4DXUA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with aminocaproic acid at 1.46 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with aminocaproic acid at 1.46 A Resolution
rcsb
molecule keywords Lactotransferrin
molecule tags Metal binding protein
total genus 118
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA02
5I56B 4FJPA 3BKIB 5L8DA 2ZNSA 4ZE9A 5IKBA 5L9SA 1I6BA 3LSFB 3FZVA 3O2AA 4MF3A 5DVIA 3S9LC 3A09A 3ECRA 3VV5A 4K3FA 3PMVA 2GHBA 2CZLA 4RJZA 3OMBA 1UTBA 3ONMA 1WODA 1FW0A 4WEPA 5F7VA 1P1OA 3KGCA 4G8NA 3C34A 1R9LA 2GFEA 1SW5A 1LCFA 3UORA 1S50A 1MM7A 4OZ9A 4R73A 1IXHA 2KLFA 1UQWA 4ESWA 1RKMA 3FGSA 3EHTA 1B3EA 3LR1A 1UIVA 5CM6A 1TFDA 4OFOA 3CR9A 3GZGA 2H99A 1M5BA 2HZKA 2H5YA 4NWDA 5H8QA 4KYDA 1AOVA 1FQDA 2DS9A 1OMPA 3HV1A 4LATA 3B6QA 1N84A 4MFIA 5DVJA 3FVOA 1D3KA 3U94A 2YLNA 1FQCA 3V5AA 1Q35A 3O66A 5KCJA 2IEEA 2ZMBA 3TQLA 3M3LA 2XXTA 4JXIA 4PFUA 4R6HA 2IA4A 2D3IA 4C1TA 1HSJA 4JB7A 1B3FA 2ESNA 1NNFA 1NKXA 1QKAA 4F22A 1JEUA 3H7MA 1LB9A 2XXUA 1GGGA 1PDAA 4F1YA 3F11A 1DPEA 5I2NA 3C9HA 2DVZA 2Z8EA 2X7QA 3HCQA 1USYE 4JSDA 2ZYKA 2ZNTA 4YMBA 4NTLA 1LBBA 4R74A 1XVYA 3HPIA 3OD7A 3VVDA 3VVEA 3PV0E 3DELB 1MG1A 1B46A 4TLLB 5DEXB 1SI0A 2QRYA 4F2OA 3MP1A 3O29A 2PT2A 4LUBA 3G3KA 3RNNA 2O7UA 1JNFA 1NMUA 4BDMA 4XKQA 3HHFA 2XXIA 1Y4TA 4YB5A 1MDQA 4ZS9A 4Q0CA 4DCYA 2B65A 4LONB 3TCFA 1EZ9A 5M2VA 4U23A 5IAIA 1SW1A 5I58A 1SYHA 2XXXA 4OMBA 4OQOA 1AH5A 2FA7A 4NF4A 3MUQA 4RXLA 1MXXA 2HXWA 2OK2A 3RTFB 3CFZA 3H6UA 3PUWE 1B2HA 1B7HA 4HTGA 3TTNA 2F78A 4U1OA 1ATGA 3QUJA 5ITOA 3MWBA 2F6PA 4NE4A 2XXQA 3MPLA 1SD3A 4RPNA 4HCYA 1B5HA 3TUSA 1FCKA 1I6AA 4MBPA 2F35A 3AXFA 4ZEKA 1POY1 4R9FA 3TTMA 2Q2CA 3KG2A 5DYHA 2QMWA 4N6PA 4C0RA 1O7TA 4NF5A 1NNPA 1FTJA 3PPOA 4KD5A 4DCXA 4THIA 4E0WA 3GXAA 5CMKA 1B52A 1URGA 1B32A 2UYFA 4BDOA 3JYRA 2NVUB 3RT8A 2OWSA 5ITPA 3C33A 2NOOA 3G3IA 1R1NA 4FIMA 1Y20A 5I84A 1MXUA 4H8IA 5TU0A 4EF2A 4H8JA 4F3BA 1MH3A 2R9JA 4KR5A 3VLWA 4RNSA 3FVNA 2E1SA 4OEUA 2R6GE 2OBGA 2O84X 3EQ1A 4R72A 4OESA 1P1NA 4EQ9A 4RYAA 2OLBA 2QL3A 1MQGA 5AA4A 2I4BA 3KN3A 4IO2A 1EH3A 5EHSA 2ZYMA 4I8CA 1ZU0A 3LSXA 3OEKA 1A99A 1NH7A 4H0WA 4I62A 3VFJA 1EU8A 4OWDA 4IY5A 1JETA 1MY2A 1MQIA 2I49A 2E0SA 5I56A 1NL5A 4M4GA 3IAZA 4G2ZA 4LQ2A 2DWIA 1HSLA 4R6YA 1B7UA 4FATA 2GHAA 4OERA 2F97A 4F3GA 2PT1A 1IUDA 2REJA 1YTVA 1MY1A 4ELPA 1A54A 1SVXB 3ILTB 1M5CA 2AL5A 3MVWA 1Y3NA 4H67A 1ZIUA 1JEVA 1DTZA 2DXYA 4WKMA 1H45A 4ONYA 2A5SA 3K4UA 4LA9A 5DT6A 1BKAA 3KEIA 2Y84A 5KDTA 1Z7NE 3SKPA 1YCJA 1JQFA 2RINA 3FXRA 1F9BA 3MAMA 5TP9A 4XIGQ 3K00A 1QVSA 4N07A 1D9VA 2ANJA 2NXOA 4L17A 5H8SA 1DOTA 3TCHA 2X7PA 5BWJA 4H65A 5B7DA 4HCWA 3LSWA 3FJGA 4NEDA 2UXAA 5AA2B 5H8HB 5TPAA 3SEXA 3VLUA 3OO6A 3N6UA 1MPCA 4POWA 1P1WA 1TT1A 1B6HA 3M8UA 4QFNA 2ONRA 3M3FA 4R2BA 4ZEFA 3E13X 3KN7A 1L5TA 3WAFA 2UYEA 1XOCA 2UVGA 1POTA 2YPNA 1QULA 2F34A 5H8FB 3H4ZA 1GV8A 3SEYA 4ZEBA 3H3GA 1SYIA 1ZKBA 1DMBA 1J1NA 4YICA 1PBQA 2QS4A 2VOZA 3O6GA 1NH8A 1FQEA 1IXCA 4Q8RA 3TYHA 4NF8A 2V3QA 1FQFA 4GLIA 1QUKA 2A5TB 2UVIA 1VFDA 1FTKA 3FV1A 1N04A 1CB6A 1BP5A 2PYYA 2G29A 1B1XA 3FJ7A 4QFLA 1FQAA 3UGWA 3TTLA 3I3VA 3EF7A 4DXCA 3O6IA 3Q28A 3VVFA 3OXNA 2I3VA 1RYOA 3TELA 4XKPA 2PBWA 1OQHA 2RF1A 3TCGA 5I2KB 3VXBA 2NWJA 1PB7A 2F7AA 5JTYB 2XX8A 3L6GA 1MXWA 4ZE8A 2RC8A 1FTOA 1A7LA 1VR5A 3PPPA 1GR2A 1JVXA 3GBAA 4FE8A 2Y7IA 3U92A 3CSBA 1CE2A 4HS7A 4TQUQ 5CI5A 4OYVA 4FECA 1R6ZA 2F6GA 4Q30B 5FTIA 2B3FA 3T9UA 4PFTA 1XT8A 4YB6A 3TPAA 3Q25A 2Y7PA 2F8DA 1Z7ME 5ELVA 3V89B 2OZZA 2XD3A 3IOUA 4IB2A 5CRYA 4LZ8A 3S2VA 4OVJA 3PUZE 3IORA 4DXBA 3MVXA 2O68A 3R6UA 2DSFA 3Q27A 1Y3QA 2PVUA 3S9EA 1IZ1A 2FYIA 4BDRA 2P1SA 1N3WA 2GRVA 3R7XA 2XXWA 1O64A 3B7DA 2HEUA 4ZZEA 3RTWB 4NMYA 3T22A 3GLBA 4F39A 4FORA 3G3HA 4I1DA 1N7WA 4JWYA 2Q8JA 5I57B 4DDDA 5H8NA 3BFUA 3VE1B 3IJXB 1PB8A 3B6WA 4MH5A 3H06B 3K6WA 1T0KA 4G68B 3PUXE 2LAOA 1BTJA 2W7YA 1IQ7A 3RQTA 3C36A 3C4MA 2Y7RA 4WEDA 4YKPA 1FQBA 4F19A 3PMXA 5J1DA 1A8EA 3EPEA 5AE4A 3MC2A 4QSEA 4Z0IA 2I58A 1LSTA 1ANFA 1MY4A 4OETA 1MPDA 1QKBA 5CBRA 1D9YA 3CVGA 4YAHX 2XXRA 3N94A 3P7IA 5FTHA 1PB9A 3EHUA 2XXPA 3MZ1A 4BDQA 3MP8A 4NF6A 1LAHE 2F36A 3IL1B 2CMOA 3DP6A 4OXVA 1SDXA 3ZKKA 4NWCA 2P2AA 3OO9A 3CG1A 1SW4A 1ZMGA 4ISUA 1B5JA 3KZGA 2ONSA 5AA3A 4G8MA 3C31A 5CMBA 3C35A 3QYTA 3OELA 1B0HA 2QSXA 2F7CA 4KFQA 1MM6A 4O3CA 4M1VA 4ZEDA 4X48A 3Q29A 3DLNA 5EHMA 3U8QA 5ICTA 4E0XA 1NNKA 2O7IA 3QIMA 2XXHA 1LFHA 5ICQA 1JW1A 3UIFA 2R71A 4IO3A 3OO8A 3K6XA 2O1MA 4EQBA 2BJJX 4PFWA 1N0TA 4GRKA 5H8QB 5H8HA 2XXYA 1LAGE 3ODBA 3PD9A 2O1LA 1RYXA 3ILUB 4ZZAA 4KYEA 4KYSA 3KJ7A 1PEBA 1II5A 3E3KA 3IOTA 1PBPA 1US5A 1NFTA 3UK4A 2DWHA 1VFEA 1MY3A 4ZEIA 4GIZA 3FXQA 2H98A 4DZ1A 3OO7A 2QMXA 1OLCA 5CMMA 3E4RA 4X1DA 3SETA 1B0LA 2D21A 1B05A 3IO4A 3G3JA 1ZBMA 2VD2A 3PUYE 4QSDA 2I0CA 4U21A 4IO4A 2YJPA 3WAEA 4F31B 1M5EA 3MW0A 4GL8A 4LVQA 3OOAA 4QSCA 2Z22A 1P1UA 2DYXA 3USDA 2DP8A 3T9XB 4U4XA 5AA2D 3PMWA 3RGYA 4LZ5A 3E9XA 3BFTA 4Z7EA 3KOTA 5HM4B 1MS7A 4RY1A 5I58B 1H76A 1MPBA 3CRBA 3MJNA 1H3DA 4ELQA 1URSA 4QRZA 3FVGA 3CIJA 2DE4A 3MBPA 1VE4A 1LAXA 1OVBA 4EQ7A 4GOTA 1URDA 1QUJA 2HQ0A 3H03A 2RC9A 4C1UA 2I4CA 1IEJA 4P0IA 4QF9A 4TLMB 2V25A 4LZ7A 1MQJA 1DTGA 3I5OA 2O51A 4EF1A 2WKYA 3MP6A 1B9JA 3K02A 2HCAA 1VSOA 4XXUA 3SEUA 5JEIA 3IR1A 2QJEA 4NF5B 3MQ9A 4RK9A 1M5DA 3GBBA 3O28A 4GFRA 3S9MC 3DP8A 1B7ZA 4YB7A 2DWAA 4H5GA 3CG3A 3M3KA 3S9NC 4ESXA 3CI8A 4R6KA 4JBZA 1YPNA 2H25A 4YKKA 5I59B 3SEVA 4OHNA 4YMAA 1EZOA 1BLFA 1MXYA 4PP0A 5L9OA 1B3GA 5EYFA 3IB1A 5AA1A 1XS5A 1MDP1 4YU0A 3N26A 4GXAA 1LBCA 1SW2A 1ELJA 4QFKA 3MVZA 3TFLA 5DTBA 3RT6B 5A5XB 1LFIA 3QUFA 3IOVA 3K6UA 3K1MA 4FAJA 1LCTA 3PU5A 4IO5A 4ELRA 3W9WA 4YKJA 5K2XA 3CSGA 2UVJA 4P11A 1HSEA 1FTMA 4OFLA 1IIWA 2THIA 2FNCA 3IX1A 3TQWA 4P0GA 4DXUA 4EXKA 4GD5A 1SBPA 1WDNA 4TOZA 1ZJLA 5DEXA 3RY3A 2DOJA 1B4ZA 1OVTA 3RN8A 4KI0E 3THIA 1Q1KA 3RLFE 2PMSA 2Y7KA 5HPQA 3I6VA 2Q9TA 1S7YA 2I0BA 3N5LA 3QK6A 4POXA 1JW5A 4PQJA 3SERA 4GXSB 1R9QA 3TODA 2V3TA 1FTLA 1YAEA 2DVCA 4GQOA 3RUMA 2DXRA 4H6DA 4OEVA 5DVFA 2DE2A 2ALUA 4G4PA 1IXIA 1B3HA 1I6QA 1QJMA 4QFOA 1LAFE 1TWYA 4F1VA 1MRPA 4U22A 4XKNA 3HN0A 4MLQA 1QUIA 4FEBA 5KDTB 2NUVA 3MVYA 3PUVE 1MXVA 2I48A 5TP9B 3PGFA 3IB0A 4DIGA 4IY6A 1KWHA 3K01A 4PETA 2XX9A 3SDFA 4HW8A 4O3AA 2REGA 3FD3A 3LUYA 5TPAB 2Q88A 5ISUA 2UVHA 3O6HA 4AB5A 4RA1A 3MZBA 2V84A 3IO6A 3ZSFA 1O63A 3IOWA 4RK2A 3OEMA 1XHYA 4BDLA 3VLVA 3T9VA 2ZYNA 4MLVA 2PX1A 1LLSA 3D4CA 4ZECA 5CC2A 2XX7A 2Y7WA 3O97A 3VDFA 4DLDA 1GVCA 5L9MA 5LOMA 3T9HB 4BDNA 2O69A 4XTCQ 3W9VA 2RCAA 3K1PA 1NNTA 4NF8B 3U93A 3QXMA 4JWXA 1UTHB 1LGBC 1AL3A 3ZS6A 1N7XA 3L6HA 2F5XA 3KJTA 3KBRA 4O3BA 2OJTA 4EUOA 1A55A 2XD2A 2VHAA 4PE5B 4U1ZA 1AIVA 1S9TA 3FV2A 1IXGA 2O6AA 3G3FA 2I6EA 4R9GA 4LQ5A 2X26A 2ZXTA 5FHNA 3T66A 4EDPA 5KZTA 2D5WA 1DPPA 3OSRA 1H43A 1N3XA 4ND9A 3FXUA 3PPNA 4FEDA 4F1UA 1OQGA 1TFAA 4H1XA 5K2YA 4KPTA 4R2FA 4AQ4A 3TZAA 1UTBB 5HBCA 4G8HA 1Y1ZA 1TXFA 5F1QA 1PC3A 3TKDA 1B58A 4JSOA 3VXCA 3HHGA 3G3GA 1B3LA 2B3BA 3QAXA 3LBSA 3K6VA 3PD8A 4U2RA 3FIRA 2H9BA 2HAUA 1D4NA 3TMGA 4OENA 3FASA 1B51A 3W15C 1SQYA 4N13A 1ZLQA 2XXVA 1A8FA 2V93A 4F3SA 1OLAA 5AA2A 4R75A 1P99A 4UA8A 2ZYOA 3C32A 1B4HA 1JVYA 4G68C 3R26A 3V8XB 1MH4A 4GWOA 4F2QA 2RKMA 3CFLA 5H8NB 4JWOA 2QPQA 4F29A 3FVKA 5KCJB 5H8FA 4IO7A 4KQPA 5I59A 2Q89A 2VGQA 3H6VA 2Z8DA 3SESA 1LFGA 2OWTA 3EN3A 3DP4A 2Z8FA 1WVJA 2AL4A 1US4A 1IITA 4EXLA 3TTRA 1JW4A 3K2DA 3KFMA 2AIXA 4I9DA 1Y3PA 3T93B 2A5TA 4KCDA 5I2NB 5A5XA 2XHDA 2DWJA 3OENA 2DQVA 2AYSA 2HFBA 4KHZE 2RCBA 1Y9UA 4KCCA 1GTKA 3DM0A 3U1OA 2ABHA 3JZJA 3RPWA 4H5FA 4YZZA 2RC7A 2H4IA 3TDJA 5I2KA 5FHOA 2HZLA 4NF6B 3K0VA 5JTYA 1OIBA 2HAVA 1SI1A 1I69A 1N76A 3U72A 1Y4CA 2GH9A 3TEPA 3N6TA 4WXJA 1B40A 1EZPA 2F7BA 3KSXA 1XC1A 4AB6A 4IO6A 3EHSA 3T96B 3FATA 3HSTA 1B1HA 2Z23A 3Q26A 3G7WA 3H6TA 4NF4B 4GVOA 4LP2B 5CMCA 4ECFA 4QFPA 3UP9A 1QW0A 4OFJA 3FUZA 1MQDA 4X9TA 3TAJA 1XVXA 3LC8A 3QSLA 3FJMA 4G77A 3ZKLA 3S4UA 2VP1A 3UN6A 3IJOB 2QS3A 3MPKA 2ZNUA 4JDFA 1B5IA 4IGTA 1DSNA 1ZTYA 3KN8A 5B70A 1MY0A 4QHQA 2Q2AA 3O9PA 5FHMA 4Q5TA 3CFXA 3H6WA 3B6TA 3BBRA 4GF8A 1Y1MA 1H44A 4F3PA 3TTKA 2VD3A 5I57A 5JK4A 4U4SA 4UACA 3PPRA 2QS2A 3K1NA 3A3UA 3IB2A 5CBSA 3JV9A 1AMFA 3OSQA 1A40A 1MXZA 3UA8A 3KOSA 3KSJA 4DE8A 4ELOA 3IK6B 3PPQA 2QS1A 1MQHA 4IGRA 2OCUA 4G68A 4F18A 3MZ9A 2P0SA 5AA4B 1M5FA 2I3WA 1P1QA 4ZDMA 3D4GA 5BUUA 2M8CA 1BIYA 2DE3A 4RPOA 3HO7A 1UTHA 1UIUA 4BLAA 4OTEA 4XKRA 2G93A 4PFYA 3SEWA 1USYH 4X1BA 4YKIA 2V3UA 3LSLA 2ONKE 3V83A 3A3CA 4GL0A 1LB8A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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