4DWSD

Crystal structure of a chitinase from the yersinia entomophaga toxin complex
Total Genus 191
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
191
sequence length
539
structure length
532
Chain Sequence
PTENIPSPILVEDKYTEETYSRPDVNFKEDGSQGNLSYTATRVCAPMYNHYVGDKTKPKLSAYITDWCQYDARLDGGGSKEEERGRGFDLATLMQNPATYDRLIFSFLGICGDIGNSKKVQEVWDGWNAQAPSLGLPQIGGHIVPLDPYGDLGTARNVGLPPESADTSIESGTFLPYYQQNRAAGLLGGLRELQKKAHAMGHKLDLAFSIGGWSLSSYFSALAENPDERRVFVASVVDFFVRFPMFSCVDIDWEYPGGGGDEGNISSDKDGENYVLLIKELRSALDSRFGYSNREISIACSGVALKKSNIDQLVANGLDNIYLMSYDFFGTIWADYIGHHTNLYSPKDPGEQELFDLSAEAAIDYLHNELGIPMEIHLGYANYGRSAVGGDLTTRQYTNGPALGTMENGAPEFFDIVKNYMDAEHSLSMGKNGFVLMTDTNADADFLFSEAKGHFISLDTPRTVKQKGEYAAKNKLGGVFSWSGDQDCGLLANAAREGLGYVADSNQETIDMGPLYNPGKEIYLKSISEIKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The BC component of ABC toxins is an RHS-repeat-containing protein encapsulation device.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Chi2
molecule tags Sugar binding protein
source organism Yersinia entomophaga
total genus 191
structure length 532
sequence length 539
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.50.10 Alpha Beta Roll Chitinase A; domain 3 Chitinase A; domain 3 4dwsD01
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 4dwsD02
1Q6EA 1O6IA 5BXRA 4W89A 2QLYA 1M03A 1XRVA 5DEZA 1ITXA 1KWKA 1H2JA 4D6GA 1HN1A 4UQBA 2JIWA 2BHZA 2WC7A 5E9AA 1MQRA 2ZUWA 1X6NA 1E71M 3N18A 4GKLA 4S3JA 2OSYA 4HZ6A 1NOFA 2C8NA 3TTSA 3ZMRA 1B3YA 4RL3A 4DUXA 1HL9A 3K8MA 3OGVA 2PWFA 5DT5A 1EXPA 2VRKA 1J11A 1IT0A 1CGTA 3EMZA 1XSIA 2X05A 3E1F1 1V6VA 3F5LA 3N1AA 3N17A 1WDQA 2DSKA 2X0YA 1VBRA 1HKMA 2WHLA 2G3MA 3VIFA 3PZUA 2WBGA 4EK7A 3WF1A 2WKLA 1H5VA 2WVVA 1LWJA 1E70M 4IM4A 5GNZA 1MFVA 2WNWA 2ZX7A 3RDKA 1XSJA 4F9DA 4AD3A 2J47A 1W9UA 4OKDA 4MNJA 4V27A 5A3HA 3T0BA 2J8GA 4U2ZA 5BWFA 1OIFA 3VDHA 3CPUA 1J0IA 5AY7A 1G0CA 2D0HA 3L4YA 3QOMA 3CHCA 1US3A 1BGAA 1PX3A 1V6UA 1Z32X 2DPEA 3K1DA 2CBUA 1KGXA 1ISYA 3MS8A 2YIHA 2FHBA 1SYTA 1E1FA 4QP0A 1YHTA 1H0IA 3ARVA 3CUFA 3THCA 3VIMA 3JUGA 1BYBA 4PMQA 3ZJ6A 3FNDA 4PEEA 3II1A 3AZTA 2J7FA 2EPNA 4U3CA 3L4WA 4FF5A 1QW8A 1VEPA 2EPKX 4X9YA 2QPSA 4JKKA 1R86A 2PBGA 5ABFA 1BG9A 2A3EA 1D3CA 2DGAA 1DWGM 3VIJA 1CEOA 2D0FA 1WPCA 2VCBA 2DT1A 5ABEA 2YA0A 2B31A 4WKAA 4M29A 1E4IA 1FA2A 1LL6A 2E9LA 4TOQA 1B3ZA 5DMYA 3VD7A 1V0NA 1VEOA 4W7UA 4UOZA 4W7WA 3ZO9A 2W92A 4GIAA 3SCQA 3ZM8A 4CKQA 4Z2HA 1FHLA 1JG9A 1GUVA 4GI6A 3GH4A 2VZOA 5AC4A 3VD9A 2W66A 5D9NA 4AD4A 2E9BA 2OWCA 4PTXA 3OGSA 3PZGA 2FDMA 1UG6A 2WMFA 5AYIA 2WZEA 2J78A 3PTQA 2G3NA 2UWFA 3W82A 4UOQA 3BLPX 4KGJA 1FFQA 2PWHA 3K8LA 1US2A 1SMAA 1NP2A 3MANA 1LL7A 2VZSA 4CU7A 1KBKA 3FW6A 5A94A 1E6ZA 3U7BA 1V3HA 1OD0A 4QDMA 2G3JA 1K6AA 1JZ6A 3FHQA 3FXYA 3AFBA 3CO4A 4AD1A 2A3BA 4GQQA 4GXPA 1ZB5A 3WH7A 3DC0A 2XTKA 2ZX6A 2WAGA 2W4XA 2Y24A 3ARRA 3OA5A 4AZ5A 4ZENA 1ECEA 1QHPA 4M24A 4NF7A 1DWHM 5FL1A 1UD4A 3I3EA 2DH3A 4JFVA 5FIPA 1M01A 4HPHA 1Q6CA 4K68A 1CXFA 3MMUA 4PMUA 3FAWA 1QNRA 3D3AA 3AS0A 4TX8A 3WUFA 2Q8XA 3VIIA 1EIBA 2WXDM 3K8KA 1GQKA 4KGLA 3LPFA 3VGHA 3VMPA 2GJXA 3PZIA 2CERA 5CSUA 4W8LA 1AQMA 1HVXA 4JCLA 2Y8KA 4CVWA 1HF6A 3M6DA 2AMGA 3K4DA 2BV9A 1V02A 5E6YA 2BNJA 2VJXA 4QLJA 5DO8A 1TG7A 2WVSA 1G01A 3VTRA 1ZS2A 4CD5A 3VMNA 3ZJ7A 2ZXAA 3J7HA 1M53A 4JIEA 2GDVA 3N9KA 5EMYA 3WD4A 3M46A 3WEMA 4PSPA 4H7VA 4AZCB 2FH8A 4CD6A 2OWXA 4AIEA 1M04A 4HZ8A 4AYSA 1GPFA 2DT2A 1KQZA 3PZTA 2PI6A 2VX4A 1GVIA 4JCMA 1KR0A 2V3EA 1CNVA 3BAWA 4R27A 5IFTA 3GXIA 1W1VA 2O92A 2XVLA 4XZWA 4EE9A 1MWOA 2BY3A 3UR8A 1B30A 4JL1A 1C93A 1E43A 4HU0A 2DSWA 1GOOA 5AYBA 2ZUNA 7A3HA 1QVBA 2XFRA 3PTMA 4PCTA 4AZHA 1VFUA 1EHNA 2CHNA 2D3NA 3AS2A 2WMJA 1B0IA 3SEPA 1H4PA 2ZXQA 2WVTA 2XWEA 2BVDA 4GO9A 1KXTA 1JXJA 1C90A 3WKZA 4E8CA 3O9NA 1MW3A 3AMKA 4MDPA 2DIEA 4J3SA 3ARTA 3GH5A 1AQHA 1V3MA 1VRXA 4JHZA 4B9ZA 2XFYA 5LA2A 3DYPA 3KWXA 3F5KA 3AHYA 3VIKA 4WF7A 3UG5A 3KL5A 1CGWA 3K4AA 4WLCA 1B3VA 1WNOA 4UQ9A 3MKKA 3L2MA 1ZBWA 2UY4A 1V0LA 4ACZA 1H11A 1EA9C 5D9OA 1QHOA 1QW9A 4LGXA 1VF8A 5BROA 1CXEA 2XUCA 2W63A 3SCTA 1HNYA 1QI2A 4XV0A 5ECUA 3MSDA 2CETA 2WVVB 3CUJA 4PMOA 3VPLA 2E8ZA 1ISVA 3W4RA 1RH9A 3K46A 4J3WA 3SCNA 3KL3A 1JDCA 3PHAA 1EOMA 4PTVA 4HOZA 3WFZA 1RP8A 3CHFA 4H2CA 3GDBA 4M82A 1VENA 3A4XA 4UFHA 3ZJ8A 4KRUA 2A3CA 3T09A 5IFPA 5EBAA 3T2PA 5A6KA 4Z2IA 2G8ZA 3IK2A 4P7LA 4DWSC 2Y8VA 5A6SA 2VO5A 4CU8A 1CENA 4CN1A 3VILA 1EGZA 1XGZA 1BG4A 1HKIA 4U31A 3VX1A 3NJ3A 3BGAA 1E0VA 3CZKA 3QR3A 5A8QA 2ZOXA 3MUY1 3HMCA 2OWWA 3WNLA 2VZTA 4PUEA 1IZKA 3LMYA 1JNEA 4IPNB 2YLLA 2ZUUA 1E55A 4D72A 1JAEA 3RM8A 2VRJA 4WKFA 1XD0A 3WNMA 4Q22A 1PIGA 5E70A 5ABFB 3PZQA 1LF1A 4V28A 1TVPA 2WVUA 1LLOA 4JKLA 3VINA 1WAWA 1PIFA 3WQ8A 1C7SA 4PTMA 3G6MA 3UCQA 1KR1A 4A3HA 3AQUA 1U30A 2X8RA 1VIWA 1JD7A 3OG2A 1HJXA 3WEZA 4NSBA 3G6LA 1OSEA 1BYDA 3BAIA 5CZKA 2PWGA 1C92A 1WDSA 3VM5A 1J0HA 1C8QA 1IZJA 3LPOA 2A3AA 2WHMA 4HP5A 1UKQA 3HJEA 4PBGA 2AOSA 1XCWA 2DDXA 3A6OA 5GQBA 3ARYA 2CKRA 1QNOA 4FLSA 2CBVA 4DUWA 1E4MM 4PUDA 3ARPA 2DEPA 3AHZA 3GNPA 1UR1A 2YKKA 2YL5A 1WE5A 5JBDA 1JDAA 1UR4A 4H41A 4P8UA 4J3VA 3VMOA 2FGLA 5I0DA 4CCDA 1CXHA 2VQUA 3W6MA 5C70A 2YA2A 5BRPA 4ZE5A 2E8YA 4UFIA 3SIMA 4D1IA 1DWJM 3WD2A 3S6TA 4CCCA 1UOKA 4OUEA 2EO7A 4H8HA 3WDPP 4CD8A 4JKMA 2CESA 3OLEA 3WL0A 5D8WA 1J0JA 3A4AA 3IAQA 5CGTA 1CXLA 4HTYA 3PTKA 4P8XA 1HJUA 1K9FA 4CD4A 2J8FA 3PBGA 3VDBA 2FHFA 3VD4A 4W84A 1J01A 3GBEA 3U57A 1QNQA 5JBEA 2ZUMA 4UNIA 3N04A 1ZU8A 3BAKA 3BLKA 4A4AA 2DSZA 1S46A 5FOOA 4CU6A 2F8QA 3L4UA 1G5AA 4V2XA 1E72M 4TTGA 1JI1A 3SCRA 1W91A 1KWGA 2QMKA 3WDJA 6TAAA 4B15A 3WF3A 2GFTA 1E3XA 2GJXB 2J25A 3QGVA 2GDUA 2WLYA 5CJ5A 4JFSA 1E6SM 5ABGA 3WH5A 5A8OA 3EDEA 1V08A 4QLLA 1W9DM 1O7AA 5DF0A 2FGZA 3ZJKA 1BVZA 3AOFA 3VD3A 8A3HA 1ISWA 4KH2A 1FFRA 4BF7A 1HJVA 1Q6DA 3ECQA 1W32A 3AJ7A 5CQ1A 5E0FA 4WJXA 1MXDA 1ZBCA 3RCNA 2VX6A 1DP0A 2XVNA 4AXNA 2WK2A 4D6DA 4LX4A 2D2OA 1GVYA 3D5HA 1J10A 1E1EA 3NSMA 5BYWA 5BXTA 3GXDA 3VU2A 2OSXA 3ZT5A 1L8NA 3VGBA 3AS3A 3QHMA 4PMZA 1GCYA 1KXQA 5EFDA 1TZ7A 3VNZA 3W28A 2VC9A 1FHDA 3WEOA 2E9MA 1MYRA 5I77A 4CD7A 3M07A 1E6NA 3WQ6A 3U5UA 1B2YA 1Q4NX 2WZHA 2GJPA 3EYPA 4F8XA 5A8MA 5AC5A 3CIVA 5CG0A 4RE4A 1E3ZA 4WSKA 1UH4A 2O9PA 4KMQA 4UZUA 5E6ZA 4CGTA 3QHNA 3AYRA 5FCZA 4ZXOA 2DIJA 4MTVA 3LPGA 1VFFA 2ZICA 1TE1A 1EDQA 3RO8A 3GTNA 4N0RA 1GW1A 2WWCA 2WB5A 3AIWA 4HA3A 3AHVA 3F5JA 1HP5A 2C0HA 1KCLA 1QI0A 4U3AA 4WK9A 1GJUA 1U2YA 3FHAA 4QAWA 1XH1A 4MB4A 4MNLA 1V6YA 3N13A 4ZXLA 4M8UA 4ZEPA 3VIHA 3AIRA 4HMDA 5GNXA 3T08A 3VGDA 2VX5A 3TTQA 2DT0A 1BFNA 2VL4A 1ODZA 1H3GA 2W62A 2V3GA 2VURA 1UQZA 2Y5EA 1W9BM 1EDGA 1NP0A 3UESA 3RMEA 1B1YA 3WIJA 3RM4A 4ACZB 4D6CA 3EDFA 1WKYA 2G41A 3ALGA 1HKJA 1J0KA 4D71A 4JAWA 4Z2KA 4F66A 4YHGA 3SCOA 1MQQA 1JZ7A 1MW0A 1QBAA 2V3FA 4BS0A 4U33A 1AVAA 3SURA 4AEFA 4N42A 2G4FA 1E0XA 2BHUA 3VGEA 4W85A 1HP4A 5HPOA 2E40A 2VCAA 4GI9A 1J18A 1UZ4A 4OOUA 1V3JA 1E6QM 3GM8A 4IUGA 5E09A 4C7GA 1KFWA 4OJYA 1UH3A 1GOIA 3WQWA 1VFMA 1W3LA 5HPCA 1WO2A 4HU8A 2XM1A 1JFXA 3AMLA 5LA1A 3IJ8A 2X2YA 3VDAA 3VKKA 1C7TA 1NWUA 3CMGA 4ATDA 1UR0A 4UFKA 1CYGA 1UZ1A 3SCUA 4PMVA 3GYCA 2MANA 2J7DA 3PZNA 5D9MA 6A3HA 1H1NA 2VR4A 5A1AA 3WH6A 4MB5A 1JF5A 2YDRA 3BXWA 3GXMA 1DHKA 1WZAA 4TVUA 2BXZA 1BLIA 4B3LA 1TVNA 4AWEA 1XV8A 4AW7A 1ISXA 3MUAA 4HMCA 4LYRA 3W27A 2VQTA 3CZEA 4Y7EA 4ACYA 1I1XA 2ZX9A 3KEHA 3W38A 4MB3A 3B9DA 2JALA 1XD1A 2G3IA 4UTFA 4MAZA 1ZL1A 5A69A 3WDIA 3UG3A 4UQDA 5TD4A 1WB0A 2BY1A 3BC9A 2EPOA 3O2LA 1EHAA 3EBVA 4AC1X 1W9XA 2GSJA 3SUWA 1UA3A 4KWUA 3UEQA 1W3JA 1UD3A 2E3ZA 4U2YA 2EXOA 3VGGA 3ALFA 3AMCA 3SUUA 4M80A 2EJ1A 2D24A 3WL1A 3BAJA 3GBDA 3PZOA 1NQ6A 4PRWA 2VVNA 2OYLA 1HJWA 1JNDA 3M7SA 4W8BA 3AHXA 1VB9A 4JL2A 1F4HA 1R7AA 3RM9A 1CTNA 3AXIA 4PYSA 5IDIA 3SCVA 3THDA 3WDQA 4P8VA 2E4TA 1C8XA 4AIUA 3IAPA 5EB8A 2C7FA 3UETA 2BVYA 1UKTA 2YDQA 2GK1A 1NWTA 3AYSA 1N82A 4OIFA 4TVCA 2WMIA 5IHSA 3AIVA 1HT6A 3VX0A 5I3DA 1LG2A 3SCWA 3VIPA 4UQEA 2DH2A 1E9LA 2YL6A 4AISA 1L0PA 1BGGA 2UY5A 4J28A 1OINA 2CKSA 3FN9A 4B9YA 1UUQA 4E2OA 1JIBA 3WDHA 1BQCA 3VDCA 4M56A 5JIPA 3ZOAA 3RILA 3ZR5A 4UZSA 4BQ4A 3S2CA 3WFLA 1C8YA 2YL9A 4UOJA 2VZVA 3BCDA 5D4YA 2J75A 3NSXA 1OM0A 2VX7A 1DWAM 1JFHA 1AQ0A 4FK9A 4QCEA 2PB1A 4WIWA 3NYDA 1CECA 7CGTA 5BXSA 1E5NA 1UR8A 3ARZA 1XYFA 4LYPA 2ZIDA 2D0GA 3A3HA 3EDDA 3IJ9A 1B9ZA 2W61A 4W86A 2X09A 1G94A 4J27A 2CBIA 4QFUA 4ZE4A 3PZVA 1JXKA 2JF6A 4EKJA 3AZSA 1ITCA 2WMHA 3WUEA 3ARQA 5KZ6A 4WKHA 5CXPA 3VIGA 4D6JA 3FY1A 3N15A 4S3KA 2ZX5A 2J4GA 3N12A 4XZBA 1J9YA 3VNYA 1GONA 3ARSA 1K9TA 1WZKA 1OGGA 1V3IA 1HJQA 4F9JA 2VZUA 3MUIA 1XYZA 3VD5A 3APGA 2WKGA 4Q7NA 3CUIA 4H8VA 1UD2A 3MU7A 1EQPA 4LYQA 2OLHA 1JZ2A 3T2OA 3ZR6A 2D20A 3W81A 1LL4A 1J0YA 1KBBA 2JE8A 1VEMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 1ODU A;  1HL8 A;  1K9E A;  1KXV A;  2J7B A;  2Z1K A;  3DHU A;  5JUV A;  2BXY A;  3FAX A;  4EAN A;  4UQC A;  4MDO A;  2XG9 A;  4CN4 A;  5I2U A;  3DYM A;  2Y4S A;  1CZ1 A;  2BY2 A;  4DUV A;  1CGX A;  2CIP A;  4B16 A;  4F79 A;  1X6L A;  2WMK A;  2YL8 A;  1J0Z A;  2CHO A;  4UFJ A;  3WUB A;  3RPM A;  2PWE A;  3B9A A;  2V3D A;  3I3D A;  2WZI A;  4JHO A;  1E56 A;  4AZ7 A;  5A8P A;  2EPM X;  3MSG A;  1BHG A;  4AD5 A;  3CHE A;  1R7O A;  1D7F A;  2WC3 A;  3WF4 A;  1BYC A;  2D1Z A;  3L4V A;  2PBO A;  4BCE A;  4D6I A;  3ZT7 A;  1GNX A;  1FH9 A;  1B3X A;  1PAM A;  4IIS A;  4AY1 A;  1JZ8 A;  4YHE A;  4R5E A;  3CLW A;  1G1Y A;  4HA4 A;  2CYG A;  3L2L A;  2ESC A;  4C7D A;  2OYK A;  4MNM A;  2DQX A;  4HPG A;  3BAX A;  3BMV A;  1ZBV A;  7TAA A;  4GPN A;  2D22 A;  1CDG A;  2ZE0 A;  4HA1 A;  2DT3 A;  5ABH A;  3AIB A;  3BAY A;  2QHA A;  1ZBK A;  4J3X A;  1EO5 A;  2EPL X;  1UWU A;  3GXF A;  1RD6 A;  3POH A;  2J77 A;  2WW5 A;  3WUG A;  1BYA A;  4L4P A;  4AZ6 A;  2AAA A;  4M1R A;  4AZB A;  3WEL A;  4OBS A;  5FL0 A;  1C91 A;  5CLW A;  4AZC A;  3CHD A;  4AMC A;  4PMY A;  4CUC A;  5A6J A;  2W67 A;  5JBF A;  2WSK A;  3HN3 A;  4D1J A;  2V5C A;  4URI A;  2XFF A;  4UFM A;  2WCG A;  3TP4 A;  4LQ1 A;  2XHY A;  2DSV A;  3CTT A;  1X1N A;  4OZO A;  2O9R A;  3SUT A;  4MAD A;  1DED A;  5C71 A;  5I78 A;  4RE3 A;  2QF8 A;  1TA3 B;  1KXH A;  1NOW A;  1V0M A;  1WP6 A;  2WCS A;  3VM7 A;  9CGT A;  1B90 A;  3WH9 A;  1AMY A;  4HOW A;  1DTU A;  1FOB A;  5HBF A;  3ZSS A;  1JDD A;  3W6L A;  2VNC A;  2YA1 A;  2D3L A;  3AIE A;  1JZ3 A;  1UH2 A;  3NSN A;  3CBW A;  1CGV A;  4W5Z A;  2VI0 A;  5IXE A;  5A6L A;  3OZP A;  4CVU A;  3DYO A;  1SMD A;  2BS9 A;  1UYQ A;  4PSR A;  1EDT A;  3GNR A;  1HJS A;  1E6X M; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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