4D73A

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 61
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
61
sequence length
180
structure length
171
Chain Sequence
IKENDLIPNVKVMIDVRNMNPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTPTSTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKNN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Plasmodium falciparum
total genus 61
structure length 171
sequence length 180
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73A00
5A4UA 6GSSA 5CRDA 5F0GA 2I1UA 5F8BA 4EE0A 2C3NA 2H19A 4K9ZA 2DJKA 3QOUA 4RUVA 2GS3A 3GKNA 1FB6A 4BWSA 5EPFA 5E4WA 3MSZA 1XZOA 2WB9A 4IP6A 4E8EA 3FEUA 2NPBA 1NW2A 5J3RA 5EL8A 1O6JA 2YWNA 3WGEA 2HI7A 2TRCP 4HU9A 3BJ5A 4G10A 2YV7A 3QPMA 5HFGA 5IMFA 3C73A 4XHMA 2GQKA 1I5GA 3ZL5A 3D4MA 4HQSA 4HS1A 3DVXA 2H0GA 1SU9A 1TOFA 4ACSA 3C7MA 2F8AA 1DUGA 5CREA 13GSA 2YOIA 5A5KA 4JE1A 2R3XA 1Z6MA 3ME8A 3L78A 1XWKA 2VM1A 3C71A 2MZCA 5GSTA 2I81A 5LCZA 2FCHA 2H76A 5D9VA 3KD0A 2HE3A 4JR4A 2DJ0A 3F4SA 2FY6A 3Q19A 3HY2A 4LMWA 2HLSA 1UA5A 3D22A 3VPQA 2R5GA 1K3YA 1BX9A 3HKRA 4G2EA 4OO5A 2FD3A 2C3TA 4MZWA 3IAS2 5HR1A 4MCUA 3GA4A 3Q18A 2VO4A 4PNFA 5GAPD 3MWHA 3IDVA 3HVSA 2MMOA 6GSXA 3F4RA 2OKAA 2IMFA 2LJRA 4K2DA 3U6VA 1EEMA 5G5EA 1WMJA 3UEMA 3CSIA 1H75A 4H86A 4I2UA 3ZTLA 2VCTA 2VL9A 5B7CA 2ES7A 2CAQA 2FWGA 5DAKB 2H73A 3ZVJA 5ECIB 2O7KA 3GKKA 4ZBAA 1C72A 3PR8A 3GMFA 3P90A 1TP9A 6GSUA 1PKZA 1WE0A 3VURA 1V58A 8GSSA 1K0MA 2YPMA 5KN1A 2FUG2 3KCMA 1K0AA 5LD0A 5JWQB 2AAWA 3PH9A 3A2VA 3GURA 3DIEA 2HFDA 2CX4A 3UBLA 4X0XA 1URMA 3HVVA 1NHOA 1B4PA 1RK4A 1V40A 4EUYA 2GSTA 3J7Yb 2WJUA 3KP8A 1K0DA 2I9HA 2LQOA 4IS0A 2NVLA 1Y25A 3IXRA 3WGDA 4F82A 3KXOA 2EIRA 5CRWA 1FOVA 1JZRA 7GSSA 1NM3A 4GWRA 3IBHA 2HSHA 1SK2A 3VI5A 1GNEA 1JZOA 2PN8A 4N10A 4FIWA 17GSA 2HT9A 2OBKA 1TRWA 3IHQA 2C0FA 3VPTA 5D9WA 3UJ1A 3APSA 1G0TA 1AC1A 4POBA 4MF7A 1OC9A 1NSWA 2GQLA 4LLRA 3D4TA 1M2BA 3L0HA 5B8AA 3UL3A 1GWCA 1XBSA 2H75A 3FR3A 2N5AA 3ERFA 4V2NA 4NHZA 3EU4A 1AAZA 3DKSA 1ZGNA 1Q98A 5AGYA 3GUSA 4KNDA 1K0NA 1GSYA 1XVWA 5ECRB 2XBIA 4ZBDA 4D73B 5IM9A 5KN3A 4PX1A 3EYTA 2ALBA 5D96A 5KN2A 1OAZA 4GSSA 4OO4A 2KP2A 4ILFA 1YKCA 4ECIA 1E6BA 2H30A 4IKHA 2H1BA 1A8YA 3HXSA 1TK0B 1S3DA 2F51A 1A2MA 3EURA 4V2LA 2PERA 3M3MA 6GSYA 3WT1A 1X5EA 3H8QA 3KMOA 1T4ZA 1JZWA 1ZYQB 2DBCA 2LUSA 1XOAA 2DIZA 1X0RA 4MABA 1TJDA 4JEDA 4HJMA 1R4WA 3FZAA 3FKFA 3FYGA 2Z9SA 4MJEA 3TKSA 1OYJA 3KZQA 2I3YA 4EC0A 2CQ9A 4F03A 3TKSC 5D9XA 5G5FA 4LA1A 3UMAA 3D5JA 3EMPA 3LXZA 1TU7A 3ZIVA 3HJOA 1KBNA 4BL7A 5G1LA 3P2AA 5E59A 6GSTA 1VRSD 2LS5A 4DSSB 4PURA 1MDJA 3PGTA 2XPEA 3OR5A 3C1RA 3DRNA 2GT6A 2GTUA 4I6XA 2DSAA 1PQNA 2J23A 2FHEA 1M9BA 4MK3A 4WBJA 3APOA 5IO0A 5C00A 1MD4A 5KEJA 4JRRA 3UVHA 1OVNA 3VI7A 3F8UA 5ENUA 1HNAA 2H1AA 4QL9A 1AXDA 2X8GA 1W4VA 5FHIA 2MMZA 3FR9A 4WR5A 2V32A 2JZSA 2JADA 2DLXA 2HXKA 2VM2A 1ZYEA 1EOHA 3W8SA 5IPHA 1AQXA 3TKQA 2K6VA 4GRFA 1TW9A 3QAVA 4DVCA 2EC4A 1ERUA 2IMKA 5GZZB 3GNJA 4KCEA 5GSSA 2MYGA 5J4UA 1U87A 4IJIA 4ZB8A 4ZL8A 2FWEA 5ECQB 2O8VB 3L9UA 1SL1B 1MDIA 5DDLA 4KDUA 2MMAA 4RQRA 1XIYA 3GKXA 3BBYA 4V1Ap 3KP9A 5FWGA 2R37A 4K6XA 2CVBA 4ECCA 3ZMKA 3TJJA 1Z7PA 2X99A 5HR0A 2ON5A 5D9TA 4AJ8A 1Z9HA 2BJXA 1XWCA 2GZYA 3R2QA 4BA7A 1GRXA 3RPNA 3IE3A 1Z6NA 1F3BA 5ID2A 1HYUA 6GSVA 4N0ZA 4OCEA 1TRVA 3TRXA 5J5NA 3M9JA 1VF3A 3NOFA 1B48A 1TU8A 3HDCA 3LORA 2FGXA 3HHVA 2LEGA 5H5SA 3TCOA 2YWIA 1BG5A 5H5QA 2JZTA 4HQZA 2M46A 2GSRA 1GSSA 1Q4JA 2H6ZA 2P5QA 5JCWA 1O85A 4GTUA 1XPVA 1ZOFA 2L6CA 1GSQA 5ECKB 2OACA 1JLWA 3TB2A 3KTBA 2ZNMA 4I97A 4FO5A 1LBKA 1JFUA 2P31A 3GSSA 1OE7A 1OC3A 5C04A 3IK7A 3ZVJD 3HVXA 1DSBA 2VAFA 20GSA 3ZFBA 4RI6A 4OD7A 3TDGA 2V6OA 5ECOB 2VIMA 4NXIA 5ELAA 3FZ4A 4PGTA 4GF0A 3TRQA 1OE8A 2N5BA 1MD3A 3GFKA 1XWAA 1GLPA 3N5OA 3GH6A 4EDZA 3GSTA 2B1LA 4MZBA 2RM6A 2L5LA 3Q6OA 1LU4A 3CTFA 5ELGA 1ZL9A 1IYIA 2VLVA 1SYXA 1GH2A 2MBSA 1J0FA 4O7HA 3IOSA 4L8EA 4NWYA 1AQVA 2NBSA 1K0CA 3RPPA 5DALA 4PQIA 1EWXA 1F6MC 1A0RP 3PINA 4ZXGA 4L5OA 1M0UA 2KOKA 1A2LA 3ERGA 4WF5A 1DE2A 4X1UA 3LG6A 3H4KA 4ZB6A 1HNBA 4LMVA 5G1KA 4FYCA 5G31A 3AY8A 2H66A 1Z5YE 3LYPA 1R26A 2J9HA 2K8SA 3IV4A 1QGVA 1WWJA 4MP4A 3O3TA 1TDIA 10GSA 1DBYA 1YZXA 4YQUA 3RHBA 3D0ZA 1Y6EA 5D73A 2WS2A 4PUAA 3P7XA 5JWRB 3GL5A 3MDKA 1IYHA 1O8WA 3CXGA 5D8IA 4TR1A 4L0WA 3L9VA 1EGOA 3HYPA 4J2FA 3GTUA 1PRXA 1Z7RA 5LNKe 2IN3A 2HZFA 5CP1A 2VOCA 4PQHA 4EXJA 2VL3A 2O89A 2NTOA 1T4YA 1AQWA 1EV4A 2H01A 2VD0A 3HZ8A 1PX6A 3TJFA 3GKMA 1ERWA 3UARA 2LJKA 5ECNB 2MBTA 1GTAA 1ERTA 1T1VA 4POKA 1SK0A 5GAND 2WGRA 1V2AA 16GSA 3CMIA 3HJPA 4WBRD 4K0NA 1R5PA 2VCXA 2R2JA 5G2ZA 4GSTA 1O81A 3DGQA 5IMVA 2RLIA 1R7HA 2A2SA 1XW6A 2P5RA 1O73A 4YAVA 2B7KA 2QC7A 3UOMA 1XW9A 1XCCA 1GSUA 1YEPA 2CZ3A 1R5AA 1CQGA 2OE0A 4IN0A 1QUWA 1TI3A 1UN2A 5DQSA 4GQCA 3KH9A 4XS1A 1PMTA 2GVPA 4ISDA 3BCKA 2H72A 4GXZA 3KGKA 5KN0A 3VLNA 2FA4A 4AGSA 4V1Ag 2PU9C 2IMEA 14GSA 4MA9A 4RI7A 2XBQA 1FB0A 1TTZA 1EP7A 3WT2A 2RIIA 1OKTA 2AB6A 2OE3A 4MH3A 3QD9A 3QFAC 3TKRA 1A0FA 1XFLA 3E3EA 3QR6A 3I6AA 4FH8A 4XS4B 9GSSA 4WR4A 1THXA 1G6YA 1FAAA 2IIYA 2P0GA 1GL8A 2IPAA 2CA8A 4MLYA 5DJMA 4TR4A 2AUVA 1GSEA 3A3TA 5F06A 2K9FA 4NPBA 1ACVA 2A2RA 4TXOB 2YJHA 1X5CA 1AW9A 1T8EB 3EE2A 4IELA 4IGJA 1PN9A 3TOUA 4EDYA 2VCQA 3RHCA 2QGVA 3CYNA 4P3YB 4ZBBA 4XRAA 1T00A 1F3AA 4XCSA 1N8JA 4MH2A 4AJ6A 5ECSA 1B9XC 2GZZA 1B8XA 2WZ9A 2TIRA 3FHKA 4ULXA 3W8JA 2H0IA 3HJMA 4O32A 5DAKA 1GNWA 3F63A 3UBKA 4YQVA 4AJ7A 1T3BA 2PBJA 2DC5A 3KEBA 5EY6A 3G9BA 1H4OA 2E2MA 2B5EA 4KDXA 5AIXA 3M9KA 4QQ7A 4ZB9A 2C80A 3GRXA 3TJBA 3FRCA 1Z3EA 2JACA 1A23A 1J9BA 2KUCA 1OC8A 3BOAA 1QMVA 1SJZA 4XIHA 3VWUA 1OKDA 2N5FA 1NHYA 1SL0B 2IJYA 1EV9A 3F4TA 4MPFA 2DIYA 2LSTA 4BVXA 2FNOA 2PMTA 4EO3A 2YV9A 1ST9A 3H79A 3LWAA 1V98A 3E0UA 5ECLB 1K0OA 1I9DA 4Z7XA 1VF4A 1F9MA 2GGTA 4WF4A 4HI7A 2YWOA 4TKYA 3TGZA 3TKPA 18GSA 1SKRB 2FLSA 3A2WA 4YQMA 4L5LA 3LSZA 5CAXA 1PGTA 4NAXA 2C8UA 2GSQA 2G0FA 4XRDA 2LTKA 3C8EA 4D73A 4KCAA 4I5QA 1EOGA 3F9UA 3GX8A 4MDCA 3O6TA 4LL1B 2F9SA 2DMLA 1QFNA 2YNXA 2WDUA 1B9YC 3DWVA 5HR3A 2VCZA 4TR0A 2K18A 2OJLA 3U5RE 3UVTA 1X5DA 3GIXA 3TJKA 2GT5A 2EIOA 1HQOA 1K0BA 2EIQA 1TRSA 3TOTA 3A5WA 5AIVA 2PUKC 1A8LA 4KE3A 5CRHA 5DQYA 3H1NA 2OBIA 3APQA 4PUFC 1M2AA 1YKAA 3KIJA 4K7NA 4O5RA 4CDOA 2O85A 5DVBA 2LRNA 2B6MA 4OFNA 2AYTA 3SWLA 1TI1A 1W89A 2PVOC 2JSYA 1B4QA 4POLA 5JCUA 3NZNA 4DSSA 4POMA 1BYEA 1YEXA 2V2GA 2YZHA 5B8BA 4DSRA 2KHPA 1ABAA 3HA9A 4MJBA 1HNCA 1TK8B 4KB3A 2IMIA 4IW9A 2F8FA 3US3A 1TRUA 5IIZA 2A4VA 2MMNA 3GL3A 3LJRA 2VCWA 3G7JA 3LGCA 2GZPA 4ZL9A 2FA8A 1XWGA 2H6XA 3DVWA 1O7UA 5DCHA 1PX7A 3VWXA 3FR6A 4JBBA 2PWJA 2HRNA 3EC3A 5F05A 1G7EA 1SD9A 3F6FA 2DMMA 2V41A 3WD6A 1SKSB 1USBA 2D2ZA 3I9V2 2I4AA 2LKUA 1AUCA 3TRPA 4NV2A 1QK8A 5INYA 2V1MA 3RBTA 4WEYA 3E9JB 4DSQA 4EF0A 1A2JA 5CYYA 4IBPA 3QCPA 4WKWA 1KNGA 2R6KA 3DEXA 1U3IA 3QFBC 3N9JA 1YF0A 2L4QA 2DJ1A 2C0DA 1O8XA 4Q5NA 3QDNA 1V9WA 4IP1A 5J9BA 2REMA 3WYWA 4Q5QA 4IHUA 3GX0A 3RDWA 1U88A 2LRCA 3FW2A 4TN8A 3Q74A 3BCIA 4QL7A 3D21A 1VF2A 4K1FA 3RAZA 1GULA 4I8BA 2H71A 3A2XA 3VWWA 4ZILA 5B6NA 3EINA 5H5RA 1YY7A 2VCVA 2X8CA 1JZDA 3ZLPA 4PQ1A 1GTUA 3QMXA 22GSA 5CNWA 2CV4A 5ECHB 1GLQA 1K3OA 3ISOA 1AIUA 1PKWA 2C4JA 4NMUA 1QXHA 1M9AA 4RQXA 1F37A 1ML6A 4MJAA 2X8HA 2RM5A 1VF1A 4ZL7A 1YJ6A 3IC4A 1ZCPA 4I2TA 2M80A 1U3AA 1WJKA 3NIVA 2CT6A 4F9ZA 1OC9B 2LQQA 3G7IA 2L57A 2VLTA 2PGTA 1MDKA 2H1GA 4Q5FA 3EVIA 5IMAA 5ABRA 2B5XA 2OA7A 3M8NA 4XTSA 4ML6A 4F2IA 4IQAA 3IPZA 2YJ7A 1SK1A 2YZUA 3ZFLA 2B5YA 2NDOA 4K7OA 4N11A 1SYRA 1N2AA 4V2MA 2WRTA 4EKZA 4KAEA 1M99A 4Q5RA 2LNTA 1GSFA 1JLVA 1TKDB 3M1GA 3K8NA 2G2QA 3VWVA 1MTCA 2WULA 4TW5A 2H70A 4GCIA 1WOUA 4LL4B 2WCIA 4L0UA 3FZ9A 3DYRA 5AISA 4KGIA 4TR3A 2LNSA 1BEDA 2QKEA 1FHEA 3HD5A 3HZ4A 2ZUPA 1EEJA 1VGLA 1FVJA 5IPGA 3F0IA 3VK9A 5J9CA 4OWYA 1JHBA 2JU5A 2JL4A 2RUEA 3F6DA 4HJ2A 4G9HA 2DJJA 4KX4A 3JCML 4TOPA 5IOXA 1G6WA 4HZ2A 5AN1A 3HCZA 3J7Yk 2K8VA 3IK9A 1U6TA 1XWBA 2H74A 3MAKA 5EVOA 2YP6A 2CZ2A 3G7YA 4CW9A 5B6MA 3ZITA 2E7PA 2V6KA 2VLUA 3KMNA 2YN1A 2CAIA 4KA0A 1XOBA 1PL2A 3MNGA 1ZZYA 1EZKA 4MPGA 1PSQA 4GLTA 1KTEA 2WFCA 2C0EA 2PVQA 3KTLA 3DD3A 4NV5A 1SL2B 1EGRA 1YF1A 3KJYA 1TK5B 4MF5A 1THOA 4JZQA 5F07A 4DEJA 3DXBA 2LRTA 4K0GA 5ECPB 2H8LA 2LJAA 4XS6A 1CQHA 2DJ2A 5JCGA 1RQMA 1WP0A 4MMMA 4NHWA 1J08A 5DBQA 5G30A 3IRAA 3UIWA 2BMXA 2RUFA 4HZ4A 1GUMA 1XVQA 5DJLA 1QQ2A 1WPIA 5IMDA 2L6DA 2C3QA 4IJ3A 4N0VA 1ILOA 2VD1A 2C0GA 1FW1A 1UVZA 1GP1A 2VL2A 3F3RA 4JR6A 4MF6A 2VL2C 2AJQB 4OFTA 1LJRA 1ZMAA 1E2YA 1T7PB 4OFMA 4ECJA 4PXOA 4BVYA 3I69A 4X43A 3FK8A 3W6GA 4CHSA 5CO3A 4KDYA 3L4NA 4IVFA 1F2EA 3I43A 5HR2A 2M72A 4TVEA 5ID2B 2OADA 2XPDA 3LYKA 5IQYA 1X9MB 4ID0A 19GSA 2YANA 4HOJA 2IMDA 3GYKA 2R4VA 3LQ7A 4AF2A 1S3CA 1HD2A 2DJ3A 3FY7A 1GTBA 1YQ1A 3L9SA 3WGXA 3ZIJA 2KP1A 4HUAA 1YDKA 2HZEB 3TUEA 5HFIA 4ML1A 3EMXA 1SD8A 3SBCA 3D6IA 4BPYA 1PA3A 5D93A 1M2DA 4KUNA 3QAGA 2F3MA 3ME7A 4XS4A 2BTOT 3LEFA 4PNGA 2GQMA 3ZZXA 2XC2A 2ZCTA 1EP8A 2L5OA 3UAPA 4WXTA 1M7TA 3CRUA 2IFQB 5A4VA 4K8MA 2B1KA 4KSOA 1WRYA 4N30A 4YAPA 1V57A 3ERWA 4MJCA 4EL1A 3EU3A 5IO2A 4TXOA 1WIKA 3V1WA 3KH7A 3CRTA 5COHA 2C1YA 4HDEA 4E8HA 1KEBA 2IWTA 3QAWA 3EWLA 3IAM2 2QSIA 2FWFA 3CBUA 1BAYA 3FZ5A 5J41A 12GSA 2ON7A 6GSWA 3S9FA 1BJXA 2HYXA 1A24A 1GUHA 2CVDA 4YH2A 2KLXA 1XXUA 1MEKA 4FYUA 4F0BA 5DALB 5IMCA 2HRFA 4FYBA 1FO5A 3C1SA 2H0HA 2HSYA 2H6YA 3GV1A 1GSDA 4F0CA 1K3LA 1G7OA 2GSSA 3TJGA 5JWOB 2JSZA 2CVKA 3BD2A 1SENA 3VFIA 3TKSE 4K7IA 2FWHA 2H1DA 5A4WA 1GUKA 1X9SB 5CRGA 3M0FA 1X9WB 4MZCA 3GHAA 1ERVA 4ECBA 1FVKA 2GDRA 2L4CA 2E2GA 2X64A 2PPTA 2B3SA 3CSJA 1PL1A 2B7JA 5ECMB 3IR4A 4HEA2 4JU5A 2AV4A 4O92A 2YWMA 3O76A 5DCGA 1SJIA 2GLRA 3CTGA 3ZYWA 1DE1A 2HZEA 3ZREA 4OCFA 1PD21 1TXXA 4G19A 1GTIA 11GSA 3LFLA 4WETA 3H93A 2HNLA 2TRXA 2OE1A 4TR1B 3GH9A 4J56E 1SKWB 2IL3A 3GTUB 4HU7A 3P8WA 3GN3A 2XHFA 2AHEA 4KSMA 4KW6A 5HQPA 4J57E 2E0QA 2O87A 4TRXA 3CSHA 2L59A 2IFQA 4BWQA 3ZMLA 4ZIJA 4TXVA 3ED3A 3KM6A 4EVMA 1UC7A 4OMVA 5HFKA 1RW1A 2VUPA 3ZRDA 2JZRA 1SJ6A 3DMLA 4GSNA 3LXTA 5FT3A 5L71A 4IQ1A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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