4DGPA

The wild-type src homology 2 (sh2)-domain containing protein tyrosine phosphatase-2 (shp2)
Total Genus 154
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
154
sequence length
526
structure length
499
Chain Sequence
SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRYKNILPFDHTRVVLHDSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQRR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

publication title Structural and Mechanistic Insights into LEOPARD Syndrome-Associated SHP2 Mutations.
pubmed doi rcsb
molecule tags Hydrolase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
total genus 154
structure length 499
sequence length 526
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-01-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgpA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4dgpA03
2OZOA 3VS7A 1LYVA 3B7OA 1YTNA 3GXXA 2JJDA 1EENA 1Q1MA 2C0OA 3S3EA 1BM2A 1SHDA 3M7FA 3PS5A 1GFYA 1YTSA 2C46A 4ERCA 5J3XA 2B4OA 3QWXX 2ABLA 3TL0A 1T48A 4WOHA 1BZCA 4K2RA 2G6ZA 1I9TA 2K7AB 2QDMA 2CR4A 3RGQA 5EG3B 2CJZA 2DLYA 2Y96A 1PXHA 1D5RA 1PTVA 2F6TA 1AOUF 3VS3A 3VS6A 1G83A 1O49A 3CWGA 4F59A 1C85A 2BV5A 3MXYA 2HB1A 4GS0A 4B04A 3BRHA 1O4OA 3AWEA 3V0JA 2OOQA 1RQQC 1MILA 3EACA 2ECDA 2IUGA 1A1CA 1LKKA 4OHIA 3BM8A 4KI9A 4JGHA 1Y1UA 2K79B 2PLEA 1T49A 2MQIA 1LQFA 4A4CA 2E0TA 1WQUA 1OEOX 5KA2A 1TZEE 1HCTB 2QDPA 4ZI4A 5K9VA 2GP0A 1O42A 3EU0A 3VRNA 3O3LA 3EB1A 1OPLA 2A8BA 1FU6A 1FBVA 3O4TA 5K25A 4ROJA 2AOAA 3ZM3A 2SRCA 4P9VA 1K9AA 2LQWA 5KA7A 2I42A 2EO3A 2IUHA 5KA4A 1PA9A 4QSYA 3K2MA 2QCJA 1ONYA 1OPKA 2AUGA 1O4RA 2BZLA 2EO6A 4HJPA 4NNDA 2CNIA 3V0FA 3QCLA 2RF6A 4JMJA 2EU0A 2Q47A 4KYQA 4OHHA 1BLJA 3BKBA 2F70A 1U24A 4FL3A 3NHNA 1O4EA 4PYHA 2I6IA 5KA8A 5KA3A 2GSBA 1FBZA 1F1WA 3GXHA 5KAAA 5KA0A 1OESA 2B4SA 1G7GA 1AOTF 1RPYA 3AWGA 1OO4A 2LCTA 1OO3A 4GL9E 1BFJA 4GWFA 5EHRA 2NZ6A 5BZXA 1O4JA 2L3TA 1O46A 2HVLA 5KA9A 5EEQA 2HY3A 3QCDA 2BBUA 1CSZA 4YR8B 4GFUA 1G1HA 4K44A 3QCMA 3VRRA 1NWLA 3CD3A 2CNFA 2MRKA 1ONZA 5M43A 5EHPA 3H2XA 4R0TA 3PQZA 1R1PA 2VEUA 4X6SA 1PH0A 2VEVA 2PLDA 3MOZA 4HJQA 3V0DA 1NZ7A 1SPRA 3LJ8A 1BKLA 1YFOA 1V3AA 2DLZA 1WCHA 2EYYA 2CNGA 2CNEA 4H34A 5CDWA 1OEMX 1YPTA 4RDDA 1I57A 3QCBA 3C7IA 2RSYA 1YGUA 3ZMPA 4NX8A 2CMAA 2B4PA 1T4JA 3V0GA 1O4GA 2DVJA 1M61A 1VHRA 1XA6A 4E93A 5BZZA 1R6HA 1FPRA 1NWEA 4QBWA 3OV1A 1MKPA 2HC1A 4J51A 5KA1A 3QWYA 3S8OA 1BMBA 4QAHA 4RKKA 1O4FA 1Q6MA 2ZN7A 3NMEA 5J8RA 5K24A 1KA7A 2LQNA 3IN7A 2H4VA 2PI7A 1ZCLA 2DXPA 4I8NA 2CMCA 1XBOA 3VS1A 3A5JA 2F71A 1O4CA 3CBLA 2XP1A 2ESBA 2EKXA 1X24A 5LXQB 4M4ZA 1XRIA 2BGDA 2VEYA 5KADA 1JYUA 3GXWA 1O47A 4GRYA 4Y2EA 1Z3KA 2ETZA 1BLKA 3V0EA 2CM3A 2MK2A 3ZV2A 2YU7A 5D0JA 3VGOA 2F6FA 1PTTA 4QUMA 2Y1NA 3HIZB 4S0GA 1BFIA 2PA5A 5EELA 4GE6A 3I36A 4R30A 5BUGA 4OHDA 2KNOA 3VS2A 1YGRA 4GPLB 5DF6A 1SUGA 2CM8A 2CM2A 1A1EA 3ZNIA 2LNXA 2J17A 2IZVA 1Q6JA 2OUDA 2PBNA 4JEGA 3MAZA 2OQ1A 1RPMA 3EMUA 3QCKA 1O4LA 2QCTA 1U25A 2L4KA 1O4MA 4A4BA 1M3GA 4JMKA 2HNPA 1A09A 3EAXA 2OZ5A 1ZCKA 3QCFA 1AAXA 1AYDA 2C0IA 2I75A 3ZM0A 2EYZA 3IMDA 4WU2A 1I9SA 3WA4A 1BG1A 4EY0A 2QMSA 3GQIB 1QZ0A 3BUWB 2PQ5A 2YDUA 1C84A 2BIJA 2I4EA 1NZLA 4K45A 1YVHA 5BO4A 4H1OA 2GE9A 1SKJA 1A07A 1SHBA 3VS4A 4AZ1A 2SHPA 2R0BA 3S3KA 3SR9A 1PA1A 2IMGA 1NO6A 3RO1A 1ZFPE 2Y1MA 2CFVA 1EEOA 2QEPA 4GE2A 3D1OA 1AB2A 1UUSA 3D44A 3GXGA 5HDEA 3T04A 1Q6SA 1KAVA 3F41A 5DC0B 1AYBA 3S8NA 1Q6NA 3US4A 1JYQA 2PSZA 2H5KA 1L8KA 4QAPA 1TCEA 3IN8A 3MMJA 3ZMQA 2FJNA 2KK6A 4WWQA 1JF7A 1YZ4A 1BHHB 2M3VA 1LCKA 1CJ1A 3D1QA 2HCMA 1Q6TA 2P6XA 1PTYA 4QBEA 2VEWA 3TKZA 5I6VA 4YAAA 2MBCA 2I5XA 4FL2A 2HDXA 2BGEA 5KABA 1O43A 1KC2A 3N8MA 2EYVA 2H04A 2J16A 1A08A 1JYRA 4XZ1A 1G4WR 1L8GA 1J4XA 2Q05A 1O4AA 1C88A 2I6OA 3SMEA 4XZ0A 1FMKA 5GTJA 1CWDL 3EAZA 3VRQA 2B4UA 1O4NA 3CM3A 1FHSA 5KACA 1RJAA 2DM0A 1B47A 4RH5A 1XM2A 1Y57A 3O4SA 5IBMA 1OHDA 1M27A 5K22A 2PNAA 4KYRA 4DGXA 2DX0A 1LUIA 1YTWA 3V0HA 2I4GA 2HCKA 1WRMA 2RVFA 4U1PA 3VRZA 1YN9A 1NL9A 2OC3A 2ZMMA 5HKWA 2H8HA 1O41A 3F99A 4R0SA 1OETA 5AWXA 2HXPA 1YWFA 1KA6A 1PICA 2A3KA 2CMBA 2F6ZA 3PJPA 4NWFA 3A5KA 2F6WA 2IUIA 1KSWA 4DGPA 4NWGA 1G1FA 4D3PA 2MRJA 1C83A 1SHAA 2CI9A 3S9KA 1CSYA 1A5YA 4ZRTA 5KAZA 3S3HA 2JYQA 2C7SA 5MMZB 1H9OA 2HMHA 1F2FA 1XXPA 2QBPA 5AULA 5BX1A 2CS0A 4BPCA 3BLTA 1AYCA 2I4HA 1P15A 3D1HA 1BKMA 4E68A 2VEXA 1OEUA 4MBBA 5HKYA 1C87A 1XXVA 3QCCA 4RI4A 1LUKA 2H4KA 2HDVA 1FPZA 4ICZA 2I6MA 2PNBA 3OB2B 4D3RA 1G7FA 1O4HA 1GHUA 1LCJA 1R1QA 2H46E 3F81A 3QCHA 4D3QA 3RGOA 2C9WA 2QBRA 1NNYA 2B3OA 1FYRA 5DC4A 4U17A 1O4IA 2RMXA 1U26A 3QKPA 4Z6BA 1BHFA 3VS0A 1JLNA 1O4DA 2AZRA 1WAXA 1D4WA 3N0AA 1O44A 3D9CA 3BUOB 2PTKA 1O4PA 1FU5A 2QDCA 3CXLA 2CRHA 3PLFB 3QCIA 1AYAA 3PFVA 3ZM2A 3UF4A 2I3RA 3O4UA 2LNWA 5IBSA 2B49A 4PVGA 4LUEA 2EOBA 4NYHA 1QXKA 1GWZA 1O48A 1QCFA 3I7ZA 4QUNA 4JE4A 3BUMB 3VRPA 2FCIA 3EZZA 2YSXA 2NV5A 1O4KA 1IS0A 1GRIA 1PYNA 1OEVA 1O45A 2VIFA 3M4UA 4GFVA 4GRZA 1OHEA 2NLKA 2GJTA 4ZN5A 1QG1E 3OMHA 1BHHA 1NRVA 3UYOA 2GWOA 2I6PA 4RI5A 2I3UA 2I1YA 2MC1A 2DCRA 4F5AA 3QCEA 4RHGA 2PT0A 5GJHA 3ZM1A 2F6VA 3BLUA 1X6CA 1YVLA 1IJRA 2HC2A 3QKQA 2WGPA 1G1GA 2H4GA 2HNQA 2FO0A 1D1ZA 2CM7A 4JNBA 2EL8A 1LKLA 2FJMA 1LUNA 1KAKA 3KFJA 1R1SA 4K11A 5GJIA 4D8KA 1Q6PA 1AD5A 3PSKA 3HCKA 4OHEA 3S4OA 3VS5A 2I6JA 2FH7A 4JBCA 4EIHA 1JWOA 1X27A 5AXIA 1BF5A 3RZ2A 3V0IA 1ECVA 4F5BA 1RXDA 1SPSA 2H02A 2NT7A 3VRYA 2Y2FA 3MXCA 2B07A 1C86A 3QCJA 1BZJA 3OB1B 4Y14A 5DC9A 2P4DA 4RH9A 2CI8A 3BUNB 4FBNA 1P13A 3OP0A 1OHCA 4GE5A 3PSJA 4HRFA 5K9WA 3OVEA 1O4QA 5HKZA 2QBSA 3HHMB 1PTUA 1BZHA 1A1BA 3S4EA 3IMJA 1MW4A 3CWEA 4BJOA 1D4TA 3N84A 2F6YA 4IKCA 1I3ZA 3F9BA 3QCGA 3QCNA 3MOWA 2J16B 1X0NA 2RORA 2Y3AB 5K23A 4WTYA 4TZIA 3U96A 1LARA 1FQ1A 2CNHA 3OLRA 1JU5A 4LUDA 2AHSA 3AWFA 1ZC0A 1A1AA 1HCSB 3VROA 1ZZWA 2NTAA 1O4BA 2CIAA 2L6KA 4P9ZA 3N7YA 2QBQA 2CBLA 4OHLA 1A81A 2HUWA 1LUMA 1QADA 1NZVA 2F46A 3S8LA 1UURA 3D42A 1G4US 2G59A 4TVVA 2NT2A 3S3FA 4L1BB 2C0TA 3O5XA 3BUXB 1CWEA 2H03A 3I80A 4WU3A 3F9AA 2AOBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2OZOA 3VS7A 1LYVA 3B7OA 1YTNA 4HV4A 3GXXA 2JJDA 1EENA 1Q1MA 2C0OA 3S3EA 1BM2A 1SHDA 3M7FA 3PS5A 1GFYA 4CVMA 1YTSA 2C46A 4ERCA 5J3XA 2B4OA 3QWXX 2ABLA 3TL0A 1T48A 4WOHA 1BZCA 4K2RA 2G6ZA 1I9TA 2K7AB 2QDMA 2CR4A 3RGQA 5EG3B 2AM1A 2DLYA 2CJZA 2Y96A 1PXHA 1D5RA 4QF5A 1PTVA 2F6TA 1AOUF 3VS3A 3VS6A 1G83A 1O49A 3CWGA 4F59A 1C85A 2BV5A 3MXYA 2HB1A 4GS0A 4B04A 3BRHA 1O4OA 3AWEA 3V0JA 2OOQA 1RQQC 1MILA 3EACA 2ECDA 2IUGA 1A1CA 1LKKA 4OHIA 3BM8A 4KI9A 4JGHA 1Y1UA 2K79B 2PLEA 1T49A 2MQIA 1LQFA 4A4CA 2E0TA 1WQUA 1OEOX 5KA2A 2LRAA 1TZEE 1HCTB 2QDPA 4ZI4A 5K9VA 2GP0A 1O42A 3EU0A 3VRNA 3O3LA 3ZM6A 3EB1A 2WTZA 1OPLA 2A8BA 1FU6A 1FBVA 1J6UA 3O4TA 5K25A 2JFGA 4ROJA 2AOAA 3ZM3A 1GG4A 2SRCA 4P9VA 1K9AA 2LQWA 5KA7A 1E0DA 2I42A 2EO3A 2IUHA 5KA4A 1PA9A 4QSYA 3K2MA 2QCJA 1ONYA 1OPKA 2WJPA 2AUGA 1O4RA 2BZLA 2EO6A 2UUPA 2VOSA 4HJPA 4NNDA 2CNIA 3V0FA 3QCLA 2RF6A 4JMJA 2EU0A 2Q47A 4KYQA 4OHHA 1BLJA 3BKBA 2F70A 1U24A 4FL3A 3NHNA 1O4EA 4PYHA 2I6IA 5KA8A 5KA3A 2GSBA 1FBZA 1F1WA 3GXHA 5KAAA 5KA0A 1OESA 2B4SA 1G7GA 1AOTF 1RPYA 1EEHA 3AWGA 1OO4A 2LCTA 1OO3A 4GL9E 1BFJA 4GWFA 5EHRA 1P3DA 2NZ6A 5BZXA 1O4JA 2L3TA 1O46A 2HVLA 5KA9A 5EEQA 2HY3A 3QCDA 2BBUA 1CSZA 4YR8B 4GFUA 1G1HA 4K44A 3QCMA 3VRRA 1NWLA 3CD3A 2CNFA 2MRKA 1ONZA 5M43A 5EHPA 4ZIYA 3H2XA 4R0TA 3PQZA 1R1PA 2VEUA 4X6SA 1PH0A 2VEVA 2PLDA 3MOZA 4HJQA 3V0DA 1NZ7A 1SPRA 3LJ8A 1BKLA 1YFOA 1V3AA 2DLZA 1WCHA 2EYYA 2CNGA 2CNEA 4H34A 5CDWA 1OEMX 1YPTA 4RDDA 1I57A 3QCBA 3C7IA 2RSYA 1YGUA 3ZMPA 4NX8A 2CMAA 2B4PA 1T4JA 3V0GA 1O4GA 5A5EA 2DVJA 1M61A 1VHRA 1XA6A 4E93A 5BZZA 1R6HA 1FPRA 1NWEA 4QBWA 3OV1A 1MKPA 2HC1A 4J51A 5KA1A 3QWYA 3S8OA 1BMBA 4QAHA 4RKKA 1O4FA 1Q6MA 2ZN7A 3NMEA 5J8RA 5K24A 1KA7A 2LQNA 3IN7A 2H4VA 2PI7A 4C12A 1ZCLA 2DXPA 4I8NA 2CMCA 1XBOA 1UAGA 3VS1A 3A5JA 2F71A 2VTEA 3LK7A 2GCAA 1O4CA 3CBLA 2XP1A 2ESBA 2EKXA 1X24A 5LXQB 4M4ZA 1XRIA 2BGDA 2VEYA 2Y68A 1JYUA 3GXWA 5KADA 1O47A 4GRYA 4Y2EA 1Z3KA 2ETZA 1BLKA 3V0EA 2CM3A 2MK2A 3ZV2A 2YU7A 5D0JA 3VGOA 2F6FA 1PTTA 4QUMA 2Y1NA 3HIZB 4S0GA 1BFIA 2PA5A 5EELA 4GE6A 3I36A 4R30A 5BUGA 4OHDA 2KNOA 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 2I6M A;  2PNB A;  3OB2 B;  4D3R A;  1G7F A;  1O4H A;  1GHU A;  1LCJ A;  1R1Q A;  2H46 E;  3F81 A;  3QCH A;  4D3Q A;  3RGO A;  2C9W A;  2QBR A;  1NNY A;  2B3O A;  1FYR A;  5DC4 A;  4U17 A;  1O4I A;  2RMX A;  1U26 A;  3QKP A;  4Z6B A;  1BHF A;  3VS0 A;  1JLN A;  1O4D A;  2AZR A;  1WAX A;  1D4W A;  3N0A A;  1O44 A;  3D9C A;  3BUO B;  2PTK A;  1O4P A;  1FU5 A;  2QDC A;  3CXL A;  2CRH A;  3PLF B;  3QCI A;  1AYA A;  3PFV A;  3ZM2 A;  3UF4 A;  2I3R A;  3O4U A;  2LNW A;  5IBS A;  2B49 A;  4PVG A;  4LUE A;  2EOB A;  4NYH A;  1QXK A;  1GWZ A;  1O48 A;  1QCF A;  3I7Z A;  4QUN A;  4JE4 A;  3BUM B;  3VRP A;  2FCI A;  3EZZ A;  2YSX A;  2NV5 A;  1O4K A;  1IS0 A;  1GRI A;  1PYN A;  1OEV A;  1O45 A;  2VIF A;  3M4U A;  4GFV A;  4GRZ A;  1OHE A;  2NLK A;  2GJT A;  4ZN5 A;  1QG1 E;  3OMH A;  1BHH A;  1NRV A;  3UYO A;  2GWO A;  2I6P A;  4RI5 A;  2I3U A;  2I1Y A;  2MC1 A;  2DCR A;  4F5A A;  3QCE A;  4RHG A;  2PT0 A;  5GJH A;  3ZM1 A;  2F6V A;  3BLU A;  1X6C A;  1YVL A;  1IJR A;  2HC2 A;  3QKQ A;  2WGP A;  1G1G A; 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 4OHL A;  1A81 A;  2HUW A;  1LUM A;  1QAD A;  1NZV A;  2F46 A;  3S8L A;  1UUR A;  3D42 A;  1G4U S;  2G59 A;  4TVV A;  2NT2 A;  3S3F A;  4L1B B;  2C0T A;  3O5X A;  3BUX B;  1CWE A;  2H03 A;  3I80 A;  4WU3 A;  3F9A A;  2AOB A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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