4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
source organism Caulobacter vibrioides
molecule tags Structural protein
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
4FSVA 1HKCA 5AQMA 4BRHA 5LJVA 1GLBG 3D2FB 4A61A 1MA9B 3CHWA 1NBWA 3ULEB 2V52B 5E84A 4B1XB 5AQIA 4QS9A 3H45C 1DGKN 2E1YA 1YAGA 3ZETA 5AQQA 4CZHA 3LM9A 2YHXA 4IO8A 3VEVA 1LOTB 1XUPO 1DKGD 1RFQA 5E26A 5F1XA 3GG4A 3WXKA 1MWKA 4O8KA 1QQOA 1Z05A 2Q1NA 1T6CA 3KHYA 3H1QA 4FWSA 2IVNA 3BF1A 3I8BA 3O1WA 2P9IA 5I9EB 1XC3A 4K42A 4BC2A 5AQJA 3D7EO 1P8ZA 3QDKA 1S3XA 5BPNA 4BRIA 1RDWX 3R6MA 4FWMA 4DHYA 2AP1A 4BR7A 3LDOA 4DB3A 3WEEA 4M63C 2P9KB 1NGIA 2P9LB 2HF3A 4FOIA 3FLCO 4MO4A 5AQWA 4BC3A 3R9PA 3GBTA 2P9SB 4XH4A 2EWSA 3WXIA 2DPNA 3ATUA 1QZ5A 4WYBA 4B1UB 3LDLA 4WQ4C 4CZIA 4BG8A 1BWFO 1SQKA 2ZGYA 3H6EA 5KQ8A 3CQXA 5AQOA 4AM7A 3CJ1A 2P9NB 5AQYA 3WUHA 4DQ8A 4O5FA 4I6MB 2Q36A 3M3ZA 3RSEB 4EFHA 5AQTA 4BRKA 4NO7A 4L3QA 3FFKB 1HUXA 2WUSA 3ID8A 3CQYA 4WQ5C 3DXKB 1ZBSA 3D2EB 5JICA 1E4FT 3IMXA 2Q0RA 4CI6A 2QWPA 2UYTA 3LM2A 2PAVA 3VEXA 4CZFA 4BRAA 2H3GX 2W40A 2FSJA 4CZEA 4E1JA 3VGMA 3LDQA 4CJ7A 2GEMA 2D1KA 2E2QA 3ZEUB 3H46O 1E4GT 3A5NC 2HMPA 3HSCA 1C0GA 4H0PA 1DEJA 2YJFA 3IDHA 1TUUA 2E20A 4BRCA 1D4XA 1ATRA 2ASPA 1X3NA 3UB5A 2V7ZA 4H03B 2BTFA 1SZ2A 3EL2A 4IJNA 5AZIB 3H3NO 3J8AA 3CJAA 4BROA 4BRDA 3SMSA 4IXCA 5B8HA 1QHAA 5LJWA 3O4WA 4YDUA 5EXWA 4RCHA 2NRHA 2NZTA 4PL7A 4M7XA 1QZ6A 3VF6A 1OKJA 1TYQB 3U9DA 1KXPA 1TUYA 5CE3A 1NGEA 4K41A 3VESA 2F9WA 1NMDA 3AAPA 2AA4A 2GWKA 2YCHA 1JCGA 4K25A 1K8KB 3CI5A 1IG8A 5FPDA 3B8AX 3LDPA 1U2VA 1HJOA 5BN8A 1MWMA 3VPZA 3ZX2A 2I7PA 3SJHA 4BRGA 1NGBA 2YHYA 5FPMA 1BOTO 4GY2B 3UKUA 3VGLA 1ESVA 3P4IA 4CZMA 3VEOA 2V7YA 1KAZA 4BR0A 3QFUA 2P9UB 2VCPA 3MN7A 4BRMA 3CIPA 2CH5A 5AR0A 2FSKA 3AAQA 3O8MA 4NB4A 3H1VX 4A2AA 4FL9A 3CJ7A 2P9PA 4DCHA 4H0VB 4BVPA 3ENOA 3HZ6A 1GLFO 5AQRA 4QS7A 4EAHD 4H5VA 3BUZB 1NGAA 2YI1A 4BG9A 3W0LA 3M1FA 3C0BA 3DXMB 3GL1A 4FPBA 1ATNA 4Y0WA 5AZJA 1Y64A 3VF4A 1SAZA 2E2OA 3HM8A 4BRFA 1X3MA 2QM1A 3KVGA 1GLLO 4ISFA 1GLAG 1NLVA 5ADXA 3IUCA 4FWLA 2FF6A 3SLCA 3TPQA 2E2PA 4BRLA 5TKYA 5BRFA 2QW9A 3U9ZA 4XEIA 5BN9A 3UKRA 5JMVA 5AFUH 4BR4A 1NWKA 4Z94A 3LL3A 2CGLA 4EHUA 2YHWA 1HPMA 5EX5A 2J4RA 4IZ9A 5AQZA 3CJBA 4FWQA 3ZETB 2QWNA 2VWBA 1RGIA 4KBOA 3A8YA 3WXJA 4ISGA 3QMLA 5JLFA 2QWQA 3I33A 3JS6A 5AQGA 2CH6A 2E88A 1QQNA 3FZFA 2FSNA 3A0IX 3WXLA 2QWLA 1BU6O 4FOEA 2A5XA 3VERA 3AARA 2FLOA 2P9IB 2ZF5O 4IWVA 5BREA 2ITMA 4JNEA 2GWJA 5BRDA 4CZKA 2Q2RA 4EHTA 1X9JA 3SK3A 2FXUA 3WQUA 3FZMA 2E1ZA 4JD2A 4PKGA 1R59O 4BREA 3FZLA 4JHDA 3CETA 4BRNA 3WEEB 3MDQA 1BA1A 1NM1A 3BF3A 5FPNA 4J8FA 4B1YB 4RWTA 2OANA 4YDUC 2KHOA 5AQNA 4JAXA 4XH5A 4F9OA 3A5OC 3IFRA 2Q0UA 4JHDB 4BQZA 2Q97A 4MLHA 1MDUB 5AQXA 1J6ZA 3O80A 1U6ZA 2A3ZA 1H1VA 1T6DA 3DAWA 3L4IA 4FPAA 3WT0A 5AQVA 5BPMA 3FZHA 1NGFA 3VEZA 3TU5A 2A40A 3QFPA 2QWOA 4BC5A 5AQLA 4A2BA 3FE1A 4H0YB 1XQSC 4IJAA 1YVNA 3ATVA 4FWPA 3O08A 5AQPA 3VOVA 1C0FA 4BVOA 5KPRA 4HTLA 4PKIA 2NLXA 2IIRA 4CBUA 2V51B 4HWIA 4BGAA 2D0PA 1WUAA 3W3DA 2A41A 3ZX3A 4LC9B 3HTVA 2P9KA 5EVZA 3VENA 2P9LA 1NGJA 3G25A 1HX1A 3UE5A 2P9SA 4BQLA 1NGDA 1HLUA 2ZGZA 3EO3A 1GLEG 5BRHA 1V4TA 1T44A 3BEXA 1CZAN 1GLDG 3VGKA 1G99A 2E8AA 3ENHA 3MN9A 1WOQA 2GUPA 4B9QA 4BR2A 2IVPA 3R8EA 3EKUA 4K43A 1HKBA 2P9NA 3HBTA 3L6QA 1IJJA 4I6MA 2QWMA 3VEYA 3RSEA 3MCPA 5LY3A 3VETA 2D4WA 2FF3B 1GLJO 3QBWA 2E2NA 2BUPA 1ZXOA 4CD1A 3DXKA 3D2EA 1NGCA 3SMPA 2GTDA 5EOYA 3MN6A 3FR0A 2VYPA 4GNIA 2CGJA 2I7NA 1GLCG 1BO5O 3VF2A 3HI0A 2Q31A 3CJ9A 2YJEA 5KPZA 4B1VA 3ZEUA 1U2VB 2GELA 4B1WB 4EIAA 2CGKA 3O1BA 3DJCA 3UKUB 3WQTA 1ZC6A 1V4SA 1LCUA 5AZIA 5F2RA 3VEWA 4XH1A 3C7NA 5AQSA 2D0OA 3U8XA 1JCFA 3LDNA 2ZWHA 4FWRA 2A6AA 4CD3A 3A5MC 3BP8A 3CJCA 3GE1A 4PL8A 4FWNA 1NGGA 3H3OB 2P9PB 3AY9A 3MMVA 4AM6A 4WQ4A 1YXQA 1TYQA 1QQMA 3L0QA 5KQDA 3MN5A 3M6GA 3EZWA 4BRQA 3EKSA 4QS8A 5AZJB 1K8KA 4CBXA 4H0TB 2QWRA 5AQKA 4MLEA 3FGUA 1YUWA 3OHRA 3QICA 3O6WA 3D2FA 4H5TA 4A62A 3ULEA 1JCEA 4FO0A 4WQ5A 5AQHA 1Q18A 5AQFA 2A42A 1BG3A 1BUPA 3MK6A 5EY4A 3UKRB 5BR9A 1KAXA 2P9UA 2ASMA 4RTFD 1BA0A 1ATSA 4JN4A 3GDQA 4H5NA 2QXLA 3ZX0A 5AFUA 1KAYA 3F9MA 3KZBA 1Z6RA 1S22A 3QB0A 5FPEA 4H0XB 4PKHA 5ELZA 4FWOA 3JXUA 4H5RA 4MO5A 4CZLA 3U4LA 3CERA 4H5WA 1HKGA 3DWLA 3GOIA 5F0XA 3C7NB 3DXMA 4C23A 2HF4A 3A5LC 4BR5A 5JLHA 4BGBA 4CZJA 5ADXH 2F9TA 4BR9A 3O5BA 1NGHA 3FZKA 5AQUA 4BRPA 4B1ZA 1EQYA 1BDGA 5KPTA 4H0OA 2ASOA 4M7YA 4CBWA 4JD2B 2IVOA 2W41A 4FWKA 4ISEA 2HOEA 3S41A 3EN9A 4BC4A 4CZGA 2PBDA 3QBXA 5BPLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4RG8A 4FSVA 4FJGA 5AQMA 3ULEB 4AHRA 2V52B 4O44A 3D0PA 5E84A 1QVGM 5AQIA 1YAGA 1JLQA 5AQQA 4CZHA 3LM9A 3THVA 2YHXA 2G8UA 1LOTB 4DV4K 2PYJA 5E26A 3U6FA 5F1XA 3SAFA 2Z1JA 3MEGA 4CJEA 4O8KA 1QQOA 3MWTA 3DOKA 2Q1NA 1T6CA 3KHYA 3CYMA 2IVNA 3CCQN 4CEEA 4B9TA 5I9EB 1P8ZA 3AVIA 5BPNA 4KI4A 4H8KA 5GIOA 5C12A 3T69A 4BR7A 3KLEA 4JK9A 4I7FA 4DB3A 2DTUA 1D8YA 2P9LB 4GW6A 1OH5A 4JS4A 2HF3A 3FLCO 5AQWA 3O4QA 2EWSA 3OYKA 3RTVA 4PQUA 2Z1GA 2DPNA 5AJ3K 2Z1HA 3NHGA 1YI2N 4E1MA 3TAQA 4CEOA 4OKEA 3ZSWA 2ZGYA 3H6EA 4AM7A 1T03A 3CJ1A 2P9NB 4I6MB 1HRHA 1VSHA 3SUNA 5AQTA 4RW8A 4NO7A 4M42A 1HUXA 3SQ1A 1W7AA 4M3ZA 3Q7CA 1Q7YO 1GOAA 1EWRA 4JS5A 3SCXA 1YHQN 1K8AO 4F4KA 2RKIA 1TKDA 4DSKA 3VEXA 4MQ3A 4CZFA 4BRAA 4E1JA 3LDQA 3TAFA 1WSEA 3AA3A 3AGKA 3ZEUB 3H46O 1J5EK 2HMPA 1C0GA 4FW2A 4JI4K 1ATRA 2QI2A 2ASPA 3P1GA 4ICLA 4B3RK 1X3NA 3UB5A 3HT3A 3L8BA 1ILYA 2BTFA 4OX9K 1EP4A 3AVJA 4IJNA 3VQEA 3K5MA 3AVFA 3EE8A 4BROA 1RBTA 4FLWA 1QHAA 5LJWA 3AV9A 4CJTA 2NZTA 1WAJA 4LD0A 1BI4B 1QZ6A 3VF6A 4JKHA 3U9DA 1FW6A 4N5SA 3CCSN 5CE3A 1TUYA 4JI7K 2F9WA 3AAPA 4LH5A 3CQ8A 3SAHA 2B4JA 5FROA 2AA4A 3MWPA 4LF6K 1NK5A 1K8KB 3CC2N 1WSHA 3LDPA 5BN8A 1JL2A 2OPSA 4AF1A 3L2UA 4DSFA 4JKGB 1VQPN 2KFZA 1WB9A 4CGGA 3AA5X 4CJLA 5FPMA 3TARA 4DQQA 1N36K 4WFBL 2P5GA 3P4IA 1KAZA 4C8KA 3ENBA 1RTIA 1WSIA 4FJ7A 3CIPA 1WBBA 1KQSM 3HPGA 2FSKA 4NB4A 4DUYK 3H1VX 4QOZB 2E4LA 3V1RA 4CK2A 3VTHA 4GV9A 3BUZB 5MLCQ 3DLLL 2ZJQL 5AZJA 2O8EB 2E2OA 4CFBA 5C24A 4FZZA 1X3MA 4FLVA 5H1SQ 1NK7A 1NJZA 1GLAG 3J7AP 2B5JA 4DR7K 3HVRA 4FWLA 4Z4EA 1OVYA 1QHTA 3VQ5A 5JMVA 4B9SA 3UKRA 4OGCA 1RT2A 3SUOA 4DU1A 3ZT3A 3HPOA 1HPMA 5EX5A 5LL6Z 3CJBA 4FWQA 2XHBA 3ZETB 5HRSA 4KBOA 3A8YA 3QESA 4K8XA 1IO2A 2HNDA 3QMLA 4HTUA 3T1YK 1VQ9N 2QWQA 3I33A 3JS6A 3R3LA 2E88A 4CGJA 2QTDA 3SV4A 4FVUA 3QEIA 1C0TA 4OLBA 2X6NA 4KTZA 5TKWA 2C1IA 3DRPA 1QSSA 4CFDA 5CZ1A 2DFHA 4OLAA 3V1OA 5BREA 2IOCA 1I39A 4W5QA 4U67L 3VQ6A 1HR0K 1ASUA 3WQUA 3FZMA 1J54A 2E1ZA 3T1AA 2WFBA 3WEEB 3SQ2A 3HP6A 3M8PA 4E89A 3V81A 2QA4N 4JAXA 4CGIA 4F9OA 1IKVA 3A5OC 1B9DA 3HJFA 4BQZA 2Q97A 4HHTA 1CZ9A 1C0UA 3LANA 4CJRA 4FLXA 1B9FA 4B9VA 3OYMA 3T1HK 1XQSC 1Q82O 4JEPA 4FWPA 5AQPA 5DM7L 4UY8O 4BVOA 4KPYA 4CBUA 2V51B 1IKWA 2D0PA 3O9SA 2P9LA 1TGOA 2YNGA 3OYDA 1YJWN 3WNHA 2OCEA 1TAUA 1NGDA 3VQCA 1GLEG 3M8QA 4CEFA 5BRHA 1V4TA 1U47A 4FJ9A 1RTJA 2ATQA 1CZAN 1GLDG 2KW4A 1G99A 4PA1A 1VQ6N 1BIUA 4ILHA 4ELUA 4FW1A 3ZSYA 1LW0A 4YHHK 4NLCA 2I5JA 2BE2A 4ELTA 3EKUA 1HKBA 2P9NA 3HBTA 4I6MA 4M3UA 3MCPA 1LWCA 3O4NA 1R0AA 2G8HA 1CLQA 1GLJO 1J5OA 3NE6A 2UUBK 3QBWA 2E2NA 4CHZA 1FKOA 5FLXO 3N4PA 4DF8A 4PUOA 3FR0A 1KD1O 1CXQA 2CGJA 3CJ9A 3ZSRA 1N32K 2NRTA 2NRXA 3ZEUA 5KTQA 2GELA 2AJQA 4B1WB 4EIAA 4I2PA 4MDAA 3RMAA 2X6SA 4F2SA 3LAMA 4RW9A 3MXIA 1LCUA 5F2RA 3J81O 4GV3A 4CJSA 4GMJB 3U8XA 1OH6A 1JCFA 4KRFA 1HQUA 3CM5A 4CD3A 2RPIA 4E7LA 2NRWA 4DFJA 3CJCA 1KTQA 4PL8A 4HVJA 4W5TA 1LV5A 2UUAK 1NGGA 3TSUA 2P9PB 1RNHA 1BI4A 4AM6A 4IOCL 4CIGA 4CHPA 4FJ8A 5KGXA 1U48A 2RE2A 4FZYA 4B3MK 1K8KA 5C42A 2XY5A 2QWRA 3U3YA 3QICA 3OYFA 2HHUA 3D2FA 3TR8A 5KRTA 4JKGA 1JCEA 2O8DB 4MFBA 5CYQA 1F21A 4KH5A 4OVLA 4KHYA 1WSFA 4YORA 3GDQA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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