4DFXE

Crystal structure of myristoylated k7c catalytic subunit of camp-dependent protein kinase in complex with sp20 and amp-pnp
Total Genus 113
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
113
sequence length
350
structure length
347
Chain Sequence
GNAAAACKGSEQESVKEFLAKAKEDFLKKWETPSQNTAQLDQFDRIKTLGTGSFGRVMLVKHKESGNHYAMKILDKQKVVKLKQIEHTLNEKRILQAVNFPFLVKLEFSFKDNSNLYMVMEYVAGGEMFSHLRRIGRFEPHARFYAAQIVLTFEYLHSLDLIYRDLKPENLLIDQQGYIQVTDFGFAKRVKGRTWLCGTPEYLAPEIILSKGYNKAVDWWALGVLIYEMAAGYPPFFADQPIQIYEKIVSGKVRFPSHFSSDLKDLLRNLLQVDLTKRFGNLKNGVNDIKNHKWFATTDWIAIYQRKVEAPFIPKFKGPGDTSNFDDYEEEEIRVINEKCGKEFTEF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Transferase/transferase inhibitor
source organism Mus musculus
publication title Role of N-terminal myristylation in the structure and regulation of cAMP-dependent protein kinase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit alpha
total genus 113
structure length 347
sequence length 350
ec nomenclature ec 2.7.11.11: cAMP-dependent protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dfxE01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dfxE02
4IBMA 3QCXA 4IVAA 4CFUA 5KNJA 1OL5A 2B0QA 5B2MA 3KB7A 4CFMA 4YZMA 4UEUA 3A62A 3CS9A 2W1DA 4FZDB 3UBDA 1ZYLA 3SLSA 5JFWA 3PWYA 3QLGA 4BIEA 5I9VA 1UU7A 4O0TA 2XMYA 4DH3A 3SGCA 3JVRA 4BF2A 5A3XA 1PKDA 4IADA 4ACHA 3GQIA 2GNHA 5EH0A 3MFUA 3O8PA 1XR1A 3BCEA 3QKKA 2CKEA 3TNPC 3GNIB 4R8QA 4W4VA 4YUQA 3B2WA 2HZIA 4NT4A 4QTEA 3AXWA 3F7ZA 3L8SA 2H6DA 5ANJA 3AQVA 4ASZA 5LCJA 3L8XA 2W96B 5ANOA 4DH1A 3KRLA 4D1ZA 5EQYA 4DCAA 4DE4A 4D2SA 4YTCA 4LQMA 4I3ZA 4DEBA 5EM5A 2B7AA 2VWVA 2VNWA 3OW4A 4BCOA 4JX7A 4O6LA 5IA5A 4P2KA 3Q4CA 3KCKA 1PF8A 4FV9A 1Z9XA 4M66A 4QMLA 3CTJA 2GNFA 3WZEA 3HMOA 5HBEA 1YDTE 3OWJA 3DKFA 5AV4A 4JG6A 4F9AA 2XIKA 3VS2A 5K0XA 4BB4A 5T3QA 2R3JA 3FKOA 4BCIA 1KV2A 4F9YA 2IO6A 1Q8YA 1IASA 5HD4A 5J9LA 3R1QA 1YHSA 3R1SA 3RPOA 3CGFA 3C4XA 3PP0A 4BBEA 3KULA 4NM0A 2Y7JA 3GUBA 1OI9A 3QC9A 4N6ZA 5ACKA 3W16A 2XJ1A 3UG1A 5M56A 4X6RA 1VJYA 3AMAA 3SG9A 1FOTA 2W1FA 1FQ1B 4TWCA 2X7FA 4O81A 2R3QA 3WI6A 4LUEA 3ZH8A 5KMLA 1YXSA 4D2PA 3OTUA 4ZTNA 4O0WA 1PYXA 5LCKA 2C3JA 4DTBA 3COKA 1UNGA 4FYNA 3FPQA 5CALA 3R2BA 5IH6A 5KMNA 5E4HA 4AS0A 4XG8A 3BWJA 3LM0A 2HXQA 5HX8A 3OWLA 3UO5A 4RFYA 4YJTA 2X9EA 2VGOA 3MTFA 4ENXA 4CTCA 3ROCA 3ZO1A 3IGGA 1ZLTA 5AR3A 1YHVA 5IU2A 3CC6A 4J98A 1HCKA 4O6EA 5TOZA 3LXKA 4FKSA 5IH4A 3F5GA 3KRRA 3K54A 4KAOA 3FMEA 3ZXZA 4ANNA 1XKKA 3EZRA 3IECA 2WMAA 4KIKA 4PPBA 2C5XA 4GV1A 4U0IA 4QTAA 1E9HA 3F2RA 5KMIA 2BROA 3MW1A 4IX4A 2ERZE 2QOQA 4BFMA 2F9GA 2W1ZA 3MPTA 3BRBA 3LW0A 3OUKA 3P0MA 4XLIA 4FA2A 4CYIA 1SYKA 1NXKA 2G2FA 3FXZA 4M13A 4XP0A 1L3RE 3TZMA 3MV5A 4U41A 3U6HA 4BIBA 5HO8A 2W4OA 4GUBA 1FVTA 2R7BA 4D2VA 1NY3A 2XKDA 3RALA 3ID6C 5HE3A 4DFUA 3KVXA 2OG8A 4FK6A 4FSUA 2QO2A 4TWPA 5JZJA 4RLKA 5K9IA 2XNGA 5IA4A 5L8LA 4Q5EA 4HGTA 3WE8A 5GIOE 3HNGA 3HYHA 2V7OA 2REIA 5AP6A 3OG7A 2BKZA 3GXLA 3ORNA 2WELA 2WMBA 3P7AA 5HBHA 5F9EA 3LCSA 3HGKA 4BCNA 2RIOA 3R6XA 3KY2A 2VTHA 3BELA 2ZV8A 4JG7A 2R3NA 4A9RA 4RQVA 4M7IA 3QL8A 4QRCA 1ZXEA 5CF4A 4R1VA 2HOGA 3BX5A 4CMOA 3G9NA 1Q61A 2XKCA 3RVGA 3SXSA 5IQDA 4RT7A 3T8OA 3HDMA 4ENYA 3QKLA 3BEAA 1IEPA 4QP6A 1Q8WA 4X2JA 5ACBC 3KU2A 3FZTA 2F7EE 4C33A 4DCEA 2E9NA 4FE2A 1ZY5A 2ZV2A 4ERKA 3POZA 4RVLA 5EQEA 5EYMA 4YO4A 5J9YA 3Q3BA 5EM8A 5EOLA 3ZBFA 4GIHA 3MFTA 4H36A 4O0SA 5D41A 5CU2A 5EW8A 5KZ0A 3ZOSA 2YEXA 3IOPA 2R5TA 1YW2A 3LFSA 4AG8A 2C5YA 2IZUA 3ZZWA 1H1QA 5DN3A 2ITNA 4EH8A 4GK2A 1JKTA 5CEIA 4MYGA 4YC3A 1JWHA 4CSVA 4CMTA 4LM5A 4TNDA 4BDAA 2JIUA 2RFDA 3R8PA 1U54A 3I7BA 4BGHA 3HRBA 3AC1A 4O83A 3QC4A 2C47A 4DH7A 1V0OA 4FTJA 4RIYA 1X8BA 3E5AA 4XLVA 4ZSEA 2GQGA 4I94A 3RCDA 3TZ7A 4LUDA 3DA6A 3C0HA 4F99A 3F3TA 3ORLA 5C8NA 5HGIA 1KWPA 2BZIB 4OAVB 4U42A 2X81A 3NUAA 5J5TA 4N4SA 2OIDA 3SKCA 1ZMUA 4G5PA 5IA0A 5ETFA 5CSPA 1OPLA 2YITA 3KRWA 3P23A 4CKJA 2A0CX 2OF4A 3LVPA 5EI6A 1SZMA 3CXWA 3GCUA 2BAJA 3Q5ZA 3WF6A 3JUHA 4I0RA 3VULA 2QONA 2J0JA 4RBLA 2VAGA 5FGKA 5J87A 2WMRA 4FKIA 4JBPA 5DT0A 5EYCA 4PDSA 2XRUA 3TG1A 4KBAA 3QRIA 4HGLA 3TNWA 4A9YA 4ZY4A 3PE2A 5BUIA 4ALVA 4OTFA 5AUUA 3LXLA 3CR0A 2G01A 3QQFA 5I9XA 4BY9E 3IONA 1M2PA 3UNZA 3QTUA 4XP3A 1OPJA 5L6WL 4RGJA 3UVQA 2NO3A 3C4WA 1WVWA 2JKQA 3MGYA 4IB1A 2UW5A 4DITA 4O38A 1WAKA 3P5KA 4MHAA 2UZEA 4AN2A 3EN6A 4QNAA 4C4EA 3C7QA 4DEEA 3LFDA 3BU5A 3CIKA 3R21A 4J8MA 4C3PA 3ERKA 4WBOA 4GJ2A 2ITTA 4HPUE 5LVOA 3QUPA 5AAEA 5CF5A 3OS3A 3OW3A 2W05A 4TWOA 1W98A 4XV2A 4E7WA 1OL2A 3UVRA 4FOBA 4O1PA 4D0WA 3EQGA 3CE3A 4IDVA 4CZTA 4DEIA 4G9RA 5F1ZA 3EJ1A 4EKLA 1NT2A 3EN7A 4JR7A 4U45A 4C4IA 2QOHA 4TRLA 2E9VA 2UW8A 5FQDC 3HL7A 4UBAA 3E87A 4WD5A 3GC8A 3KCFA 4RVMA 5AJQA 4FIIA 5A9UA 2W1GA 3VUKA 2WMWA 4FSTA 4M15A 4WNOA 2J7TA 3UOLA 5L2QA 3P7BA 2VTRA 2C30A 3F61A 5GJFA 1ZWSA 4FV2A 3WF5A 3ZDIA 4CG8A 4DF3A 4JDJA 4PWNA 3GVUA 4E93A 2X1NA 4IWOA 2JFMA 1REKA 4CRLA 3UIUA 2DQ7X 4GG5A 5CAOA 2OJFE 3FL4A 3G33A 4AW1A 4TN6A 4ZJVA 5GZ8A 3F69A 4X3FB 4HNIA 3GB2A 4FR4A 4XHKB 4UZHA 2PMIA 2RKUA 3FC1X 3ZO3A 2XRWA 4Q2AA 2YJRA 2DUVA 3OXTA 3JXWA 1CTPE 3FXWA 4LV8A 2Z60A 4PL4A 5I4NA 4NYEA 1GZNA 4TZRA 3O17A 3QFVA 4FT9A 5HCYA 3VJOA 4BHNA 5AA8A 4USFA 4FNZA 3UYTA 3Q52A 3QRTA 4EK5A 4QMQA 1URCA 4E6AA 3AD6A 4U3ZA 2ZB1A 5HICA 4TY1A 3ACKA 3OOMA 3LPBA 1PY5A 1ZAOA 2GHLA 3KXGA 3GOPA 3KRXA 3WF8A 3Q9YA 2PL0A 3ATTA 2W7XA 2PE0A 1L8TA 4EQMA 3FPMA 3E88A 3GT8A 3UZPA 1KE8A 3OY3A 3V8WA 3R9HA 2FA2A 2QI8A 1Z5MA 4GVAA 3IW7A 3DK7A 4XNEA 2DS1A 1FGKA 4OT5A 2ITQA 4A9UA 4AT4A 4JQ8A 4DC2A 2J0KA 4J8NA 2BVAA 3TZ8A 5A6OA 3ODYX 1KUTA 2PU8A 4FSNA 3BEGA 4BBMA 2WMTA 4FK3A 5HCZA 4YC6A 2IJMA 4EHEA 2CCIA 1CSNA 3BYUA 1CKJA 4HNFA 4YLLA 5ITAA 1G8SA 5CSHA 2Y0AA 2HY81 4M67A 3WIKA 3FY2A 5GJDA 2BRNA 2GQSA 1MP8A 2QVSE 2XEZA 3I6UA 2A1AB 2P33A 3TI1A 4AP7A 3ZRKA 3HLLA 2GPHA 3QYWA 4EOKA 3Q6UA 3EFLA 5AEPA 3ZLWA 3TKHA 1Q8TA 2LAVA 4I20A 2Z7LA 2QCSA 4ZZMA 1PXKA 3MH1A 1OUYA 5G6VA 3PJCA 5AUTA 3BYMA 1ATPE 2OIBA 1R78A 3CP9A 3VBVA 1ZOGA 4EC9A 3G6HA 4AZEA 3FBVA 4EKKA 4FTQA 5D9HA 5TT7A 3W2RA 3C5IA 3A4OX 4HZRA 2FSMX 3HUBA 5FLFA 1M2QA 4IEBA 3DJ6A 3MN3A 4J1RA 3L9LA 2F57A 5EFQA 4AW5A 5CXHA 2RSVA 3A7GA 4FIJA 4LL0A 2XNOA 4FSRA 3KULB 4QMNA 4O21A 1UV5A 3MFRA 3ZBXA 5GZAA 1XH5A 3MVJA 3KL8A 4UMPA 4DG3E 3V5LA 5CEOA 2YAKA 3A2CA 2UZTA 3HV3A 4JQ7A 2YWPA 4K8AA 4XBUA 2GTMA 4XG7A 4ANOA 4EOIA 3DT1A 3NYXA 4Q5HA 2J4ZA 2QD9A 4JX3A 4UV0A 3E64A 5LVLA 2YA9A 3S95A 1IA9A 2H96A 3MH0A 4DAWA 3D5VA 5HKMA 3RNYA 1IR3A 3VC4A 5LXMA 4O7TA 2OH4A 1JAMA 3VO3A 5AX9A 3BQCA 2UZBA 1H26A 3WILA 4JG8A 3L1SA 1UKIA 3BU3A 5CEQA 4DFLA 5ANIA 3SAYA 1UKHA 5CU3A 3ZXTA 2R3FA 2IPXA 5BVNA 1GAGA 3TNHA 4LRKA 2ZYBA 3DXNA 3EMGA 4MF1A 3ZM9A 5T6KA 3HV5A 3PVUA 4PTEA 3VNTA 4D4RA 4EYJA 2O0UA 3P4KA 3QGWA 4IB3A 3PXZA 2CMWA 4KS8A 4W8DA 1OIUA 3VWAA 1VYWA 4XG4A 3QTZA 3PE1A 3SA0A 5E9EA 4FKUA 2Y9QA 3I5NA 4J71A 4B4LA 5IPJA 4CGAA 3VRZA 4KIKB 4O7RA 3S0OA 3CSVA 4O86A 4MVFA 2BCJA 2GQRA 4QP1A 4XMOA 2PMNX 1PMVA 2AC3A 2GNGA 4MBLA 4NWMA 4ACDA 5JT2A 3DNDA 4JQEA 5CTPA 5LVMA 1ZZ2A 3QCSA 2QLUA 2EXMA 3NCGA 2P2HA 3DJ7A 4YJRA 5BQ0A 1V0PA 2BHHA 4OTIA 4WG4A 4EHZA 3UQCA 3WF9A 1O6KA 2QOIA 4D28A 2Z7RA 2YM5A 4QO9A 5BVEA 4NIFB 4D5KA 1WBWA 3GFWA 5F95A 1UNLA 4ALWA 4BCFA 3R73A 3UZTA 5CXZA 4V0GA 2UZVA 3HP2A 4FV6A 3VS0A 3S3IA 2ZDUA 3DOGA 5CZHA 4G17A 5HD7A 3OC1A 2CHLA 2QKWB 4CFNA 1O6YA 4GH2A 1CM8A 4CFWA 3IDBA 4XBRA 4L43A 4FTIA 4Y5QA 4DEDA 4MX9A 2VV9A 4YJPA 1FBNA 2F4JA 4G3FA 3R7VA 5AADA 3AC2A 3QQKA 1Q99A 4ALUA 5KBQA 3EQPA 4GFMA 1NVRA 5JFVA 5IH5A 3UMWA 4NKAA 3MIYA 3F7WA 4FUXA 4I4FA 3ZONA 5IQBA 4I6BA 5AIRA 3CQUA 3R7EA 1G8AA 4G9CA 1J1BA 2GS6A 3MI9A 5BMMA 4F1TA 5FBOA 5CENA 3V51A 3PXYA 3W2OA 3QRUA 5IQIA 3H0YA 4W4WA 2Q0BA 5AP0A 1FPUA 2YCSA 3R02A 1OIQA 4FV5A 1S9IA 5HG8A 5E91A 1PKGA 4ANQA 4E4XA 2Z2WA 4R77A 4FKGA 4U44A 3MVHA 4QYGA 4X3JA 5FM2A 1LR4A 3W1FA 4BDCA 1GIIA 3HUCA 3FHIA 2XH5A 4IFGA 2BTRA 4ZTQA 3W18A 3QRJA 4CQEA 4ZSJA 1ZZLA 5I9ZA 2WQOA 1YWRA 4U3YA 3Q60A 5I9WA 3ZUVA 2NRYA 3FMLA 3KGAA 3ORMA 4LG4A 5CT7A 2V0DA 2UW6A 2IVSA 4YTHA 5LARA 5J79A 4RIYB 2Y8OA 2BR1A 2J0MB 4BGQA 2RFEA 4R7HA 3PPJA 3OUNB 3IQ7A 4TTHB 1F3MC 5ETIA 3EWHA 5I3OA 3ZO4A 2OICA 3LM5A 4IC7A 3GCPA 2VTSA 5D7VA 5EYKA 1JPAA 5HQ0A 3V8SA 3MWUA 1BL6A 4CD0A 1OL1A 3BLRA 3VBXA 5EI8A 2OZOA 4C4HA 2BAQA 3TIZA 3ZLYA 2XJ2A 4YTIA 3OOGA 1B39A 3LHJA 3UPZA 2VWUA 2BZHB 1W83A 3FUPA 4QQCA 1PYEA 4IH8A 2ERKA 2G2HA 3II5A 4FV1A 5I9UA 4IVBA 3ZLXA 4JAIA 1JKSA 3VS6A 5DT3A 4BZDA 3I1AA 3DGKA 1XH8A 5JK3A 4F9BA 3V5PA 2X0GA 3BGPA 4CMUA 2R7IA 4EQCA 3LFAA 3EZVA 3LJ1A 4ASDA 5CYIA 5AV2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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