4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
4B67A 1TYTA 4U8MA 1PXBA 1L0VA 5JCMA 3LZWA 3NYEA 4IVOB 2BC0A 1K0LA 2GR2A 2YG5A 3CNJA 2FBWA 3AD7B 4A6NB 2YWLA 2GR1A 5FS7A 2YVGA 1DJQA 4H4WA 3UTFA 2R0CA 3AWIA 2GR3A 1MOKA 1PHHA 4CY8A 5IPYA 2YAUA 4GF7A 3UP5A 3NRNA 4XXGA 4RG3A 1BGJA 1DXLA 3ISHA 3P4SA 1KSSA 2HQMA 1P2HA 2QAEA 3EAOA 4MJWA 1KDGA 2BS3A 1FL2A 4LIIA 1JNZA 1RYIA 4NEVA 4BURA 1H82A 1NG4A 3EPTA 2R4JA 5C3JA 1ELIA 1KFYA 3VRAA 1VG0A 2W0HA 2APGA 3AE2A 2DKIA 3CPIG 3UTGA 4C3YA 1F8WA 2VRLA 3FIMB 3G5RA 3S61A 2EQ9A 1H86A 3GD4A 1DODA 4B1BA 2C72A 1TDEA 2B7RA 3F8RA 4H7UA 4Z24A 4BJYA 2IVDA 2GMHA 2XLRA 3SGLA 3QSEA 4XWRA 1H81A 2XFOA 1IUVA 2FJBA 1F8RA 4BJZA 4AP3A 2H89A 3T37A 1ZX9A 3HZLA 4A5LA 4YSYA 4EQXA 3NKSA 1B37A 4E0VA 1HYUA 4J36A 1E6EA 4C77A 2OAMA 1TRBA 2BS4A 3D1CA 3NHOX 5M10A 4Z44A 2C76A 4C5OA 1CL0A 3DH9A 3ICRA 1FECA 3AYLA 1H7WA 1GPEA 4LU6A 4JY2A 4U8NA 4AT0A 4CCRA 1GERA 4H4SA 3R9UA 2GB0A 3GRSA 3NK2X 2DKHA 2F5ZA 1QO8A 5J7XA 3GDPA 1NDAA 2C64A 2VVMA 5KOWA 3URHA 5C2TA 2XCGA 3CN8A 3V3OA 1UKVG 3NN0X 1ZY8A 3GMCA 1LPFA 4ADWA 3QFBA 1KNPA 4H2NA 4J33A 2BK3A 3RP7A 1Y0PA 3P4RA 2Z5XA 4EQRA 4I58A 4U8PA 1NAAA 4USRA 2XVEA 2PYXA 2WDVA 1GREA 1IUWA 1S2YA 4H4TA 2PHHA 3RNMA 4DNAA 1CBOA 3C96A 3P9UA 4AOSA 1FEBA 3EANA 2V3BA 2X8HA 1ZOVA 2AR8A 3V3NA 1KNRA 2R0PA 1RSGA 2YLXA 4EMJA 3AE6A 1GRTA 4OPUA 4CBQA 4EM3A 2OALA 2NPXA 1M64A 4O5QA 3VRBA 4P9SA 3C4AA 4H4PA 1Q1WA 3AEBA 3RP6A 3LB8A 3CNSA 1GESA 4FK1C 2E1MA 1CJCA 2XLTA 3P4PA 1N1PA 2WBAA 3COXA 3F8DA 1QLBA 4IV9A 4NTDA 1PBDA 2FJEA 2UZZA 3GD3A 4U2TA 2Q0KA 3DMEA 5EBKA 4GDEA 2YLWA 1O5WA 5EB5A 4K2XA 2BC1A 3DJJA 1O94A 1PJ5A 3UKFA 3AB1A 5JCKA 1Y56A 1B8SA 4J31A 4YTNA 2YM2A 4UDRA 2GMJA 4U8KA 3UKHA 1D7YA 3PO7A 4YTPA 1QJDA 2BXRA 5JCNA 2YLRA 4Z2TA 4AP1A 3DA1A 1FCDA 2JKCA 1VG9A 4H4QA 1E1MA 1YQZA 1LV0A 2BXSA 3ICSA 3GYIA 1JEHA 2FJDA 3M13A 1IJHA 4OVIA 2JB1A 3LOVA 4B63A 1GRHA 5BULA 1EL7A 1JU2A 1OJTA 1NEKA 4JN9A 2EQ8A 3K30A 2JB3A 3OC4A 4EQSA 1CC6A 1ZMDA 3Q9TA 2BABA 1BGNA 4FK1A 3WE0A 5KWFA 4U8JA 2R0GA 3NTAA 2JAEA 3NNEA 3AYIA 2WDRA 4OPDA 1BF3A 2YR4A 4ZCDA 4OPTA 5GRTA 4A7AA 3UOYA 1PJ7A 3DK4A 3GMBA 1COYA 4TM4A 3P1WA 2CULA 2A87A 4NEWA 5JCLA 1JRYA 2ACZA 5HXIA 5EOWA 2V5ZA 4OCGA 3AE7A 3C4NA 4OPGA 3AE5A 1CC4A 1XHCA 1F8SA 1NHQA 3ABVA 3BHKA 5FS8A 1S3BA 5KXJA 1ZDLA 1JOAA 1CC2A 1PS9A 2V60A 2WHDA 2XYOA 2ZZ0A 3BHFA 3F8PA 4JQ9A 3KPFA 2JK6A 3RP8A 3M12A 4CY6A 1E1NA 2EQ7A 2C75A 3SFDA 3G5QA 3IHMA 1NHRA 1GRBA 1LTXR 2AAQA 1PBCA 2GRTA 2GVCA 3K7QX 4JY3A 4U2LA 3ATRA 4Y4NA 2WQYA 2CDUA 4Y4LA 4J56A 2Y6QA 1EBDA 4B68A 2BCGG 3LXDA 2Q6UA 2WPFA 2C73A 2XVJA 2BACA 2O9ZA 3EF6A 1JRZA 2OLNA 2YR6A 4H2RA 2I0ZA 4BK2A 3KU9A 3LZXA 3AYJA 2YG4A 2C3CA 1GV4A 4OPIA 2YVFA 2GEWA 2VVLA 4NZHA 4JDRA 3KA7A 2IVEA 3JSKA 1LJ1A 2RGOA 4EM4A 1MXTA 4U2SA 2Z5YA 4UDPA 1NHPA 3SFEA 2WPEA 1CF3A 2RABA 4Z43A 2WOWA 1H7XA 1DJNA 1TYPA 3FG2P 2WP6A 3PS9A 4YSHA 3DGHA 1RP0A 3ATQA 5HYMA 4YXDA 3IF9A 4YSZA 3GWDA 4M52A 1D7LA 1H83A 5ER0A 4NTCA 2RGJA 4EQWA 3I6DA 4J57A 1B5QA 3NT6A 3UTHA 3UOZA 3VRDB 4USQA 2X99A 3UOXA 1K0IA 4PAAA 3IWAA 3AEAA 1M6IA 2BS2A 2JB2A 2YR5A 2VZ2A 4RG4A 4TLXA 1CJ3A 3UP4A 2VRMA 3DK9A 1OJ9A 2C65A 1NG3A 3UKQA 1D4CA 1PBEA 1Q9IA 3AE8A 4TM1A 3ADAB 1OJDA 3QSMA 2VQBA 1W4XA 2C7GA 1CHUA 3ICTA 2H88A 4TM0A 1YY5A 4YKGA 1BZLA 3DK8A 3VR8A 1TDNA 4GUVA 1LQUA 3AD8B 4Y4MA 4Z26A 1TDFA 3L8KA 2ZBWA 4ZCCA 3DGZA 2WESA 3AE3A 1EL8A 1PDHA 4FX9A 2V3AA 2X8CA 4GR1A 2TMDA 4X9MA 2Y6RA 2QA1A 2YVJA 3ALMA 3KLJA 2GAGB 3CNTA 2YLZA 3GDNA 2X3NA 3QJ4A 4HB9A 2XLSA 3S5WA 2XFPA 4DGKA 4K5SA 4Z2RA 1E1KA 1S2QA 2R4EA 3AE1A 2B9YA 1NHSA 4H4XA 1PBBA 2BA9A 4BK1A 5L46A 2JBVA 4OPCA 1GEUA 1V59A 2CFYA 4C3XA 3GSIA 1L9CA 2XLUA 3VR9A 3BNUA 3B6DA 3GRTA 3NIXA 3QVPA 2BCPA 2C3DA 2IIDA 1ZK7A 4X4JA 1E1LA 1NENA 2WU2A 3D8XA 4CNJA 3UKLA 4A65A 1Y56B 1GRGA 4N9XA 2Q0LA 5KOXA 2OA1A 3UOVA 1YKJA 2EQ6A 3BI4A 2XDOA 4B69A 2ARDA 2X8GA 3NK1X 2GR0A 4IA6A 3NN6X 3KD9A 3NH3X 4JNQA 3UKKA 3CPHG 2GF3A 1GETA 2YG6A 3CGBA 4PABA 4ECHA 1IUXA 1GALA 3PVCA 5KRQA 4TLZA 3AE4A 1D5TA 1IUSA 1GNDA 3DJEA 4KX6A 4OPLA 1KSUA 2X50A 2TPRA 5HHFA 4WCTA 3M0OA 3VQRA 4A6NA 3FMWA 4H2PA 2Q7VA 3CIRA 4TM3A 2XFUA 5GSNA 2V61A 2A8XA 1GTHA 2WPCA 3CGCA 2WETA 5BVAA 3O0HA 4U8OA 4H50A 2R46A 3NGCX 4Z2UA 1X31B 3FPZA 3AEEA 4B65A 3GYJA 5FMHA 4A79A 5FS6A 3NG7X 3E1TA 2BK5A 4WX1A 3CGEA 4A9WA 3KVEA 3V76A 1JRXA 1P2EA 1YQ4A 4C74A 4YSXA 2WS3A 3DJGX 1LVLA 4DSHA 1DNCA 4JNAA 1N4WA 1LQTA 1VRQB 2WP5A 4H4YA 3UKPA 2OLOA 3ZDNA 1DOCA 4XWZA 1PXCA 2YG3A 1TDOA 3CNDA 4EIPA 1GT8A 3QVRA 3AEFA 2WP9A 1PJ6A 1VQWA 4O5UA 3LJPA 4K5RA 1K4QA 1DOBA 2CVJA 2VOUA 5EB4A 4B64A 4BK3A 1XDIA 5BUKA 5J60A 1GRFA 3BNMA 1NPXA 2FJAA 4UP3A 1ZMCA 3P4QA 5U1OA 1IUUA 1KF6A 4X9NA 3K7TA 2YG7A 1TDKA 2R9ZA 2WOVA 4D03A 2C67A 3H8IA 5KVHA 2QA2A 1IUTA 1Z6LA 2XLPA 2XVFA 1L9DA 1E39A 4H4RA 4A99A 5CKUA 1N4UA 3II4A 3NTDA 3L1RA 3SM8A 1VDCA 4EIQA 1N4VA 1XANA 2ZZBA 1GSNA 4K8DA 4REKA 3AEDA 2E5VA 3SQPA 5IQ1A 3ZYXA 4B66A 4EMWA 3CNPA 4YTMA 1H84A 5HY5A 2C70A 4YT0A 2J3NA 3AE9A 3REDA 4H4UA 3NLCA 2C66A 5FS9A 1ZP0A 4K22A 2B9XA 4IVMB 4KPRA 4RSLA 3AECA 4NTEA 2XVIA 2B9WA 3I3LA 3ALJA 1MO9A 3H4KA 1CJ4A 2YLSA 3BI5A 3UKAA 5BRTA 3AD9B 1E7PA 3G5SA 1PXAA 1BWCA 3DJDA 2ZZCA 1D4EA 1PN0A 3AEGA 4H4ZA 3BI2A 2GAHB 3H8LA 1PBFA 1OJAA 4APNA 5KVIA 1ZOYA 2XFQA 4J34A 1FEAA 1SEZA 3CGDA 4FDCB 4HA6A 3QSSA 2E4GA 4ICYA 5IQ4A 5LV9A 3NK0X 2QCUA 2VVLG 3CTYA 3K7MX 1ONFA 3Q6JA 3RHAA 4Z25A 4IA5A 1YQ3A 3NYCA 2WU5A 2AQJA 2XVHA 3IC9A 3ALLA 4AOXA 2GQFA 4I59A 3QFAA 1JNRA 2WEUA 3NYFA 1AOGA 3OZ2A 5TR3A 2A89A 2B7SA 5U25A 1GTEA 4CRTA 2BK4A 4UDQA 1B4VA 2YM1A 1S3EA 2RGHA 2B76A 4DSGA 1CJ2A 2V6OA 2GH5A 1L9EA 3FBSA 4H2QA 4CNKA 2NVKX 2WDQA 3AXBA 3CPJG 4GDPA 2YLTA 3GWFA 4YKFA 1BKWA 1O95A 4GRTA 4LA1A 1EL9A 4H4VA 1H6VA 1REOA 2VQ7A 2YQUA 1OJCA 5JCIA 4YWOA 1F3PA 2BYBA 2GV8A 4U8LA 5M0ZA 3UTEA 1ZKQA 3UCLA 1GRAA 4U8IA 4CCQA 1D4DA 1GXFA 2R45A 4ZN0A 1Q1RA 1XPQA 3B3RA 2GQWA 4D04A 3IHGA 5U63A 1F6MA 3LADA 1EL5A 4GCMA 3KKJA 4BV6A 1K0JA 4AT2A 4J2WA 3ITJA 1DOEA 4K7ZA 1GOSA 5CQFA 5DBJA 2WOIA 1FOHA 2XFNA 4EMIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ERVA 4U8MA 2PWJA 5HR3A 3NYEA 4IVOB 1K0LA 1J9BA 3WD6A 5GAND 4XTSA 2YVGA 3AWIA 3EMPA 4IS0A 2MZCA 4HU7A 4BVYB 4O7HA 4F82A 5IPYA 4LLRA 4MF7A 1BGJA 2QGVA 1KDGA 3L9SA 4HDEA 4ZB8A 2GQLA 2JSZA 3IC4A 1H82A 1NG4A 1PKWA 1KFYA 1PKZA 3CPIG 1OVNA 3UTGA 3TUEA 1SD9A 4XIHA 3FIMB 3GNJA 4IGJA 2CZ3A 2LRCA 4F9ZA 3WYWA 1GUKA 2JZSA 2C72A 2B7RA 3KTLA 2HI7A 4EC0A 2GMHA 2XLRA 1DUGA 4IP1A 5G31A 1IUVA 1F8RA 4TR4A 4MH3A 3T37A 2H73A 3CSHA 4EQXA 3NKSA 1FHEA 3TKPA 2GDRA 1GLQA 1HYUA 2DC5A 2VD0A 1E6EA 2OAMA 4HUAA 1FECA 1B48A 4JY2A 2HSMA 16GSA 3M8NA 3TKSA 6GSUA 2GB0A 5J7XA 4TW5A 4OCEA 1NDAA 1YEXA 3URHA 5KOWA 2JSYA 2L6DA 2ZCTA 1XCCA 1UKVG 2X64A 4OWYA 1PX7A 3GA4A 4J33A 1KNPA 3T2KA 2BK3A 2Z5XA 2PYXA 3T31A 3E3EA 3SBCA 1TU8A 4XRAA 1FEBA 1XWCA 4USSA 3HYXA 2AR8A 3V3NA 4G0KA 4RI7A 2R0PA 4KGIA 5IMVA 4EMJA 1BG5A 5F05A 5GSTA 1EOGA 4CBQA 3EC3A 5H5RA 4HJMA 4IHUA 4NMUA 5FT3A 4H4PA 3HD5A 5G1KA 3LB8A 4GQCA 3MDKA 5KNLA 4DVCA 2WBAA 3COXA 2GVPA 1QLBA 4IV9A 2Q0KA 4I97A 4GDEA 2RLIA 1CQGA 3H93A 3GTUA 2K8VA 3GFKA 8GSSA 3UKHA 4KAEA 3PO7A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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