA 3O6CA 3IGSA 3W7EA 3P82A 1W3TA 1UJPA 3GAYA 5HJLA 2CZDA 1YXCA 3M5YA 2ZZ2A 3PSWA 4O0KA 3H55A 3EX4A 5KZEA 5FEWA 5D09A 4Z0SA 1KFJA 1JULA 1TIMA 4S2BA 5DELA 3TQKA 1KV5A 3S5ZA 1IIHA 3N14A 3PSVA 2QF7A 3TQVA 3CWOX 3LRMA 1GJPA 4NJIA 3WK1A 3R5EA 4LY8A 2HTMA 4JNMA 5HQEA 3M0ZA 5AC7A 3EWYA 3LCGA 2WJZA 3HG4A 4G1KA 4S2CA 1MEWA 4Z1AA 3TR2A 3EWZA 2FPVA 3CIWA 3GAKA 2G95A 2W79A 3GR8A 3MW7A 3NA8A 2H90A 1KLYA 2ZA1A 3GNNA 1AG1O 3R89A 3N9SA 1SUXA 4Q4KA 1W56A 3B05A 4Y9AA 4RR4A 1GYLA 3M1ZA 2E5CA 2ZZ6A 2BTMA 2V8ZA 4K36A 1JRBA 4GRSA 1O94A 4O18A 2BX7A 1KM2A 5CZJA 2BSLA 2YYTA 3V1PA 4O16A 4UMAA 1M6JA 2C13A 1XBVA 3HPZA 3B04A 3W71A 2WOQA 1HO4A 3DI1A 3NQ2A 1DHPA 3LV5A 4M5PA 1QFEA 2OT0A 3LLFA 2B7OA 5U7SA 2BXVA 4WY0A 4N9BA 4KKXA 4RX0A 3KAOA 4E0CA 4N4QA 3R2GA 4K7VA 3W22A 3LI1A 2E5BA 3BV4A 3C2OA 4AH7A 4EF8A 3NQ8A 4WZHA 5GVJA 2EKCA 2X1UA 2CFFA 1HUVA 3GX9A 3W1MA 1R2SA 4FXRA 3WK2A 5K9CA 3I7SA 2OJPA 2O7SA 5D2VA 1SQ7A 4IMDA 1C29A 1TPH1 3PULA 1PHQA 3UPBA 4DPPA 3IIOA 1DOSA 3NL5A 4QIUA 1FDJA 1QNVA 2QCDB 4AHPA 2RDTA 1LBMA 1OVDA 1ZJIA 2VELA 2GOUA 2HS8A 2FJKA 1OFPA 3NL3A 3DXIA 3MMTA 1FUYA 1YDVA 4IGHA 1WA3A 4DBEA 2A85A 3NXFA 3ZWSA 5BRBA 3S8HA 3LV6A 5AYYA 4RKAA 3P67A 4LTSA 3W75A 1TPWA 3W23A 3AO0A 1KFEA 1FCBA 3PC0A 3S5OA 3EWXA 2Q8LA 3IV3A 4NNBA 2QCLA 1J4EA 3DHDA 4PA8A 3TROA 1WX0A 3ABRA 2FDSA 1EP3A 3SIZA 3MP4A 4O4WA 3NPWA 5D2TA 4NXSA 1DKWA 3O16A 5D03A 2DU2A 2VKZG 1PS9A 4M19A 3GDKA 2WO5A 2BZNA 1NAL1 1T99A 4HPJA 2NUYA 4LW7A 2ZA3A 4DPQA 3PY2A 3IIPA 4O54A 2D73A 1BTMA 1MXSA 1ZNNA 5HR7A 2YCEA 4TO8A 4JTJA 3VI2A 4FIQA 5FEXA 1F73A 1P5BA 1TTQA 1PHWA 3O63A 1ME8A 4QITA 2GQ8A 4N9CA 1ONRA 3A22A 3NVTA 4ADUA 2ALDA 2I1OA 1N7KA 2ZFAA 1OFAA 3LX9A 3DFPA 2V2HA 4HN4A 1Z42A 3W7RA 1SW7A 1TPUA 1J2WA 4QJ1A 1O5KA 1FWRA 1S5VA 3EWBX 4JTHA 5I3FA 1KBIA 1OX4A 4JR5A 4BF9A 1W54A 3IIZA 4GWEA 1W0MA 3GDTA 4FNRA 1E51A 1R47A 1AK5A 4O12A 3C61A 1JUKA 4CCDA 4WXZA 4GUGA 3H54A 4XKYA 4UTJA 2ATSA 1KW1A 2FLIA 2EF9A 3P61A 4UFLA 4JTFA 5TBOA 4YXGA 3C2RA 4LVBA 3SR7A 4O0ZA 3KXQA 1DL3A 1BWKA 2DZSA 2TRSA 3A24A 3N2XA 1YPFA 1F2JA 1WDWA 4M6PA 4O53A 2FB3A 2QKFA 4JTKA 1F5ZA 3DKJA 4U4MA 4IXHA 2B4GA 5E0KA 4GFSA 1I2QA 4EVZA 1O60A 4M7TA 1N55A 4H3DA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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