4CUPA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-1 n09421
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
b'SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-1 N09421
rcsb
molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 42
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cupA00
3ZYUA 4KV4A 5TCMA 4UYHA 4IR3A 5D26A 5D24A 2F6NA 5D7XA 4QR5A 5D25A 5L96A 4PCEA 5BT3A 2YQDA 4OUFA 3QZSA 5I7XA 2NXBA 5FFWA 5DKDA 4KCXA 5CQ8A 3U5KA 4QSSA 5I80A 5HLSA 5A83A 4HBWA 4NUEA 4HXPA 4MENA 3G0LA 4TTEA 5CUBA 3UVXA 2DVSA 5FE4A 4UITA 5FDZA 3SVFA 4QEUA 5DKCA 4NYXA 4QSQA 2G4AA 4O72A 5DYUA 5HQ7A 4J0SA 5F1LA 4TS8A 4DONA 4LYWA 1E6IA 5F63A 3P1FA 4YYHA 5A5PA 5DYCA 4A9OA 3LJWA 3GG3A 5CQ7A 3O36A 5CRZA 4Z1SA 1ZS5A 4QUUA 5C8GA 5EVAA 5IGKA 2E7OA 5A5SA 3IU6A 4WIVA 3ONIA 2FSAA 4IOOA 4LZRA 4UYFB 4TU6A 5HQ6A 5I1QA 4YBMA 5E73A 4J1PA 2YEKA 4N4HA 5L8TA 5DYAA 4YY6A 5HQ5A 5ENJA 5H1UA 5AD3A 5LUUA 5DX4A 3UV5A 4A9LA 4YH4A 5EM3A 5KTUA 5F1HA 4HXRA 4UYFA 5A5RA 5D3SA 2H60A 4YC9A 5ENEA 4HXKA 5DW2A 4BW4A 5CU8A 3G0JA 4BW3A 4LR6A 5FE7A 4TU4A 3SVGA 5HFQA 5CZGA 2RFJA 4XUAA 2D9EA 4LZSA 4A9JA 5J0DA 4A9IA 4N4FA 4UIVA 4MR3A 4BHWA 5EI4A 4TT4A 4ZQLA 5FG4A 4ZW1A 3UV2A 5LJ2A 5FFYA 3UVWA 5EV9A 5I40A 5LVRA 4X2IA 4TZ8A 4NYWA 5ENFA 5A5OA 4NR8A 4IOQA 4NR6A 4O7FA 3QZVA 2L85A 4A9HA 5DBMA 3NXBA 2R0VA 5AD2A 4YATA 4QUTA 4QSVA 5IGNA 4UYDA 5FE1A 2DVQA 4NR7A 5LJ0A 4YYKA 2WP1A 3P5OA 4O75A 2RNYA 5EWDA 2DWWA 5E3DA 4CLBA 5I29A 2L84A 5FE0A 5DY7A 5TB6A 4YBSA 5IG6A 5F36A 5KTWA 4QB3A 2N9GA 2LSPB 3UV4A 5L97A 4NXJA 2OO1A 5E9IA 4WHUA 5HM0A 5LKZA 5KO4A 5FG5A 5EPBA 4UIXA 4UIYA 3U5JA 1F68A 3MB3A 4YK0A 4NQNA 5D3RA 5FG6A 2RO1A 5F3AA 4HXMA 4O78A 4QY4A 4N4IA 3UVYA 5A5NA 2F6JA 4CUPA 5JWMA 5CPEA 4PS5A 4J3IA 4O77A 4UIWA 2OUOA 1X0JA 4HBVA 4Q0NA 5A85A 5HRWA 4Z6HA 5EISA 3JVJA 3O33A 4ALGA 1JM4B 5I7YA 5JI8A 5CQ5A 4O70A 4J0RA 5E9YA 4NR9A 5E3GA 5C87A 5FE2A 5D3PA 4HBXA 4NRBA 5IGLA 4N3WA 4QSUA 5DKHA 3JVMA 5EWWA 3P1DA 5BT5A 2DVVA 5CRMA 5ENHA 5D3JA 3O34A 5A7CA 2RS9B 5EK9A 4YH3A 5HFRA 4A9FA 4A9KA 4MR6A 5AMFA 4MEOA 5E0RA 5E9VA 4AKNA 4YYGA 4CUUA 4NS5A 4PKLA 2YW5A 5ENBA 5ACYA 5CP5A 2WP2A 3O37A 5FH6A 5CFWA 5FE5A 4N4GA 2E7NA 5LJ1A 5EU1A 4QSRA 5KTXA 5G4RA 3Q2EA 4QSXA 3MB4A 5COIA 4UIZA 5A81A 2OSSA 4GPJA 4XYAA 5D3TA 4NUCA 4PY6A 4QBMA 4O7BA 5H1TA 5CQ4A 1WUGA 2YELA 3S92A 5ENGA 4TT2A 5E7DA 3LQIA 2MJVB 3MQMA 4O7EA 4O7CA 2YYNA 5I89A 4QYDA 4LYSA 4LDFA 4HBYA 4YY4A 4CUTA 3SVHA 5F2PA 3P1CA 4LZ2A 5II2A 5F60A 4NUDA 5F25A 5D3HA 5DFBA 3UW9A 4NQMA 1N72A 3MUKA 5E9LA 4YYNA 2E3KA 3LQJA 5ETBA 3HMHA 3D7CA 4Q0OA 5EWHA 4BW1A 3Q2FA 5E9MA 5D0CA 2DKWA 4C66A 4NRAA 5BT4A 2DATA 5CUDA 5C7NA 5FFVA 5II1A 5EWCA 3P1EA 5DW1A 4YAXA 5K29A 5G4SA 4YYJA 4MR4A 5E74A 5I83A 5CUAA 4YYDA 2RNXA 3FKMX 2R0YA 5H1VA 4O7AA 3LXJA 3JVLA 5FE8A 3MULA 3I3JA 5EA1A 4QSTA 5DLXA 2D82A 4O74A 2YEMA 4TQNA 3HMEA 4LYIA 4CURA 3AQAA 5EICA 4CFLA 4C67A 4IR4A 5DFDA 4LRGA 5D3NA 5EWVA 5LKUA 1EQFA 4NYVA 4A9NA 4QC1A 2YDWA 3LQHA 5ENIA 3MXFA 3JVKA 4A9EA 4QR4A 3AADA 4HXLA 4HXNA 2DVRA 5CQTA 4XY8A 5EP7A 5FH7A 4QNSA 5A5QA 4LC2A 4E96A 5CS8A 4YBTA 4CL9A 4RVRA 1WUMA 5F62A 5CY9A 3IU5A 5LKTA 3U5PA 2R10A 5CGPA 4QR3A 4ZC9A 4MR5A 4F3IA 5IGMA 5LVQA 5ENCA 4O71A 2I7KA 4IR6A 3TLPA 4QSWA 2RNWA 5I88A 4UYEA 5HCLA 4A9MA 4PCIA 5L98A 5CUEA 4QZSA 4TZ2A 4OGJA 5HEMA 5DLZA 4KV1A 5IIDA 4Z6IA 4HXOA 5DYXA 5FBXA 1JSPB 5FE9A 4CFKA 5KU3A 5F5ZA 4O76A 2RI7A 4WHWA 2KTBB 3U5MA 4TT6A 2L5EA 3DAIA 5EQ1A 3U5OA 3QZTA 5AMEA 5CUGA 2GRCA 3HMFA 4NRCA 4ALHA 2I8NA 3K2JA 4Z1QA 5E9KA 4QEVA 4MEQA 5LKXA 5CTLA 5L99A 4QEWA 4Y03A 5HJCA 5EPSA 5FE3A 5FE6A 4XUBA 5D3LA 4IR5A 4YYMA 5HELA 5KHMA 5CQ6A 5FB1A 4QSPA 3S91A 4PTBA 4YABA 5H85A 5EPRA 4FLPA 4HXSA 4CUQA 5EGUA 5HRXA 5FB0A 5C89A 5CUCA 4NR4A 4Z93A 4YYIA 5CQAA 3DWYA 4UYGA 3UVDA 5FH8A 5HENA 5L8UA 5A82A 4QYLA 4MEPA 4NR5A 3U5NA 4UIUA 5DFCA 4TYLA 4YADA 5IBNA 4BW2A 5C85A 5C4QA 5HRVA 4XY9A 5CQ3A 4CUSA 4QC3A 3O35A 4OGIA 4IORA 5I86A 5ETDA 5F61A 3U5LA 2R0SA 3RCWA 4BJXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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