4DD2A

Eval processed hewl, carboplatin aqueous glycerol
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd2A00
2HEDA 4DC4A 1KIRC 4TSCA 5L9JA 2X0AA 1JITA 1NF5A 5DN5A 1IP6A 4HJVA 3HBHA 1B5UA 1VDSA 3MGWA 4UWUA 1XGTC 4H9CA 1UIDA 4WM6A 3CSRA 1LHIA 1LJFA 1C08C 2F4AA 3WUMA 4NHIA 1GE0A 4NG8A 4ETBA 1NBZC 2YVBA 5I54A 2DQIY 1B9OA 3WXTA 5KXTA 1I1ZA 3QE8A 2FBBA 1AT6A 5APFA 4XADA 1LZ6A 1LHJA 4OWHA 2W1LA 1VFBC 3AW6A 4BADA 3WXUA 1UIBA 3CT0A 5F16A 4LYBA 1GB9A 5KXNA 4H9IA 4HP0A 1DI5A 1GB2A 2C8PA 1PS5A 4PGJB 2D6BA 2DQGY 5KJ9A 4ET9A 1IR7A 1BWHA 1HEPA 1A4VA 5LAFA 4DT3A 1HF4A 4ETCA 3TMVA 1AKIA 2FYDA 5KXSA 3EXDA 1FLQA 1XGQC 5LA5A 1NDMC 2Z19A 2HUBA 3W6EA 4TX7A 4C5FA 4CGEA 5M1YA 1B5VA 1IP3A 4HPEA 2HEBA 1DPXA 1Z55A 1GFGA 1BGIA 1UA6Y 2Z39A 2D4JA 2LYOA 4EOFA 4MSTA 1FKVA 5LIOA 5B05A 4IATA 1LSBA 1LZGA 1C10A 4W96A 4XJGA 1W6ZA 4TWSA 3WMKA 4HV2A 1RE2A 5LVHA 2HTXA 1GD6A 1C45A 2CWIA 4DD7A 5LXWA 3TXGA 1G7MC 1HMKA 3RZ4A 1CJ9A 2H9JA 3M18B 1IC4Y 4X3BA 1LZAA 1IP4A 1IWVA 1LHHA 3QY4A 1LJHA 5LYZA 1JJ3A 2NWDX 1FDLY 1G7HC 4NGYA 4NGWA 5C6LA 4E3UA 3ZVQB 5A3ZA 3CSQA 1NWGA 5HMVA 1GFEA 4N1CC 4GN4A 1UIHA 5B06A 1YAPA 4ETEA 4PPOA 3AZ5A 1HEOA 2H5ZA 4XYYA 3RU5A 1LKRA 1BB4A 3ATNA 4GLVA 5FELA 7LYZA 2BQGA 2BQOA 3ULRA 4G9SA 3M3UA 2RSCA 1XEIA 1ZV5L 2BQJA 5DL9A 2BQKA 1IOCA 1LPIA 1V7SA 2DQFC 1NMMA 5D5FA 1QQYA 2A7DA 1NHEA 3B72A 1XGPC 4O34A 1B7LA 1LMNA 1O23A 1UACY 3RW8A 2MECA 5KXXA 1NQIA 1LSGA 1YL0X 2YBHA 1QDRA 3LZTA 2D4IA 1IOTA 1D0LA 4H93A 4B4IA 1GBWA 5IELA 4DD3A 1JKDA 4NGIA 2BQAA 1P2CC 1BQLY 5L3IA 1MLCE 2Z38A 1BVKC 1WQNA 1KXXA 2XTHA 1GE1A 1LHMA 1LZTA 5I53A 1IC7Y 4CFOA 2IHLA 3WPKA 3A91A 1EL1A 3P64A 3AZ7A 1CJ6A 1G7LC 1LYYA 2BLYA 3B0IA 3WW5A 1AT5A 1BB5A 1OUDA 1HFXA 1CKDA 1RJCB 3KAMA 1DI4A 1C7PA 1D6PA 3A96A 3A8ZA 3HBDA 4A7DA 1I56A 2YBJA 4OOOA 1HERA 1HC0A 1YAQA 4H94A 1UIFA 4XJIA 5AMYA 5IHGA 4HTQA 1WVVA 4NGVA 4RDSA 3B6LA 4XN6A 3WPJA 4H9EA 2Z12A 2DQCY 2GV0A 3P66A 1HEWA 1LMPA 1V7TA 4I8SA 3N9CA 2D91A 1KXYA 3AYQA 1IY4A 1LMQA 1LZBA 1HENA 1F10A 1GBYA 1JWRA 3HFMY 4QDNA 4WO9A 2LHMA 4BAPA 3TMUA 4KPMA 4OWBA 4R0FA 1H6MA 1UIEA 3CT1A 4RW2A 1IWTA 5F81A 1DXJA 4LT0A 4WG1A 5FDJA 1OUBA 1VDPA 1TBYA 4YM8A 4N1EI 4DDBA 1GBZA 3A90A 3CQLA 4H9AA 4M6DA 5I4WA 4DYGA 1LZ4A 4ZIXA 4H9HA 1IOSA 4LFXA 2MEAA 3E3DA 1TAYA 1G7IC 1GF4A 4WLXA 5C6JA 1XSFA 1YILA 1DI3A 4N5RA 2YBNA 1IC5Y 4LYOA 1B7OA 1GXXA 1IR9A 4GCFA 3WVXA 4NY5A 2PC2A 1GFVA 3A3RX 4H92A 3WU9A 3IWRA 4ETDA 1FLWA 2G4NA 1UIAA 1GB8A 1GAYA 3EMSA 1HELA 4WLYA 1NBYC 1OUGA 5B07A 5C6IA 1IOQA 4NIJA 2DKVA 3WU8A 3TXHA 4B0DA 4HSFA 2A7FA 1DKJA 2ZIJA 1IP7A 4J0LA 5LA8A 4DD1A 6LYTA 4II8A 3W6AA 4NSHA 4TUNA 3FI7A 3W6DA 1VEDA 2HU1A 4FDYA 4WOAA 1JISA 135LA 5ILCA 1YKXX 4D9ZA 3IJUA 1BB3A 1JPOA 1OUJA 1FLYA 5KXYA 4CFPA 1BWIA 4HPIA 1EQ5A 1LHKA 4FJRA 4HJZA 5HQ1A 1B7MA 4OWAA 5I5QA 3A6CY 4CHXA 2MEBA 2YSSC 4KL7A 1LSNA 3F6ZA 5B59A 1GPQC 1JKAA 1HSXA 1TCYA 4LYTA 2G4QA 1HFZA 1OUHA 1REXA 2MEIA 1F6RA 1XEKA 4HTNA 4UWNA 1IWZA 1B5XA 5B1GA 1LMCA 1UBZA 3LYTA 4UWVA 2ZWBA 3A93A 4EMNA 4DD9A 1GFHA 2Q0MX 4LGKA 3TXKA 1XEJA 2ZQ4A 4WG7A 2DQDY 1TEWA 4NGJA 1GFKA 2YDGA 4J7VA 1LZDA 4HJYA 3W6BA 3W6CA 3P68A 1HHLA 1OUCA 2FYCA 2ZIKA 1JKCA 4WLDA 5II3A 5KXKA 4IJ4A 1B0DA 4L41A 4LYMA 1GF3A 3P65A 2HEAA 1GWDA 1VDQA 4XJHA 1LTMA 1T3PA 2DQHY 1LZ9A 1TDYA 3TXEA 5KXWA 1B5WA 1LJ3A 1LAAA 4H90A 4YF2A 4ZFPA 3EBAB 5F9XA 3AB6A 5E9RA 3N9AA 4G49A 1DPWA 1LJKA 4KXIA 5ILFA 1GXV2 1EQ4A 4B4EA 4RW1A 5LYTA 1HEQA 4NGLA 1OUIA 2VB1A 4N0JA 2I25L 1FBIX 1XGRC 5J7CA 1CKFA 4NSGA 1GEZA 1LZ1A 4H91A 4LT1A 4AXTA 1AM7A 4WO6A 4KT3A 4NGKA 1LHLA 3HBEX 3P4ZA 1BB7A 3A92A 4PRUA 1QTKA 1GE4A 4W94A 1RCMA 5A3EA 5HNLA 4GCCA 1LSCA 1LYSA 2XBSA 1INUA 5APDA 1UCOA 4LT3A 1LZNA 1QTEA 2IFFY 2ZNWY 4ML7A 5JENB 133LA 4GN5C 1GF8A 4LZTA 4N9RA 4WL6A 4DDAA 2C8OA 4LYCA 4NSIA 1LZSA 3A6BY 4RLMA 1B7QA 1VDTA 3OK0A 2N5ZA 4WM2A 2G4PA 2W1MA 4NHPA 1LSMA 3LYMA 1F6SA 3OJPA 4NEBA 1OUEA 3B0KA 1IEEA 1SQ2L 3TXJA 2W1XA 3WL2A 1LJ4A 4DWXA 1J1PY 5KKIA 1JEFA 4G4BA 3SP3A 1IWXA 1IO5A 1GB5A 4NHQA 4WM5A 3ZEKA 5LAGA 4H8XA 1LSYA 2HECA 5EBHA 5HMJA 3TXFA 154LA 2BQIA 3CT5A 194LA 2BQMA 2HEFA 3WPLA 1QUSA 1IWUA 2Z2EA 4C3WA 1YIKA 3GXRA 1XGUC 1CKCA 3A34A 4NHSA 1QUTA 1XFPL 4GLAA 4OW1A 1LJIA 4RLNA 2MEHA 5KXLA 4I0CA 5KXRA 1GFJA 4WL7A 4DD0A 1GEVA 1WQPA 3LZ2A 1I20A 5LVGA 3AGGG 2BAAA 3FE0A 3J6KA 4J1AA 1LJNA 1LYZA 4Z41A 4G4HA 3BKVA 2EQLA 4WM3A 1JTPL 1JHLA 3AW7A 1D9UA 1HSWA 5FHWA 4LT2A 5KY1A 1B7SA 2LZTA 4CJ2A 4U3XB 4NSJA 3TMXA 1EQEA 3WW6A 4LYZA 1AZFA 1DZBX 2Y8PA 1J1OY 1WVUA 2D4KA 4HTKA 4QEQA 1WQQA 3J4GA 4PRQA 4P2EA 2DQEY 1LZCA 1GF9A 1GBSA 1GB6A 1WTNA 4LFPA 1T6VL 2MEEA 5DM9A 3QNGA 1UICA 1IP2A 1JJ0A 1GFUA 1IY3A 1ZMYL 1OUFA 1GHLA 1LYOA 1QDTA 2BQBA 3W6FA 4NWHA 1LCNA 1GAZA 3AJNA 1GF7A 1LZRA 1BWJA 2LYZA 1J1XY 2ZQ3A 4OWEA 1YAOA 1IWYA 2EIZC 5APEA 5LVJA 1IX0A 4OOTA 3LYZA 1FKQA 3A67Y 1NKHA 1H87A 1QIOA 2F4GA 1JSEA 1BVXA 5K7OA 1KXWA 1LZEA 1GFTA 208LA 4R6CA 4ZEEA 1LMOA 5F9UA 1IR8A 3AGIA 2BQHA 193LA 4Z3MA 5IDDA 1B2KA 1D0KA 4NG1A 3TMWA 4YEOA 3T6UA 2BLXA 3AZ6A 1JTTL 4B4JA 4DDCA 1N4FA 2ZYPA 8LYZA 3G3AB 3WH1A 1GB7A 1GE3A 1HNLA 2Z18A 4YOPA 3TXBA 4B1AA 2XJWA 5FSTA 2DQJY 4Z98A 1ALCA 3D9AC 1D0MA 2YBMA 2LYMA 4ANRA 1D6QA 2BQDA 1YKYX 1YQVY 1HFYA 4NGOA 5FEKA 1BB6A 1C43A 1FN5A 2LZ2A 4GN3A 3GXKA 1WQMA 5LVIA 1CJ7A 1YL1X 3BKHA 3CSZA 4NHTA 3WU7A 4PHIA 4H9BA 1F0WA 1GB3A 1UUZC 2HU3A 4HV1A 1LSDA 1B7RA 2YBLA 4GCBA 1LJGA 5D5CA 1E8LA 2MEDA 1OQMA 1REMA 3A3QA 2ZILA 5KXZA 2I6ZA 4MR1A 1WTMA 1QSWA 4YEMA 5I4YA 1IP5A 1CKGA 1HMLA 1KIPC 5FCPA 3TXIA 5B1FA 5E4PA 3LYOA 4NWEA 2F30A 2F2NA 1DKKA 2ZYCA 1VAUA 4H8ZA 3TXDA 3A94A 5F14A 2EKSC 1PZYA 3AGHA 4G4CA 9LYZA 2BQEA 3WVYA 1W08A 1MELL 2BQCA 2CDSA 2W1YA 3A95A 3W3EA 4XJBA 5L3HA 1RFPA 2DQAA 1LSZA 5KXOA 1B7PA 4NGZA 1G7JC 4B49A 2MEGA 4MCKA 1CJ8A 1LSPA 1LMAA 1OUAA 1WQOA 4H1PA 3K3TA 4XENA 3B0OA 4QGZA 3RNXA 5KXMA 4DD2A 3RT5X 4N8ZA 5DLAA 2I26L 4OWCA 4Z46A 1UIGA 2ZNXY 1IVMA 3T36A 1KIQC 1B7NA 1JKBA 5T3FA 4NFVA 3WUNA 1LZ5A 1OP9B 1IIZA 1GDWA 1VATA 2DBTA 4M4OA 1HEMA 3LHMA 3N9EA 1LZYA 1LOZA 2AUBA 2BPUA 4WLTA 1RI8B 4WM4A 1GE2A 3VWOA 2BQNA 1GDXA 1C46A 2MEFA 3EO5A 3LN2A 3IJVA 5I4XA 1JUGA 4XJDA 1CNSA 1JSFA 3WULA 1YAMA 132LA 3CB7A 1LJEA 1QSAA 1LKSA 2XBRA 2Z2FA 1GF5A 3WUAA 5HNCA 4WMGA 5HLLA 1BHZA 1LZ8A 3ATOA 1GF0A 2WARA 3G3BB 1IWWA 2CJLA 4J1BA 5LVKA 4GCDA 4WM1A 4PJ2C 1LSFA 1JJ1A 4ETAA 1YKZX 1REZA 3WYHA 1WQRA 4ET8A 134LA 1B5YA 1UC0A 1YROA 4BAFA 1LMTA 1GBOA 4GCEA 4YENA 2CGIA 5KKJA 1JTOL 1LJJA 2H9KA 1YANA 2Z37A 5LYMA 153LA 2HEEA 3ZVQA 1GFAA 1LSAA 1A2YC 4H9FA 4QY9A 1B5ZA 5DN4A 1ZVHL 207LA 2FBDA 5KXPA 4TTDA 1CKHA 4XJFA 2BQFA 1FLUA 2BQLA 3D3DA 5LINA 5APCA 4H8YA 1ZVYB 2YBIA 1DQJC 4IASA 1JIYA 1LSEA 4TSBA 4AGAA 6LYZA 1GF6A 1SLYA 1NDGC 1REYA 1IP1A 1GBXA 2EPEA 1IORA 2B5ZA 3AZ4A 1GB0A 4BS7A 1GFRA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
239LA 2X0AA 1JITA 1QT3A 3HBHA 1B5UA 1L66A 4UWUA 3DNAA 3CSRA 4I7MA 1GE0A 2DQIY 211LA 3WXTA 120LA 5KXTA 1I1ZA 1C6TA 4I7RA 188LA 4OWHA 2Z6BA 4BADA 1L62A 3WXUA 1UIBA 5KXNA 5KJ9A 130LA 4DT3A 1G0GA 4ETCA 4EKRA 1FLQA 1XGQC 1NDMC 2Z19A 3W6EA 125LA 1T6HA 4CGEA 1DPXA 1BGIA 4MSTA 3HTDA 1LZGA 2XQOA 1C10A 4W96A 1L31A 4TWSA 4HV2A 1RE2A 2B6XA 5LXWA 1G7MC 205LA 1LZAA 1IWVA 2HUMA 2B6YA 5LYZA 3HH6A 171LA 1FDLY 4E3UA 5A3ZA 1L89A 5HMVA 1GFEA 4GN4A 5B06A 3RU5A 5FELA 4GLVA 3FA0A 250LA 4G9SA 2RSCA 1IOCA 2DQFC 2A7DA 4O34A 2L78A 1B7LA 1LMNA 1O23A 1C6DA 1UACY 3RW8A 2YBHA 1YL0X 2D4IA 1D0LA 1CVKA 4ARMA 1JKDA 4NGIA 1L49A 166LA 1KW5A 5L3IA 4W52A 1BVKC 2XTHA 1GE1A 1LHMA 1LZTA 3SB6A 5I53A 1IC7Y 3WPKA 1CJ6A 1T8AA 1AT5A 196LA 1HFXA 1C6CA 1RJCB 3KAMA 1D6PA 4OOOA 1HERA 4H94A 4HTQA 4ARQB 3WPJA 2DQCY 2GV0A 3N9CA 1KXYA 3AYQA 1IY4A 1LZBA 1L06A 2NTGA 4KPMA 1H6MA 3CT1A 1IWTA 256LA 237LA 4DDBA 1L70A 1C65A 4H9AA 4H9HA 4LFXA 2MEAA 5C6JA 1C6HA 4GRVA 139LA 4NY5A 2RBRA 1G07A 1GAYA 3EMSA 1IOQA 2F32A 4DD1A 1TLAA 4TUNA 4S0WA 2HU1A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2HED A;  4DC4 A;  1KIR C;  4TSC A;  5L9J A;  2X0A A;  1JIT A;  1NF5 A;  5DN5 A;  1IP6 A;  4HJV A;  3HBH A;  1B5U A;  1VDS A;  3MGW A;  4UWU A;  1XGT C;  4H9C A;  1UID A;  4WM6 A;  3CSR A;  1LHI A;  1LJF A;  1C08 C;  2F4A A;  3WUM A;  4NHI A;  1GE0 A;  4NG8 A;  4ETB A;  1NBZ C;  2YVB A;  5I54 A;  2DQI Y;  1B9O A;  3WXT A;  5KXT A;  1I1Z A;  3QE8 A;  2FBB A;  1AT6 A;  5APF A;  4XAD A;  1LZ6 A;  1LHJ A;  4OWH A;  2W1L A;  1VFB C;  3AW6 A;  4BAD A;  3WXU A;  1UIB A;  3CT0 A;  5F16 A;  4LYB A;  1GB9 A;  5KXN A;  4H9I A;  4HP0 A;  1DI5 A;  1GB2 A;  2C8P A;  1PS5 A;  4PGJ B;  2D6B A;  2DQG Y;  5KJ9 A;  4ET9 A;  1IR7 A;  1BWH A;  1HEP A;  1A4V A;  5LAF A;  4DT3 A;  1HF4 A;  4ETC A;  3TMV A;  1AKI A;  2FYD A;  5KXS A;  3EXD A;  1FLQ A;  1XGQ C;  5LA5 A;  1NDM C;  2Z19 A;  2HUB A;  3W6E A;  4TX7 A;  4C5F A;  4CGE A;  5M1Y A;  1B5V A;  1IP3 A;  4HPE A;  2HEB A;  1DPX A;  1Z55 A;  1GFG A;  1BGI A;  1UA6 Y;  2Z39 A;  2D4J A;  2LYO A;  4EOF A;  4MST A;  1FKV A;  5LIO A;  5B05 A;  4IAT A;  1LSB A;  1LZG A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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