4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
b'ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
molecule tags Structural protein
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
1ESVA 5AQGA 2A42A 5AQXA 3DXKA 4O5FA 2A41A 3D2EA 3VEWA 4AM6A 3EO3A 2I7NA 2ZF5O 2F9TA 2IVPA 3C7NA 3O1WA 3JXUA 5AZIA 4KBOA 1HJOA 5ELZA 3U4LA 3VOVA 4JAXA 4WQ5A 4CD3A 3FLCO 4YDUC 3O4WA 3CJAA 4BG9A 1MDUB 1ATNA 4BC4A 1BWFO 3QICA 4FOEA 1BA1A 2UYTA 3FFKB 4FPBA 3VESA 4K43A 3LDNA 4BROA 5FPDA 4O8KA 2A6AA 3KVGA 2PBDA 5AZJB 1LCUA 3VF2A 2CH6A 4YDUA 5KPZA 5EX5A 3A5NC 4BG8A 3QB0A 3UKUA 3BEXA 1SZ2A 1E4GT 3CJBA 4H5VA 1ATRA 4CI6A 1YXQA 4IZ9A 3F9MA 2QWMA 2EWSA 1QZ6A 3H1QA 3QFPA 4FWLA 4QS9A 4E1JA 4BC5A 3CIPA 3MCPA 3SLCA 4BRNA 3VEVA 3CJ9A 1NWKA 5AZJA 5AQSA 4C23A 4BRGA 1KXPA 3GE1A 4QS7A 3A5OC 1MA9B 1XC3A 3QFUA 2CH5A 4M7XA 4FWMA 3GL1A 1NBWA 5LJWA 1JCFA 3O1BA 3OHRA 3LM2A 3TU5A 4JNEA 2FF3B 2HOEA 2YJFA 3FGUA 2P9SB 3J8AA 3LDOA 2E1ZA 1KAXA 3HTVA 3L4IA 4B9QA 3DWLA 4CBXA 1HPMA 1GLJO 2YCHA 3IMXA 4BRCA 4IO8A 4FWNA 4BVOA 5AQHA 4I6MB 3FZFA 4EHTA 3IUCA 2GTDA 1DKGD 1T6CA 5F0XA 3MN6A 4Z94A 3VERA 1KAYA 2P9SA 2QWOA 1V4SA 3VF4A 5JMVA 2Q1NA 2E2PA 1XQSC 1NGJA 3O5BA 4WQ4A 2Q31A 1DGKN 2E20A 5BPMA 4IJAA 2FSKA 2GELA 2A5XA 4H0XB 1HKBA 2QWQA 2P9UB 3P4IA 3A8YA 4CZLA 2D1KA 2BTFA 3ID8A 4FO0A 3W0LA 2J4RA 5AQQA 3R6MA 4CZEA 3KHYA 1X9JA 3W3DA 3ZEUA 1X3MA 1DEJA 2A3ZA 2FF6A 4GY2B 3WUHA 1NGHA 2FLOA 3QMLA 2P9UA 4BRPA 1C0GA 3C7NB 3ZX0A 2VYPA 1QQMA 3D7EO 4B1VA 3VEOA 3FZLA 5BPNA 4XH4A 3BP8A 3GG4A 4WQ5C 2ZWHA 1RDWX 5JLHA 1MWMA 4EIAA 3LDPA 1KAZA 5BPLA 1RFQA 4H5RA 1GLFO 5I9EB 1WUAA 1QHAA 3MMVA 3BF1A 3CJ7A 3VETA 1GLAG 3AAQA 3WXJA 4FWRA 4FWSA 4K41A 1ATSA 3SK3A 3FZMA 4HWIA 2YJEA 2P9LB 4Y0WA 2P9PB 4BR9A 4B1WB 3CJCA 4CJ7A 3WXIA 4BRHA 4CZFA 1Q18A 2QXLA 3UKUB 1GLBG 2P9NB 2QWLA 4DQ8A 3CHWA 3L6QA 2IVOA 2QWNA 4QS8A 1R59O 5AFUA 3JS6A 5LY3A 3CQYA 5AQTA 5FPNA 2P9LA 2P9PA 4FWKA 4WYBA 4NB4A 1TUYA 3A0IX 3ENOA 3AY9A 2YI1A 2P9NA 1S22A 2GWJA 1BDGA 4BGBA 4PKGA 2V51B 2W41A 5FPMA 4BRFA 1WOQA 4CZHA 3DJCA 2FSNA 1HUXA 2FXUA 2Q0RA 3SMSA 1K8KB 2P9KB 3MN7A 5AQUA 4BVPA 4BQZA 2ZGZA 4XEIA 4EFHA 2PAVA 4J8FA 1BOTO 3H45C 4ISFA 2YHYA 5EXWA 4BRDA 3HZ6A 3FE1A 5AQNA 2D4WA 2VWBA 5JICA 1G99A 5AQPA 1IG8A 3VEXA 4BR4A 3C0BA 1E4FT 1K8KA 1NM1A 2P9KA 4H0YB 3R8EA 3VENA 4RCHA 3VPZA 4F9OA 4CZIA 5F1XA 3VEZA 2CGJA 1SAZA 5BRHA 4WQ4C 3FR0A 1U2VB 3MK6A 3EKSA 1YAGA 3O08A 3MN5A 4IWVA 4CZJA 5CE3A 5TKYA 3ENHA 2NZTA 3U9DA 1BU6O 1GLDG 1X3NA 3O6WA 5AFUH 4BRQA 4BR2A 4ISGA 2FSJA 3AAPA 3VEYA 1U2VA 5EVZA 3EKUA 3ZEUB 3CERA 3IFRA 5LJVA 3I8BA 3FZHA 4MO5A 5AQLA 4FL9A 3VF6A 3O8MA 5ADXH 5AQRA 2KHOA 3WXLA 1GLEG 2Q0UA 2ASPA 2Q2RA 4FSVA 2A40A 1GLLO 5KPRA 3UB5A 2YHXA 4H5WA 3EZWA 2V52B 4BR7A 1Y64A 4DCHA 5BREA 3ZETB 2H3GX 5AQKA 1TYQB 4H0OA 1T6DA 4FWPA 4CD1A 2QW9A 4CZKA 4EAHD 1NGAA 3M3ZA 3KZBA 4GNIA 1NGIA 3R9PA 3VGLA 3LL3A 4HTLA 3UE5A 3I33A 4LC9B 3CJ1A 2ZGYA 1HLUA 4H5TA 2ITMA 3GDQA 1RGIA 4H0PA 3ZETA 1TYQA 4H0TB 5AR0A 5KQDA 4BR0A 4H5NA 1D4XA 4EHUA 1Z6RA 3TPQA 2Q97A 2D0OA 4M7YA 3H3NO 5KQ8A 3ZX3A 4B1UB 4FPAA 2NLXA 1HX1A 5AQIA 2IVNA 1MWKA 2E2NA 3VGKA 5AQFA 4BRKA 2I7PA 1BA0A 3CI5A 4JHDB 1NGFA 4B1XB 4BREA 5AQOA 1NGCA 1JCEA 1BG3A 4A62A 4PL8A 3SMPA 3U8XA 1JCGA 2HF4A 5EY4A 3EN9A 5E26A 3RSEB 3FZKA 3QBXA 1OKJA 2Q36A 2V7ZA 4L3QA 4CBUA 2QWPA 4BRMA 4A61A 1SQKA 4DHYA 5ADXA 1BUPA 1TUUA 1Z05A 2AA4A 2ASOA 3M6GA 4JHDA 3M1FA 1YVNA 3A5LC 5B8HA 2W40A 5AQYA 2CGKA 2YHWA 1P8ZA 2DPNA 4H0VB 2E1YA 4PKIA 3O80A 4IXCA 3DAWA 2HF3A 2D0PA 2E2QA 3RSEA 3GBTA 3MDQA 4PKHA 2CGLA 2QWRA 3D2FB 4FWOA 3HSCA 3ATUA 3IDHA 4NO7A 3HBTA 3SJHA 1NGBA 1NLVA 1S3XA 3ULEB 2VCPA 4H03B 1XUPO 5BN8A 4MO4A 2IIRA 1IJJA 1YUWA 3HI0A 5BN9A 4A2AA 1NGDA 3G25A 4MLEA 4A2BA 3WQTA 3EL2A 5JLFA 5BRDA 3QDKA 3D2FA 1H1VA 2OANA 5AQZA 3ULEA 5FPEA 4B1ZA 1HKCA 5EOYA 4AM7A 3WXKA 1QZ5A 1QQOA 4FWQA 4XH1A 1NMDA 4BGAA 4K42A 1GLCG 4XH5A 1ZXOA 4FOIA 1U6ZA 3UKRB 4BC3A 4RTFD 3ZX2A 4K25A 1LOTB 3B8AX 3H6EA 1V4TA 2NRHA 3BF3A 5AQVA 2QM1A 2E2OA 3AARA 2F9WA 3H46O 1BO5O 2GUPA 2BUPA 4CZMA 2V7YA 4BRIA 5BRFA 3MN9A 3QBWA 3A5MC 3HM8A 2AP1A 1NGEA 2E8AA 3WT0A 3UKRA 4BC2A 4CBWA 1ZBSA 4MLHA 4JD2B 4M63C 3S41A 1NGGA 3LDQA 4I6MA 2E88A 2HMPA 4B1YB 3GOIA 3WEEB 4RWTA 2ASMA 3LDLA 4ISEA 1J6ZA 1HKGA 4BR5A 3DXMB 1ZC6A 2P9IB 4JD2A 3U9ZA 3CETA 1T44A 4JN4A 5E84A 5BR9A 3H3OB 5AQWA 3CQXA 5F2RA 1EQYA 4BQLA 3DXKB 4IJNA 3D2EB 1QQNA 3WEEA 2GWKA 5AZIB 1C0FA 5AQJA 4CZGA 3DXMA 4BRAA 3LM9A 2WUSA 2P9IA 3VGMA 3L0QA 2GEMA 5KPTA 3H1VX 4PL7A 3WQUA 3BUZB 5AQMA 4BRLA 3ATVA 1CZAN 4DB3A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LAWA 1TK8A 4O5FA 2I7NA 1W97L 2IVPA 3O1WA 4WE1A 4XIUA 2Y1JA 3JXUA 4E0DA 3Q7CA 1J53A 1K6YA 1WN7A 3O3HA 3DLEA 4C1NI 4YDUC 4OGCA 4IEIA 4UQGA 3O4WA 3SQ1A 4H8KA 4I9LA 4IOCL 4FOEA 1L5UA 4CHYA 1BA1A 2UYTA 4KPYA 4CJ5A 3VESA 2WONA 3LP3A 3SUOA 1T05A 1VQKN 2ZJQL 5GIOA 3KVGA 1XWLA 1TGOA 4HHTA 4CJFA 3DLBA 3ZSYA 3BEXA 1SZ2A 1YXQA 1DT9A 4IZ9A 4YNQA 2YNHA 3QESA 2EWSA 3I56N 1YIJN 4JI6K 1QS4A 4QS9A 3EEQA 4DSFA 3SLCA 1B92A 4B8CA 4BRNA 3VEVA 1KVAA 1NWKA 5DM6L 4B9TA 5AQSA 2C1GA 4EZ9A 4FLVA 3I55N 4AHUA 4FLZA 3C95A 4FWMA 4QOZB 2O8CB 1NJYA 4KTQA 4YFUA 2XY8A 1K8AO 3O1BA 3L2WA 3R1XA 3DLLL 3RMAA 4JKDA 1VSJA 2G8KA 3U3YA 5JS1A 4BDZA 1KAXA 3EE8A 4B9QA 3L4IA 1S1WA 2PFUA 4DLGA 4JKBA 1RTDA 3IMXA 4ILJA 4BRCA 3RWUA 1FK9A 3ZSOA 1RT2A 4E7KA 4BVOA 5AQHA 4I6MB 3AA4A 3IUCA 3NH1A 4OO1J 3SAGA 4IFEA 3OVNA 3TANA 4DFJA 2XY5A 1I3AA 2QEXN 5KRTA 2UXCK 2Z1HA 3CPWM 4DTSA 2HBMA 1XQSC 2GUIA 1JL2A 1XHZA 3AVKA 2FSKA 1ASUA 2A5XA 1SS6A 1IKVA 2NRZA 1S1UA 4Y1DA 3NVKA 4LFAK 3OS2A 5AQQA 4CIGA 2O8EA 4RG8A 3AVMA 3OYDA 2A3ZA 4C8KA 4CHNA 2O8DA 2YKNA 2FLOA 4U67L 3LZIA 3QMLA 4NYFA 4V19S 5KGWA 4BRPA 5HROA 4B3TK 4ILGB 1YJ9N 4B1VA 3FZLA 3BP8A 4WQ5C 3NE6A 4EIAA 3LPUA 4DQPA 4NCAA 4DS4A 5HP1A 1YF5L 4X65K 5GINA 4GVEA 1QHAA 3LANA 1NG9A 5HRNA 4E7JA 2LSNA 4YOUA 4J2AA 4O44A 4FWSA 3K5OA 3S3MA 3THYB 4HWIA 1OH6A 4OKJA 4CJSA 3CJCA 4CJ7A 3KIOA 3CC4N 4BRHA 3T1HK 4FJ7A 2GBZA 1ZBLA 1GLBG 1WAFA 1U48A 4Z4IA 4RW4A 2YNGA 1IKWA 1S9GA 4DQ8A 3L6QA 3AO2A 2NRWA 2QI2A 3QLHA 3J80O 3JS6A 3RVCA 3CF5L 2YNIA 3HXMA 4LF6K 2P9PA 1HR0K 1UAXA 4WYBA 4FJXA 1HNVA 3AVGA 2GX9A 1QVFM 3V1RA 4DR6K 2YI1A 2P9NA 4DTUA 2HHIA 4GKKK 2GWJA 2RKIA 5JVHL 4CIEA 4CJQA 5FPMA 4BRFA 4CFAA 1CZ9A 4CHOA 2BANA 3TSUA 3AA5X 2P9KB 3E9PA 3IS9A 4BQZA 4CGJA 4F3TA 4YOYA 1VSMA 5SZTA 3VA3A 5C10A 1C6VA 2YHYA 5EXWA 2FBVA 4BRDA 3FE1A 5AQNA 5JENA 1IG8A 4DTNA 1VAZA 1E4FT 4PWDA 1OVQA 4CZIA 1EP4A 1SAZA 5BRHA 3NBPA 4DKWA 2O8FB 4RW8A 1YAGA 1QE1A 3KLGA 3LWLA 3DYAA 4IWVA 2XHBA 5DM7L 3TAGA 4GW6A 3MXMA 2O8BA 4H4OA 3CFPA 3THXA 3O6WA 3VMFB 2DFHA 1S5JA 4YY3K 1GOCA 4E7LA 5EVZA 3EKUA 3WNGA 3IFRA 3FZHA 1WSHA 5AQRA 2KHOA 3WXLA 2Q2RA 3OYCA 4DFKA 2A40A 3UB5A 3AVJA 1JLEA 4AHTA 1X9SA 4BR7A 1J9AA 4DCHA 4KTZA 1JXBA 2OTLN 4H0OA 1C0TA 1L3VA 2PYLA 2IC3A 3CCVN 2D5RA 2DFFA 3LAMA 5M1PA 5CHIA 2DY4A 3S3OA 1NNEA 1QHTA 4LC9B 3ZSVA 1HLUA 3GDQA 4KKOA 3U6FA 2HB5A 4F4KA 3MWTA 1D4XA 1VQPN 4WCEL 4N76A 1VQ7N 5KQ8A 4B1UB 1IV0A 1QVGM 3M8PA 2E2NA 1XI1A 3V6DA 5HRRA 3HYFA 3NAEA 2VGMA 1JCEA 4PL8A 1HNXK 4DR4K 1T8EA 5EY4A 2Z1JA 4HTUA 1OKJA 5C15A 2E4LA 1MU2A 4Q5VA 4AQYK 3G71N 2QWPA 4DLEA 5ADXA 5J2PA 4ELTA 1A5XA 2ASOA 5IT9O 1TK0A 5B8HA 4DG1A 3K9KA 2YHWA 3MECA 2G8FA 4PKIA 5J1EA 4BY9C 2HF3A 2D0PA 3RSEA 1WSJA 2YNFA 1HQEA 1IH7A 4IFVA 3D2FB 5M1OA 4NXNK 4DFMA 2HHSA 1NJZA 1LV5A 5J2NA 3M8SA 1BI4B 3RMBA 4K0KK 4NO7A 3HBTA 1S3XA 2IIRA 1DTTA 3HI0A 1RT3A 1W9HA 1YTAA 1N6QA 4MLEA 4O5BA 1H1VA 1XHXA 3OYBA 5AQZA 1TK5A 2IOCA 3SPYA 2KLAA 2X74A 4AM7A 3WXKA 3NF8A 4FWQA 1NMDA 3VQ8A 1VSDA 3THWA 4CJVA 4DU1A 4KHQA 3PO5A 2W00A 1L3SA 4K8ZA 1ZXOA 4DSKA 3DM2A 4O0JA 3SBGA 3ZX2A 4K25A 1DLOA 4HUGA 1U47A 2HHWA 4CJ4A 4I2PA 3CYMA 3SI6A 2F9WA 3H46O 1BO5O 4E19A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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