4DGLC

Crystal structure of the ck2 tetrameric holoenzyme
Total Genus 101
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
101
sequence length
334
structure length
334
Chain Sequence
SGPVPSRARVYTDVNTHRPREYWDYESHVVEWGNQDDYQLVRKLGRGKYSEVFEAINITNNEKVVVKILKPVKKKKIKREIKILENLRGGPNIITLADIVKDPVSRTPALVFEHVNNTDFKQLRQTLTDYDIRFYMYEILKALDYCHSMGIMHRDVKPHNVMIDHEHRKLRLIDWGLAEFYHPGQEYNVRVASRYFKGPELLVDYQMYDYSLDMWSLGCMLASMIFRKEPFFHGHDNYDQLVRIAKVLGTEDLYDYIDKYNIELDPRFNDILGRHSRKRWERFVHSENQHLVSPEALDFLDKLLRYDHQSRLTAREAMEHPYFYTVVKDQARMG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural determinants of protein kinase CK2 regulation by autoinhibitory polymerization.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Casein kinase II subunit beta
molecule tags Transferase
source organism Homo sapiens
total genus 101
structure length 334
sequence length 334
chains with identical sequence D
ec nomenclature ec 2.7.11.1: Non-specific serine/threonine protein kinase.
pdb deposition date 2012-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF00069 Pkinase Protein kinase domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 4dglC01
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 4dglC02
4NM0A 1YDTE 2UZOA 3R6XA 4F4PA 4FNYA 3PA5A 4BGHA 3VS7A 3NUYA 4RMZA 4BYJA 4NZWB 4DT8A 3N4UA 3E3BX 3QCYA 4TTHB 4YZ9A 1UKIA 3KCKA 5BYZA 5JMSA 4HGEA 3A7IA 3FJQE 3MV5A 4FL1A 4E5WA 3MY0A 4IDTA 5C26A 3C4CA 3DB8A 3HL7A 3KRXA 5GJGA 3VS4A 1Y8YA 2W4KA 4I22A 1PJKA 4BTKA 3DJ7A 5DLSA 2PZRA 5HBEA 5CEIA 3R83A 3RM7A 5IH5A 4JIAA 4MD8E 2V22A 3G6HA 4X2KA 3VS2A 4I23A 2C30A 4HYSA 3CJGA 4XG4A 3W55A 5FD2A 1RJBA 4J8MA 4IX5A 1OL6A 2QCSA 4BCHA 3R28A 4AX8A 4DLJA 4BCGA 3CPBA 1Q24A 3MIYA 4F70A 2QODA 4BWPA 4EH7A 4JG8A 4YSJA 3BEGA 2VNWA 2GNJA 4O0YA 5HG9A 4DFUA 3A7FA 3IKAA 2YZAA 1Y91A 3FZOA 4HYUA 3L9NA 4D58A 4TNDA 3QZFA 2C6KA 4FNXA 4O7WA 3V5QA 2RSVA 1OL5A 3UQGA 4FGRA 1YXXA 4PRJA 2YCQA 4I21A 2UZWE 4MCVA 5IQAA 2F9GA 4FG8A 4FKPA 4ANOA 4BDAA 2JITA 4DCEA 1GJOA 4F9WA 5M56A 4I6FA 4AW2A 2CMWA 4IWPA 3RPOA 3IK3A 3IONA 2YCSA 4I6HA 4EC9A 5HNGA 4Z3VA 2ETRA 3EHAA 2WOTA 4FIIA 4IANA 3BLRA 5IA2A 4UN0C 2W9ZB 1Q8YA 1OPJA 2WEVA 3KEXA 3MA6A 4MBJA 5IQCA 2A0CX 3UGCA 4BCOA 2RKUA 2RIOA 3GOPA 3JVSA 4Q9SA 4CG9A 4GJ2A 3R9NA 1H1RA 4HCUA 5F4NA 3ZM4A 4IXPA 3ZO4A 4C59A 2VWUA 3ET7A 5HD7A 4QP9A 3FMMA 4S31A 4XOZA 3FDNA 4QMTA 5DPVA 3BEAA 4R1YA 1JBPE 2QOFA 3O96A 5DWRA 3MTLA 2BRBA 4FT7A 5A6OA 5LMKA 5JKGA 4GJ3A 4EBVA 3HRCA 1PXJA 2QG7A 4YSMA 2JIVA 4CFVA 2WTVA 4IAKA 4XLIA 5E90A 3UC4A 3NAYA 3VBTA 1PXPA 5GINE 1O6LA 1R78A 3F69A 2XNNA 3I6WA 3PDTA 4L9IA 4DCAA 5J9LA 3OTUA 5AAFA 4WBOA 2GTNA 4IAZA 3WE4A 4QT1A 3ZXTA 2BTRA 1OIRA 1CTPE 5KBQA 1KOAA 3NUPA 4U45A 3NSZA 5T6KA 5HQ0A 1OL7A 2R3HA 2ZV8A 4EL9A 5IA1A 3MS9A 1CMKE 4O0VA 5EW9A 1Q8TA 4I0SA 2WZJA 2X8DA 3ZLSA 3VS5A 5LVNA 4MWIA 4RX9A 2CLXA 3BGZA 1NVQA 2YITA 4W9WA 2P4IA 4UZDA 4TT7A 3BLQA 4F99A 2R3MA 3D7TB 2CLQA 4GVJA 3QALE 3PJ1A 4FT9A 1Q3WA 3W2SA 5AA8A 5AR8A 4OR5A 5I9WA 4R3CA 3C0IA 5HBHA 4EH9A 5CU2A 3CE3A 3UPZA 3F2RA 1W84A 4NK9A 5AIKA 3ELJA 2YABA 4QQJA 3VS3A 4EC8A 4HOKA 4IHPA 5BQ0A 4EH4A 1ZAOA 4KS8A 5ANDA 2GQRA 3LCSA 5KMIA 3UIBA 1XH8A 2XIKA 1UNHA 3HMOA 3DY7A 1JSUA 2WTWA 4L3JA 3UOLA 4V04A 4WNKA 2I1MA 4XMOA 3TN8A 4A9YA 1LUFA 4FKSA 3SOAA 3KKVA 1WBSA 2W1EA 4EK8A 4EKLA 3MB7A 4GH2A 3BBTB 4KKEA 2ERZE 4ZOGA 2VN9A 3UJGA 1IAHA 2EU9A 2OJIA 1Q97A 3QKLA 3GNIB 5EYCA 3MVMA 4G9CA 1QPJA 3LIJA 3KVWA 4MH7A 3R7OA 4ZTMA 3VAPA 2H34A 4IB5A 5FUTA 3OVVA 3DBFA 1OMWA 4UYAA 4CV9A 5KHWA 1OIQA 2UVZA 4KA3A 4QMQA 2ITTA 4XEYA 3A7GA 4L3PA 4I5PA 1U46A 4L3LA 3PY0A 4RA5A 3R7VA 3MDYA 3PJCA 2WD1A 5AWMA 4F1TA 3GGFA 1JPAA 5HO8A 2FVDA 4LRKA 4FK3A 2X7GA 5FEDA 5LCJA 2QO2A 4BZDA 2ZM3A 4WRGA 5G1XA 4F6WA 4RJ3A 4WT6A 4P5QA 2XJ2A 5AR3A 2JIIA 2HWOA 3WILA 2W1GA 2ZV9A 5HVJA 3ZEWA 4A07A 5HZNA 5LJJA 3HDMA 4DINA 4BICA 2CKPA 2JDTA 1SZMA 3EJ1A 3BE9A 1UV5A 2EVAA 3GC9A 4IZYA 2FUMA 2X7FA 4QMOA 4UZHA 1MP8A 5I9UA 4OTGA 2BDWA 2W99B 4TYEA 4CKIA 5BVDA 4FEQA 5K5XA 2E9OA 3Q9ZA 4M69B 4PPBA 3R63A 4O7NA 4MXXA 4IZ5A 3NIZA 1VYZA 2WU7A 4C4HA 4JDHA 2WMAA 4U7ZA 4ZK5A 3HV5A 4AXAA 4BBMA 5FQDC 2FGIA 3PLAE 2QLQA 4FV0A 4XJ0A 5GZ8A 4ZP5A 2WELA 2V7AA 4J8NA 3MFUA 3QKKA 3DDQA 1P14A 3IOPA 2UZBA 3FWQA 4Z9LA 2WXVA 2JLDA 4KIPA 4IH8A 2QKWB 5JT2A 4QTBA 2JGZA 4ZLOA 4EBWA 4JI9A 4E1ZA 2CSNA 3RNIA 3BZ3A 4NSTA 4WNPA 4FV7A 2YLEA 2F7EE 4YPSA 4YJUA 2R3QA 3DFAA 3LCOA 4JRVA 4JBVA 5CU4A 1YVJA 4FK6A 4G3CA 2WU6A 4LOOA 1Z9XA 3UPXA 5EM5A 4AE9A 5BPYA 1H28A 2ZJWA 4GT3A 4YJSA 4GCJA 5CZIA 4QPMA 2WMRA 4FZAB 1JSVA 3GQLA 3FMJA 4NWMA 3VO3A 3DZOA 2HZIA 3CIKA 4I4EA 4ID7A 5AV1A 3TL8A 2QOLA 3DK7A 5KE0A 2VU3A 5AR7A 4C4IA 2BZJA 4LL0A 3K3JA 5GNKA 5EM8A 2R3JA 4J97A 5E8XA 3UO6A 4HGLA 4RZWA 3LLTA 5AADA 3P5KA 5HU3A 4AP7A 5EDPA 5E8SA 3GB2A 2C0OA 5FEQA 4MXCA 2CGXA 3LVPA 3RNYA 4GKHA 3ENHA 3U6IA 3AMBA 4IB0A 4D2TA 5A4EA 4EQUA 4NIFA 1ZY5A 1UVRA 3PWDA 1ZYDA 2BUJA 3A60A 3P79A 3QD3A 4K2RA 3K5UA 3PLSA 4D2RA 1WVXA 4CEGA 4F0FA 2IZSA 3M11A 1SYKA 2HAKA 1S9JA 4UY9A 3S1HA 3C13A 5AAEA 3QC4A 3LXLA 3EKKA 4XLVA 4DAWA 4E5AX 4OAUC 4E6AA 5K0XA 3QQHA 1E9HA 4MNFA 4DFXE 2VUWA 4NTSA 2ITYA 4U97A 5C8MA 4YU2A 1Q4LA 5HHWA 5C8KA 5HIEA 1YI6A 4IZ7A 4U43A 3TNHA 4KAOA 4YHFA 3EQPA 3PSBA 4R7HA 3TZ7A 4D2PA 3CKXA 3WF7A 4C3PA 4GT5A 3O17A 2GU8A 4YBJA 4J96A 4N0SA 2G15A 4EK3A 2XBAA 2O8YA 1MQ4A 2Z2WA 3MJ2A 4FC0A 4GUBA 4CKRA 3U55A 5DN3A 3V5JA 5IQGA 3H0ZA 4PL5A 3EN4A 4TNBA 3DDPA 5AM6A 3VF9A 4AA4A 5C4KA 2W1HA 4Q9ZA 3QCSA 1YKRA 4LMUA 3LAUA 2OJGA 2GQGA 3F5GA 5AR2A 3DTWA 3ACJA 5CT0A 5E4HA 3COMA 2YERA 3E93A 5A46A 3U54A 4X3FC 5LQFA 4O84A 3HV7A 1W82A 3KMWA 4JX7A 2WQEA 4ZJJA 2I0HA 2V5QA 3EQCA 4JG6A 4MXZA 4RJ6A 5HIBA 3UP2A 5LMKC 1UKHA 2RFEA 3GEQA 4I1ZA 4D1XA 2I6LA 3C4ZA 4ZJVA 3GCPA 4CSVA 2XIZA 3VUMA 3KXZA 4F6UA 3PUPA 3Q96A 2XNMA 4EH6A 2J5EA 4J95A 3VS0A 5L2WA 4H1MA 3DJ6A 2ESMA 2QU5A 3F6XA 3OXTA 4QMSA 5HLNA 3QTQA 3LLAA 4YHTA 4F64A 5DMZA 5GHVA 2Y4PA 3EQFA 3FMLA 4BIEA 2BIYA 2EB2A 3HMMA 3JXWA 1JAMA 3MB6A 2J4ZA 4BIBA 4O0XA 3C7QA 5DT4A 4L7SA 2P55A 4I24A 4YR8A 4KIKA 3F7WA 4EJNA 4BWXA 5GZ9A 2YIRA 5J1WA 1JLUE 5AX3A 4GVAA 4WSYA 3PPZA 1GZ8A 4UXQA 5HE3A 4ZY5A 3E8CA 5HG8A 5HVYA 5D1JA 2R3PA 3FE3A 2ZDUA 4G5JA 1MUOA 1K3AA 3I5NA 4Y83A 5DVRA 3DTCA 1J7IA 3E8NA 1XH9A 4OT5A 4FTMA 4UEUA 3DKFA 5E1EA 1KV2A 2FO0A 1H4LA 2G2FA 4XV3A 4AACA 4NH1A 4YMJA 5HBJA 3TKHA 4EUTA 2JC6A 4FICA 5LOHA 2X7OA 3TNQB 4FZDB 5AV0A 3O8TA 4BHZA 4K77A 4DG2E 4EK5A 2XB7A 3KMUA 3L8VA 4AGUA 4EZ7A 2X2KA 5M4UA 2Y7JA 1SNXA 3PY3A 4I6BA 4U0IA 3KGAA 2W5HA 3FPQA 3SRVB 5GZAA 4LUEA 3UC3A 2X9EA 5AV3A 2WMSA 4YO6A 5CEKA 3NPCA 3LCDA 3GCQA 4PPCA 3BX5A 2Z7LA 3E88A 3GQIA 2WMBA 3IQ7A 4FNZA 3DNEA 3EQBA 4K18A 3D14A 5K0KA 5LVLA 1DS5A 2VTIA 4L43A 5CVHA 3UNZA 1W98A 3LFNA 4WRSA 2WMVA 1PXIA 3PIYA 4HCVA 5AX9A 4HVGA 4FSYA 5LCKA 4QNYA 4EORA 5LXMA 4NU1A 1URCA 4RFYA 4XYFA 4BCPA 3ORMA 2VTJA 4RJ5A 4D5HA 4DEIA 5KNJA 1Y6AA 5C8NA 4K11A 5TT7A 1ZLTA 3DFCB 3PP0A 5BYLA 2XK8A 4GSBA 4D4VA 3IS5A 4YTIA 3W8LA 2CGVA 3F3VA 4QP1A 5IH6A 4USEA 4XUFA 2PPQA 2BTSA 3FZTA 2LAVA 1WBPA 4ZSEA 2C5VA 2I0VA 1Q8ZA 2XIXA 4CFWA 2XJ1A 3TTJA 4BN1A 3H0YA 4FI1A 3UYSA 5HKMA 4EWHA 4ZLZA 5AA9A 3QRJA 3AGLA 3PG1A 5CYIA 2GFSA 5KMOA 1IA9A 3G9LX 5T3QA 4UX9A 3L8PA 1ERKA 3F5UA 4EJ7A 3R7GA 1SVHA 4RJ7A 5FP5A 3TIZA 4EI4A 4OLIA 5IDNA 2PVFA 2JKOA 4UXLA 4R1VA 4TN6A 3QTZA 2A1AB 3FQHA 2DWBA 4HYHA 1OB3A 1IA8A 4NM7A 4OTQA 3VRZA 2VNYA 2XK6A 5FDPA 4WA9A 2ITVA 2O2UA 3A8XA 4IC7A 3I5ZA 3C50A 4HZSA 3AC8A 4P5ZA 3G15A 4YJPA 3IDCA 4TYHB 2BFXA 5AR5A 5EYKA 3Q04A 1OGUA 3P23A 3RHXA 2WTKC 2X8IA 2YDJA 3OWKA 4FR4A 4JLCA 4PMPA 5CVGA 2HW6A 2XRUA 4IACA 5M53A 3LCTA 4MD7E 4I3ZA 5EH0A 3UVQA 3U9CA 4BDHA 4O7SA 2B1PA 3GU4A 4W4YA 3LMHA 3QUDA 2ERKA 3KF7A 4OTPA 4P4CA 4V01A 3MESA 3QKMA 3R8PA 4EHGA 4A9RA 3OCSA 3ZU7A 2J50A 4ASZA 3BHTA 3VW8A 3GC8A 3Q6WA 4D5KA 4E4NA 2W05A 3FHIA 3NEWA 4QMNA 1H8FA 5KHXA 4NYEA 5BVNA 3C4WA 2WIHA 2NPQA 3ORPA 2X1NA 3PVUA 4BKYA 3POZA 4I5HA 5K4JA 4LV8A 4HNIA 4WG5A 4DEBA 4LGHA 1XBAA 4A9UA 4ZZMA 5KUPA 2FSMX 4BGGA 3TM0A 1XH6A 2JDSA 1W0XC 2A2AA 4OBQA 4FA2A 3DU8A 3OUNB 5G6VA 3UOHA 1PMEA 3MY1A 1P4FA 4FKQA 4ZSGA 3HV3A 5IUIA 5JFWA 1URWA 5FM3A 4UWYA 4E3CA 4O2PA 4G31A 3QX2A 3WF8A 1WBWA 3V8WA 4XG2A 3QYZA 4C8BA 3U4WA 4CFUA 2R3NA 2X4FA 2J9MA 4ALWA 4QP8A 2OW3A 3PRIA 4DEEA 1YWRA 5CU6A 2UZVA 1BI7A 4JQEA 2OJJA 3F2NA 1VYWA 3SXRA 3VVHA 4X2FA 5AIRA 4FV6A 1ZYLA 5J87A 4FTNA 5HGIA 2BAJA 1YXVA 2C6TA 4JAJA 1ZMVA 4I94A 1TKIA 4IAFA 2BPMA 4ZSLA 4JNWA 1PXNA 1J1CA 2O3PA 2JKMA 3TUCA 5JFXA 4BI1A 4OBPA 4YJOA 2WFYA 3EZVA 4BTMA 2C6DA 3GXLA 4L6QA 4FNWA 2J2IB 2WB8A 4HW7A 3EN6A 1U4DA 2FH9A 2VTQA 1P4OA 3IO7A 5JQ5A 1GZKA 2Y6OA 4XBRA 3KULB 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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