4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
b'SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
molecule tags Oxidoreductase
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
1VDCA 2YLXA 2WS3A 1E39A 2VOUA 3UKQA 4H7UA 1NG4A 1KNPA 2XLTA 1D7LA 3UKPA 4I59A 2DKHA 4DSGA 3LB8A 3WE0A 4YSYA 2FJEA 4H4PA 5KWFA 1N4UA 1ZP0A 4NZHA 3UOVA 4AT0A 4B65A 5EOWA 1GALA 3NKSA 3I6DA 1UKVG 2RGJA 2VRLA 4CY6A 4A99A 1D5TA 3AE2A 4JY3A 3QSMA 1GERA 4OPCA 1ZKQA 2QAEA 1Z6LA 3DK8A 3LZXA 1V59A 3NRNA 2C72A 2WDRA 3P4SA 1NEKA 3DGHA 3FG2P 4C3XA 3QSSA 4U8OA 2E4GA 2WQYA 1FL2A 2GQWA 2WPFA 3COXA 2BYBA 1GNDA 1LQTA 2E5VA 1L9CA 2GF3A 5FS9A 3M12A 1H81A 1SEZA 5J60A 2YAUA 4IVMB 5KOXA 4OPIA 2JB1A 2V3BA 1FCDA 1B4VA 3LXDA 2B9WA 3BNMA 3ALJA 4JDRA 2WU2A 1CHUA 4N9XA 4CNKA 5KXJA 1GSNA 3KA7A 3V3NA 1DODA 3H8IA 2CULA 4O5UA 3IHGA 5FS8A 1CC6A 2Q6UA 4CCQA 2JK6A 1TDNA 3UKAA 4H4SA 4BK2A 4USRA 4JNQA 4K8DA 2DKIA 3KU9A 4RG3A 1GREA 1YKJA 1D4EA 1MO9A 1NPXA 1Q9IA 2GAGB 2Q7VA 2VVLA 5C3JA 3G5SA 4NEWA 1VQWA 2X50A 3V76A 2QA1A 4WX1A 1EL5A 4NTCA 3UP5A 1PBFA 2WOWA 3AEEA 4J34A 4U8LA 4BJZA 1JOAA 4UDQA 3QSEA 1P2EA 1GRFA 2A89A 2XVJA 3AYIA 4OPLA 1PJ6A 1ONFA 1GTHA 2APGA 3CGDA 1CF3A 4J33A 2GVCA 3DJJA 4FDCB 4H4YA 5JCNA 1PXCA 3ADAB 3DK4A 3DMEA 3F8DA 2ZZCA 3CIRA 3GDPA 4H4TA 4NTDA 3I3LA 3IWAA 1DOBA 4AOSA 1CJCA 3PVCA 2C67A 4Z2UA 4H4QA 3NYEA 4DNAA 5KRQA 4TLZA 5KVIA 4APNA 3NK2X 2YG3A 3P4QA 1K0IA 3GRSA 2B7RA 2X8GA 3AWIA 3B3RA 3ITJA 1Q1WA 3AB1A 2Y6RA 3G5RA 3S61A 2QA2A 3ALMA 1H7XA 3G5QA 1IUTA 1ZOYA 3ICSA 2E1MA 2BS4A 4YTNA 1P2HA 2GR2A 3NLCA 4YTMA 4B67A 2X8CA 5FS6A 3DK9A 1E1MA 2QCUA 3AEAA 1PJ7A 3CTYA 1KSSA 4YKGA 2JAEA 4FX9A 4HA6A 1EL7A 2Z5XA 3F8PA 2CFYA 3GMCA 1K0JA 2FJAA 1LQUA 2YLSA 3LJPA 4U8NA 3CNJA 1QJDA 2ARDA 3CGBA 3GD4A 4J56A 4YWOA 3KKJA 4A7AA 1MOKA 3AXBA 1DOCA 3K30A 1KDGA 3FIMB 4YSHA 3AE6A 2WESA 1CBOA 4O5QA 1IUUA 4RSLA 3ALLA 3RP7A 3EF6A 1KF6A 1TDKA 4USQA 4HB9A 1ZMDA 1D7YA 3DJDA 2C66A 1JEHA 1OJDA 4BK3A 1DJQA 1ZOVA 2BCGG 2GEWA 4XWRA 2XDOA 3II4A 1TYPA 2RABA 3IHMA 2JKCA 2V3AA 5LV9A 2TPRA 2WOVA 4EQWA 4OPGA 1GT8A 4IA6A 3VR9A 4A5LA 3SGLA 3BNUA 3GWDA 1PXAA 1JNRA 1DNCA 1H86A 1ZK7A 2GRTA 2X99A 3DA1A 2GV8A 3AE8A 1IUWA 5BRTA 4OPUA 3AYLA 4H2NA 4P9SA 2YM2A 1DOEA 2WP6A 1CJ3A 1PBDA 2Q0LA 3VR8A 5IQ1A 2A87A 3UTHA 2O9ZA 2HQMA 2YG4A 4M52A 4OPDA 1VG0A 1PXBA 3UTEA 2WHDA 3UTGA 1NG3A 4H4VA 1QLBA 2CVJA 2GH5A 3KVEA 4LA1A 3GYIA 1OJTA 3BI5A 3CPJG 4C3YA 2Q0KA 4X9NA 2IIDA 3C4NA 5IQ4A 2J3NA 2WDQA 3CN8A 1B5QA 4U8PA 2YWLA 4EQXA 1GRBA 1GETA 3L8KA 3ATRA 3OC4A 4WCTA 3M13A 1GPEA 3O0HA 4KPRA 2F5ZA 3VQRA 2R0CA 4PABA 1N4WA 1D4DA 4JNAA 1S3BA 5M0ZA 3DJGX 5U63A 5L46A 1LJ1A 1GV4A 5CQFA 5M10A 1B37A 1BGNA 2B76A 2C64A 2NPXA 2OLOA 3NNEA 3NK1X 2NVKX 3AD9B 4U2TA 2WPCA 4NEVA 5KVHA 2WETA 4TM3A 2ACZA 5FMHA 4B69A 3NG7X 1FECA 2VQBA 3LADA 3BI4A 3P9UA 1IJHA 4UDPA 5JCIA 3D8XA 4EM4A 2YVGA 1H84A 4H2PA 1OJCA 3GYJA 2H89A 4CY8A 2W0HA 3AEBA 3BI2A 2PHHA 4J2WA 3NYFA 3QVPA 2XVIA 4AT2A 1Q1RA 4H50A 1BKWA 1KSUA 1PN0A 4JN9A 1YY5A 1XANA 1TDEA 1B8SA 3PO7A 1F8SA 3K7MX 3D1CA 4H4ZA 4J57A 5JCMA 4K2XA 3UCLA 4GDEA 2YLZA 4U8IA 2OALA 1PS9A 2BC0A 2XVEA 1BZLA 2WDVA 3SM8A 4BURA 3P4PA 2BXRA 3NH3X 1L9EA 4NTEA 3VRDB 4TLXA 1NENA 1TDOA 3ISHA 3NGCX 1JRYA 3KLJA 4EM3A 4FK1C 4K7ZA 2XVFA 3AD7B 5KOWA 2WEUA 1E7PA 2V61A 1JRXA 4AP1A 2XFUA 3NK0X 3H8LA 1K0LA 4IA5A 2BK4A 2GR3A 2XLPA 1NHRA 4ZCCA 1BWCA 2JBVA 3IF9A 3UP4A 2EQ7A 1XPQA 2B7SA 2Y6QA 1X31B 1Y0PA 4IVOB 1YQZA 4Z43A 1IUSA 1D4CA 2VVLG 3M0OA 4GRTA 3P1WA 3URHA 4DSHA 4B64A 1KFYA 3UKKA 1M6IA 4B66A 1EL8A 1Y56A 2C3DA 4A6NA 2XFNA 5BUKA 1L9DA 3GRTA 4BJYA 5C2TA 1GRGA 1ZX9A 3UKFA 4A79A 5DBJA 2XVHA 5HY5A 4C74A 2R9ZA 3AE1A 3VRBA 2EQ9A 1MXTA 2GAHB 3FBSA 1GESA 3JSKA 3DH9A 1N4VA 3K7QX 3KPFA 4K22A 1E1NA 1TRBA 4REKA 1CC2A 3C4AA 1GRTA 3CNDA 3GMBA 4JY2A 2XYOA 3DJEA 1H82A 1HYUA 1YQ4A 3CGEA 3L1RA 1RSGA 1FEBA 1F8WA 5GSNA 4JQ9A 2XFOA 5FS7A 3S5WA 2IVEA 1ZMCA 2GMHA 1TDFA 2RGOA 4OVIA 2EQ6A 2B9YA 5HHFA 2C70A 3CGCA 3ICRA 4J31A 1DXLA 2BS3A 2C65A 2YVFA 1F3PA 4Z25A 2JB2A 3BHFA 3NIXA 2BC1A 1XDIA 3KD9A 3K7TA 4I58A 1E6EA 3AECA 4U2LA 2R0GA 3H4KA 3QFAA 4PAAA 4DGKA 2BABA 5U25A 2VZ2A 3E1TA 4Y4MA 1CC4A 1CJ2A 1E1LA 1K4QA 1GRHA 1GXFA 2ZZ0A 4H2QA 4CCRA 3UOZA 2WU5A 2YR4A 3BHKA 3SQPA 2YLWA 1LPFA 4U2SA 5BULA 1CJ4A 4MJWA 4E0VA 3V3OA 2GR1A 3FPZA 1GOSA 2YG5A 3LOVA 2BA9A 2BXSA 3ABVA 3B6DA 3UTFA 2WPEA 4A9WA 4YSXA 4BK1A 3GWFA 1ZY8A 4IV9A 4ADWA 4LU6A 4GUVA 3CNPA 1OJAA 4ZCDA 4D04A 2C76A 3LZWA 3AE7A 1OJ9A 2XLSA 2ZBWA 2A8XA 1RP0A 3CPIG 5HYMA 5IPYA 2OLNA 4GDPA 2X3NA 1GTEA 2R4EA 2C75A 3C96A 4H4UA 3RHAA 2XLRA 2WBAA 3ZDNA 1EBDA 2V5ZA 3CPHG 2R0PA 1W4XA 2V60A 1NHQA 3NTAA 2I0ZA 1JNZA 2YLTA 2XFQA 2R45A 3UKLA 3R9UA 2XCGA 5U1OA 2BCPA 4CRTA 3GSIA 2VVMA 2BK3A 2V6OA 3NN6X 2WP9A 1BGJA 2YR5A 2UZZA 1RYIA 4EMWA 2YVJA 3NTDA 5JCLA 1NHSA 3SFEA 3AD8B 1Y56B 3DGZA 3AE3A 4A6NB 2AAQA 4CBQA 2BS2A 4YSZA 1REOA 4EMJA 3F8RA 4KX6A 4C77A 4Z44A 3VRAA 2AR8A 1FEAA 2YG6A 2TMDA 3IC9A 4H2RA 5TR3A 3RP6A 4Z2TA 3QFBA 5CKUA 1F8RA 4YKFA 3UOXA 4OCGA 5EBKA 4EQSA 1NAAA 1PBCA 2VQ7A 3EAOA 3UKHA 1NDAA 3CNSA 2C73A 3HZLA 3ZYXA 4LIIA 3AE4A 5ER0A 1NHPA 3SFDA 1PDHA 4ICYA 4EIPA 1O95A 2FJBA 2RGHA 3CNTA 3GDNA 4YTPA 1GEUA 4K5RA 1LV0A 1S2YA 2OA1A 2BK5A 4ECHA 1M64A 2YLRA 3AEDA 3QVRA 4YXDA 1VG9A 3UOYA 1ELIA 1PHHA 2YR6A 2C7GA 1ZDLA 4RG4A 2C3CA 4Y4LA 2B9XA 1FOHA 4GF7A 2GR0A 5EB5A 4K5SA 2ZZBA 1JU2A 4AP3A 3EANA 3QJ4A 4CNJA 1LVLA 4U8KA 5BVAA 1DJNA 2GQFA 2R4JA 3ICTA 4Z26A 1L0VA 3FMWA 3AEGA 4EMIA 5EB4A 1O5WA 3RNMA 1GRAA 4B1BA 4XWZA 2FJDA 2YQUA 4GR1A 3GD3A 4TM4A 2CDUA 4U8JA 1JRZA 3T37A 4X9MA 3AE5A 1H7WA 2X8HA 1AOGA 3AYJA 4U8MA 1EL9A 4Y4NA 4XXGA 1COYA 1XHCA 2PYXA 3NT6A 4H4XA 4D03A 5HXIA 4UP3A 1E1KA 2XLUA 1S3EA 1LTXR 4TM0A 2YG7A 4TM1A 1IUXA 2WOIA 4EQRA 3OZ2A 4Z24A 1TYTA 1IUVA 2YM1A 4A65A 2FBWA 2GB0A 4ZN0A 1H83A 2IVDA 3NN0X 4C5OA 1H6VA 3REDA 4Z2RA 1VRQB 3RP8A 3AE9A 5JCKA 2Z5YA 1CL0A 4EIQA 4J36A 2AQJA 4AOXA 3NYCA 2OAMA 2JB3A 1N1PA 1BF3A 2EQ8A 5GRTA 2VRMA 3EPTA 2WP5A 4BV6A 1PJ5A 3ATQA 4B63A 2XFPA 4X4JA 3AEFA 3P4RA 3PS9A 1S2QA 1PBBA 4UDRA 3Q9TA 4GCMA 3Q6JA 4H4RA 1KNRA 4FK1A 1YQ3A 2GMJA 4H4WA 2H88A 5J7XA 1PBEA 2R46A 2BACA 1F6MA 4YT0A 4OPTA 1O94A 1QO8A 3NHOX 4B68A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2WS3A 4DSQA 4WEYA 4V2LA 2H30A 1EP8A 3DD3A 2PBJA 3BD2A 6GSVA 1Z6MA 1Y25A 4H4PA 1A2LA 1FB6A 3E0UA 3PINA 4AT0A 1XPVA 3EU4A 5KMRA 1GALA 2MYGA 2VAFA 4MLYA 2YV7A 2MMAA 2AV4A 3LZXA 3D21A 1XFLA 3DGHA 3FG2P 3QSSA 4ILFA 2R2JA 2GQWA 1XZOA 3COXA 3EYTA 2GQMA 1E2YA 1GNDA 2GF3A 1H81A 1M9AA 5HR2A 4IVMB 4OPIA 2V3BA 1B4VA 3LXDA 4Z7XA 2H01A 2B9WA 4JDRA 3IAM2 5D9WA 1N8JA 4CNKA 2C3TA 3ZTLA 4MH2A 1TU7A 3FHKA 3WGEA 1DODA 4O5UA 5FS8A 1CC6A 1TDNA 4JNQA 5GSSA 4EE0A 5IMFA 2DKIA 1BX9A 1Q9IA 2LQOA 1R7HA 4J2FA 1VQWA 2X50A 3QAGA 5J41A 4WX1A 3C7MA 3HCZA 3UP5A 1PBFA 1GTAA 2DMLA 5IIZA 4MABA 4UDQA 4G10A 2A89A 1F3AA 2FHEA 2BMXA 1GTHA 1ONFA 1PJ6A 1YKCA 2GQLA 2F8FA 5H5RA 3DK4A 3F8DA 3GDPA 1V2AA 1DOBA 1XOAA 1ERUA 4BWQA 4AOSA 4PXOA 4MJAA 3QFAC 4APNA 3LEFA 3A5WA 3ZITA 3NK2X 2EIRA 1OVNA 3APQA 1LU4A 3ITJA 1Q1WA 2QA2A 1H7XA 2GGTA 4FIWA 2BS4A 3NLCA 3RHBA 2PPTA 2X8CA 3LJRA 1E1MA 1KSSA 2WB9A 4BVYB 2L5OA 3Q18A 1EL7A 2IWTA 3HJOA 1K0JA 1URMA 3L9UA 2P5RA 3L9SA 3M9KA 3CGBA 4YWOA 1O7UA 1MOKA 4FO5A 4YSHA 4MJBA 2C0FA 1CBOA 1IUUA 3ALLA 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1TI1A 5BUKA 2YWOA 1WRYA 5CRDA 4C74A 2HZFA 3A3TA 5C04A 4CHSA 3QCPA 4BL7A 2AJQB 1X5DA 3F4RA 1X9MB 3TB2A 3K7QX 1CC2A 4O92A 3IR4A 3DJEA 3WD6A 1BEDA 3HKRA 3CGEA 1PN9A 1XIYA 1M3IA 1RSGA 1FEBA 2J23A 5FS7A 2IVEA 3LFLA 4PUAA 1K0CA 1B9YC 1AC1A 2B9YA 2C70A 4KDXA 3GL3A 1DXLA 2YVFA 1F3PA 2NDOA 3KMOA 4F03A 3NIXA 3QFBC 4QQ7A 4TXVA 3RPNA 5IQYA 4I58A 1E6EA 1U3AA 4PAAA 3CQFA 1CJ2A 3CTGA 1GRHA 3IRAA 4HSCX 5BULA 4MJWA 2YANA 3IXRA 3P2AA 2YG5A 2BA9A 2H6YA 5KN3A 3ABVA 2WPEA 4BK1A 3GWFA 1ZY8A 4IV9A 1ZYPA 2C76A 5FWGA 1RP0A 4POBA 3CPIG 4GDPA 1ZMAA 3F6FA 4RQXA 4H4UA 3C96A 2O87A 4X1UA 1TK8B 5G1LA 4PQIA 2R0PA 3NTAA 3D22A 4OCFA 2YLTA 2XFQA 1B9XC 2R45A 5U1OA 3F3RA 2VVMA 2WP9A 1RYIA 4ZB8A 3F4TA 2LJRA 1TP9A 5IMVA 1ZGNA 3C1RA 1Y56B 4CBQA 2AAQA 5G31A 2BJXA 3KEBA 4I8BA 4CDOA 4C77A 5D9VA 12GSA 3IC9A 2FGXA 5TR3A 3RP6A 4BVXA 2YPMA 4DSSB 3UOXA 3QR6A 1ABAA 2DJKA 1TTZA 2OE0A 3BOAA 3CNSA 2AAWA 3HZLA 3SFDA 1PDHA 4EIPA 2RGHA 4YH2A 4XIHA 2CVBA 3QVRA 2ALBA 3UOYA 3DKSA 3IDVA 2C7GA 4GF7A 5EB5A 4EF0A 1JU2A 5HFIA 2LSTA 1DJNA 1E6BA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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