4DFBA

Crystal structure of aminoglycoside phosphotransferase aph(2")-id/aph(2")-iva in complex with kanamycin
Total Genus 98
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
98
sequence length
299
structure length
297
Chain Sequence
MRTYTFDQVEKAIEQLYPDFTINTIEISGEGNDCIAYEINRDFIFKFPKHSRGSTNLFNEVNILKRIHNKLPLPIPEVVFTGMPSETYQMSFAGFTKIKGVPLTPLLLNNLPKQSQNQAAKDLARFLSELHSINISGFKSNLVLDFREKINEDNKKIKKLLSRELKGPQMKKVDDFYRDILENEIYFKYYPCLIHNDFSSDHILFDTEKNTICGIIDFGDAAISDPDNDFISLMEEEYGMEFVSKILNHYKHKDIPTVLEKYRMKEKYWSFEKIIYGKEYGYMDWYEEGLNEIRSIK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/antibiotic
molecule keywords APH(2")-Id
publication title A small molecule discrimination map of the antibiotic resistance kinome.
pubmed doi rcsb
source organism Enterococcus casseliflavus
total genus 98
structure length 297
sequence length 299
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-01-23

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01636 APH Phosphotransferase enzyme family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dfbA01
3.90.1200.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 Aminoglycoside 3'-phosphotransferase; Chain: A, domain 2 4dfbA02
1I09A 1Q4LA 2X8EA 5M44A 1PY5A 3NWWA 3VBXA 3CIKA 2PVMA 4PMTA 4DG3E 4N4SA 5AV2A 4OTRA 2IW9A 3MY1A 3TTIA 5EHYA 5L3AA 3ODYX 2XIZA 5TT7A 3ZYAA 4F7LA 5D10A 3KMWA 5CAOA 5M07A 3DJ5A 4DHFA 4UYAA 1XKKA 3R63A 1BKXA 4IWDA 1YQJA 4LOPA 2BIKB 3E7OA 3LCKA 4PF4A 3NYNA 5KMOA 3GENA 3UG2A 4RPVA 4TYGA 5HZNA 4QMQA 1GAGA 4ENYA 3KKVA 2WQOA 3MB7A 4ZIMA 5IDPA 3BQRA 1SZMA 5IQFA 2ZVAA 5E1SA 4ZZMA 3HV5A 3TNPC 2XA4A 4IANA 4KINA 5EG3A 5E8SA 3A7HA 5E8UA 1JKTA 2PTKA 3ZH8A 3AC2A 4FIGA 3UJGA 3ORTA 1PMEA 5DR9A 5E90A 4CD0A 5L2SA 2B9FA 3Q2MA 1R0PA 2C6OA 4EYJA 4UWCA 5JK3A 1KSWA 2PE2A 4R1YA 4BICA 3S0OA 3G51A 3PXRA 4PDOA 2XBAA 2ZJWA 5K4IA 1YXTA 4YJTA 4P4CA 4WZYA 3ETAA 2UW9A 2BZIB 3HX4A 2PMOX 2R5TA 2P2HA 3O51A 4L3LA 4NL0A 3WOWA 4MXOA 5AAFA 2C6LA 1W83A 3RHXA 2BDFA 1W82A 3RK7A 4JT3A 4IX6A 4NCTA 5A4TA 1YW2A 2VTOA 2H34A 3E8NA 2OH4A 1LUFA 1NVQA 3PIXA 3VBQA 4YTFA 2W9ZB 3BX5A 5HIBA 3LFAA 2YZAA 4G3CA 2XNPA 2CN5A 3MFSA 4RWJA 3HUBA 3Q4TA 4AE9A 4ACGA 2V55A 4BRXA 3C4XA 4I21A 3CQWA 4GCJA 4NSTA 4O38A 2X81A 4GK2A 4UY9A 4YC3A 4KWPA 4L67A 1PXPA 2GDOA 2VTHA 5CXHA 1JBPE 4I0SA 5KHXA 4N70A 3R7EA 2C0OA 2XP2A 5L8JA 4Y85A 3D0EA 3P23A 2FA2A 4J71A 5EW8A 3H0YA 4J95A 5JEBA 4J8NA 5AIKA 4AF3A 2UZEA 3GFWA 4D0WA 2VTSA 2X2KA 4LMNA 3ULZA 1XH5A 1XR1A 4YBKA 4FTQA 4DF3A 1XBAA 3CD8A 3DZOA 4TL0A 3R9HA 3U51A 3EKKA 3AC8A 2YWPA 4IZ7A 3WI6A 2WMUA 5CEPA 3NW7A 3NVKI 4EONA 4L00A 2XBJA 3SRVB 5AP7A 3BEGA 5C01A 4RIWB 5ANIA 2V0DA 4NM7A 4XP0A 2O65A 3MFUA 5DG5A 4DH8A 2X6DA 3DFAA 2UZDA 3ACJA 1L8TA 4LG4A 5DHJA 3TUDA 1E1XA 2J5EA 4BN1A 2W06A 1F5QA 2H9VA 2QOLA 3EFLA 3I0QA 3R1NA 4N6ZA 2JDOA 3AMYA 4R7IA 4LM5A 2UZBA 2B9HA 2EWAA 3JXWA 3OT8A 4ASEA 5AUUA 2WTKC 3UQGA 3UIBA 3EMGA 4HCTA 4GVJA 4HGTA 4JS8A 4XHKB 4QP1A 3W0QA 5IH4A 3KGAA 3WZJA 4V0GB 3P7AA 3LAUA 2CNUA 2ITVA 2E9OA 2VWVA 2CNVA 4RIOA 3GCPA 3VS2A 5IU2A 3ZHPC 4O82A 4I24A 4USDA 3SX9A 3SOCA 3ZXZA 5CF4A 3SVVA 3PDTA 4R6VA 3ZZWA 3ZOSA 2YHVA 3HNGA 3VS1A 3ZEPA 3O7LB 4RT7A 3PY1A 4V01A 4DGOA 2GFSA 3BU3A 4GG5A 3LQ3A 5G6VA 4D28A 5BNJA 5K5XA 5CQWA 3A2CA 3RZBA 4CT1A 2W1EA 5AP5A 3LCOA 3QQHA 1H24A 3NAXA 2C6MA 4O86A 4GU6A 4A07A 3MVMA 4CGAA 2C6IA 3QKMA 4FTRA 3ZC5A 3TNWA 3AT3A 3ZFYA 1Z57A 4YTHA 3FLYA 3LCDA 2CN8A 4OTIA 4TRLA 4DH7A 3C0HA 4FSNA 4LV5A 1WBPA 4O0YA 4R5YA 4P90A 4JRNA 4DITA 3KN6A 2BZHB 4F9WA 4UX9A 4EH9A 3A99A 5HEZA 4ZLOA 4FL3A 1G8AA 4ONAA 4QYYA 4MXCA 3NUUA 4TYIA 3FKLA 4KUJA 3EH9A 3FEGA 1U4DA 4E5BA 4EH8A 4FV7A 2QG5A 4EKKA 4NIFB 1OL2A 4LV8A 4W8EA 3ENMA 3UZRA 5F9EA 1U59A 1GNGA 2BRGA 4FV0A 4DEHA 3ZUTA 4FNZA 3MPTA 4H3BA 1CM8A 5HIDA 2QO9A 4JRVA 5A3XA 2IO6A 3PSCA 4F09A 5CWZA 1QL6A 4U3ZA 2IN6A 1SNXA 2ONLC 2EXCX 3OMVA 3PPZA 2VU3A 1Q97A 5DOSA 4IEBA 4K11A 4ZZOA 2YM5A 3BIZA 3F7WA 3NNXA 5HLWA 3ZO1A 3TT0A 3MI9A 3IGOA 4IM3A 2HZIA 2V7AA 3FY2A 3HKOA 5CSXA 3BQCA 2PE0A 2JKQA 5HKMA 3T3VA 3TXOA 3DB8A 4I5PA 3BHTA 4AFJA 3PWYA 3EYHA 4BBFA 3R8UA 2F9GA 4GJ3A 4F0FA 2WMTA 3HGKA 2FO0A 1NA7A 3NPCA 4F64A 4QP6A 3QTQA 4JI9A 3SQQA 3LXNA 4DINA 5EOLA 2IPXA 3FMLA 4AXAA 1E1VA 5CU0A 2J0JA 3C7QA 4FTAA 4RGJA 4L7SA 3WF8A 1AQ1A 2W5BA 4MYGA 4QMUA 1YRPA 5KMJA 3IOPA 5B0XA 3TUCA 1QCFA 2VWIA 3N4TA 3LLTA 4O0RA 4FT7A 4XMOA 3OUNB 4F6UA 5AWMA 5HVJA 2ZM4A 3PRFA 1VYZA 3VQUA 3FI8A 5KBQA 1YHVA 5BYLA 3UG1A 2JFLA 5KHWA 4O7OA 3GCQA 4O7PA 3D5WA 4XG2A 3JVRA 2PVYA 5E8WA 1Q8YA 4G3EA 4AP7A 3D4QA 5HTBA 4TPTA 4HNFA 1UWJA 5FRIA 4DFNA 1IRKA 3Q9ZA 3D94A 4OT5A 2ITUA 3TZ7A 4CFVA 5HHWA 4YC6A 4GIIA 1M17A 1PYXA 2F7XE 4UBAA 3IG7A 1PXOA 3K5VA 5CSWA 2ITXA 4LMUA 4U94A 1URCA 2YDJA 5TO8A 3ZSHA 4X21A 4BIEA 1JPAA 3UNZA 2ITZA 4RSSA 2QR8A 2JDSA 4IZ5A 2BPMA 1ZYCA 3QD0A 3ALNA 4EH2A 5IQDA 1ZWSA 4RQVA 5C8MA 2YCRA 4EUUA 3QHWA 2PMNX 2FUMA 3V04A 4EK5A 4XV9A 3W8QA 4ZY5A 2QOKA 1H27A 4HYIA 2R0UA 2C69A 2OIDA 2VN9A 5JRSA 5M51A 2E2BA 5F1ZA 3UPZA 4FKTA 3SHEA 3M2WA 1FVRA 1XHAA 5CU3A 4BIBA 4FT0A 2DS1A 5EH0A 4QMXA 3SA0A 3LCTA 4BDCA 3FY0A 3I81A 4TNBA 2UUEA 1BI7A 2BHEA 2FYSA 2PK9A 2WOTA 2WQMA 4PWNA 5IQBA 3VBYA 2R3MA 1KE7A 1SM2A 4DEEA 4F9CA 4F70A 3AC4A 4YZCA 3HMOA 5JGBA 5HBJA 3P78A 1E9HA 1I44A 3ZRKA 2QU5A 4ZZNA 3ZRLA 1FOTA 4XRJA 2GNGA 4AN9A 4QMVA 4GKIA 2UV2A 2BZKB 1JKLA 4CFMA 3DQXA 1OUYA 4RIYA 3A61A 3QLFA 4DEGA 3R8LA 4QQ5A 3C0GA 2VO7A 3QYZA 2YA9A 3GC7A 4FVRA 4LQMA 3W33A 1KE9A 4I94A 3VW8A 4RJ7A 5L2IA 1J1BA 1WBTA 4CVAA 3A7IA 2C5NA 3F2NA 5FD2A 4BHZA 5FXRA 5LWNA 3PLAE 4A06A 2J51A 2I7QA 3E88A 3WE4A 3DKOA 1WBWA 4JDKA 3LQ8A 3UVRA 3R6XA 5AAGA 4QMZA 1WMKA 3HV3A 1UU3A 2KTYA 3EFKA 3FXWA 2IG7A 2R3LA 3E63A 4EK3A 5LMBA 1DI8A 3EQGA 3ORNA 5HVKA 4K1BA 1T46A 5BQ0A 3RINA 5IA5A 3RK5A 3FMEA 4F65A 3TJDA 1YI4A 2QOIA 2ZM1A 2PZ5A 4FIHA 5CI6A 4AN2A 4BHNA 4E93A 1YWVA 2Z02A 2XK8A 4AWIA 2IVTA 4EEVA 4FSMA 3PY0A 4GT4A 3EN7A 2Y4IB 3BWFA 5HE0A 1OIYA 2GU8A 2UZVA 2VTIA 5C8NA 3QAME 4RG0A 1JLUE 5EM8A 3D5XA 3DCVA 3DB6A 3LHJA 3MSSA 3S3IA 2BFXA 3PP1A 4BDHA 4YSJA 3OBJA 2Z7SA 4KS7A 2YZLA 2HELA 3PE1A 3ET7A 2A2AA 5DA3A 4YPSA 4EOQA 1GZNA 3BGQA 3LPBA 4ID7A 4DT8A 2GS2A 1CKIA 1LP4A 5HE2A 3AT4A 1YKRA 3ZTXA 3F7ZA 5CT7A 4JG6A 4BDDA 2IWIA 2ZM3A 4EBWA 2GNLA 1BMKA 3RPRA 3LXLA 2ZAZA 4I0TA 3OUKA 4PUZA 4AOJA 4CMOA 3QUEA 3Q2JA 4DTKA 3FL5A 5EDRA 2RFNA 4I4EA 3ZLYA 3GQIA 2Q83A 1MQBA 2YJSA 2Y6OA 3PTGA 3M1SA 4C4JA 2WMBA 4E6AA 2PWLA 3FSKA 5AV0A 2WNTA 4AZSA 4EHGA 4GSBA 4OTGA 2QOHA 4BZOA 2YFXA 2HWOA 4IB5A 1GOLA 2P4IA 2PZRA 5J87A 4YHFA 3KQ7A 5TR6A 5EW9A 4BY9E 4IVBA 4W4WA 3CTHA 2Z7LA 4G5PA 5ITAA 3R8ZA 3VS5A 2OZAA 4P5ZA 4XCUA 5IISA 2OF4A 3DLSA 3R1QA 4ITJA 2WTDA 4V04A 5AMNA 4EC9A 2C4GA 4D1ZA 4BI2A 2OSCA 2R64A 4GFGA 4TWOA 1BL7A 3FKNA 4CFUA 2HAKA 2VWBA 3IW6A 2VX0A 2JIVA 4YLLA 5EOBA 3CSVA 3MJ2A 5FG8A 4EHVA 3ANRA 4EOJA 4XG3A 3E8EA 1SVHA 3LLAA 3OXZA 2IW6A 3P0MA 3QRJA 4NK9A 1BL6A 1JSUA 2VGOA 4XX9A 4RRVA 3W0NA 1XBCA 3BBWA 4RX7A 4MQ1A 4XP3A 4IX3A 3CEKA 3BYVA 3FQHA 4TWCA 3R9DA 4YU2A 2WEIA 2V7OA 2R3KA 3QA8A 2PUIA 4ZY4A 1BX6A 4FTJA 3MVLA 4ENXA 4CZTA 3VF8A 3RHKA 3ENHA 4O0TA 4ZTNA 4MD7E 3MESA 2P3GX 2VAGA 2CLQA 2VO3A 3DDPA 4WD5A 5CF5A 5CI7A 2IW8A 3ZDUA 3ZBFA 3PXYA 4KBAA 4MX9A 2E9VA 2WELA 4RZWA 1ZMVA 2HXLA 2FGIA 4TYHA 4U44A 2XCKA 1KE5A 2YM6A 4X2GA 4S30A 1IAHA 4FIFA 3FC1X 4RJ3A 4S33A 2PU8A 5DH3A 3V5LA 1Q62A 1XJDA 2C5XA 5BVEA 4F9BA 3U4UA 3PVWA 3D2KA 4M12A 3TDWA 2VTRA 3G15A 3ZM4A 4F1MA 4ZS4A 1J3HA 2CDZA 1YDRE 3QUPA 1KOBA 3W2QA 4CTBA 2H8HA 3KA0A 4XBRA 4UWYA 3TTJA 3DTWA 3EQIA 4CFWA 4C3PA 3I5ZA 1XWSA 3R21A 4X3JA 4FV1A 4NW5A 3H0ZA 4Q9ZA 4E4MA 3NYXA 4Z55A 3NNWA 4FBXA 4QQCA 4BB4A 5DLSA 4EQCA 3NR9A 4RFMA 2PVJA 2R3QA 5TF9A 4YUQA 5BX0A 5LVLA 4U43A 5L6WL 3E92A 4BDIA 4D4SA 1B39A 3R2YA 2Z7RA 3CP9A 4JX3A 4R3CA 4E5AX 4U42A 3V5TA 1MRVA 3OT3A 1Q41A 1PXKA 3PJCA 2G9XA 3HAMA 3PZHA 3A7JA 1H08A 3EN5A 2WZJA 3ATTA 4ZXTA 3UP7A 4GYIA 1YI6A 1URWA 3AD6A 4C36A 5JZJA 3PG1A 4FKVA 4PTEA 2DQ7X 2XIRA 5AUYA 5CEKA 2NPQA 5D12A 5FXSA 4O21A 3E93A 4RX8A 4C4HA 2QD9A 3WE8A 4FYNA 4DFZE 3CPBA 4WG5A 2XEYA 4O81A 2G15A 3QCSA 4AOIA 4CCBA 4C37A 3FI4A 3GT8A 3NIEA 3ATSA 2UW6A 4TWPA 2R3JA 4X2NA 4QP3A 3C4ZA 4CFFA 5AUXA 3CS9A 1KV2A 3QZGA 4RC2A 5E4HA 2AC5A 3MPMA 3PPKA 4QYEA 2JIIA 4IW0A 4YPDA 4FTIA 5EKNA 3V01A 3NNUA 4H36A 3V3VA 3ZONA 2CNQA 5LVMA 4I5HA 2J7TA 4TZRA 3TEIA 3E8DA 3CKXA 4ARKA 3FLSA 4AGUA 4B4LA 5KCVA 4RX5A 4O0SA 2BVAA 5KMMA 4EKLA 3SLSA 2Q0BA 2I0YA 4O96A 4AFEA 4QMTA 4FC0A 3BEAA 2LGCA 4NM5A 4O7TA 3VS4A 4RVMA 4TKSA 3EFWA 4E20A 2C5YA 4RZVA 4C33A 3EZVA 4E5WA 3C4CA 2ESMA 4IM0A 3Q6WA 3ERKA 4QNYA 3ZEWA 4MXZA 3OTUA 3DJ6A 4O7RA 3GC9A 4QP4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 4GKH A;  4IAD A;  1O9U A;  3LMI A;  3R9N A;  3L8X A;  3KCK A;  2QNJ A;  3UQC A;  5CAV A;  4J1R A;  1M2Q A;  3TIZ A;  3VHK A;  3A4P A;  1Q24 A;  4CFN A;  4D4R A;  2OXY A;  3BU6 A;  4UXQ A;  5AIR A;  4A4L A;  4TT7 A;  5CT0 A;  3VUK A;  1M7Q A;  2VNY A;  2QQ7 A;  3PXZ A;  4HVG A;  2X2L A;  4L8M A;  5FQD C;  3QTS A;  3QWJ A;  1L3R E;  4ZS0 A;  3EID A;  2GTM A;  1SNU A;  1XH7 A;  4BCF A;  2W99 B;  1MRU A;  3A7G A;  3F61 A;  4GW8 A;  3TM0 A;  2BTS A;  3F5P A;  3MDY A;  4RJ4 A;  3MYG A;  3FXX A;  3NCZ A;  4Z7G A;  1Q3D A;  5JKG A;  4MHA A;  4G9R A;  3QTU A;  5KZI A;  4AAA A;  4ALW A;  2J2I B;  4KB8 A;  1OPJ A;  1JWH A;  2UW5 A;  4MD9 E;  4D58 A;  4GV1 A;  1IAJ A;  3DGK A;  1XH4 A;  5EW3 A;  4O27 B;  4X3F B;  1KUT A;  3PA4 A;  4BDB A;  3UOJ A;  5IQI A;  3CQE A;  3CD3 A;  5CU6 A;  2ETK A;  2X6E A;  3CGO A;  1NT2 A;  3ZDI A;  3IDC A;  4E26 A;  3ELJ A;  2OG8 A;  2UZW E;  4F6W A;  4WOV A;  1WVX A;  4EOP A;  2FSL X;  3LMH A;  4P5Q A;  2NO3 A;  5A14 A;  4EWQ A;  3FMD A;  2O5K A;  4AU8 A;  2QHN A;  3FL4 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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