4CZFA

C. crescentus mreb, single filament, adp
Total Genus 105
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
105
sequence length
337
structure length
329
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNKVVHAVGIEAKQMLGRTPGHMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELASDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 105
structure length 329
sequence length 337
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czfA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czfA03
2QWRA 3GBTA 1ZXOA 1WUAA 2ASOA 4JNEA 3CIPA 5KPRA 3WQTA 3G25A 1IG8A 1QZ6A 4CBXA 2OANA 4FWLA 5AQNA 3L6QA 1ESVA 1QZ5A 3LL3A 4FWSA 3O5BA 3EL2A 1RFQA 3DJCA 3WXIA 3ZX2A 2PBDA 3D2EB 2P9SB 1Y64A 4H5WA 5AQWA 2D0PA 1ATSA 1NGHA 5AQMA 5AQJA 1KXPA 2Q2RA 4BR7A 5BPNA 2Q36A 1ZBSA 3IFRA 3JXUA 2P9IA 4B1VA 4B1UB 3EKUA 3VF4A 1H1VA 4BC3A 3WXKA 5F0XA 4CZHA 4HTLA 2P9UA 4BC5A 3EN9A 3VGKA 4CI6A 4FWOA 3WQUA 5AQFA 3ZX3A 4BRQA 3QFPA 1V4TA 3CJAA 2HMPA 1QQNA 2BUPA 4FL9A 3HM8A 2ASMA 2A5XA 3A5LC 3VEXA 5AQZA 4A2AA 1SQKA 4EFHA 4ISGA 3M1FA 3U8XA 3WEEB 1OKJA 1HKCA 3GE1A 3VETA 2FF3B 3MN7A 2UYTA 5TKYA 4FOIA 1GLJO 2IVOA 3D7EO 4WQ5C 5LY3A 2V7YA 2GUPA 1RDWX 1NGCA 2HOEA 4PKIA 5AQRA 4CZGA 2AA4A 3U9ZA 3LM9A 1E4GT 3CJCA 4BRPA 1X9JA 3WXLA 2ASPA 1S22A 3BF1A 4L3QA 4NO7A 3H46O 3O1BA 3FZMA 3JS6A 3GL1A 3MDQA 3VEOA 5CE3A 2E2NA 5I9EB 3LM2A 2QXLA 4BRHA 3VEVA 2V51B 3FE1A 3VF2A 4BR9A 4H5RA 3ENHA 2A41A 3ZETB 1BUPA 4Y0WA 2DPNA 3CQXA 1K8KB 1NBWA 3O8MA 3ATVA 4CZFA 4GY2B 2IIRA 4JHDB 2F9WA 1TYQB 5EOYA 4QS7A 1BU6O 2A42A 4J8FA 5F2RA 5AZIB 1U2VB 1NGIA 4AM7A 1Z6RA 1BO5O 1GLFO 2A40A 2IVNA 4K41A 3UKUB 4MO4A 3AY9A 5JMVA 1NGEA 3RSEB 4H5TA 4H03B 3VF6A 4BR0A 3DXKA 2E88A 3CQYA 5LJVA 3DWLA 4O8KA 3CJ1A 4HWIA 1JCEA 5AQVA 4EHUA 5KQDA 5BRFA 1LOTB 5AQGA 4FWRA 4PL8A 2P9KA 1GLDG 4JAXA 4FWNA 3GOIA 4WQ4C 3CHWA 3ZEUA 4BROA 2YHYA 3BP8A 3FFKB 2P9NB 3WXJA 2YHXA 4EIAA 2QWNA 3O4WA 2Q1NA 2YCHA 4YDUC 1EQYA 4C23A 2PAVA 1YAGA 4I6MA 4IJAA 4BG8A 2V52B 3C7NA 5KPZA 3S41A 3HTVA 3MK6A 2WUSA 3U9DA 3UB5A 4A62A 4AM6A 2V7ZA 4Z94A 3CJBA 3EZWA 4FSVA 4BQZA 5JLFA 3MCPA 1DGKN 1KAYA 4DQ8A 5BPMA 3GDQA 2P9SA 1IJJA 3M6GA 3LDLA 2CGLA 1ATRA 3VENA 4BC4A 3D2FA 3R9PA 4A61A 1XC3A 5EX5A 4BRIA 4B1ZA 5AR0A 4E1JA 2P9LB 2QWLA 3H3NO 4BRKA 1P8ZA 4MLEA 4CZKA 5EXWA 4ISEA 3F9MA 1HUXA 4EHTA 4XH1A 1GLCG 1MA9B 3O1WA 3FLCO 4BR2A 2E1YA 3J8AA 2KHOA 2FF6A 2YJEA 1C0GA 1T6CA 2Q0UA 3DAWA 4QS8A 3U4LA 2A3ZA 3QICA 4B1WB 4RCHA 1CZAN 4BREA 4BRFA 3I8BA 5EY4A 3CERA 3I33A 2FSJA 2Q97A 4B9QA 3SJHA 4EAHD 3A8YA 3H3OB 4ISFA 4RTFD 3L0QA 3ATUA 4CZIA 2NLXA 4XH4A 5AQIA 2ZWHA 4FOEA 1Q18A 5BPLA 3BEXA 2E2PA 5BRHA 4FO0A 4K42A 2P9PA 4DCHA 5FPNA 1ZC6A 3FZHA 5AQQA 1QQMA 2YHWA 3EKSA 3HSCA 1NGGA 1NMDA 2NZTA 4FPAA 3SMSA 1MWKA 1XUPO 2H3GX 2HF3A 3FZFA 3ZETA 5AQYA 1K8KA 4K43A 3SMPA 3MN6A 1J6ZA 2HF4A 4H5VA 1BWFO 3AAPA 4H0VB 4BRNA 4IJNA 4BQLA 3DXMA 4PKGA 3VOVA 3BUZB 1HKBA 2F9TA 1U2VA 5AZIA 4CJ7A 1BG3A 3SK3A 3UKUA 3A5OC 4O5FA 4BVOA 4DB3A 1HKGA 5ELZA 2AP1A 1S3XA 3MN9A 4IZ9A 3UE5A 2YI1A 1D4XA 3ULEB 2VCPA 2QWMA 4M7YA 1MDUB 2D4WA 5AQHA 1TUYA 3O6WA 4KBOA 3AAQA 5FPEA 1QQOA 2FLOA 4QS9A 5AZJB 2I7NA 5FPMA 3QDKA 2P9NA 1T6DA 4WQ5A 2E1ZA 4JD2A 3UKRA 4H0TB 5KQ8A 2Q0RA 1R59O 5AQOA 1QHAA 5AQUA 1YUWA 4PKHA 2QM1A 5ADXH 5EVZA 4FWPA 2FSNA 4CZEA 4IWVA 2ZF5O 2ZGYA 1KAXA 1NGDA 2NRHA 3A0IX 3FGUA 3KVGA 5AQPA 3VGLA 3A5MC 4B1XB 4DHYA 2QW9A 3VESA 1WOQA 3ZEUB 4H0OA 1NM1A 5ADXA 2D1KA 2Q31A 3D2EA 5AFUH 3LDOA 2VWBA 2CGKA 5F1XA 4I6MB 4CBWA 3C7NB 1YVNA 3EO3A 3VEYA 1XQSC 2P9LA 1JCGA 3QBWA 4IO8A 3OHRA 1BDGA 1DKGD 5AFUA 1LCUA 4H5NA 3LDQA 1NWKA 3CI5A 1BOTO 2GEMA 1NGAA 4FWQA 3VERA 5BREA 3QMLA 3IDHA 4FWKA 4BGBA 1HLUA 4MLHA 2ITMA 3B8AX 2CH6A 5AQLA 3D2FB 4BRCA 1HJOA 2E20A 1G99A 3P4IA 3W3DA 1YXQA 3WEEA 3KHYA 2P9IB 2ZGZA 4BRMA 4A2BA 3A5NC 3CJ7A 4NB4A 2P9UB 4H0PA 2D0OA 4CZLA 3ID8A 4BR5A 3IMXA 4H0YB 1GLLO 3FR0A 3WT0A 3O80A 1X3MA 2YJFA 4BRAA 1GLBG 3HBTA 3L4IA 4WQ4A 3TU5A 1E4FT 2FXUA 4CZMA 4YDUA 4BVPA 5AQSA 2I7PA 2GELA 5BR9A 1RGIA 3R8EA 2FSKA 1TUUA 4K25A 3ZX0A 1NGFA 1NLVA 1X3NA 4BRDA 2E2OA 2W41A 4BR4A 3VGMA 1DEJA 4BRLA 5LJWA 2VYPA 1KAZA 1NGBA 2CH5A 2E8AA 1HPMA 4JHDA 1U6ZA 1TYQA 3IUCA 3W0LA 4BGAA 4JN4A 3R6MA 3C0BA 4BG9A 3WUHA 3CETA 2P9PB 3H1QA 3KZBA 5E84A 3VEWA 4FPBA 1GLAG 3BF3A 2E2QA 2GWKA 4WYBA 3RSEA 3GG4A 5E26A 3ENOA 1T44A 4XEIA 3AARA 3H45C 3LDPA 3MN5A 4H0XB 4XH5A 5B8HA 1V4SA 1C0FA 3M3ZA 3ULEA 1BA0A 4IXCA 2BTFA 5AQXA 1BA1A 4F9OA 3DXMB 4M63C 4LC9B 3QBXA 4CBUA 3O08A 3TPQA 2CGJA 2IVPA 5BN9A 3SLCA 3QB0A 3QFUA 5BN8A 1SAZA 4GNIA 2GTDA 5AZJA 4BRGA 5AQKA 3DXKB 4PL7A 2QWOA 2GWJA 4CD1A 3H6EA 3MMVA 5JICA 3FZLA 5JLHA 4CZJA 3VPZA 4MO5A 4CD3A 2J4RA 1ATNA 3LDNA 1HX1A 4B1YB 3HZ6A 2QWQA 5KPTA 1GLEG 1MWMA 2A6AA 3H1VX 3HI0A 1SZ2A 5AQTA 2P9KB 4FWMA 5BRDA 1NGJA 2EWSA 4RWTA 4BC2A 3FZKA 3VEZA 2QWPA 1JCFA 2W40A 1Z05A 4JD2B 5FPDA 3UKRB 4M7XA 3CJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2QWRA 1ZXOA 2ASOA 1LWEA 3L4QA 1Y97A 4YFUA 2OANA 5AQNA 4YHHK 1ESVA 1IBLK 1QZ5A 4FWSA 4DR6K 1JL1A 1FW6A 3LPTA 3WNGA 4RW4A 1Q8IA 1RFQA 5FRNA 3HM9A 4B9NA 1Y64A 4FJKA 3ZSWA 2D0PA 4OKJA 1I3AA 3VF4A 4OPJA 5F0XA 2FBYA 4DS4A 4RW6A 4HTLA 4BC5A 4JKCA 3WQUA 4AHVA 4BRQA 1V4TA 2HMPA 2BUPA 1JLFA 4FVMA 3V9SA 4B3MK 1ASUA 2A5XA 3A5LC 5J1EA 3VEXA 4DTUA 4FJXA 1KLMA 4LF8K 3EE9A 4ISGA 2HSTA 2G8IA 1FXXA 4CESA 3GE1A 4KPYA 2HHUA 4FJ8A 3MN7A 5TKYA 4FOIA 1VSHA 4KB1A 4F8RA 5LY3A 4DQIA 4N47A 4PKIA 2HHVA 2KW4A 2AA4A 4CEZA 3T69A 4CF2A 4G9ZA 1X9JA 3T1YK 4L3QA 1BCOA 2ETJA 1Q82O 4CF1A 3JAMO 5HOOA 1BIUA 1LV5A 4AHCA 3FZMA 3KWIA 4LF9K 1EWQA 2KZZA 5CE3A 1C0TA 4A5AA 4KV8A 2P1JA 3LM2A 2QXLA 1C6VA 3IS9A 4BR9A 4H5RA 1N36K 1HYVA 1IO2A 2UUBK 5CZ1A 1LW2A 3PIPL 1HNXK 2NNWA 3EY1A 5FDLA 2PY5A 3L3VA 1WSJA 5C10A 2E5LK 3AVAA 3DRSA 4J8FA 1BQMA 5AZIB 1NGIA 1VSMA 1BO5O 3IAYA 3VA3A 2UUCK 4GV6A 2KLAA 5JVHL 2IGIA 4H03B 3VF6A 4B9UA 3DXKA 3OJUA 1C1CA 4AHUA 3CCMN 1RT7A 1Q9XA 3SQ4A 1WBDA 1LOTB 2P9KA 1GLDG 4FWNA 3PX6A 2P51A 4WQ4C 2HNDA 3CHWA 3T7ZA 1VQPN 3C95A 3WXJA 4CFCA 1XMQK 1ZBFA 5J2PA 4LF5K 2HHXA 4DR4K 4I6MA 4MQ3A 4FK0A 4X65K 4FW2A 1IKWA 4CJTA 3LZJA 4CHQA 1TK0A 3UB5A 4AM6A 2G8KA 1NOZA 1VSFA 4N41A 4B3RK 3EZWA 1M90O 5JLFA 4F2RA 2Q3SA 3CCVN 4TSXA 5J2NA 1KFDA 3LDLA 4CK2A 2CGLA 3OYGA 3VENA 3CC2N 4A61A 1XC3A 3D0PA 3TAGA 2QKKA 2P9LB 3G0ZA 3VN5A 3HRGA 1RTJA 4MLEA 3F9KA 1A5XA 3ZSYA 3F9MA 1NKEA 3O1WA 3FLCO 2KHOA 4DQRA 3OYLA 2FF6A 4M3ZA 3ZT4A 2JLEA 1C0GA 3O3GA 3NFAA 2D0CA 3DOLA 4DKWA 1BHLA 3TTCA 1S5JA 4B1WB 3THWB 1XNRK 1EX4A 4RCHA 1REVA 3SQ2A 3I8BA 3CXCM 4H8KA 3U6FA 3CCLN 1LWCA 1CXUA 2Q97A 3OVNA 3AVFA 3SJHA 3A8YA 1EXQA 4ISFA 4KFBA 4MFBA 1IKVA 1O1WA 1OH6A 3K9JA 2W6LA 3TAMA 4Z0UA 5AQIA 4EZ9A 3BEXA 3CCRN 1NMNA 4FO0A 2P9PA 1ZC6A 3FZHA 5AQQA 1G15A 2YHWA 1NMDA 2NZTA 3HYFA 4DTMA 3RMBA 3HVRA 1RTHA 1KD1O 4O5BA 2YHAA 4CHPA 2H3GX 4K43A 2A1RA 4C8LA 1DT9A 3MN6A 1HYZA 4H0VB 1KFSA 4X66K 3VOVA 3U3YA 5AZIA 1VRTA 4YOWA 1XHZA 3SK3A 4O5FA 4BVOA 1QVFM 3VQ9A 1NKBA 1HKGA 3LAMA 1S3XA 4GVEA 4BE2A 1SKWA 1D5AA 3CD6N 4L8RB 5FRMA 2VCPA 1Z26A 5CYQA 1UAXA 4Q5VA 1X9WA 1N8RO 5JVGL 3AVBA 3LAKA 4IEIA 1QQOA 2D5RA 1SS6A 2E1ZA 4JD2A 1RT4A 3O9RA 1E3MA 1JLGA 1JLQA 1QHAA 2QM1A 3NH1A 4FWPA 1RDCA 5HROA 4A57A 1KAXA 1RBRA 2NRHA 1UOCA 3KVGA 4OPAA 4CFDA 3PLAA 4GKJK 3NGIA 2NRVA 4B1XB 4DHYA 2E6MA 2QW9A 5A2QO 3ZEUB 2QKBA 3ZYYX 3DLGA 1U47A 4C1NI 3NF7A 3D2EA 3RMCA 1KC8O 3MEEA 2A1SA 1VQON 4CEFA 3CC4N 1NOYA 1X9MA 3NCIA 4NLBA 3BY5A 3V9WA 2P9LA 1L3TA 1RT5A 1VSDA 1BGXT 4R79A 5AFUA 3OYBA 1LCUA 1VSKA 3CYMA 3T1AA 4YOVA 4OKEA 2GEMA 3HVTA 2O8DA 3MECA 3P83D 4FWKA 1UA1A 1HLUA 3VQ6A 1VQLN 3D2FB 1YXQA 4DS5A 2RF2A 3KHYA 4WFAL 2O8CB 4FJHA 5KI6A 5HRSA 1VQ9N 5SZTA 1X3MA 2YJFA 1X9SA 3CYGA 4FLUA 4BRAA 4WQ4A 4FLZA 3TU5A 2IOCA 4EP4A 2FXUA 4CZMA 1KQSM 4BWMA 4BVPA 1RT2A 4CJ4A 2W6KA 2GBZA 2WC9A 3KLGA 2I7PA 2GELA 3DLKA 1JLCA 3R8EA 4ELTA 2DTUA 4BRDA 1ILYA 2E2OA 1BI4B 4FM0A 3VGMA 2VG7A 5LJWA 4DQPA 1ITGA 1KAZA 1NGBA 3ID6A 4NCAA 2WOMA 1HPMA 1U6ZA 1VSLA 3AVCA 3C0BA 3V9UA 5E84A 3H1QA 3KZBA 4JKDA 3VEWA 4JRQA 3FFIA 4JK8A 4I9LA 3GG4A 1D9DA 3ENOA 3CCEN 2GUIA 2OTLN 1K6YA 4RG8A 4B9LA 4DG1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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