4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
3Q9TA 4Y4NA 3GD3A 1JEHA 2BS3A 5JCMA 3KU9A 2ZBWA 1SEZA 3AE2A 2VOUA 3FBSA 2YVFA 2Z5XA 3P4SA 1DOBA 3EAOA 3LOVA 2GH5A 1O5WA 2X50A 2VQBA 5M10A 2OALA 1OJTA 1ZK7A 1GRHA 3VQRA 4I59A 1GT8A 1NDAA 3AE9A 4NTCA 3CNTA 1CC2A 3WE0A 5KWFA 4B65A 2R9ZA 2Y6RA 2VVMA 4Y4MA 1GERA 4YTNA 3L8KA 3ISHA 3K7TA 1JRZA 4OPUA 4U8PA 1Y56A 4MJWA 2C66A 3CPIG 1M6IA 2XDOA 2AAQA 1IUUA 3LXDA 2Q0KA 1VG0A 4EM3A 3VR8A 1GRAA 4BK2A 4C77A 2A8XA 4EIPA 4AT2A 4YKGA 1KSSA 4JN9A 1IUVA 2EQ8A 2FJBA 5U1OA 4J56A 4X9NA 3CGDA 1LVLA 1EL5A 2GR3A 3VRAA 4YSXA 1O94A 1PBBA 2GRTA 2RGHA 2WOWA 2XFQA 3NTAA 4H4XA 4TLXA 1NENA 3NK0X 4EQRA 4ZCDA 2YLRA 4CY8A 1JOAA 1ELIA 1S2QA 2FJDA 3FG2P 1N4WA 1CJ2A 2VZ2A 1K0JA 4NTDA 1QLBA 4OPCA 5ER0A 5C3JA 2C3CA 3NYCA 3NHOX 2Q6UA 3COXA 4H4ZA 4I58A 2YM1A 2V5ZA 3EPTA 2W0HA 2XVJA 5CKUA 1LJ1A 3S5WA 4GCMA 1CC4A 2BXRA 2X3NA 1CJ4A 1XPQA 2OLOA 3II4A 1H81A 4YSYA 4OPDA 4EQSA 4H4RA 1NEKA 4EMJA 3AD7B 4CNKA 3C4AA 1Q1RA 1PXAA 1D7LA 3OC4A 1H7XA 3JSKA 1KNRA 1H86A 2C73A 2R0PA 3F8PA 3M12A 1GXFA 4EQXA 3CPJG 3SFDA 1GNDA 2XFNA 3KKJA 3QJ4A 3SM8A 3UKHA 2YVGA 2ARDA 1KFYA 5LV9A 2WOIA 4Y4LA 2YR4A 1CBOA 1CJCA 3DJJA 1LTXR 3GMCA 5EOWA 3VRBA 4P9SA 4B63A 4B68A 1PXCA 3DK8A 3G5QA 4WX1A 2BYBA 2EQ7A 4U8IA 1NHPA 1PHHA 2R46A 1JNZA 2GQWA 1EL9A 1GOSA 2WPCA 1NG3A 3HZLA 2YG4A 3GSIA 4BJZA 1B8SA 2QCUA 3IC9A 4H4YA 1EBDA 3AEFA 1H6VA 4J2WA 4DSGA 5BULA 3CNDA 1JRYA 2B9WA 3AYJA 4PAAA 5CQFA 5GRTA 4A6NB 2Z5YA 3DMEA 4K5RA 2PHHA 4JNAA 3NN0X 2C67A 2WQYA 4GDPA 3UKFA 1Z6LA 4BK1A 2WDQA 5KVIA 2QA2A 2AQJA 2F5ZA 2CVJA 1RSGA 1Q1WA 2BS2A 4BV6A 1ZOYA 3M13A 4C3YA 4UDPA 3ZYXA 2ZZBA 3NRNA 4H2RA 3ICSA 1XANA 1UKVG 1H84A 2BK3A 5J60A 1CJ3A 5BRTA 4U2TA 3AD8B 1OJAA 3CNPA 4B67A 4X4JA 3ATQA 4LIIA 3F8RA 4NEVA 1E39A 5KRQA 4WCTA 4KX6A 5HY5A 2XVFA 1OJCA 3IHMA 1GRGA 4A99A 2O9ZA 4A6NA 2C76A 4CRTA 5HHFA 2EQ9A 2JKCA 1GPEA 4U2SA 4U8NA 1BKWA 2XFPA 2Q0LA 2B7RA 4H2QA 5IQ1A 5BUKA 3RP7A 2WPFA 1RYIA 1BF3A 2BCPA 3AEAA 4TM3A 1LPFA 1JRXA 3ICTA 4UDRA 3NH3X 4JY2A 2I0ZA 2JB2A 2Q7VA 3K7QX 4J36A 4TM0A 1F8WA 1BGJA 1MOKA 3B3RA 2E5VA 5FS7A 3IWAA 4U2LA 1VG9A 4IVOB 2C70A 2H89A 1N1PA 1ZMDA 3C4NA 1CC6A 1QO8A 1KSUA 4DGKA 1DJNA 4YKFA 3F8DA 5EB5A 1N4VA 5DBJA 3M0OA 1Q9IA 2IVDA 2VVLG 1K0IA 3CPHG 5J7XA 2B76A 3LADA 2X99A 4GR1A 2BK5A 2BK4A 1L9EA 1E1KA 3ABVA 4NZHA 4C5OA 2C75A 2OLNA 3QSMA 2YR5A 1IJHA 1KF6A 1DJQA 1E7PA 2WP9A 1GALA 2XLRA 4FX9A 3AEGA 2B9YA 4A7AA 1K4QA 3CNSA 3AD9B 4A5LA 3GMBA 3ICRA 2IIDA 3UTGA 2BCGG 2QAEA 4H4VA 1TDFA 4U8OA 1F3PA 5FS6A 3UKPA 5JCKA 1NG4A 3RP6A 1RP0A 3NYFA 3LZXA 3KA7A 1GTHA 4U8LA 3T37A 4AOSA 5BVAA 1PDHA 1ZMCA 2JK6A 3CGEA 3UTHA 1B5QA 2C7GA 2V6OA 3BI4A 4OPIA 5IPYA 3BNMA 4TM4A 1L0VA 1LQUA 1ZP0A 1XDIA 4AOXA 3DA1A 5GSNA 1FOHA 1D4CA 2GQFA 3QSEA 2Y6QA 4UDQA 2JBVA 1PJ6A 2VRMA 4ZCCA 3CTYA 3H4KA 1PXBA 2CDUA 1M64A 4PABA 2QA1A 3IF9A 4H2PA 3REDA 1JU2A 1ZDLA 2YWLA 3AE6A 3AECA 1VDCA 2R0GA 2B9XA 1NHRA 4Z2RA 2CULA 1ZKQA 2V61A 2XYOA 3NNEA 3P9UA 2WP6A 4XXGA 3FPZA 4C74A 4EMIA 3B6DA 4Z2TA 4B1BA 1FEAA 2E4GA 2YQUA 4U8MA 4Z2UA 1P2HA 1S2YA 4X9MA 3UKLA 1TYTA 3AE8A 4XWZA 3K30A 1B4VA 1L9DA 1ZY8A 3BI5A 5IQ4A 2WU2A 3NK2X 3ADAB 4B64A 3G5RA 4DSHA 1BZLA 2YVJA 3EANA 3NG7X 4OPTA 5FMHA 2GMJA 3UP4A 2XLUA 1REOA 3GYIA 4BURA 3PVCA 3QSSA 4U8KA 4LA1A 3AE7A 3KLJA 4M52A 2DKHA 4JDRA 2CFYA 3S61A 4B69A 3NN6X 2YM2A 3P4QA 2WBAA 3GRTA 1IUWA 4J34A 3CGCA 4AT0A 1CL0A 1FEBA 2WP5A 4GRTA 4EM4A 2RABA 2ZZ0A 3O0HA 3NKSA 4A65A 3UKAA 3LB8A 3UOXA 1PBFA 2BACA 3DJEA 1GESA 1O95A 5L46A 2A87A 1CHUA 2R0CA 3GDNA 2VVLA 4U8JA 3LJPA 3GYJA 1GV4A 4YTPA 1OJDA 2FJAA 2GV8A 1MXTA 2EQ6A 2GR2A 5TR3A 1GRBA 3FMWA 3H8IA 4C3XA 4Z26A 5KOXA 1FCDA 2GAHB 2XFUA 1BGNA 1H82A 2R4EA 3NIXA 4Z43A 4Z25A 2GF3A 1F8RA 2V3AA 4J33A 1TRBA 2WS3A 2WETA 3UOVA 1GEUA 4FDCB 4OVIA 2YLXA 1ZOVA 2WESA 2XLSA 3AWIA 3GWFA 3ALMA 4GUVA 4IVMB 4NEWA 4ECHA 1IUTA 2YR6A 3DGZA 1KDGA 2E1MA 4OPGA 3I3LA 1X31B 3AYIA 3CN8A 2VQ7A 2AR8A 1DODA 2V60A 1FECA 4UP3A 4HB9A 5JCNA 1ZX9A 2HQMA 1CF3A 2A89A 2YG7A 1GTEA 1TDKA 2YG5A 2OA1A 4H4WA 3UP5A 4RG3A 5JCLA 2WPEA 2X8CA 1YY5A 3BNUA 2WU5A 2RGJA 3BHKA 1NPXA 4H7UA 4APNA 1NHQA 1E1LA 2C64A 3AB1A 3H8LA 3ATRA 3AE1A 1GREA 3GDPA 3UKQA 4YXDA 5KOWA 3IHGA 3P4RA 4AP1A 1V59A 2J3NA 2WHDA 1MO9A 1E1NA 2BABA 2RGOA 4OPLA 3E1TA 3ITJA 4EMWA 4YSZA 3DH9A 2YAUA 2XVEA 1GRFA 4IA6A 3GWDA 3NTDA 1DXLA 1BWCA 2X8HA 2WOVA 1F6MA 1P2EA 3V76A 1YKJA 1IUXA 2FBWA 2NVKX 1COYA 3ALJA 4A9WA 2ZZCA 1KNPA 2GMHA 2XFOA 3RP8A 4RG4A 5HXIA 4EQWA 3P4PA 3PO7A 1PN0A 1S3BA 3LZWA 4TM1A 3VR9A 2XLPA 3D8XA 3DJDA 3VRDB 4J57A 2GB0A 2YG6A 4USRA 1D7YA 1TDOA 5HYMA 4IV9A 3D1CA 4GDEA 4HA6A 1E6EA 5U63A 1D4EA 1Y0PA 3DGHA 2GR1A 3EF6A 4OCGA 4Z44A 2VRLA 3KVEA 3Q6JA 4H4QA 4YTMA 1GRTA 4TLZA 3L1RA 2X8GA 3AEDA 2WDRA 2C72A 1GSNA 3RHAA 3CIRA 4CNJA 4EIQA 2C65A 2WEUA 1PJ7A 2TPRA 3AE5A 3QFBA 4BK3A 1EL7A 1VQWA 4H50A 2PYXA 4RSLA 3R9UA 3UOZA 4GF7A 4H4TA 3NGCX 1YQ3A 1H7WA 1PBCA 2YLTA 3KD9A 2BC0A 4NTEA 2JB3A 5KXJA 1B37A 3PS9A 1AOGA 3C96A 4LU6A 1JNRA 4E0VA 1QJDA 1LV0A 3QFAA 2BA9A 1ONFA 1PJ5A 5KVHA 4DNAA 2TMDA 2FJEA 4FK1A 4H4UA 5EBKA 2YG3A 1W4XA 3OZ2A 4YT0A 1YQ4A 2JAEA 4XWRA 4H4SA 4D03A 1PBDA 1VRQB 2JB1A 2GVCA 1H83A 1HYUA 2R4JA 2IVEA 4YWOA 3CNJA 4ADWA 3AXBA 3GD4A 3UCLA 3NLCA 4A79A 4CBQA 1TDEA 4ICYA 3NK1X 3UOYA 1DOEA 2DKIA 3AYLA 1D5TA 5FS9A 4K2XA 3SGLA 4J31A 1IUSA 1PBEA 3AE4A 4YSHA 1N4UA 2GEWA 3SQPA 4BJYA 3RNMA 2OAMA 2XVHA 4N9XA 3V3OA 2BXSA 3FIMB 1LQTA 5U25A 3NT6A 3G5SA 1D4DA 2BC1A 3UKKA 4ZN0A 2GR0A 3BHFA 3CGBA 3ZDNA 5C2TA 2YLWA 1NHSA 2BS4A 2R45A 1OJ9A 3KPFA 3QVRA 3AEEA 3URHA 1DNCA 2YLZA 1DOCA 2XCGA 1GETA 2XLTA 2GAGB 3DK4A 3QVPA 1L9CA 4AP3A 3BI2A 4K8DA 5FS8A 3UTFA 4O5QA 1E1MA 3DK9A 2B7SA 4CY6A 3SFEA 2YLSA 1XHCA 4CCRA 5EB4A 2UZZA 4H2NA 4D04A 4JQ9A 2XVIA 3ALLA 3GRSA 1EL8A 4CCQA 3DJGX 4H4PA 1NAAA 4B66A 2APGA 4KPRA 1YQZA 4Z24A 5JCIA 1F8SA 4IA5A 1TYPA 4JNQA 3AEBA 3NYEA 4USQA 1PS9A 1TDNA 3V3NA 1S3EA 3UTEA 4K22A 1FL2A 5M0ZA 1K0LA 3K7MX 1Y56B 4O5UA 4K5SA 4FK1C 2WDVA 4JY3A 3AE3A 2ACZA 2C3DA 4K7ZA 2NPXA 2V3BA 3I6DA 3P1WA 2H88A 4REKA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3Q9TA 4V1Ag 3RHCA 2ZBWA 4KB3A 2XHFA 1SEZA 3AE2A 2FWGA 2AAWA 2VOUA 2HNLA 4FYCA 2B7JA 3GYKA 1XWGA 2R4VA 2VQBA 5M10A 2OALA 2C4CA 4FYBA 4NTCA 3CNTA 2WFCA 2BJXA 5KWFA 3PR8A 6GSUA 2PBJA 1ST9A 4MJAA 1JHBA 4U8PA 2C66A 4DSSB 1X9SB 3CPIG 3LXDA 2Q0KA 6GSWA 3TRXA 1GRAA 1TKDB 1S3DA 2RUFA 1KSSA 1IUVA 2EQ8A 5U1OA 5J3RA 3QAWA 4ECCA 3TKSE 1LVLA 1ZYEA 4O92A 2A2RA 2GR3A 3VRAA 3WGXA 1MEKA 1PBBA 2GRTA 2RGHA 2PMTA 4H4XA 3NK0X 4EQRA 4KGIA 3FG2P 4TXVA 1ELIA 1XIYA 4KSOA 4NTDA 2XC2A 5G1LA 2HSYA 2YM1A 5DDLA 4EC0A 2E2MA 2CX4A 2X3NA 1XPQA 3II4A 2AB6A 4OPDA 4WBJA 4EQSA 5EY6A 3HYXA 2JL4A 5ECKB 3TJKA 5HFIA 5IO2A 1A8LA 2C73A 2R0PA 3F8PA 2AV4A 1XWCA 4GSNA 1CQGA 1ZZYA 3UKHA 3DVWA 1WOUA 3ZLPA 3UL3A 4Y4LA 3KIJA 1CBOA 1VRSD 5EOWA 3VWXA 3VRBA 1PXCA 3E9JB 1TRUA 4WX1A 4U8IA 1XWKA 2R46A 2GQMA 1JNZA 4PUAA 3LXTA 1NG3A 4J2FA 2XBQA 4XCSA 1B8SA 1DBYA 5EPFA 4G9KA 3LORA 5CQFA 2WULA 2YCDA 3FW2A 2K6VA 4KDUA 2C67A 4PX1A 3ZVJD 5A5KA 3M3MA 4N10A 2F5ZA 1XCCA 2B5EA 1Z7PA 2CVBA 3Q6OA 4C3YA 5HFKA 3ICSA 1XANA 2HZEA 5A4UA 4POMA 2CVDA 4A5PA 3CNPA 1E39A 4WCTA 2DSAA 3TOTA 5HY5A 2K18A 4NV5A 3IHMA 3HVXA 3IR4A 3Q18A 2AYTA 6GSVA 3D4MA 5HHFA 2EQ9A 1XWAA 1GPEA 2FGXA 2L4CA 4YSZA 4HS1A 1GTAA 2Q7VA 1BGJA 4YH2A 3VURA 2I4AA 4GQCA 4JR4A 5FS7A 2JZRA 4IVOB 4F2IA 4HU9A 4LL4B 4OFMA 2XPDA 4ECIA 1ZMDA 1CC6A 4DGKA 1DJNA 4YKFA 5DBJA 3O76A 2OBIA 1ERUA 3M0OA 3SZWA 3L9VA 5J7XA 1PKZA 2REMA 1AW9A 4GR1A 3IBHA 2IFQB 1KBNA 3QSMA 2YR5A 1IJHA 1DJQA 3T14A 2DJ3A 3FZ9A 1Z3EA 4YAVA 2WP9A 5D93A 4FX9A 3AEGA 3T2YA 3ME7A 4A7AA 5LNKe 3CNSA 5DCGA 3GMBA 2BCGG 13GSA 4PGTA 4U8OA 1F3PA 3S9FA 5JCKA 3RP6A 1RP0A 3LZXA 2VM2A 3KA7A 4U8LA 3T37A 8GSSA 1ZMCA 1ZCPA 3PPUA 3UTHA 2TRCP 1PGTA 3UBKA 3BI4A 3EMXA 1L0VA 2I9HA 4J57E 5KN3A 1U3IA 1M64A 4PABA 1E2YA 3IF9A 3REDA 1JU2A 1ZDLA 3F6FA 3L78A 2GSTA 2V61A 3MSZA 1ZKQA 1A8YA 2ZUPA 1HNAA 2C3QA 4XXGA 2PVQA 1OE8A 5CP1A 2PVOC 1RW1A 1B4VA 1JZOA 2E0QA 4B64A 5KMRA 2YVJA 2L5OA 3KZQA 14GSA 2QGVA 4IS0A 2XLUA 5CRDA 5DJMA 4IQAA 2OE0A 4U8KA 1XOAA 2YV9A 4OO5A 2CFYA 4I2UA 3BCIA 4YAPA 3KXOA 4I8BA 3UOMA 2YM2A 2LQQA 2WBAA 3GRTA 1GRXA 2DC5A 1CL0A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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