4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
b'ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
2E1YA 3WXLA 3HZ6A 3I33A 4CZMA 2QXLA 3UKRA 1JCEA 2FSJA 3WQTA 1TYQA 4IWVA 3SK3A 3ZX3A 3CJCA 4PL7A 2CGKA 4YDUA 2P9SA 4H0XB 1KXPA 3CJ1A 2ASOA 4B1UB 3ID8A 5KPTA 3H1VX 4BC4A 1MA9B 1HKGA 3B8AX 5E26A 3VPZA 5ADXA 5AQYA 4FWPA 3IFRA 2HF3A 3GL1A 4QS9A 2AP1A 3VOVA 4FWOA 2V51B 4IJNA 4BRGA 3BF1A 2IIRA 1U6ZA 3ZETB 3U9ZA 4CJ7A 4H5NA 1BU6O 4DHYA 1V4SA 3CETA 4BR5A 4FO0A 4WQ5A 1BO5O 1HJOA 4XH5A 4GY2B 5BRFA 5AQKA 2DPNA 5BN9A 3CJAA 1MDUB 1NMDA 2W40A 4DB3A 2A6AA 1JCGA 4PKHA 5EOYA 5AQMA 1X3NA 4IO8A 1R59O 4CZFA 1BWFO 1XQSC 3QDKA 1MWMA 4CZIA 3EKUA 3ZX2A 3L4IA 4BGBA 5LJWA 3ZX0A 1Z05A 5AQIA 3SMSA 2P9NB 1P8ZA 1BA0A 1MWKA 3O5BA 5AQLA 1NM1A 4RWTA 1NBWA 4BGAA 1GLFO 3I8BA 4FOIA 3CI5A 1U2VA 2OANA 2H3GX 3DAWA 3SJHA 4BRMA 3O8MA 3AY9A 3FLCO 2E2NA 5F1XA 2V7YA 3H1QA 2P9PB 5AQUA 3RSEB 3FFKB 4BRFA 4FWRA 1X9JA 3ULEA 2I7NA 3GE1A 4BRCA 3LDLA 2CGLA 2A5XA 1ATRA 2CH5A 3VETA 3W3DA 4LC9B 4CBUA 3GBTA 4BR0A 4WQ5C 5AR0A 3VGMA 4A61A 1D4XA 2F9TA 3C7NB 5KQDA 4RCHA 5EXWA 3VERA 3D7EO 5FPEA 5AQXA 2E20A 1WUAA 4BRQA 5BPMA 4KBOA 1QQOA 1ZC6A 4FSVA 1NGFA 1ESVA 3BUZB 1HUXA 3U8XA 5EVZA 3KZBA 5BR9A 3WT0A 2GTDA 3F9MA 3VEYA 4A2AA 3UE5A 5CE3A 3ZEUB 3ATUA 2PBDA 2YJEA 4BR9A 3DJCA 4CZHA 3VF6A 3O1WA 1NGGA 4IJAA 1QZ6A 3SLCA 5BPLA 3WEEB 1V4TA 3H3OB 4BRHA 1NGAA 4FPAA 3MDQA 4RTFD 2D0PA 1K8KB 3D2EB 5AQWA 3HTVA 5AQOA 4BROA 2ZWHA 2D4WA 3M3ZA 3GDQA 2VYPA 3DXKA 3A5NC 3LDPA 2P9PA 4JD2B 3MMVA 4BRPA 1E4GT 2FSKA 3VESA 3CIPA 2GELA 1BA1A 2F9WA 5F0XA 4GNIA 2FF3B 2FF6A 3A0IX 3FZMA 4E1JA 5ELZA 2GUPA 2ITMA 4F9OA 5AFUA 4K42A 3EKSA 2YHXA 1T6CA 3BF3A 5AQRA 4BRDA 3HI0A 3GOIA 3U4LA 4ISFA 3WXKA 3CJ9A 3C7NA 3W0LA 2P9LA 4FWMA 5F2RA 1DKGD 3P4IA 3VGKA 4BREA 3QMLA 1ZBSA 4QS7A 2V52B 2YI1A 4DCHA 4H03B 4BVPA 4XH4A 2KHOA 3UKRB 5BREA 3CJ7A 4H0PA 4J8FA 4BC2A 2QWLA 3H46O 3M1FA 4MO5A 4EHUA 5EY4A 1H1VA 3VEZA 4Y0WA 3O80A 3TU5A 5BN8A 3VF4A 2CH6A 2QW9A 5FPDA 3CQXA 3MN7A 5LY3A 2QM1A 2P9UB 3DXMA 5AQFA 1IJJA 1OKJA 2ZF5O 4ISGA 3AAPA 1K8KA 3D2EA 2E2QA 4BR7A 4CI6A 2QWRA 3H3NO 2QWQA 4EHTA 2FSNA 3A5OC 2A41A 1RFQA 3H6EA 4I6MA 5AQTA 3CERA 3LM9A 3UKUB 1KAZA 2BTFA 3OHRA 5AQGA 2IVOA 4FWLA 2Q31A 2D1KA 2HF4A 4WYBA 3VENA 5TKYA 3FZHA 2QWNA 3WQUA 1J6ZA 2P9SB 3QBXA 1T6DA 3LDQA 3FZKA 4K25A 2HOEA 3LDOA 1S22A 2P9NA 1T44A 4MO4A 3QB0A 3S41A 5AZJB 2Q1NA 4B1YB 1QHAA 4XH1A 1GLJO 3CJBA 1NGJA 4MLEA 2YHYA 1TUYA 1U2VB 5JMVA 1XC3A 3MN9A 2VCPA 4H5VA 3BP8A 2A42A 4BG9A 4A2BA 1DGKN 3AAQA 5KPRA 4H0OA 4IXCA 4BRKA 2YJFA 4BG8A 3DXKB 3G25A 2E2PA 4IZ9A 2I7PA 5FPNA 1DEJA 4JD2A 4B1VA 1RDWX 3A5MC 4B1ZA 4EFHA 3IUCA 2WUSA 3MK6A 5KQ8A 4O8KA 2D0OA 4JHDB 5AQPA 2E1ZA 1BUPA 5KPZA 1QQMA 2E88A 3VEOA 1SZ2A 4QS8A 1S3XA 4WQ4A 3EN9A 3CQYA 2QWMA 3D2FA 3VF2A 4FWQA 4FPBA 1HLUA 3C0BA 3ENOA 3FGUA 3WXIA 3LDNA 4I6MB 1XUPO 1Q18A 1YXQA 1BDGA 2YCHA 3O6WA 4CZGA 4M7XA 1QQNA 3ATVA 5AZIA 1C0GA 3ZEUA 4M7YA 1GLLO 1NWKA 1HKCA 4H5TA 5FPMA 2E8AA 4JNEA 4BC5A 2UYTA 4K41A 1GLCG 3FZLA 1ATSA 2ASPA 2V7ZA 1IG8A 4YDUC 2E2OA 4AM6A 3FR0A 4K43A 3JS6A 3SMPA 1X3MA 1GLAG 5BRHA 2Q36A 5AQHA 2ZGZA 4WQ4C 3UKUA 2P9KB 2P9IA 1GLBG 3RSEA 1G99A 3M6GA 2Q97A 3QFUA 3ENHA 3R6MA 4PL8A 4CZJA 4FOEA 2IVNA 4CZKA 1TUUA 2BUPA 1CZAN 4CBXA 4BR2A 3MN5A 3VGLA 3R9PA 3UB5A 4DQ8A 2Q0RA 1SQKA 1E4FT 1Z6RA 4FWSA 2GWJA 1RGIA 5AZJA 4BC3A 4PKIA 4BRIA 4ISEA 2ZGYA 3QFPA 1HKBA 1NGHA 1KAYA 4M63C 5LJVA 2J4RA 2W41A 2QWPA 4H5RA 3EO3A 3CHWA 1NLVA 3U9DA 4JAXA 4BQZA 2AA4A 4B1WB 4A62A 2ASMA 4HTLA 4EAHD 3HM8A 4BRLA 1NGCA 2P9UA 1NGDA 2EWSA 2NLXA 1LOTB 1C0FA 1SAZA 5JLFA 1YAGA 1HPMA 2FXUA 4NB4A 1NGEA 2NZTA 1HX1A 5AQQA 3WEEA 3KHYA 5AQJA 4CZEA 2CGJA 3JXUA 3L6QA 3EL2A 4B1XB 3AARA 4BR4A 3R8EA 1BOTO 3ZETA 2NRHA 2YHWA 5AQNA 2Q0UA 3QICA 2GWKA 3L0QA 3A8YA 4NO7A 5ADXH 3GG4A 2PAVA 1ZXOA 2A3ZA 3VEVA 4BVOA 3KVGA 5BPNA 1TYQB 4HWIA 3O08A 4H0YB 2QWOA 4L3QA 3O4WA 3IDHA 1BG3A 5AQVA 2A40A 2FLOA 5JLHA 4FL9A 4XEIA 5E84A 5B8HA 4JN4A 1NGBA 3O1BA 4Z94A 4CBWA 3DWLA 1LCUA 4BQLA 4CD1A 1Y64A 3FE1A 2HMPA 2VWBA 3LL3A 4EIAA 3J8AA 4CZLA 1KAXA 3VEWA 4PKGA 3MN6A 3QBWA 1GLDG 4B9QA 5AQSA 3FZFA 3ULEB 4JHDA 2P9IB 2P9KA 5I9EB 3MCPA 1YVNA 5AFUH 3BEXA 3HBTA 2GEMA 2Q2RA 4BRAA 3DXMB 3A5LC 4FWKA 3WXJA 5BRDA 4H5WA 1QZ5A 3EZWA 4AM7A 3TPQA 4MLHA 4H0TB 3LM2A 3D2FB 1WOQA 3HSCA 5EX5A 2IVPA 1GLEG 1JCFA 1EQYA 3H45C 3WUHA 4FWNA 5AQZA 4C23A 1ATNA 2P9LB 4BRNA 3VEXA 5JICA 1NGIA 5AZIB 1YUWA 4O5FA 3IMXA 4H0VB 4CD3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4C8OA 1VQ7N 1ZBHA 2OZMA 3DLRA 5C2FA 1G15A 1RDDA 3OYEA 2CGKA 4YDUA 4CFDA 4DQSA 4F2SA 1NOYA 1KXPA 2ASOA 5M1PA 1BCOA 4M3WA 5KPTA 3H1VX 1MA9B 4DUZK 2D5RA 1EETA 3O4NA 5E26A 4CJ3A 4HUFA 3F9KA 3VPZA 3CMEN 2HHSA 5AQYA 4WFAL 3IFRA 3OBYA 2HNYA 3D6RA 4DFMA 2ZJRL 1OVQA 5MLCQ 4YFUA 4DSEA 1YHQN 3IG1A 1IBKK 4JS5A 4LF4K 3KK1A 3MXIA 1BU6O 4DHYA 1YI2N 1HJOA 4NXNK 4OGEA 4CJ4A 5C12A 1SKRA 4ILGB 3KK7A 2DPNA 1MDUB 3PSIA 1OVYA 3SNNA 3NF6A 4GKKK 1JCGA 4PKHA 3CC2N 4YOXA 3HL8A 4CZFA 1WAFA 1YJNN 1BWFO 2X74A 3CYGA 5LJWA 3ZX0A 1Z05A 5AQIA 4LD0A 1VQ8N 4H4OA 4FW1A 3OYAA 1MWKA 5AQLA 1CZ9A 3C6TA 4GVMA 1NBWA 5KGWA 4W5QA 4DFPA 4ZTJA 1GLFO 3ZCMA 4PQUA 4CK3A 1NJYA 4CJEA 2H3GX 4LF7K 3VQ8A 2V7YA 1QSYA 1HNWK 4AHSA 2WC9A 5AQUA 3M8SA 4CHNA 4FWRA 1JLBA 3THYA 2QTDA 3T1YK 4ZTFA 2CH5A 2F4VK 3W3DA 4CBUA 3VA3A 3GBTA 2JGUA 4KHYA 1VQON 4A61A 5KQDA 3SAFA 5FPEA 3L4QA 5AQXA 1RT2A 2E20A 4BRQA 4DUYK 3E1YA 4KBOA 4Z4CA 3THWA 4N76A 3VQ6A 3U8XA 3HPOA 3KZBA 2KFZA 3SUQA 3VQCA 5BR9A 1VSMA 4HHTA 4A2AA 1S1TA 3ZEUB 3ATUA 1KVAA 3CCLN 1YTUA 4PY5A 4MDAA 3M8PA 2O8BB 3VF6A 1VQ5N 3KIOA 1I39A 3CG7A 2VG6A 3JSMA 5BPLA 4RW8A 4BE7B 3K2PA 3H3OB 3VTIA 5HRNA 1NGAA 4FPAA 3MDQA 4RTFD 3QESA 3S5TA 3HSTB 3HTVA 3RMBA 4BROA 2D4WA 1VSJA 4CF1A 3CM6A 3A5NC 1RDBA 2VQFK 2W00A 2P9PA 2JLEA 3MMVA 3O9QA 1E4GT 2FSKA 1B9FA 4GMJB 1S9GA 2GELA 2F9WA 2X6NA 5F0XA 5HRRA 5AFUA 5EU7A 2YHXA 4YOWA 1K6YA 4BRDA 4ID5A 1JLCA 5HL7L 3C7NA 3V9XA 4FWMA 3J7YP 3P4IA 4CFAA 2E4LA 3THXA 4A5AA 1HPZA 3TABA 3QMLA 3CFRA 3AVBA 3OYBA 4QS7A 2V52B 5FRNA 2O4IA 1S1WA 1LWFA 4XH4A 4FLVA 2KW4A 1NJZA 1FXXA 1SS6A 2QWLA 4EHUA 4FCYA 3VEZA 4Y0WA 4FK0A 4OX9K 2ETJA 5CYQA 4WFNL 3O80A 2CH6A 4MQ3A 2O8FB 5FPDA 2PYLA 3MN7A 1JKHA 2P9UB 1RNHA 5AQFA 4FLZA 5HROA 4BE2A 4JKHA 4M3XA 2HNDA 3NMUA 4CE9A 4ISGA 1K8KA 4BR7A 1RTJA 4K8XA 1EP4A 5FDLA 2QWQA 3A5OC 3ZYYX 1SKSA 1W9HA 1RDUA 2YX6A 4FWLA 4NLCA 3PO5A 2D1KA 4DR7K 2HF4A 3AA4A 1JLAA 3SAHA 4KRFA 2VWJA 2QWNA 3WQUA 1VQ4N 1J6ZA 3QBXA 1T6DA 4Y1DA 2YNIA 2HOEA 4B9VA 1S22A 4LF8K 5GIPA 3HJFA 3PV8A 1BIZA 5M1QA 4MLEA 1NGJA 4E89A 1U48A 2FBYA 4QCLA 4CJ5A 1U2VB 3G4SN 3BP8A 2A42A 4BG9A 4A2BA 3AAQA 4JV5K 2YNGA 4J2BA 4BRKA 2FBVA 1M90O 3T1AA 5HLFA 1REVA 4BG8A 3G25A 2F96A 2E2PA 2I7PA 4JD2A 3HYFA 4W5TA 4B1VA 3A5MC 1KRPA 4B1ZA 4EFHA 3MK6A 5KQ8A 2D0OA 2XY8A 4ILHA 2WFBA 2IC3A 4DF4A 1JLQA 2E88A 1UAXA 4JI4K 4JI8K 2RE2A 4JI5K 1S3XA 4JI0K 4WQ4A 3EN9A 1RDCA 2QWMA 1RT3A 4IG0A 2XY6A 4KHWA 4FPBA 2WONA 4I6MB 2O8CB 1XUPO 4DTSA 3DMJA 4M7XA 3K5LA 2R7YA 3AVJA 1C0GA 4IDHA 3DOKA 3E66A 4JNEA 1RCHA 4DG1A 4WFBL 1VQ9N 2VGNA 2E5LK 4M3TA 1ATSA 1A5XA 1KQSM 4YDUC 4AM6A 1L3VA 1RILA 1C1BA 3OBWA 4K43A 3KLFA 3JS6A 1QHTA 3SMPA 4BECA 4DSFA 4CHYA 2Q36A 3HVTA 4DFKA 4IOCL 4Z0UA 3I0SA 1KTQA 3RSEA 2KZMA 1TAUA 3M6GA 3TANA 2Q97A 3ENHA 4CZJA 2HHWA 4FOEA 2IVNA 4CZKA 1TUUA 1TKZA 1CZAN 2HB5A 4CGFA 1VHXA 3KLEA 3KD1E 1SQKA 3LANA 3CCMN 1RGIA 5AZJA 1M1KO 4PKIA 2ZGYA 1ASVA 1OH7A 1HKBA 3Q7BA 2UUCK 2W41A 2B5JA 3EO3A 3AA3A 1LW2A 2PYJA 2AA4A 3EYZA 2NRZA 4A5BA 4GKJK 1NKBA 3I55N 3K0SA 2ASMA 1Y97A 3HM8A 4BRLA 4EZ6A 4BACA 3ZT3A 3OJSA 4KI6A 1LOTB 3PSFA 3O3GA 1YAGA 1DTTA 3THYB 1HX1A 5AQQA 3DYAA 2D0CA 1HYVA 3TR8A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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