4CUPA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-1 n09421
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-1 N09421
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Transcription
total genus 42
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cupA00
3QZSA 5KTXA 5FB0A 3MULA 3U5JA 4NQNA 5H1TA 4O7FA 2RFJA 3O36A 5FH7A 2E7OA 4OUFA 5F63A 2DATA 4IORA 5D3PA 5HQ5A 5FDZA 4O75A 5A7CA 5CQ5A 3UV5A 4LZSA 5CUEA 5DKCA 2D9EA 5C8GA 4Z6IA 4CUSA 4HXMA 4CUQA 3UV2A 4YATA 5DW1A 4UIYA 5CUDA 4AKNA 4A9NA 3QZTA 4YADA 2GRCA 5CGPA 5D3NA 5EU1A 5EISA 5I83A 5I40A 4HBWA 5L8TA 5HRXA 4RVRA 2RNXA 1JSPB 4DONA 4TS8A 4XY8A 5A5RA 5FG6A 4YK0A 5CQ6A 4PKLA 5CRMA 4YYNA 2DVVA 4J0RA 4HXLA 3UVXA 5E3DA 5DYCA 4NR4A 4MR5A 3LQIA 4NS5A 3HMHA 5EWWA 4Z1SA 5F1HA 5F2PA 5ENEA 4Y03A 5EGUA 5E9LA 4UIWA 1WUMA 3MXFA 5LKXA 5E7DA 4MEOA 4UYDA 5KTUA 5C89A 3LJWA 5LKZA 3O34A 4O74A 5FFYA 4N4HA 5ENJA 2NXBA 5HFQA 5IG6A 4YBSA 5I7YA 5A5SA 2OSSA 4O78A 5A85A 4CFKA 2YYNA 4CLBA 5K29A 2L84A 5E73A 4UYFA 4NR9A 5LVRA 4YC9A 4A9IA 1X0JA 4C67A 4YYHA 1F68A 4QY4A 4LR6A 5EQ1A 4MR4A 2WP1A 4O7CA 2E3KA 4QSPA 5A5NA 4UYFB 5FG4A 4XUBA 5ENBA 4PCIA 4UYEA 2KTBB 3MQMA 4HXPA 4N3WA 5I86A 4NYWA 5ACYA 5E9IA 5AD3A 5JI8A 4LZRA 2G4AA 3NXBA 5I1QA 5DLZA 5ENGA 4UIVA 5FE5A 3IU5A 2DKWA 3HMFA 4TZ8A 4TU6A 4TU4A 5IGNA 4HXKA 4E96A 4MENA 4YYKA 5HRVA 5I88A 1JM4B 5FE1A 4A9EA 5AMFA 3AQAA 5F3AA 5FBXA 4QR4A 4BW3A 4XYAA 5CY9A 4Q0OA 4NQMA 2MJVB 3P1EA 4QSSA 4IOOA 4PS5A 3K2JA 5FE7A 5II1A 5DKDA 5CUAA 3FKMX 5E9MA 5CQ4A 5L97A 5EA1A 5E0RA 2WP2A 4YBMA 4YY4A 5EP7A 5D25A 4QSWA 4NYXA 4BW4A 4XUAA 5FE8A 4YYMA 4BJXA 5KTWA 5LJ0A 4O76A 3U5PA 4YYDA 5I7XA 5TB6A 4QSUA 4O71A 5FG5A 2I8NA 4YABA 3DWYA 3JVMA 4TYLA 5D3RA 2RNWA 4NXJA 3JVKA 5CPEA 2OUOA 5LUUA 5D0CA 4TQNA 5CQTA 4OGIA 4LYWA 3ONIA 3G0JA 4A9FA 4PY6A 4QR3A 4A9HA 3UW9A 5CQAA 4KV4A 5ENCA 4LC2A 4NR5A 4X2IA 4ZQLA 4LYSA 4MR6A 5HFRA 2R10A 4UYGA 4TZ2A 4N4GA 4CUPA 5D24A 5CUBA 2YDWA 4ZC9A 4HBYA 4Q0NA 4A9JA 2E7NA 5D3JA 5AMEA 5EVAA 4IOQA 5DYUA 5LKTA 3JVLA 3HMEA 4FLPA 5HRWA 4NR7A 5IGKA 3S91A 2YELA 5LVQA 4YYIA 5HQ6A 1WUGA 5FH8A 5EPRA 5FE6A 5II2A 4QSQA 5H85A 4CUTA 4J0SA 2H60A 4J1PA 5DLXA 4ZW1A 4TT2A 4QR5A 2I7KA 5ENHA 5I29A 4ALHA 3GG3A 2RI7A 4YYGA 5FFWA 5F1LA 4QEWA 4MEQA 4NRBA 4GPJA 5D3LA 5DW2A 5I80A 3SVFA 5D3HA 1E6IA 3TLPA 4NR8A 3AADA 3U5LA 2YEMA 3P1FA 5EPBA 1EQFA 3U5NA 5CS8A 5AD2A 4OGJA 3I3JA 5CUCA 4N4IA 5DYAA 4MEPA 5D3SA 4IR6A 2R0VA 3LQHA 3MB3A 4CUUA 4NUDA 5A83A 5FB1A 4YH3A 4LZ2A 4O72A 4TT6A 5HEMA 3MB4A 4QB3A 5F62A 4YY6A 5CQ8A 5A81A 4C66A 4YYJA 5EWCA 4HXRA 5FE4A 5LKUA 5EM3A 3IU6A 5CU8A 4QSTA 4UIXA 5H1UA 5E9YA 5A5QA 4ALGA 5DFDA 4CFLA 4NRAA 5C4QA 4WIVA 2F6NA 5F36A 5EICA 2DVSA 5FE2A 5F25A 5DFCA 4IR5A 4QEUA 5EV9A 3Q2EA 5FH6A 5CTLA 3UVDA 4IR4A 4Z6HA 5HCLA 5H1VA 4QUUA 3P1DA 4YBTA 5FE9A 3SVHA 5EWVA 4NUEA 3DAIA 4A9KA 3JVJA 4MR3A 4QSVA 4A9MA 4QNSA 4TT4A 5ETBA 4PTBA 3P5OA 5L99A 5HM0A 3S92A 5A5PA 4CURA 4HBVA 5IGLA 5FE0A 5KO4A 5CRZA 4Z1QA 5TCMA 4Z93A 4CL9A 4O77A 5CZGA 5EK9A 5FFVA 5HJCA 5CUGA 5HQ7A 4NUCA 2DVQA 4KV1A 3UV4A 2DVRA 5IBNA 5IGMA 2R0SA 4UIZA 4QBMA 5CQ3A 3O33A 2YQDA 3Q2FA 3O35A 5ENFA 4UITA 4WHUA 5D3TA 4QYDA 5CQ7A 5HLSA 4YH4A 3U5OA 4O7EA 4A9OA 5DBMA 5DX4A 4BW2A 4XY9A 1N72A 4QUTA 5C87A 5DYXA 5A82A 5G4RA 4O7BA 5A5OA 4QC3A 5DKHA 2N9GA 4N4FA 4UYHA 3O37A 4NR6A 4HXOA 4YAXA 5DFBA 2L85A 2FSAA 4QSRA 5F61A 2RS9B 4A9LA 4TTEA 5LJ1A 2L5EA 3UVYA 4PCEA 2LSPB 4LDFA 4BW1A 4BHWA 2RNYA 5ETDA 5EI4A 4HBXA 5JWMA 2DWWA 4KCXA 5KU3A 5E9KA 4QEVA 3MUKA 2YEKA 5E3GA 5EWDA 5F60A 2F6JA 3U5MA 4NYVA 2D82A 5L98A 5E74A 5D7XA 3U5KA 4LRGA 4QC1A 5ENIA 5LJ2A 5EWHA 4UIUA 3QZVA 4LYIA 4F3IA 4IR3A 5COIA 3SVGA 5HELA 3LQJA 4J3IA 5BT5A 4QZSA 5DY7A 1ZS5A 4WHWA 5IIDA 5CFWA 2OO1A 5D26A 2RO1A 5E9VA 5F5ZA 5HENA 5L8UA 4O7AA 3LXJA 5EPSA 4QYLA 5I89A 5FE3A 5J0DA 3P1CA 5L96A 4O70A 4QSXA 3RCWA 5BT3A 5CP5A 5C85A 4HXNA 3ZYUA 3UVWA 4NRCA 2R0YA 5BT4A 3D7CA 3G0LA 5KHMA 5C7NA 2YW5A 4HXSA 5G4SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3QZSA 5KTXA 5FB0A 3MULA 3U5JA 4NQNA 5H1TA 4O7FA 2RFJA 3O36A 5FH7A 2E7OA 4OUFA 5F63A 2DATA 4IORA 5D3PA 5HQ5A 5FDZA 4O75A 5A7CA 5CQ5A 3UV5A 4LZSA 5CUEA 5DKCA 2D9EA 5C8GA 4Z6IA 4CUSA 4HXMA 4CUQA 3UV2A 4YATA 5DW1A 4UIYA 5CUDA 4AKNA 4A9NA 3QZTA 4YADA 2GRCA 5CGPA 4AI6A 5D3NA 5EU1A 5EISA 5I83A 5I40A 4HBWA 5L8TA 5HRXA 4RVRA 2RNXA 1JSPB 4DONA 4TS8A 4XY8A 3D1BA 5A5RA 5FG6A 4YK0A 5CQ6A 4PKLA 5CRMA 2EJNA 4YYNA 2DVVA 4J0RA 4HXLA 3UVXA 5E3DA 5DYCA 4NR4A 4MR5A 3LQIA 4NS5A 3HMHA 5EWWA 4Z1SA 5F1HA 5F2PA 5ENEA 4Y03A 5EGUA 5E9LA 4UIWA 1WUMA 3MXFA 5LKXA 5E7DA 4AKHA 4MEOA 4UYDA 5KTUA 5C89A 3LJWA 5LKZA 3O34A 4O74A 5FFYA 4N4HA 5ENJA 2NXBA 5HFQA 5IG6A 4YBSA 5I7YA 5A5SA 2OSSA 4O78A 5A85A 4CFKA 2YYNA 4CLBA 5K29A 2L84A 5E73A 4UYFA 4NR9A 5LVRA 4YC9A 4A9IA 1X0JA 4C67A 4YYHA 1F68A 4QY4A 4LR6A 5EQ1A 4MR4A 2WP1A 4O7CA 2E3KA 4QSPA 5A5NA 4UYFB 5FG4A 4XUBA 5ENBA 4PCIA 4UYEA 2KTBB 3MQMA 4HXPA 4N3WA 5I86A 4NYWA 5ACYA 5E9IA 5AD3A 5JI8A 4LZRA 2G4AA 3NXBA 5I1QA 5DLZA 5ENGA 4UIVA 5FE5A 3IU5A 2DKWA 3HMFA 4TZ8A 4TU6A 4TU4A 5IGNA 4HXKA 4E96A 4MENA 4YYKA 5HRVA 5I88A 1JM4B 5FE1A 4A9EA 5AMFA 3AQAA 5F3AA 5FBXA 4QR4A 1PUOA 4BW3A 4XYAA 5CY9A 4Q0OA 4NQMA 2MJVB 3P1EA 4QSSA 4IOOA 4PS5A 3K2JA 5FE7A 5II1A 5DKDA 5CUAA 3FKMX 5E9MA 5CQ4A 5L97A 5EA1A 5E0RA 2WP2A 4YBMA 4YY4A 5EP7A 5D25A 4QSWA 4NYXA 4BW4A 4XUAA 5FE8A 4YYMA 4BJXA 5KTWA 5LJ0A 4O76A 3U5PA 4YYDA 5I7XA 5TB6A 4QSUA 4O71A 5FG5A 2I8NA 1ZKRA 4YABA 3DWYA 3JVMA 4TYLA 5D3RA 2RNWA 4NXJA 3JVKA 5CPEA 2OUOA 5LUUA 5D0CA 4TQNA 5CQTA 4OGIA 3VKHA 4LYWA 3ONIA 3G0JA 4A9FA 4PY6A 4QR3A 4A9HA 3UW9A 5CQAA 4KV4A 5ENCA 4LC2A 4NR5A 4X2IA 4ZQLA 4LYSA 4MR6A 5HFRA 2R10A 4UYGA 4TZ2A 4N4GA 4CUPA 5D24A 5CUBA 2YDWA 4ZC9A 4HBYA 4Q0NA 4A9JA 2E7NA 5D3JA 5AMEA 5EVAA 4IOQA 5DYUA 5LKTA 3JVLA 3HMEA 4FLPA 5HRWA 4NR7A 5IGKA 3S91A 2YELA 5LVQA 4YYIA 5HQ6A 1WUGA 5FH8A 5EPRA 5FE6A 5II2A 4QSQA 5H85A 4CUTA 4J0SA 2H60A 4J1PA 5DLXA 4ZW1A 4TT2A 4QR5A 2I7KA 5ENHA 5I29A 4ALHA 3GG3A 2RI7A 4YYGA 5FFWA 5F1LA 4QEWA 4MEQA 4NRBA 4GPJA 5D3LA 5DW2A 5I80A 3SVFA 5D3HA 1E6IA 3TLPA 4NR8A 3AADA 3U5LA 2YEMA 3P1FA 5EPBA 1EQFA 3ERRA 3U5NA 5CS8A 5AD2A 4OGJA 3I3JA 5CUCA 4AKIA 4N4IA 5DYAA 4MEPA 5D3SA 4IR6A 2R0VA 3LQHA 3MB3A 4CUUA 4NUDA 5A83A 5FB1A 4YH3A 4LZ2A 4O72A 4TT6A 5HEMA 3MB4A 4QB3A 5F62A 4YY6A 5CQ8A 5A81A 4C66A 4YYJA 5EWCA 4HXRA 5FE4A 5LKUA 5EM3A 3IU6A 5CU8A 4QSTA 4UIXA 5H1UA 5E9YA 5A5QA 4ALGA 5DFDA 4CFLA 4NRAA 5C4QA 4WIVA 2F6NA 5F36A 5EICA 2DVSA 5FE2A 5F25A 5DFCA 4IR5A 4QEUA 5EV9A 3Q2EA 5FH6A 5CTLA 3UVDA 4IR4A 4Z6HA 5HCLA 5H1VA 4QUUA 3P1DA 4YBTA 5FE9A 3SVHA 5EWVA 4NUEA 3DAIA 4A9KA 3JVJA 4MR3A 4QSVA 4A9MA 4QNSA 4TT4A 5ETBA 4PTBA 3P5OA 5L99A 5HM0A 3S92A 5A5PA 4CURA 4HBVA 5IGLA 5FE0A 5KO4A 5CRZA 4Z1QA 5TCMA 4Z93A 4CL9A 4O77A 5CZGA 5EK9A 5FFVA 5HJCA 5CUGA 5HQ7A 4NUCA 2DVQA 4KV1A 3UV4A 2DVRA 5IBNA 5IGMA 2R0SA 4UIZA 4QBMA 5CQ3A 3O33A 2YQDA 3Q2FA 3O35A 5ENFA 4UITA 4WHUA 5D3TA 4QYDA 5CQ7A 5HLSA 4YH4A 3U5OA 4O7EA 4A9OA 5DBMA 5DX4A 4BW2A 4XY9A 1N72A 4QUTA 3D1DA 5C87A 5DYXA 5A82A 5G4RA 4O7BA 5A5OA 4QC3A 5DKHA 2N9GA 4N4FA 4UYHA 3O37A 4NR6A 3VKGA 4HXOA 4YAXA 5DFBA 2L85A 2FSAA 4QSRA 5F61A 2RS9B 4A9LA 4AKGA 4TTEA 5LJ1A 2L5EA 3UVYA 4PCEA 2LSPB 4LDFA 4BW1A 4BHWA 2RNYA 5ETDA 5EI4A 4HBXA 5JWMA 2DWWA 4KCXA 5KU3A 5E9KA 4QEVA 3MUKA 2YEKA 5E3GA 5EWDA 5F60A 2F6JA 3U5MA 4NYVA 2D82A 5L98A 5E74A 5D7XA 3U5KA 4LRGA 4QC1A 5ENIA 5LJ2A 5EWHA 4UIUA 3QZVA 4LYIA 4F3IA 4IR3A 5COIA 3SVGA 5HELA 3LQJA 4J3IA 5BT5A 4QZSA 5DY7A 1ZS5A 4WHWA 5IIDA 5CFWA 2OO1A 5D26A 2RO1A 5E9VA 5F5ZA 5HENA 5L8UA 4O7AA 3LXJA 5EPSA 4QYLA 5I89A 5FE3A 5J0DA 3P1CA 5L96A 4O70A 4QSXA 3RCWA 5BT3A 5CP5A 5C85A 4HXNA 3ZYUA 3UVWA 4NRCA 2R0YA 5BT4A 3D7CA 3G0LA 5KHMA 5C7NA 2YW5A 4HXSA 5G4SA
chains in the Genus database with same CATH topology
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