4D73B

X-ray structure of a peroxiredoxin
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
175
structure length
170
Chain Sequence
b'DLIPNVKVMIDVRNMNNISDTDGSPNDFTSIDTHELFNNKKILLISMPGAFTKMIPGYEEEYDYFIKENNFDDIYCITNNDIYVLKSWFKSMDIKKIKYISDGNSSFTDSMNMLVDKSNFFMGMRPWRFVAIVENNILVKMFQEKDKQHNIQTDPYDISTVNNVKEFLKN'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Plasmodium Falciparum Antioxidant Protein Reveals a Novel Mechanism for Balancing Turnover and Inactivation of Peroxiredoxins
pubmed doi rcsb
molecule keywords 1-CYS PEROXIREDOXIN
source organism Plasmodium falciparum
molecule tags Oxidoreductase
total genus 57
structure length 170
sequence length 175
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2014-11-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4d73B00
3M9JA 1XWKA 4TXOA 4K1FA 1GTUA 1PSQA 3VWWA 2CAQA 3ERFA 3UIWA 4G9HA 3M1GA 4IJIA 5B6NA 3WGXA 2A2RA 1GUHA 1JHBA 3LXZA 1W4VA 1B4PA 4AF2A 1M2AA 4LL4B 4XS6A 2WRTA 3QCPA 2J9HA 3ZFLA 1SL1B 4MK3A 4JEDA 2REMA 4XTSA 1GUMA 5J3RA 4HQSA 3W8SA 2YWOA 5HFKA 3TOUA 18GSA 3H1NA 3TKPA 4N10A 1GSYA 4V1Ap 4TR4A 3QDNA 2YWIA 1SKSB 1SJIA 2CQ9A 5FT3A 3ZVJA 1THXA 5ECSA 2L59A 1TDIA 1F6MC 2GQLA 2KP1A 1F3AA 5ECNB 1V58A 5GSSA 3D22A 4J2FA 3C73A 3KP9A 1PKWA 1XWAA 2B5EA 4V2MA 8GSSA 1DBYA 2O87A 3GKMA 1PQNA 4D73B 3GHAA 4GXZA 3LG6A 1G7EA 1ERUA 2PUKC 4Z7XA 1JLVA 1I5GA 5JWQB 1Z7RA 3TDGA 3KTLA 4KDUA 5D73A 4K7NA 5F06A 4POLA 3KXOA 3FRCA 3L4NA 1TK5B 2RUEA 3GH6A 2YCDA 2C3NA 4F0BA 5J5NA 3G7JA 2NVLA 3C1RA 2N5BA 2PWJA 3D5JA 3UMAA 4WEYA 5E4WA 4OD7A 3C71A 4CDOA 1SK1A 2GSRA 2LKUA 6GSXA 4MA9A 2XHFA 2ZNMA 3ERWA 3GURA 6GSWA 3BJ5A 4G2EA 1M99A 2GT6A 1H4OA 2L57A 4EF0A 4J57E 3CTFA 1UA5A 4YH2A 2V6OA 4XRAA 2HZEA 1YEXA 2HSYA 1OKDA 1FVKA 1TRVA 1FW1A 3PINA 3JCML 5HR2A 5CP1A 2I1UA 5JWOB 1C72A 4BVYA 1GTBA 2FNOA 4KUNA 3UOMA 2H71A 2K8SA 1U3AA 1ST9A 2GZPA 4MH3A 3UVTA 3M9KA 5DVBA 3GUSA 1XWCA 3HKRA 3TJFA 2MMZA 5JCWA 2BTOT 2GDRA 3KEBA 2O89A 4Q5QA 4AJ8A 2A4VA 4HOJA 3F63A 3HVSA 4GWRA 1HNAA 3KZQA 3VWXA 2YJ7A 2C3TA 4IQ1A 4HZ4A 4WKWA 5KN2A 1KNGA 4DSSA 3P8WA 4I5QA 2B5XA 2RUFA 1EV9A 2GSQA 5CRGA 4FYUA 5HQPA 2K6VA 2H70A 3FEUA 3ISOA 1TOFA 2FUG2 4J56E 2GGTA 2XPEA 1DE1A 5D9XA 2K9FA 3EURA 5IQYA 2VCTA 5G1LA 1FVJA 1M2BA 2OE0A 4LMVA 2H72A 2CX4A 4IVFA 1R4WA 4ZILA 2PN8A 1AQVA 1GRXA 4POBA 2ES7A 4TRXA 2XBIA 3GMFA 4BA7A 3H8QA 1SD8A 1B9XC 1ON4A 2OA7A 1AAZA 3A2WA 1T4YA 2EIOA 3DVXA 2GT5A 2E7PA 1JZOA 4G10A 4HQZA 1R5AA 4XRDA 1WIKA 1FAAA 2VCWA 2ZCTA 2MMAA 4WR4A 5EPFA 4MF5A 5DCGA 1LU4A 5G30A 2DJJA 2C0FA 4QL7A 1CQGA 2VCXA 1R26A 3FR6A 5ECKB 5IMAA 5ECRB 3OR5A 3UJ1A 4JR4A 5CREA 2LEGA 3D21A 1SL2B 1ERWA 2B7KA 1T3BA 5HFGA 2VM1A 1M9AA 4MABA 3MAKA 11GSA 1PN9A 2GQMA 4IQAA 5DQSA 2VCQA 3CMIA 5F0GA 3HD5A 2H6XA 3UAPA 4HDEA 1TKDB 5CYYA 3C8EA 5ID2B 1J0FA 2YZHA 4D73A 6GSSA 3LEFA 2VUPA 3KH9A 2F8FA 4PNGA 4MLYA 3LXTA 2DIZA 4JR6A 3ZTLA 2YANA 4ID0A 4O5RA 3DRNA 1PKZA 2FWHA 1XXUA 3QFAC 4N0ZA 5G1KA 4K9ZA 1XPVA 3TJKA 1H75A 2AHEA 2XBQA 2M46A 3G7YA 5IMCA 3V1WA 2AYTA 4TXVA 4KGIA 3ZFBA 1MD3A 2H1DA 3ZMKA 2H6YA 3LQ7A 1OAZA 1K0MA 1OE8A 5DDLA 1HNCA 2B6MA 5CRWA 3ZRDA 4WETA 1V57A 1ERVA 3DXBA 2VOCA 1WRYA 2B1KA 3F3RA 17GSA 1HNBA 2L6CA 1GP1A 3GN3A 2PVQA 2RM5A 1FOVA 1JZDA 1TTZA 4O7HA 3D4TA 2R2JA 2VIMA 4JBBA 3WGEA 3HA9A 1W89A 3TB2A 2LNSA 4HJ2A 3QMXA 4MJAA 4XIHA 2DJKA 4HU7A 2B3SA 4AGSA 5D9VA 3F4RA 1FO5A 5FHIA 5LCZA 3TJJA 1PD21 2VLTA 3C7MA 4MJEA 4ULXA 1VF3A 4TVEA 4F82A 2LJRA 2X64A 1K0BA 1A2MA 2JZRA 1DUGA 1O6JA 3DEXA 3F8UA 2IFQB 2LNTA 2C8UA 2OKAA 5EY6A 4I97A 1EZKA 1BYEA 2CT6A 5JCUA 4KNDA 2O85A 1ML6A 1EOHA 4POMA 5D93A 5IPHA 2Z9SA 2GVPA 2VCZA 5B8BA 3R2QA 2K8VA 22GSA 5KN0A 3BBYA 3EINA 4IJ3A 5B7CA 3FY7A 4PQ1A 2VCVA 1TU7A 2V32A 1K3YA 2WCIA 5AIXA 4LL1B 4KE3A 3I6AA 1T1VA 1XZOA 4OFTA 1Z3EA 3KJYA 4KCAA 4NV5A 1TRSA 5DALB 4ZL8A 3M8NA 1SK0A 2VO4A 3O6TA 1AQXA 2H1AA 2FHEA 2B7JA 3CRUA 1ABAA 2GTUA 2IMKA 5JCGA 5COHA 3A5WA 1EP7A 5DAKB 1M9BA 1XW5A 2GSTA 1U87A 2D2ZA 4HJMA 5AIVA 3SWLA 1YKAA 4GSTA 3TRXA 1SYRA 3LSZA 4KSMA 1XW9A 1KEBA 2IIYA 4AJ7A 3TCOA 1PA3A 1B48A 5KN3A 2PERA 4X0XA 3F6FA 3US3A 5J9BA 4ZL7A 2H1GA 4EDYA 4JE1A 4E8EA 3L9UA 3ZIJA 2DJ0A 3Q6OA 1K0NA 4ZB6A 4KX4A 3QOUA 5J41A 3APSA 2DLXA 1A0FA 1XIYA 4O32A 1X5DA 1EEMA 2XC2A 4RUVA 3WD6A 1TP9A 4HU9A 1Z9HA 2CAIA 3C1SA 3HJPA 3IV4A 1NHOA 4IBPA 1EOGA 4TR0A 2WGRA 1PRXA 4EE0A 2P0GA 2G2QA 3ED3A 3VK9A 1MEKA 2ZUPA 4KB3A 2E2GA 2L4CA 2I4AA 3Q18A 1EGOA 1PX6A 2FY6A 2P5QA 2YZUA 2FGXA 2OADA 3L9SA 2GZZA 4ILFA 4ZBBA 3TOTA 1X9WB 1YF0A 2PMTA 1BAYA 1YQ1A 1K3OA 3HZ8A 1T00A 2OACA 1SJZA 3M0FA 3U6VA 1V40A 2PPTA 3FYGA 3F9UA 1AW9A 2EIQA 1QGVA 2FD3A 2HE3A 3A3TA 2H66A 5IMDA 4ZB8A 2L5LA 4Q5RA 2ALBA 3D4MA 2H0IA 1X0RA 2KP2A 4EL1A 3HHVA 2HRFA 3WYWA 4OWYA 2AAWA 2RM6A 3ZLPA 1YEPA 1PL1A 4MP4A 5J9CA 2KUCA 5G5EA 1PX7A 1URMA 2IMEA 2C0EA 1BX9A 1ZL9A 3DD3A 4K0GA 3E3EA 3NIVA 3F0IA 4JZQA 3LGCA 2WS2A 2F51A 2CZ3A 2RIIA 1QK8A 1WE0A 3HVVA 5IM9A 3TUEA 4ZL9A 2CVDA 3HJOA 3GL3A 2IN3A 1Z5YE 1N8JA 3DGQA 1BJXA 4JRRA 4MMMA 4K6XA 3BOAA 13GSA 3UEMA 3IA1A 5HR1A 4PXOA 1THOA 2GS3A 2O7KA 2IMDA 4EKZA 3PH9A 2JACA 1TW9A 5D9TA 4EDZA 4ECBA 4KDYA 3DWVA 3LYKA 2X8GA 3DKSA 1G7OA 3SBCA 2YN1A 3HZ4A 4KAEA 4TR1B 2IFQA 3VFIA 2A2SA 2MMNA 3EU3A 3ME7A 3IOSA 2OBIA 1ILOA 3EC3A 1M2DA 4F2IA 1VRSD 4CW9A 3KP8A 2GLRA 3KMNA 3FKFA 2YV7A 1J9BA 1XVWA 4EO3A 1X5EA 1GSSA 1FB6A 3FZ5A 3HCZA 3BD2A 3P2AA 2H0GA 5CNWA 4FO5A 5KEJA 5G5FA 5FWGA 3J7Yk 5J4UA 1JZWA 1LJRA 1O73A 2BMXA 5A4UA 2FWGA 5A4WA 3DIEA 4I2UA 2DJ1A 5C00A 1BEDA 2I81A 3GFKA 2CX3A 5DALA 3GTUB 2DSAA 2MYGA 1F37A 3TKQA 3IHQA 2VL2A 1HQOA 3P90A 4GQCA 1T7PB 2F8AA 2CZ2A 1Y25A 2MBTA 1YY7A 4HUAA 4AJ6A 3CTGA 2JADA 2EIRA 5DAKA 3GA4A 4K8MA 2H0HA 3TKSA 5ECHB 1G0TA 2FA4A 1AXDA 1Q98A 1GLQA 3LFLA 1MDKA 2WFCA 1SL0B 1AIUA 1YKCA 2HZFA 4XHMA 1NM3A 3LYPA 4L5OA 1MD4A 4N30A 1AQWA 3W6GA 4ZB9A 3K8NA 5F07A 3QD9A 2DJ2A 1B9YC 4FYBA 4MF7A 1E6BA 1JLWA 2LJAA 1U6TA 1WMJA 2R5GA 4X1UA 2HT9A 4LLRA 4RI6A 2HFDA 2F9SA 1BQ7A 2WJUA 3CBUA 2OE1A 5ABRA 2M80A 2JSZA 5H5RA 3EU4A 2R4VA 1NSWA 3VWVA 6GSTA 1GTIA 5INYA 2QSIA 3U5RE 1GUKA 3GSTA 3KD0A 1QFNA 3VI5A 1VF1A 2LQOA 4BVXA 3RAZA 4DVCA 4H86A 2VM2A 3F4TA 1KTEA 3TRQA 1ERTA 2NDOA 1SJ6A 4EC0A 1WJKA 3KIJA 4I6XA 2VL9A 2JL4A 4LMWA 2WZ9A 1V2AA 2LS5A 2V41A 5DJMA 4EVMA 1EEJA 1O85A 1RW1A 4P3YB 3VWUA 2JZTA 1A2LA 3TJGA 4NHZA 2FWEA 2XPDA 1O8XA 4GQFA 1WWJA 2YJHA 1RQMA 5ELGA 2H75A 3IAM2 9GSSA 2VL3A 4NMUA 2IWTA 2TIRA 2LTKA 2H30A 1VF4A 4ZIJA 1ZGNA 1FG4A 1XFLA 3LORA 4TW5A 4LA1A 2FWFA 3IK9A 5F05A 2H1BA 1GNEA 3F6DA 2VD0A 1YDKA 1PL2A 1OVNA 2DC5A 3FZAA 4XS4B 2LRNA 2HZEB 2K18A 2LJKA 4K0NA 2CA8A 2IJYA 3HY2A 3ZREA 2R37A 3TJBA 4CHSA 1JFUA 2DMMA 2I3YA 3IXRA 4FIWA 2H01A 3EE2A 1ZCPA 1Z6NA 3H79A 3LJRA 3HDCA 4G19A 4DSQA 6GSVA 1X9MB 3IRAA 2FLSA 1GH2A 2AB6A 4NWYA 2LRTA 1S3AA 4YAVA 1WPIA 2C3QA 1TK8B 4PNFA 1ZZYA 3EWLA 4I2TA 3ZYWA 1OC3A 3VI7A 2CV4A 2AUVA 4BWQA 3WT2A 2IMIA 4MH2A 5L71A 4F9ZA 1HYUA 3GYKA 3CSIA 4I8BA 1GSDA 1K0DA 2X99A 2IPAA 1QMVA 4TR1A 3TGZA 4Q5NA 3KTBA 1PGTA 3APQA 4TOPA 4ECIA 5DJLA 1TRWA 1VF2A 1E2YA 3D6IA 3F4SA 1V98A 2RLIA 4HI7A 2E0QA 4HEA2 3RBTA 2JZSA 4OFNA 2B5YA 4RQXA 3RHCA 3FZ9A 1XOBA 4QQ7A 3EMPA 5GZZB 4KA0A 2VLUA 4N11A 5ECMB 1SK2A 2R3XA 2CVBA 5ECQB 1VGLA 1JZRA 4OCEA 2C0DA 1A23A 2CVKA 3NOFA 2YV9A 4NPBA 2FCHA 4IN0A 3F3QA 5EVOA 2OBKA 3FZ4A 3GTUA 5IO0A 1EGRA 3KH7A 3QR6A 2QC7A 4V1Ag 4BPYA 1LBKA 1K0AA 2H6ZA 3KM6A 5AISA 5F8BA 2LV3A 20GSA 3UBLA 3AY8A 3NZNA 4MZBA 5CO3A 4IHUA 4OMVA 1KBNA 3G9BA 4RQRA 2KHPA 1QQ2A 3L0HA 1WOUA 5IMVA 5GAPD 1U3IA 1ZYQB 1V9WA 3I9V2 4WBRD 1EV4A 2LQQA 1J08A 3WGDA 4GSNA 4OO5A 1B8XA 2X8HA 1TI1A 5HR3A 5G2ZA 2ON5A 4ACSA 1FB0A 2TRXA 3ZVJD 3Q19A 3BCIA 1USBA 2C1YA 3CSJA 1SKWB 3GX0A 2WDUA 1OC8A 4XS1A 2JU5A 3GSSA 1ZYEA 6GSYA 2P5RA 4IS0A 3GKXA 2L4QA 3ZIVA 3FW2A 4MZCA 4KSOA 1GWCA 5AGYA 3IBHA 5GAND 16GSA 3KCMA 2ON7A 3IE3A 5ID2A 3VPQA 2B1LA 1Y6EA 4NHWA 4V2LA 3MNGA 3FR9A 4O92A 4MF6A 3IK7A 3N5OA 5IPGA 1TJDA 4HZ2A 1N2AA 2PGTA 3MSZA 2DJ3A 5D96A 2C80A 4NAXA 2N5FA 1QXHA 3E9JB 4MPGA 4IKHA 4N0VA 3I43A 3GL5A 4PURA 1I9DA 1OYJA 2MBSA 3QPMA 1S3CA 1OE7A 2YOIA 4PGTA 2C0GA 3DYRA 1GSUA 4MCUA 2H76A 5CAXA 4YQVA 3GRXA 4FYCA 1MDIA 3ZL5A 2AJQB 4MJCA 3L78A 2I9HA 2X8CA 5DQYA 5KN1A 1CQHA 4ML6A 2OE3A 5C04A 2VLVA 5H5QA 4YQUA 4BL7A 5DBQA 3APOA 4K2DA 3D0ZA 4WXTA 2E2MA 4NXIA 3QAWA 1XW6A 5ELAA 1YF1A 2P31A 1GULA 1AC1A 2KLXA 2V2GA 1NW2A 3GX8A 1OC9B 2QGVA 4XS4A 1YZXA 1HD2A 1XWBA 3H4KA 3IAS2 4GTUA 4IELA 4NV2A 5G31A 3ZMLA 19GSA 1G6WA 2WULA 2H8LA 4JU5A 4KCEA 3TKRA 4IGJA 1GTAA 1B4QA 4MZWA 1UN2A 3A2VA 4OCFA 3EMXA 2PU9C 1T8EB 2IMFA 1ACVA 5AN1A 5GSTA 3HYPA 3QFBC 2MMOA 3PR8A 4POKA 1A8LA 4QL9A 4KH7A 3P7XA 1F9MA 3BCKA 3UBKA 3ZZXA 4IP6A 3DMLA 3E0UA 2FA8A 1A8YA 4F0CA 1M0UA 3Q74A 4K7IA 1NHYA 4DSRA 1K0OA 2L5OA 5CRHA 5ECOB 3VLNA 4ISDA 3N9JA 3GKKA 1XBSA 4TR3A 4EUYA 1O7UA 3IDVA 2HRNA 1MTCA 3HJMA 2LRCA 3ZITA 1OKTA 3G7IA 1U88A 4TXOB 2YP6A 3A2XA 5JWRB 3GNJA 2KOKA 12GSA 4GF0A 3DVWA 5LNKe 3FK8A 1YJ6A 5A5KA 4ZBDA 4ECJA 4GRFA 3O76A 2L6DA 2WB9A 2N5AA 2NTOA 4RI7A 3UL3A 2OJLA 2YPMA 3LWAA 4WBJA 3CXGA 2R6KA 4GLTA 3GKNA 2C4JA 4XCSA 1R5PA 4GCIA 3RDWA 1SKRB 3I69A 4Q5FA 3HVXA 1XVQA 4MDCA 1XWGA 4L8EA 3W8JA 4L0WA 3KMOA 2MZCA 5IMZA 2H19A 4GSSA 1TU8A 5IO2A 3MWHA 3L9VA 3VURA 5D8IA 5D9WA 4V2NA 3HXSA 2GZYA 2YWMA 3GIXA 3IC4A 10GSA 4FH8A 1Z7PA 5LD0A 4PQHA 3TKSE 2H73A 3QAGA 3CYNA 4PUAA 4WR5A 5B6MA 5A4VA 3IPZA 4ECCA 1FHEA 1RK4A 3J7Yb 1T4ZA 4WF4A 1K0CA 1GNWA 1GSFA 1Z6MA 2HNLA 2HYXA 5HFIA 1F2EA 2NPBA 2VL2C 1A24A 2J23A 2VD1A 2DMLA 2H74A 1ZMAA 4KDXA 2GSSA 2QKEA 3QAVA 1TK0B 2V1MA 1G6YA 2DBCA 1IYIA 3TKSC 2G0FA 2M72A 5IMFA 4ZBAA 4X43A 1PMTA 2IL3A 3ME8A 3GV1A 5IOWA 2F3MA 4ML1A 1GSQA 4YQMA 2BJXA 4EXJA 1EP8A 5DCHA 4L5LA 4MJBA 2LSTA 1XCCA 3ERGA 3IR4A 5E59A 2EC4A 4OO4A 6GSUA 1TI3A 1ZOFA 1IYHA 2HSHA 3MDKA 3GH9A 4IP1A 3H93A 1A2JA 1Q4JA 4YAPA 3VPTA 2TRCP 4TN8A 3S9FA 2VAFA 1S3DA 1MDJA 3UVHA 4DEJA 2HXKA 1OC9A 4PX1A 1BG5A 1X5CA 5IIZA 5ECLB 1SD9A 14GSA 1SU9A 1DE2A 2PBJA 1EWXA 1GSEA 2YNXA 4TKYA 1O81A 2DIYA 3RPPA 1GL8A 5B8AA 4ZXGA 5ECIB 3FHKA 2YWNA 2LUSA 3CRTA 4OFMA 1WP0A 1X9SB 3EVIA 3PGTA 3EYTA 2AV4A 1GLPA 3WT1A 1AUCA 1O8WA 4PQIA 5CRDA 1XOAA 1F3BA 3FR3A 1K3LA 5ECPB 2JSYA 4K7OA 2V6KA 4F03A 2NBSA 1A0RP 4E8HA 1R7HA 5IOXA 1UC7A 4HS1A 3RPNA 3O3TA 3TRPA 1TXXA 5ENUA 4DSSB 5HR0A 2GQKA 2HI7A 1DSBA 1TRUA 2HLSA 2O8VB 4MPFA 3UARA 3RHBA 3KGKA 1SYXA 4BWSA 3M3MA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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