4CUUA

Crystal structure of human baz2b in complex with fragment-6 n09645
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
SMSVKKPKRDDSKDLALCSMILTEMETHEDAWPFLLPVNLKLVPGYKKVIKKPMDFSTIREKLSSGQYPNLETFALDVRLVFDNCETFNEDDSDIGRAGHNMRKYFEKKWTDTFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords BROMODOMAIN ADJACENT TO ZINC FINGER DOMAIN PROTEIN 2B
publication title Crystal Structure of Human Baz2B in Complex with Fragment-6 N09645
rcsb
molecule tags Transcription
total genus 40
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-03-21

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4cuuA00
5LJ2A 5E0RA 3UVWA 2YELA 5DYAA 4MEOA 5BT5A 5E9MA 5DKDA 5E3GA 5LJ0A 4CURA 3QZVA 5J0DA 5D3NA 4QSSA 5I1QA 4CFLA 4QSUA 4IR6A 3MQMA 2RO1A 4IR3A 4UIXA 4MR6A 4YATA 4TZ2A 5LVQA 5DFBA 5EU1A 2RNYA 3S91A 3AQAA 3MB4A 5D25A 5CRZA 5A5SA 5I29A 4QYDA 4O76A 4PCIA 5D3TA 3MUKA 4TTEA 4O7FA 5CU8A 5D7XA 5EPSA 4O77A 5JWMA 4A9LA 5FE6A 5ENHA 5DYUA 4NQNA 5ENBA 3AADA 5E73A 4LZRA 5FE1A 4CUQA 5I86A 3O37A 5DKHA 5BT4A 5CS8A 4NQMA 5D3SA 4F3IA 4CUSA 5HLSA 2WP2A 2F6NA 5FFVA 5I89A 4YK0A 3O36A 4Y03A 3MB3A 4YH3A 5FH7A 4A9KA 5EWWA 5CPEA 3U5MA 5DKCA 4QEWA 5A83A 5IGMA 5DFCA 3GG3A 2LSPB 4HXMA 5EPBA 5KHMA 5HFQA 3MULA 4QSVA 4YBSA 5EI4A 4UIZA 4NUDA 4HXKA 3O34A 4O7AA 4UYFA 4QEUA 3U5NA 1EQFA 2YW5A 4XY9A 4HXNA 4KV1A 5HENA 4NRCA 5IGKA 4NR5A 2DVQA 5F25A 5ENCA 5CQ6A 5HRWA 3O33A 4J1PA 2DVVA 2GRCA 2R0SA 4YYKA 5TB6A 2N9GA 4J3IA 5L98A 5CUGA 4O71A 4NRBA 2YEMA 5FFYA 3DAIA 4J0SA 5CRMA 4IR4A 3HMEA 5H1VA 3P1DA 2RNXA 2OSSA 5HRVA 5I88A 4TQNA 5CQ5A 4UYGA 5HM0A 3JVMA 3JVLA 5E3DA 2YYNA 4RVRA 5EWDA 5AD3A 4HXOA 5KO4A 5E9YA 4J0RA 4MR3A 5FE0A 4MEQA 4LRGA 4N4IA 5DLZA 2E7OA 5E9KA 5EVAA 2YQDA 3Q2FA 4YYDA 4BW2A 4TS8A 2D9EA 5LKZA 4X2IA 4A9FA 4QB3A 4WHUA 5BT3A 5CUCA 4NS5A 5AMFA 5COIA 3K2JA 4YYJA 4DONA 5L8TA 5IGLA 4PKLA 5KTUA 5L99A 4Z93A 2E7NA 4LZ2A 2R0VA 5FE5A 5EM3A 5C85A 2I8NA 5LUUA 2F6JA 5ETDA 4YYNA 3FKMX 4CUTA 5A5RA 4MR4A 5DYXA 5JI8A 5DYCA 4O70A 5CY9A 4A9EA 5HQ5A 1X0JA 4XUBA 4NR6A 5EWHA 4HBXA 2NXBA 5CGPA 5EA1A 5FE7A 4C67A 4PCEA 4A9IA 4OUFA 5E74A 1WUGA 5F61A 5AMEA 4LYWA 2YDWA 5G4SA 5H1UA 4N4HA 4QY4A 4CLBA 4O78A 4QUUA 5EV9A 4YYHA 4TU6A 2I7KA 4BW1A 4IORA 4NYXA 4CUPA 5FDZA 2D82A 4LC2A 4Z1QA 5FE3A 5EWCA 4TZ8A 5KTWA 4HXRA 3MXFA 5DBMA 2KTBB 5IG6A 4YH4A 5IGNA 3TLPA 5EP7A 5C87A 4E96A 3UW9A 4OGIA 3HMFA 5A81A 4NXJA 3LQHA 3DWYA 4QSRA 5HELA 5K29A 4HBWA 5FH6A 4QSXA 5C8GA 5LJ1A 3U5LA 4A9HA 5L97A 5I7YA 5LKXA 5I80A 4O72A 4BW3A 5D3LA 4LYSA 5E7DA 4UIYA 5A5NA 2WP1A 5ENEA 4N3WA 3P5OA 5HCLA 3U5JA 4PTBA 5CP5A 4MR5A 5DW2A 4QSWA 4GPJA 3HMHA 3U5KA 5F3AA 4ALGA 5EGUA 3UV4A 4YY4A 3NXBA 5HRXA 5E9LA 5D3RA 5CQ3A 2MJVB 4A9OA 4Z6IA 4ZW1A 4FLPA 5H85A 4Q0OA 4YYGA 5EISA 3ONIA 5DW1A 5D3PA 5DLXA 5L8UA 5CTLA 4XYAA 3SVGA 4BHWA 5F36A 5FE2A 4LZSA 5FG6A 2R10A 1E6IA 4QSTA 3Q2EA 4O7BA 5AD2A 4KV4A 4QSQA 4CUUA 4LYIA 4QC3A 4IOOA 3UV2A 4PS5A 4UIUA 4ZQLA 4CFKA 4NRAA 5A7CA 5CQ7A 4QC1A 2DATA 5E9VA 4YABA 4Q0NA 4NUCA 5CZGA 5CQTA 4N4FA 4LDFA 5ENGA 5HEMA 4IR5A 5L96A 5F62A 5F60A 4LR6A 5ETBA 5ENFA 2RFJA 4YC9A 5I7XA 2DWWA 5FBXA 5A85A 4BJXA 3LXJA 3G0JA 4HXPA 4QR5A 3IU6A 5D3HA 2R0YA 4TYLA 4NUEA 5C89A 5LVRA 3O35A 3G0LA 5C4QA 5EK9A 4BW4A 5KTXA 5C7NA 3P1FA 5D3JA 3LQJA 4WIVA 4NYWA 5E9IA 4ALHA 5LKUA 2L84A 5FH8A 5FFWA 5HFRA 4A9NA 5DX4A 3JVKA 3UV5A 5HQ7A 4YYIA 2OUOA 4UITA 5F1LA 4WHWA 5D24A 4YADA 5FE4A 3U5OA 4O74A 3SVFA 3P1EA 4O7EA 4YAXA 4N4GA 5CFWA 4O75A 3UVXA 3U5PA 4QYLA 5IIDA 3QZSA 4NR8A 5CUBA 1JSPB 4MEPA 4ZC9A 2RNWA 4AKNA 4HBVA 5CQ4A 4XUAA 4QR4A 2OO1A 4CL9A 4XY8A 4UYFB 2DVRA 5I83A 3D7CA 5F1HA 4YBTA 3ZYUA 3UVYA 1N72A 2DVSA 5II2A 5D0CA 3IU5A 4UYDA 5A82A 3I3JA 3RCWA 5H1TA 5FB1A 3LJWA 1WUMA 4MENA 5ACYA 5G4RA 2E3KA 5CUDA 5F2PA 4TT2A 5TCMA 5EWVA 4UYHA 3JVJA 5FG4A 2RS9B 5A5OA 4OGJA 5A5PA 4O7CA 5F5ZA 1F68A 4QNSA 4UYEA 5A5QA 5CQAA 5EPRA 4UIVA 5II1A 4YBMA 5HQ6A 4QSPA 5FB0A 5I40A 4TU4A 4HBYA 4HXLA 5DY7A 4QUTA 4NR4A 2L5EA 5CUEA 2DKWA 4A9MA 4HXSA 4TT4A 5CUAA 3S92A 5ENIA 4NR9A 4IOQA 4TT6A 4A9JA 1ZS5A 5LKTA 2L85A 4NR7A 4NYVA 5EQ1A 1JM4B 3LQIA 4UIWA 4PY6A 2H60A 4KCXA 5F63A 3QZTA 5HJCA 4C66A 4QZSA 5IBNA 4YYMA 4QR3A 2G4AA 3SVHA 5ENJA 4Z6HA 5FE8A 5EICA 5CQ8A 2FSAA 2YEKA 3UVDA 4QBMA 5FG5A 4YY6A 3P1CA 5DFDA 5FE9A 4QEVA 4Z1SA 5KU3A 5D26A 2RI7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5LJ2A 5E0RA 3UVWA 2YELA 5DYAA 4MEOA 5BT5A 5E9MA 5DKDA 5E3GA 5LJ0A 4CURA 3QZVA 5J0DA 5D3NA 4QSSA 5I1QA 4CFLA 4QSUA 4IR6A 3MQMA 2RO1A 4IR3A 4UIXA 4MR6A 4YATA 4TZ2A 5LVQA 5DFBA 5EU1A 2RNYA 3S91A 3AQAA 3MB4A 5D25A 5CRZA 5A5SA 5I29A 4QYDA 4O76A 4PCIA 5D3TA 3MUKA 4TTEA 4AI6A 4O7FA 5CU8A 5D7XA 5EPSA 4O77A 5JWMA 4A9LA 5FE6A 5ENHA 5DYUA 4NQNA 5ENBA 3AADA 5E73A 4LZRA 5FE1A 4CUQA 5I86A 3O37A 5DKHA 5BT4A 5CS8A 4NQMA 5D3SA 4F3IA 4CUSA 5HLSA 2WP2A 2F6NA 5FFVA 3D1DA 5I89A 4YK0A 3O36A 4Y03A 3MB3A 4YH3A 5FH7A 4A9KA 5EWWA 5CPEA 3U5MA 5DKCA 4QEWA 5A83A 5IGMA 5DFCA 3GG3A 2LSPB 4HXMA 5EPBA 5KHMA 5HFQA 3MULA 4QSVA 4YBSA 2EJNA 5EI4A 4UIZA 4NUDA 4HXKA 3O34A 4O7AA 4UYFA 4QEUA 3U5NA 1EQFA 2YW5A 4XY9A 4HXNA 4KV1A 5HENA 4NRCA 5IGKA 4NR5A 2DVQA 5F25A 5ENCA 5CQ6A 5HRWA 3O33A 4J1PA 2DVVA 2GRCA 2R0SA 4YYKA 5TB6A 2N9GA 4J3IA 5L98A 5CUGA 4O71A 4NRBA 2YEMA 5FFYA 3DAIA 4J0SA 4AKGA 5CRMA 4IR4A 3HMEA 5H1VA 3P1DA 2RNXA 2OSSA 5HRVA 5I88A 4TQNA 5CQ5A 4UYGA 5HM0A 3JVMA 3JVLA 5E3DA 2YYNA 4RVRA 5EWDA 5AD3A 4HXOA 5KO4A 5E9YA 4J0RA 4MR3A 5FE0A 4MEQA 4LRGA 4N4IA 5DLZA 2E7OA 5E9KA 5EVAA 2YQDA 3Q2FA 4YYDA 4BW2A 4TS8A 2D9EA 5LKZA 4X2IA 4A9FA 4QB3A 4WHUA 5BT3A 5CUCA 4NS5A 5AMFA 5COIA 3K2JA 4YYJA 4DONA 5L8TA 5IGLA 4PKLA 5KTUA 5L99A 4Z93A 2E7NA 4LZ2A 2R0VA 5FE5A 5EM3A 5C85A 2I8NA 5LUUA 2F6JA 5ETDA 4YYNA 3FKMX 4CUTA 5A5RA 4MR4A 5DYXA 5JI8A 5DYCA 4O70A 5CY9A 4A9EA 5HQ5A 1X0JA 4XUBA 4NR6A 5EWHA 4HBXA 2NXBA 5CGPA 5EA1A 5FE7A 4C67A 4PCEA 4A9IA 4OUFA 5E74A 1WUGA 5F61A 5AMEA 4LYWA 2YDWA 5G4SA 5H1UA 4N4HA 4QY4A 4CLBA 4O78A 4QUUA 5EV9A 4YYHA 4TU6A 2I7KA 4BW1A 4IORA 4NYXA 4CUPA 5FDZA 2D82A 4LC2A 4Z1QA 5FE3A 5EWCA 4TZ8A 5KTWA 4HXRA 3MXFA 5DBMA 4AKIA 2KTBB 5IG6A 4YH4A 5IGNA 3TLPA 5EP7A 5C87A 4E96A 3UW9A 4OGIA 3HMFA 5A81A 4NXJA 3LQHA 3DWYA 4QSRA 5HELA 5K29A 4HBWA 5FH6A 4QSXA 5C8GA 5LJ1A 3U5LA 4A9HA 5L97A 5I7YA 5LKXA 5I80A 1ZKRA 4O72A 4BW3A 5D3LA 4LYSA 5E7DA 4UIYA 5A5NA 2WP1A 5ENEA 4N3WA 3P5OA 5HCLA 3U5JA 1PUOA 4PTBA 5CP5A 4MR5A 5DW2A 4QSWA 4GPJA 3HMHA 3U5KA 5F3AA 4ALGA 5EGUA 3UV4A 4YY4A 3NXBA 5HRXA 5E9LA 5D3RA 5CQ3A 2MJVB 4A9OA 4Z6IA 4ZW1A 4FLPA 5H85A 4Q0OA 4YYGA 5EISA 3ONIA 5DW1A 5D3PA 5DLXA 5L8UA 5CTLA 4XYAA 3SVGA 4BHWA 5F36A 5FE2A 3D1BA 4LZSA 5FG6A 2R10A 1E6IA 4QSTA 3VKGA 3Q2EA 4O7BA 5AD2A 4KV4A 4QSQA 4CUUA 4LYIA 4QC3A 4IOOA 3UV2A 4PS5A 4UIUA 4ZQLA 4CFKA 4NRAA 5A7CA 5CQ7A 4QC1A 2DATA 5E9VA 4YABA 4Q0NA 4NUCA 5CZGA 5CQTA 4N4FA 4LDFA 5ENGA 5HEMA 4IR5A 5L96A 5F62A 5F60A 4LR6A 5ETBA 5ENFA 2RFJA 4YC9A 5I7XA 2DWWA 5FBXA 5A85A 4BJXA 3LXJA 3G0JA 4HXPA 4QR5A 3IU6A 5D3HA 2R0YA 4TYLA 4NUEA 5C89A 5LVRA 3O35A 3G0LA 5C4QA 5EK9A 4BW4A 5KTXA 5C7NA 3P1FA 5D3JA 3LQJA 4WIVA 4NYWA 5E9IA 4ALHA 5LKUA 2L84A 5FH8A 5FFWA 5HFRA 4A9NA 5DX4A 3JVKA 3UV5A 5HQ7A 4YYIA 3VKHA 2OUOA 4UITA 5F1LA 4WHWA 5D24A 4YADA 5FE4A 3U5OA 4O74A 3SVFA 3P1EA 4O7EA 4YAXA 4N4GA 5CFWA 4O75A 3UVXA 3U5PA 4QYLA 5IIDA 3QZSA 4NR8A 5CUBA 1JSPB 4MEPA 4ZC9A 2RNWA 4AKNA 4HBVA 5CQ4A 4XUAA 4QR4A 2OO1A 4CL9A 4XY8A 4UYFB 2DVRA 5I83A 3D7CA 5F1HA 4YBTA 3ZYUA 3UVYA 1N72A 2DVSA 5II2A 5D0CA 3IU5A 4UYDA 5A82A 3I3JA 3RCWA 5H1TA 5FB1A 3LJWA 1WUMA 4MENA 5ACYA 5G4RA 2E3KA 5CUDA 5F2PA 4TT2A 5TCMA 5EWVA 4UYHA 3JVJA 5FG4A 2RS9B 5A5OA 4OGJA 5A5PA 4O7CA 5F5ZA 1F68A 4QNSA 4UYEA 5A5QA 5CQAA 5EPRA 4UIVA 5II1A 4YBMA 5HQ6A 4QSPA 5FB0A 5I40A 4TU4A 4AKHA 4HBYA 4HXLA 5DY7A 4QUTA 4NR4A 2L5EA 3ERRA 5CUEA 2DKWA 4A9MA 4HXSA 4TT4A 5CUAA 3S92A 5ENIA 4NR9A 4IOQA 4TT6A 4A9JA 1ZS5A 5LKTA 2L85A 4NR7A 4NYVA 5EQ1A 1JM4B 3LQIA 4UIWA 4PY6A 2H60A 4KCXA 5F63A 3QZTA 5HJCA 4C66A 4QZSA 5IBNA 4YYMA 4QR3A 2G4AA 3SVHA 5ENJA 4Z6HA 5FE8A 5EICA 5CQ8A 2FSAA 2YEKA 3UVDA 4QBMA 5FG5A 4YY6A 3P1CA 5DFDA 5FE9A 4QEVA 4Z1SA 5KU3A 5D26A 2RI7A
chains in the Genus database with same CATH topology
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