4CZLA

C. crescentus mreb, monomeric, adp
Total Genus 100
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
100
sequence length
339
structure length
333
Chain Sequence
ISNDIAIDLGTANTLIYQKGKGIVLNEPSVVALRNVGGRKVVHAVGIEAKQMLMEAIRPMRDGVIADFEVAEEMIKYFIRKVHNRKGSGNPKVIVCVPSGATAVERRAINDSCLNAGARRVGLIDEPMAAAIGAGLPIHEPTGSMVVDIGGGTTEVAVLSLSGIVYSRSVRVGGDKMDEAIISYMRRHHNLLIGETTAERIKKEIGTARAPADGEGLSIDVKGRDLMQGVPREVRISEKQAADALAEPVGQIVEAVKVALEATPPELADDIADKGIMLTGGGALLRGLDAEIRDHTGLPVTVADDPLSCVALGCGKVLEHPKWMKGVLESTLA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Bacterial Actin Mreb Forms Antiparallel Double Filaments.
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
source organism Caulobacter vibrioides
molecule keywords ROD SHAPE-DETERMINING PROTEIN MREB
total genus 100
structure length 333
sequence length 339
ec nomenclature
pdb deposition date 2014-04-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF06723 MreB_Mbl MreB/Mbl protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4czlA02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4czlA03
4BG9A 3WQUA 2CH6A 4BG8A 4FWMA 4IJNA 1HLUA 1IG8A 4WQ5C 2CGKA 4FWKA 4MO4A 3UE5A 2PBDA 1U2VA 4MLHA 3H6EA 3DWLA 3LM2A 4IO8A 1NM1A 5KPRA 1TYQB 4H03B 2P9IB 5AQUA 4F9OA 2E1YA 3MCPA 3ZX3A 1ZXOA 5AQFA 5CE3A 1RGIA 4JN4A 1C0GA 1CZAN 2QWLA 3LL3A 3U8XA 3O6WA 4FWNA 4PKIA 1ATNA 4FWPA 4H5RA 1KAYA 1MA9B 4BQZA 1QQMA 3MN9A 4FWOA 3H3NO 1E4FT 4H0PA 4H0TB 5EY4A 1NGEA 2P9PA 2CH5A 2AP1A 3H46O 2E1ZA 2P9NB 4CD1A 2YJFA 5AR0A 4E1JA 2GWJA 2J4RA 3RSEA 2P9LB 3IDHA 4XH1A 3AAQA 3O4WA 5F1XA 2QWNA 4BRAA 2D0OA 2OANA 4RCHA 5BPLA 3ZETB 4JAXA 2D0PA 4B9QA 1WOQA 4AM7A 2BTFA 4H0XB 4BRMA 2V51B 4BRCA 4BC3A 4PKHA 3QBXA 2WUSA 2D1KA 3W0LA 3D2FA 3O08A 4IXCA 4RWTA 2GUPA 4BC2A 4PL8A 4CBUA 3GOIA 3ATUA 1G99A 3O1WA 2CGLA 3VF2A 1BO5O 1R59O 2W41A 4Y0WA 4DB3A 4BREA 3SMPA 3VEVA 2V52B 3JXUA 3M3ZA 4JHDA 3BF1A 5AQSA 1XUPO 3HTVA 3QICA 3IUCA 3LM9A 1YUWA 3A5LC 2VCPA 3MN5A 4KBOA 4BROA 1HUXA 2I7NA 3VF4A 3IMXA 3VGLA 2FXUA 3HBTA 4AM6A 1ATRA 3ZX0A 1HKCA 3B8AX 3EKUA 3ULEB 2EWSA 5F0XA 4GY2B 1QHAA 1JCFA 5JMVA 1MDUB 2FF6A 2BUPA 3J8AA 4CZFA 5ADXH 2FSNA 3FGUA 4M7XA 4CZKA 3A8YA 2GELA 4JD2B 4BC5A 3GBTA 3H3OB 3WEEB 1BA0A 3FFKB 2P9SA 5KPZA 2Q31A 2Q1NA 2W40A 3EZWA 5AQLA 2HF3A 4A62A 4O8KA 4YDUA 3VOVA 4CZHA 3BUZB 4CZJA 3R6MA 3FLCO 5AQIA 4CD3A 1X9JA 4FWSA 1QQNA 4WYBA 3VGKA 3ENOA 3VEWA 2YHWA 5AQYA 4J8FA 3QFUA 4YDUC 3TU5A 4EHTA 4FOEA 3QMLA 4CI6A 2QWMA 1QZ6A 3U4LA 4BRIA 5AQPA 3M1FA 4ISFA 3R9PA 4K41A 5KQDA 4IWVA 4FSVA 5BN8A 1U6ZA 3C7NB 3VEXA 3ZEUA 1ZBSA 1XQSC 3CQXA 4HWIA 3LDNA 1Y64A 4ISGA 4BVPA 1NGIA 5BPNA 3S41A 1S3XA 3UKUA 1P8ZA 1T6DA 2D4WA 3O5BA 2FLOA 5E26A 3KZBA 1YAGA 3MDQA 5BN9A 1WUAA 3BP8A 3O1BA 1BDGA 1EQYA 3DAWA 5FPEA 4FOIA 5AZIB 1ESVA 3QFPA 3CJBA 1NGCA 4BVOA 5BRFA 2P9KB 4I6MA 2ZGYA 3IFRA 3D7EO 3VESA 1NGBA 3VERA 1DEJA 1BU6O 3C0BA 3EL2A 1BWFO 4BRKA 4JNEA 5EVZA 4H5TA 4A2BA 2E8AA 3UKRA 3EO3A 2A6AA 4GNIA 5ADXA 1GLEG 5AZJB 4DCHA 5F2RA 4BRGA 2DPNA 3AAPA 3CJ7A 5LY3A 3D2EB 3ATVA 1Q18A 1K8KB 3H45C 4A61A 3DXKA 3CERA 2IVOA 2P9UB 4CBWA 3SJHA 2A41A 2Q36A 3UB5A 3VEZA 4EFHA 3GL1A 1V4SA 4XEIA 4CBXA 5AQRA 4CZIA 1U2VB 4H0OA 2GEMA 3VEYA 1SZ2A 5AQQA 5AQHA 3BF3A 1TYQA 2ZWHA 2P9IA 2QXLA 4EAHD 3O8MA 4L3QA 4RTFD 3VF6A 2E20A 3KVGA 4XH5A 4M63C 2E2PA 5AQXA 3AARA 3SMSA 5AFUH 1NGGA 2ASMA 3GE1A 4B1ZA 2Q0RA 1RFQA 2GWKA 3ZX2A 2QWPA 2A3ZA 3GG4A 1GLLO 2ASPA 2P9NA 1HKGA 4CJ7A 2FSKA 3RSEB 3HM8A 2IVPA 2IVNA 4H0YB 2P9LA 1NGHA 2H3GX 3ID8A 3QDKA 1KAZA 5AQKA 5LJVA 1E4GT 4H5VA 3EN9A 3ZETA 3L4IA 3SK3A 3MN7A 4PL7A 3CI5A 4B1YB 3DXMB 1BA1A 2FSJA 4CZMA 3A5OC 3MMVA 5AQJA 3CHWA 3D2FB 4Z94A 4QS8A 2Q0UA 3WT0A 1T44A 5AQTA 1X3MA 1S22A 1TUYA 3BEXA 2E2OA 2NZTA 1NWKA 5AQWA 4CZEA 1GLCG 1K8KA 2QWQA 2NRHA 5BR9A 2E2NA 2PAVA 4JHDB 3SLCA 4PKGA 1BG3A 1X3NA 3KHYA 3FZKA 3A0IX 4BR4A 1D4XA 2I7PA 4BR5A 3LDLA 1LOTB 5B8HA 4QS7A 4B1WB 1MWKA 1NBWA 3I8BA 5FPMA 1HPMA 3LDOA 1KXPA 4CZGA 4EHUA 3FR0A 5BREA 5I9EB 5JLFA 3H1QA 4B1VA 1GLBG 5FPNA 3FZLA 1JCEA 3QB0A 3ULEA 1YVNA 1V4TA 2CGJA 3AY9A 4BQLA 2V7ZA 4M7YA 2ITMA 4FWRA 3DJCA 5TKYA 2A5XA 5AQNA 2KHOA 3LDQA 3R8EA 4LC9B 4BR7A 3CJCA 3M6GA 5ELZA 4BRHA 2P9SB 5EX5A 2QW9A 2QWOA 4JD2A 3G25A 1YXQA 2F9TA 3WEEA 5KQ8A 1ATSA 3CIPA 2YJEA 3A5NC 3WQTA 4FWLA 3P4IA 2HF4A 2VWBA 3H1VX 5AFUA 3WXJA 1T6CA 4H5NA 2VYPA 2YCHA 4FWQA 3WXKA 2FF3B 3VGMA 3FE1A 4MLEA 1OKJA 4CZLA 1J6ZA 3MN6A 1C0FA 1Z6RA 4BRQA 1HKBA 2QWRA 4BGBA 3MK6A 1GLJO 1NLVA 2HOEA 4FL9A 1NGJA 3DXMA 3VPZA 4BR0A 1NGFA 2QM1A 3VETA 5JLHA 4BGAA 1SAZA 4BRNA 2Q2RA 2NLXA 4XH4A 4BR9A 5E84A 4IZ9A 3GDQA 1GLAG 4B1XB 4EIAA 4K42A 2Q97A 2ZF5O 1QZ5A 1XC3A 1Z05A 3W3DA 3JS6A 2AA4A 1IJJA 1KAXA 1QQOA 1RDWX 3U9ZA 3CETA 1NGAA 1HX1A 5AQZA 2YHYA 4B1UB 3VEOA 3ZEUB 1LCUA 3C7NA 3CJ1A 1ZC6A 5AQGA 3VENA 4BRFA 4K25A 2P9PB 1SQKA 4ISEA 2E88A 3UKUB 4HTLA 1JCGA 5KPTA 1H1VA 2UYTA 1DGKN 3CQYA 4WQ4A 5FPDA 3FZFA 4BRLA 4BR2A 3WUHA 2IIRA 4FPBA 3EKSA 1DKGD 1BOTO 4FO0A 4QS9A 4C23A 2YHXA 3U9DA 3WXIA 4NO7A 5AQMA 3LDPA 4BRPA 1NMDA 5LJWA 5JICA 5AZIA 4I6MB 5BRHA 5BRDA 2A42A 2E2QA 2A40A 4H5WA 3WXLA 4BC4A 2P9KA 3A5MC 4DHYA 1GLDG 4DQ8A 4WQ4C 3L0QA 3HI0A 2HMPA 3F9MA 3CJAA 5EXWA 1HJOA 1NGDA 4FPAA 4A2AA 1GLFO 3QBWA 3UKRB 3HZ6A 2ZGZA 3L6QA 4IJAA 4NB4A 5EOYA 4MO5A 3O80A 5AZJA 3I33A 4BRDA 2GTDA 3CJ9A 3HSCA 1MWMA 4WQ5A 3FZHA 3DXKB 1TUUA 3D2EA 2V7YA 3OHRA 5AQVA 1BUPA 2ASOA 5AQOA 3TPQA 4H0VB 2P9UA 2YI1A 2F9WA 3ENHA 4K43A 4O5FA 5BPMA 3FZMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2G8VA 1NG9A 1UOCA 4CEFA 4RW7A 3HJFA 1YITN 3RWUA 4FWKA 3UE5A 2HHIA 2YKMA 3R3LA 4MLHA 3S9HA 5J2MA 2F8SA 4A5AA 5CYMA 4N76A 3L2WA 1IKYA 3BGRA 4FW1A 4DKWA 1RGIA 3NGYA 4JN4A 4IEEA 3SUPA 2HHVA 1RT7A 3OBWA 3EE9A 4ID5A 4CF9A 1QQMA 3MN9A 4JI1K 1C0MA 4H0TB 3THXA 4CEQA 5J2NA 3EY1A 1NK7A 1BQMA 2P9NB 2AJQA 2YJFA 2F7TA 4IEIA 4DFKA 3QESA 1XWLA 1I39A 1S6QA 4XH1A 1GOBA 1HNXK 3M8PA 2XO7A 3DRSA 3ZETB 4CJLA 4JAXA 1Z26A 4GKKK 1WOQA 3TABA 4BRMA 4H0XB 4G1QA 1KLMA 4IOXA 4CF0A 3W0LA 4JI6K 1SL0A 5M1QA 1JLCA 3KWGA 2GUPA 3MXIA 1SKRA 3ATUA 2YNIA 3KLIA 4C1NK 3PY8A 3VF2A 4CJTA 3ID6A 2F8TA 4BDZA 2W41A 2FBTA 3OYNA 1GOAA 4N5SA 3HO1A 1KRPA 2IGIA 5DM6L 3VEVA 4MFBA 3O3GA 2UUBK 3KLHA 1D8YA 3LM9A 5GIOA 2A1SA 4WF9L 3A5LC 2VCPA 1VQ7N 1ZBHA 5CZ2A 4BROA 1HUXA 1RT6A 5JS1A 2ZQBA 3IMXA 4JKGB 2OZMA 3HBTA 3E9OA 4AM6A 1HKCA 1Q82O 3ULEB 3J7AP 1FKOA 1FXXA 1BIUA 1QHAA 1W0HA 4CGDA 4DS4A 5JMVA 1MDUB 2KFZA 2BUPA 4Z0UA 3KD5E 1P90A 4M7XA 3WEEB 3VQ4A 2P9SA 3KJVA 3ZSXA 1NKEA 1NMNA 3VQCA 4KB0A 4E1NA 2Q1NA 1U4BA 4A62A 4E7IA 3ZSYA 4CZJA 3R6MA 1VSDA 4CF2A 3FLCO 3HOTA 2R7YA 4DS5A 3NF7A 3T1HK 1XMQK 2C1IA 1KLNA 1SUQA 3AVAA 3ENOA 3P39A 4FM2A 2ZJPL 4KH4A 2HNZA 4DTUA 4EHTA 4TSXA 4FOEA 4WFBL 4I9QA 1QZ6A 5HP1A 4YORA 3MXMA 1XNQK 4ISFA 2VQFK 4DSIA 3CCUN 2XRIA 1RTJA 3NGZA 3ZEUA 1ZBSA 3TSPA 4HWIA 4ISGA 3V9UA 1NOZA 3R1XA 3K57A 1RILA 3VQ5A 3MAQA 3SV3A 3UKUA 1P8ZA 1T6DA 3OYGA 1WAJA 1RNHA 1HNZK 3DAWA 3DM2A 4BVOA 1RT5A 3TAMA 5BRFA 4I6MA 3VQEA 1EX4A 3D7EO 2XY8A 3J7ZO 1DEJA 1HR0K 2KLAA 3C0BA 3EL2A 4BRKA 4JNEA 4JLHA 1DTTA 3EO3A 4B9LA 4IFEA 3AA3A 1GLEG 3KK7A 4CGHA 4CEZA 3T7ZA 4BRGA 5C0YA 5HRSA 3MXJA 1CZ9A 1DLOA 3H45C 4M41A 3WNHA 3ENBA 2B4JA 4H4MA 4B8AB 4KHNA 4CBWA 4CJFA 2Q36A 3HYFA 1IO2A 3VEZA 1ASWA 4EFHA 2DFFA 4XEIA 1A5VA 4E19A 4DV5K 1T03A 2EHGA 1U2VB 5JS2A 3VEYA 1SZ2A 2PZSA 4CERA 4KHPK 3WNFA 2QXLA 3L3UA 4EAHD 3ZSZA 3VF6A 4XH5A 1VSEA 4ZTJA 3SAFA 2E2PA 2E5LK 4DWIA 3SMSA 1HRHA 3NF9A 2P5OA 4ILGB 2Z1HA 4E7HA 2X6SA 1NU0A 4ILHA 2GWKA 1VQ6N 2A3ZA 4B3MK 4BECA 1IKWA 2P9NA 3Q7CA 1HKGA 1Y97A 2LSNA 2KZZA 3FFIA 3HM8A 2IVNA 3V81A 3HT3A 3O3HA 1VSKA 3KIOA 3QDKA 5AQKA 1NK9A 3OW2M 4PY5A 2HHWA 4QAGA 3ZETA 1WN7A 3L4IA 3LWMA 3THVA 1QE1A 4MQ3A 1BA1A 2VG7A 1J5OA 3D2FB 4Z94A 4QS8A 4GV9A 2BANA 2P51A 5AQTA 3ZT4A 5C2DA 1RDDA 3BEXA 1D9FA 1NWKA 5AQWA 3IAYA 1C1BA 1ZBIA 3J80O 5DM7L 1L3UA 5BR9A 3CMAN 1RDBA 1D9DA 3O9SA 2HHTA 4BR4A 2W42A 2W6KA 2I7PA 4QS7A 5M1NA 1WSEA 3I8BA 5HOOA 4B3OA 1L5UA 1LWFA 4CJ3A 4IFYA 1SKSA 4HCBA 3ULEA 2UUCK 3AY9A 4BQLA 3MX5A 3PO5A 4FWRA 3HPGA 2A5XA 2X6NA 3KK1A 3CFPA 3AVJA 2RKIA 4FYDA 2NRXA 3CC2N 3K0SA 1M90O 4KPYA 4FJNA 4YFUA 1U04A 5EX5A 1FK9A 3WEEA 5KQ8A 4OLBA 5DMRA 2BDPA 4AILC 3WQTA 1A5WA 2F4VK 5CZ1A 2VWBA 1U47A 4DSEA 1IBMK 5AFUA 1REVA 3WXJA 1QSLA 4LH4A 4RW6A 3MWTA 4FWQA 4FK0A 4YNQA 1NOYA 4CZLA 1J6ZA 1JL2A 3SUNA 1HNWK 1C0FA 4DQSA 2QWRA 4BGBA 3ZLJA 3MK6A 3JAMO 3CC4N 1D5AA 2HHUA 4DV6K 1NGFA 3VETA 5JLHA 3HPOA 4BRNA 1ILYA 3L2RA 1DT9A 3M8RA 4DR7K 3ZSQA 4OPAA 4OPKA 3PLAA 3OYCA 1VK0A 4JI5K 1GLAG 4B1XB 2ZF5O 1BGXT 1XC3A 3W3DA 3U9ZA 3CETA 2X74A 1Q8IA 3KK2A 1NGAA 3L2VA 4AHUA 1HX1A 1Z25A 3LZJA 4GV3A 3VQDA 1FW6A 1WSJA 1VSJA 3THXB 2GUIA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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