4DQ5A

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (wt)
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
173
structure length
164
Chain Sequence
LQALSRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYPKQSEAAVAAVAAARNQHVKESWA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Membrane protein
source organism Pseudomonas phage phi6
publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5wt
total genus 59
structure length 164
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dq5A00
4DQJA 4DQ7A 4DQ5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1Z55A 244LA 2HEFA 1LYOA 2H5ZA 1HENA 1L40A 209LA 4PPOA 4ARLA 1B9OA 1HNLA 3DN4A 1D3JA 1UACY 219LA 126LA 3HTGA 1NDGC 4YF2A 1LSMA 1L58A 1LSYA 3CDQA 3ULRA 2RAZX 4TX7A 4NHSA 1HC0A 1KNIA 4EKRA 1LZTA 2B70A 3AJNA 3G3XA 2BQMA 1L36A 1FDLY 1YL0X 4TUNA 5T3FA 170LA 1GF3A 1REZA 4LT1A 4NSGA 3TXIA 2ZQ3A 3C7WA 1CU5A 3HBEX 3V2WA 4CFPA 4IJ4A 2DQEY 2BQKA 1KY1A 4B0DA 5DN5A 4G9SA 1YKXX 3ODUA 6LZMA 3T6UA 2N5ZA 1D6QA 1CV6A 1VDTA 1T8FA 1LZBA 4PRQA 1J1XY 1LJFA 4DDBA 1L41A 152LA 1PQOA 3RNXA 225LA 1IWUA 3ZVQB 5APCA 3C8SA 1PQMA 1IWWA 107LA 2XJWA 4Z41A 4GCBA 1L13A 237LA 4W57A 200LA 1L03A 1J1PY 1CNSA 1CJ9A 2O79A 1JJ3A 4XJHA 3CSRA 1LJKA 1IWZA 3N9EA 164LA 2CWIA 3LN2A 1LZNA 3SP3A 1L24A 4HPIA 1LSNA 4DD1A 1LYJA 2Y8PA 1JIYA 2F4AA 125LA 5FCPA 4OO9A 3D3DA 2HEBA 1LJ4A 1OWZA 1PQJA 214LA 3N9CA 2G4PA 183LA 1XGQC 1I1ZA 1B5VA 1QUGA 5KXOA 188LA 3HU9A 4NEBA 1LYEA 4HPEA 1LYZA 1VAUA 2Z2FA 3WU9A 3CSQA 1LTMA 169LA 1AT6A 4G4HA 233LA 5K7OA 3CT0A 1AZFA 3W6DA 1LHMA 1C6IA 2XBRA 2BQAA 4EOFA 1AM7A 5KXWA 1G0MA 1CUQA 2PC2A 1FBIX 1GB5A 3AZ7A 3TMWA 2HECA 5I4XA 1OWYA 3HTBA 2BLXA 5E4PA 5B05A 5KXLA 1REXA 3AZ4A 4DD7A 1GBSA 4DQ7A 1P2RA 141LA 3HWLA 1L52A 206LA 3AW6A 144LA 2MEHA 119LA 1LZGA 1L34A 3A93A 2HU3A 4WM2A 1P2LA 4E3UA 3WUAA 4NFVA 1L64A 1C6AA 242LA 3L64A 1C7PA 3P66A 3W6FA 1W6ZA 256LA 1LZ1A 166LA 2ZYCA 5KXXA 1L95A 228LA 3C81A 4NGZA 1DYCA 1B6IA 187LA 1UIHA 1QSQA 4NGJA 4HV1A 1JITA 1JTPL 1G0QA 1P37A 5DL9A 5KJ9A 7LZMA 4HJYA 3CDOA 181LA 4ETDA 4BS7A 1WTMA 110LA 1CU0A 1L69A 1LSDA 1C64A 4B4EA 2YBMA 1LHLA 3EBAB 156LA 1IWTA 2RB1X 1L07A 5ILFA 2B75A 1L33A 207LA 3LZMA 4I0CA 1KW5A 1GE3A 4C5FA 3HH4A 1G7JC 1GF6A 4YEMA 4W58A 1LSPA 2B6XA 1LYSA 1G0GA 1FKVA 2FBDA 1NDMC 2HUKA 5JENB 4J1BA 5FEKA 2W1MA 3TMUA 4HSFA 103LA 1QT6A 1L63A 4PRUA 1VDQA 3ZVQA 2EPEA 1L98A 2DQDY 7LYZA 3PDSA 5F81A 5LYZA 4UWUA 1P6YA 1CU6A 4I7PA 1T6VL 1SX7A 2YSSC 3DMXA 5HMVA 4DAJA 2ANVA 257LA 2OU8A 4H9FA 1DYDA 2B6WA 1QTDA 1G0PA 151LA 3CQLA 2MEGA 3GUJA 1ZVYB 1L91A 4CHXA 1L75A 3OE9A 3WH1A 5M1YA 3DN8A 1ZMYL 3CDTA 5I4WA 1B7LA 4C3WA 1LHIA 3DKEX 5KY1A 1JSEA 217LA 4ARPA 1BB7A 1HEPA 1GFHA 4WLDA 2Z6BA 2F47A 3CB7A 4ETAA 3HT9A 1GB8A 1C6EA 1GDWA 4TTDA 1ZWNA 3HBHA 4DYGA 4WO9A 3TMVA 1AKIA 4QEQA 2D4IA 1GE4A 2Q0MX 1L96A 3G3AB 1UIFA 3GUNA 4PJZA 1L71A 1BB5A 1W08A 2DQHY 4RW2A 3A34A 4YENA 133LA 1FKQA 1L27A 1GFRA 4QDNA 1QT4A 1L32A 1QTZA 4YXAC 155LA 2MEEA 4NSJA 1XEKA 3WVYA 3GULA 2OU9A 2BQOA 150LA 4LFPA 1GBZA 3GXKA 4LZTA 2XTHA 1JKCA 2Q9EA 112LA 1GDXA 229LA 2CUUA 1L94A 3AGIA 140LA 4M4OA 1L02A 4P2EA 3NYAA 1LZ4A 216LA 1LZAA 139LA 1BGIA 1WQOA 1GB2A 1KY0A 1IR9A 1L31A 3PBLA 161LA 3SBBC 3WU8A 1LAAA 1L89A 1LI2A 3DNAA 4I7TA 135LA 3L2XA 4N5RA 5FSTA 3EO5A 4ZIXA 1OUDA 2XQOA 1L86A 1SQ2L 1G7IC 4WM4A 4W56A 3TXEA 1C6QA 2FYDA 1QSAA 4RDSA 4LDEA 4GCDA 1SWYA 3KAMA 3RZEA 1GF9A 1ZYTA 1P36A 3ATNA 1QSWA 2L78A 3J4GA 3B72A 1L15A 4W53A 4NSHA 1IP6A 4I7MA 4EKQA 2X0AA 5LINA 4LYZA 3NY9A 1G1WA 1L84A 3HT8A 1L70A 2F32A 2ZNWY 1LJHA 1CTWA 1LJEA 3RW8A 1GE0A 4NGKA 1BWIA 2C8OA 3HDEA 1TLAA 4NGYA 3W3EA 2W1YA 1C62A 5DN4A 1KXYA 1L83A 1DPXA 2RB0X 6LYZA 3WW5A 1G7LC 3K3TA 146LA 5A3EA 4N1CC 4DDAA 1UIGA 1D9WA 3G3WA 1L57A 4J1AA 177LA 4NHTA 3D4SA 1GE2A 220LA 2MECA 4I7SA 4WM6A 1DXJA 1B7QA 4IASA 1MELL 1LCNA 5HQ1A 2B6YA 3OK0A 1B0DA 3UONA 4GRVA 196LA 4NWHA 2QB0B 1NWGA 4EKSA 1NMMA 2OU0X 1IP5A 2YBHA 1B7SA 2LYOA 1GD6A 215LA 2RAYX 3WMKA 4OOOA 1KXWA 5L9JA 1F0WA 3C83A 1C6KA 1QDRA 1GB3A 189LA 3OJPA 5LZMA 171LA 1UBZA 3FA0A 4DWXA 1D3MA 3A92A 2B72A 5LAGA 1LI3A 165LA 2DQGY 4LT0A 1QTEA 2ZYPA 1IC5Y 3BKVA 4WM5A 4I8SA 3WPJA 243LA 3WPLA 1GFUA 1D3FA 1RFPA 3P64A 4LZMA 195LA 2YBIA 1L51A 3HT7A 2Q9DA 2B6TA 2OE9X 1GXV2 1DYBA 1T97A 1D6PA 1C6HA 4DQJA 2O4WA 4R6CA 1KIRC 1DYFA 3QNGA 4BADA 1GWDA 3IJUA 4R0FA 4H9EA 1LZEA 1WVVA 1LSGA 4X3BA 154LA 1LJNA 4WM1A 5LVGA 1L23A 1CKCA 1L87A 4PHIA 5L3IA 3RUNA 1JWRA 1LJJA 1EQ5A 5KXPA 4AXTA 1TCYA 1LYGA 4J7VA 4DJHA 1GFAA 4S0WA 3DN0A 4TSBA 1IOSA 4NY5A 1L49A 1WQMA 1L09A 2DBTA 1GB6A 3VWOA 224LA 2BLYA 118LA 4OWHA 3SB6A 210LA 4GCEA 1L10A 2H9KA 2ZIKA 1JJ1A 1HF4A 4PJ2C 2EIZC 245LA 251LA 163LA 115LA 4H8XA 1LYFA 1QUSA 3GUIA 4NHQA 208LA 3WYHA 4DDCA 3SN6R 3TXFA 1L38A 253LA 1C6PA 153LA 191LA 1JTNA 1L44A 1CV0A 1HMLA 4W55A 1BB4A 5B1FA 1LMTA 1FLQA 145LA 185LA 3OE8A 3C8RA 2F2QA 4LDOA 1L62A 4LYBA 2CGIA 127LA 4ETCA 1T3PA 3GXRA 1KIQC 1L22A 4WOAA 1JQUA 5LA5A 1EQ4A 2OE7X 2D4JA 1G1VA 1T8GA 2B6ZA 1YROA 2IFFY 4MCKA 1REYA 2D4KA 4GN5C 1CVKA 5I5QA 1LI6A 2ZILA 4WLYA 221LA 1UIAA 3FI5A 1LZCA 4DD0A 1L46A 1T8AA 3AB6A 1L08A 1LGUA 160LA 1HEMA 1LHJA 5I14A 246LA 2OTYX 226LA 4NGOA 5LAFA 4YXCA 3IJVA 2CDSA 2VB1A 1LZRA 1IC7Y 1GAZA 2IGCA 1LKSA 1V7TA 1NHEA 4PK0A 1OQMA 1J1OY 1LSZA 5LIOA 1IP4A 1L93A 1BB3A 1GFKA 1L35A 3TXDA 3G3BB 1CUPA 1DQJC 1LYDA 4B1AA 4D9ZA 236LA 2HUBA 1C63A 1YAQA 1LSFA 2MEDA 3B6LA 1LSCA 3AGHA 111LA 1JTTL 3OE6A 2GV0A 1YQVY 1G7HC 5A3ZA 1L0JA 4CFOA 1XEJA 259LA 4G4BA 1PZYA 1B5WA 1XGUC 2BQJA 3QY4A 3W6CA 1OUAA 122LA 1L01A 4NGVA 5KXSA 1AT5A 1B5ZA 1QS5A 2HU1A 4H90A 123LA 2RH1A 197LA 1L16A 159LA 5E9RA 3C8QA 1DYAA 1I56A 4H8YA 1IWVA 1DI5A 1L11A 1C65A 1VEDA 1N4FA 4WL7A 1LMOA 1GPQC 3V2YA 1DKKA 3QAKA 2OEAX 5KXTA 4NG8A 3WUNA 3HBDA 247LA 182LA 1HSWA 1L14A 3DN6A 1KIPC 1VDSA 1HSXA 1HFXA 2Z37A 2WARA 1VATA 108LA 1XSFA 5KKJA 1GAYA 4I7KA 4K5YA 1LZ5A 1L47A 1F6SA 1P7SA 3AZ5A 2QARC 1E8LA 1IEEA 1JTMA 5HNCA 1CU3A 4IATA 1JPOA 4I7LA 148LE 1L54A 1YAOA 4Z46A 4HJVA 1SSWA 5IELA 1EPYA 1JJ0A 1PQDA 4NWEA 1T6HA 2A7FA 5FDJA 4ETBA 1C67A 2BQFA 1XGPC 250LA 3BKHA 205LA 4LGKA 1PQKA 4NSIA 1GF5A 1LGXA 1PS5A 4ZFPA 1D2WA 3TXKA 1CJ6A 1XJTA 4GN4A 2G4NA 1B5UA 1WTNA 1LYYA 1LGWA 3GUOA 1L60A 4OWAA 4I7RA 5KXNA 1GFVA 1TEWA 1ALCA 1D0KA 2BQLA 3WUMA 3DN3A 1H87A 4MSTA 192LA 1IP1A 3JR6A 1L30A 1L97A 3C7ZA 3HT6A 1LJGA 5D5FA 1PQIA 1GBOA 1BB6A 1LZDA 1LJIA 3SB5A 1C6FA 3HFMY 2YBJA 3WL2A 4NGWA 2Z38A 3AGGG 102LA 3WW6A 4KPMA 4ET8A 2FBBA 5AMYA 241LA 5HNLA 4ARQB 1GBYA 5C6LA 3FE0A 4XJBA 4ANRA 1LPYA 1XFPL 4XJIA 1OUCA 2BQNA 2EKSC 2OE4X 1QUDA 4FDYA 4NHIA 2RBOA 5LYMA 2DQIY 3SB8A 2BPUA 1C6GA 3RZ4A 1LWKA 1C6JA 1L43A 1L80A 1HHLA 4KL7A 2DQFC 1GEZA 1C66A 4U3XB 1K28A 128LA 4LDLA 2BQEA 1L68A 2BQIA 2NTHA 1DYEA 5KXZA 2RBNA 222LA 1BWJA 4J0LA 5F9XA 4G49A 1DPWA 1CJ7A 1GB7A 1LZ9A 1G7MC 4EJ4A 1D2YA 1BQLY 2MEBA 3HUKA 254LA 137LA 3ZEKA 2BQDA 4H9CA 1L45A 2LYMA 1LHHA 3AW7A 3A67Y 1EQEA 3HH5A 1GBXA 248LA 1L21A 1YAMA 1C6LA 1SX2A 1LZ8A 1WTHA 201LA 1WQQA 4Z98A 1OV5A 4OWCA 4QGZA 1L66A 238LA 4N1EI 223LA 5FHWA 2ANXA 1G0JA 4KT3A 1UICA 1IP2A 213LA 3DMZA 4DD3A 4GN3A 5II3A 1L39A 4LT3A 1I20A 3AZ6A 4H9BA 167LA 1B7PA 4HTKA 2LZMA 1IWYA 4YOPA 4HTNA 1L53A 5LVJA 1C45A 3T36A 2BQBA 2XBSA 4W52A 4WMGA 1L65A 4UWVA 3WULA 172LA 3A95A 2Z18A 1HFYA 1HEQA 3LZTA 4BAFA 2RBSA 5LXWA 1L73A 3CT1A 255LA 1O23A 1IWXA 1YANA 239LA 1A4VA 8LYZA 1JSFA 3K2RA 142LA 1L42A 1NHBA 4W94A 1L04A 138LA 3QE8A 1L0KA 212LA 1B5XA 1HEOA 1L26A 1RI8B 3HH6A 1B7RA 3GUMA 1C6TA 1CV5A 1IP3A 1L48A 2MEIA 2Z12A 2BQGA 235LA 2DQAA 4I7QA 2LHMA 1FN5A 2I26L 1OUHA 1C10A 1TAYA 3C7YA 198LA 2I6ZA 1CX6A 2HEEA 2DQJY 2NTGA 1C61A 4WLXA 4OOTA 3A6BY 4B4IA 1UIEA 3TXHA 4ARQA 1P56A 4ET9A 1YL1X 5ILCA 2D91A 3CT5A 1L55A 2NWDX 5F16A 1IO5A 1JUGA 3F6ZA 1P64A 2H9JA 1D3NA 1YIKA 1IX0A 3W6EA 3AYQA 3F9LA 5LVKA 1WQRA 5DLAA 2RB2X 3WXTA 5LVIA 5EBHA 4DD2A 5IDDA 3TXJA 1QTKA 1QTHA 1YKYX 3HDFA 1LHKA 1C43A 2G4QA 1IIZA 1C6BA 4ETEA 1QQYA 2BQCA 1UIBA 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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