4DQ7A

Structural investigation of bacteriophage phi6 lysin (v207f mutant)
Total Genus 56
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
56
sequence length
173
structure length
168
Chain Sequence
LQALLPKNSRVRFTTAEVDSAVARISQKIGVPASYYQFLIPIENFVVAGGFETTVSGSFRGLGQFNRQTWDGLRRLGRNLPAFEEGSAQLNASLYAIGFLYLENKRAYEASFKGRVFTHEIAYLYHNQGAPAAEQYLTSGRLVYPKQSEAAVAAFAAARNQHVKESWA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Membrane protein Phi6 P5
publication title Selective pressure causes an RNA virus to trade reproductive fitness for increased structural and thermal stability of a viral enzyme.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas phage phi6
total genus 56
structure length 168
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-02-15
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.50 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dq7A00
4DQ5A 4DQJA 4DQ7A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1C6CA 1CV0A 4WM5A 1L47A 1KY1A 1J1PY 2O4WA 4WLXA 3KAMA 234LA 1B7NA 158LA 2HUBA 2B5ZA 2RB1X 3F9LA 3WUNA 127LA 1LJGA 3AW6A 3A90A 1DQJC 4HJVA 252LA 1GEZA 4M6DA 3E3DA 1REZA 2HTXA 3G3XA 108LA 3TXGA 1GE1A 231LA 2FBBA 1LTMA 1QT8A 1D9WA 1JSFA 2XQOA 1LJEA 1SWYA 1GB6A 1DYBA 212LA 4Z3MA 5B1GA 1L52A 1L81A 1LHIA 5FEKA 2DQEY 4NSGA 5I53A 1JTMA 1OUGA 2FYCA 4ETAA 5I4WA 3V2WA 5DN5A 3PDSA 230LA 216LA 1CU5A 3W6BA 4TSBA 1GB7A 1L43A 4ETEA 5HNLA 1QUDA 1KIRC 1QT5A 2MEIA 1G0JA 1GF3A 1GFRA 1OUFA 2HEBA 4GCDA 1LWGA 3CDOA 4IJ4A 1QTZA 242LA 1CJ6A 1DI4A 1B5ZA 4H1PA 1LZRA 4EKRA 1LZAA 4GCEA 1D6PA 2HU3A 4G4BA 1GE3A 1L38A 4OWBA 5APEA 140LA 1OUHA 3SP3A 4W58A 132LA 1EL1A 248LA 4MR1A 1JEFA 5F16A 1JTNA 1B7SA 1OUIA 1GFVA 1C6JA 5I4YA 1L50A 1CKHA 1L0KA 1LSPA 3AGGG 1QDTA 2F4AA 4DD1A 2X0AA 1C60A 1L84A 1KW5A 2C8PA 1SSYA 4NGIA 1AM7A 1L41A 1L94A 152LA 1LWKA 4ZEEA 2LYZA 4WLDA 6LYZA 3N9AA 1SQ2L 259LA 4I7PA 1SWZA 4H93A 5FSTA 1TLAA 2O79A 2H5ZA 3LYMA 1G7MC 1G0QA 4HP0A 186LA 2W1YA 1LYIA 1HF4A 5KXRA 3ZEKA 1GF7A 4ARLA 1LSGA 3A91A 4DD9A 1NQIA 1UBZA 4YF2A 1HFXA 2BQNA 3C8RA 5KXYA 1LJJA 2DQDY 1LMOA 5I4XA 1ZURA 1L33A 1CTWA 1LZ4A 2HEAA 1L17A 1L51A 3N9EA 1ZYTA 3FADA 4HV1A 1L88A 1LYGA 3UONA 4I7JA 3W6FA 1HHLA 3SB8A 174LA 3RUNA 3TMWA 1W6ZA 3C82A 1L68A 3HBHA 1GFAA 1LZ9A 1CJ7A 1IR9A 4KL7A 1SLYA 4XJHA 3J4GA 1B7LA 4H92A 190LA 1L54A 1DYFA 1FDLY 1L37A 4TTDA 1L24A 1REYA 4AQNA 1LKRA 1WTMA 1IP4A 1LYDA 1JKDA 1LYEA 3EMSA 5KXPA 1C10A 1UIDA 4KT3A 1G7LC 1QTEA 3TMUA 125LA 1L23A 3A93A 1HEWA 3HTGA 2CDSA 4O34A 5C6IA 5FCPA 2OE4X 3WVXA 1FN5A 236LA 1L93A 2XBSA 256LA 2F4GA 1LZCA 4HV2A 1PS5A 5LA8A 4E3UA 2A4TA 1LHKA 4NGLA 187LA 1YL1X 1GBWA 1F6RA 159LA 4H9IA 3WVYA 4NGYA 4A7DA 1K28A 2OEAX 4ETCA 1LMPA 107LA 1F0WA 3TXJA 2I26L 146LA 4I7SA 4RDSA 1BB7A 3OE6A 1CV4A 1INUA 4H90A 178LA 1ZVYB 1C08C 1C68A 2YBNA 207LA 2Z19A 1JPOA 4EKPA 2YBIA 3HH5A 1C66A 5DM9A 1GD6A 1HMLA 1T6VL 232LA 5LVJA 1L83A 4CGEA 1B0DA 1F10A 1LZSA 1V7SA 3WUAA 1J1XY 4W53A 1GXV2 1W08A 2B7XA 148LE 147LA 218LA 8LYZA 4HPIA 1V7TA 4RW2A 5IDDA 2BQBA 1YAMA 215LA 1XGPC 1OUBA 1L92A 2ZYCA 5KY1A 1GAZA 1IP6A 2YBHA 3LYOA 4N5RA 3AW7A 111LA 1JJ0A 3FE0A 3WH1A 4L41A 172LA 4GN5C 4G49A 1GFEA 2YDGA 1VDQA 3D9AC 1REMA 3W3EA 4H9AA 1OUCA 1OVJA 191LA 3L2XA 4B49A 3C8QA 1IWXA 4YXCA 3CSRA 1LYHA 1BWHA 1GE4A 1KS3A 2HUKA 3HUKA 1GF4A 5LZMA 1IEEA 2ZWBA 1GFKA 4N0JA 5ILCA 2HEEA 4ARMA 4M4OA 3HDEA 4IASA 1QUGA 4UWNA 2EPEA 1UIBA 1YIKA 4PRQA 1EQ5A 1P7SA 4H8ZA 3HDFA 1GAYA 1LMNA 1L06A 2B6XA 1FKVA 1C6MA 1LJHA 1OUEA 6LZMA 3GXKA 1MELL 1LYJA 1OUJA 2Q9EA 1YAOA 2BQEA 1L48A 5APFA 1LZYA 3G3VA 2ANVA 5D5FA 4DAJA 3B0OA 1C63A 1L57A 5LYTA 4HTNA 1DYDA 1CKDA 1B5WA 4W52A 3WW5A 1C43A 245LA 1C6HA 1GFUA 182LA 1L62A 3A96A 1XJUA 1LSMA 3TMXA 219LA 2N5ZA 3A92A 3EXDA 1L21A 1IWYA 2LC9A 4DQ7A 1KIQC 4YENA 2B6ZA 143LA 2BQCA 214LA 2RH1A 2Q9DA 1YROA 4LZMA 102LA 1LSBA 2Z38A 2Z37A 3T36A 4ZFPA 1L64A 1GFGA 180LA 2FBDA 1IR8A 1LLHA 4I7TA 1TBYA 1L11A 2DQGY 3LZ2A 2RAYX 3ZVQA 3W6AA 1QT6A 1RI8B 4Z41A 2G4NA 3HT9A 5LA5A 1LSZA 3LYTA 171LA 4AXTA 4NFVA 254LA 1P3NA 160LA 1VDTA 1GB2A 5HLLA 2C8OA 1JKBA 3DMVA 4QGZA 1UA6Y 1T6HA 1FLUA 4I7KA 1BVKC 1L12A 3DKEX 189LA 1IY4A 2LZMA 3FA0A 1C6FA 177LA 2Z39A 3DN8A 2OE7X 1D6QA 3GUNA 2HUMA 1P36A 4PJ2C 4H8XA 1L71A 3J6KA 1L75A 4I7OA 4HJZA 1LJ3A 1L22A 1QUTA 1XEJA 3QNGA 2CWIA 1IOTA 1XGQC 1UIAA 1OV5A 2MEGA 1BVXA 1UIFA 1L0JA 4DYGA 156LA 1IR7A 128LA 1G7HC 4H9EA 1C46A 2EQLA 220LA 1QTKA 1WQQA 2D91A 2IFFY 4PJZA 5LYMA 3A67Y 1BB3A 5LVGA 4LZTA 1LSYA 257LA 145LA 1C45A 208LA 2B6WA 2HEFA 5II3A 1D2WA 1UIGA 5HMVA 1L34A 1L89A 1FBIX 260LA 3M18B 1LSNA 139LA 1UICA 123LA 1QDRA 4UWUA 3TXHA 1LSDA 1L32A 4H94A 1L49A 2MECA 4GCCA 2D4IA 1L27A 2W1MA 1L85A 4NHSA 1L99A 4KXIA 5I5QA 4TX7A 1P2RA 1CJ8A 3RZEA 225LA 4DQ5A 4OWHA 4ARMB 1L65A 3WYHA 2LYOA 4G9SA 1JKCA 4EMNA 1XGTC 1L10A 1P2CC 3C7WA 3LZMA 4HSFA 3AB6A 2F2QA 3B6LA 1OWYA 1C64A 1LHMA 1CV3A 5LIOA 3P4ZA 5C6JA 1GBOA 1IVMA 5L3IA 1GFTA 4LDOA 2BQGA 2Y8PA 3D4SA 1L42A 3D3DA 4B1AA 5M1YA 5L9JA 206LA 4G4CA 201LA 253LA 2LHMA 1YILA 4DJHA 2LYMA 1L03A 1GF0A 4ZPUA 4WM3A 1IP5A 1WQRA 1QUOA 1LGUA 250LA 3A6BY 164LA 4DKLA 1L08A 228LA 3TXKA 1XEIA 1D0LA 1UUZC 1C65A 3WUMA 4DDCA 3G3AB 4WL7A 1OWZA 1IWUA 194LA 1IC5Y 2IHLA 4YEMA 1VAUA 2YSSC 1LYOA 5KXWA 3LZTA 5IHGA 1BB6A 103LA 1OP9B 1GF5A 4LGKA 130LA 3T6UA 1OUAA 3A34A 185LA 1I1ZA 1AKIA 4W96A 1DYCA 4DQJA 1YL0X 1LZ1A 1L58A 1LJNA 1YAQA 3OE0A 4PGJB 3B72A 1G0GA 4EPIA 1QIOA 1G7JC 5FDJA 1BGIA 3AYQA 2B70A 3G3WA 1GB9A 4LYBA 1L60A 1QT3A 1L13A 4R0FA 1B7OA 3IWRA 3CSQA 1C6LA 3P66A 1NHBA 3HUAA 144LA 1D2YA 2H9KA 4I8SA 2ANXA 1P5CA 3HH3A 1L15A 4DC4A 4LT3A 4NGOA 1L80A 4DD7A 1ZVHL 4WG1A 2YBLA 1UIEA 3NYAA 1QTBA 2G4PA 5FHWA 184LA 1L96A 1NHEA 2D6BA 1HEMA 1FKQA 1G1VA 2XBRA 3DNAA 4WLYA 4ARQB 4HTKA 3HH6A 2WARA 3CT0A 5KJ9A 3AZ5A 4N1CC 3EMLA 4IATA 3CQLA 5JENB 1BHZA 3C83A 1WQPA 1L55A 4RW1A 2I6ZA 1C62A 5LYZA 6LYTA 1JKAA 4EJ4A 1P56A 3HBEX 3SBBC 4W56A 1CKFA 2BQMA 4H91A 5B05A 4XJFA 3GUJA 1CUPA 1GDWA 4LYZA 1LZEA 4S0WA 4NG1A 1LPYA 1IC4Y 4N8ZA 1D0MA 1L01A 1L73A 1BQLY 1IX0A 4KPMA 1C6BA 1XFPL 1B5YA 1L04A 1GHLA 2CGIA 1F6SA 1C7PA 1XGUC 1QT7A 1DKJA 2RBPA 4OOOA 3GXRA 3EBAB 2LZTA 4LT0A 161LA 3AGHA 210LA 1PZYA 5KXOA 134LA 2HEDA 5LVIA 2Q0MX 4XJBA 4WM2A 4D9ZA 1G0PA 1LYSA 3DMXA 162LA 1BWIA 1IORA 4NGKA 4N1EI 3A3RX 5F14A 1CKCA 1L35A 4C5FA 1C6IA 1JHLA 2FYDA 196LA 173LA 3SB7A 1JITA 3WPLA 1C6GA 5KXTA 1DYEA 1Z55A 5I14A 1L40A 4RLMA 3SB6A 1QUHA 3AZ4A 3TXDA 1OVKA 2BLXA 3C8SA 149LA 2Z2FA 4W57A 3HFMY 1HMKA 2MEDA 3HTFA 1YKYX 4ARPA 5E4PA 4EKSA 4RLNA 1P6YA 1JWRA 1LI2A 2F2NA 226LA 104LA 2A7DA 1GB0A 3TXIA 5KXKA 4DDBA 2BQLA 5AMYA 2BQOA 3TXFA 5A3ZA 2DQJY 119LA 1GBZA 1QTDA 1FLYA 199LA 3ODUA 1CU3A 4K5YA 3P65A 246LA 4C3WA 5L3HA 1LI6A 4I7MA 5EBHA 261LA 155LA 3TXBA 4WO6A 4XYYA 1MLCE 2ZQ3A 4UWVA 1CV1A 133LA 1GDXA 1D0KA 176LA 1DKKA 4LFXA 1G06A 1LSEA 3CB7A 2Z18A 1WVUA 3FI7A 1J1OY 3A3QA 1LGWA 2DBTA 2YVBA 2Z2EA 3A95A 4BS7A 4NWEA 3HH4A 1HENA 4OO9A 1G0KA 4HTQA 1GB5A 3LHMA 1EQEA 4ET8A 4Z98A 4W55A 4EOFA 1C6TA 4XENA 3LYZA 1TDYA 1QUSA 213LA 1B7QA 3WPJA 4ANRA 1HERA 1KXXA 4TUNA 2W1LA 4R6CA 1JTTL 1GF6A 4LYCA 1N4FA 4ARJA 4CFPA 4YM8A 1B2KA 1WTNA 2HU1A 1LGXA 120LA 3CDVA 2MEBA 1HSWA 227LA 2DQCY 183LA 3HTBA 2OTYX 1B5XA 3SB9A 1IOQA 3RNXA 4DWXA 157LA 4TWSA 4I0CA 1LJ4A 262LA 1TCYA 163LA 2OU9A 2MEHA 1SX7A 2RAZX 1JISA 1L72A 4LT1A 1CU0A 2PC2A 4WL6A 5J7CA 5IELA 1OUDA 1XEPA 4WM4A 224LA 2B6TA 2F30A 1IP2A 247LA 1JUGA 3CDQA 1GBXA 4QEQA 2DQHY 5A3EA 4H9BA 1D3JA 5FELA 5LVKA 4NHIA 4DD0A 4CJ2A 2RSCA 1I6SA 1RJCB 258LA 129LA 4LDEA 2OU8A 1GB3A 2ZNXY 1JTOL 1D3FA 4BAFA 4ET9A 217LA 1O23A 200LA 235LA 1T8AA 3DN0A 4NSHA 2G4QA 141LA 4J0LA 1LYYA 4HPEA 142LA 3LN2A 1PQIA 1KXYA 1AT6A 1LZTA 1C6DA 249LA 4B4IA 1A2YC 2YBJA 4H9HA 4XN6A 2DQFC 5KXMA 2IGCA 1LMAA 3NY8A 4B0DA 5DL9A 1LZGA 1FLQA 1NDMC 1WTHA 3GUOA 3BKHA 4FJRA 3ATOA 3CT1A 5B07A 5DLAA 197LA 2NTHA 166LA 3A8ZA 1C67A 4ETBA 1B7MA 2EIZC 2B6YA 1L86A 2RBQA 3RZ4A 5KXSA 2BQHA 1ZWNA 3ATNA 1JTPL 221LA 4OOTA 1OV7A 4LFPA 1AT5A 2VB1A 3C80A 1C6NA 3CDTA 1HFZA 135LA 2BQJA 5KKIA 1RCMA 3DN6A 112LA 2BQKA 1L00A 1CUQA 1L31A 3HT7A 1IIZA 2ZNWY 1GXXA 181LA 1LZDA 1GF9A 188LA 1QSQA 2CUUA 4YEOA 2I25L 1L09A 5HNCA 165LA 3AJNA 4PRUA 4W51A 1QSBA 4U3XB 4NGVA 3TMVA 3WU8A 1L16A 1L97A 3V2YA 1CX6A 1YANA 1L66A 1G0MA 1L82A 1L05A 4MSTA 4IAPA 4NIJA 118LA 3WMKA 3B0IA 1C6KA 1XGRC 154LA 1B7RA 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