4DD1A

Eval processed hewl, cisplatin aqueous paratone
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
molecule tags Hydrolase
total genus 46
structure length 129
sequence length 129
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd1A00
1XGTC 2HEFA 5KXOA 4GLVA 1DXJA 1IOQA 4A7DA 5FHWA 5KXSA 3WW5A 1MELL 3WPKA 1JITA 1FBIX 1VDQA 1AT5A 1LSPA 1TDYA 1AZFA 2BQAA 3ULRA 1NWGA 1WQMA 1OQMA 1GBWA 4OWHA 1IWWA 1FLUA 4AGAA 4OWAA 1LZ4A 1YIKA 5KJ9A 1QSWA 1B9OA 1HHLA 2YDGA 1G7HC 3AGIA 5DM9A 3TXFA 4M6DA 3W6CA 2ZQ4A 1CKDA 2ZNWY 1GFHA 1H87A 1NBYC 1YKYX 1B0DA 1LSFA 1B5ZA 3WUAA 2BQJA 1AKIA 3CT5A 1JTTL 2G4QA 1IOCA 1B5WA 1GE4A 1YAOA 2W1LA 1LHJA 1GXV2 207LA 4WM2A 1LSDA 4XJFA 1OUCA 1I56A 4H1PA 4NG8A 1DI3A 1JJ1A 5KY1A 1B5UA 4XADA 5FCPA 4WG7A 1LYSA 1HMLA 1C7PA 2DQEY 3AZ4A 3CSQA 1B7LA 2Q0MX 2HTXA 4WM5A 1LZBA 4I0CA 135LA 3AZ6A 1LMAA 4H8ZA 5J7CA 1OUFA 1LSAA 1RFPA 4RLMA 5I4YA 4H9BA 2DQCY 3W6FA 4PRUA 2D4IA 2MECA 4XYYA 1HMKA 1MLCE 4LYTA 1GBZA 3BKVA 1OUJA 1LAAA 1LJGA 3TMXA 1UIFA 5IELA 1LHIA 4OWEA 3K3TA 4HJYA 4WLXA 4J1BA 3CSRA 1REMA 1QUSA 4N1EI 1B7NA 2G4NA 4TSCA 3WMKA 5KXTA 2A7DA 1AT6A 1IWZA 1GEZA 1LMNA 2BQGA 4NWEA 3WVYA 1LMTA 1GBOA 133LA 2HU3A 1BGIA 3TXIA 2Z2FA 4ETDA 4H9HA 5APEA 1D6QA 1IWTA 1VDSA 2BQFA 4RW2A 2FYCA 3KAMA 2F2NA 5D5FA 5DN4A 4LT0A 4DD9A 1UIDA 4WOAA 4WLTA 5L9JA 1C46A 1ZVYB 3OJPA 5LVKA 5C6IA 4CGEA 1KIPC 1FLQA 2CDSA 1GFUA 2DQAA 1NF5A 1UACY 1LZ6A 1WQQA 1XGUC 2PC2A 1HEWA 2RSCA 1WQRA 2YBLA 2Z18A 1D0KA 1LCNA 1BWHA 4WMGA 5JENB 1YL0X 1JJ3A 2W1XA 1ZVHL 2YBJA 1BWJA 1HEPA 1LZ8A 1UICA 1GB2A 4YEOA 3P64A 1J1PY 4QDNA 1JSEA 4NEBA 3T36A 5KXYA 1NDMC 1OUDA 4J7VA 5II3A 1LJHA 1CKHA 4B4IA 1KXYA 1XGQC 4HTQA 1IWVA 2MEEA 4NHTA 4D9ZA 4NG1A 4H90A 1GB0A 1YAPA 1YKXX 4HTKA 1HC0A 4NHSA 1IP7A 5K7OA 194LA 4UWUA 2BQIA 3WH1A 1BB7A 2NWDX 4NGYA 3TXBA 4TTDA 3TXDA 2BAAA 1YAMA 1INUA 3W6EA 3WVXA 2YBMA 1T6VL 4GLAA 4LGKA 4RLNA 4YM8A 1JKCA 5T3FA 1CJ6A 1LYOA 1SLYA 1REZA 1HSWA 2DQJY 3WU8A 4ML7A 1F10A 4NSGA 1UUZC 1BVKC 1DI4A 3A94A 4DD0A 4XJIA 1J1XY 4DDAA 1XEJA 2HEDA 1GE3A 1NHEA 3CT0A 1EQEA 5I5QA 4DD2A 1GFRA 1C08C 2ZQ3A 5IHGA 1DPWA 3TXJA 1UIAA 2EQLA 4BAPA 1B7MA 1JKDA 2Z38A 2Z39A 1VAUA 3VWOA 3W6AA 2LYZA 3A34A 3AGGG 3LN2A 1LZSA 4W94A 1YANA 1WTMA 4NSHA 2BQEA 1OUGA 1GFTA 1CNSA 3TXEA 1WVUA 3A95A 1GF8A 4RDSA 1DKKA 4II8A 1DI5A 1PZYA 1D9UA 1IOSA 5B06A 4Z3MA 2BQMA 3N9AA 4G4HA 1G7IC 4GCCA 4H92A 4GCEA 2LZTA 5D5CA 1UC0A 5E4PA 1GE0A 1GFGA 2C8PA 4W96A 4ET8A 5L3HA 1GBSA 5LAFA 3LZTA 4PJ2C 1IP5A 4NHQA 5HMJA 1LZRA 2A7FA 1ALCA 4LYOA 5C6JA 193LA 5LYZA 4DDBA 3RU5A 4B4JA 4QEQA 1C10A 1LMQA 2BQLA 3FE0A 5B05A 2BPUA 1OUHA 1QDRA 4WM6A 4CFOA 4LYBA 4M4OA 3ATNA 1REYA 3J6KA 4HJVA 4DD3A 1CKFA 3P66A 5HLLA 3QNGA 3B0OA 1D6PA 1LHMA 2IHLA 3A6CY 5DN5A 1ZV5L 4LYCA 1GFAA 2MEDA 4TX7A 5APCA 1UIGA 2EPEA 4B49A 2DKVA 7LYZA 1LJ3A 1XFPL 4NHIA 1GF4A 1FKQA 1VFBC 1Z55A 3AGHA 4J0LA 1LSYA 5AMYA 4ZIXA 4G4CA 5KXLA 4PPOA 1IP2A 1HERA 5I53A 4XJBA 3ATOA 1GFJA 4LT1A 5LYTA 4O34A 3N9CA 4EOFA 1LSNA 1OUAA 2DQFC 4MSTA 5HNCA 1HFZA 2BQKA 4H91A 2ZYPA 4WO9A 5I4XA 5LVJA 5KXRA 2AUBA 3WYHA 1GEVA 1LJIA 1WQOA 4TSBA 4LYMA 4GN5C 4NGJA 1LZ5A 3LHMA 3W3EA 5I4WA 1XGRC 1IY3A 2I25L 1VEDA 3A96A 3QE8A 5FDJA 1IR9A 3ZVQB 1GF5A 1WQPA 4X3BA 2BQCA 1GB6A 3GXRA 2HEAA 4HSFA 1C45A 1GWDA 1T3PA 2DBTA 2ZYCA 1LJJA 3B0IA 4DC4A 5I54A 153LA 2LHMA 2WARA 4GCFA 5ILFA 2VB1A 1GFVA 4GCDA 3AJNA 3HFMY 1IR8A 4ANRA 3EMSA 1IY4A 1LZGA 4HV2A 1GXXA 1GF7A 1IWYA 5M1YA 1EQ4A 1LJFA 2D4KA 1JJ0A 4LT2A 4N0JA 4CJ2A 5LVIA 3AW6A 5B1FA 3F6ZA 1V7TA 5B59A 3AYQA 1LSGA 1RJCB 4KPMA 2LYOA 1NQIA 3P65A 4H9EA 4NHPA 3P68A 4EMNA 1GDXA 6LYTA 1IC5Y 3M3UA 2ZIJA 3A3RX 4R0FA 3WU7A 1J1OY 1AM7A 3TXKA 5HMVA 1LZEA 1UIBA 2LYMA 1IR7A 1EQ5A 4PGJB 4WM3A 4XENA 3RW8A 3WUMA 5KXMA 1G7JC 3A91A 1LZCA 1HELA 4NGVA 4NIJA 1JHLA 1KXWA 1VDTA 3G3BB 2CJLA 4H9FA 1O23A 1IC4Y 2MEFA 3SP3A 3WXUA 5KXXA 3LYMA 1LSBA 3EXDA 4QY9A 1B7QA 1IP1A 1LSEA 3A8ZA 1JKAA 1LMOA 1G7MC 1UIHA 3A92A 3WULA 1HENA 4YEMA 1LSMA 1FDLY 1GFKA 3EBAB 1GB9A 1IC7Y 1YROA 2EIZC 3AW7A 1RCMA 1F6RA 4WG1A 1OUBA 2H9KA 4NY5A 1QIOA 1HEOA 2XBSA 1WTNA 2BQNA 5LVHA 2D4JA 5LVGA 1NKHA 1ZMYL 1IP3A 3A90A 1CJ7A 3BKHA 3WL2A 1JSFA 3A6BY 3WPLA 4G49A 1P2CC 3CSZA 2YVBA 2BLXA 5F14A 4J1AA 4GN4A 1KIQC 2ZILA 6LYZA 5L3IA 1LPIA 2CGIA 2HU1A 2DQIY 4TWSA 4KL7A 4C3WA 3WW6A 4H9AA 3EO5A 4IATA 1GB8A 1XGPC 1B7RA 1B2KA 5LIOA 1IWXA 1GDWA 2DQGY 4LFPA 3FI7A 1LHHA 4XJHA 2N5ZA 2HUBA 1F0WA 1QUTA 1W6ZA 2MEIA 4B4EA 3TXGA 4DWXA 5KXKA 1TCYA 3TXHA 4ETCA 1YILA 5KXZA 4H93A 4HPEA 3WUNA 3ZVQA 1LJ4A 1GHLA 5FELA 2FBBA 2Z19A 2Z37A 4YOPA 4KT3A 4LZTA 4LYZA 5FSTA 4ZFPA 1LHLA 5LA5A 1RE2A 5F9UA 3W6BA 1LYZA 132LA 1D0MA 2HECA 3LYTA 1LJEA 2MEHA 2FYDA 1JTPL 1JKBA 3LYZA 4DD1A 3G3AB 2D6BA 1H6MA 1LZ9A 3WU9A 5HNLA 5C6LA 4PRQA 5F9XA 8LYZA 1LJNA 1JIYA 5KKIA 134LA 1HFYA 5DLAA 2Z2EA 2YBHA 1GD6A 4H8XA 1KXXA 1LZNA 2BQBA 2BQHA 2ZIKA 4NSJA 1A2YC 2I26L 1LZ1A 3IJVA 2IFFY 4NFVA 4ET9A 1WVVA 2H5ZA 4RW1A 1HEMA 1IEEA 4DD7A 4HPIA 1V7SA 1IP6A 1FLWA 1GE2A 1QDTA 3IJUA 3B72A 4I8SA 1B7OA 2LZ2A 3GXKA 5KKJA 2D91A 1GAYA 4OW1A 4ETBA 1JTOL 4B0DA 1C43A 3RZ4A 1UBZA 5FEKA 1CKGA 1IX0A 4KXIA 4N1CC 1TAYA 4NGKA 1TBYA 1BB6A 3P4ZA 4HJZA 1W08A 4UWNA 3ZEKA 1YQVY 2W1YA 2ZNXY 1LJKA 1CJ8A 1GBXA 3B0KA 2G4PA 4H94A 4UWVA 1LOZA 1IWUA 1LSZA 5ILCA 5LAGA 1XSFA 2CWIA 3LZ2A 4MR1A 2Y8PA 4N9RA 1FKVA 4ETEA 3HBDA 3A67Y 3B6LA 1RI8B 2F4AA 4N5RA 4R6CA 1QTEA 3WPJA 1KIRC 4WL6A 3AZ5A 1NDGC 3M18B 3D3DA 1DQJC 4U3XB 5DL9A 2HEBA 1N4FA 5B1GA 3AB6A 4GCBA 4P2EA 1GF6A 2C8OA 3TMVA 1G7LC 4WLDA 1LZDA 5LA8A 1GE1A 1IOTA 2GV0A 1OUEA 3CQLA 4H9IA 3CB7A 1TEWA 1PS5A 1QSAA 2XJWA 1BQLY 2YBNA 4OOOA 1OUIA 1REXA 4XJDA 1HNLA 4Z98A 4FJRA 3CT1A 3OK0A 1B5VA 1UA6Y 2BQDA 5HQ1A 5B07A 1NMMA 4XN6A 1VATA 1I20A 1LZAA 4WL7A 4WM1A 3TMWA 3HBHA 1BWIA 1JPOA 4HP0A 4L41A 3N9EA 4OWCA 5A3EA 4OWBA 4XJGA 2DQHY 1LMPA 5F81A 2EKSC 154LA 2BLYA 1CKCA 4HV1A 2MEBA 4TUNA 1EL1A 1LTMA 2HEEA 3A3QA 4BADA 1IO5A 3W6DA 4NWHA 3A93A 1GF3A 2I6ZA 4CHXA 1DKJA 1JUGA 1GB3A 4NGIA 2X0AA 1YKZX 1B5YA 1GF0A 1SQ2L 4NGZA 1JEFA 4YENA 1FN5A 208LA 1LYYA 1HEQA 1JISA 1VDPA 4LFXA 4BS7A 1IIZA 2MEGA 2F4GA 4WM4A 4GN3A 4FDYA 1A4VA 4G4BA 4HTNA 2XBRA 3E3DA 1HSXA 5E9RA 4MCKA 1B7SA 1GFEA 3AZ7A 4E3UA 1UCOA 4IJ4A 4NGOA 3HBEX 5KXNA 4NGLA 1CJ9A 1OP9B 1UIEA 2YBIA 2ZWBA 5F16A 4WO6A 4ETAA 4IASA 1HF4A 1F6SA 1DPXA 1JWRA 1GF9A 4NGWA 4YF2A 1NBZC 1WQNA 2FBDA 3TMUA 2YSSC 3D9AC 1FLYA 4PHIA 3LYOA 1BVXA 1HFXA 4Z46A 3IWRA 5APFA 3RNXA 2F30A 1QTKA 4LT3A 2DQDY 1BHZA 1DZBX 1I1ZA 3T6UA 1LZTA 4AXTA 4ZEEA 1B7PA 4BAFA 1LZYA 4G9SA 4DDCA 1BB4A 1IVMA 5EBHA 4Z41A 1GB5A 1IORA 5LXWA 1GAZA 1YAQA 1B5XA 3QY4A 1YL1X 5LYMA 1LHKA 2B5ZA 4CFPA 1LMCA 1E8LA 3RT5X 1LKSA 1GPQC 4DYGA 4H9CA 4QGZA 4DT3A 1D0LA 1IP4A 2W1MA 2XTHA 2H9JA 1GB7A 1BB3A 4OOTA 2BQOA 4B1AA 2MEAA 5IDDA 5A3ZA 1LKRA 5APDA 1XEKA 4C5FA 1LSCA 5LINA 3WXTA 1GBYA 4N8ZA 4H8YA 4WLYA 9LYZA 5KXWA 1BB5A 5KXPA 3MGWA 3J4GA 1QQYA 4NSIA 1XEIA 2Z12A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
130LA 1IOQA 177LA 1JITA 1QT3A 1LSPA 1PQIA 3DMXA 240LA 1OQMA 1QS5A 1IWWA 1YIKA 1B9OA 231LA 1C6BA 3OE6A 149LA 1KNIA 1C6PA 205LA 1CKDA 145LA 1GFHA 125LA 163LA 2G4QA 1LWGA 2W1LA 4AQNA 1CU2A 1L44A 1CV4A 5KY1A 197LA 3PDSA 5FCPA 3FA0A 4WG7A 1LYSA 4EKQA 2HTXA 3K2RA 4H8ZA 1LSAA 255LA 4PRUA 1HMKA 1MLCE 3BKVA 1LAAA 1LJGA 4HJYA 4J1BA 3CSRA 4N1EI 1QUSA 1L30A 1B7NA 1L02A 214LA 2A7DA 1AT6A 3WVYA 2BQGA 162LA 1C63A 1GBOA 2HU3A 1BGIA 1LGWA 4ETDA 5APEA 1D6QA 1IWTA 1L66A 102LA 3OE8A 2FYCA 2F2NA 1CX6A 1C46A 4I7RA 1KIPC 1P2LA 2DQAA 1LZ6A 2Z18A 1ZVHL 4NEBA 5KXYA 4B4IA 1IWVA 1DYGA 4LDLA 4D9ZA 4NG1A 1GB0A 1YKXX 1HC0A 1L52A 1SSWA 3PBLA 1BB7A 3HTDA 4TTDA 254LA 4GLAA 5T3FA 225LA 1HSWA 3WU8A 2RAYX 1J1XY 2HEDA 183LA 1GE3A 1GFRA 1LI3A 248LA 2ZQ3A 1PQJA 2B75A 120LA 1UIAA 2EQLA 4BAPA 1C6DA 1VAUA 2B7XA 3AGGG 1LZSA 1L12A 126LA 168LA 1WVUA 2OE4X 1DI5A 1IOSA 5B06A 3GUJA 1G7IC 4GCEA 1KY0A 1UC0A 1C6IA 1GBSA 1L49A 4NHQA 1ALCA 5C6JA 5LZMA 3RU5A 1L43A 1C10A 2BQLA 1QUDA 4M4OA 4CFOA 4LYBA 221LA 3SB5A 3HT8A 4DD3A 1DYAA 1CKFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1XGT C;  2HEF A;  5KXO A;  4GLV A;  1DXJ A;  1IOQ A;  4A7D A;  5FHW A;  5KXS A;  3WW5 A;  1MEL L;  3WPK A;  1JIT A;  1FBI X;  1VDQ A;  1AT5 A;  1LSP A;  1TDY A;  1AZF A;  2BQA A;  3ULR A;  1NWG A;  1WQM A;  1OQM A;  1GBW A;  4OWH A;  1IWW A;  1FLU A;  4AGA A;  4OWA A;  1LZ4 A;  1YIK A;  5KJ9 A;  1QSW A;  1B9O A;  1HHL A;  2YDG A;  1G7H C;  3AGI A;  5DM9 A;  3TXF A;  4M6D A;  3W6C A;  2ZQ4 A;  1CKD A;  2ZNW Y;  1GFH A;  1H87 A;  1NBY C;  1YKY X;  1B0D A;  1LSF A;  1B5Z A;  3WUA A;  2BQJ A;  1AKI A;  3CT5 A;  1JTT L;  2G4Q A;  1IOC A;  1B5W A;  1GE4 A;  1YAO A;  2W1L A;  1LHJ A;  1GXV 2;  207L A;  4WM2 A;  1LSD A;  4XJF A;  1OUC A;  1I56 A;  4H1P A;  4NG8 A;  1DI3 A;  1JJ1 A;  5KY1 A;  1B5U A;  4XAD A;  5FCP A;  4WG7 A;  1LYS A;  1HML A;  1C7P A;  2DQE Y;  3AZ4 A;  3CSQ A;  1B7L A;  2Q0M X;  2HTX A;  4WM5 A;  1LZB A;  4I0C A;  135L A;  3AZ6 A;  1LMA A;  4H8Z A;  5J7C A;  1OUF A;  1LSA A;  1RFP A;  4RLM A;  5I4Y A;  4H9B A;  2DQC Y;  3W6F A;  4PRU A;  2D4I A;  2MEC A;  4XYY A;  1HMK A;  1MLC E; 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 1GB3 A;  4NGI A;  2X0A A;  1YKZ X;  1B5Y A;  1GF0 A;  1SQ2 L;  4NGZ A;  1JEF A;  4YEN A;  1FN5 A;  208L A;  1LYY A;  1HEQ A;  1JIS A;  1VDP A;  4LFX A;  4BS7 A;  1IIZ A;  2MEG A;  2F4G A;  4WM4 A;  4GN3 A;  4FDY A;  1A4V A;  4G4B A;  4HTN A;  2XBR A;  3E3D A;  1HSX A;  5E9R A;  4MCK A;  1B7S A;  1GFE A;  3AZ7 A;  4E3U A;  1UCO A;  4IJ4 A;  4NGO A;  3HBE X;  5KXN A;  4NGL A;  1CJ9 A;  1OP9 B;  1UIE A;  2YBI A;  2ZWB A;  5F16 A;  4WO6 A;  4ETA A;  4IAS A;  1HF4 A;  1F6S A;  1DPX A;  1JWR A;  1GF9 A;  4NGW A;  4YF2 A;  1NBZ C;  1WQN A;  2FBD A;  3TMU A;  2YSS C;  3D9A C;  1FLY A;  4PHI A;  3LYO A;  1BVX A;  1HFX A;  4Z46 A;  3IWR A;  5APF A;  3RNX A;  2F30 A;  1QTK A;  4LT3 A;  2DQD Y;  1BHZ A;  1DZB X;  1I1Z A;  3T6U A;  1LZT A;  4AXT A;  4ZEE A;  1B7P A;  4BAF A;  1LZY A;  4G9S A;  4DDC A;  1BB4 A;  1IVM A;  5EBH A;  4Z41 A;  1GB5 A;  1IOR A;  5LXW A;  1GAZ A;  1YAQ A;  1B5X A;  3QY4 A;  1YL1 X;  5LYM A;  1LHK A;  2B5Z A;  4CFP A;  1LMC A;  1E8L A;  3RT5 X;  1LKS A;  1GPQ C;  4DYG A;  4H9C A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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