4DQ5A

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (wt)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
173
structure length
164
Chain Sequence
LQALSRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYPKQSEAAVAAVAAARNQHVKESWA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5wt
publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas phage phi6
total genus 59
structure length 164
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dq5A00
4DQ7A 4DQ5A 4DQJA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1LSFA 1LHHA 4AGAA 3HT6A 4LYBA 5C6LA 177LA 1LYDA 4X3BA 4I7LA 5B1GA 1VDQA 3HT8A 4NGVA 5LA8A 3SBAA 2NWDX 1HFYA 1G7IC 4EXMA 3A6CY 1HSWA 1LYIA 1AT5A 220LA 4WG1A 3AB6A 2B6YA 2I26L 3LZTA 1OUFA 1IO5A 1F10A 3AW6A 1PQOA 1LZGA 1QTHA 4PRUA 4CGEA 1ZURA 3HBHA 211LA 2BPUA 3LYMA 141LA 1LOZA 1OQMA 3WUMA 3JR6A 4WLXA 189LA 1SQ2L 3WL2A 1QTZA 1QTCA 1QUHA 4DDAA 2HTXA 238LA 3EBAB 4YEMA 2IGCA 1C6HA 180LA 103LA 1DYCA 1GFKA 4WG7A 4LYCA 3VW7A 1GB9A 1VATA 4U3XB 1L37A 1L90A 1L34A 3AGGG 1XGTC 1C6MA 1QTKA 3G3VA 3TMWA 7LYZA 2CDSA 1B5VA 207LA 1L95A 2ANXA 1BVKC 4XN6A 1XGQC 5AMYA 4AXTA 4EPFA 2D6BA 2DQIY 2B73A 3W6FA 1XEPA 235LA 4GCDA 3RUNA 4OOOA 4W57A 3AZ6A 2A4TA 1GF7A 132LA 1L45A 5IELA 3HU8A 2CWIA 4GLAA 1ZYTA 4H9HA 4NFVA 2BLXA 1G0JA 1LKSA 1WTNA 2F30A 5FHWA 4E3UA 4WO9A 1L98A 228LA 1C68A 5KXRA 1IWWA 1L93A 1L69A 1L35A 4LDOA 1G0GA 4RLMA 3TXDA 1IOSA 4RLNA 1LTMA 1GE3A 1JQUA 1LAAA 3WPJA 4ETCA 1FLUA 3TXIA 4H92A 3F6ZA 1IR9A 1LJ4A 4NGZA 114LA 4QY9A 1L08A 1L05A 1LMPA 1BB6A 123LA 193LA 1GFGA 1T8FA 1L42A 4XENA 1KY1A 1C6NA 1LJ3A 1L71A 1L11A 1L44A 1Z55A 4B1AA 4BS7A 2DQDY 1L00A 4I7RA 1SSYA 4YENA 120LA 1F0WA 1L67A 4H9IA 194LA 1L40A 1LSGA 1GBWA 178LA 2OTZX 2G4PA 1L49A 1DYGA 1L94A 3B0KA 2I25L 3FI7A 1EQEA 1FN5A 5LVHA 5II3A 1B2KA 127LA 4PHIA 3TXBA 168LA 5A3ZA 5APDA 5L9JA 2EPEA 5KKJA 4G4CA 1L0KA 1GF4A 1WQRA 3C7WA 2BQBA 1RCMA 2F4GA 3AZ5A 1IIZA 3WPLA 1GBZA 1ZMYL 1EQ4A 1EL1A 4WL6A 5JENB 4TSCA 4PK0A 1JUGA 1P46A 1OV5A 3GXKA 1LHKA 2EQLA 3J4GA 1KIRC 2NTHA 3RNXA 4G4HA 4GBRB 1CV4A 4M6DA 4WM3A 246LA 1L59A 1YKXX 5ILCA 2MEBA 4YOPA 3SB8A 1CJ9A 4DJHA 1V7SA 2HECA 104LA 4D9ZA 1L14A 1IEEA 1C6FA 1C60A 1GFRA 1JTMA 1NHBA 3OE0A 4DDCA 1P5CA 215LA 1DQJC 1KY0A 225LA 1L39A 1SWZA 3AGHA 161LA 1T8AA 3DN8A 4B4JA 1AKIA 1D2WA 1GD6A 4OWEA 3EXDA 1L20A 1L13A 1YKYX 1L64A 4GLVA 3C80A 1CTWA 4GN5C 1L76A 1HEWA 2RBPA 1I20A 4FDYA 4W59A 3WUAA 185LA 3GUPA 186LA 148LE 1LJGA 1EPYA 3GUOA 2ZYPA 4MR1A 149LA 1B9OA 5B1FA 4XYYA 4LFPA 2BQCA 1OUHA 3DN4A 3C8SA 2B7XA 1SX7A 1OUAA 1HEMA 3BKHA 1YKZX 4NG8A 1LI2A 2F32A 1C6AA 1F6SA 1LYOA 1T3PA 5FEKA 1UIDA 1LJEA 1C45A 1G06A 4GCFA 3A8ZA 4RW1A 1QIOA 1IY3A 4I7JA 2ANVA 1QUOA 4N1CC 251LA 4N9RA 1LZ5A 1C6IA 1SLYA 1B7LA 3G3XA 4ARMB 4R6CA 1G07A 111LA 1LZ4A 162LA 1GFJA 1PQIA 1OUBA 5KXZA 248LA 3D3DA 1L06A 5C6JA 1L84A 3HT9A 227LA 3LZ2A 3ZVQA 1L25A 5LYMA 2BQFA 1XEJA 1L91A 3HH3A 1LHMA 1L29A 4I7SA 2DQAA 4I7TA 4WLTA 1HELA 1GF0A 1RI8B 1L81A 1JKAA 4EKQA 1J1OY 1GEZA 4CJ2A 1L87A 3WXTA 2G4NA 6LYZA 1VDPA 5APEA 1GFEA 4PJ2C 1LI6A 1A2YC 1DYDA 1OUIA 5ILFA 5KJ9A 1IC4Y 2HU1A 3B0IA 2RSCA 4L41A 4PJZA 5APFA 1KS3A 4W96A 4DQJA 1IWTA 1CV3A 2RBSA 4RW2A 4HJYA 1T6HA 5J7CA 1C6GA 3FA0A 4TWSA 1T6VL 1E8LA 261LA 2O7AA 1LZBA 1I56A 1LZYA 1HFXA 1WQPA 1V7TA 3GUJA 2QARC 1ZV5L 4PRQA 2CGIA 3DN1A 2IFFY 1L0JA 1LSBA 1LZ8A 3L2XA 3LHMA 1NWGA 1VDSA 2RBQA 1L63A 4W52A 1D0MA 1L12A 1VEDA 5KXNA 5A3EA 1JJ1A 3P66A 1GBOA 2H9KA 4DD0A 5KY1A 2F2NA 142LA 3W6AA 2BQHA 1CX7A 3M18B 1L73A 1CNSA 1D3JA 1YANA 2BLYA 1GPQC 2B6ZA 1NDMC 109LA 1IORA 1C67A 4KT3A 5F9XA 1BB7A 3DN3A 3GUNA 4H91A 3SN6R 1LJJA 1IX0A 1L82A 4ARQB 1C69A 2LZMA 184LA 3HTDA 4J1AA 1CJ6A 2HULA 4Z98A 188LA 135LA 1L72A 1UA6Y 9LYZA 4N8ZA 1LHJA 126LA 250LA 1XGPC 1CV5A 3AZ7A 3CDVA 1ZVHL 1G1VA 4XJBA 3HBDA 5KXWA 1L92A 1GDXA 1QUTA 4MSTA 1L83A 2B6TA 2DKVA 153LA 1YL0X 4ZEEA 3HU9A 5DM9A 5I4XA 1B7OA 134LA 1LSZA 216LA 4I7PA 107LA 2B5ZA 2WARA 1GBSA 4BAPA 1G0PA 1C6KA 4EJ4A 1LGUA 1IOCA 1JPOA 138LA 218LA 4ZPUA 2LYOA 3UONA 1SX2A 2HEEA 2HEBA 2RAZX 1LYYA 3W6BA 166LA 1CKHA 2Z12A 2B70A 1C7PA 1GFVA 1QT8A 1XGRC 3G3AB 5KXKA 5B07A 2F4AA 3HUAA 1LZ1A 4NGOA 1L04A 4LYTA 4NGJA 1REXA 214LA 1LZAA 2D4KA 195LA 6LZMA 1LSPA 3LYZA 3HT7A 3WVYA 4CFOA 3AZ4A 1D2YA 2RB2X 4LZTA 1TBYA 4ARQA 3LN2A 2DQFC 2ZWBA 1LWKA 1P2RA 4N1EI 198LA 196LA 2Z2EA 3A3RX 4NWHA 4DDBA 1OYUA 1LCNA 1D0KA 2L78A 1DI5A 1F6RA 1LLHA 1L51A 1WTMA 1JTPL 1C6PA 4H8YA 175LA 4ARJA 3WULA 164LA 243LA 3NYAA 4NSIA 4XADA 1C61A 3V2YA 1GB5A 2G4QA 4HPIA 4H1PA 4I7KA 3G3WA 3DKEX 1BVXA 1G7LC 2YBMA 1OUCA 1HEPA 4LT2A 3J6KA 5LA5A 1B5ZA 1RE2A 2EIZC 4ETEA 2RAYX 242LA 4OWCA 1NBYC 1AT6A 4H9AA 1WVUA 1GF9A 4H9BA 4YX7C 165LA 3AGIA 1DYEA 5KXPA 4I7NA 1GB7A 1C6BA 5K7OA 1D9WA 4I0CA 3OE6A 223LA 3L64A 4NSJA 4W53A 1HF4A 3CB7A 3TXGA 1B7QA 1IC7Y 3AJNA 4YXCA 1UCOA 4II8A 1XEKA 4ML7A 4WM1A 2IHLA 5B06A 1L15A 2BQAA 4NGWA 201LA 1QT3A 1LZSA 1OWZA 4UWUA 4GCEA 252LA 1JIYA 2BQEA 2B74A 4HV2A 1LYEA 1QDTA 1G0MA 3WPKA 4HV1A 1UIAA 5I4WA 1QUGA 5KXMA 257LA 1CKFA 3GXRA 150LA 3NY8A 1IR7A 1L22A 1L16A 1ALCA 3CDTA 2OE4X 1GF5A 1QT4A 1JSFA 1L75A 1K28A 1TLAA 4IAPA 3DN6A 2BQOA 3TMUA 4KXIA 2BQJA 2XQOA 3W6EA 182LA 1LHIA 1RJCB 2Z19A 4LZMA 4DD9A 154LA 1GAZA 2BAAA 222LA 1LMTA 2LYZA 4B4EA 1LMNA 4DD2A 4H93A 4OOTA 3DNAA 1L85A 259LA 5FSTA 4TX7A 1YILA 1WQOA 4EKPA 2QB0B 5LVKA 1L36A 1LW9A 1L77A 4WMGA 4ETAA 1B7SA 1FDLY 4GCBA 4W54A 5LVJA 2ZNWY 4DWXA 4YXAC 5DL9A 159LA 1L66A 1FLWA 1T8GA 4LGKA 1LSNA 1BQLY 1DYBA 5M1YA 115LA 3F9LA 1CU2A 5T3FA 5LVGA 1OP9B 2W1MA 2OE7X 4QDNA 4GN3A 4HTQA 1NMMA 2GV0A 1L62A 1VFBC 5LYZA 3A95A 4RDSA 2ZNXY 1LMAA 3A6BY 1GB8A 3CT1A 4H8ZA 1GXV2 167LA 5E9RA 4EMNA 102LA 3QAKA 2YVBA 213LA 1C46A 5KXLA 4ARPA 1REYA 258LA 1JSEA 4M4OA 1GEVA 4H90A 3GUKA 1IC5Y 3WMKA 1O23A 3WU8A 4ARLA 1L80A 1CV1A 2A7FA 4ETDA 2C8OA 240LA 206LA 226LA 1L41A 1L38A 212LA 4LT3A 1L60A 1JKDA 4WM6A 5EBHA 1GE1A 1I6SA 1LSDA 144LA 1L19A 1G7HC 254LA 1OUDA 3TXKA 1INUA 1GF3A 3RZEA 4IASA 4WO6A 1LSCA 1LGXA 3CSQA 1L88A 4WLDA 131LA 1L54A 1P2CC 1IP7A 3DMVA 4YF2A 3HTGA 4H9FA 3C7ZA 4NGIA 1BWIA 1CU5A 3WXUA 1J1XY 2FYDA 5I53A 1FLQA 2LZTA 4WM2A 4WLYA 1WTHA 4EOFA 4GCCA 1GWDA 4WM5A 1SWYA 5HQ1A 1WQMA 3D9AC 1L26A 1LMCA 3GUMA 4NGYA 1KXWA 3DMXA 4NHTA 1CKDA 3DN2A 1LJIA 4HTKA 1CX6A 1G0KA 1OV7A 4LT0A 1PZYA 2OE9X 5L3HA 4W58A 1L17A 1L43A 4NGKA 1C63A 5HNLA 2HU3A 2OEAX 5C6IA 1JJ3A 1H6MA 1LI3A 4YEOA 1A4VA 2OU8A 4H94A 1FLYA 1LZ9A 3C81A 5L3IA 3TXJA 1C10A 3BKVA 4NSGA 1LZCA 4B4IA 4OO9A 1D3MA 2XTHA 3HH5A 3HWLA 173LA 4EPIA 5IDDA 1JKCA 1L65A 1DKKA 4O34A 1T97A 4CHXA 2F47A 2HEFA 5LXWA 5B59A 3C7YA 1JITA 7LZMA 1L46A 157LA 1D9UA 1W6ZA 1L79A 4H9CA 140LA 5KXOA 2RBOA 1DPWA 110LA 6LYTA 1L55A 3MGWA 3AYQA 2A7DA 2Z39A 3HH6A 1GF8A 4PGJB 1IP6A 4G4BA 4WM4A 2ZIJA 1B5YA 1QT6A 1L86A 4CFPA 2MEDA 2O79A 1B5WA 2RB0X 1LGWA 1IWXA 262LA 256LA 143LA 1P56A 3DN0A 4HP0A 2RH1A 1FBIX 1PQDA 4ARMA 4DD7A 2N5ZA 181LA 4B49A 1QSBA 2D4IA 2YBJA 1JJ0A 1P37A 3A96A 4I8SA 1GB2A 1QSQA 3K3TA 1YAPA 155LA 1GFUA 1OVHA 1UIFA 3EO5A 1JTOL 1YAQA 3CDRA 3C8RA 4KPMA 1L09A 5LIOA 1UIHA 3V2WA 1IOTA 5HNCA 3ATNA 1D3FA 1TCYA 3N9EA 1FKVA 3T36A 199LA 3ATOA 5F81A 3HTBA 1BHZA 5I54A 4WL7A 1P6YA 1B7NA 2RBRA 1LJKA 3M3UA 3SBBC 4LT1A 1ZWNA 1B0DA 4J7VA 1GDWA 4W55A 125LA 1LYFA 1IWZA 3HH4A 4LFXA 1UIGA 3CT0A 4EKSA 3ODUA 2OU9A 1DZBX 4KL7A 5F9UA 2BQLA 3D4SA 3RT5X 1ZVYB 3IJUA 2B75A 4QEQA 5APCA 3P4ZA 4Z46A 1L07A 1HMLA 5FELA 2Z18A 4LDEA 3C83A 1GB0A 5KXSA 4IJ4A 1LZNA 1CV0A 3KAMA 3WW5A 4C5FA 4ETBA 4ET9A 3QE8A 1BB5A 151LA 3PBLA 1CU3A 1YAMA 1EQ5A 1C08C 1HEOA 1MELL 1CUQA 208LA 112LA 5HMVA 3A94A 4NWEA 2DQEY 1JHLA 2FYCA 2Q9DA 118LA 1C6CA 3OE9A 1L70A 1AZFA 1RFPA 1GAYA 3CSZA 171LA 4XJFA 1L27A 3LYOA 1MLCE 4G9SA 1BB3A 4HTNA 3TMXA 1TDYA 4LYMA 2MEEA 1LYJA 2VB1A 1L74A 1L50A 2HUMA 1D0LA 245LA 1B7MA 1L52A 3HBEX 4NGLA 1QTVA 1C64A 2D4JA 2HUBA 163LA 1GF6A 2BQNA 4DD3A 1L31A 3HTFA 1LZTA 1KXYA 108LA 4LDLA 1NF5A 1GE2A 1LYGA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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