4DD7A

Eval processed hewl, carboplatin dmso glycerol
Total Genus 45
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
45
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title Structural studies of the effect that dimethyl sulfoxide (DMSO) has on cisplatin and carboplatin binding to histidine in a protein.
pubmed doi rcsb
total genus 45
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-01-18

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dd7A00
1B5UA 4HTKA 1H6MA 3EBAB 1FLYA 1YKYX 4WG7A 4HSFA 1GAZA 1LZ5A 3RT5X 3WUNA 3CSQA 4EMNA 1CNSA 5KXKA 4XENA 5HNCA 4UWNA 3BKHA 5DN5A 2H5ZA 1LZSA 1I1ZA 4ZFPA 1GFEA 3P65A 1LMPA 2MEIA 4KPMA 4AXTA 3FE0A 5DN4A 2A7DA 4DWXA 1IP5A 4UWVA 2MEEA 4FJRA 4KXIA 1DXJA 1LJ4A 5LAGA 1B5WA 4TUNA 1LHLA 1OUCA 3GXKA 2ZIJA 5LIOA 1UIFA 5K7OA 5HMVA 1KIRC 5FDJA 4WM6A 1JSEA 3QY4A 4LYMA 1BQLY 1DPWA 1LZ1A 2MEAA 1LSPA 1A2YC 1FKQA 4NWEA 1C10A 3F6ZA 1XGTC 5DM9A 3QNGA 1T3PA 1VDTA 2X0AA 5KXYA 1WQMA 5M1YA 1LSEA 5B59A 2NWDX 4TSBA 1UIAA 4N1EI 1HFZA 2I25L 1DI3A 1HEPA 4ETCA 1LZNA 2BAAA 1LZYA 2BQOA 1TEWA 4LYZA 1HNLA 3CT1A 4U3XB 1P2CC 1LYYA 2HEDA 3RNXA 1GE3A 3LYOA 5F81A 1REYA 3A6BY 1ZMYL 2W1LA 6LYZA 1GDWA 1G7LC 5DLAA 4NGKA 2CGIA 4P2EA 1C08C 1ALCA 1LSNA 2DQDY 4XJBA 4W94A 1IWVA 1B7NA 3MGWA 4DDAA 5I4YA 4OW1A 3WMKA 3WXUA 1WVUA 1C45A 1HENA 1OUHA 1IWXA 1QQYA 2XJWA 4LFPA 3TMXA 4WL7A 3WUAA 1AT6A 2EIZC 4LYOA 1BGIA 1B5ZA 2BLYA 1IP2A 3ATNA 1FBIX 4B4EA 4H8YA 1JJ3A 1JISA 4HTQA 4NGWA 5C6LA 1HSWA 1DI5A 1RCMA 3TXGA 4H91A 2F4AA 4XYYA 1LZTA 4I0CA 1EL1A 2YVBA 3WYHA 4QEQA 1UACY 3A90A 3T6UA 5F14A 4NSHA 4NGZA 2I26L 3WL2A 4OWBA 2I6ZA 1LYOA 1CJ9A 4OWAA 1GF3A 6LYTA 1IC4Y 1JWRA 1UC0A 1FLQA 4BADA 5J7CA 1I56A 1HSXA 2DQJY 1GE1A 1XGPC 3ZEKA 4N1CC 1IP1A 1F6RA 3W6CA 3ULRA 1HELA 2F4GA 4H92A 5KXTA 1LZCA 1KXYA 1QSWA 2EKSC 1B5VA 1RE2A 1REZA 2D4JA 1GXV2 2HEBA 3A34A 4ETBA 1KIQC 2YBLA 3B0KA 3TXEA 1MLCE 2Z19A 3W6DA 1C7PA 1HFXA 1GE0A 1OUGA 2CDSA 2Z18A 1Z55A 2Z37A 1GB9A 3B0OA 4NHIA 4DDBA 5L3IA 3IWRA 1B9OA 4RW1A 1GFTA 4WM5A 1JSFA 4I8SA 1YL1X 4II8A 1ZV5L 4YEOA 4MR1A 4TSCA 3G3AB 1IEEA 1LZGA 1LMAA 4NEBA 4XJDA 4ANRA 2AUBA 2F30A 5JENB 1IWWA 1OUFA 4LZTA 4WM4A 153LA 1OQMA 1QDTA 4NG8A 1YKXX 1ZVYB 3A96A 3G3BB 4DD9A 3WXTA 1G7MC 1D6QA 3TXDA 4J1AA 2W1MA 1CJ7A 1GEZA 1B7QA 1UCOA 3J4GA 4NGOA 4OOOA 5LA8A 5KXZA 1G7JC 3TMUA 2BQDA 2YBNA 1WQPA 5B1FA 4YEMA 1A4VA 1VATA 3WPLA 2Z2FA 4XJIA 5HQ1A 4OOTA 3AB6A 3LZ2A 3RZ4A 4B1AA 1HF4A 1AKIA 4OWCA 1LZDA 1GPQC 2D4IA 5FEKA 1LJEA 5KJ9A 1GF5A 3J6KA 1D0LA 4CGEA 5KXLA 1NBZC 135LA 1GBXA 1LTMA 3EMSA 4ETAA 1GE4A 1LJIA 2BQBA 5C6IA 3EXDA 1GF4A 3W3EA 2D4KA 3EO5A 2BQMA 2WARA 2MEGA 3K3TA 4G4HA 1D6PA 2HTXA 1V7TA 4NY5A 1LPIA 5AMYA 4CJ2A 1F6SA 2BQLA 1LKRA 3N9EA 4DDCA 4DYGA 3A95A 1GBOA 1RI8B 1O23A 2Z38A 1GB2A 5LVKA 4CFPA 1LKSA 1GFJA 1HEQA 1WQOA 1CKFA 4NGIA 3TXFA 5KXOA 1XGQC 1DQJC 1NDGC 4H9EA 1IY4A 1QUTA 2MEBA 4DD0A 4YF2A 1HEWA 3P68A 2G4QA 1XSFA 2ZWBA 1LJJA 1IWUA 1LJ3A 4H9IA 4DD7A 2BPUA 4GCEA 1UBZA 1YAOA 2LYMA 1GXXA 4LYCA 1WQRA 1DKJA 2B5ZA 5II3A 4WLTA 4ETEA 3AW7A 2BQKA 3LYTA 5DL9A 1IWYA 1TDYA 1LJNA 5F9UA 4ET9A 4J0LA 4X3BA 4C3WA 2YBHA 1OUAA 4PRQA 2DQEY 1GE2A 4L41A 5LINA 1IOCA 1WVVA 4BS7A 1FKVA 3ZVQB 2CWIA 5KXMA 3FI7A 2BQGA 5LYTA 3IJUA 2MECA 1GEVA 2FBBA 2ZYPA 4B4IA 4H9AA 1VAUA 4YM8A 1BVXA 1B2KA 1OUEA 4WO9A 1GFAA 2ZILA 4NHSA 3TMWA 5A3EA 2A7FA 3AZ6A 5I53A 2G4NA 4H8ZA 1KIPC 4N9RA 193LA 2FBDA 133LA 1GHLA 2FYDA 1UA6Y 1LSMA 3M3UA 4N8ZA 5APCA 1W08A 3ATOA 2W1XA 1QDRA 1GFKA 5LVJA 3WPJA 4IASA 2XBRA 4G4BA 5FHWA 1LSYA 4B49A 1IORA 4RW2A 1LHIA 3LHMA 1GB0A 1KXWA 2HEAA 3WPKA 1YAPA 4ETDA 4AGAA 1JTOL 4B0DA 1LMTA 1LJGA 1JJ0A 1CJ6A 134LA 1NHEA 4NSIA 1BHZA 2ZNWY 1PZYA 1H87A 5LYZA 3TXJA 5L9JA 3SP3A 9LYZA 2YSSC 4LFXA 1IR9A 1VEDA 4NG1A 3AZ5A 1B0DA 1JKDA 3AJNA 3WULA 1GD6A 1GBSA 3CQLA 4NIJA 1IOTA 2Z2EA 3TXBA 1C46A 4LYTA 2HUBA 5KXSA 1LCNA 3ZVQA 2MEDA 4H94A 3HFMY 1J1XY 2ZYCA 2RSCA 1GBWA 4WG1A 1INUA 1JKCA 1LSDA 1VFBC 2DQGY 1HMKA 1HHLA 3A8ZA 3A91A 5B06A 1GB5A 1AZFA 4GCCA 5KKJA 1HEMA 4H9BA 1JHLA 1FDLY 1TBYA 1BWIA 2DKVA 1IR7A 2HU3A 1IWZA 2Z12A 3P64A 4NGYA 2D6BA 2MEHA 4BAFA 1LHMA 2F2NA 1JUGA 4CFOA 2ZQ3A 1IO5A 4NGVA 1GFGA 3WVYA 4NGLA 1JTTL 1NDMC 1G7HC 1LHKA 1BVKC 1V7SA 4H93A 5FCPA 1JTPL 1LZ6A 1IOSA 1HEOA 1VDQA 1YILA 2DQIY 2DQAA 1DZBX 1GBZA 1GDXA 1YL0X 4GN5C 1D9UA 3LN2A 3CT5A 4RLNA 3CB7A 5KXPA 1XEKA 2YBMA 1EQ5A 4PJ2C 2DQCY 4DD1A 4ZEEA 1D0KA 1MELL 1UICA 1YKZX 2BQJA 1UIGA 4H90A 1BB6A 1AM7A 3WW5A 5E9RA 1HMLA 5ILCA 1NMMA 1UIHA 2CJLA 1FLWA 4LT1A 4HPEA 1NWGA 1OUBA 3WU7A 4A7DA 2DQHY 1SLYA 4HV1A 4YOPA 8LYZA 4NSJA 4EOFA 4Z46A 1BB7A 3AGGG 1LMQA 1LJKA 4N0JA 2YBIA 5APFA 1PS5A 1QSAA 3P66A 5I4WA 1CKGA 1C43A 4KT3A 2ZNXY 4CHXA 4PGJB 3A3RX 1B7SA 1IC7Y 3TXKA 1IVMA 1KXXA 2LHMA 1LSFA 2N5ZA 3AGHA 1EQEA 2DBTA 1NQIA 3AYQA 3E3DA 4E3UA 1GB6A 1G7IC 1LZEA 1QUSA 1IP6A 5LVGA 5LVIA 3IJVA 4IATA 1WTMA 4R6CA 4YENA 132LA 1DI4A 4DT3A 1LZ8A 3A3QA 1GF0A 1T6VL 4HPIA 4GCDA 1JPOA 5APDA 3A6CY 5B1GA 4N5RA 1FN5A 5D5FA 3T36A 1QIOA 1RJCB 1LMNA 2LZTA 1IP7A 2HU1A 4NHPA 1TAYA 4NHTA 1YROA 1YAMA 2HEFA 3D9AC 1IP4A 4WOAA 4B4JA 1LMCA 1J1PY 3P4ZA 4HTNA 4NFVA 4WLXA 1OUDA 1OUIA 5IELA 154LA 2LYZA 4J7VA 1UIBA 1GFUA 3WVXA 1BWHA 2H9JA 4KL7A 1WQNA 4OWEA 1WQQA 3W6BA 3B72A 4XJGA 4G4CA 1UIDA 1JITA 208LA 3OJPA 3BKVA 4WL6A 4DC4A 2Y8PA 2DQFC 1NBYC 4QGZA 4O34A 1GB3A 4XN6A 4H1PA 3AZ4A 1YQVY 4XJFA 1HERA 1YIKA 4XADA 4H9HA 5KXNA 4Z98A 5LAFA 1VDSA 1CKDA 2HEEA 2W1YA 1LHHA 2BQNA 4J1BA 1LOZA 4HJZA 1LSZA 1JEFA 1LMOA 4H9FA 1GF8A 4GN3A 3W6EA 4LT0A 3HBEX 5T3FA 2C8OA 4RDSA 1IX0A 1GF9A 1JIYA 5KY1A 4GCFA 3KAMA 1XGRC 2IFFY 2H9KA 2EPEA 3WUMA 1GFHA 5KXRA 4TX7A 1LZ4A 1YAQA 1ZVHL 1LSAA 5E4PA 5KKIA 3LZTA 1LZ9A 2LYOA 3CSZA 3TMVA 1LZBA 4H8XA 4ET8A 3A92A 4Z3MA 5LYMA 1DKKA 4PHIA 4W96A 3N9CA 3GXRA 4D9ZA 1GB7A 2HECA 3HBDA 4LGKA 1BB3A 3AZ7A 4H9CA 4C5FA 1HC0A 1OP9B 4R0FA 1W6ZA 1BB4A 4RLMA 1IIZA 1JKAA 1LYSA 1XGUC 2BLXA 5I4XA 1BWJA 3N9AA 1CJ8A 1LSCA 4MCKA 4UWUA 1JJ1A 3D3DA 2LZ2A 2BQIA 1JKBA 2Z39A 4NGJA 2XBSA 1UIEA 4GLAA 4NHQA 4PRUA 3A93A 5B07A 5KXWA 1LZRA 1HFYA 3A67Y 4HJVA 3RW8A 5I54A 1LSBA 5ILFA 4LT3A 5HNLA 4HV2A 1CKCA 5LVHA 1IP3A 1XFPL 3QE8A 4BAPA 2BQEA 2PC2A 1IC5Y 4LT2A 4NSGA 1IY3A 2FYCA 4XJHA 2VB1A 4PPOA 2Q0MX 1XEJA 4WM2A 3WU9A 3CSRA 3WW6A 3A94A 3HBHA 1B7LA 4WO6A 4WM1A 1B7RA 5HLLA 2IHLA 1N4FA 5F16A 1LYZA 5KXXA 2MEFA 4M6DA 3OK0A 1REXA 1EQ4A 4FDYA 4IJ4A 3B0IA 1LSGA 4WLYA 2BQHA 5HMJA 2GV0A 5IHGA 1D0MA 1BB5A 5LA5A 1LJFA 1REMA 194LA 3TXIA 1B5XA 1CKHA 3VWOA 4OWHA 1WTNA 1XEIA 1YANA 3B6LA 4G9SA 7LYZA 4GLVA 1B7OA 1GFRA 1GF6A 1LJHA 1RFPA 1GF7A 4HJYA 5IDDA 4HP0A 3RU5A 4DD2A 5A3ZA 4ZIXA 1IWTA 2G4PA 3M18B 4NWHA 4QY9A 2C8PA 1GB8A 2D91A 5LXWA 1B5YA 1E8LA 4WMGA 1B7PA 3CT0A 4Z41A 1IR8A 5F9XA 2YBJA 1GAYA 3TXHA 4TTDA 1IOQA 1DPXA 3LYMA 2XTHA 3WH1A 5FELA 5B05A 5I5QA 4WLDA 3AW6A 1VDPA 3AGIA 1F10A 4LYBA 5FSTA 1F0WA 1LAAA 1QTKA 2ZIKA 2EQLA 4TWSA 1NF5A 1UUZC 5D5CA 5EBHA 4M4OA 1TCYA 4MSTA 1I20A 1B7MA 4WM3A 1FLUA 207LA 1SQ2L 1LHJA 2YDGA 1AT5A 1NKHA 3W6FA 1GBYA 1GWDA 5C6JA 4GCBA 1GFVA 4DD3A 1OUJA 4QDNA 3W6AA 5APEA 4G49A 4ML7A 3WU8A 2BQFA 3LYZA 4GN4A 2BQAA 5L3HA 2BQCA 2ZQ4A 1LZAA 1QTEA 1J1OY
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1B5UA 1CUPA 1H6MA 3EBAB 1GAZA 249LA 3RT5X 3CSQA 3C8QA 1DYBA 2H5ZA 2Q9EA 1I1ZA 3HH4A 1GFEA 1LMPA 2MEIA 4KPMA 4DWXA 187LA 2MEEA 1LJ4A 5LAGA 1LHLA 172LA 3HUAA 2ZIJA 137LA 3HWLA 2B74A 1WTHA 4OO9A 4I7LA 1KIRC 5FDJA 3QY4A 1KNIA 1FKQA 4NWEA 3QNGA 3C83A 5DM9A 1T3PA 5KXYA 7LZMA 1WQMA 1LSEA 2NWDX 223LA 1DI3A 1HEPA 4ETCA 1OV5A 1T6HA 3CT1A 1LYYA 1L28A 248LA 6LYZA 1P46A 1L82A 3OE0A 5DLAA 3GUMA 254LA 191LA 1ALCA 4W94A 1B7NA 2HULA 3DN4A 1C45A 1HENA 1QQYA 3TMXA 1DYAA 4LYOA 3ATNA 3UONA 4H8YA 4HTQA 1JISA 4W55A 1RCMA 3TXGA 1G06A 2B7XA 3HTGA 1L32A 2RAZX 1LZTA 1QTHA 108LA 1C67A 4NGZA 1C64A 2I6ZA 2OU8A 1C68A 4N1CC 1L65A 147LA 3ULRA 1HELA 2F4GA 1L33A 160LA 2EKSC 1REZA 1GXV2 3B0KA 1C7PA 1HFXA 2CDSA 2Z18A 1GB9A 4NHIA 4WM5A 1L48A 1YL1X 4II8A 1C66A 3FI5A 1IEEA 1L46A 4ANRA 2ANVA 2AUBA 190LA 153LA 1L99A 4DQ7A 4NG8A 4DD9A 1G7MC 4S0WA 4J1AA 2W1MA 1L73A 4EKSA 1C6CA 4I7QA 3C7WA 5B1FA 4YEMA 1D9WA 1VATA 1L08A 232LA 3LZ2A 1CV1A 1HF4A 173LA 1AKIA 1LZDA 2D4IA 4I7OA 1LTMA 4ETAA 3EXDA 1GF4A 2BQMA 3SBBC 4G4HA 150LA 1OVJA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1B5U A;  4HTK A;  1H6M A;  3EBA B;  1FLY A;  1YKY X;  4WG7 A;  4HSF A;  1GAZ A;  1LZ5 A;  3RT5 X;  3WUN A;  3CSQ A;  4EMN A;  1CNS A;  5KXK A;  4XEN A;  5HNC A;  4UWN A;  3BKH A;  5DN5 A;  2H5Z A;  1LZS A;  1I1Z A;  4ZFP A;  1GFE A;  3P65 A;  1LMP A;  2MEI A;  4KPM A;  4AXT A;  3FE0 A;  5DN4 A;  2A7D A;  4DWX A;  1IP5 A;  4UWV A;  2MEE A;  4FJR A;  4KXI A;  1DXJ A;  1LJ4 A;  5LAG A;  1B5W A;  4TUN A;  1LHL A;  1OUC A;  3GXK A;  2ZIJ A;  5LIO A;  1UIF A;  5K7O A;  5HMV A;  1KIR C;  5FDJ A;  4WM6 A;  1JSE A;  3QY4 A;  4LYM A;  1BQL Y;  1DPW A;  1LZ1 A;  2MEA A;  1LSP A;  1A2Y C;  1FKQ A;  4NWE A;  1C10 A;  3F6Z A;  1XGT C;  5DM9 A;  3QNG A;  1T3P A;  1VDT A;  2X0A A;  5KXY A;  1WQM A;  5M1Y A;  1LSE A;  5B59 A;  2NWD X;  4TSB A;  1UIA A;  4N1E I;  1HFZ A;  2I25 L;  1DI3 A;  1HEP A;  4ETC A;  1LZN A;  2BAA A;  1LZY A;  2BQO A;  1TEW A;  4LYZ A;  1HNL A;  3CT1 A;  4U3X B;  1P2C C;  1LYY A;  2HED A;  3RNX A;  1GE3 A;  3LYO A;  5F81 A;  1REY A;  3A6B Y;  1ZMY L;  2W1L A;  6LYZ A;  1GDW A;  1G7L C; 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 2VB1 A;  4PPO A;  2Q0M X;  1XEJ A;  4WM2 A;  3WU9 A;  3CSR A;  3WW6 A;  3A94 A;  3HBH A;  1B7L A;  4WO6 A;  4WM1 A;  1B7R A;  5HLL A;  2IHL A;  1N4F A;  5F16 A;  1LYZ A;  5KXX A;  2MEF A;  4M6D A;  3OK0 A;  1REX A;  1EQ4 A;  4FDY A;  4IJ4 A;  3B0I A;  1LSG A;  4WLY A;  2BQH A;  5HMJ A;  2GV0 A;  5IHG A;  1D0M A;  1BB5 A;  5LA5 A;  1LJF A;  1REM A;  194L A;  3TXI A;  1B5X A;  1CKH A;  3VWO A;  4OWH A;  1WTN A;  1XEI A;  1YAN A;  3B6L A;  4G9S A;  7LYZ A;  4GLV A;  1B7O A;  1GFR A;  1GF6 A;  1LJH A;  1RFP A;  1GF7 A;  4HJY A;  5IDD A;  4HP0 A;  3RU5 A;  4DD2 A;  5A3Z A;  4ZIX A;  1IWT A;  2G4P A;  3M18 B;  4NWH A;  4QY9 A;  2C8P A;  1GB8 A;  2D91 A;  5LXW A;  1B5Y A;  1E8L A;  4WMG A;  1B7P A;  3CT0 A;  4Z41 A;  1IR8 A;  5F9X A;  2YBJ A;  1GAY A;  3TXH A;  4TTD A;  1IOQ A;  1DPX A;  3LYM A;  2XTH A;  3WH1 A;  5FEL A;  5B05 A;  5I5Q A;  4WLD A;  3AW6 A;  1VDP A;  3AGI A;  1F10 A;  4LYB A;  5FST A;  1F0W A;  1LAA A;  1QTK A;  2ZIK A;  2EQL A;  4TWS A;  1NF5 A;  1UUZ C;  5D5C A;  5EBH A;  4M4O A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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