4DGPA

The wild-type src homology 2 (sh2)-domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (shp2)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
526
structure length
499
Chain Sequence
b'SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Structural and Mechanistic Insights into LEOPARD Syndrome-Associated SHP2 Mutations.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 154
structure length 499
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4dgpA03
2I3UA 3GXXA 1L8GA 2C9WA 3AWGA 2CNHA 3ZMQA 1MW4A 1OHCA 1U25A 2K7AB 2YDUA 1PTTA 2CNIA 2B3OA 2L6KA 4QBEA 4WTYA 1XRIA 3VROA 3D1HA 1RJAA 1LCKA 5KAZA 1LYVA 1NZLA 2NT7A 1PYNA 1EEOA 4RH5A 1FU6A 3TL0A 4QUNA 3ZM3A 2CNEA 2B07A 1NRVA 3PS5A 1U24A 3ZV2A 3IN7A 2I4GA 3QWXX 5GJIA 3GXGA 2P4DA 1LUIA 1FBZA 2CM7A 3OB1B 1KAVA 2HDXA 5AULA 1U26A 1C87A 1GRIA 1Q6MA 2QEPA 4U1PA 2HMHA 3IMDA 3EU0A 2DVJA 1AD5A 1NO6A 3O4SA 1ONZA 2F6VA 3PFVA 3F81A 1D5RA 1CWEA 1BM2A 3S4OA 2H4KA 2QDPA 4Y2EA 1JF7A 1O43A 1JYUA 2EO6A 3BUWB 3GXWA 2VEUA 1IS0A 4BJOA 5KA1A 2HB1A 3VS5A 3IMJA 5KA9A 3HCKA 2ETZA 3MXYA 1O4PA 2QMSA 1VHRA 3GXHA 2PQ5A 4YAAA 4ZN5A 3VS6A 2B4UA 2QBQA 1M61A 1SHBA 1BF5A 3S3KA 3BLTA 4A4BA 4GRZA 2VEYA 5EG3B 2EYZA 5IBMA 2B49A 4OHLA 2RMXA 2QDCA 4ZI4A 4NYHA 3QKQA 2KK6A 1JU5A 1A1BA 1CJ1A 3EMUA 2LNXA 1QCFA 2YU7A 1OEVA 2NTAA 4R30A 3OV1A 5K9WA 1BKLA 1TZEE 3BM8A 5BO4A 1O4LA 1OEMX 4RH9A 1CWDL 2FJMA 4QUMA 2FJNA 3OVEA 2Y3AB 1G7FA 2QDMA 2IUHA 4QSYA 1O4OA 1XM2A 3OLRA 2RORA 1ONYA 3N8MA 1OEUA 2CR4A 1JYRA 4GE5A 1O4QA 2F6FA 1M3GA 2A3KA 3N0AA 5DC0B 5IBSA 4FL2A 5KA7A 1NL9A 4I8NA 1OO3A 3VRYA 1YGUA 4H34A 1O4CA 4OHIA 3V0EA 3TKZA 2CJZA 2HDVA 2DM0A 2CFVA 2CS0A 3VRNA 4U17A 3VS3A 2CMCA 4JBCA 2HC1A 1O4GA 4OHEA 3RO1A 3AWFA 4D3QA 3PSKA 3LJ8A 4K45A 3S3HA 2CIAA 1QXKA 5LXQB 3D9CA 2VEWA 2I5XA 1O44A 3N7YA 3A5KA 2C0TA 2EU0A 2CM8A 1O4NA 3PLFB 3EZZA 2H04A 4WU2A 5K23A 3MOWA 3V0GA 3QWYA 1A07A 4FBNA 5K25A 1YN9A 3QCDA 5KA3A 4X6SA 4HJQA 1KSWA 1L8KA 1J4XA 1V3AA 1AOUF 1C83A 2WGPA 4WU3A 5GJHA 3VS0A 5K22A 2B4OA 2OZ5A 3NMEA 3S3EA 2F6TA 1BLJA 1AOTF 2CM3A 3RGOA 1O4HA 1SHAA 5BX1A 4NWFA 1YTWA 4GL9E 1FMKA 4JGHA 5KABA 1BKMA 3PJPA 1YPTA 3K2MA 1NNYA 1D4WA 4NX8A 1O4DA 1KC2A 4OHDA 1ZZWA 2EYYA 2QCTA 4YR8B 1P15A 4NNDA 3KFJA 3OP0A 1OO4A 3BUXB 4GFUA 3S8OA 2F6YA 1G4WR 1CSZA 1A1AA 1RXDA 3F99A 1Z3KA 2Y2FA 4Z6BA 3ZM1A 3T04A 1PTUA 4KYRA 2QBSA 3BRHA 1YWFA 3F41A 2I6PA 3QCBA 5GTJA 5HDEA 2C7SA 2H03A 4L1BB 3VS7A 1O4IA 2HVLA 3I7ZA 1OETA 3CWGA 3O4TA 1LUKA 2BBUA 2GWOA 3OB2B 2BGEA 2I1YA 3QCJA 3SMEA 4JEGA 1AYCA 1G1GA 5J8RA 3O5XA 3HHMB 5AXIA 2BZLA 3BLUA 2F70A 1P13A 3QCKA 4ERCA 2C0OA 2L4KA 1YGRA 2G59A 2I6IA 1LCJA 4F5BA 1QG1E 2EOBA 1QADA 3AWEA 2ESBA 5DF6A 1SKJA 1D4TA 1RPYA 1X24A 3CXLA 3ZMPA 4RDDA 1LUMA 1XXVA 4GFVA 4JMKA 2EYVA 1F1WA 1YVHA 3BKBA 2AOBA 1LKLA 3C7IA 3F9AA 5BZZA 2P6XA 5KA0A 1K9AA 1Y57A 5EEQA 1A5YA 2NT2A 4ICZA 1NZVA 1ZFPE 2HCKA 5DC4A 3O3LA 3RGQA 1YFOA 1H9OA 1O46A 3QCIA 2PI7A 3D44A 1T49A 3QCGA 3QKPA 1I9SA 1O49A 1O4BA 1O42A 1OPKA 3B7OA 1FPZA 1RQQC 3O4UA 5K9VA 5KA2A 3EAXA 4PVGA 3V0HA 1SUGA 2PSZA 1LQFA 2VEXA 3D1QA 2CMBA 2ECDA 2MC1A 3UF4A 2Q47A 2C46A 3IN8A 4LUDA 1O4JA 4B04A 4GRYA 4WOHA 1OEOX 2PT0A 5EHPA 1PH0A 5KA8A 3PSJA 3MOZA 4RI5A 1O48A 1FPRA 2LNWA 1GHUA 1QZ0A 2H4GA 3S8NA 2MRJA 2MK2A 2F6ZA 3VRPA 3V0IA 2H8HA 2L3TA 1FU5A 1C88A 1FQ1A 2ABLA 5J3XA 1UUSA 1UURA 2GP0A 1A09A 1BHHB 1TCEA 2AOAA 4RHGA 1O4FA 2HUWA 1PTVA 3S4EA 4Y14A 5EHRA 1OESA 1Q6PA 1A1EA 3QCHA 2FO0A 1AYBA 1JWOA 4RI4A 1BFJA 2J16B 1LKKA 2NV5A 3ZM2A 2VIFA 2DLZA 4P9VA 1YTSA 1C86A 2A8BA 2DCRA 2EKXA 2CI8A 2H5KA 1X0NA 2EL8A 1FBVA 5KAAA 2C0IA 5CDWA 1ZCLA 5KACA 2CRHA 1NWLA 5AWXA 2H4VA 2CBLA 4K11A 1Q1MA 4JMJA 1ECVA 1B47A 1G1FA 4FL3A 4F5AA 1BHFA 2IUIA 4ZRTA 4RKKA 4EY0A 1HCTB 3OMHA 5KADA 3CWEA 1KAKA 4GPLB 1O41A 4BPCA 1Q6TA 1YTNA 2PNBA 1FHSA 1SHDA 3BUNB 1PA9A 3V0JA 1R6HA 1R1QA 1PA1A 3ZNIA 1EENA 1XBOA 1ZCKA 3I80A 2MRKA 2SRCA 2I6JA 4DGPA 2I6OA 2NLKA 3VGOA 2MQIA 2F46A 1BZJA 1X6CA 5MMZB 2QBPA 1GFYA 2IUGA 4DGXA 1AAXA 2I4HA 4MBBA 4QAHA 2HXPA 5K24A 1G1HA 5HKWA 1I57A 2GJTA 1YVLA 2I3RA 2B4SA 3D42A 2NZ6A 5HKZA 3EAZA 1Q6SA 3H2XA 4P9ZA 4QAPA 4HRFA 2HNQA 2PBNA 4NWGA 4F59A 4J51A 1X27A 1JLNA 1HCSB 3MAZA 4K2RA 4D3PA 3N84A 2I42A 1NZ7A 2Y1NA 2OC3A 2K79B 2RSYA 5I6VA 4D3RA 1OHEA 4ROJA 1FYRA 2PA5A 1XXPA 1A81A 2E0TA 2FH7A 4AZ1A 2DLYA 2IMGA 2CMAA 2SHPA 2AZRA 4GWFA 2H02A 5D0JA 3RZ2A 1AYDA 2PTKA 1I9TA 1BMBA 1LARA 4GS0A 2IZVA 4M4ZA 2G6ZA 1LUNA 3QCFA 1JYQA 3S9KA 2F71A 2LCTA 1BLKA 2I6MA 3V0FA 3M4UA 5BUGA 1IJRA 4JE4A 1T48A 5BZXA 1O4EA 3PQZA 1GWZA 4HJPA 2QCJA 1WAXA 3VS2A 1Q6NA 4H1OA 2Y1MA 4R0SA 2Q05A 2DX0A 2AUGA 2GSBA 2BGDA 2PLDA 2Y96A 2RF6A 2CM2A 1R1SA 4GE2A 3CM3A 2FCIA 3BUOB 1O47A 1O45A 1BG1A 2XP1A 2BIJA 1WRMA 1C84A 4KI9A 2YSXA 2GE9A 3M7FA 1R1PA 3QCLA 2VEVA 4QBWA 3CBLA 3A5JA 3D1OA 4KYQA 4GE6A 2PNAA 1BZHA 4E93A 2QBRA 2PLEA 2M3VA 1MILA 2KNOA 1MKPA 2ZN7A 1O4MA 1RPMA 1WQUA 3VRRA 3S3FA 2JJDA 2RVFA 2OQ1A 2B4PA 2HC2A 1KA7A 3MMJA 3QCMA 4TVVA 4S0GA 3EB1A 1SPSA 1OHDA 5HKYA 1PXHA 2MBCA 2I4EA 3QCNA 2AHSA 3EACA 3CD3A 4PYHA 2LQNA 3HIZB 3GQIB 4JNBA 3NHNA 4XZ1A 2CI9A 1BZCA 1OPLA 3S8LA 2R0BA 2ZMMA 2DXPA 3SR9A 5KA4A 2H46E 3VS4A 1BHHA 3BUMB 2BV5A 2HY3A 4XZ0A 4K44A 2I75A 3MXCA 1G4US 1NWEA 4A4CA 4IKCA 3US4A 2EO3A 1A08A 2CNFA 4OHHA 1BFIA 3V0DA 1I3ZA 1PTYA 2JYQA 3WA4A 2HNPA 2J16A 1C85A 2HCMA 5M43A 1G7GA 3U96A 1F2FA 3I36A 4EIHA 1ZC0A 1CSYA 2CNGA 1D1ZA 1WCHA 3VRZA 1SPRA 1KA6A 3UYOA 3F9BA 3VS1A 1PICA 2LQWA 1A1CA 2J17A 1O4RA 4R0TA 2OZOA 1O4KA 1AB2A 1XA6A 1Q6JA 1O4AA 4WWQA 1T4JA 2F6WA 5EELA 4D8KA 1AYAA 4E68A 1G83A 3QCCA 3ZM0A 1M27A 4TZIA 2OOQA 2OUDA 3VRQA 3QCEA 5DC9A 1Y1UA 4LUEA 1YZ4A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2I3UA 4ZIYA 3GXXA 1L8GA 2C9WA 3AWGA 2CNHA 3ZMQA 1MW4A 1OHCA 1U25A 2K7AB 2YDUA 1P31A 1PTTA 2CNIA 2B3OA 2L6KA 4QBEA 4WTYA 1XRIA 2Y67A 3VROA 3D1HA 1RJAA 1LCKA 5KAZA 1LYVA 2Y66A 1NZLA 2NT7A 1PYNA 1EEOA 4RH5A 1FU6A 3TL0A 2UAGA 4QUNA 3ZM3A 2CNEA 1JBVA 2B07A 1NRVA 3PS5A 1U24A 3ZV2A 3IN7A 2I4GA 3QWXX 5GJIA 3GXGA 2P4DA 1LUIA 1FBZA 2CM7A 3OB1B 1KAVA 2HDXA 5AULA 1U26A 1C87A 1GRIA 1Q6MA 2QEPA 4U1PA 2HMHA 3IMDA 3EU0A 2DVJA 1AD5A 1NO6A 3O4SA 1ONZA 2F6VA 3PFVA 3F81A 1D5RA 1CWEA 1BM2A 3S4OA 2H4KA 2QDPA 4Y2EA 1JF7A 1O43A 1JYUA 2EO6A 3BUWB 3GXWA 2VEUA 1IS0A 2F00A 2JFHA 4BJOA 5KA1A 2HB1A 3VS5A 3IMJA 5KA9A 2UUPA 3HCKA 2ETZA 3MXYA 1O4PA 2QMSA 1VHRA 3GXHA 2PQ5A 4YAAA 4ZN5A 3VS6A 2B4UA 2QBQA 1M61A 1SHBA 1BF5A 3S3KA 3BLTA 4A4BA 4GRZA 2VEYA 5EG3B 2EYZA 5IBMA 2B49A 4OHLA 2RMXA 2QDCA 4ZI4A 4NYHA 2KGYA 3QKQA 5A5FA 2KK6A 1JU5A 1A1BA 1CJ1A 3EMUA 2LNXA 1QCFA 2YU7A 1OEVA 2NTAA 4R30A 3OV1A 5K9WA 1BKLA 2XPCA 1TZEE 3BM8A 5BO4A 1O4LA 1OEMX 4RH9A 1CWDL 2FJMA 4QUMA 2FJNA 3OVEA 2GC5A 2Y3AB 1G7FA 2QDMA 2IUHA 4QSYA 1O4OA 1XM2A 3OLRA 2RORA 1ONYA 3N8MA 1OEUA 2CR4A 1JYRA 4GE5A 1O4QA 2F6FA 1M3GA 2A3KA 3N0AA 5DC0B 5IBSA 4FL2A 5KA7A 1NL9A 4I8NA 1UAGA 1OO3A 3VRYA 1YGUA 4H34A 1O4CA 3PYZA 4OHIA 3V0EA 3TKZA 2CJZA 2HDVA 2DM0A 2CFVA 2CS0A 3VRNA 4U17A 3VS3A 2CMCA 2UUOA 4JBCA 1P3DA 2HC1A 1O4GA 4OHEA 3RO1A 4CVKA 3AWFA 4D3QA 3PSKA 3LJ8A 4K45A 3S3HA 2CIAA 1QXKA 5LXQB 3D9CA 2VEWA 2I5XA 2WJPA 1O44A 3N7YA 3A5KA 2C0TA 2EU0A 2CM8A 1O4NA 3PLFB 3EZZA 2H04A 4WU2A 5K23A 3MOWA 3LYVA 3V0GA 3QWYA 1A07A 4FBNA 5K25A 1YN9A 3QCDA 5KA3A 4X6SA 4HJQA 1KSWA 1L8KA 4BUCA 1J4XA 1V3AA 1AOUF 1C83A 2WGPA 3LK7A 5GJHA 4WU3A 3VS0A 3MVNA 5K22A 2B4OA 2OZ5A 3NMEA 3S3EA 2F6TA 1BLJA 1AOTF 2CM3A 4BUBA 4CVLA 3RGOA 1O4HA 1SHAA 5BX1A 4NWFA 1YTWA 4GL9E 1FMKA 4JGHA 5KABA 1BKMA 3PJPA 1YPTA 3K2MA 1NNYA 1D4WA 4NX8A 3ZL8A 1O4DA 1KC2A 4OHDA 1GQQA 1ZZWA 2EYYA 2QCTA 4YR8B 1J6UA 2Y1OA 1P15A 4NNDA 3KFJA 3OP0A 1OO4A 3BUXB 4GFUA 3S8OA 2F6YA 1G4WR 1CSZA 1A1AA 1RXDA 3F99A 1Z3KA 2Y2FA 4Z6BA 3ZM1A 3T04A 1PTUA 4KYRA 2QBSA 3BRHA 1YWFA 2VTDA 2I6PA 3F41A 3QCBA 5GTJA 2C7SA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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