4DWXA

Crystal structure of a family gh-19 chitinase from rye seeds
Total Genus 91
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
91
sequence length
242
structure length
242
Chain Sequence
SVSSIISHAQFDRMLLHRNDGACQAKGFYTYDAFVAAANAFPGFGATGSTDARKRDVAAFLAQTSHETTGGWATAPDGAFAWGYCFKQERGAAADYCTPSAQWPCAPGKRYYGRGPIQLSHNYNYGPAGRAIGVDLLRNPDLVATDPTVSFKTALWFWMTAQAPKPSSHAVITGKWSPSGADRAAGRAPGFGVITNIINGGLECGHGQDSRVADRIGFYKRYCDILGVGYGDNLDCYNQRPF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Basic endochitinase C
publication title Crystal structure and chitin oligosaccharide-binding mode of a 'loopful' family GH19 chitinase from rye, Secale cereale, seeds
pubmed doi rcsb
source organism Secale cereale
total genus 91
structure length 242
sequence length 242
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 3.2.1.14: Chitinase.
pdb deposition date 2012-02-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00182 Glyco_hydro_19 Chitinase class I
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4dwxA01
3.30.20.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Endochitinase; domain 2 Endochitinase, domain 2 4dwxA02
1A2YC 1W6ZA 2I25L 1UUZC 1YAMA 1G7IC 3TXIA 3TXGA 2PC2A 3TXDA 2C8PA 2MEIA 4XJBA 4DDCA 3FE0A 3AYQA 1J1PY 1LZNA 2ZYCA 4I0CA 4GLVA 1UA6Y 2BQIA 1LOZA 4NGKA 1RJCB 1HNLA 3B72A 3G3BB 3WU8A 4NY5A 4IATA 1I1ZA 5E4PA 1N4FA 4QDNA 4KT3A 3IJVA 4AGAA 5LA8A 3M18B 1D0MA 3BKVA 4Z3MA 4RLNA 1LSYA 5IDDA 3AB6A 6LYTA 2BQDA 3IJUA 2BQFA 4FJRA 1GFUA 1BGIA 3TXHA 2LHMA 4TTDA 4YEOA 2CDSA 2BQGA 1ZMYL 3ATNA 5B1FA 2HEEA 3N9EA 3TXKA 1GE1A 1OUHA 4GCCA 1CJ9A 3A95A 1YIKA 1GBWA 1HEPA 2BQCA 5B05A 5C6JA 4HTNA 1CNSA 3P66A 4NSIA 3A91A 3W6FA 1EQEA 3W6DA 1LHIA 1YQVY 1TBYA 1HSXA 4LT0A 3WVYA 1DI5A 1LJ4A 1UCOA 1GF8A 1LJGA 4U3XB 1XEKA 3WW6A 1B7NA 1B9OA 1JEFA 1UICA 1B7OA 1JSFA 1B5VA 1DPWA 1DZBX 5KXLA 5B1GA 1BVKC 2MEEA 2YBMA 3CT5A 4QEQA 5IELA 2MEGA 3TXBA 1GF0A 1WTNA 3RU5A 5K7OA 1LZYA 1A4VA 4CFPA 1GF6A 1IOQA 194LA 4H8YA 1C10A 1WTMA 1IP7A 1JTPL 1KIRC 1GFAA 4HTKA 4KPMA 1LZAA 1BB5A 1OUFA 5KXYA 4HPEA 1Z55A 2GV0A 2LZTA 2XBSA 3D3DA 5KXTA 1G7HC 4H94A 1NWGA 5B06A 4ETAA 2HU1A 1LHLA 5DN4A 4M4OA 1GB9A 1RI8B 3A90A 4GCDA 1CJ8A 2BQNA 3HBDA 4GN5C 4XENA 1UIFA 1BB7A 1LYZA 1IC7Y 5C6IA 2DQGY 3CQLA 4HSFA 4GCFA 3RZ4A 1IX0A 8LYZA 2XJWA 3CSZA 4LYCA 2Z18A 1QDTA 2MEBA 5LXWA 5ILFA 1UIBA 1YKYX 3LYTA 3LN2A 2A7FA 154LA 4DD7A 2FYCA 1IVMA 1LZ9A 4IJ4A 1B5UA 4PRQA 3TXEA 2EPEA 3HBEX 193LA 1JITA 1JTTL 3WU9A 1F0WA 1IR9A 4UWNA 2BAAA 5LYZA 3ATOA 1DKJA 2Q0MX 3IWRA 1GBOA 1JKAA 1LCNA 3LYZA 4NSJA 1B5YA 1JJ3A 4NGIA 2BQMA 3TMWA 4Z41A 1JKCA 1HERA 4MSTA 1LJKA 4AXTA 1GDWA 3WMKA 1IIZA 4XN6A 1IP6A 2HEDA 4E3UA 1FKVA 1XGPC 1H87A 1LMPA 2LZ2A 1UIHA 1GB2A 1JTOL 1BQLY 2ZILA 4WM5A 133LA 1BWJA 4DWXA 9LYZA 3A3RX 5APEA 1GFKA 5FDJA 1RE2A 4H92A 1AM7A 4DD1A 2HEAA 4WM2A 1JHLA 2BQAA 4RDSA 1LMTA 4N1CC 1B7RA 1IO5A 3WPLA 3WUAA 5FHWA 5F14A 1CKFA 1F10A 2DQJY 2RSCA 1LTMA 3TXFA 1GAZA 1OUAA 4ET8A 3P64A 5LIOA 4W94A 2HU3A 1IP4A 1LZBA 3A3QA 4ET9A 1H6MA 4CJ2A 1GAYA 1JPOA 3ZVQA 1LJFA 3T36A 134LA 3MGWA 1IP5A 1BB3A 2YSSC 4C3WA 4WLDA 1BVXA 3OK0A 4NG8A 4YOPA 2YBNA 2HECA 4NWHA 4PPOA 4WL6A 1E8LA 2D4IA 2Z12A 1D9UA 3ZVQB 1IWWA 4MCKA 153LA 1GEZA 1REYA 1UIEA 3QE8A 2YBJA 1I20A 1XSFA 3B0IA 1GPQC 1O23A 1G7LC 4NGLA 1LZRA 1GF5A 1JUGA 2W1MA 2EQLA 4QY9A 1XEJA 1GE2A 1DI3A 2MEDA 4LZTA 1B5WA 2BLXA 3AZ6A 1AZFA 4TWSA 1NKHA 1SLYA 4G4CA 4HP0A 4H9HA 4LYOA 4WL7A 4OWEA 4D9ZA 1GFGA 1GB7A 2N5ZA 1JISA 1HFYA 3J6KA 1IR8A 3CB7A 3RNXA 1HC0A 1LJNA 1C46A 2ZQ3A 1BB4A 1J1XY 1REMA 207LA 3CT1A 3J4GA 4H9CA 4OOOA 4NHSA 1V7TA 2BQEA 1OUEA 4G9SA 4EMNA 1LZ5A 3B0OA 5KXZA 5A3ZA 1XEIA 3K3TA 1CJ7A 2EIZC 5DL9A 1TAYA 5LVHA 1W08A 2BQBA 4NSGA 2DQAA 2ZWBA 4DD9A 4YF2A 1HFZA 4GN3A 4LT3A 3W3EA 3W6CA 2MEAA 1GXV2 4KXIA 1GF3A 4PGJB 1LHKA 3WW5A 4OOTA 2DKVA 1D0KA 1VATA 1GFHA 5F9UA 3HFMY 4WOAA 4M6DA 3AW7A 4H9FA 2H9KA 4GCBA 2H5ZA 1QDRA 4BS7A 1FDLY 1FBIX 4CGEA 1OUGA 1JIYA 1LSMA 2EKSC 1DQJC 3KAMA 4B4JA 4YM8A 1IWTA 1LZDA 5AMYA 5FEKA 3WPJA 4G4HA 4WO9A 1XFPL 3AJNA 1HMLA 1LZGA 2G4NA 3AGHA 1CKDA 1NHEA 1IWUA 3AZ5A 4HJZA 2BQKA 4J7VA 5KKJA 1HEQA 3A34A 4WM1A 3M3UA 1D0LA 2I26L 1G7MC 5A3EA 3N9AA 4H90A 1BHZA 4WLTA 1GBXA 135LA 1LJ3A 2YVBA 1FLWA 1WVUA 5I4YA 2BQHA 2CJLA 1CKCA 4XJFA 5LA5A 5HQ1A 2IHLA 2G4PA 1NBYC 4NFVA 4WM4A 5T3FA 1D6QA 1KXWA 2Z38A 1EQ4A 1MLCE 5L3HA 3AGGG 1GFEA 4XADA 1V7SA 2YBHA 1SQ2L 3LYOA 4H9BA 4WM3A 1LJIA 5HNCA 1KXXA 1B7SA 1IWYA 1LZCA 3GXKA 1LYYA 2Z19A 2Z2FA 4H1PA 4H8XA 4NWEA 3WXUA 1GF4A 5J7CA 2D4JA 1JSEA 1GB0A 3P4ZA 4X3BA 5HMVA 1OUDA 4LFPA 1LSNA 3AGIA 3WPKA 4NIJA 1QSWA 4TSBA 6LYZA 3A6CY 2BQJA 4N0JA 4NHIA 4N8ZA 4XJGA 1GB5A 4NHTA 1B7QA 1YAOA 5KXRA 4HV2A 4B49A 4B4IA 1XGRC 2YDGA 5EBHA 4NGWA 1LHMA 1XGQC 2X0AA 1LMCA 4H91A 4NEBA 5IHGA 2DQDY 1HEMA 1QSAA 2ZIKA 3AZ7A 4Z46A 1LZ1A 2YBLA 2FBBA 3WL2A 2DQCY 4NSHA 5LVJA 1IY4A 4P2EA 1HFXA 1GB8A 4N9RA 1YAPA 3VWOA 5APCA 4YEMA 1GFJA 1DXJA 4YENA 3WYHA 1IP2A 1IOSA 1NMMA 2ZNWY 3CT0A 4WLYA 4LYBA 4BAFA 1WQPA 5I5QA 4XYYA 2F30A 1WQMA 3LZ2A 3TMUA 132LA 1AT6A 1IP3A 2F4AA 4O34A 1CKGA 1JKBA 5DM9A 1RCMA 4CFOA 3AW6A 3LYMA 1LZ4A 3EXDA 2HTXA 4NHPA 2F2NA 1LYSA 1LSBA 2BPUA 2F4GA 1VFBC 1GD6A 2IFFY 2XBRA 4R0FA 1OUBA 1LMNA 4GCEA 1C08C 5APDA 1GBSA 1LMQA 2Y8PA 1TCYA 1UIAA 2MECA 5D5FA 1LZEA 2Z37A 1HENA 4LGKA 4WLXA 4KL7A 3TMVA 3WUNA 2D4KA 1LSEA 1LMAA 1KIQC 3W6AA 4WO6A 4RLMA 5I4WA 1EL1A 4I8SA 5F9XA 1YKXX 5KXXA 1WQNA 3B0KA 4B1AA 1VDQA 1HSWA 1OUIA 1NDGC 1GBYA 5KXOA 3A96A 4IASA 3EMSA 1VDSA 2HUBA 3WVXA 4DD3A 1DPXA 4UWUA 2BQLA 4OWHA 1LSFA 2HEBA 3A92A 1PZYA 4HJVA 3EBAB 1P2CC 2BLYA 3AZ4A 1GE3A 2DQFC 4PRUA 4H8ZA 5LINA 3A6BY 1LHHA 1GDXA 3E3DA 1GB6A 3P65A 5HNLA 2YBIA 3LHMA 4NGYA 5KY1A 1IWXA 1LJJA 3RT5X 4HPIA 4CHXA 1BWHA 4ZEEA 4DT3A 1GB3A 4TSCA 1YKZX 5LVKA 1LZSA 4H9EA 1IR7A 2LYZA 4FDYA 2DQIY 5I4XA 4NGJA 4WG1A 4ETDA 4DDAA 2MEHA 3CSRA 5D5CA 2B5ZA 2ZIJA 4HV1A 5LYTA 1RFPA 1GFRA 1UC0A 1ALCA 1IWVA 1GBZA 3FI7A 2CGIA 1HMKA 4NGOA 2NWDX 4PJ2C 4W96A 1GWDA 1IORA 5HMJA 5B59A 2D6BA 2W1YA 1IP1A 1REZA 2Z39A 1LSPA 4GN4A 1WVVA 4ZFPA 1GF7A 5LYMA 1GEVA 5FSTA 1YROA 3A8ZA 5I54A 2CWIA 1GFVA 1KIPC 1YL0X 4NHQA 1BB6A 1GF9A 4WG7A 5HLLA 4LFXA 1PS5A 5KXKA 2LYOA 1GE0A 5KXNA 2I6ZA 1GXXA 5FELA 1WQQA 2DBTA 3A93A 1VDTA 1LJEA 3QY4A 2VB1A 1XGUC 3P68A 4DC4A 1G7JC 1VDPA 2C8OA 2MEFA 2AUBA 4G4BA 1IOCA 1UBZA 4GLAA 4BAPA 4LYTA 4OWCA 1HF4A 2ZYPA 1B7MA 2WARA 3GXRA 1LMOA 4N5RA 208LA 1F6SA 1REXA 1JWRA 1YL1X 1LSGA 4N1EI 5KKIA 1HELA 1NF5A 3WUMA 3BKHA 4H93A 1LSCA 1D6PA 1HEWA 1LKSA 2XTHA 1B5XA 4B4EA 1VEDA 5KXWA 4DD0A 4L41A 3EO5A 2LYMA 5LAFA 4WM6A 1T3PA 1QTEA 1LZ8A 4H9AA 3CSQA 3B6LA 4J0LA 3ULRA 1OUCA 3W6EA 1LHJA 4WMGA 1LZTA 1F6RA 5L9JA 1OP9B 3F6ZA 4ETBA 3ZEKA 2BQOA 1JJ1A 1B7LA 1J1OY 2G4QA 4ML7A 2HEFA 3WU7A 1QTKA 4NG1A 1IOTA 4LYMA 2DQEY 3A67Y 3W6BA 1XGTC 4DYGA 5LVIA 1GHLA 1YILA 1QIOA 4G49A 1FN5A 1IEEA 3HBHA 4LYZA 3WH1A 1ZVYB 1FLUA 7LYZA 1YAQA 1INUA 5APFA 1GE4A 4OW1A 5KXSA 5II3A 1LJHA 1DKKA 4RW2A 1JJ0A 1AKIA 1TDYA 4J1BA 1WQOA 2DQHY 2ZQ4A 1UIDA 4XJIA 1IY3A 1TEWA 5DN5A 1CKHA 1C45A 5KXPA 4EOFA 4A7DA 1JKDA 1DI4A 1OUJA 1WQRA 1HEOA 4TX7A 1FLYA 1UIGA 2Z2EA 3LZTA 3T6UA 3TXJA 1EQ5A 1LYOA 4HTQA 2D91A 1B7PA 3OJPA 1C43A 4XJHA 2H9JA 1I56A 3SP3A 1NQIA 5ILCA 4RW1A 4II8A 1B0DA 1ZVHL 1HHLA 3N9CA 4NGZA 1C7PA 1NDMC 1NBZC 4PHIA 5F81A 1B5ZA 1LZ6A 1OQMA 3G3AB 5JENB 4DD2A 1IWZA 2FBDA 2W1LA 4LT1A 3D9AC 5F16A 1YANA 5KXMA 4MR1A 4Z98A 1CJ6A 1LAAA 1T6VL 4DDBA 1LPIA 1GFTA 1KXYA 1LSZA 3WXTA 5FCPA 1FLQA 1QUTA 1FKQA 4B0DA 1LKRA 1QUSA 4R6CA 3RW8A 5L3IA 5C6LA 4J1AA 1BWIA 2A7DA 5LVGA 2FYDA 4LT2A 4UWVA 4ETCA 3QNGA 5DLAA 5M1YA 4ZIXA 1B2KA 1LSAA 4TUNA 1LSDA 2W1XA 4OWAA 3TMXA 2ZNXY 4C5FA 5KJ9A 1UACY 4ANRA 4H9IA 3WULA 1IC5Y 3A94A 4NGVA 4XJDA 5E9RA 5B07A 4QGZA 4ETEA 1AT5A 5LAGA 4OWBA 4HJYA 1QQYA 1VAUA 1MELL 1ZV5L 1IC4Y 4BADA 5I53A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1A2YC 1L71A 1YAMA 2OU8A 4DDCA 2C8PA 4XJBA 240LA 3AYQA 1J1PY 3B72A 5E4PA 4W52A 3IJVA 5LA8A 3AB6A 3QAKA 2BQFA 131LA 4FJRA 2LHMA 4TTDA 1C65A 1KNIA 236LA 5B1FA 2HEEA 1GBWA 1HEPA 215LA 4HTNA 1YQVY 1OYUA 3WVYA 1LJ4A 1LJGA 1B7NA 1L52A 3C80A 5B1GA 4QEQA 5IELA 1GF0A 4H8YA 1KIRC 1JTPL 1LZAA 1OUFA 5KXYA 1Z55A 119LA 3RUNA 1L20A 4H94A 1NWGA 169LA 5B06A 1LHLA 5DN4A 1QTVA 3A90A 212LA 1CJ8A 2BQNA 4PJZA 4XENA 214LA 2OTYX 1LYZA 1OVJA 8LYZA 1QUGA 1C6FA 1QDTA 3HTDA 160LA 5LXWA 1C6LA 3LYTA 2A7FA 3JR6A 1ZYTA 4IJ4A 1B5UA 2B6TA 1JITA 1JTTL 1SWYA 1F0WA 1IR9A 1P2RA 256LA 2A4TA 4MSTA 4YXAC 1DYAA 3SB8A 1IP6A 1CX7A 1XGPC 1LMPA 2LZ2A 1CV6A 2ZILA 1BWJA 1I6SA 5APEA 5FDJA 4H92A 1AM7A 4DD1A 1C6DA 2HEAA 1JHLA 1IO5A 4ARPA 1F10A 2RSCA 1L96A 1OUAA 5LIOA 1LYDA 1IP4A 4LZMA 1BB3A 2YSSC 4C3WA 3OK0A 4NG8A 2RB1X 3CDVA 1D9UA 1I20A 1XSFA 1O23A 1PQJA 1L19A 1DI3A 1L65A 4G4CA 4HP0A 4WL7A 4OWEA 1GFGA 1GB7A 229LA 219LA 1HFYA 3J6KA 1IR8A 3CB7A 1L81A 1REMA 4OOOA 4NHSA 3UONA 2BQEA 1P5CA 1PQMA 4EMNA 3B0OA 5KXZA 197LA 1XEIA 4NSGA 4DD9A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1A2Y C;  1W6Z A;  2I25 L;  1UUZ C;  1YAM A;  1G7I C;  3TXI A;  3TXG A;  2PC2 A;  3TXD A;  2C8P A;  2MEI A;  4XJB A;  4DDC A;  3FE0 A;  3AYQ A;  1J1P Y;  1LZN A;  2ZYC A;  4I0C A;  4GLV A;  1UA6 Y;  2BQI A;  1LOZ A;  4NGK A;  1RJC B;  1HNL A;  3B72 A;  3G3B B;  3WU8 A;  4NY5 A;  4IAT A;  1I1Z A;  5E4P A;  1N4F A;  4QDN A;  4KT3 A;  3IJV A;  4AGA A;  5LA8 A;  3M18 B;  1D0M A;  3BKV A;  4Z3M A;  4RLN A;  1LSY A;  5IDD A;  3AB6 A;  6LYT A;  2BQD A;  3IJU A;  2BQF A;  4FJR A;  1GFU A;  1BGI A;  3TXH A;  2LHM A;  4TTD A;  4YEO A;  2CDS A;  2BQG A;  1ZMY L;  3ATN A;  5B1F A;  2HEE A;  3N9E A;  3TXK A;  1GE1 A;  1OUH A;  4GCC A;  1CJ9 A;  3A95 A;  1YIK A;  1GBW A;  1HEP A;  2BQC A;  5B05 A;  5C6J A;  4HTN A;  1CNS A;  3P66 A;  4NSI A;  3A91 A;  3W6F A;  1EQE A;  3W6D A;  1LHI A;  1YQV Y;  1TBY A;  1HSX A;  4LT0 A;  3WVY A;  1DI5 A;  1LJ4 A;  1UCO A;  1GF8 A;  1LJG A;  4U3X B;  1XEK A;  3WW6 A;  1B7N A;  1B9O A;  1JEF A;  1UIC A;  1B7O A;  1JSF A;  1B5V A;  1DPW A;  1DZB X;  5KXL A;  5B1G A;  1BVK C; 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 1ZVY B;  1FLU A;  7LYZ A;  1YAQ A;  1INU A;  5APF A;  1GE4 A;  4OW1 A;  5KXS A;  5II3 A;  1LJH A;  1DKK A;  4RW2 A;  1JJ0 A;  1AKI A;  1TDY A;  4J1B A;  1WQO A;  2DQH Y;  2ZQ4 A;  1UID A;  4XJI A;  1IY3 A;  1TEW A;  5DN5 A;  1CKH A;  1C45 A;  5KXP A;  4EOF A;  4A7D A;  1JKD A;  1DI4 A;  1OUJ A;  1WQR A;  1HEO A;  4TX7 A;  1FLY A;  1UIG A;  2Z2E A;  3LZT A;  3T6U A;  3TXJ A;  1EQ5 A;  1LYO A;  4HTQ A;  2D91 A;  1B7P A;  3OJP A;  1C43 A;  4XJH A;  2H9J A;  1I56 A;  3SP3 A;  1NQI A;  5ILC A;  4RW1 A;  4II8 A;  1B0D A;  1ZVH L;  1HHL A;  3N9C A;  4NGZ A;  1C7P A;  1NDM C;  1NBZ C;  4PHI A;  5F81 A;  1B5Z A;  1LZ6 A;  1OQM A;  3G3A B;  5JEN B;  4DD2 A;  1IWZ A;  2FBD A;  2W1L A;  4LT1 A;  3D9A C;  5F16 A;  1YAN A;  5KXM A;  4MR1 A;  4Z98 A;  1CJ6 A;  1LAA A;  1T6V L;  4DDB A;  1LPI A;  1GFT A;  1KXY A;  1LSZ A;  3WXT A;  5FCP A;  1FLQ A;  1QUT A;  1FKQ A;  4B0D A;  1LKR A;  1QUS A;  4R6C A;  3RW8 A;  5L3I A;  5C6L A;  4J1A A;  1BWI A;  2A7D A;  5LVG A;  2FYD A;  4LT2 A;  4UWV A;  4ETC A;  3QNG A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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