4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
5LY3A 4A2AA 4MLHA 5KQ8A 3ULEB 4XEIA 4BRHA 1BOTO 1KAZA 2ZGYA 4CBUA 1MWKA 5I9EB 4YDUC 4FO0A 3A8YA 2UYTA 4IXCA 3C7NB 3FZHA 4H5NA 4CZEA 2CGKA 1MDUB 4FWLA 5AQTA 4JHDB 4FOIA 3D2EA 4BROA 1TYQB 4BRKA 3QBXA 3QBWA 4O5FA 2P9UA 4BRFA 5ADXA 3CHWA 3DXKB 1ATNA 3W0LA 2IVPA 3CJAA 3JXUA 3QFPA 5ADXH 4IJAA 5AZIB 4E1JA 5LJWA 4BR4A 5BN8A 1U2VA 4BRPA 4BQZA 3LDOA 3MDQA 4B1WB 1Q18A 4ISFA 5LJVA 5KQDA 3EKUA 1K8KB 2GWKA 2IIRA 1NGEA 2D0PA 3EZWA 5CE3A 1JCFA 4IWVA 1BUPA 3VEVA 1HKCA 2P9NA 1QQNA 1NGAA 3CETA 4H0VB 4JD2B 3ENHA 3VEXA 1SAZA 3CJ1A 1BA1A 3O1WA 1V4SA 1BG3A 3SLCA 4H03B 3IUCA 3D2FB 3O6WA 4I6MB 4ISEA 5AR0A 3ZETA 3SK3A 3ATVA 3U9ZA 1GLJO 5AQXA 4H5VA 4XH5A 4KBOA 3ZX2A 2FSJA 1LOTB 1T6DA 3HSCA 1KAYA 4FWSA 3QICA 1BU6O 2QWLA 2NZTA 4HTLA 1D4XA 5AQHA 5AQLA 2I7NA 1YAGA 4NO7A 1OKJA 5BPNA 5E26A 4BRAA 3FLCO 2A3ZA 5KPZA 2E8AA 5AQQA 3DJCA 4BRNA 2FSKA 1T44A 2PAVA 3FZFA 5AQIA 3H3NO 4A62A 4BVOA 1X3NA 4J8FA 1Z6RA 5JICA 2P9PA 4FWOA 4XH4A 1DGKN 4BC4A 2ASPA 2ASOA 4BRGA 2NRHA 4MO5A 3WT0A 4FWKA 5FPMA 3WXIA 1HJOA 4EHUA 5E84A 1V4TA 5BRFA 2A42A 1XQSC 3MN7A 4FOEA 3H6EA 3H3OB 5AFUA 3D2EB 3LDNA 3IMXA 3WEEA 2Q97A 3AAQA 1X3MA 2QWQA 3IDHA 5AFUH 3L0QA 3VPZA 1IJJA 1NLVA 3DAWA 5TKYA 2P9UB 4NB4A 1T6CA 4FPAA 2GEMA 3CJCA 2V7YA 1R59O 2YHWA 2E20A 3L6QA 5AZJA 3HZ6A 4WQ5C 2V7ZA 3C0BA 5AQSA 1U2VB 3AARA 4CD1A 3WQUA 3A5OC 5BPMA 3WUHA 1S3XA 4PKIA 5AQJA 3G25A 3H1VX 3A5LC 4HWIA 3LDQA 2HF3A 4MO4A 2E2QA 1HKBA 1J6ZA 1IG8A 1TUYA 2P9NB 1HLUA 3I33A 1NWKA 1XC3A 1X9JA 3LM2A 3HBTA 4PKGA 1HUXA 3JS6A 1Y64A 5AQNA 4RWTA 2Q0RA 2OANA 4WQ4A 2Q31A 3ZEUA 3D7EO 3R9PA 3VESA 4FWMA 4BR2A 3UB5A 1HPMA 3ZETB 4LC9B 1E4FT 1NGJA 1NGCA 5AQZA 2P9LA 1C0GA 2FLOA 2F9WA 2NLXA 2QWOA 2AA4A 4BRIA 2FSNA 4PL8A 3ENOA 3AY9A 4PL7A 1S22A 3M3ZA 4IJNA 3O8MA 3WXKA 1NGBA 5B8HA 2WUSA 3FGUA 4WQ4C 3OHRA 2A41A 1TUUA 1NGDA 3VGMA 3O4WA 2QWNA 3QFUA 5BN9A 5AQPA 2P9PB 4RTFD 4BVPA 3QDKA 3SMPA 1U6ZA 2P9KA 4CBXA 4H0PA 1KXPA 1ATRA 2E88A 2VWBA 3J8AA 4F9OA 5AQFA 2BTFA 4CZGA 3M1FA 1YVNA 4QS8A 3ZX3A 1GLCG 4RCHA 3B8AX 4BR9A 3ZX0A 2E2OA 2FF3B 5EY4A 3DWLA 3LDPA 3WEEB 3RSEA 4EHTA 1BA0A 3VENA 4BG8A 3MK6A 2V51B 5AQRA 1GLAG 1DKGD 1ZC6A 5FPDA 3W3DA 3F9MA 2BUPA 4O8KA 1GLEG 1JCGA 1G99A 1RGIA 3VOVA 3VF6A 2A40A 5AQUA 5AZJB 3MMVA 4BR0A 3CERA 4B9QA 3CI5A 5BRHA 1NGFA 4JN4A 4BC3A 2J4RA 4FWRA 4H5TA 2QW9A 3VEZA 4GNIA 3A5NC 1WUAA 5AQGA 3DXMA 2HF4A 4CZHA 1NBWA 1RFQA 3CIPA 3H1QA 2CGJA 1WOQA 2QWPA 3MCPA 4H5WA 5AQVA 3UKUA 4BC2A 3U4LA 1NGGA 3O08A 3ATUA 1EQYA 3VEOA 3ID8A 4BRCA 3ZEUB 2ITMA 4CZJA 1ZXOA 3HTVA 4XH1A 4DQ8A 3VGLA 4BGBA 1XUPO 4K25A 2ZWHA 4BQLA 3TU5A 2P9LB 1MWMA 4JNEA 3BEXA 3CQXA 3FZLA 3HI0A 3LM9A 5F2RA 4FSVA 4H0TB 3S41A 1NM1A 3H45C 5BREA 1QQOA 3GOIA 4CZMA 2D4WA 3KHYA 2HOEA 3MN9A 4BC5A 4K43A 2P9IA 3VETA 4BRDA 3HM8A 5JLHA 3BF3A 1H1VA 3O5BA 2E1ZA 2YJFA 4B1XB 3FZMA 4CJ7A 3VEWA 2P9SA 5F0XA 4CBWA 1QHAA 3WXJA 4BR5A 3A0IX 2KHOA 2H3GX 1P8ZA 2E1YA 2YCHA 3GBTA 4FL9A 3KVGA 4K41A 4BRQA 2P9KB 4K42A 2Q2RA 3LDLA 2DPNA 2E2PA 5BR9A 2GWJA 3MN6A 3R6MA 3I8BA 3MN5A 3UKRA 5EVZA 1YXQA 2ASMA 2HMPA 2IVOA 4IZ9A 3CJ7A 3M6GA 3RSEB 2QWMA 3CJ9A 4DCHA 2AP1A 1KAXA 2PBDA 4JAXA 4B1YB 4BREA 3FR0A 3U9DA 2GUPA 5EX5A 2D0OA 1NGHA 4H0XB 2IVNA 1ZBSA 2W40A 5AQOA 1NMDA 1DEJA 1BWFO 4M7YA 2ZGZA 2QXLA 4QS9A 4DHYA 5FPEA 3AAPA 1NGIA 3CJBA 2E2NA 4ISGA 1BO5O 1Z05A 5JMVA 4BG9A 3ULEA 4AM7A 1C0FA 4M63C 3WXLA 5KPTA 3O80A 5EXWA 4BR7A 2YJEA 3DXMB 4FWPA 1E4GT 4Z94A 3A5MC 3VF4A 1SZ2A 3TPQA 3GL1A 1QZ6A 3EN9A 3UKUB 3C7NA 4A2BA 4B1UB 4EAHD 3H46O 3SMSA 2FF6A 4FWNA 4Y0WA 1YUWA 4JHDA 3LL3A 5AQMA 4CZFA 1TYQA 3FZKA 1ESVA 2W41A 4QS7A 1HX1A 1MA9B 1GLBG 3QMLA 5AQKA 3VGKA 2VYPA 5EOYA 3FFKB 4DB3A 3QB0A 2GELA 1RDWX 3DXKA 4EIAA 1LCUA 5AZIA 3VERA 1QQMA 2QM1A 4CZKA 1CZAN 1QZ5A 2P9IB 3WQTA 4CZIA 2CGLA 4B1ZA 4PKHA 4CZLA 3L4IA 1ATSA 2A6AA 2P9SB 2A5XA 2YI1A 3UE5A 4WYBA 2VCPA 4L3QA 1K8KA 5FPNA 2Q0UA 1SQKA 1BDGA 3GDQA 5F1XA 5ELZA 2YHXA 3VEYA 5JLFA 2V52B 3U8XA 3O1BA 1GLLO 4H5RA 3SJHA 3IFRA 2CH6A 3EKSA 4B1VA 3CQYA 3GG4A 4C23A 4JD2A 4FPBA 2GTDA 2I7PA 5AQYA 3EO3A 1JCEA 3P4IA 3UKRB 2FXUA 3VF2A 4EFHA 3D2FA 3KZBA 4I6MA 4H0YB 4WQ5A 4FWQA 4BRLA 4CD3A 4AM6A 3BP8A 2Q36A 3FE1A 4M7XA 4IO8A 3BF1A 1GLDG 4YDUA 5KPRA 2F9TA 2Q1NA 4GY2B 5BPLA 5AQWA 2CH5A 4BRMA 5BRDA 3R8EA 2EWSA 4CI6A 4BGAA 3EL2A 2ZF5O 2QWRA 4H0OA 4MLEA 1GLFO 4A61A 3GE1A 2D1KA 2YHYA 3BUZB 1HKGA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3RTVA 4MLHA 4M41A 1CZBA 4CESA 4WFAL 2XY7A 2O4IA 3BZKA 1KAZA 1VQ7N 3TABA 4JI7K 3J7AP 4B8AB 2YHBA 4JKGB 2X74A 3E66A 3VMFB 1JLFA 2O4GA 4KHNA 5C25A 1VQ5N 4GKKK 3FZHA 4CF0A 2NRXA 3L3VA 2KKZA 4CZEA 1MDUB 1WAFA 4FOIA 1I39A 4CE9A 5CZ1A 3QBXA 1N5YA 2P9UA 4BWJA 3LWLA 1ATNA 2IVPA 3CJAA 2VGNA 3JXUA 3LP3A 4IJAA 3TI0A 4CJTA 3NH1A 1SL2A 1SKWA 3OYNA 3SI6A 4K0KK 3QEIA 5BN8A 1EWQA 3MDQA 4B1WB 4CIGA 3WNGA 5LJVA 4ELUA 2IIRA 5SZTA 5LL6Z 2D0PA 5KGXA 1WSEA 3KIOA 2OPRA 4GMJB 1RDDA 2UUBK 4BE2A 1S1UA 4RW4A 2P9NA 3ZYYX 4UY8O 1JLEA 3D45A 1HMVA 1YJ9N 4LFAK 2KFZA 4CECA 4DR5K 3ENHA 4C8KA 2X6SA 3J7ZO 5AR0A 4I6MB 1NOZA 3ATVA 2VGMA 1GLJO 1MU2A 4H5VA 5AQXA 2DFHA 4XH5A 1DTQA 4KBOA 1ITGA 3QESA 4DU4A 4K8ZA 2HNDA 1NK6A 2QWLA 4JRQA 3F73A 5AQLA 1D4XA 1VRTA 4X64K 3S3OA 2C1GA 1ASWA 4DV5K 3MWPA 1XC9A 4RW9A 3S5TA 3QLHA 1TKZA 3AVHA 3H3NO 2WFBA 1X3NA 4YY3K 1VSMA 4DUZK 2ASOA 3LDSA 3T7ZA 3DI6A 3WT0A 3WXIA 3T1YK 4DTPA 4DQIA 5E84A 1ZBLA 2HHHK 4WF9L 5JVHL 3LDNA 2WC9A 4BDPA 2Q97A 3RR7A 4KREA 5AFUH 1NKCA 3VPZA 3DAWA 3HYFA 2P9UB 4NB4A 3CCUN 1N8RO 5M1QA 3CJCA 4OPAA 4DFPA 2PYJA 1KSPA 3KTQA 1M1KO 1SL1A 4CIFA 5AZJA 1NK5A 4JKFA 1WBBA 4IG3A 2YKNA 3Q7BA 2V7ZA 5AQSA 4MQ3A 2YHAA 5BR8K 2UUCK 3HSTB 3MCAB 1CXUA 1S9EA 1IBKK 2ZE2A 4BECA 2HF3A 1U47A 4CJEA 1HNXK 3ZCMA 3O9RA 2P9NB 3LM2A 4BE7B 3JS6A 1W2BM 4JI0K 2Q31A 4M3UA 3ZEUA 3VESA 4DLGA 4M45A 1YF5L 1NGJA 1S1VA 2FLOA 1QVFM 1BL3A 2QWOA 3CCLN 4PL8A 2A1RA 3CCQN 4UQGA 1RNHA 3O8MA 1RT2A 3AVIA 3LAKA 4CEFA 4NCAA 3FGUA 3ZT1A 4FVUA 4CEOA 3VGMA 4DTSA 3QEXA 5BN9A 3L4QA 1T7PA 3DYAA 4CBXA 4H0PA 3V4IA 1RBVA 4F9OA 4YOUA 1BQNA 2QK9A 3U6FA 2HHSA 5GIPA 4IOCL 2FF3B 5EY4A 1JJ2M 4BY9C 2IGIA 3OYFA 4EHTA 4ELVA 3OVNA 1RT7A 3MK6A 1BISA 3RRGA 4DR4K 2P1JA 1DKGD 1ZBHA 2X78A 3F9MA 4C8OA 4F2SA 1KCFA 3DRSA 2RHKA 3PUFA 1GLEG 5J2QA 1JCGA 4YORA 3VF6A 2A40A 5AZJB 1VQMN 4OPJA 4I7FA 4BR0A 3RMDA 5BRHA 2KTQA 3DMJA 4BC3A 2I5JA 1DLOA 4GNIA 3MEEA 3A5NC 3DLHA 4M3WA 3DXMA 3UIQA 1RFQA 4DTOA 2W42A 3F5TA 1G15A 1WOQA 2FBTA 2QWPA 4H5WA 4JKBA 3L2RA 3LAMA 1BCMA 1NGGA 3OYLA 3DM2A 1YT3A 3ATUA 4ELTA 1HNWK 3SQ1A 3CC2N 3ZEUB 1ZXOA 1F21A 1TKDA 2ZWHA 4BQLA 1N33K 1MWMA 2RPIA 3BEXA 3FZLA 1K9MO 3S41A 1NM1A 2HVIA 2D4WA 3KHYA 3QIOA 4OLAA 4BC5A 4K43A 2P9IA 3BF3A 3O5BA 2YJFA 4CJ7A 3VEWA 3AGRA 2P9SA 1WBDA 3J80O 1FXXA 4LY7A 5GAGP 3ALYA 4BR5A 1NK9A 3P83D 4CJQA 3WNFA 2HB5A 4FL9A 4RG8A 4K42A 3ASMA 2Q2RA 1WLJA 4OKEA 3LDLA 1HR0K 5IT9O 3ZSYA 2HVHA 1VQNN 5EVZA 2ASMA 4BE0A 4ZHRA 3EE8A 3P38A 1CLQA 3CJ7A 4ILGB 4DCHA 1KLNA 2AP1A 4JAXA 2PBDA 3T1AA 2VWJA 3U9DA 3VTHA 4KI4A 2IVNA 1ZBSA 5AQOA 1NMDA 2HHUA 4DFKA 5M1KA 4N47A 1NGIA 1TK8A 4LF8K 1NJIO 1NJWA 4BG9A 1KFDA 3TTFA 3ULEA 4CFCA 3AVGA 1VQPN 1NJZA 3DXMB 3OYHA 3J7YP 2JWLA 3WNEA 3GL1A 1QZ6A 4OGEA 4KTZA 4JK7A 3SAGA 1RTJA 2E4LA 2FF6A 4FWNA 1W7AA 1YUWA 4JHDA 3SNNA 4IDHA 4CHPA 4AHVA 4AF1A 1GLBG 5AQKA 3VGKA 4QCLA 2VYPA 5M1FA 4CHNA 2GELA 3DXKA 1QSLA 3CQ8A 3MECA 1T05A 1LCUA 4EP4A 3AVCA 1QQMA 1QZ5A 3ITHA 4JI8K 2P9IB 5I42A 4ID5A 2P9SB 1K8KA 4HVJA 2Q0UA 1LWCA 1SQKA 5ELZA 2V52B 4LD0A 4DFJA 1XNRK 4KB1A 3OYIA 4F3TA 4DF8A 2XY5A 5LMNK 1A5WA 4KI6A 1L5UA 3TSQA 1VSLA 2I7PA 3N4QA 3A2FA 3EO3A 1S1TA 1RT3A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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