4DD3A

Eval processed hewl, carboplatin aqueous paratone
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd3A00
1F6SA 4GCEA 1EQEA 4X3BA 1GB8A 3LZTA 1XGRC 3G3AB 1KIRC 1XSFA 2G4NA 1GBOA 3J6KA 2DQAA 3WUMA 2AUBA 2HECA 4BAPA 5KXLA 1FN5A 1YAMA 1V7SA 3A3RX 4HPEA 154LA 2MEDA 3TXDA 1JTTL 1REYA 5KXTA 1JITA 1LZGA 2Z37A 1VAUA 1LZ1A 1WQQA 2XBSA 1IY4A 4R6CA 1G7JC 1JISA 4NHSA 3W6EA 4NFVA 1LSGA 1QUSA 4OWCA 1NBZC 1C7PA 2G4PA 3ATNA 2IHLA 2W1LA 3A94A 4XYYA 5I54A 3TMUA 5KXOA 4NGIA 5JENB 3D3DA 3WU7A 1V7TA 2B5ZA 1B7MA 4WLTA 1GF3A 5DN5A 1D9UA 1HERA 5L3HA 5LIOA 1BQLY 3W6FA 1GF8A 1IIZA 5IHGA 3CSRA 4W94A 5A3ZA 1LSNA 1J1XY 3OK0A 4A7DA 2ZILA 1BB5A 3A92A 3GXKA 4YEMA 4DC4A 3B72A 3HBDA 1LZTA 1WQOA 1GB5A 1BB6A 3AYQA 4GN3A 153LA 5KXMA 1GBYA 1CJ6A 1B5VA 1GE4A 4DD3A 1QTKA 4N9RA 4YENA 3LYOA 1GFHA 3WL2A 2Z38A 4WM3A 3LN2A 2MEEA 1ZMYL 3P65A 5LVKA 5II3A 1LZ4A 3WW5A 1WQMA 2Z2EA 4NG1A 1BB3A 4NGWA 3AB6A 5D5FA 4LGKA 3N9CA 4KXIA 1LJHA 5KXSA 4ETAA 4NWEA 3M18B 4LT3A 1EQ4A 1CKFA 2HEDA 3E3DA 5DN4A 1GE1A 1LMOA 4CHXA 1HF4A 3B6LA 5FDJA 2XJWA 1G7LC 1QSWA 4PPOA 2DQIY 1B5XA 2Z18A 5HQ1A 4PGJB 2BQDA 4NY5A 1JSFA 4Z46A 1LSEA 2G4QA 3WPKA 3AZ4A 2Z39A 1B0DA 1B7SA 3GXRA 1RCMA 1KXXA 4LZTA 1BVXA 1JJ0A 3WUNA 4XJGA 1WTMA 4H1PA 5I4YA 3LZ2A 1REZA 1LSBA 1LSZA 1NDMC 3A90A 1T6VL 1CJ9A 1GFVA 1CJ7A 2Z2FA 1HEWA 1LMAA 4HP0A 1WQRA 9LYZA 1OUHA 1GEVA 1DZBX 1JJ1A 2EQLA 4CFPA 1LSPA 4HJZA 1UBZA 4PHIA 1N4FA 5KXXA 1FLQA 1NWGA 1DPXA 1RE2A 1XEKA 1OUDA 1LJEA 2LYOA 4QEQA 1JKBA 2BQGA 3HBEX 4UWNA 4UWUA 1LZNA 1LJNA 3EXDA 3TXBA 5LA5A 2ZIKA 1JKDA 3A91A 5B05A 4M4OA 5LXWA 1YKXX 2F4AA 3CSZA 4RW1A 1GD6A 2FBBA 2BQLA 2BQOA 1LMCA 4L41A 1YIKA 1KIPC 2CJLA 4ETCA 3ZVQA 1EL1A 1VEDA 2FBDA 3BKHA 4H9CA 1GE0A 2BQKA 3A6CY 4DDAA 5LVHA 3WVYA 4O34A 1FKQA 1IOSA 3RNXA 1LSCA 3RT5X 1A4VA 4GCCA 1REMA 4DD7A 1CKGA 1ZVYB 1TAYA 4XN6A 3WPLA 2YBJA 1VDSA 3WXUA 1OUCA 2CGIA 3A95A 4M6DA 1F0WA 6LYZA 3IWRA 3AGIA 3TMWA 1VFBC 1KXWA 4XJFA 2BQEA 1JKCA 4NIJA 1GXV2 5DLAA 3TXKA 4WM5A 1XGTC 3CB7A 3FI7A 1LKRA 4LYZA 1AKIA 4FJRA 5F81A 4B4IA 1YANA 5LYZA 4NHQA 2XTHA 5D5CA 4HSFA 4PRUA 1GE3A 2A7DA 3SP3A 4NEBA 2HTXA 1YAPA 1LZBA 1BWHA 2YVBA 1HFXA 1XEJA 5K7OA 2CDSA 2YSSC 1B7OA 3HFMY 1B7PA 2BQFA 2MEFA 1ZV5L 2MECA 4DT3A 1BVKC 1LMQA 4NGJA 4RW2A 5LAGA 2HEBA 1LJGA 1LZ6A 4J1BA 1LTMA 1LHIA 1TDYA 4ZFPA 1CKHA 3CSQA 4ANRA 5DM9A 5FHWA 1RFPA 3CT5A 1XGQC 1GB7A 1GBSA 4DYGA 2LZTA 2LYMA 2LZ2A 2ZYCA 1GBWA 2DQHY 4NHPA 3TXJA 4ZEEA 1IVMA 1IWVA 2H9JA 3WU8A 5C6IA 1REXA 4NGYA 5B1FA 2H5ZA 2NWDX 1HELA 1IR8A 4GLAA 5B59A 3QE8A 4QGZA 1WTNA 3T36A 2D4JA 2HU3A 1GFAA 4I8SA 2W1MA 5B07A 5KXKA 4LYCA 4LT1A 1PS5A 2MEAA 3AZ5A 1IR9A 4H91A 4HTKA 4N0JA 1LOZA 2HU1A 4YF2A 1YL1X 4GCBA 1JSEA 4OWEA 5I53A 1VDQA 134LA 1JWRA 3RW8A 5B06A 2W1XA 4B0DA 2MEBA 1B7NA 2BLYA 5LAFA 3W6AA 1IOQA 4WLXA 5C6JA 4CJ2A 4GN4A 4ZIXA 4ETEA 4E3UA 1JUGA 4WMGA 1UIBA 5F9XA 4WO9A 4LT2A 1OUBA 4IJ4A 1C10A 1XFPL 1IR7A 1UACY 4MR1A 1TEWA 3W3EA 5KKJA 2BPUA 1LMNA 2ZYPA 4G9SA 4TTDA 2YDGA 1DXJA 1HFZA 3B0OA 1MLCE 3WMKA 1D0MA 1FLWA 1FKVA 3ULRA 4Z41A 1MELL 2HEAA 1WVVA 2Z12A 5KJ9A 1OQMA 1D0LA 2LYZA 2PC2A 1OUGA 1GPQC 1NQIA 1SQ2L 3IJVA 4N8ZA 2A7FA 1VDPA 4NG8A 5FSTA 1YKYX 4NSGA 1BWIA 1GB2A 1UUZC 1IWXA 1HEOA 4LFPA 2YBHA 3WUAA 2RSCA 4H8ZA 1LJKA 2DQFC 5T3FA 1NF5A 4H93A 1LZ5A 4BS7A 4WM1A 1LYYA 4N1EI 4DDBA 4ET9A 1C43A 1FLYA 2BQHA 1JIYA 1IP3A 4WO6A 1OP9B 1XEIA 5FELA 1GBXA 1UIGA 4WLYA 1LYZA 1BHZA 3N9AA 1IC7Y 1W6ZA 4ET8A 1LHMA 2YBIA 1F6RA 1HMKA 4H8YA 1GFRA 2F2NA 2F30A 4WL6A 4DD1A 1YILA 1UIHA 3WU9A 1H6MA 5F14A 4KPMA 2I6ZA 4H94A 1OUIA 2Y8PA 1D6PA 5LVJA 1LZ9A 208LA 5LINA 2DKVA 4OW1A 1JPOA 1HHLA 4G4HA 4B4EA 1GB3A 4D9ZA 1UC0A 1IORA 3AW7A 3G3BB 1HSXA 3RU5A 5ILFA 1TCYA 3W6DA 4H9AA 3J4GA 2BQIA 4YOPA 2YBMA 3FE0A 1A2YC 3IJUA 1AZFA 5EBHA 4Z3MA 2ZQ4A 4B1AA 132LA 4N1CC 5KXYA 4YM8A 1LJJA 1GF4A 3TXGA 5LYTA 1BWJA 1YROA 3A67Y 4WG1A 4HTNA 1LZ8A 1T3PA 3WYHA 1E8LA 1IP5A 5KXPA 1DKKA 1GFGA 3RZ4A 1WVUA 4WM6A 1BB7A 1IOCA 2X0AA 1UICA 3AW6A 3VWOA 4MSTA 3AJNA 4H9BA 2HUBA 2BQNA 4XENA 2VB1A 5KY1A 1IP1A 5KKIA 2GV0A 3AGGG 1NMMA 3QNGA 1Z55A 4NGLA 1LMPA 2LHMA 1C46A 1IC5Y 4DD9A 1D0KA 4HV2A 4TSCA 3A34A 2BAAA 4KL7A 3WVXA 1CNSA 5I4WA 1UIAA 1B2KA 2WARA 1LMTA 3EBAB 4J1AA 5F16A 1G7IC 4EMNA 1GFKA 2I25L 3A96A 1IO5A 1F10A 2D4KA 3AZ7A 193LA 1AT5A 1GF7A 2IFFY 1GAYA 2ZNWY 1LYOA 5HMJA 3T6UA 194LA 1HFYA 2Q0MX 5AMYA 1B5YA 5IELA 1GFEA 1DPWA 2DQEY 1LHHA 4OWBA 1GHLA 3CT0A 2ZNXY 4NSIA 5APEA 3WULA 1BGIA 1DI4A 1GWDA 1LJFA 1JKAA 1IWWA 4U3XB 4CFOA 3A93A 1INUA 1OUEA 4OOTA 1RJCB 5LYMA 5E9RA 4I0CA 3M3UA 4H9FA 4II8A 3TMVA 1GXXA 5HNLA 8LYZA 4GCDA 4G4CA 1LZEA 3TMXA 2FYCA 1ALCA 1XGPC 4J7VA 4PRQA 4QDNA 1GEZA 4XJBA 4H9HA 2FYDA 1FLUA 1GB0A 3EMSA 4NHIA 1IP2A 4WLDA 4WM2A 3LYTA 1GFTA 4HJYA 4XJDA 3LYMA 5DL9A 5FEKA 2ZQ3A 2BQMA 3A3QA 5HLLA 4NSJA 1JEFA 1CKCA 4NHTA 4B4JA 2BQBA 1I1ZA 3ATOA 2EPEA 1HEPA 1QSAA 4TSBA 1UCOA 2C8PA 3CQLA 1QDTA 2Z19A 4P2EA 2F4GA 4H8XA 1GFJA 4TUNA 4AGAA 1NKHA 1B5UA 1HMLA 3MGWA 4TX7A 1QDRA 4H9IA 1UIFA 1B9OA 1GDXA 4WOAA 3TXHA 3W6CA 5FCPA 1YAOA 2MEIA 1ZVHL 1LAAA 1LJ3A 4YEOA 1JJ3A 1LZSA 4W96A 1JHLA 4XADA 4EOFA 4QY9A 5I5QA 1I56A 1G7HC 4LFXA 1HEMA 4BADA 4WM4A 1TBYA 1FDLY 1NDGC 4DWXA 1QIOA 4HPIA 4IATA 5I4XA 2CWIA 1OUAA 4GLVA 1B5WA 2XBRA 1GF6A 3W6BA 5J7CA 4BAFA 4NWHA 7LYZA 2C8OA 4N5RA 5M1YA 4NSHA 2BQJA 1JTPL 1IWYA 1J1OY 4GN5C 4PJ2C 4MCKA 4OWAA 2MEGA 3LHMA 1LYSA 4LYOA 1VATA 4IASA 5LVIA 4J0LA 4G49A 1B7QA 1GF9A 1IP7A 2D91A 5A3EA 5ILCA 4FDYA 4NGKA 1KXYA 1XGUC 4XJHA 1CKDA 3WXTA 1C45A 4HJVA 1B7RA 3P66A 1QTEA 4DD2A 1B7LA 2EIZC 2BQCA 3AGHA 4ETBA 3B0IA 4DD0A 1IX0A 1IEEA 4LT0A 1W08A 5B1GA 4C5FA 4CGEA 4XJIA 4C3WA 1DQJC 1IWUA 1LSAA 1LSDA 2H9KA 3EO5A 5APFA 5HMVA 4NGZA 2DQDY 5L3IA 4ML7A 1LPIA 1YQVY 1C08C 1LSFA 1NBYC 2DBTA 2HEEA 2YBLA 3N9EA 1HC0A 3KAMA 1IP4A 5F9UA 3P64A 1HSWA 3A6BY 1LZYA 1DKJA 1I20A 3WH1A 4H9EA 1LKSA 2N5ZA 4LYTA 135LA 1AT6A 1IWTA 1GF0A 3ZVQB 5KXRA 3TXEA 1DI3A 1LHKA 3QY4A 1UIDA 1LHJA 2ZIJA 1H87A 3WPJA 5APDA 2I26L 2BQAA 1QQYA 1GDWA 3OJPA 4RDSA 5APCA 5IDDA 1AM7A 1VDTA 1WQPA 3LYZA 4ETDA 1PZYA 1YKZX 133LA 1LZRA 1QUTA 2D6BA 1LZAA 2HEFA 3F6ZA 1HNLA 1LHLA 4GCFA 2EKSC 1O23A 3B0KA 4NGOA 4RLMA 1IP6A 4AXTA 4WG7A 1LSMA 3CT1A 1FBIX 2BLXA 5KXWA 1LJ4A 1NHEA 4KT3A 5C6LA 3D9AC 1D6QA 3HBHA 5LA8A 4DDCA 5L9JA 2W1YA 1YL0X 1GB6A 2MEHA 3BKVA 3WW6A 1LSYA 1P2CC 1LZCA 2YBNA 1EQ5A 1HEQA 1UA6Y 1WQNA 4R0FA 4Z98A 3AZ6A 1SLYA 5HNCA 4WL7A 1CJ8A 1GE2A 3K3TA 4NGVA 1YAQA 1KIQC 1OUFA 3P68A 4G4BA 4OWHA 3P4ZA 1JTOL 4HV1A 1UIEA 1GAZA 4RLNA 2DQCY 1IOTA 5KXNA 3TXIA 1RI8B 2ZWBA 1GB9A 3A8ZA 1GFUA 1HENA 1GF5A 207LA 1LZDA 4HTQA 4LYMA 4TWSA 1OUJA 1J1PY 2DQGY 2DQJY 4OOOA 4UWVA 1BB4A 6LYTA 1B5ZA 1IY3A 1G7MC 1LCNA 1LJIA 3TXFA 2D4IA 4H92A 5KXZA 4B49A 4LYBA 1IC4Y 5LVGA 3ZEKA 1DI5A 4H90A 1GBZA 5E4PA 1IWZA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
145LA 3OE0A 1KIRC 1XSFA 3J6KA 2DQAA 1FN5A 1YAMA 1V7SA 2MEDA 3TXDA 4LDOA 3L64A 168LA 1VAUA 1LZ1A 1L53A 4R6CA 3HTFA 3W6EA 1QUSA 4W56A 2W1LA 156LA 3D3DA 4WLTA 1D9WA 169LA 5LIOA 3CSRA 1LYIA 161LA 4A7DA 250LA 3B72A 1WQOA 5KXMA 1C6EA 6LZMA 3DN3A 3LYOA 3WL2A 2F47A 2Z38A 1L29A 1C6MA 1WQMA 2Z2EA 3AB6A 4LGKA 1QTBA 4KXIA 1LJHA 3E3DA 4CHXA 1G7LC 2RH1A 4PPOA 2OU0X 2BQDA 4Z46A 1JSFA 177LA 1LSEA 3V2YA 1B0DA 2RB0X 1BVXA 2OU9A 1KY0A 1REZA 1NDMC 3A90A 1CJ9A 1CJ7A 2Z2FA 1DZBX 1JJ1A 1LSPA 4HJZA 1UBZA 5KXXA 1DPXA 1XEKA 1OUDA 1LJEA 4QEQA 3HBEX 4UWNA 2CUUA 3A91A 3OE6A 5LXWA 3CSZA 2CJLA 245LA 1T6HA 3A6CY 230LA 4GCCA 1REMA 1TAYA 2YBJA 1KXWA 1JKCA 4NIJA 1GXV2 5DLAA 4WM5A 1AKIA 1BWHA 1HFXA 2HULA 1QT3A 211LA 2CDSA 3HFMY 1ZV5L 1DYFA 2HEBA 104LA 1TDYA 1G0KA 5FHWA 1GBSA 4DYGA 2RBNA 1GBWA 1OWZA 1IWVA 1REXA 4NGYA 3DNAA 1IR8A 4GLAA 5B07A 5KXKA 4LYCA 151LA 2MEAA 4I7SA 1IR9A 4HTKA 4N0JA 4ARQA 1C6PA 5B06A 1B7NA 2BLYA 1L20A 3W6AA 5C6JA 3CDOA 1JUGA 3HT6A 4WO9A 1OUBA 173LA 1XFPL 131LA 4MR1A 1TEWA 5KKJA 2BPUA 3HU9A 2YDGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1F6S A;  4GCE A;  1EQE A;  4X3B A;  1GB8 A;  3LZT A;  1XGR C;  3G3A B;  1KIR C;  1XSF A;  2G4N A;  1GBO A;  3J6K A;  2DQA A;  3WUM A;  2AUB A;  2HEC A;  4BAP A;  5KXL A;  1FN5 A;  1YAM A;  1V7S A;  3A3R X;  4HPE A;  154L A;  2MED A;  3TXD A;  1JTT L;  1REY A;  5KXT A;  1JIT A;  1LZG A;  2Z37 A;  1VAU A;  1LZ1 A;  1WQQ A;  2XBS A;  1IY4 A;  4R6C A;  1G7J C;  1JIS A;  4NHS A;  3W6E A;  4NFV A;  1LSG A;  1QUS A;  4OWC A;  1NBZ C;  1C7P A;  2G4P A;  3ATN A;  2IHL A;  2W1L A;  3A94 A;  4XYY A;  5I54 A;  3TMU A;  5KXO A;  4NGI A;  5JEN B;  3D3D A;  3WU7 A;  1V7T A;  2B5Z A;  1B7M A;  4WLT A;  1GF3 A;  5DN5 A;  1D9U A;  1HER A;  5L3H A;  5LIO A;  1BQL Y;  3W6F A;  1GF8 A;  1IIZ A;  5IHG A;  3CSR A;  4W94 A;  5A3Z A;  1LSN A;  1J1X Y;  3OK0 A;  4A7D A;  2ZIL A;  1BB5 A;  3A92 A;  3GXK A;  4YEM A;  4DC4 A;  3B72 A;  3HBD A;  1LZT A;  1WQO A;  1GB5 A;  1BB6 A;  3AYQ A;  4GN3 A;  153L A;  5KXM A;  1GBY A;  1CJ6 A;  1B5V A;  1GE4 A;  4DD3 A;  1QTK A;  4N9R A;  4YEN A;  3LYO A;  1GFH A;  3WL2 A;  2Z38 A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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