4D2JA

Crystal structure of f16bp aldolase from toxoplasma gondii (tgald1)
Total Genus 130
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
130
sequence length
338
structure length
338
Chain Sequence
SQEVAKELAENARKIAAPGKGILAADESTGTIKKRFDSIGVENTEANRAFYRDLLFSTKGLGQYISGAILFEETLYQKSPSGVPMVDLLKAEGIIPGIKVDKGLETLPLTDDEKATMGLDGLSERCKKYYEAGARFAKWRAVLSIDPAKGKPTNLSITEVAHGLARYAAICQANRLVPIVEPEILTDGSHDITVCAEVTERVLAAVFKALNDHHVLLEGALLKPNMVTHGSDCPKPASHEEIAFYTVRSLKRTVPPALPGVMFLSGGQSEEDASLNLNEMNKMGPHPFQLSFSYGRALQASCLKAWKGVPENKAKAQQVLMERARANGEAQLGKYGGG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase
source organism Toxoplasma gondii
publication title Structural and Functional Divergence of the Aldolase Fold in Toxoplasma Gondii.
pubmed doi rcsb
molecule keywords FRUCTOSE-BISPHOSPHATE ALDOLASE
total genus 130
structure length 338
sequence length 338
ec nomenclature ec 4.1.2.13: Fructose-bisphosphate aldolase.
pdb deposition date 2014-05-09
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4d2jA00
1QFEA 3QF0A 1VGAA 4OQVA 3IIVA 2RDTA 1RV8A 1WDWA 5HWMA 1NSJA 1AK5A 1IXPA 1SU5A 5KINA 4LT9A 1OABA 4NNBA 1HO4A 4CNPA 3O63A 1UBSA 1ZHAA 4Y9AA 1K7FA 4LTSA 3NNTA 3S5YA 3MHFA 3M41A 1OFBA 2CLOA 5E1QA 2YCEA 5D03A 1A5SA 4FIQA 4JY8A 2WSQA 4O1AA 2Y85A 1G6CA 3UXAA 4Y90A 3DFSA 4NZJA 3TAKA 3U8GA 4JTFA 3BLFA 3L68A 5LHEA 1DQXA 1Q6QA 3GKFA 4H6KA 5KZDA 5AC8A 1SSGA 4GUJA 4CCEA 4GWEA 4H4IA 5G4WA 2EKCA 4FNQA 3TU9A 3LLFA 1VLIA 4X9SA 4JTUA 3G8RA 3A22A 1OX5A 4R33A 3UWQA 1T8XA 2Y6ZA 3NQ7A 2BWGA 3LOTA 3MO7A 2IQTA 4ORMA 1EWEA 4PEKA 3ABRA 3USBA 5C2XA 3GR8A 4XQ6A 3F03K 3OIXA 2YW4A 3LB0A 2EPHA 2H8XA 1NEYA 2ABAA 3MYOA 2HS8A 2B0MA 2TYSA 3G1XA 3MI6A 3QPZA 3JS3A 2H8ZA 1S5WA 3TSMA 1QDSA 1IXOA 1HO1A 3NXFA 4ALDA 4CCCA 4DO5A 2G97A 5J5RA 5F4SA 3O6DA 1AG1O 3PB2A 1PE1A 3L5LA 3KVMA 3FS2A 7TIMA 1KTCA 2ZZ6A 2E1DA 3E9AA 4O13A 1JJKA 3CM4A 3DH7A 4L4MA 1DOSA 2VKZG 4QITA 1R46A 3GNNA 4FHAA 3BW4A 2DZUA 5I3FA 3CWNA 2FPYA 2WOQA 5F2MA 3BLEA 3G24A 4ZQOA 2QCLA 3BO9A 3G8EA 1Z48A 3HIJA 5C54A 1HFBA 3NQDA 5I3GA 3CEPA 4PH6A 2NWRA 1NFBA 3A21A 3G1AA 4ADTA 5AYZA 4KFPA 1XUZA 5FEXA 1YDOA 2E68A 4O1BA 3WK1A 1FDJA 1QPQA 3NZ1A 4FX8A 4QISA 5D2XA 1TB3A 2ZRWA 1SW3A 2XN0A 1Z42A 4PTNA 3DI1A 3IIPA 4K36A 1KFEA 2JKEA 4OE7A 4AB4A 1TPC1 2J9YA 3BPWA 3B8DA 3FKRA 1E51A 1RQBA 3DFTA 4BWLC 4AMAA 2ZRXA 3TMQA 1FDZA 5CPLA 1X6UA 3GXTA 1F5ZA 1PS9A 4GUGA 1ZENA 1M6JA 2FPVA 2FPTA 3THAA 3HO8A 4UTWC 4ZQPA 4CLMA 3HPSA 3T78A 4LRTA 4WX2A 1YXCA 5LNUA 3FJ6A 1OX6A 4WY0F 4MPQA 1J2WA 4M6QA 1TPUA 5CSSA 1C29A 3C2RA 1CX9A 4JDBA 3VI2A 3W7HA 2A7RA 5EKYA 4QQ3A 4A22A 3F1QA 4LY8A 4OWGA 1K7XA 1LOLA 5G1TA 1M7PA 1VYSX 5HQEA 1C8VA 3QYQA 4Y8FA 4UCGA 3CIXA 3BGGA 1KBIA 1KV8A 4DF0A 1GG1A 4NQ1A 2LLEA 2OZ0A 3W7IA 2QJGA 3UWZA 2ABBA 2CZFA 4RZ4A 1F6PA 1R2SA 4R53A 1HTIA 1W56A 3PAJA 5LNRA 4LNYA 2CW6A 4IX0A 3S1VA 3LXCA 2JKAA 3W85A 1OYBA 3W86A 3UYCA 1YDNA 2W79A 3W7QA 4RZ5A 3RLVA 4M7TA 1TPH1 2HTMA 3MUXA 3C6CA 1K8XA 5CKSA 4ADSA 1DV7A 2UV8G 4JYFA 4MJMA 5G2IA 2RHGA 4BI5A 1DORA 3WJYA 2QF7A 4ONVA 5FF2A 3IVUA 1KA9F 2C16A 1OVDA 4CNOA 5I3IA 3EWWA 3P8JA 5T26A 1A50A 1T0OA 2NV2A 1QOPA 1VC4A 1QO2A 4B5NA 4ICNA 4EWND 3HPZA 2NUXA 1OHLA 2PURA 5U4NA 4JYDA 4RV8A 4GBUA 3W70A 1A5AA 3BW2A 1AL8A 2A21A 3CTLA 4LC6A 2Y63A 4DBDA 4RR4A 2B7NA 2OMAA 1FBAA 2E5DA 1PHQA 3WK3A 4O0ZA 3RK8A 3ZFHA 3M1ZA 3LRMA 2BZNA 1SSDA 4FNTA 4HPJA 5HR7A 3LCHA 3L0GA 2J6XA 3SW6A 2TSYA 5AC6A 3W74A 2ZZ7A 4AXKA 3GIYA 3A5FA 2FFCA 2B7OA 1X8FA 5KSWA 5H2ZA 3BARA 2C19A 3H54A 2CZEA 4UUIA 1HL2A 4RZ6A 4N4PA 1FWSA 4DBEA 3W7NA 1LORA 2YFNA 1B3OA 3V1PA 3TFXA 1JCJA 5AHIA 2B7PA 1SZGA 4MKNA 4OV9A 5G5IA 4QNEA 2ZZ4A 3TXZA 3LTYA 3LCWA 1WOBA 3W87A 5IBXA 3WJSA 5DXYA 2A2IA 4FEZA 2WNZA 4NUWA 3QQ1A 4ZMGA 4LS2A 2PE4A 2GVLA 2V9DA 4MOZA 2C18A 3KVJA 1Q3NA 3LXAA 4NX5A 4DO4A 3F4WA 2J88A 4O17A 1L6WA 3W23A 3UPWA 4UFHA 1GVQA 2PRMA 3TJXA 5HWJA 3T55A 5AYYA 3GDKA 1BWKA 2GUUA 2CLFA 5AN7A 4NNAA 3OVPA 5LNWA 3CIWA 5EY5A 1A53A 5J5DA 2CLLA 3W22A 3P74A 4Y6GA 2ISVA 2ZBTA 2BX7A 2R91A 3C2VA 2WNNA 1H7WA 3LTSA 3M16A 2VEIA 4HSOA 4TU1A 4LW7A 1Z41A 3GDMA 4UTIA 5HINA 1ZCOA 3VFLA 1EP2A 3KHJA 4HIBA 3NPUA 4FO4A 3EEGA 4JNMA 5FEZA 1JQVA 4MFEA 4LVAA 2QCMA 2Y7GA 1VCVA 3NM1A 1EP1A 3C61A 3VE9A 2PC4A 4ZQRA 5LGXA 2GJNA 3G1YA 3LHVA 1ZFJA 3UWYA 3GAKA 3Q94A 4N4QA 1U5JA 3R5EA 4O54A 4UTTA 4TR9A 2WKJA 1JULA 3FFSA 3EX4A 4JGDA 2DZSA 1IIHA 4ZQNA 4E2DA 5BNKA 8TIMA 2DJLA 3WJXA 2ALDA 1W37A 2Y7FA 3M5VA 2BTMA 3QMSA 3UWUA 4M5PA 5KITA 5LSMA 3HOJA 1UUMA 2D73A 3G1HA 4UFLA 3FJLA 2WSYA 1TPWA 3QH2A 1P5BA 3N9RA 3KX6A 3N19B 2G5WA 4JTKA 3VNDA 4E2BA 3GYEA 3GLCA 1H61A 2FIQA 1QPOA 5K9DA 3IGUA 4LS1A 1OFDA 3MMTA 1O60A 1VLWA 3OEXA 5CSRA 1V5XA 3NQ8A 4TIMA 4UR8A 1GTHA 3QFEA 5A5WA 3O1NA 3O16A 5AHMA 3GR7A 5K3VA 2WO5A 5D38A 1OF8A 1KM3A 1IGSA 3HGSA 1JUEA 3B04A 5HMSA 4OBTA 3S0CA 5D02A 4KFNA 2GQAA 3N2MA 4HT3A 4JS3A 3W7EA 4GNJA 1IXQA 1SO4A 3DFOA 4A2RA 3DI0A 1B4KA 1DBTA 1FWRA 3DXIA 4IPIA 2QCGA 4O52A 4K38A 4M19A 3W1TA 5FESA 1TTPA 1KTNA 4YLWA 1TPEA 5CPNA 2A7PA 2QCDA 3IV3A 1G67A 5FF0A 5F4XA 4WOQA 4OGZA 1H60A 4N9EA 4QSHA 1XBYA 4JIPA 3NQEA 5DN1A 1ZAHA 2OT1A 4P2VA 2W0UA 3C2OA 4HPXA 2YDAA 4AHPA 4O1CA 1PIIA 4JY9A 5BRBA 3FYPA 3ABOA 2NX1A 2ZQ0A 2XFWA 4NJKA 1QMLA 2QKFA 4AH7A 3H53A 4DPQA 2CWNA 3QC3A 1TV5A 4O18A 3PBWA 1O95A 1Q6LA 4S2CA 5AOUA 3EX6A 3GDTA 2P0OA 1JCNA 3W7LA 3LCFA 1W3TA 1L6YA 3B0PA 5CZSA 5HUPA 3L67A 3S42A 3P8IA 4AVFA 1K3UA 1EPXA 1B4EA 4EVZA 4IX2A 4JEQA 5AYXA 2WJZA 2CU0A 4JTHA 3P67A 3MHUA 4LOCA 3KVLA 4UXDA 5H91A 4M6PA 4TMBA 2J9XA 4O57A 5CGQA 3I7RA 3CT7A 3KVKA 1UJPA 1KFCA 2PRHA 1OFPA 4YL2A 3NQVA 3EKLA 3O6YX 3GDLA 5CZJA 5DBTA 3A9IA 1LYXA 3NVTA 3FLUA 1FCUA 4O28A 4HNNA 4UTHA 1YTKA 4XBKA 1LTDA 2Q3RA 4CCDA 4EIVA 1N8FA 1J5TA 1WAUA 1TRIA 2E6YA 2V5LA 3GZ3A 2OJPA 2XN2A 4DQWA 3G0SA 1RQHA 5HJLA 2GVGA 1AW1A 3LLDA 4WJEA 5D2YA 3GNDA 5E0KA 3LCIA 1WOAA 3G3MA 1XM3A 1SPQA 1JCMP 2A1YA 2TMDA 1QR7A 5HULA 2R14A 2W6RA 2J24A 3PUEA 2ZTJA 4RJEA 5CG7A 3P5ZA 2VELA 5G1YA 2VC6A 3LHWA 5K4ZA 5C5YA 3DFNA 3LCLA 1OFQA 5CPOA 4S1FA 3MP4A 3UXDA 1QPNA 3LCGA 4N2YA 4KFOA 1PV8A 1GG0A 4P61A 3HGRA 3MHGA 2B4GA 3GAYA 4UTTC 3KAOA 3C8FA 2C6QA 1VYRA 4JTTA 1OYCA 2NZLA 2ATSA 4RK8A 1LLZA 3HF3A 1I45A 2Z0IA 4EOUA 4K37A 4IWWA 3TQ0A 1D3HA 5G2HA 5KZEA 2C14A 3CPRA 3G0XA 4DPPA 3E12A 2PRLA 1F6KA 1ME9A 4FF7A 2QDGA 2BSLA 3STCA 4LUJA 3K30A 1VS1A 4K39A 1EWDA 4POCA 5LHFA 4O10A 4UNLA 2Y89A 4KKXA 4LWWA 4JX4A 3THQA 4XKYA 1LOQA 1T99A 3PG8A 4DO6A 1R30A 4YMZA 4FX6M 1FY6A 2C0AA 3C52A 1RQEA 1LLWA 2QEZA 1RVGA 4MY1A 5I3HA 2E6AA 4IOTA 3O8AA 2EHHA 2X1RA 3ZS4A 3PC0A 3W1LA 1H51A 1PCWA 5C6MA 2ZCGA 3S5NA 1FXPA 4AF0B 3PSWA 3IGXA 3NDOA 1LRQA 5D2TA 1V7YA 3O06A 4IMGA 1TSIA 2ZA1A 3TW6A 1H7XA 2AAMA 4OU1A 2Z1BA 5DY3A 4MZYA 4LVDA 4O16A 5EYWA 2CZDA 4C1LA 1TV7A 3OVQA 2H90A 1Q45A 1HG3A 3KRSA 1SFJA 3GDRA 1VJIA 3UNDA 5FEWA 2WNQA 1S3HA 3EWXA 2Z6IA 1I2RA 4N02A 3W2NA 1TRDA 1LZOA 4MLRA 5FF3A 2Y62A 5HR6A 2H6RA 2WV8A 3ABQA 3P7YA 4GE8A 4GFSA 3W1AA 1UASA 1JCLA 4K7YA 4XWUA 5GVJA 3LCXA 1KM1A 4UTKA 2E77A 4NJGA 2E5CA 3CHVA 1G7UA 4NJHA 5TIMA 3IGSA 3R12A 4JIQA 4LV4A 4CQAA 5F4WA 1TPDA 2QUVA 3KOFA 2ZA3A 1XUUA 3MBFA 1S5TA 2GPTA 1R2RA 3TV8A 2YPIA 5AC7A 3T40A 4IUOA 3O07A 1WYIA 1DKWA 3DAQA 1I2NA 5BMXA 4WY0A 1X7FA 5I3KA 3NAVA 2YSWA 1I2QA 1G69A 3PG9A 4A3UA 3EWYA 1MSSA 3NZRA 4X2RA 5F1VA 3STFA 2Z6JA 3ZWSA 3W2MA 1W5PA 4N9DA 3QW4B 3W83A 2I1OA 1PVNA 5DLCA 5DXXA 3LHTA 4HNTA 1GYLA 4IMCA 3W1NA 5K2ZA 5KTLA 1KLYA 3DFPA 4JX5A 4O1DA 1H1ZA 4LUIA 3SGZA 1H7NA 1JVNA 4JTSA 1H7PA 4Q32A 1W31A 1W54A 3W2LA 5AHLA 2P1FA 4N6EA 3H55A 3DENA 3GX9A 2ZRVA 1W5QA 4OHQA 5CZ0A 3AO0A 3OBKA 1MZHA 2QUTA 2YW3A 2V82A 2X1TA 2NUWA 2QCNA 2V2HA 4WD0A 1RD5A 4NU7A 1KM5A 4IQLA 3ZR4A 3QEZA 2X2GA 2YYUA 4NX0A 1I8JA 1N7KA 4IXXA 2A6NA 3AJXA 4LVBA 4TO8A 3G1VA 4X22A 3QRHA 3G22A 2A85A 4UTUA 1OFOA 2P10A 4AF0A 1PHWA 3SFKA 3INPA 1D3GA 4N9BA 1KFBA 3ATYA 4MLJA 4D2JA 3PS7A 1R47A 1I2PA 3EWBX 3L9CA 4MZ8A 1F05A 4FXSA 5C55A 1ME7A 4NNCA 1W3IA 3KRUA 4HNVA 4UMAA 2AQWA 2OX1A 3EX1A 4EF9A 4Z1CA 1XL9A 1Z44A 3TAOA 2A7NA 2DZWA 4FIRA 2C1HA 1L6SA 3R13A 3R2GA 3M44A 1LCOA 3ANYA 3CWOX 1TPB1 2CLMA 1FDYA 1AMKA 4YWIA 2VEKA 3TK7A 1K8YA 3GXPA 3LRKA 3EWZA 3MBDA 3IEBA 3DKLA 3HG5A 2V0TA 3OVRA 2NXGA 1F7BA 4FNPA 3CQ0A 3G0UA 1ZAIA 3WK2A 4UFMA 3GB6A 4JTJA 5D2VA 1XBVA 5EA9A 3LDVA 4N6FA 4UFJA 4XUGA 2QCEA 5BOOA 4C1KA 5A8GA 4YCPA 3NEVA 4JN6A 1GQNA 2C15A 5EPDA 1VPXA 2VEMA 2HSAA 1TMHA 2YGYA 1GVSA 3NA8A 1GT8A 1NF7A 4WXZA 3HGJA 4TX9A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3AZR A;  3P2V A;  1QFE A;  3QF0 A;  2Q6Z A;  1GVI A;  3RX2 A;  1W1B 1;  1MRA A;  4E8G A;  3D6N A;  1R6W A;  4LT9 A;  3F4C A;  5JU6 A;  3XIN A;  1V02 E;  2PTZ A;  2GDU A;  4PRR A;  3O63 A;  2PDY A;  4RE0 A;  1DID A;  1JG9 A;  3NNT A;  2DDX A;  1R3T A;  4QEH A;  1IEQ A;  5IOB A;  2OYM A;  5E1Q A;  3VCC A;  1A5S A;  3GZA A;  4FIQ A;  2L5H A;  3L4W A;  4EXB A;  2Y85 A;  1ZSX A;  3AMC A;  1BXB A;  5ECV A;  4EXA A;  5LHE A;  1Q6Q A;  3ZJ6 A;  4B15 A;  4X0V A;  3A4X A;  1SSG A;  4IP4 A;  4CCE A;  4R3U A;  4Q6J A;  2EKC A;  4FNQ A;  2OOD A;  2IPG A;  3BAI A;  1FWC C;  4X9S A;  3N4A A;  3ZLH A;  3DGB A;  3IJ7 A;  1NJJ A;  3UWQ A;  4DXX A;  5M5D A;  3LOT A;  3DER A;  3K46 A;  4IIE A;  2PDL A;  4WKF A;  3LMZ A;  3ABR A;  3USB A;  4XQ6 A;  1M53 A;  4G56 A;  2QDD A;  1R86 A;  3M0H A;  1O6I A;  4XD5 A;  3F4V A;  3G1X A;  4CEX C;  1XLB A;  4HME A;  3QPZ A;  1WB0 A;  2H8Z A;  3JS3 A;  4HMN A;  3RX3 A;  1GQL A;  4GXW A;  3HA1 A;  1IXO A;  3RRA A;  3B9D A;  3XIS A;  3MVT A;  1X98 A;  5AYB A;  3ABX A;  1PE1 A; 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