The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
27
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sequence length |
116
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structure length |
116
|
Chain Sequence |
KRQVASGRAYIHASYNNTIVTITDPDGNPITWSSGGVIGYKGSRKGTPYAAQLAALDAAKKAMAYGMQSVDVIVRGTGAGREQAIRALQASGLQVKSIVDDTPVPHNGCRPKKKFR
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
A structural basis for streptomycin resistance
rcsb |
| molecule keywords |
16S rRNA
|
| molecule tags |
Ribosome/antibiotic
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| total genus |
27
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| structure length |
116
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| sequence length |
116
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-02-22 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| K | PF00411 | Ribosomal_S11 | Ribosomal protein S11 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Alpha Beta | 2-Layer Sandwich | Nucleotidyltransferase; domain 5 | Ribosomal protein S11 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4K0K K; 4YHH K; 3J7A P; 3J80 O; 1XNQ K; 3J81 O; 1N32 K; 4GKJ K; 2UXB K; 1N33 K; 1XNR K; 1J5E K; 4LFA K; 4B3T K; 4CVN E; 5LMU K; 4X62 K; 5BR8 K; 3J7Y P; 1N36 K; 4KHP K; 4DUZ K; 1N34 K; 4LF8 K; 4DV3 K; 1HR0 K; 2UU9 K; 4DR6 K; 2UXC K; 1HNZ K; 4LFC K; 4GKK K; 2F4V K; 4LFB K; 4B3S K; 2ZM6 K; 5A2Q O; 4V19 S; 4JI8 K; 4X65 K; 4JI6 K; 4NXM K; 1HNX K; 4LF6 K; 5FLX O; 2E5L K; 1XMQ K; 4DR5 K; 4DUY K; 4DV6 K; 4OX9 K; 4B3M K; 4DR3 K; 4JI4 K; 1I94 K; 4JI0 K; 5IWA K; 4DR2 K; 2VQE K; 1IBK K; 4NXN K; 4AQY K; 2VQF K; 5LMN K; 2UXD K; 4JI3 K; 4YY3 K; 1HNW K; 4LF5 K; 4LF4 K; 2HHH K; 4LF9 K; 3T1Y K; 4DV1 K; 4DR4 K; 2UUA K; 3T1H K; 4X66 K; 4X64 K; 4JI5 K; 2UUB K; 4CW7 B; 2UUC K; 4JV5 K; 5LL6 Z; 4DV0 K; 4DV2 K; 4DV5 K; 4JYA K; 4B3R K; 4LF7 K; 1XMO K; 1IBL K; 4JI1 K; 4DR7 K; 3OTO K; 4JI7 K; 4DV7 K; 5IT9 O; 5AJ3 K; 4JI2 K; 4DV4 K; 1FJG K; 1IBM K; 3JAM O; 4DR1 K; #chains in the Genus database with same CATH topology 1JCF A; 4ZTF A; 3NVK A; 2WOM A; 1YIT N; 1C1B A; 2P9S A; 3EEQ A; 5CZ1 A; 4YOT A; 1GOB A; 2FC0 A; 4E7H A; 3S3N A; 4BR4 A; 4DU3 A; 2O8E A; 3FR0 A; 4GV3 A; 3V81 A; 3CD6 N; 4X62 K; 4OPH A; 3NF6 A; 2RPI A; 3VGK A; 4CHZ A; 4HWI A; 3S9H A; 3EKS A; 4Y1C A; 3FZK A; 1EQY A; 3RVC A; 4CGH A; 1NKB A; 4MQ3 A; 1SV5 A; 1VSL A; 3GDQ A; 1HUX A; 3DRS A; 1JLF A; 4K43 A; 1H1V A; 1VQO N; 1RT5 A; 4MO4 A; 4C8K A; 2G8I A; 1TKX A; 5DMR A; 1YTU A; 3SJJ A; 5A2Q O; 3OYN A; 4YDU A; 1UOC A; 1X9J A; 2DY4 A; 3O1B A; 2IVP A; 4Q0B A; 4CGJ A; 3AO2 A; 2YCH A; 3AVA A; 3LAN A; 4JK9 A; 5CY4 A; 4Q5V A; 4JI4 K; 3LM2 A; 4FWM A; 3VEZ A; 1LCU A; 1TK0 A; 3SNN A; 2A40 A; 4Z4E A; 2WBN A; 4JN4 A; 2VQF K; 2Q0R A; 4LSN A; 4FYD A; 2D0A A; 2GEM A; 3C6T A; 5ELZ A; 5GAG P; 3AAQ A; 4OGC A; 2OTJ N; 2DFE A; 3RR8 A; 4FK2 A; 2P5O A; 1RDC A; 5FPM A; 1S72 N; 3I0S A; 3F9K A; 4HUG A; 3RTV A; 4LH5 A; 5HBM A; 4DV5 K; 4Z4I A; 4H5W A; 5DK5 A; 3G71 N; 4Z4C A; 4CBU A; 5AQU A; 3QB0 A; 4IEI A; 3CXC M; 4DR7 K; 1WSJ A; 5ADX H; 2HNZ A; 1OVQ A; 3GBT A; 4DFJ A; 3FZH A; 3P31 A; 4CJK A; 2Q31 A; 4C1N I; 1JXB A; 3CCU N; 2FSK A; 3L4I A; 5F0X A; 4N47 A; 1M1K O; 3V4I A; 3SJH A; 4B9N A; 3O1W A; 3QO9 A; 4CJS A; 3EE8 A; 3QEI A; 3TAP A; 4RW4 A; 4ILJ A; 5AR0 A; 1X3M A; 4BRP A; 5JIC A; 3SUQ A; 4M3Z A; 4FJ5 A; 1NGA A; 4GKJ K; 1X9W A; 2O8B A; 4M42 A; 3VET A; 2UXB K; 3G10 A; 2KFN A; 4KRE A; 3LL3 A; 2QI2 A; 5BN9 A; 1BOT O; 4BRM A; 1Q9Y A; 3VTI A; 4XH4 A; 5AZJ A; 5HRP A; 4BRE A; 3J7Y P; 5C10 A; 4OLB A; 3VQB A; 3VQ8 A; 3QEW A; 3OYM A; 4M7Y A; 3CYM A; 4PKG A; 2UXC K; 1HNZ K; 1TUY A; 1W97 L; 2HB5 A; 3DXK B; 3AO4 A; 2NZT A; 1U47 A; 1A5X A; 4JHD A; 1YVU A; 2OPR A; 3MXJ A; 4ILH A; 1JL2 A; 1SUQ A; 3VOV A; 2GTD A; 2QXL A; 4FM1 A; 3KLE A; 1U2V A; 5H1S Q; 4NXM K; 1DT9 A; 4K8X A; 4LF6 K; 4RW6 A; 3LP2 A; 4E1J A; 3HK2 A; 5F1X A; 1BA0 A; 2HVH A; 1IH7 A; 3ZSV A; 1KLN A; 1WLJ A; 3VF6 A; 3VQ9 A; 4CES A; 4YOY A; 2DPN A; 4BWM A; 5GAE P; 3V1O A; 1BIS A; 3OBW A; 1OKJ A; 5JLF A; 5JVH L; 1RFQ A; 4E0D A; 3V9S A; 3ULE B; 4AHR A; 4FCY A; 1HQE A; 1XUP O; 4C8M A; 2G8K A; 4JKG B; 5C42 A; 1C0M A; 4LF9 K; 1RCH A; 1CLQ A; 1GLJ O; 3SLC A; 1SAZ A; 1VQ7 N; 3H6E A; 3RMD A; 4BDP A; 3TSU A; 4O44 A; 2YNF A; 1TAU A; 2FF3 B; 3MCA B; 1GOA A; 4B1Y B; 3VGM A; 3WXL A; 3BGR A; 2XY7 A; 2A1R A; 1KSP A; 1NGC A; 3FFI A; 1VK0 A; 3NHG A; 3DRR A; 4FJK A; 3VEW A; 2VG7 A; 2F96 A; 2YHA A; 3KVG A; 1W7A A; 2HVI A; 4YDU C; 1L5U A; 4BR9 A; 4H5T A; 4CED A; 1W2B M; 3L0Q A; 5FDL A; 1UA1 A; 2D0P A; 1N32 K; 1NBW A; 3U6F A; 5DM7 L; 3RMA A; 3HYF A; 3DM2 A; 5HLF A; 4AF1 A; 2G8H A; 2F9T A; 3QNN A; 3THV A; 4OKE A; 1HRH A; 1TL3 A; 3AVN A; 3BDP A; 3K5M A; 1UA0 A; 1TKD A; 2X74 A; 3OJU A; 1SL0 A; 4AM7 A; 1SL1 A; 2P9I A; 4GKK K; 3L2U A; 3PY8 A; 1E3M A; 3KHY A; 4CJ7 A; 2HOE A; 1DGK N; 1U48 A; 1P8Z A; 2IVO A; 3SQ1 A; 4C23 A; 3G4S N; 1T8E A; 4CJL A; 3ZEU A; 4IG3 A; 1NLV A; 4IKF A; 1V4T A; 3I8B A; 3AVC A; 4WFA L; 1LAW A; 2DFF A; 4I9Q A; 1NK0 A; 2Z1I A; 3V9X A; 4DSK A; 3NE6 A; 5SZT A; 2P9I B; 1QS4 A; 5BPN A; 4DQI A; 3FZM A; 3THW B; 3QEP A; 2FBY A; 1RDB A; 1E4G T; 3VEN A; 3CCM N; 4LF5 K; 4LF4 K; 1KAY A; 3OYE A; 4RTF D; 3CCS N; 3T1H K; 3NH1 A; 4KHY A; 1D9F A; 1Y64 A; 1BQN A; 2UUC K; 2E88 A; 5TKW A; 1WSE A; 4J8F A; 3HOT A; 4JKA A; 2I7P A; 1QQM A; 1BA1 A; 4CER A; 3QBW A; 3A5L C; 5TKY A; 3I55 N; 4PA1 A; 4ELT A; 1ZXO A; 3IDH A; 4JI7 K; 3THY B; 3AAP A; 3IFR A; 3U8X A; 4CFC A; 4AHU A; 3TAF A; 3NAE A; 1CZ9 A; 4W5O A; 4FJH A; 1IBM K; 3ZT3 A; 4C8N A; 2YX6 A; 2EWS A; 2I5J A; 5B8H A; 3RR7 A; 1NOZ A; 2P1J A; 3MMV A; 2ZGZ A; 3O4W A; 3HP6 A; 3ZET B; 4E7J A; 4Y1D A; 1SKS A; 3V9U A; 4CHO A; 3DLH A; 1XNR K; 4LFA K; 4O0J A; 2ETJ A; 4CZJ A; 1EWQ A; 1N8R O; 4FWK A; 5AQY A; 5FRM A; 3L2V A; 4BG9 A; 2XO7 A; 3RMB A; 1D9D A; 2ASO A; 4FVU A; 4CJV A; 4KPY A; 1OH7 A; 3QIO A; 4DF4 A; 4BR0 A; 5CE3 A; 3OYJ A; 1C0G A; 3H3O B; 2YNG A; 4IFV A; 1YF5 L; 3LAL A; 4FOI A; 3EE9 A; 4H0X B; 4GY2 B; 4BQL A; 4IOX A; 4GMJ B; 3M5R A; 2D1K A; 1IG8 A; 2CGK A; 1K8K A; 3ENH A; 2FBV A; 4PL8 A; 3PUF A; 1XMQ K; 2G8U A; 4CZG A; 2IAJ A; 4IOC L; 4DTJ A; 3CCL N; 4NLC A; 1KVC A; 4FPA A; 3MN5 A; 3BEX A; 2HHV A; 1IBK K; 2QWQ A; 3OYC A; 4DTU A; 3SI6 A; 3RRG A; 4JI3 K; 5BRE A; 2WUS A; 4YY3 K; 1WSH A; 1X3N A; 3HJF A; 5KPT A; 3QNO A; 3ID8 A; 1NG9 A; 1NMD A; 2VWB A; 4FWN A; 4B08 A; 5M1O A; 3QER A; 1IKV A; 3R8E A; 2HHX A; 4IWV A; 4H8K A; 5AFU H; 3A8Y A; 2KQ2 A; 5KGX A; 2YI1 A; 4F4K A; 5AQN A; 1MA9 B; 4LSL A; 1RDA A; 5CYM A; 3B6P A; 2P9K B; 1RDW X; 3K9K A; 2WON A; 2D0B A; 3C6A A; 2P9L B; 4H5N A; 2P51 A; 3CCR N; 3P83 D; 3UKU A; 5AJ3 K; 5JVG L; 1R0A A; 2XY6 A; 4NYN A; 1BWF O; 2GUI A; 1ATN A; 2YNI A; 4EHU A; 2VG5 A; 4I7F A; 1FW6 A; 1BIU A; 3THX A; 3WXM B; 2UYT A; 4O8K A; 4CZM A; 1SKR A; 4CZH A; 4EFH A; 2KKZ A; 3K58 A; 1QZ5 A; 3HM9 A; 4FO0 A; 3C0B A; 1NMN A; 2WTU A; 2GWJ A; 3SAG A; 3PIO L; 1VQ5 N; 1HPM A; 3PLA A; 3Q7B A; 4U7B A; 1ASU A; 4DTX A; 4ISF A; 2PY5 A; 1VQ9 N; 1MDU B; 3TPQ A; 1N36 K; 5AQL A; 4CJQ A; 3ZSQ A; 4CCH A; 3K0S A; 5GAD P; 3B6O A; 2KZM A; 4Z0U A; 4QS7 A; 3AA4 A; 2BUP A; 4Z94 A; 1N6Q A; 3HVR A; 4BC4 A; 4FLZ A; 1OH6 A; 1NKE A; 3O9R A; 4PQU A; 4KHW A; 4LFB K; 3DOL A; 4QOZ B; 2ZM6 K; 2FSN A; 1S9G A; 4OKJ A; 4OLA A; 4K8Z A; 2Q2R A; 4NCA A; 5M1Q A; 3VEO A; 3ENO A; 2QWN A; 4HCB A; 4XEI A; 3WXJ A; 2QW9 A; 3RSE B; 3O08 A; 1NK7 A; 1TUU A; 3UIQ A; 1NK8 A; 4CJT A; 5MLC Q; 2PFU A; 4A62 A; 1S1X A; 4KTW A; 4HTL A; 1HNW K; 4JS5 A; 2HF4 A; 2Y1J A; 4I2Q A; 2D5R A; 4CI6 A; 3I0R A; 3M8Q A; 4FVM A; 1L3V A; 2IIR A; 4B1Z A; 4DFM A; 1FKO A; 2A41 A; 1BQM A; 3EO3 A; 4DKW A; 1XHX A; 1XMO K; 1VQ6 N; 5AQZ A; 1GLA G; 3KK2 A; 4KRF A; 3VQ5 A; 3PIP L; 3DYA A; 4DSI A; 3ZCM A; 1LWC A; 1YTA A; 4DHY A; 4NCB A; 1O1W A; 4JI2 K; 2KTQ A; 1RIL A; 3EY1 A; 3MN9 A; 4BRO A; 3LP1 A; 1ZBL A; 2YHW A; 3HST B; 3KIO A; 1NOY A; 3SPY A; 2F7T A; 3QET A; 4ID1 A; 1B92 A; 3J80 O; 3NGZ A; 3EZ5 A; 4W5Q A; 3CQ8 A; 1GOC A; 4DB3 A; 4CZL A; 3ZLJ A; 1Z26 A; 3BZK A; 4JEP A; 4AM6 A; 3DLG A; 1TAQ A; 4BRA A; 4CVN E; 1CXQ A; 1NJI O; 4DF8 A; 5I42 A; 2CH5 A; 4A61 A; 4A2B A; 5KPR A; 3ZYY X; 1N34 K; 4CEA A; 1T03 A; 4W5R A; 2KFZ A; 1U6Z A; 4CJF A; 2QKK A; 3JS6 A; 3LM9 A; 3OYG A; 4CHP A; 3LPU A; 1XC9 A; 3RMC A; 1M90 O; 2E2Q A; 1J5O A; 3HPG A; 3O4N A; 2O8D B; 4QCL A; 1RT7 A; 4CJE A; 3QFU A; 4BE2 A; 4CEE A; 2HHS A; 3CM5 A; 3HZ6 A; 3BZC A; 3ID6 A; 3SZ2 A; 4M3W A; 5M1P A; 4OX9 K; 4A2A A; 3ISN C; 1NGG A; 1VSE A; 4CGD A; 2Z1J A; 4JRQ A; 3HTV A; 4KHS A; 2V51 B; 3KLH A; 3HXM A; 3SUP A; 4IDH A; 2Y1I A; 3D2F A; 5J1E A; 2PYL A; 1VQ8 N; 3KWI A; 1VSF A; 4XH1 A; 1SKW A; 3BF3 A; 3OYA A; 2IGI A; 2Q1N A; 3NGI A; 4K41 A; 1VRU A; 4HCC A; 2QWP A; 4CJ3 A; 1DTT A; 2YHY A; 3VEX A; 1IBL K; 4BRF A; 4G9Z A; 2Q0U A; 1QHA A; 1TVR A; 3H45 C; 4FJG A; 3ZSW A; 4G1Q A; 4CF2 A; 5AQH A; 1RBR A; 3P39 A; 3D2F B; 1NM1 A; 4B1V A; 2ZD1 A; 5AQF A; 4CJ4 A; 2G8W A; 4M63 C; 4KAZ A; 4DR1 K; 4FK0 A; 2P5G A; 4JKH A; 3ATU A; 3LDN A; 1S1W A; 4FM0 A; 4DMN A; 5J2Q A; 1X9S A; 3CJ7 A; 3L3V A; 1XNQ K; 2E8A A; 4DSF A; 1WN7 A; 1C1C A; 2ZF5 O; 4CEC A; 3TSP A; 4DS4 A; 3MWT A; 4B1U B; 1B9F A; 3MX2 A; 3AGR A; 1YUW A; 3NF9 A; 1GLE G; 4F3T A; 3H08 A; 2AP1 A; 1Q9X A; 3DXK A; 3K5L A; 1C0T A; 3MCP A; 1IKY A; 4MDB A; 3V9Z A; 1ATS A; 2HBL A; 3TR8 A; 2A6A A; 3CC2 N; 2PZS A; 2YV0 X; 3L8B A; 3AA2 A; 4DQR A; 1RTD A; 4CIF A; 1QQC A; 4ELU A; 3CPE A; 3R1X A; 4JKE A; 3K5O A; 3DLE A; 4DUY K; 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3DXM B; 2OYQ A; 4JAX A; 3VA0 A; 1RGI A; 5EXW A; 3PV8 A; 4CBX A; 4DLE A; 1NKC A; 3HRG A; 4H5R A; 4BDZ A; 3MEE A; 2PYJ A; 4UQG A; 3ZSR A; 3AGK A; 4LC9 B; 4FWQ A; 3THW A; 1RT4 A; 2ZWH A; 4BRC A; 3D2E B; 5AZI B; 3AVM A; 3CET A; 1ZBI A; 1OH5 A; 1TGO A; 5M1K A; 3AVL A; 4DR4 K; 4KKO A; 2E6L A; 3CHW A; 2F9W A; 4JI5 K; 2VG6 A; 2UUB K; 3K2P A; 4BRG A; 1S5J A; 2HMI A; 2W42 A; 2NLX A; 3AY9 A; 2W6L A; 3R9P A; 2VCP A; 4DTS A; 3U3Y A; 1T6C A; 3IAY A; 5CHI A; 4YOV A; 3QIC A; 2Z1G A; 3CME N; 3THY A; 2B4J A; 3R6M A; 1TKZ A; 3D7E O; 4QS8 A; 4BRI A; 1S6P A; 4LY7 A; 4ILG B; 4RCH A; 1Q82 O; 2P9N B; 4BDY A; 4E7I A; 1LWF A; 1ZBU A; 3AO1 A; 3KK3 A; 4FPB A; 4YOU A; 3UKR B; 1X9M A; 1FJG K; 3TAB A; 2IDO A; 4WF9 L; 1KC8 O; 4CF1 A; 1RT2 A; 3J8A A; 2O8C B; 1S1U A; 4BR5 A; 3CER A; 4FJ7 A; 3CJ9 A; 2E6M A; 4J2E A; 1MWK A; 4CJW A; 3ZET A; 4IEE A; 5GIN A; 3TTF A; 4FJI A; 2JGU A; 3NH2 A; 5LY3 A; 4IO9 L; 2YHX A; 4RW8 A; 1JLQ A; 3SCX A; 4N5S A; 2KZZ A; 1U45 A; 3CC4 N; 4EHT A; 3O8M A; 3NF7 A; 4DSJ A; 1V4S A; 5C2F A; 3PX6 A; 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