4DAJA

Structure of the m3 muscarinic acetylcholine receptor
Total Genus 159
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
159
sequence length
432
structure length
429
Chain Sequence
IWQVVFIAFLTGFLALVTIIGNILVIVAFKVNKQLKTVNNYFLLSLACADLIIGVISMNLFTTYIIMNRWALGNLACDLWLSIDYVASNASVMNLLVISFDRYFSITRPLTYRAKRTTKRAGVMIGLAWVISFVLWAPAILFWQYFVGKRTVPPGECFIQFLSEPTITFGTAIAAFYMPVTIMTILYWRIYKETEKMNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYLIKEAQTLSAILLAFIITWTPYNIMVLVNTFCDSCIPKTYWNLGYWLCYINSTVNPVCYALCNKTFRTTFKT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Signaling protein, hydrolase
molecule keywords Muscarinic acetylcholine receptor M3, Lysozyme
publication title Structure and dynamics of the M3 muscarinic acetylcholine receptor.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
total genus 159
structure length 429
sequence length 432
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
A PF00001 7tm_1 7 transmembrane receptor (rhodopsin family)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dajA02
1.20.1070.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins Rhopdopsin 7-helix transmembrane proteins 4dajA01
1L27A 2L6XA 3FADA 1L09A 1C6JA 4EKSA 225LA 3S3DB 2F32A 127LA 2OE7X 3CDRA 3C82A 3OE8A 3RUNA 1CVKA 2Z73A 4HWLA 3G3WA 250LA 2I1XA 4FAAB 1QM8A 3VVKA 1P5CA 3UTXA 1PQJA 2F95A 2Y02A 1T8FA 5B35A 4L35A 1C6DA 1C6CA 1LW9A 1L47A 1LLHA 255LA 1L30A 3CAPA 4TL3A 4ARQB 4KLYA 3SB5A 1L90A 3V2YA 1L60A 1L63A 1QTZA 1BRDA 1L16A 1L05A 114LA 143LA 3ZPRA 1L25A 1L50A 2QB0B 5H2KA 3PQRA 2RBPA 2KS9A 249LA 3C80A 1L39A 3C7YA 4I7MA 1C69A 1P8HA 4QIDA 1PQDA 1KY0A 3DN2A 2LCBA 2Q9EA 1OV7A 170LA 3OE6A 1GZMA 1L96A 1PQMA 2L78A 1CUPA 3LZMA 1VJMA 1G1WA 224LA 3VW7A 5ITCA 1L41A 5AWZA 1X0K1 2B7XA 218LA 1CX6A 1L74A 1L93A 2R4SA 4OV0A 4PXKA 4XXJA 166LA 2RB1X 4I7SA 3QJVB 4I7NA 1L99A 252LA 1L51A 221LA 4WAVA 1L95A 2YCZA 163LA 3C7WA 1QKOA 3SB8A 1C6EA 1S54A 2HUMA 156LA 4AMJA 1B6IA 187LA 2KSYA 4UG2A 206LA 5B6VA 3UTYA 237LA 1IXFA 150LA 5H2MA 1P3NA 1L79A 3QDCA 1DYCA 4BEZA 2LZMA 2AT9A 1R84A 1CU5A 2F47A 1QT5A 4LZMA 3GUKA 3HH6A 1L68A 4EPFA 1L28A 197LA 4MD2A 239LA 4XTNA 3S8GB 1L44A 3HT6A 1XMEB 1MGYA 4GP8B 2B6YA 4EKRA 5JJJA 130LA 4AMIA 1L75A 1LGXA 229LA 1L03A 242LA 1EHKB 254LA 1L40A 3GUMA 1L71A 1L01A 1LYJA 1L22A 2RH1A 4W59A 1C8SA 164LA 2HULA 4GBRB 3RZEA 2Q9DA 1SX2A 1L10A 5DHHA 131LA 4A4MA 189LA 167LA 1L15A 1CV3A 3DKEX 4X31A 1F4ZA 2OE4X 4HYXA 1OWYA 1HZXA 4G72B 1JTNA 4I7LA 4QI1A 1ZYTA 1L92A 1C6HA 1BM1A 1L06A 4YXAC 2OEAX 3HUKA 138LA 1DYFA 1L0KA 1L52A 235LA 2B6XA 1FBKA 5B34A 2YCWA 1G0JA 2YDVA 1CTWA 4PXFA 3HDFA 3HWLA 1JV6A 5FJGA 4XTOA 1C6LA 1L86A 1SWZA 3SB6A 1L19A 3NS0A 1SSWA 4S0WA 2VT4A 142LA 5B2NA 1P37A 1D2YA 3HU9A 168LA 123LA 3UONA 2OU8A 1LYFA 108LA 1QUGA 4BV0A 1L58A 1D2WA 2OTZX 4I7JA 155LA 5LWEA 3PDSA 3HT8A 2A4TA 1L17A 3SBBC 119LA 4N6HA 1D9WA 1L88A 257LA 4W52A 4W56A 3EH5B 1D3FA 1AP9A 4EIYA 190LA 1S8LA 1SWYA 1XEPA 258LA 199LA 1DYDA 1C6TA 1G06A 1L08A 205LA 3DNAA 1P2LA 1L66A 1TN5A 4ARMB 1OYUA 1P2RA 4LDLA 145LA 1LI3A 2OE9X 5AZDA 2B73A 2HUKA 3NY8A 1M0LA 1L18A 1L13A 5C1MA 5B6YA 1CV6A 1L00A 1KG9A 5B0WA 4N4YB 4X32A 1L65A 3RFMA 1PQOA 175LA 2ANXA 2B74A 5A45A 223LA 1KS3A 2OTYX 4FA7B 176LA 4I7KA 1DYGA 2I35A 3ZEVA 3ODUA 2B70A 1F88A 3HANA 4MQTA 185LA 3K2RA 2NTWA 6LZMA 3CODA 5G2CA 1C60A 3OE9A 3VGAA 3F8VA 4XT3A 5H2OA 157LA 3QJSB 5BR2A 169LA 1C6NA 5AX0A 209LA 1LYEA 1LI2A 1C66A 3CDOA 141LA 1C6MA 219LA 4JQ6A 1L23A 1QTDA 1Q5IA 1L55A 165LA 1KMEA 1QSQA 1UAZA 2B72A 4WW3A 5DHGA 3C9MA 3NSBA 1S51A 1C6PA 1L97A 3DN0A 1G07A 3QJTB 1SX7A 1L26A 1H68A 147LA 1L64A 2M3GA 4I7QA 3HASA 3DQBA 1T8GA 1P46A 1X0I1 151LA 1PY6A 3ABWA 148LE 1L0JA 1T97A 1LI6A 4BWBA 178LA 245LA 3DMXA 260LA 3NY9A 2JAGA 4IAQA 1L49A 3HAPA 7LZMA 2ZFEA 4G70B 1S53A 3REYA 3AM6A 1LGWA 152LA 3BVDB 2RBQA 1L73A 4GRVA 1QTCA 174LA 3CDTA 234LA 2J4YA 2YDOA 4EKPA 3V2WA 2WJLA 2IGCA 3T45A 1T6HA 4JR8A 1O0AA 1L57A 3DN8A 3UZAA 248LA 5G2DA 3HTBA 146LA 4G7QB 1JFPA 1QUDA 2RBSA 1C62A 1L34A 1Q5JA 3OAXA 120LA 3DN6A 200LA 2RAZX 3G3VA 4FBZA 1L83A 1L80A 1L31A 217LA 2KSBA 5J7AA 1CU2A 2B6ZA 2QPDB 1KW7A 2NTHA 3HTGA 171LA 1LPYA 1P6YA 3G3XA 2NTUA 3FI5A 2BRDA 3ZPQA 1BRXA 215LA 4Y9HA 1CWQA 1L07A 1CU6A 1C3WA 2RBOA 3HH3A 5JJNA 3HH4A 1L48A 2LC9A 4ARQA 1QT6A 222LA 160LA 1L98A 5H2PA 236LA 1L02A 192LA 118LA 4W58A 4YX7C 3VHZA 5B6XA 188LA 4GP4B 3MBVA 1VGOA 1G0PA 2Y04A 2OU0X 3DN1A 1CV1A 226LA 2O7AA 240LA 4BEYA 125LA 5B6WA 2JAFA 1IW6A 1L94A 3C7ZA 4W54A 3GULA 102LA 112LA 1L72A 1M0KA 4ARJA 109LA 1L59A 4G71B 4OO9A 2ZIYA 1G1VA 4BUOA 1PXRA 1L67A 1L82A 213LA 3UG9A 1KG8A 3QBIA 3HU8A 5H2LA 1QSBA 1L24A 1LYHA 4XT1A 4IAPA 1X0SA 1D3JA 5EN0A 2F93A 1F50A 4HYJA 5ITEA 1C61A 5BR5A 1PQKA 1G0MA 1QT8A 220LA 1C64A 1XJIA 1CU0A 2ZZLA 3HAQA 1L53A 139LA 1L61A 1QTBA 5G2AA 1L20A 4MD1A 230LA 1L89A 1OWZA 3PWHA 1H2SA 244LA 2I20A 4GP5B 2B75A 4J4QA 2F2QA 3GUJA 3HTDA 1GU8A 5AHZA 227LA 4YXCA 129LA 1L29A 2R4RA 111LA 110LA 4MBSA 5H2IA 182LA 3GUOA 256LA 2G87A 1E12A 210LA 1ZWNA 4W51A 1OVJA 4PJZA 1L62A 1XJUA 4ARLA 2EI4A 3HH5A 4GYCA 1LGUA 161LA 1C8RA 1JV7A 159LA 1XJTA 1TLAA 4GBRA 1R2NA 1C65A 3GUIA 4EA3A 1PQIA 2Y03A 1G0KA 214LA 3HT7A 1C67A 184LA 1D3MA 4W57A 1LWKA 243LA 3EH3B 1L42A 3DMVA 172LA 1C6IA 4L6RA 1L69A 5G36A 115LA 1QS9A 1T8AA 5G28A 5B6ZA 3PBLA 1C6BA 3DN4A 113LA 3KJ6A 5H2HA 5JJEA 3D4SA 4DJHA 183LA 1C6FA 3A7KA 1NHBA 1C6KA 1LYIA 1S52A 3SBAA 1P36A 4I7TA 2O79A 2Y01A 162LA 3QBKA 247LA 2RBNA 1I6SA 5F8UA 1L84A 2NTGA 1DYAA 246LA 3VG9A 5TGZA 1L70A 1S8JA 5G54A 3X3CA 1E0PA 1JTMA 1WTHA 3DMZA 3QAKA 4PK0A 1LN6A 1CV5A 2RB0X 4JKVA 4IB4A 4ARPA 186LA 3HARA 1L43A 3S3BB 4BVNA 137LA 1C63A 2OU9A 1P56A 1G0LA 2B6WA 1JGJA 140LA 1QUHA 1DYBA 1L76A 233LA 4E97A 2LNLA 3C81A 228LA 4EXMA 1C6QA 2RB2X 3L2XA 4I7PA 5LZMA 3CDQA 4EPIA 5I14A 1L77A 4KNFA 5H2NA 1L87A 2Y00A 1L36A 1SSYA 3DDLA 2WJKA 1L32A 1CUQA 1U19A 104LA 1KY1A 3SB9A 4G7SB 1LYDA 1JQUA 3C8SA 4ARMA 2RBRA 3S3CB 1C6AA 4DAJA 1C6GA 1OV5A 1L56A 4EKQA 3C8QA 1P8IA 1QT3A 3C8RA 2YCYA 5A8EA 4G7RB 2PEDA 1L45A 1CU3A 2Z6BA 4I7RA 1L0MA 3GUNA 3QJRB 5ETZA 3WQJA 5A44A 1L54A 1BRRA 196LA 1L81A 1QT7A 3F9LA 1QKPA 4DKLA 2QARC 1C68A 4LDEA 126LA 238LA 1P64A 1UCQA 3AYNA 191LA 2YCXA 4LDOA 212LA 1XIOA 2HPYA 5AHYA 1QTVA 2QPEB 3X3BA 1P7SA 3UTWA 3HUAA 128LA 1L04A 3JR6A 2X72A 231LA 177LA 4QRYA 5DYSA 251LA 1OVKA 1FBBA 3COCA 3DN3A 1PXSA 4IARA 1L91A 1QUOA 1AT9A 5KKHA 1G0QA 232LA 2O4WA 2CUUA 5H2JA 1P8UA 1L9HA 3SB7A 149LA 259LA 201LA 1KGBA 1L38A 4W55A 1G0GA 1OVHA 4AQNA 1DZEA 4XTLA 1L21A 1K28A 173LA 1CV0A 144LA 1KW5A 1QS5A 122LA 4UHRA 3P0GA 4N4WA 107LA 2ANVA 1L11A 1L46A 3QJQB 1L33A 181LA 4I7OA 1ZURA 5G53A 1LWGA 198LA 1QT4A 2KSAA 4GPOA 3NYAA 1D3NA 4ZPUA 2RAYX 4NC3A 1GUEA 3UTVA 3HAOA 1KNIA 262LA 3SN6R 3C9LA 3UZCA 1CV4A 4K5YA 1IW9A 4W53A 4MQSA 1L35A 3S8FB 3CDVA 3HDEA 3EH4B 3VI0A 1L37A 3QBGA 3C83A 253LA 261LA 1TN0A 2B6TA 3OE0A 4X1HA 158LA 3L64A 1L14A 1M0MA 3GUPA 3PXOA 216LA 3QBLA 3AYMA 5AX1A 103LA 1LYGA 4EJ4A 3QJUB 3QAPA 1L12A 3HUQA 241LA 3HT9A 180LA 2Z55A 4FPDA 195LA 1L85A 1QHJA 1CX7A 211LA 1QTHA 1EPYA 3EMLA 2I21A 3HTFA 1DYEA 3FA0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1L27A 1HSWA 1RJCB 3S3DB 2OE7X 3RUNA 2Z73A 1CVKA 4XJHA 4Z46A 2I1XA 4FAAB 1DQJC 2Y02A 1LSAA 5B35A 4XJDA 4NGIA 1F6RA 1NDMC 4TL3A 3V2YA 1QDRA 4CFOA 1L16A 1L25A 1L50A 3PQRA 2KS9A 4I7MA 1L39A 4QIDA 4X32A 170LA 1L96A 2L78A 3LZMA 1CUPA 1G1WA 3VW7A 1L41A 1LJIA 4NGZA 4GN5C 2MEEA 1L99A 1PS5A 1LYOA 1IWXA 1MLCE 1JKDA 1L95A 1QKOA 5II3A 4DS7E 4W96A 2HUMA 4AMJA 1B6IA 4WM5A 5APCA 5B6VA 150LA 4G4BA 1LJ3A 1L79A 3QDCA 3T6UA 153LA 1LJHA 3HH6A 197LA 1L28A 1GF0A 1UIEA 1LMCA 4XTNA 4PJ2C 3S8GB 1XMEB 5KXKA 1LMOA 2B6YA 130LA 1UBZA 1L03A 1VEDA 1B5WA 1LZCA 1DPXA 1L40A 3GXKA 2RH1A 5DN4A 2Z37A 1YKYX 1C8SA 164LA 1JIYA 2Q9DA 189LA 1L15A 3P65A 4OWHA 1JISA 1C46A 4HYXA 3AJNA 4WO9A 5I4XA 1JTNA 4QI1A 1QQYA 4LGKA 1GFHA 4NGJA 4YXAC 4RW2A 1B2KA 5KKIA 3HUKA 6LYZA 1G7MC 2YCWA 4H91A 1IOSA 1CTWA 4PXFA 4XTOA 1AT6A 1LZ1A 1C6LA 1L86A 4NGVA 5DN5A 1L19A 1LZGA 1LZEA 4S0WA 1D2YA 1LSNA 2Z38A 3B0OA 3D3DA 2Z18A 108LA 1QUGA 2LYMA 4LYBA 2OTZX 4I7JA 1JHLA 4AGAA 3HT8A 4YF2A 4DDBA 1J1OY 1B7SA 1LJKA 1NMMA 3EH5B 1EQ4A 1QIOA 2EPEA 4WG1A 4NIJA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2QAR C;  1C68 A;  4LDE A;  126L A;  238L A;  1P64 A;  1UCQ A;  3AYN A;  191L A;  2YCX A;  4LDO A;  212L A;  1XIO A;  2HPY A;  5AHY A;  1QTV A;  2QPE B;  3X3B A;  1P7S A;  3UTW A;  3HUA A;  128L A;  1L04 A;  3JR6 A;  2X72 A;  231L A;  177L A;  4QRY A;  5DYS A;  251L A;  1OVK A;  1FBB A;  3COC A;  3DN3 A;  1PXS A;  4IAR A;  1L91 A;  1QUO A;  1AT9 A;  5KKH A;  1G0Q A;  232L A;  2O4W A;  2CUU A;  5H2J A;  1P8U A;  1L9H A;  3SB7 A;  149L A;  259L A;  201L A;  1KGB A;  1L38 A;  4W55 A;  1G0G A;  1OVH A;  4AQN A;  1DZE A;  4XTL A;  1L21 A;  1K28 A;  173L A;  1CV0 A;  144L A;  1KW5 A;  1QS5 A;  122L A;  4UHR A;  3P0G A;  4N4W A;  107L A;  2ANV A;  1L11 A;  1L46 A;  3QJQ B;  1L33 A;  181L A;  4I7O A;  1ZUR A;  5G53 A;  1LWG A;  198L A;  1QT4 A;  2KSA A;  4GPO A;  3NYA A;  1D3N A;  4ZPU A;  2RAY X;  4NC3 A;  1GUE A;  3UTV A;  3HAO A;  1KNI A;  262L A;  3SN6 R;  3C9L A;  3UZC A;  1CV4 A;  4K5Y A;  1IW9 A;  4W53 A;  4MQS A;  1L35 A;  3S8F B;  3CDV A;  3HDE A;  3EH4 B;  3VI0 A;  1L37 A;  3QBG A;  3C83 A;  253L A;  261L A;  1TN0 A;  2B6T A;  3OE0 A;  4X1H A;  158L A;  3L64 A;  1L14 A;  1M0M A;  3GUP A;  3PXO A;  216L A;  3QBL A;  3AYM A;  5AX1 A;  103L A;  1LYG A;  4EJ4 A;  3QJU B;  3QAP A;  1L12 A;  3HUQ A;  241L A;  3HT9 A;  180L A;  2Z55 A;  4FPD A;  195L A;  1L85 A;  1QHJ A;  1CX7 A;  211L A;  1QTH A;  1EPY A;  3EML A;  2I21 A;  3HTF A;  1DYE A;  3FA0 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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