4D73A

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
IKENDLIPNVKVMIDVRNMNPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 61
structure length 171
sequence length 180
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73A00
3L9SA 1PMTA 1THXA 2A2RA 1PA3A 4EL1A 4WR4A 1FVJA 2VM1A 2FCHA 1W89A 1GSQA 3GKXA 4KB3A 3GUSA 3CSHA 3GN3A 1KEBA 2VM2A 1FHEA 3LORA 2B5EA 3M1GA 2JADA 2LJKA 5D9WA 2YWNA 2HZFA 1WOUA 3KZQA 3GTUB 3HVSA 1F3BA 1O73A 4TW5A 4WBJA 1FO5A 2B1KA 4RI6A 1VGLA 2H6XA 4GRFA 1XBSA 3QD9A 2G2QA 1SL0B 1I5GA 4I6XA 1XPVA 2DMLA 3F3RA 1A2MA 2PUKC 3RHCA 4AJ7A 4ZBBA 3IAS2 2PPTA 2KLXA 3WT1A 1R5AA 2PERA 3L9VA 4KUNA 3NZNA 4DSQA 4WXTA 3ME8A 4IBPA 1H75A 2ZNMA 4XS1A 1GWCA 4MCUA 2XPDA 3CRTA 3HVXA 2NPBA 2VCWA 2YP6A 2C3QA 1BJXA 3FYGA 3UJ1A 4NMUA 1SU9A 4TKYA 1TJDA 3PGTA 2IFQB 2PMTA 4MJBA 4XS4A 3ZZXA 3FW2A 1BQ7A 2R6KA 2ON7A 4L5OA 4TR1B 1UVZA 2PU9C 2N5FA 2CVKA 3G9BA 2VCVA 2FGXA 1K0DA 3ZIJA 2HSYA 5KN3A 4EE0A 3G7IA 2L59A 4N10A 5IO2A 2CAQA 3QMXA 1TU7A 4ISDA 1PRXA 1Z9HA 2AJQB 13GSA 3WGDA 4OCFA 3RHBA 1U3IA 3LXTA 1OE7A 4DEJA 3DKSA 1F9MA 2V1MA 4OFTA 2O87A 3F4RA 1M0UA 2X8CA 3WD6A 1QFNA 4XIHA 4JE1A 1TU8A 2P5RA 3L4NA 4QQ7A 3PR8A 1EP7A 2L6CA 1A24A 4TR3A 3I69A 2RLIA 2DJ0A 1TDIA 5AN1A 4NXIA 1GRXA 3GKKA 3AY8A 3L78A 4KDYA 4FYCA 1PX7A 3KH7A 5JWQB 3D5JA 1M2DA 3KCMA 1X5CA 1A2LA 4PUAA 1JLVA 8GSSA 3GL5A 2YZHA 5A4VA 5B7CA 2R3XA 5IMVA 4RUVA 3TKSC 3VWVA 1VF1A 4POKA 3D6IA 3U6VA 2H1DA 5GAND 3ZLPA 3EMPA 5JCWA 5CRDA 4ZL9A 3FZ9A 4K1FA 4XCSA 2XC2A 1XWGA 2WRTA 1TRUA 2HFDA 3HJPA 4EUYA 10GSA 4TRXA 2HT9A 4XS4B 4DSSA 1W4VA 1Y6EA 4ZILA 1AC1A 4K7NA 1A23A 2L4QA 1AIUA 3FRCA 4POBA 4ZB8A 2C8UA 1PL1A 4LL1B 2NDOA 4K0NA 4MZCA 1WWJA 3IA1A 1T7PB 2HLSA 2JZSA 3ED3A 4ECCA 3ERGA 1Z5YE 5CREA 2HYXA 4FYUA 5D9VA 3KMOA 2DJ2A 22GSA 2HNLA 2AV4A 3DGQA 3C73A 4HJ2A 1HQOA 4ZXGA 5F07A 1H4OA 3A3TA 2VAFA 2H76A 2GQMA 1MDJA 4XRAA 4BVXA 1NHOA 4IW9A 1ERWA 2GTUA 1TRSA 1GSSA 3FR6A 4Q5QA 3RAZA 2OACA 4V2MA 4TVEA 1URMA 2XPEA 4GLTA 2CZ2A 2YWIA 5FHIA 3C1SA 1O85A 5LNKe 2QC7A 3GX0A 1ST9A 4BVYA 3WYWA 2F3MA 4LL4B 1EV4A 5D96A 3KTBA 1EOGA 5JCGA 3W8JA 4XRDA 1TK0B 1Y25A 2FLSA 4KNDA 4ECJA 2KHPA 4MJEA 2OBKA 3D22A 4IJ3A 3GA4A 2X8GA 2REMA 2IN3A 2K8VA 1YY7A 3MWHA 3HKRA 4K0GA 1GULA 3ME7A 1XOAA 4XTSA 2H71A 3HY2A 1ZL9A 1SJIA 3QFBC 3I43A 2I9HA 2WULA 5G2ZA 4O5RA 4IQAA 5IOWA 1MDIA 1O7UA 4XHMA 4WEYA 1EOHA 4ZL7A 4GQCA 2VUPA 2EC4A 2OJLA 2VL3A 1DE2A 2B6MA 3GV1A 1XZOA 2MMAA 5J41A 1AQWA 1K3OA 2LSTA 3EE2A 2MMZA 4AJ6A 1GSYA 1SKSB 4MF6A 5COHA 4ULXA 2C0EA 3KD0A 3Q19A 3VURA 1EP8A 1R7HA 5IOXA 3EVIA 4HZ4A 4V1Ag 1YJ6A 1HNAA 2XBQA 1V57A 3LEFA 1XFLA 2NBSA 1TK8B 1I9DA 3FZAA 4KAEA 4EC0A 4I8BA 1G0TA 1S3AA 4MPGA 2VCTA 5IMAA 3ZFBA 2KP2A 1B4PA 6GSWA 4JZQA 4MJAA 4KH7A 2OADA 4IHUA 4BWQA 4O32A 3UVTA 1OYJA 3QAWA 2H75A 2B1LA 4F0CA 1XWCA 1K3LA 2N5BA 3IBHA 1PQNA 2V6KA 2YPMA 3IAM2 3KEBA 4HU9A 1GSDA 3HD5A 5ABRA 3TKQA 1HD2A 1PSQA 4AGSA 2J23A 1XWAA 3LYPA 1AW9A 2VLTA 2PVOC 4NHWA 5D8IA 3LG6A 3J7Yb 2GGTA 3HXSA 5D93A 2FWHA 1GTIA 3EMXA 2G0FA 2L57A 3UAPA 2HXKA 1ZYEA 3FK8A 4KCEA 1SL2B 3IRAA 2GQLA 4FIWA 2YJHA 5CNWA 1F37A 5DJMA 1SKWB 2M72A 4X1UA 2H0IA 1G6YA 2YV9A 4PURA 4ZBAA 2K6VA 4ML6A 2JZTA 5HR0A 2HRNA 2OKAA 3IR4A 4IKHA 2H8LA 1M2AA 2YV7A 1G7EA 1GNWA 3W6GA 5IO0A 3U5RE 3WGXA 4MA9A 1GP1A 1B8XA 2N5AA 1PD21 1RQMA 3FKFA 4NAXA 5ECIB 2R5GA 1FVKA 1E2YA 2LS5A 5J5NA 3LQ7A 2EIRA 4MDCA 1SYXA 1JHBA 1TI1A 1YF1A 2FWEA 1SL1B 2GT6A 2GSTA 2V41A 2FA8A 2H01A 4JEDA 1V58A 5F0GA 4KDXA 4F82A 1OKTA 5DCGA 1R4WA 3KTLA 1YDKA 5HQPA 4KSOA 4CDOA 4TR0A 4HEA2 1VRSD 4QL9A 4EDZA 2GSSA 3GL3A 1SD8A 3TB2A 1YKAA 2GZYA 3LWAA 5D73A 2FA4A 5AGYA 3M9JA 4KX4A 5ECHB 2ES7A 1SJ6A 5E4WA 3VLNA 3A2XA 3QFAC 1YEPA 4N0ZA 2CA8A 3QAVA 4K2DA 2V32A 4L0WA 5AISA 3DEXA 3TKSE 2VD0A 3QPMA 1VF3A 1MDKA 5IMFA 2VCXA 2H6ZA 4WR5A 2LRNA 4KCAA 2LUSA 5G31A 2GT5A 2I4AA 3F4SA 2O89A 3TOTA 1SD9A 2H1GA 2K18A 1ACVA 5GSTA 3IC4A 4TXOA 4JRRA 4OMVA 4K8MA 4OCEA 1B9YC 1YQ1A 5JWOB 2CT6A 1AQXA 1YF0A 4LLRA 1X5DA 1FAAA 5ECQB 2GS3A 1ML6A 4Q5NA 3ZVJD 5F8BA 2IMFA 4I5QA 4G9HA 1ZZYA 1OE8A 2B3SA 1NW2A 4MF7A 4V2NA 1LJRA 1OVNA 3F6DA 1ERUA 1U87A 3GX8A 5DDLA 2QSIA 3ZL5A 3UARA 5IPHA 2H0HA 4K7OA 2EIQA 3D4MA 4LA1A 3LXZA 4NV2A 5FT3A 2C0GA 4GQFA 2H30A 1QXHA 1QQ2A 3O6TA 1C72A 3APSA 5CRWA 2Z9SA 2CAIA 3ZRDA 1MD3A 2VL2A 3VWXA 2H72A 5LCZA 2H19A 1M2BA 5D9XA 4OO4A 1T8EB 3KGKA 3I6AA 1T00A 3FZ4A 3C7MA 1TRWA 1TKDB 2LRTA 3TRXA 1ZGNA 2E2GA 4MABA 2BTOT 4KA0A 1J08A 1B48A 1AQVA 2M80A 3KP8A 1GLQA 1EZKA 4Q5FA 2AAWA 4N30A 3RPNA 4PQHA 1A0FA 5A4WA 5DBQA 4FYBA 2JL4A 1DE1A 3E3EA 2VL2C 2HE3A 1SYRA 2PBJA 3C1RA 2C4JA 4E8EA 12GSA 4GTUA 1G7OA 2IL3A 4MLYA 1BG5A 1UA5A 2VOCA 4L8EA 1O8XA 4BPYA 4RI7A 4J57E 4JBBA 4MPFA 4POMA 3H8QA 4TXOB 3C71A 5ECRB 3HDCA 3GFKA 2FNOA 2YN1A 1GH2A 3US3A 4MP4A 14GSA 4E8HA 1M9AA 5F06A 2GLRA 3EWLA 1XVWA 3QCPA 3QR6A 3TRPA 2IMIA 1JZOA 2GZPA 2KUCA 3EYTA 5ELAA 3VWUA 4TXVA 5DJLA 3TJBA 3DWVA 3C8EA 2LNSA 1HNBA 5ECSA 5INYA 1QGVA 3IE3A 4NWYA 3APOA 6GSTA 5ELGA 2IMEA 4OFMA 4EKZA 4WETA 1X5EA 3GURA 5HR2A 2WB9A 5CRGA 3TUEA 5L71A 4WKWA 3LGCA 1IYIA 3H93A 1ABAA 4OO5A 1ZYQB 1WMJA 1XWBA 2LRCA 2XBIA 5D9TA 3ISOA 2L5LA 2LJAA 4JU5A 4WF5A 18GSA 2L4CA 1V98A 4GSNA 5ECLB 2YWMA 1SKRB 4OFNA 3ZVJA 2K9FA 4HZ2A 3CBUA 2B5YA 5J3RA 11GSA 2R4VA 3PH9A 2QKEA 2NTOA 4IQ1A 3TCOA 6GSXA 1XCCA 3LSZA 3ERFA 1J0FA 3QAGA 1K0OA 3UEMA 2AB6A 4GSTA 3LJRA 6GSSA 5KEJA 4EF0A 1IYHA 1X9SB 2GVPA 5EPFA 1F2EA 4F03A 4J2FA 2CX4A 4PXOA 3CTFA 2L5OA 2TRCP 4NHZA 1YZXA 3BCKA 3CRUA 1NSWA 4ZB6A 3TJFA 4HS1A 2MZCA 2M46A 3GSTA 1ERTA 1Z6MA 3CXGA 4ML1A 2LJRA 4IP1A 3F3QA 1O6JA 2DIYA 3GNJA 3J7Yk 4PUFC 2WZ9A 1DBYA 3I9V2 3KP9A 2ON5A 4K9ZA 4BWSA 5HFIA 2PN8A 3F6FA 5DAKA 2DMMA 5H5SA 1GNEA 2TRXA 4DSSB 3TGZA 2DJKA 4L5LA 2OE3A 1AXDA 4JR6A 2WCIA 4EO3A 4CHSA 2RIIA 1G6WA 3HZ4A 4PGTA 4KGIA 5G1LA 4EXJA 4G19A 5EY6A 3GHAA 4KDUA 3GH9A 3P7XA 4EVMA 2LQOA 3WT2A 4G2EA 3A2WA 5IM9A 2MBTA 1OC9A 4PQIA 2OE1A 3DIEA 1A8YA 4WF4A 1TI3A 4I97A 1ERVA 4IN0A 1FOVA 4O92A 5GAPD 4YQMA 3QOUA 4GCIA 1U88A 1AAZA 1O8WA 2DJ3A 3TDGA 4IP6A 2YJ7A 4GF0A 4FH8A 2O7KA 2A2SA 3F9UA 1VF2A 3G7JA 3EU3A 4MZBA 2AUVA 4O7HA 2C0FA 1GUHA 1O81A 2JZRA 3NIVA 3ZITA 1UC7A 4PX1A 5IMCA 1V2AA 1MEKA 4KSMA 1XW5A 4P3YB 3CSIA 3FZ5A 5LD0A 3FY7A 1TK5B 4K6XA 2CVBA 4HDEA 3MSZA 2CVDA 2FHEA 5DAKB 3GH6A 2IMDA 4ILFA 1YEXA 4N0VA 2I3YA 2DBCA 1B9XC 1Z7RA 2E0QA 2JSYA 1TW9A 1TP9A 4ZIJA 1ZMAA 3IPZA 2HRFA 4YQVA 3D4TA 3UBLA 1K3YA 4RQXA 3TOUA 2LKUA 4QL7A 1OC8A 1JZDA 1PN9A 1N8JA 3SWLA 5H5QA 2LTKA 4N11A 1R5PA 1OC9B 2CX3A 2H0GA 1V40A 4L0UA 2HSHA 5G30A 3TJGA 2F9SA 4EDYA 5G5EA 1PGTA 4PNGA 2IIYA 5A4UA 1F3AA 3TKRA 2E7PA 5IQYA 1Z3EA 2PGTA 3GMFA 3ZIVA 20GSA 3BOAA 1WP0A 2H73A 2OA7A 2C3TA 3EC3A 4MF5A 3D21A 3O76A 2EIOA 3VWWA 5B8BA 1CQGA 1M9BA 5H5RA 2ZCTA 1SK0A 2X99A 3OR5A 3FR9A 3Q74A 4H86A 1FB0A 3IXRA 4RQRA 4J56E 3FEUA 1GTAA 2I1UA 1CQHA 1K0AA 3TJJA 3LYKA 3ZYWA 4LMVA 2WS2A 2O8VB 2ALBA 1XW6A 5KN2A 2GQKA 3N5OA 2DLXA 1Q4JA 3GIXA 1EV9A 1PKZA 5IMZA 2B7KA 1A2JA 3G7YA 2DIZA 2FUG2 4X0XA 4NV5A 3NOFA 3GKNA 2V2GA 3K8NA 3Q6OA 2MMOA 2PVQA 1MD4A 1GTUA 3HZ8A 2CV4A 5AIVA 1QK8A 4HI7A 3KM6A 2NVLA 2MMNA 3KMNA 2F8FA 5DCHA 3BCIA 2P5QA 4MK3A 1SJZA 3ZTLA 2WGRA 2C80A 3PINA 3CYNA 1U3AA 3LFLA 1QUWA 1HYUA 1J9BA 2C0DA 3M9KA 7GSSA 1EGRA 1T4ZA 2VIMA 3H79A 3RBTA 2WJUA 5A5KA 2V6OA 5IMDA 1X0RA 2R2JA 2FWGA 3IHQA 2LEGA 2VD1A 1S3DA 3KIJA 1XXUA 2F51A 1AUCA 3N9JA 3O3TA 1GSEA 2B5XA 1FG4A 3S9FA 3GKMA 2F8AA 1T3BA 5HR3A 4ECIA 3W8SA 2XHFA 4OWYA 1XW9A 2QGVA 3V1WA 2FD3A 2R37A 1N2AA 3CSJA 4HUAA 4OD7A 1FW1A 5C04A 1LU4A 4IGJA 3VI5A 2GDRA 4HOJA 3VPQA 2LQQA 3BJ5A 4ECBA 3Q18A 2CQ9A 3DD3A 5G1KA 4IS0A 3F0IA 2H6YA 4F2IA 1Z7PA 1WE0A 1PKWA 1SK2A 3CTGA 4JR4A 3RPPA 2DJJA 3TKSA 2OE0A 1XVQA 2H1AA 5ID2A 1BX9A 4KW6A 3RDWA 1ILOA 4FO5A 3M0FA 3UIWA 5J4UA 1T1VA 4PQ1A 5B6MA 5F05A 3F4TA 6GSYA 2JSZA 2P0GA 5ECOB 5JWRB 2VLUA 2B7JA 3TRQA 1OKDA 3A2VA 2P31A 2YNXA 3HHVA 3H4KA 3ZFLA 1EWXA 2RM5A 2KOKA 2D2ZA 1B4QA 2H74A 1ZCPA 4BA7A 3HCZA 2H70A 2E2MA 4GXZA 5HFKA 3DVWA 1ON4A 1T4YA 2RM6A 6GSUA 2C3NA 1A8LA 2A4VA 2DC5A 5J9BA 2I81A 1VF4A 1K0NA 1EEJA 3FR3A 17GSA 1KTEA 2JU5A 2VO4A 4MJCA 5CAXA 3IOSA 5DVBA 1EEMA 3E9JB 5C00A 3UMAA 1SENA 3BBYA 2CZ3A 2VL9A 2LNTA 2X64A 1THOA 3L0HA 3F8UA 4AF2A 5KN0A 1XWKA 1Z6NA 4PNFA 4GWRA 19GSA 4ID0A 3BD2A 3GRXA 1PX6A 3MNGA 2DJ1A 2H66A 5B8AA 4F0BA 2VCQA 5E59A 2HZEA 2RUFA 6GSVA 16GSA 4HU7A 1BEDA 1ZOFA 3CMIA 1K0MA 3HJOA 3ERWA 4CW9A 5KN1A 5ID2B 3HVVA 2C1YA 1YKCA 1U6TA 3EU4A 3M8NA 3KJYA 1JLWA 5CO3A 1WJKA 3DYRA 5ECNB 1NHYA 2PWJA 3SBCA 3HA9A 1R26A 3P8WA 2IJYA 1MTCA 4DSRA 3DRNA 4MH3A 2YCDA 3IK7A 3DMLA 3IDVA 4HQSA 4GSSA 3DXBA 2YANA 1V9WA 2L6DA 4X43A 5AIXA 3TKPA 2BJXA 2AYTA 5B6NA 1USBA 3P90A 1GTBA 3P2AA 1X9WB 2O85A 2JACA 3JCML 2DSAA 2FY6A 2IMKA 3GSSA 2KP1A 4V2LA 4ZB9A 4WBRD 5ECKB 2VLVA 1WIKA 1GL8A 2MYGA 1UN2A 3TJKA 3E0UA 4ACSA 5GSSA 2H1BA 5J9CA 4MZWA 2J9HA 3WGEA 1NM3A 4MMMA 3DVXA 4LMWA 3MDKA 4IELA 1GUKA 2ZUPA 1TTZA 4I2UA 2MBSA 3VFIA 4TOPA 2FWFA 3ZMLA 4D73A 1JZWA 2HI7A 4YH2A 3KXOA 4NPBA 2RUEA 3HYPA 1KNGA 3VI7A 2X8HA 4AJ8A 2IWTA 4YQUA 3L9UA 2BMXA 4Q5RA 4IVFA 1GSUA 3R2QA 5DALA 2HZEB 3UBKA 5ECMB 3MAKA 1K0CA 5EL8A 1M99A 4DVCA 2WFCA 3A5WA 4BL7A 4YAVA 3VK9A 5HFGA 4Z7XA 5DQYA 5ECPB 2IPAA 3FHKA 4POLA 2LV3A 1DSBA 3KH9A 1A0RP 1F6MC 1JZRA 1Q98A 4MH2A 4HJMA 1OAZA 9GSSA 1S3CA 3VPTA 5DQSA 5IPGA 2YZUA 4G10A 1TOFA 2YWOA 5JCUA 3IV4A 1PL2A 1RW1A 3GTUA 5ENUA 3M3MA 3QDNA 1OC3A 2GSRA 1RK4A 3ZREA 4ZL8A 5CRHA 1BYEA 2TIRA 1XOBA 1WRYA 1KBNA 4F9ZA 3H1NA 2GZZA 3UOMA 1HNCA 2OBIA 2WDUA 4IJIA 5CYYA 1FB6A 1GSFA 4XS6A 5HR1A 5FWGA 1SK1A 1X9MB 1M7TA 3EINA 2YOIA 1JFUA 3IK9A 4I2TA 4V1Ap 1GLPA 5IIZA 1GUMA 5G5FA 4KE3A 1DUGA 3D0ZA 1WPIA 4TR4A 4YAPA 4D73B 2AHEA 5CP1A 1LBKA 1TRVA 2GSQA 3UVHA 1BAYA 4HQZA 1E6BA 2K8SA 4ZBDA 1XIYA 1EGOA 3APQA 4K7IA 5GZZB 4TN8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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