4DD3A

Eval processed hewl, carboplatin aqueous paratone
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme C
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd3A00
2YBMA 3B0IA 1GWDA 4TWSA 5FCPA 1BB6A 4NGYA 1JIYA 5LVKA 1TBYA 2XBRA 3QNGA 2ZQ3A 4YF2A 1IOSA 2D4IA 4NSIA 5FEKA 3CB7A 1VDSA 1TCYA 1UA6Y 4LYCA 1WQRA 2FBBA 2HU3A 1I56A 1B5VA 2DQIY 1LMPA 3B6LA 3CT1A 3LZ2A 3TMUA 1VEDA 4LT0A 4UWNA 2BQHA 4XN6A 5I5QA 3W6FA 3A6BY 4H9BA 1JTPL 2YSSC 4TSCA 3WUAA 1DPXA 1LZ9A 4GCBA 3HFMY 1LSEA 4P2EA 2Z39A 1AT5A 1B5WA 1GB6A 2HU1A 3WW6A 1KIQC 4IJ4A 3W3EA 194LA 3TXFA 1GB5A 2DQHY 4EOFA 1DXJA 1DI3A 1IR8A 3BKVA 3A91A 4NGWA 1LZSA 1YKYX 4I8SA 4NY5A 1LYSA 5KXNA 5FDJA 1IWUA 4ETCA 1FKQA 5KXZA 1V7TA 1YROA 5APFA 5KXSA 1B5UA 1YAMA 3AZ4A 1XGPC 4BS7A 1WQOA 4HJYA 4HJZA 4NHIA 3AYQA 4ML7A 5HNCA 4ET9A 3WL2A 4LFPA 1JSEA 2HEFA 4PRQA 1GXV2 1QSAA 2YVBA 1IY3A 2NWDX 3G3AB 1VDPA 3A6CY 4TUNA 4BAFA 153LA 4J0LA 1GEZA 1EL1A 3D3DA 2C8OA 3TXIA 1G7MC 4WLDA 3W6DA 1FBIX 4II8A 4PPOA 1IP1A 3CSQA 1XFPL 3WVXA 2GV0A 4L41A 4LYOA 2IFFY 1HEPA 3ATOA 2G4QA 1F0WA 3WU7A 2DQAA 1YIKA 1ZMYL 3WPKA 2HTXA 2A7FA 3RZ4A 1GBWA 3QY4A 1IIZA 1SLYA 4H92A 1AT6A 1HFZA 4WLYA 1QTKA 2BQKA 4KT3A 2H9KA 4U3XB 3GXKA 1MELL 4MR1A 2VB1A 5KXWA 5HQ1A 1CKCA 1I1ZA 1INUA 3RU5A 3ZVQB 3M3UA 1UC0A 1D6QA 4XJFA 1P2CC 1WQNA 3B0KA 2MEAA 3G3BB 1C45A 4WO9A 5F16A 1YQVY 2ZIJA 4NIJA 1O23A 5KXLA 1TDYA 2W1YA 1E8LA 3MGWA 5KXRA 4NGJA 5B06A 5C6JA 5FELA 1JITA 1KIPC 1D6PA 1LSMA 4CFOA 4N9RA 4I0CA 5LYMA 4PHIA 4ZFPA 4TX7A 3N9CA 1NMMA 4ETDA 3AJNA 2Z38A 2N5ZA 2BLYA 1BVKC 5DL9A 2YBNA 3A34A 1OUIA 4H91A 1NBYC 4FDYA 4NG1A 4QDNA 3W6EA 1JEFA 4ZIXA 5JENB 2FYCA 4CFPA 4G4HA 2HECA 3K3TA 4H1PA 1F6SA 154LA 3W6AA 5FHWA 1XGUC 3A67Y 4DDCA 5KXXA 4G49A 4WOAA 5LXWA 1GF4A 4QEQA 1LZNA 2BLXA 3T36A 4CGEA 4GLVA 1LSDA 2H5ZA 4WM4A 2F4AA 1GFGA 1MLCE 2F4GA 1C43A 1LJJA 4XYYA 5LA8A 1NBZC 1FLWA 3ZEKA 1NWGA 2HEAA 5I4YA 5LVHA 4OOOA 4TTDA 3CT0A 2MEHA 1B7OA 2F2NA 2MEEA 1LYOA 5B1FA 3LYMA 4B0DA 1G7IC 4IASA 4HTQA 4NHTA 1QUTA 1PZYA 4DD0A 1LJHA 1B2KA 1IC5Y 4DWXA 1HELA 1BB3A 4WM6A 1FKVA 1G7JC 5E4PA 4WO6A 1HFXA 1LSGA 2BQGA 4W96A 1BB4A 5B1GA 5KXYA 2HEEA 1BGIA 4DD1A 1G7LC 1C7PA 1Z55A 3T6UA 2CWIA 1LMQA 1LHLA 3WU9A 2I25L 1IORA 1LSZA 4B49A 1KXXA 1J1PY 1OUJA 1KXYA 1ZVHL 1DZBX 4LZTA 5B05A 2BQMA 3ATNA 3WXUA 4NEBA 1EQ4A 5ILFA 1TEWA 1GFVA 1QUSA 3WU8A 4C5FA 1GFUA 1OUEA 1GEVA 1LHJA 4LYMA 1RJCB 4GCFA 1LPIA 4QGZA 4H9CA 1DI4A 1FLQA 3P68A 1NDGC 5II3A 1CKGA 4H94A 1LCNA 1H87A 2ZWBA 3EO5A 4NSGA 1IP6A 1PS5A 1GF7A 5LVGA 4ETAA 1LZBA 1UIBA 2CJLA 3W6BA 1HEWA 2HEDA 1LOZA 3CQLA 4OWAA 1CJ9A 1GB3A 2BQFA 5AMYA 1LZAA 3HBHA 5HMJA 4B4IA 1LJNA 1GFEA 1GB2A 1QDRA 2W1LA 4CJ2A 2BQBA 3A3RX 1B5XA 1JSFA 2I6ZA 1SQ2L 3WYHA 1GBZA 1DI5A 1YL0X 4GN4A 3TMXA 4DD3A 5T3FA 3LYTA 5D5CA 4WMGA 1WTNA 1XSFA 5F9UA 1LYYA 2DKVA 4M6DA 5A3ZA 4DC4A 1BWHA 3TXDA 3WPLA 1IEEA 4LYBA 1LMNA 3P4ZA 1RE2A 4WG1A 1B9OA 1LZTA 3TXKA 5KJ9A 1OUHA 4ANRA 2YBIA 1IC7Y 2HUBA 3CT5A 4LYTA 1HC0A 1GAZA 5A3EA 1GXXA 1XGRC 1HSXA 1YAQA 3IJUA 5F81A 4WLTA 1OUBA 2YBLA 4WG7A 3A93A 4NHSA 3W6CA 2FYDA 7LYZA 1LZ6A 1IVMA 4EMNA 4ETBA 4NHQA 2DBTA 1GE3A 1WTMA 3A95A 5I53A 4YEMA 5HNLA 1LJ3A 1DQJC 1FLUA 1LAAA 4HSFA 2HEBA 1LSAA 1UACY 3A96A 4MSTA 5I4XA 1LMTA 4YEOA 1LHMA 4DD9A 5K7OA 1LMCA 2BQNA 4XJHA 1BQLY 1YAPA 5KKJA 1UCOA 1LSBA 2LZ2A 3B0OA 1JHLA 1LZ1A 1QDTA 1WQMA 2BPUA 2BAAA 1OUAA 1T6VL 1B7QA 4Z3MA 1DKKA 3P64A 4RDSA 1LZYA 4GCCA 1NQIA 4J7VA 5IELA 1C08C 3E3DA 1IP2A 3B72A 1WQPA 1A4VA 2LYMA 3LYOA 2PC2A 1BWIA 4OWCA 1NHEA 2B5ZA 4J1AA 4WM1A 1JISA 1F10A 1LZGA 5D5FA 2ZIKA 4A7DA 1WVVA 1B7LA 1GD6A 3IJVA 1GE1A 3TMWA 1GFRA 5HLLA 2D4KA 3M18B 2EKSC 1G7HC 1RCMA 2YDGA 3AGHA 1IO5A 2G4PA 4OW1A 2C8PA 132LA 4TSBA 5KKIA 3A90A 5KXPA 4QY9A 3AGIA 1IWYA 133LA 2DQJY 2Z19A 4WM5A 1ZVYB 1QSWA 4HP0A 1D0LA 4HTNA 3EXDA 4NGIA 1LKSA 1YKZX 1T3PA 2MECA 1B0DA 1GFHA 3AGGG 2XTHA 5DN5A 5L9JA 1IP3A 5KXOA 1GBYA 4YM8A 3GXRA 5DLAA 1GHLA 1JJ0A 1I20A 4N5RA 2Z18A 2Q0MX 4RW2A 4R0FA 1LHHA 1JPOA 2W1XA 3LHMA 4KXIA 4LT1A 4X3BA 4Z41A 207LA 5DN4A 4DD2A 4M4OA 2CGIA 4LGKA 134LA 1GBOA 3AW6A 1HSWA 1UIAA 1IP7A 1LJKA 3J4GA 4WL6A 5APCA 135LA 1LJFA 2Z12A 3HBEX 1GFAA 4G4BA 5B07A 1GDWA 3TXJA 4C3WA 4D9ZA 4DDAA 4H9EA 4H90A 1B7NA 4J1BA 1J1XY 4KL7A 1CJ7A 1LZEA 1REZA 2LHMA 4DDBA 1B7RA 2DQCY 4Z46A 1EQ5A 3A8ZA 4LT2A 3OJPA 4N1EI 3LN2A 1IP4A 1LZRA 4IATA 2BQEA 1LSNA 1C46A 2BQOA 4HV2A 4WM2A 1LMOA 1VFBC 5LYTA 5B59A 4LFXA 2LZTA 1LMAA 2IHLA 1B5ZA 1HEOA 4W94A 4E3UA 3RT5X 1RFPA 1GF3A 1NF5A 4WM3A 4NHPA 3FI7A 3TXEA 4B1AA 4UWUA 1OP9B 208LA 2ZNXY 1GAYA 1UICA 1OUCA 4GCDA 2MEDA 1XEIA 4H93A 1F6RA 1J1OY 5KXKA 1B7MA 3WMKA 3A92A 1AKIA 1HEQA 5M1YA 3ZVQA 1BWJA 1IR7A 4GLAA 4OOTA 1OQMA 1GF8A 2X0AA 5L3IA 1DKJA 1LZ4A 1RI8B 2MEGA 1LTMA 1XGTC 4WL7A 4XJDA 1IP5A 4NFVA 3WPJA 1FLYA 4HTKA 1JJ3A 1QQYA 2RSCA 1JTTL 3P65A 2MEIA 1UUZC 1LZ5A 1NKHA 3BKHA 4PGJB 1BHZA 3HBDA 4H9HA 4H8YA 4WLXA 5L3HA 1IWXA 1JWRA 5F14A 1VDQA 1BB5A 1LHIA 2D4JA 1D9UA 2BQCA 4GN5C 4NGKA 3LZTA 1LJIA 4PJ2C 5DM9A 4BADA 5KXTA 2Z2EA 4NWHA 1DPWA 4XJIA 3OK0A 4NWEA 1JUGA 1A2YC 1IOCA 4B4EA 4HPIA 1UIDA 1GF6A 4RLMA 2D6BA 3FE0A 4XENA 3WH1A 4GN3A 1GFTA 4BAPA 2W1MA 1GFKA 3WUNA 1HENA 4UWVA 3WXTA 1IOTA 2XJWA 1IOQA 1BVXA 4Z98A 1JKBA 2YBJA 6LYZA 3J6KA 3RW8A 1VATA 1LJ4A 1LHKA 1CJ6A 3CSZA 5C6IA 1VDTA 1ZV5L 4MCKA 4H9FA 1XEKA 3SP3A 1HHLA 1OUDA 1EQEA 1LSYA 1YILA 1IWVA 1CKDA 1D0MA 3WUMA 5LVJA 1LSCA 3TXHA 1WVUA 3WVYA 1LKRA 1LJGA 1GE4A 1GB9A 1REMA 2EIZC 4GCEA 3WW5A 1HNLA 3F6ZA 1JKAA 1WQQA 1GB8A 4RLNA 5J7CA 3A94A 1IWZA 3EBAB 4LT3A 3QE8A 5KXMA 1KIRC 1HFYA 4XJGA 2YBHA 1IX0A 1W6ZA 1CKFA 4HV1A 1B7SA 1GBSA 1VAUA 4PRUA 5ILCA 1HEMA 4B4JA 2BQLA 4NGOA 4ZEEA 1HERA 2BQDA 5APDA 5LINA 1UIHA 5IHGA 2ZILA 1LSPA 1IWWA 3A3QA 3EMSA 2MEFA 4OWHA 3IWRA 4CHXA 2DQGY 2DQFC 3N9EA 1V7SA 2EPEA 1CJ8A 1HMKA 1IC4Y 5LVIA 3AW7A 4G4CA 1GE0A 4NSHA 1OUFA 2MEBA 1YANA 2H9JA 1NDMC 2FBDA 5LA5A 1GPQC 3N9AA 2DQDY 1XGQC 1YKXX 1TAYA 2AUBA 4KPMA 5LIOA 1LZCA 5I54A 5LYZA 1JJ1A 3TXGA 1GDXA 3AZ7A 4N1CC 4NG8A 1C10A 5LAGA 2F30A 1YL1X 4NGVA 1XEJA 1LSFA 5HMVA 1GBXA 1REXA 2ZQ4A 2ZNWY 3TXBA 2ZYCA 3ULRA 4AGAA 1IR9A 5F9XA 2Z37A 1JKDA 4N8ZA 5I4WA 3D9AC 2BQAA 1LYZA 3CSRA 4YOPA 4H9AA 8LYZA 1GB0A 4FJRA 2G4NA 1BB7A 4XJBA 1FN5A 4NGZA 4OWBA 1GF5A 5C6LA 5IDDA 1N4FA 1UIFA 1GF9A 4H8XA 4H9IA 2BQIA 3WULA 9LYZA 4LYZA 4DD7A 1D0KA 1KXWA 3TMVA 1QIOA 1JKCA 1YAOA 2BQJA 5LAFA 1HF4A 5FSTA 4YENA 1AM7A 1H6MA 2CDSA 4DT3A 2D91A 1LJEA 1GE2A 4H8ZA 4O34A 3KAMA 4G9SA 3AZ6A 1HMLA 2ZYPA 1CNSA 5E9RA 2LYOA 1GFJA 1LZ8A 2WARA 3LYZA 4R6CA 4OWEA 1GF0A 4HJVA 4HPEA 2Y8PA 3RNXA 4ET8A 5EBHA 4NGLA 4N0JA 3AZ5A 1IY4A 1B7PA 2Z2FA 1UBZA 4NSJA 5KY1A 1OUGA 1QTEA 4AXTA 1FDLY 2XBSA 4XADA 2LYZA 1W08A 2DQEY 1GB7A 2I26L 1AZFA 1UIEA 1ALCA 1IWTA 3P66A 4DYGA 2A7DA 4ETEA 4RW1A 2EQLA 1REYA 193LA 3VWOA 1JTOL 5APEA 3AB6A 1LZDA 1UIGA 6LYTA 1B5YA 1CKHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PQDA 1TBYA 2ZQ3A 1L52A 2HU3A 1B5VA 1LMPA 3B6LA 3LZ2A 4XN6A 2BQHA 1L81A 3W6FA 1JTPL 1SWZA 4GCBA 4P2EA 1KIQC 1QTVA 4W52A 1GB5A 2DQHY 4EKSA 4EOFA 3G3XA 1IR8A 3A91A 1LZSA 4I8SA 1LYSA 1L74A 4ETCA 5KXSA 1L22A 4ARMA 3SB8A 4HJYA 1L59A 166LA 3C81A 4ET9A 3HTBA 1IY3A 2NWDX 4TUNA 4BAFA 4WLDA 3WVXA 1DYEA 2OE4X 1HEPA 2G4QA 178LA 3WPKA 3QY4A 1L38A 233LA 230LA 2RBPA 3G3VA 119LA 1L50A 2VB1A 1LYDA 159LA 3RU5A 250LA 2B6WA 2MEAA 3G3BB 1C45A 4WO9A 5F16A 1E8LA 4YX7C 1B6IA 192LA 5B06A 5C6JA 190LA 1KIPC 4CFOA 1L58A 4PHIA 3N9CA 3F8VA 4ETDA 3VW7A 1OUIA 240LA 4ZIXA 2QARC 2FYCA 3K3TA 5FHWA 262LA 4CGEA 2F4GA 1C43A 1L15A 1FLWA 1SSWA 3L2XA 205LA 2MEHA 169LA 3NYAA 4HTQA 4DD0A 1HELA 102LA 1BB3A 1L30A 1CV0A 1HFXA 5KXYA 260LA 1G7LC 220LA 218LA 3SB6A 4B49A 1KXXA 1L13A 1KXYA 1DZBX 4NEBA 1L72A 1RJCB 5II3A 1LCNA 3EO5A 3K2RA 1PS5A 1UIBA 1HEWA 1LZAA 1LJNA 2W1LA 163LA 2BQBA 3A3RX 1CTWA 1B5XA 4DD3A 3TMXA 5F9UA 3OE9A 2DKVA 4M6DA 5A3ZA 1IEEA 1L85A 3TXKA 1OUHA 1PQJA 2B6TA 2YBIA 1IC7Y 173LA 2IGCA 3IJUA 1G0LA 4WG7A 4NHSA 3W6CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2YBM A;  3B0I A;  1GWD A;  4TWS A;  5FCP A;  1BB6 A;  4NGY A;  1JIY A;  5LVK A;  1TBY A;  2XBR A;  3QNG A;  2ZQ3 A;  4YF2 A;  1IOS A;  2D4I A;  4NSI A;  5FEK A;  3CB7 A;  1VDS A;  1TCY A;  1UA6 Y;  4LYC A;  1WQR A;  2FBB A;  2HU3 A;  1I56 A;  1B5V A;  2DQI Y;  1LMP A;  3B6L A;  3CT1 A;  3LZ2 A;  3TMU A;  1VED A;  4LT0 A;  4UWN A;  2BQH A;  4XN6 A;  5I5Q A;  3W6F A;  3A6B Y;  4H9B A;  1JTP L;  2YSS C;  4TSC A;  3WUA A;  1DPX A;  1LZ9 A;  4GCB A;  3HFM Y;  1LSE A;  4P2E A;  2Z39 A;  1AT5 A;  1B5W A;  1GB6 A;  2HU1 A;  3WW6 A;  1KIQ C;  4IJ4 A;  3W3E A;  194L A;  3TXF A;  1GB5 A;  2DQH Y;  4EOF A;  1DXJ A;  1DI3 A;  1IR8 A;  3BKV A;  3A91 A;  4NGW A;  1LZS A;  1YKY X;  4I8S A;  4NY5 A;  1LYS A;  5KXN A;  5FDJ A;  1IWU A;  4ETC A;  1FKQ A;  5KXZ A;  1V7T A;  1YRO A;  5APF A;  5KXS A;  1B5U A;  1YAM A;  3AZ4 A;  1XGP C;  4BS7 A;  1WQO A;  4HJY A;  4HJZ A;  4NHI A;  3AYQ A;  4ML7 A;  5HNC A;  4ET9 A;  3WL2 A;  4LFP A;  1JSE A;  2HEF A;  4PRQ A;  1GXV 2;  1QSA A;  2YVB A;  1IY3 A;  2NWD X;  3G3A B; 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 1IOT A;  2XJW A;  1IOQ A;  1BVX A;  4Z98 A;  1JKB A;  2YBJ A;  6LYZ A;  3J6K A;  3RW8 A;  1VAT A;  1LJ4 A;  1LHK A;  1CJ6 A;  3CSZ A;  5C6I A;  1VDT A;  1ZV5 L;  4MCK A;  4H9F A;  1XEK A;  3SP3 A;  1HHL A;  1OUD A;  1EQE A;  1LSY A;  1YIL A;  1IWV A;  1CKD A;  1D0M A;  3WUM A;  5LVJ A;  1LSC A;  3TXH A;  1WVU A;  3WVY A;  1LKR A;  1LJG A;  1GE4 A;  1GB9 A;  1REM A;  2EIZ C;  4GCE A;  3WW5 A;  1HNL A;  3F6Z A;  1JKA A;  1WQQ A;  1GB8 A;  4RLN A;  5J7C A;  3A94 A;  1IWZ A;  3EBA B;  4LT3 A;  3QE8 A;  5KXM A;  1KIR C;  1HFY A;  4XJG A;  2YBH A;  1IX0 A;  1W6Z A;  1CKF A;  4HV1 A;  1B7S A;  1GBS A;  1VAU A;  4PRU A;  5ILC A;  1HEM A;  4B4J A;  2BQL A;  4NGO A;  4ZEE A;  1HER A;  2BQD A;  5APD A;  5LIN A;  1UIH A;  5IHG A;  2ZIL A;  1LSP A;  1IWW A;  3A3Q A;  3EMS A;  2MEF A;  4OWH A;  3IWR A;  4CHX A;  2DQG Y;  2DQF C;  3N9E A;  1V7S A;  2EPE A;  1CJ8 A;  1HMK A;  1IC4 Y;  5LVI A;  3AW7 A;  4G4C A;  1GE0 A;  4NSH A;  1OUF A;  2MEB A;  1YAN A;  2H9J A;  1NDM C;  2FBD A;  5LA5 A;  1GPQ C;  3N9A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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