4CY8A

2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase (hbpa) in complex with fad
Total Genus 179
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
179
sequence length
582
structure length
539
Chain Sequence
SAETDVLIVGAGPAGAMSATLLASLGIRSLMINRWRSTSPGPRSHIINQRTMEILRDIGLEESAKSLAVPKEYMGEHVYATSLAGEEFGRIPAWASHPQAHAEHELASPSRYCDLPQLYFEPMVVSEAALRGADVRFLTEYLGHVEDQDGVTARLLDHVSGAEYEVRAKYIIGADGAHSLVAQNAGLPFEGINIEFSADLSSGDMYWMFRGVAALRMNKWICVEEKKIIHEIIGTDEIPEVGPISTWTINQQYAVRNTSGRVFCMGDAVHRHTPMGGLGLNTSVQDAYNLAWKLALVLKGQAAPTLLDSYDAERSPVAKQIVERAFKSLSTFPPVFEALSLPPAPTESEMAEALVRLKDASEEGAKRRAALRKAMDATIIGLGGGHGVELNQRYVSRAVFPDGTPDPGFVRDQEFFYQASTRPGAHLPHVWLTENQRRISTLDLCGKGRFTLLTGLSGAAWKHEAEQVSQSLGIELKVCVIGPGQEFVDTYGEYAKISEIGESGALLVRPDMFIAFRAKDASREGLEQLNVAVKSILGR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas nitroreducens hbp1
publication title Structures of the Apo and Fad-Bound Forms of 2-Hydroxybiphenyl 3-Monooxygenase (Hbpa) Locate Activity Hotspots Identified by Using Directed Evolution.
pubmed doi rcsb
molecule keywords 2-HYDROXYBIPHENYL 3-MONOOXYGENASE
total genus 179
structure length 539
sequence length 582
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.14.13.44: 2-hydroxybiphenyl 3-monooxygenase.
pdb deposition date 2014-04-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01494 FAD_binding_3 FAD binding domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4cy8A03
3.50.50.60 Alpha Beta 3-Layer(bba) Sandwich FAD/NAD(P)-binding domain FAD/NAD(P)-binding domain 4cy8A01
4K22A 1PBDA 5J7XA 1DOEA 2X8GA 3ALMA 4A79A 1GESA 1IJHA 1CHUA 2YLXA 4YTMA 4H4VA 1D7YA 1DOCA 1LQUA 1D4DA 3AYLA 1S3BA 4FDCB 3M13A 3CN8A 1PHHA 1M6IA 3GYJA 4U8LA 1DXLA 2GV8A 1S3EA 1DOBA 4Y4MA 2C67A 4TM0A 4ECHA 2Y6QA 2WETA 5EOWA 2V3BA 1Z6LA 4NEWA 4UDRA 5U25A 4HB9A 3ISHA 1PDHA 1IUXA 3AE6A 2WESA 4ICYA 2APGA 3UP4A 1ZMCA 4U8JA 2C64A 3P4RA 4GF7A 4J57A 2OLNA 1YQ4A 1D5TA 3GDNA 4JN9A 3DGZA 1LJ1A 4XXGA 5FS8A 2YG6A 3AD9B 2C70A 3FMWA 3H8IA 5LV9A 1H7XA 4UDPA 4J56A 2YWLA 1D4CA 3BI5A 2X99A 3RHAA 1E1NA 4IV9A 1O5WA 2GR1A 1PXBA 1OJ9A 2WBAA 4A65A 3JSKA 4H4XA 2EQ9A 2DKHA 3NH3X 2Z5XA 3NIXA 3P4QA 1CBOA 1XDIA 3KPFA 3GWDA 1KNRA 2WDQA 3C4AA 3GD3A 1FL2A 2WOVA 2C73A 2YR4A 1IUWA 1PBBA 2VRLA 1KDGA 1VRQB 3K7TA 1JNZA 3AEGA 4A5LA 4O5UA 2XCGA 4REKA 3NK2X 1GALA 3REDA 3V3NA 4XWZA 3P4SA 1CJ3A 1GRBA 3NN6X 3SQPA 4B67A 4EQRA 3T37A 4LA1A 3I3LA 1JNRA 2XLUA 4YSZA 2ARDA 5J60A 3UKAA 1KSUA 2YG5A 4JY3A 1D7LA 4J2WA 1GNDA 4E0VA 1X31B 5HY5A 4D03A 2WPEA 4GCMA 4IA6A 1EBDA 3CGEA 2B76A 1K0LA 2BK5A 1TDNA 2B7SA 1VDCA 1PJ5A 1E6EA 3AE8A 3BI4A 3B6DA 2BXRA 4PABA 1CJ2A 4A7AA 3G5RA 4DSHA 3QJ4A 5GSNA 1N4UA 3AYIA 2OAMA 1NDAA 2A89A 4NTEA 4GR1A 4H2QA 3AE7A 5FS9A 1REOA 1NAAA 1P2HA 1ZP0A 3OZ2A 2CVJA 3CIRA 4FX9A 3ICSA 4EQSA 2YLRA 1NG3A 1S2QA 3SFEA 3CPJG 2RGHA 2TMDA 3FBSA 3UKPA 1YQ3A 3F8RA 2BS4A 2EQ6A 2R4JA 4AP1A 2DKIA 5FMHA 4AT0A 1CL0A 4N9XA 4CBQA 1NEKA 2ZZ0A 3EANA 1ONFA 4UP3A 1PBCA 2JB3A 3CNPA 2X3NA 2XVHA 3CNTA 3UKQA 1CC2A 2BCPA 4H4WA 3AWIA 1YKJA 1NHQA 4NTCA 2YLTA 1BGJA 2BA9A 1M64A 2Q0LA 3GYIA 1VG0A 3CPHG 4C74A 1S2YA 2V60A 2XLRA 3NG7X 5KVIA 1GSNA 5M10A 5DBJA 4K8DA 1JRZA 4UDQA 1GPEA 1ELIA 4HA6A 2J3NA 5BVAA 4CCRA 2VOUA 3DA1A 2YQUA 3EF6A 1JEHA 2OA1A 2XLTA 4B1BA 5M0ZA 4CY8A 2FJAA 4H4RA 4U8IA 3II4A 1TRBA 4Z24A 3K7MX 3S5WA 3ATRA 1Q1WA 3IWAA 5U1OA 1HYUA 4H2NA 4KX6A 4U2TA 1CC6A 3LXDA 3NRNA 2VQBA 3G5QA 4B69A 1L9DA 2WU2A 4NTDA 1JRYA 4WX1A 5KRQA 2Q6UA 4I59A 4USRA 5EB5A 5CKUA 4TLXA 4AP3A 2BS3A 5KVHA 4Z25A 5C3JA 1PJ6A 4XWRA 1MXTA 4K7ZA 2YLSA 4DGKA 1F6MA 4GRTA 2XLPA 3CTYA 5JCNA 1Y56B 4H4SA 2QA1A 4K5RA 5KOWA 1FEBA 1GEUA 1O95A 4B64A 2A8XA 4B65A 1GTHA 4Z2TA 1LQTA 2VRMA 4DNAA 5EBKA 2C3DA 3EAOA 2W0HA 2WOWA 4A6NB 4JDRA 1K0JA 1NHPA 2VVLG 1Y0PA 1TDEA 2C7GA 3ITJA 1NG4A 2QCUA 4CNKA 1H6VA 2BXSA 2WDRA 2GEWA 2O9ZA 3DGHA 4H4YA 1DODA 5C2TA 1GRGA 3BNMA 1GRAA 3UOVA 3NGCX 2R46A 3AD8B 2XYOA 4NZHA 3UTFA 1GTEA 4EMIA 4GDEA 4RSLA 4YSHA 4Z26A 1BZLA 1JRXA 3ALJA 3GD4A 3P4PA 2XVJA 1EL7A 1B37A 1BKWA 2BK4A 2QAEA 2JK6A 4P9SA 4EMJA 1PBEA 4OPGA 1AOGA 3D8XA 1PXCA 4JNAA 3ZYXA 4X9MA 3H8LA 2AR8A 4IVMB 3UP5A 3VRAA 4AOSA 2V61A 3H4KA 2WS3A 3KVEA 1QJDA 3L8KA 2OALA 4U2SA 3UOXA 3QSMA 3UCLA 1NHRA 4H4TA 4C3YA 4U8KA 5HHFA 2WQYA 4OPDA 5IQ4A 2VVMA 3GWFA 4U8OA 3AEFA 3VR9A 3IC9A 4YKGA 4WCTA 2IVDA 1NPXA 1GOSA 2OLOA 2XFQA 1PJ7A 1ZX9A 3IHGA 2FJBA 2C72A 1GRTA 1E7PA 1RP0A 1FECA 2C3CA 2XFOA 2YVJA 2YLZA 1DJNA 3O0HA 2R0GA 3BNUA 1GXFA 1L9CA 4YTPA 3BHFA 1IUSA 5IQ1A 1EL9A 2R4EA 1CC4A 3AE1A 3CGCA 4GDPA 1E1KA 4ZCCA 3HZLA 4C5OA 1B5QA 1BGNA 2C66A 2WP5A 3SGLA 4BJZA 1SEZA 3LJPA 2ZZCA 3DJJA 2R45A 3AXBA 1H83A 2BC0A 5IPYA 3SFDA 3AEDA 3DH9A 2NVKX 1BF3A 2BC1A 2YVGA 5FS7A 3NTAA 1ZDLA 1XPQA 2TPRA 3SM8A 2XFPA 1TDKA 1VG9A 2X50A 3AEBA 3NHOX 1IUUA 1CJ4A 3R9UA 3PS9A 1TDFA 1TYPA 1FOHA 3P1WA 2B7RA 1CJCA 1P2EA 3F8DA 3KA7A 5FS6A 2FJDA 2RABA 2CDUA 2ZBWA 4OPCA 2GR3A 3FPZA 4CY6A 5HYMA 2C75A 4ZN0A 2F5ZA 1QO8A 3LB8A 1QLBA 3FIMB 4YT0A 2C76A 4K2XA 3P9UA 4YSXA 4AT2A 1B8SA 3S61A 3NLCA 1PBFA 1N4VA 3CNJA 4ADWA 3C4NA 4JNQA 4B63A 5HXIA 4TLZA 2VQ7A 3LZWA 1ZMDA 2BABA 2GAGB 3AE4A 3UTGA 3CGBA 2YVFA 1LTXR 3LZXA 1GERA 3VQRA 2V6OA 3AD7B 3WE0A 1BWCA 1TYTA 2GAHB 2WP6A 2E4GA 3L1RA 2XLSA 3NYCA 5BULA 3GMBA 4Z43A 2JB1A 4YXDA 2R0PA 4A9WA 1Y56A 4U2LA 3GSIA 2H89A 2XVIA 1H81A 3ABVA 2E1MA 2GF3A 4FK1A 1Q1RA 1ZOVA 3CNSA 3NN0X 4Z2UA 3CPIG 3NYEA 4A6NA 2PYXA 4EIQA 2GR0A 2WPCA 2JKCA 3COXA 4IA5A 4KPRA 4PAAA 4B68A 3AE5A 1FCDA 1VQWA 4H7UA 3UOYA 4BJYA 3AE9A 1TDOA 2BK3A 2Z5YA 3M0OA 4MJWA 3AE3A 1JOAA 2EQ7A 1F3PA 2NPXA 3E1TA 1DJQA 3AEEA 3RP8A 2GMJA 1ZK7A 3KKJA 1OJCA 2BS2A 2C65A 1L9EA 4J31A 3UKKA 4RG3A 2GR2A 2WPFA 4CNJA 4TM1A 2B9YA 3CGDA 4JY2A 1UKVG 1DNCA 2Q0KA 1E39A 2V5ZA 3LADA 2XFUA 3UOZA 2WU5A 3URHA 4OPIA 4J34A 4Z2RA 2IIDA 3NTDA 3VRBA 4OCGA 4USQA 5JCMA 4H50A 1NHSA 2UZZA 3PVCA 2A87A 1GV4A 4DSGA 3DK8A 4H2RA 2FBWA 4CCQA 4H4UA 4J33A 2B9WA 2ZZBA 1W4XA 4EQXA 2BCGG 2VZ2A 2JAEA 1LVLA 4H4ZA 4TM3A 4M52A 2YR5A 2FJEA 3V76A 4GUVA 1F8SA 1ZKQA 3ZDNA 4YTNA 5JCKA 3VR8A 4Z44A 4EM3A 1H82A 2GH5A 4X9NA 2R0CA 1N1PA 3PO7A 3DMEA 2E5VA 4IVOB 2GMHA 1XANA 4AOXA 1EL5A 3D1CA 3KD9A 5BRTA 4LIIA 4YWOA 4APNA 2CULA 2YR6A 1JU2A 3RP7A 1OJAA 2WHDA 4JQ9A 5JCLA 1F8RA 1YQZA 3GDPA 3AB1A 3ALLA 3C96A 4OVIA 3QVPA 3AE2A 2H88A 4YKFA 5CQFA 2GQWA 3QSEA 2XVEA 3NKSA 4BK3A 3BHKA 2EQ8A 3KU9A 4EM4A 1EL8A 4H2PA 2AAQA 3DJGX 4O5QA 1RYIA 1RSGA 4OPUA 1PN0A 5KWFA 1GETA 1PXAA 1ZOYA 2GQFA 2GRTA 3F8PA 4Y4NA 1IUVA 2B9XA 2RGJA 5TR3A 3RP6A 4BK1A 2YM2A 3UKLA 3QFBA 3VRDB 1H84A 1YY5A 2YM1A 4H4PA 4FK1C 4H4QA 1O94A 4U8MA 1LV0A 4LU6A 1B4VA 1OJDA 1K4QA 4I58A 1CF3A 4OPTA 4NEVA 1NENA 2GVCA 2VVLA 4K5SA 1KSSA 3DK4A 3K7QX 3B3RA 2HQMA 2PHHA 2WOIA 3Q6JA 3Q9TA 2QA2A 3UKHA 3ADAB 1GRFA 3NNEA 4EIPA 3NT6A 2JBVA 4BURA 5JCIA 2GB0A 3I6DA 1KF6A 1OJTA 2BYBA 3BI2A 1F8WA 2Q7VA 3DJDA 3NYFA 3K30A 4A99A 5KXJA 3IHMA 3QSSA 3LOVA 4Y4LA 1FEAA 2WEUA 2JB2A 3AEAA 4ZCDA 3AECA 5GRTA 1H86A 1PS9A 2CFYA 4OPLA 1KFYA 3UTHA 3KLJA 3DJEA 2WP9A 1N4WA 4X4JA 1V59A 1XHCA 2X8HA 1ZY8A 4BK2A 1H7WA 4BV6A 2BACA 4C3XA 1KNPA 3ATQA 3FG2P 4J36A 3NK0X 1IUTA 3QVRA 3GRTA 5L46A 3NK1X 2YLWA 2YG3A 5U63A 1Q9IA 2YAUA 4CRTA 4C77A 2ACZA 2X8CA 3QFAA 4EMWA 2V3AA 5BUKA 1MOKA 3UKFA 1L0VA 3AYJA 2XDOA 5KOXA 4YSYA 3EPTA 3M12A 4U8NA 4RG4A 1GRHA 3CNDA 3V3OA 3GRSA 1COYA 4TM4A 1E1LA 5EB4A 4B66A 4EQWA 1K0IA 3G5SA 3UTEA 1E1MA 1GT8A 3ICRA 2I0ZA 3DK9A 5ER0A 2WDVA 1GREA 1MO9A 2YG7A 2R9ZA 3GMCA 3ICTA 4U8PA 3RNMA 2RGOA 2XFNA 3OC4A 2Y6RA 4D04A 1LPFA 3IF9A 2YG4A 1D4EA 2AQJA 2XVFA 2IVEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T4ZA 2CX4A 4POKA 1IJHA 2YLXA 4YTMA 4H4VA 1DOCA 1LQUA 1G0TA 1S3BA 4FDCB 4POBA 2YJHA 3R2QA 4V1Ag 1DXLA 2GV8A 4ECHA 5JCGA 5HR1A 5EOWA 4NEWA 5U25A 3QFBC 1GLQA 2C3TA 5ECQB 2WESA 2APGA 4WF4A 4MZCA 2IWTA 2C64A 2LSTA 3H93A 1GTBA 6GSSA 2HT9A 1PD21 2FWFA 5CRDA 1D5TA 3GDNA 4HOJA 1SD9A 1Z5YE 3AD9B 3CYNA 2YZHA 4DSSB 4IELA 2C70A 5J5NA 4J56A 4I2TA 1GTIA 1QGVA 3BI5A 2LNTA 2GR1A 2N5BA 2KP2A 1OJ9A 4OO5A 4H4XA 1VGLA 3NH3X 4ILFA 3NIXA 4DSRA 2H1GA 1FL2A 2KLXA 2QC7A 2YV7A 4PQHA 3DVXA 3GYKA 3VPQA 3NK2X 4REKA 2H6XA 1GALA 3REDA 3IHQA 2LNSA 1GRBA 3WT2A 4B67A 3T37A 3HXSA 4II2A 5J60A 3HJPA 5A4WA 1ERTA 1R26A 4J2WA 4G9KA 3CSJA 3EC3A 1GNDA 5HY5A 1N2AA 4IA6A 1SU9A 4MF6A 2C0DA 1VDCA 3L0HA 5CRGA 3J7Yb 3M3MA 1CJ2A 4A7AA 2J23A 5CYYA 2A89A 3IK7A 1PGTA 5ELGA 4H2QA 5FS9A 1KNGA 1R4WA 5COHA 4TR3A 2NDOA 2CVJA 3CIRA 3ZYWA 4FX9A 1M0UA 2E7PA 1WP0A 3CPJG 2XPDA 4GSNA 2TMDA 3FBSA 3G7JA 4X0XA 2DKIA 5FMHA 1YY7A 1Y6EA 1ONFA 5J3RA 2X3NA 3QCPA 1CC2A 4H4WA 1DSBA 4NTCA 1M64A 2VD1A 5KVIA 5M10A 5D9WA 5DBJA 2OA7A 4UDQA 1GPEA 4IHUA 2IIYA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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