4CUPA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-1 n09421
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-1 N09421
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 42
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cupA00
4O7AA 5AD3A 4O76A 4QUTA 4QSQA 5LKZA 5F5ZA 5IBNA 4BW4A 1JSPB 4TTEA 5ENIA 2YDWA 2RI7A 5CPEA 5L96A 1WUGA 5ENCA 2OSSA 4MR3A 5KHMA 5H1TA 5A83A 5HRVA 5E9IA 5LVQA 2WP2A 4UYFB 4O71A 4QEVA 5EICA 3MQMA 2RO1A 4HXSA 4NYWA 5IGMA 5ENBA 5DYXA 4NUCA 4NR5A 4QSSA 5E9LA 4XUBA 5I80A 5L98A 5DFDA 5AMEA 3MB4A 5ETDA 4TT2A 4NXJA 4LYSA 3AADA 4HXLA 4HXNA 3P1FA 4WHWA 5ENHA 5L8TA 5F2PA 4TT4A 5D3SA 5EWDA 5CS8A 4PY6A 4QR5A 4CFKA 5CQTA 5DW2A 5KTWA 5HJCA 4Q0OA 5FDZA 4QEWA 2DVRA 5G4SA 3Q2EA 2E3KA 4NUEA 5G4RA 3SVGA 4NYXA 4YYIA 5CQ6A 4OGJA 4YYGA 5FFVA 5FE2A 3U5JA 5EV9A 2MJVB 3D7CA 5FE8A 3O33A 4TQNA 3DWYA 4XYAA 3MULA 4LYIA 5A81A 5FE7A 5A5NA 4PCEA 4CUUA 4QSXA 4UYFA 5D3RA 4Z6HA 5A5PA 5C85A 5EWWA 4CUTA 4QYDA 5FB0A 3G0LA 5EK9A 4QBMA 4RVRA 4FLPA 4Z93A 3IU6A 5IGKA 5KTXA 4J1PA 4O75A 4QC3A 3IU5A 5EWHA 5FG4A 5A85A 4PKLA 3GG3A 3HMFA 4UIZA 4O7CA 5CUCA 3NXBA 2H60A 4TU6A 1EQFA 4MEQA 4N3WA 4IOOA 5CUBA 2YW5A 4LZSA 5BT3A 4J3IA 2F6JA 4UITA 5IG6A 4KCXA 5CQ5A 5DFCA 2D82A 4O78A 4YADA 3RCWA 5EPSA 4QC1A 4BW1A 5HLSA 3UVDA 1F68A 4N4FA 5FE5A 5EGUA 4YABA 5C87A 5D3JA 4O77A 4NR4A 5K29A 5E73A 5ENJA 4A9OA 5CFWA 2OUOA 4YBMA 4NR6A 5F63A 5CQ8A 4YAXA 2RNXA 1WUMA 5IIDA 3U5NA 4O7FA 4QSRA 4ALGA 3MXFA 5A5OA 2DVSA 4YYHA 2R0SA 5BT4A 3UVXA 4F3IA 4QSVA 5FH7A 5KU3A 4CUQA 5C8GA 5CZGA 3UVWA 4LC2A 5EISA 4C66A 5DLXA 4HBYA 4YATA 2GRCA 5EP7A 2RFJA 4PTBA 4NRCA 4TYLA 4Z6IA 3U5PA 4WIVA 3Q2FA 5E0RA 1ZS5A 4QSTA 4J0SA 4KV4A 5D3HA 4UIYA 3ZYUA 3SVFA 4BW3A 5CUGA 5E9VA 4UIUA 5E9KA 5EQ1A 2E7NA 3P5OA 5HCLA 2R10A 5A5QA 5DKDA 4IR3A 4NRAA 4YY6A 5CP5A 5DYCA 5FE1A 5LKTA 4O74A 5I89A 5CUDA 3MUKA 5FE3A 4XY8A 4AKNA 3LQJA 4TZ2A 5HENA 2WP1A 4O70A 4QEUA 5I40A 5IGNA 5D26A 4QSWA 3JVLA 3O37A 4YC9A 5FG6A 4XY9A 4A9MA 3QZSA 5L8UA 4N4GA 4Z1SA 5AMFA 2N9GA 5CU8A 2YELA 5IGLA 3JVKA 5EWVA 5D24A 1E6IA 4MR6A 2L5EA 3LJWA 5FE9A 2DVVA 5E7DA 5FH8A 2I7KA 5E3DA 4HBWA 4QR3A 4HXOA 5CQ4A 3K2JA 4CUSA 4HXKA 4CURA 4ZC9A 3UW9A 2RNYA 4YBSA 5EM3A 4UYDA 4UYGA 5TB6A 2DWWA 5I29A 4E96A 5EVAA 5D3LA 4MEPA 5ENEA 4YY4A 4BHWA 4X2IA 5HEMA 4YH3A 5HQ6A 5D3NA 5DKHA 2KTBB 4YYMA 5CGPA 4A9EA 3P1CA 4TS8A 4PCIA 5CQAA 3HMHA 5CRZA 4N4HA 2D9EA 5FE4A 4IR4A 5COIA 3LXJA 5HQ5A 3S92A 5J0DA 4PS5A 5EPRA 4DONA 4TZ8A 5DYUA 5H1VA 4UIXA 3FKMX 5A7CA 5ENGA 4YYDA 2YEKA 5FE0A 4QSUA 4A9KA 5D3TA 5LJ2A 3UV5A 5ENFA 5CUAA 2E7OA 3JVJA 5FE6A 4WHUA 2RNWA 3MB3A 4A9FA 5C4QA 5AD2A 4A9HA 4GPJA 5FH6A 5HRXA 2FSAA 4ZW1A 4LZRA 3DAIA 4CL9A 4OGIA 2YYNA 4HXPA 4A9LA 4IR6A 5E74A 5E9MA 5II1A 4KV1A 3I3JA 5C89A 5DKCA 5DW1A 5FBXA 5CUEA 5HM0A 5FG5A 2RS9B 5LUUA 4UYEA 5ACYA 4NRBA 5EU1A 1N72A 5DYAA 4QY4A 4J0RA 4UIWA 4ZQLA 5HFQA 5HELA 2I8NA 5F61A 3QZTA 4QB3A 4MR4A 2DVQA 5D0CA 4XUAA 5A5RA 5JWMA 4NR8A 5D25A 3QZVA 4Z1QA 3P1DA 4IOQA 5F36A 5BT5A 4LZ2A 5JI8A 4LDFA 4LRGA 5CRMA 4YBTA 5D7XA 4O7BA 4UYHA 5I86A 4HBXA 3U5KA 5F60A 5LJ0A 5I7XA 2OO1A 5H85A 4NR7A 5I7YA 3UV4A 5A82A 2LSPB 3P1EA 4CFLA 3SVHA 3S91A 5EA1A 4IORA 4NS5A 2YEMA 4HXMA 3TLPA 4O72A 4TU4A 4QZSA 4ALHA 5EWCA 4LR6A 3LQHA 3O34A 2DKWA 3U5MA 5FFWA 5CQ7A 5L97A 5LKXA 4LYWA 4MEOA 4YH4A 5F62A 1JM4B 4NYVA 4QUUA 2DATA 4HXRA 3UVYA 3O36A 3AQAA 2G4AA 5I83A 2NXBA 5F1HA 3LQIA 4O7EA 5EI4A 3U5OA 3G0JA 4TT6A 5DFBA 5EPBA 5LKUA 4QSPA 5CY9A 4A9IA 5A5SA 4A9JA 4MR5A 5D3PA 5DLZA 5H1UA 2L84A 4N4IA 4NQMA 3UV2A 4YYKA 5HQ7A 1X0JA 5KTUA 4QYLA 5DX4A 4OUFA 5F1LA 2L85A 4QNSA 4YYJA 4C67A 5DY7A 5I88A 4Y03A 5LVRA 4HBVA 5LJ1A 4NQNA 3O35A 4BW2A 2YQDA 4NR9A 5KO4A 5FFYA 5I1QA 4NUDA 5F3AA 5E9YA 4QR4A 5L99A 4MENA 4YYNA 5ETBA 2F6NA 4BJXA 5CTLA 4Q0NA 5HFRA 5TCMA 2R0VA 5E3GA 3ONIA 5FB1A 3U5LA 4A9NA 5F25A 5C7NA 3HMEA 5II2A 2R0YA 5DBMA 4CUPA 4CLBA 5HRWA 4IR5A 4UIVA 4YK0A 3JVMA 5CQ3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4O7AA 5AD3A 4O76A 4QUTA 4QSQA 5LKZA 5F5ZA 5IBNA 4BW4A 1JSPB 4TTEA 5ENIA 2YDWA 2RI7A 5CPEA 5L96A 1WUGA 5ENCA 2OSSA 4MR3A 5KHMA 5H1TA 5A83A 5HRVA 5E9IA 5LVQA 2WP2A 4UYFB 4O71A 4QEVA 5EICA 3MQMA 2RO1A 4HXSA 4NYWA 5IGMA 5ENBA 5DYXA 4NUCA 4NR5A 4QSSA 5E9LA 4XUBA 5I80A 5L98A 5DFDA 5AMEA 3MB4A 5ETDA 4TT2A 4NXJA 4LYSA 3AADA 4HXLA 4HXNA 3P1FA 4WHWA 5ENHA 5L8TA 5F2PA 4TT4A 5D3SA 5EWDA 5CS8A 4PY6A 4QR5A 4CFKA 5CQTA 5DW2A 5KTWA 5HJCA 4Q0OA 5FDZA 4QEWA 2DVRA 5G4SA 3Q2EA 2E3KA 4NUEA 5G4RA 3SVGA 4NYXA 4YYIA 5CQ6A 4OGJA 4YYGA 5FFVA 5FE2A 3U5JA 5EV9A 2MJVB 3D7CA 5FE8A 3O33A 4TQNA 3DWYA 4XYAA 3MULA 4LYIA 5A81A 5FE7A 4AKGA 5A5NA 4PCEA 4CUUA 4QSXA 3ERRA 4UYFA 5D3RA 4Z6HA 5A5PA 5C85A 5EWWA 4CUTA 4QYDA 5FB0A 3G0LA 5EK9A 4QBMA 4RVRA 4FLPA 4Z93A 3IU6A 5IGKA 5KTXA 4J1PA 4O75A 4QC3A 3IU5A 5EWHA 5FG4A 5A85A 4PKLA 3GG3A 3HMFA 4UIZA 4O7CA 5CUCA 3NXBA 2H60A 4TU6A 1EQFA 4MEQA 4N3WA 4IOOA 5CUBA 2YW5A 4AKHA 4LZSA 5BT3A 3VKGA 4J3IA 2F6JA 4UITA 5IG6A 4KCXA 5CQ5A 5DFCA 2D82A 4O78A 4YADA 3RCWA 5EPSA 4QC1A 4BW1A 5HLSA 3UVDA 1F68A 4N4FA 5FE5A 5EGUA 4YABA 5C87A 5D3JA 4O77A 4NR4A 5K29A 5E73A 5ENJA 4A9OA 5CFWA 2OUOA 4YBMA 4NR6A 5F63A 5CQ8A 4AI6A 4YAXA 2RNXA 1WUMA 5IIDA 3U5NA 4O7FA 4QSRA 4ALGA 3MXFA 5A5OA 2DVSA 4YYHA 2R0SA 5BT4A 3UVXA 4F3IA 4QSVA 5FH7A 5KU3A 4CUQA 5C8GA 5CZGA 3UVWA 4LC2A 5EISA 4C66A 5DLXA 4HBYA 4YATA 2GRCA 5EP7A 2RFJA 4PTBA 4NRCA 4TYLA 4Z6IA 3U5PA 4WIVA 3Q2FA 5E0RA 1ZS5A 4QSTA 4J0SA 4KV4A 5D3HA 4UIYA 3ZYUA 3SVFA 4BW3A 5CUGA 5E9VA 4UIUA 5E9KA 5EQ1A 2E7NA 3P5OA 5HCLA 2R10A 5A5QA 5DKDA 4IR3A 4NRAA 4YY6A 5CP5A 5DYCA 5FE1A 5LKTA 4O74A 5I89A 5CUDA 3MUKA 5FE3A 4XY8A 4AKNA 3LQJA 4TZ2A 5HENA 2WP1A 4O70A 4QEUA 5I40A 5IGNA 5D26A 4QSWA 3JVLA 3O37A 4YC9A 5FG6A 4XY9A 4A9MA 1PUOA 3QZSA 5L8UA 4N4GA 4Z1SA 5AMFA 2N9GA 5CU8A 2YELA 5IGLA 3JVKA 5EWVA 5D24A 1E6IA 4AKIA 4MR6A 2L5EA 3LJWA 5FE9A 2DVVA 5E7DA 5FH8A 2I7KA 5E3DA 4HBWA 4QR3A 4HXOA 5CQ4A 3K2JA 4CUSA 4HXKA 4CURA 4ZC9A 3UW9A 2RNYA 4YBSA 5EM3A 4UYDA 4UYGA 5TB6A 2DWWA 5I29A 4E96A 5EVAA 5D3LA 4MEPA 5ENEA 4YY4A 4BHWA 4X2IA 5HEMA 4YH3A 5HQ6A 5D3NA 5DKHA 2KTBB 4YYMA 5CGPA 4A9EA 3P1CA 4TS8A 4PCIA 5CQAA 3HMHA 5CRZA 4N4HA 2D9EA 5FE4A 4IR4A 5COIA 3LXJA 5HQ5A 3S92A 5J0DA 4PS5A 5EPRA 4DONA 4TZ8A 5DYUA 5H1VA 4UIXA 3FKMX 5A7CA 5ENGA 4YYDA 2YEKA 5FE0A 4QSUA 4A9KA 5D3TA 5LJ2A 3UV5A 5ENFA 5CUAA 2E7OA 3JVJA 5FE6A 4WHUA 2RNWA 3MB3A 4A9FA 5C4QA 5AD2A 4A9HA 4GPJA 5FH6A 5HRXA 2FSAA 4ZW1A 4LZRA 3DAIA 4CL9A 4OGIA 2YYNA 4HXPA 4A9LA 4IR6A 2EJNA 3D1BA 5E74A 5E9MA 5II1A 4KV1A 3I3JA 5C89A 5DKCA 5DW1A 5FBXA 5CUEA 5HM0A 5FG5A 2RS9B 5LUUA 4UYEA 5ACYA 4NRBA 5EU1A 1N72A 5DYAA 4QY4A 4J0RA 4UIWA 4ZQLA 5HFQA 5HELA 2I8NA 5F61A 3QZTA 4QB3A 4MR4A 2DVQA 5D0CA 4XUAA 5A5RA 5JWMA 4NR8A 5D25A 3QZVA 4Z1QA 3P1DA 4IOQA 5F36A 5BT5A 4LZ2A 5JI8A 4LDFA 4LRGA 5CRMA 4YBTA 5D7XA 4O7BA 4UYHA 5I86A 4HBXA 3U5KA 5F60A 5LJ0A 5I7XA 2OO1A 5H85A 4NR7A 5I7YA 3UV4A 5A82A 2LSPB 3P1EA 4CFLA 3SVHA 3S91A 5EA1A 4IORA 4NS5A 2YEMA 3D1DA 4HXMA 3TLPA 4O72A 4TU4A 1ZKRA 4QZSA 4ALHA 5EWCA 4LR6A 3LQHA 3O34A 2DKWA 3U5MA 5FFWA 5CQ7A 5L97A 5LKXA 4LYWA 4MEOA 4YH4A 5F62A 1JM4B 4NYVA 4QUUA 2DATA 4HXRA 3UVYA 3O36A 3AQAA 2G4AA 5I83A 2NXBA 5F1HA 3LQIA 4O7EA 5EI4A 3U5OA 3G0JA 4TT6A 5DFBA 5EPBA 5LKUA 4QSPA 5CY9A 4A9IA 5A5SA 4A9JA 4MR5A 5D3PA 5DLZA 5H1UA 2L84A 4N4IA 4NQMA 3UV2A 4YYKA 5HQ7A 1X0JA 5KTUA 4QYLA 5DX4A 4OUFA 5F1LA 2L85A 4QNSA 4YYJA 4C67A 5DY7A 5I88A 4Y03A 5LVRA 4HBVA 5LJ1A 4NQNA 3O35A 4BW2A 2YQDA 3VKHA 4NR9A 5KO4A 5FFYA 5I1QA 4NUDA 5F3AA 5E9YA 4QR4A 5L99A 4MENA 4YYNA 5ETBA 2F6NA 4BJXA 5CTLA 4Q0NA 5HFRA 5TCMA 2R0VA 5E3GA 3ONIA 5FB1A 3U5LA 4A9NA 5F25A 5C7NA 3HMEA 5II2A 2R0YA 5DBMA 4CUPA 4CLBA 5HRWA 4IR5A 4UIVA 4YK0A 3JVMA 5CQ3A
chains in the Genus database with same CATH topology
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