4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
b'SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
1PBEA 4AT0A 4AP3A 1PDHA 1Q9IA 3CPJG 1H81A 3F8PA 2GQWA 3ALMA 2YG3A 2X8HA 4J33A 5U25A 4E0VA 2YM1A 1BKWA 2GV8A 1CJ4A 3NTDA 1TDOA 4HA6A 4RG4A 1GRAA 3AD7B 4IV9A 4RSLA 3QVRA 3AE2A 2C70A 1TDEA 1D4CA 4Z25A 4TM3A 5HY5A 3CNDA 3KU9A 1S2YA 4P9SA 3LZWA 2R4EA 3RP6A 2WP9A 2R46A 2FJEA 3RNMA 5J7XA 3GWDA 3FIMB 1TYTA 4U8NA 4JN9A 3GD4A 3WE0A 2PHHA 4AT2A 4BK2A 3UKFA 4H4UA 3PO7A 2VVLG 2UZZA 2EQ7A 3CTYA 3ZDNA 1GREA 4M52A 4CCRA 5KOWA 1ELIA 1ONFA 1H82A 2FJDA 1B37A 3EF6A 4Z2RA 4OPIA 2C66A 3SQPA 2Y6RA 2C3DA 3NYEA 4X4JA 1FEBA 3K7MX 3ALLA 1Q1WA 3AE1A 4WCTA 4U8MA 1CJ3A 3NN0X 2QA1A 1XHCA 1YKJA 3FPZA 4EMIA 5HHFA 3UCLA 1BF3A 2YR4A 3AWIA 1BWCA 2RGOA 2B9XA 5C3JA 4EIQA 4K7ZA 3G5SA 2H88A 4BJYA 4CCQA 4NEWA 2F5ZA 4H7UA 1LV0A 2X50A 1NG3A 3D8XA 1XANA 2VOUA 4JNQA 2GEWA 3IF9A 4GDEA 2DKIA 3NNEA 3GYIA 2C67A 3QVPA 1GV4A 3NLCA 3GMBA 1B8SA 2XLRA 1JU2A 1LPFA 3UKLA 3AEBA 1CC2A 1TRBA 2A87A 3AE8A 3OC4A 2Q0LA 1GRHA 1ZMCA 5KVIA 1E1KA 1Y56B 3LB8A 3SM8A 3UP4A 4YTPA 3AEGA 1JNRA 3RHAA 1N4UA 4B63A 1IUWA 4YXDA 4K5RA 3V3NA 3QFBA 1MO9A 3KD9A 3BI2A 2J3NA 2WP5A 3KA7A 5KXJA 2BS3A 3ABVA 1EL7A 5JCLA 5KWFA 3AECA 1YQ3A 5BRTA 1JRXA 3GDPA 2YVJA 4H4TA 4OPUA 4H2NA 4U8OA 2VQBA 2YLZA 1BGJA 3NT6A 2QCUA 5LV9A 3P1WA 2R0PA 2YVFA 4GDPA 1BZLA 3FBSA 2FJBA 3KLJA 4Z26A 5L46A 3NHOX 4K5SA 1H83A 1Z6LA 4NEVA 4A5LA 4Y4LA 4REKA 4U8LA 4AOXA 2Q0KA 3BNUA 1PXCA 2BABA 3II4A 1CC6A 2WS3A 4NTCA 4OPDA 2Q7VA 2YWLA 2JB3A 5FS8A 3IHMA 4NZHA 3S61A 2X8GA 1JRZA 4DNAA 4B65A 4O5QA 3AEAA 4GR1A 2CVJA 1GOSA 4H4PA 4K22A 5EOWA 5EBKA 1BGNA 2GVCA 2XCGA 1Q1RA 2YR6A 4H4WA 4OCGA 2BACA 2AAQA 4H4QA 1ZY8A 2DKHA 2OAMA 2R45A 4I58A 2V60A 5BUKA 4JDRA 2VVLA 3NRNA 4CNJA 3GSIA 4JQ9A 4D04A 3AYJA 2XFUA 2C76A 1KFYA 3E1TA 5DBJA 4H4YA 4TLXA 3BNMA 5FS9A 2ACZA 2XVHA 2WP6A 4FX9A 5U1OA 3VR8A 1N4VA 1OJCA 3NYFA 4YSXA 4Z44A 1PJ6A 3EAOA 4A6NB 2R0CA 2Z5YA 2GMJA 4J31A 2NPXA 3FMWA 3T37A 1VDCA 3ATQA 1P2HA 2A89A 2XFNA 3O0HA 5JCMA 2JAEA 4ZCDA 2ZZCA 2WU2A 3DK4A 3CPHG 2YLSA 1REOA 1NDAA 4OPCA 4UDQA 3CNTA 4CBQA 3JSKA 4EM3A 1FL2A 3NKSA 3REDA 4EQWA 4ADWA 3DA1A 2R9ZA 2CULA 3Q9TA 2IVEA 4A9WA 3ADAB 4DSHA 4YKFA 3AE7A 2GB0A 2X99A 1GERA 1NENA 2C3CA 3DJEA 3LXDA 1DOEA 1NHPA 2E1MA 3NH3X 4H2RA 4LIIA 2AQJA 3UKKA 1LJ1A 3M12A 4Z24A 2AR8A 3VRDB 4C3XA 3GRTA 1E1LA 3NYCA 1Y56A 1PBFA 3ITJA 4J34A 2YLRA 4H2PA 1GRBA 3COXA 3LOVA 2RGJA 2I0ZA 3QFAA 3UKHA 3UOZA 1O95A 2XLUA 2CDUA 3B6DA 3GDNA 1XDIA 4JY3A 3P9UA 1ZK7A 1GXFA 3UOXA 2BK5A 1IUTA 4K8DA 5KRQA 1B4VA 4UDPA 3PVCA 2EQ9A 4B1BA 1ZKQA 3C96A 3ICTA 2OA1A 4B67A 4BK1A 2GAGB 4J36A 4A65A 3HZLA 4FK1A 5BVAA 3AEEA 3QSMA 2C72A 4ZN0A 3EPTA 1GRGA 1P2EA 1HYUA 1OJDA 2BS2A 2YLTA 1B5QA 1RSGA 1ZP0A 1E1MA 1S3BA 4JNAA 4YSZA 3L8KA 1YQZA 4APNA 4C5OA 1RYIA 1NHSA 2V61A 3UTHA 2WHDA 3RP8A 2O9ZA 4LA1A 4UDRA 3RP7A 5JCIA 2C7GA 2BK4A 1GRFA 1S2QA 3B3RA 4U2TA 1JRYA 2XFOA 3SGLA 4I59A 4JY2A 1EL9A 3L1RA 5IQ4A 2IIDA 2WOIA 3K30A 2BS4A 1K0JA 3NGCX 1FOHA 4PABA 3V3OA 1VRQB 3H8LA 2XFPA 4C74A 3KPFA 2C64A 1E7PA 4CY6A 1NEKA 4AP1A 1D7YA 4N9XA 1PJ5A 1DJNA 2B7SA 3AB1A 3P4PA 2GR1A 4H2QA 2VQ7A 4EQRA 4IA6A 3ATRA 3SFEA 3C4AA 1F8SA 1H6VA 1W4XA 2BC0A 2JBVA 1H84A 3AYIA 3C4NA 4H50A 5CKUA 1SEZA 4WX1A 3K7TA 2C73A 3DJJA 1ZDLA 3H4KA 3F8DA 3KKJA 1L0VA 4KX6A 3F8RA 1PN0A 1NHQA 4A6NA 2WQYA 1D4DA 1H7XA 4OPTA 2RGHA 1F3PA 1D4EA 2XVIA 3BHKA 1DODA 1KSUA 4UP3A 3LADA 5TR3A 1IUVA 1FECA 2YLXA 4XWZA 2APGA 1L9DA 2BC1A 1NPXA 2FBWA 2JK6A 3NN6X 2VRLA 1QO8A 2XLPA 4H4RA 1H7WA 1KNPA 1CL0A 1F8RA 4FDCB 3VRAA 2OLNA 3ICRA 5GSNA 1DOBA 3DGHA 2B9WA 3K7QX 3UOVA 4BK3A 4EMWA 4YT0A 4XWRA 3AE6A 5FMHA 1ZOYA 2Y6QA 4EM4A 1PXBA 2C75A 1JNZA 3VR9A 3GYJA 3AXBA 2JB1A 1FCDA 1LVLA 2V5ZA 4J57A 4USRA 3CNPA 5M10A 2BCPA 4H4VA 3AD9B 1CHUA 1PBCA 1RP0A 2ZZBA 1LTXR 4U8JA 4YTNA 1CC4A 4X9NA 3AD8B 4GUVA 2GR3A 1PJ7A 2X8CA 1K0LA 3VQRA 3NG7X 1O5WA 3AE9A 3IHGA 1F8WA 1O94A 1DOCA 1KDGA 4H4SA 4IVMB 3ZYXA 4DGKA 1KSSA 3IWAA 4AOSA 3UKAA 4LU6A 4CY8A 1M6IA 4MJWA 3I3LA 3QSSA 1DXLA 1YY5A 1OJAA 2XVFA 3VRBA 2B7RA 4YSYA 2OALA 2GR0A 3CGBA 1IUXA 1DNCA 2JB2A 2YG6A 3Q6JA 3NK0X 4GRTA 1LQTA 3EANA 5IPYA 2YR5A 1GNDA 3UTFA 1GTEA 2R4JA 4C3YA 3ALJA 3UTEA 2YQUA 1GALA 4J2WA 1ZMDA 3UOYA 4EQXA 1JOAA 1CBOA 3LZXA 1K4QA 2XFQA 1NG4A 3CNJA 2WPFA 5HXIA 2YM2A 4OVIA 1LQUA 5FS6A 4B66A 3SFDA 1CJCA 2OLOA 2XLSA 2QA2A 3BHFA 3CGCA 2IVDA 2ARDA 2EQ8A 1XPQA 4U2SA 1DJQA 2GRTA 1UKVG 1H86A 2Z5XA 4X9MA 4HB9A 4TLZA 1PS9A 3URHA 1EL8A 2XYOA 4Z2UA 4CNKA 2V3BA 3GRSA 3LJPA 2XDOA 5HYMA 2YVGA 1TDKA 2VVMA 3DK9A 2RABA 5CQFA 1QJDA 2XVJA 3AEDA 5KOXA 2GMHA 5JCNA 1TDFA 2HQMA 4J56A 3BI5A 1GT8A 3DMEA 1MXTA 1VQWA 2GAHB 4CRTA 2WOWA 5EB4A 1IUUA 1FEAA 2V6OA 3AYLA 3AEFA 3D1CA 4ZCCA 2GH5A 3GMCA 3FG2P 1EBDA 1PHHA 1E1NA 1Y0PA 2E5VA 2X3NA 2YG7A 2ZZ0A 3GD3A 1GETA 4O5UA 3UKPA 3UKQA 1TDNA 2B76A 2WPCA 3DH9A 4YTMA 2EQ6A 4ICYA 4U8IA 5GRTA 2H89A 1S3EA 2PYXA 4BJZA 1GESA 1D7LA 5JCKA 2WDQA 1YQ4A 4A79A 1D5TA 5FS7A 3S5WA 4A7AA 1AOGA 2VZ2A 3P4QA 4B68A 1IJHA 3CGDA 4NTEA 3H8IA 4EMJA 4OPGA 1IUSA 5IQ1A 2WU5A 3CNSA 4YWOA 1GEUA 2BA9A 2WDVA 4DSGA 4FK1C 1GRTA 1PXAA 3CPIG 4A99A 2BK3A 2B9YA 2XLTA 2YAUA 3CGEA 2Q6UA 3DJDA 4IVOB 5EB5A 3UTGA 4BV6A 2WDRA 1ZX9A 2ZBWA 4NTDA 3KVEA 2WPEA 3AE5A 2C65A 1CJ2A 1QLBA 1ZOVA 4KPRA 1EL5A 3NTAA 2XVEA 4EIPA 3UP5A 2TPRA 3M13A 4EQSA 3CIRA 1M64A 1GTHA 1VG9A 4K2XA 2TMDA 3OZ2A 3QJ4A 3AE3A 2JKCA 2WBAA 3P4SA 3DJGX 4B64A 2BYBA 4TM4A 1MOKA 3M0OA 3NK1X 2BXSA 2YG5A 2NVKX 3ICSA 2WEUA 3NK2X 4GF7A 4BURA 2BCGG 4ECHA 2R0GA 2YLWA 1F6MA 3DK8A 4RG3A 3R9UA 1KF6A 4U8KA 4D03A 3IC9A 4YKGA 5J60A 1V59A 1NHRA 2W0HA 3DGZA 4TM1A 1KNRA 4U2LA 3AE4A 5BULA 4Y4MA 2E4GA 5KVHA 2V3AA 1JEHA 4OPLA 4YSHA 2YG4A 4IA5A 1NAAA 1L9EA 1K0IA 3G5QA 2WESA 5C2TA 3CN8A 3QSEA 3P4RA 1E39A 1E6EA 1N4WA 4GCMA 4TM0A 4B69A 5M0ZA 1GSNA 2WOVA 2BXRA 4USQA 2WETA 3GWFA 4XXGA 1COYA 4H4XA 3BI4A 3V76A 1GPEA 4Z2TA 4C77A 1OJTA 1CF3A 1PBBA 1X31B 2QAEA 2VRMA 3ISHA 2CFYA 5ER0A 3PS9A 3I6DA 1OJ9A 1VG0A 1N1PA 3NIXA 1TYPA 3G5RA 4PAAA 4Y4NA 2GF3A 4H4ZA 2A8XA 5U63A 4Z43A 2GQFA 1L9CA 2FJAA 1PBDA 4U8PA 2GR2A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PBEA 4AT0A 3ISOA 5F0GA 1PDHA 1Q9IA 2H72A 3GH9A 4DSSA 1H81A 2PERA 5FWGA 5J41A 3TOUA 4RG4A 4FH8A 1GRAA 4CW9A 3AE2A 2C70A 7GSSA 2LRCA 5HY5A 3L9VA 4P9SA 3LZWA 2R4EA 4AJ6A 1XVQA 2GTUA 3GWDA 4JN9A 3GD4A 3LSZA 2ZCTA 4J56E 2BJXA 3PO7A 4HQSA 1DSBA 2UZZA 1UA5A 1GNWA 5H5SA 3VPTA 4Q5FA 1WP0A 3BOAA 5KOWA 1ELIA 3BCKA 1H82A 2V6KA 1B37A 4Z2RA 4OPIA 3FY7A 5GAPD 4O32A 5A4UA 1GUHA 1FEBA 3M0FA 2CV4A 3EVIA 1O81A 2H0GA 4WCTA 2YNXA 5IPHA 2JZSA 2FD3A 4FYBA 2MBSA 3ME8A 1CJ3A 1XHCA 1YKJA 3FPZA 2MYGA 4KDXA 3UCLA 2YR4A 1N8JA 3AWIA 1BWCA 5FHIA 4G2EA 2VCVA 2VO4A 2IPAA 4EIQA 3G5SA 3CYNA 4H7UA 5H5RA 4ZIJA 1XANA 2VOUA 2GEWA 3IF9A 3MNGA 3GYIA 4TKYA 3QVPA 1S3AA 3QAGA 3EWLA 3IV4A 4G0IA 1B8SA 2XLRA 3O6TA 2OACA 1LPFA 3UKLA 2HZFA 4L5LA 3AE8A 2DIYA 3OC4A 1GNEA 1GRHA 3MYDA 1E1KA 3G7IA 3I69A 3KP9A 3ERFA 3RAZA 3DD3A 3TUEA 4YXDA 4IN0A 2M72A 2HZEA 1MO9A 3KD9A 2EIRA 3D0ZA 4TXOA 3KA7A 1GLQA 1XPVA 2BS3A 3ABVA 2GVPA 5HR0A 3AECA 1YQ3A 5BRTA 1JRXA 1ML6A 3KXOA 4XRDA 3ZVJD 5AN1A 3CTGA 3NIVA 2VQBA 1QMVA 3L0HA 13GSA 5KN3A 1X9SB 3VLNA 1XIYA 3LGCA 4Z26A 4HS1A 2Q0KA 3BNUA 4L0UA 3UIWA 2Q7VA 3ZMLA 3QMXA 2JB3A 4PQ1A 1YF1A 3AY8A 3AEAA 3L9SA 2CVJA 2PU9C 1GOSA 3M9KA 4DSRA 4K22A 4QL7A 5EBKA 3GKKA 18GSA 4EL1A 1ACVA 5AGYA 2AAQA 4WR4A 3EU4A 2DKHA 2OAMA 5IIZA 4I58A 2V60A 5BUKA 4JDRA 2VVLA 1XVWA 3GSIA 4JQ9A 4D04A 3LORA 1T4ZA 2F3MA 3GHAA 2C76A 3E1TA 1YZXA 2JZRA 2KUCA 4KX4A 4RI6A 1M2DA 4TLXA 1PKWA 4X1UA 5F06A 2IMDA 1F6MC 4HQZA 3NOFA 5G1KA 4DVCA 3NYFA 4PXOA 4YSXA 4MF5A 4YH2A 4A6NB 4KNDA 4ILFA 2JAEA 4ZCDA 2CAIA 2PVOC 3ZFLA 2WU2A 3DK4A 4EC0A 1REOA 1NDAA 4OPCA 1R4WA 4CBQA 3JSKA 3NKSA 3REDA 1BG5A 3UMAA 4ADWA 1I5GA 4XTSA 4WBRD 1F2EA 2OJLA 3GA4A 4KSMA 4NMUA 4YKFA 3UVHA 4BPYA 3AE7A 2O87A 5FS6A 1DOEA 1NHPA 5CRHA 3EU3A 3VRDB 1O85A 2AR8A 1XOAA 4PNGA 1PBFA 4J34A 4GAPA 1AW9A 4MPGA 3LOVA 4KSOA 3UOZA 2CX4A 1O95A 4KDUA 2CDUA 2XLUA 1TK0B 5H5QA 1XFLA 3G7JA 4EDYA 4OFNA 1DBYA 2JADA 5B7CA 4Q5NA 1B4VA 1ZKQA 1EV4A 5BVAA 3QR6A 4J36A 4A65A 3QSMA 3EPTA 2ZUPA 2BS2A 2YLTA 1B5QA 1JHBA 4MF6A 4JNAA 4ZB8A 3L8KA 1T00A 4APNA 2DBCA 1EGRA 4C5OA 2WHDA 3RP8A 4LA1A 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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