4DGXA

Leopard syndrome-associated shp2/y279c mutant
Total Genus 162
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
162
sequence length
525
structure length
500
Chain Sequence
b'SRRWFHPNITGVEAENLLLTRGVDGSFLARPSKSNPGDFTLSVRRNGAVTHIKIQNTGDYYDLYGGEKFATLAELVQYYMEHHGQLKEKNGDVIELKYPLNCADPTSERWFHGHLSGKEAEKLLTEKGKHGSFLVRESQSHPGDFVLSVRTGDDKGESNDGKSKVTHVMIRCQELKYDVGGGERFDSLTDLVEHYKKNPMVETLGTVLQLKQPLNTTRINAAEIESRVRELSKGFWEEFETLQQQECKLLYSRKEGQRQENKNKNRCKNILPFDHTRVVLHDPVSDYINANIIMPEKKSYIATQGCLQNTVNDFWRMVFQENSRVIVMTTKEVERGKSKCVKYWPDEYALKEYGVMRVRNVKESAAHDYTLRELKLSKVGQGNTERTVWQYHFRTWPDHGVPSDPGGVLDFLEEVHHKQESIMDAGPVVVHCSAGIGRTGTFIVIDILIDIIREKGVDCDIDVPKTIQMVRSQRSGMVQTEAQYRFIYMAVQHYIETLQR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11
publication title Structural and Mechanistic Insights into LEOPARD Syndrome-Associated SHP2 Mutations.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Hydrolase
total genus 162
structure length 500
sequence length 525
ec nomenclature ec 3.1.3.48: Protein-tyrosine-phosphatase.
pdb deposition date 2012-01-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00017 SH2 SH2 domain
A PF00102 Y_phosphatase Protein-tyrosine phosphatase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgxA01
3.30.505.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich SHC Adaptor Protein SH2 domain 4dgxA02
3.90.190.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Protein-Tyrosine Phosphatase; Chain A Protein tyrosine phosphatase superfamily 4dgxA03
2H46E 1G4US 1FPRA 1I9TA 1PTTA 2CJZA 3BM8A 1JLNA 1O4GA 4F5BA 1MKPA 4ICZA 4B04A 3PLFB 3EB1A 3RGQA 3HCKA 4QBWA 2Y1MA 1TZEE 4BPCA 4ZI4A 4OHEA 3PJPA 2QMSA 2CIAA 1C86A 2VEUA 2LNXA 1FU6A 1LUKA 5IBMA 1TCEA 3O5XA 1FU5A 3CM3A 3VRYA 4R0TA 3VGOA 2I1YA 2GWOA 1ONYA 5DF6A 5D0JA 5KA8A 1Z3KA 5DC9A 1A1BA 3OV1A 2PI7A 4AZ1A 2LNWA 3EAZA 4EIHA 1Y57A 1JU5A 1BHHB 2K7AB 4D3QA 3S9KA 5KA9A 1G1FA 5KA2A 3QWXX 3S8OA 2VEVA 3CD3A 1UUSA 4JBCA 4RH5A 1OPLA 1NWLA 2RF6A 3M7FA 2AZRA 4R0SA 1L8KA 1Q6NA 2P4DA 5KA3A 1JYUA 2E0TA 1A1EA 1AB2A 1D1ZA 1C88A 2HC1A 2H5KA 2PA5A 2VEWA 5DC0B 2CMBA 1IJRA 3U96A 2VEXA 3BUXB 3PS5A 5KA0A 4RH9A 2BBUA 1PYNA 1O4RA 4HRFA 2HY3A 2FO0A 2CMAA 5KA1A 1P13A 3GXXA 4LUEA 1AOUF 2C0IA 1LKKA 2G6ZA 3VS2A 2K79B 3MAZA 2QBSA 4NWFA 1R1QA 1NZLA 1NZVA 1CSYA 1YVLA 1O4BA 4U17A 2VEYA 2DXPA 2B49A 1OHCA 1O4DA 1BF5A 5HKWA 1RXDA 1U26A 1WQUA 3GXGA 4BJOA 2RVFA 3PSKA 1ZFPE 5EEQA 4YR8B 2GSBA 2CM2A 1EEOA 2CNIA 1XA6A 3N0AA 1YN9A 2FJNA 1AYCA 1CSZA 5I6VA 3QCDA 4QAHA 3PFVA 1HCTB 4HJPA 3V0IA 4GWFA 2KNOA 2RORA 1IS0A 2CNHA 2Q47A 1OO4A 3BUNB 2J16B 1BKLA 3N7YA 3ZMPA 3CWGA 1RJAA 1G7FA 1O4CA 5K9VA 2Y1NA 1G83A 1WRMA 1Q6TA 1O48A 5KACA 3S3EA 1JYQA 2C46A 3V0DA 2GJTA 3D42A 3QKPA 1QCFA 2F6TA 1Q6MA 2LQWA 2IUIA 1O4FA 2HB1A 3O4UA 5DC4A 3GXWA 2CM3A 2Y96A 1KC2A 1R1SA 1AOTF 2CI8A 1A81A 3D44A 2ABLA 4GE6A 4KYQA 2NT2A 1BHFA 1ECVA 2QEPA 1NRVA 3IMDA 1QZ0A 1LUMA 2F6VA 5K9WA 2OUDA 5LXQB 1BZCA 4QUMA 1YTWA 1Q6JA 4D8KA 2HNQA 1XXVA 4RKKA 3AWFA 3ZM0A 2AOBA 4TVVA 3H2XA 3IN7A 2FCIA 3IN8A 2ECDA 3T04A 1FMKA 2DX0A 1PTVA 1R6HA 2J16A 4D3RA 4F5AA 4OHHA 1Q6PA 2I6MA 4L1BB 4GE2A 5M43A 1CWEA 4GFVA 1SPSA 3QCEA 3N8MA 2QDMA 4OHIA 2GP0A 5K25A 3VS7A 3SR9A 2C7SA 2QCJA 2YU7A 3UYOA 2CNGA 2BGDA 3O4TA 2OC3A 3AWGA 3QCBA 3VRPA 5HDEA 1NL9A 3O3LA 4GL9E 2DVJA 5KAAA 1XM2A 4GRZA 4RDDA 4JNBA 1BZHA 2H02A 4GE5A 2J17A 2PTKA 2BZLA 2C9WA 3V0JA 5GJIA 2DM0A 4DGXA 4HJQA 3ZNIA 1EENA 4Y14A 1ZCLA 3VS0A 1X24A 5BO4A 2AUGA 2SHPA 2YSXA 3PQZA 1OEMX 3VS3A 4QAPA 2C0OA 2DLZA 1LQFA 1O41A 4K45A 1FQ1A 1YGUA 2PT0A 1O4AA 2PNAA 1R1PA 4J51A 2I4GA 5EHPA 1OEOX 3A5JA 4NYHA 3S3HA 1J4XA 4XZ0A 4PYHA 3EACA 3OB2B 3OB1B 2PBNA 2JYQA 2PLEA 4TZIA 1AAXA 5KA7A 2H03A 1SHDA 3B7OA 3QCCA 4YAAA 1OESA 2P6XA 3IMJA 2ETZA 3OP0A 3S8NA 2B4OA 2NT7A 1YFOA 2B07A 4R30A 5HKYA 2HVLA 1O4KA 2I3UA 3OMHA 2F46A 1A07A 2CR4A 3QCHA 1Q1MA 1I57A 3EU0A 4RHGA 1KAVA 2GE9A 1PTYA 3I80A 2IZVA 1NNYA 2EOBA 2IUGA 3HIZB 3NHNA 3VRRA 4A4CA 4DGPA 5AXIA 2HXPA 3QCIA 1YTSA 2I3RA 1FYRA 5K22A 2EYVA 4JMJA 4FL2A 1LCKA 2R0BA 4JMKA 2EYZA 1O4LA 3QWYA 3I36A 2QDCA 1KA6A 1YZ4A 2FJMA 1ZZWA 1FHSA 2BGEA 2PSZA 1VHRA 1O46A 3S3FA 2CM8A 2H4VA 3BKBA 1BMBA 3QCLA 2HCKA 1GWZA 3GQIB 1BM2A 3PSJA 1C85A 4GS0A 1A1CA 3CWEA 1RQQC 4H1OA 1OEVA 4PVGA 1A08A 3QCNA 3CXLA 2OZ5A 1BLKA 1LKLA 4Y2EA 1YVHA 3BUMB 1SHBA 1P15A 1BFIA 3F9AA 2H8HA 3RO1A 2NTAA 3ZM2A 2CS0A 1SPRA 2I42A 3O4SA 1G1HA 1LYVA 1U25A 1T4JA 2CFVA 2AHSA 4QUNA 1OEUA 2A3KA 3MMJA 4ZRTA 3VRQA 2CM7A 1KSWA 2MBCA 4X6SA 5KAZA 1A09A 2C0TA 4GFUA 4P9ZA 2RSYA 4Z6BA 2CMCA 3VS4A 4WOHA 2LCTA 1O4JA 3OLRA 1O45A 1O4OA 2EYYA 1LCJA 2Q05A 3F81A 4A4BA 2IUHA 1O44A 1O49A 2H4KA 2BV5A 1NWEA 1O4QA 2F6FA 2HC2A 4S0GA 3I7ZA 1BFJA 1X6CA 5GTJA 1O4PA 2L6KA 1OHEA 2NV5A 1B47A 4GPLB 2HUWA 1FBZA 4ERCA 4EY0A 3TKZA 5BUGA 2HMHA 3N84A 3UF4A 2Y3AB 3V0HA 1CWDL 4E93A 5IBSA 3BLUA 3D1HA 3ZV2A 5GJHA 1O4MA 4IKCA 3KFJA 4LUDA 4KYRA 2HDVA 3BUWB 4E68A 1NO6A 1C83A 2BIJA 2XP1A 1F1WA 1JF7A 3BRHA 2JJDA 2SRCA 2OZOA 4U1PA 2PQ5A 3A5KA 2CNFA 1G7GA 2VIFA 2ZN7A 1NZ7A 2RMXA 2QBRA 4RI5A 1YGRA 2AOAA 1ZC0A 3V0GA 1PXHA 2F6ZA 5K24A 3NMEA 3ZM1A 2WGPA 2EO3A 1M61A 2B3OA 2EO6A 1PA9A 2OOQA 5BZXA 2F6YA 5J3XA 1LARA 1MW4A 3BUOB 2EU0A 2Y2FA 1O4EA 3D1OA 3QCGA 3ZM3A 2B4PA 1BLJA 1OETA 5BZZA 3EAXA 1AD5A 4FBNA 1O47A 5AULA 3MOZA 1CJ1A 4K11A 3S3KA 3ZMQA 2YDUA 3MXCA 5CDWA 2B4UA 4NNDA 2ESBA 1O42A 3LJ8A 3BLTA 2NLKA 1UURA 1O4NA 2I6OA 4XZ1A 2LQNA 4ROJA 1YPTA 1OPKA 1Q6SA 1K9AA 1QXKA 1T49A 1PH0A 1M27A 2MQIA 1WAXA 2NZ6A 2QCTA 2I6PA 2EKXA 3M4UA 3QCJA 5KABA 2PLDA 4K2RA 3EMUA 4RI4A 5KADA 1O43A 3QCFA 1PA1A 2MK2A 2ZMMA 3TL0A 2HNPA 2HDXA 1D5RA 1X27A 1C87A 2F6WA 1BG1A 1V3AA 1BKMA 2B4SA 3EZZA 1XRIA 1FBVA 3WA4A 2PNBA 5HKZA 2FH7A 1PICA 2I6IA 2EL8A 3GXHA 3VRZA 2I6JA 2M3VA 1GHUA 4WTYA 3QCMA 1YTNA 1OO3A 4QBEA 3S4OA 1LUNA 4GRYA 1O4HA 2DLYA 3US4A 4M4ZA 2A8BA 4K44A 1D4TA 1I9SA 2I4HA 1BHHA 3C7IA 1MILA 4JGHA 5EELA 1PTUA 1A5YA 1SUGA 3HHMB 2L4KA 1JYRA 3F9BA 1I3ZA 5BX1A 2CBLA 4F59A 2MC1A 5MMZB 2CNEA 2MRKA 2MRJA 2QDPA 1JWOA 3F99A 1GRIA 1YWFA 2DCRA 2HCMA 2I75A 4P9VA 5EHRA 1OHDA 2G59A 1Y1UA 3VS5A 4NWGA 4QSYA 3RGOA 2QBPA 3QCKA 5AWXA 2I5XA 1BZJA 2CRHA 1FPZA 2QBQA 4OHLA 2OQ1A 1X0NA 1SKJA 4WU3A 3D1QA 2KK6A 1QG1E 2H4GA 1D4WA 3VS1A 2IMGA 3QKQA 3V0EA 3VROA 1XXPA 3AWEA 3F41A 1RPYA 3OVEA 2CI9A 1HCSB 3MOWA 1ZCKA 3VS6A 1A1AA 1LUIA 1SHAA 1L8GA 1C84A 1AYBA 3D9CA 1RPMA 2L3TA 4OHDA 1KAKA 3CBLA 3MXYA 1GFYA 1F2FA 3VRNA 1G4WR 2I4EA 1U24A 3RZ2A 3S4EA 5EG3B 4I8NA 3V0FA 1T48A 2F71A 4ZN5A 1H9OA 1ONZA 4D3PA 4H34A 4MBBA 4NX8A 4JE4A 1QADA 1AYAA 4FL3A 1WCHA 5J8RA 4JEGA 1M3GA 3K2MA 1G1GA 3S8LA 1XBOA 4WU2A 1KA7A 4KI9A 2F70A 1AYDA 4WWQA 3SMEA 5K23A 5KA4A 2H04A 1O4IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2H46E 1G4US 1FPRA 1I9TA 1PTTA 2CJZA 3BM8A 1JLNA 1O4GA 4F5BA 1MKPA 4ICZA 4B04A 3PLFB 3EB1A 3RGQA 3HCKA 4QBWA 2Y1MA 1TZEE 4BPCA 4ZI4A 4OHEA 3PJPA 2QMSA 2CIAA 1C86A 2VEUA 2LNXA 1FU6A 1LUKA 5IBMA 1TCEA 3O5XA 1FU5A 3CM3A 2WJPA 3VRYA 4R0TA 3VGOA 4QDIA 2I1YA 2GWOA 1ONYA 5DF6A 5D0JA 5KA8A 1Z3KA 5DC9A 1A1BA 3OV1A 3K2TA 2PI7A 4AZ1A 2LNWA 3EAZA 4EIHA 1Y57A 1JU5A 1BHHB 2K7AB 4D3QA 3S9KA 5KA9A 1G1FA 5KA2A 3QWXX 3S8OA 2VEVA 3CD3A 1UUSA 4JBCA 4RH5A 1OPLA 1NWLA 2RF6A 3M7FA 2AZRA 4R0SA 1L8KA 1Q6NA 2P4DA 5KA3A 1JYUA 2E0TA 1A1EA 1AB2A 1D1ZA 2Y68A 1C88A 2HC1A 2H5KA 2PA5A 2VEWA 5DC0B 2CMBA 2WTZA 1IJRA 3U96A 2VEXA 3BUXB 3PS5A 5KA0A 4RH9A 2BBUA 1PYNA 1O4RA 4HRFA 2HY3A 1FGSA 2FO0A 2CMAA 5KA1A 1P13A 3GXXA 4LUEA 1AOUF 2C0IA 1LKKA 2G6ZA 3VS2A 2K79B 3MAZA 2QBSA 2VTEA 4NWFA 1R1QA 1NZLA 1NZVA 1CSYA 1YVLA 1O4BA 4U17A 2VEYA 2DXPA 2B49A 1OHCA 1O4DA 1BF5A 5HKWA 1RXDA 1U26A 1WQUA 3GXGA 2GCBA 4BJOA 2F00A 2VTDA 2RVFA 3PSKA 1ZFPE 5EEQA 2UUPA 4YR8B 2GSBA 2CM2A 4BUBA 1EEOA 2CNIA 1XA6A 3N0AA 1YN9A 2LRAA 2FJNA 5A5EA 1AYCA 1CSZA 5I6VA 3QCDA 4QAHA 3PFVA 1HCTB 4HJPA 3V0IA 4HV4A 4GWFA 2KNOA 2RORA 1IS0A 2CNHA 2Q47A 1OO4A 3BUNB 2J16B 1BKLA 3N7YA 3ZMPA 3CWGA 1RJAA 1G7FA 1O4CA 1UAGA 2Y1NA 1G83A 1WRMA 5K9VA 1Q6TA 3LK7A 1O48A 5KACA 3S3EA 1JYQA 2C46A 3V0DA 2GJTA 3D42A 3QKPA 1QCFA 2F6TA 1Q6MA 2LQWA 2IUIA 1O4FA 2HB1A 3O4UA 5DC4A 3GXWA 2CM3A 2Y96A 1KC2A 1R1SA 1AOTF 2CI8A 1A81A 3D44A 2ABLA 4GE6A 1GQQA 4KYQA 2NT2A 1BHFA 1ECVA 2QEPA 1NRVA 3IMDA 1QZ0A 1LUMA 2F6VA 5K9WA 2OUDA 5LXQB 1BZCA 4QUMA 1YTWA 1Q6JA 4D8KA 2HNQA 1XXVA 4RKKA 3AWFA 3ZM0A 2AOBA 4TVVA 3H2XA 3IN7A 2Y66A 2FCIA 3IN8A 2ECDA 3T04A 1FMKA 2DX0A 1PTVA 1R6HA 2J16A 2XJAA 4D3RA 4F5AA 4OHHA 1Q6PA 2I6MA 4L1BB 4GE2A 5M43A 1CWEA 4GFVA 1SPSA 3QCEA 5A5FA 3N8MA 2QDMA 4OHIA 2GP0A 5K25A 3VS7A 3SR9A 2C7SA 2QCJA 2YU7A 3UYOA 2CNGA 2BGDA 3O4TA 2OC3A 3AWGA 3QCBA 1E8CA 3VRPA 5HDEA 1NL9A 3O3LA 4GL9E 2VOSA 2DVJA 5KAAA 1XM2A 4GRZA 4RDDA 4JNBA 1BZHA 2H02A 4GE5A 2J17A 3HN7A 2PTKA 2BZLA 2C9WA 3V0JA 5GJIA 2DM0A 4DGXA 4HJQA 3ZNIA 1EENA 4Y14A 1ZCLA 3VS0A 1X24A 5BO4A 2AUGA 2SHPA 2YSXA 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3VRQA 2CM7A 1KSWA 2MBCA 4X6SA 5KAZA 1A09A 2C0TA 4GFUA 4P9ZA 2RSYA 4Z6BA 2CMCA 3VS4A 2X5OA 4WOHA 2LCTA 1O4JA 3OLRA 1O45A 1O4OA 2EYYA 1LCJA 2Q05A 3F81A 4A4BA 2IUHA 1O44A 1O49A 2H4KA 2BV5A 1NWEA 1O4QA 2F6FA 2HC2A 4S0GA 3I7ZA 1BFJA 1X6CA 5GTJA 1O4PA 2L6KA 1OHEA 2NV5A 1B47A 4GPLB 2HUWA 1FBZA 4ERCA 4UAGA 4EY0A 3TKZA 5BUGA 2HMHA 3N84A 3UF4A 2Y3AB 3V0HA 1CWDL 4E93A 5IBSA 3BLUA 1O5ZA 4CVLA 2AM2A 3D1HA 3ZV2A 5GJHA 1O4MA 4IKCA 3KFJA 4LUDA 4KYRA 2HDVA 3BUWB 4E68A 1NO6A 1C83A 2BIJA 2XP1A 1F1WA 1JF7A 3BRHA 3ZL8A 1EEHA 2JJDA 2SRCA 2OZOA 4BUCA 4U1PA 2PQ5A 3A5KA 2CNFA 3MVNA 1G7GA 2VIFA 2ZN7A 2GC6A 1NZ7A 2RMXA 2QBRA 4RI5A 2JFFA 1YGRA 2AOAA 1ZC0A 3V0GA 1PXHA 4ZIYA 2F6ZA 5K24A 3NMEA 3ZM1A 2WGPA 2EO3A 1M61A 2B3OA 2EO6A 1PA9A 2OOQA 5BZXA 2F6YA 5J3XA 1LARA 1MW4A 3BUOB 2EU0A 2KGYA 2Y2FA 1O4EA 3D1OA 3QCGA 3ZM3A 2B4PA 1BLJA 1OETA 5BZZA 3EAXA 1AD5A 2XPCA 1JBWA 4FBNA 1O47A 5AULA 3MOZA 1CJ1A 4K11A 3S3KA 3ZMQA 2YDUA 3MXCA 5CDWA 2JFGA 2B4UA 4NNDA 2ESBA 1O42A 4C13A 3LJ8A 3BLTA 2NLKA 1UURA 1O4NA 2I6OA 4XZ1A 2LQNA 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 4MBB A;  4NX8 A;  4JE4 A;  1QAD A;  1AYA A;  4FL3 A;  1WCH A;  5J8R A;  4JEG A;  1M3G A;  3K2M A;  1G1G A;  3S8L A;  1XBO A;  4WU2 A;  1KA7 A;  4KI9 A;  2F70 A;  1AYD A;  4WWQ A;  3SME A;  5K23 A;  5KA4 A;  2H04 A;  1O4I A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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