4DXUA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with aminocaproic acid at 1.46 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with aminocaproic acid at 1.46 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 118
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA02
4U21A 2Y7IA 1UTBB 3CRBA 3IO4A 4DLDA 4GF8A 2E0SA 1LB8A 4NE4A 5I59B 1B46A 1LBBA 4ELOA 2GHAA 1OVTA 3MQ9A 5H8HA 3PGFA 3DM0A 3TQLA 1N7XA 1B51A 1FQBA 3UK4A 3T9HB 3U1OA 1PC3A 5AA2A 4KYEA 4DCXA 3O6HA 2HAVA 3IOWA 4U1OA 3RN8A 3SKPA 2A5TB 1B1HA 3KSJA 3B6WA 1CE2A 1YTVA 5I2KB 1XOCA 2DWIA 2VHAA 5CC2A 2I49A 3H6VA 4YKJA 2HXWA 3C36A 2OJTA 2F97A 1TFAA 3TYHA 1N7WA 4G8NA 4RK2A 4MF3A 3SEXA 4KYDA 4WKMA 1MQGA 3LUYA 4C1UA 4AB6A 2Y7WA 3HPIA 4YU0A 3OELA 2DQVA 5AA4A 1ATGA 1VFDA 1NNTA 2UXAA 3FXQA 4GIZA 1QKAA 4EUOA 4FE8A 3T96B 4H5FA 5I56A 1QUJA 2G93A 5L9OA 1DTZA 4LA9A 1UTHA 4FATA 1Z7NE 1SYHA 4EF2A 3FVNA 3PMVA 5BWJA 1H44A 3T9XB 5TP9B 5LOMA 5DEXA 3O6GA 3OXNA 4LZ7A 4XKRA 3SESA 3UGWA 3KJ7A 4YKKA 4OHNA 1B05A 2FNCA 2PMSA 5CBSA 4G8MA 2RINA 1L5TA 3K1NA 4ZE9A 2A5SA 5I2NB 3TCFA 5JK4A 1SBPA 3FJ7A 1SW1A 2AYSA 1PEBA 4ZE8A 3Q29A 3Q25A 3KZGA 5HBCA 5K2YA 2O68A 4N6PA 3OMBA 1H76A 5AA3A 3E4RA 2XX7A 3Q28A 1JEUA 3IJXB 2QS2A 4GLIA 2Q88A 1TFDA 2F35A 2CZLA 4OYVA 4ZS9A 3IOVA 2RKMA 2O84X 5JEIA 4P0GA 4LUBA 3EQ1A 3MJNA 4F1YA 5A5XA 3O28A 4IO6A 1EZOA 1EZPA 3L6HA 2ZNUA 1N76A 3H3GA 4R74A 2IEEA 1N3WA 2UVIA 4F3GA 1B7HA 3QAXA 4KCDA 4OZ9A 4O3BA 1BKAA 1P1NA 1FTLA 1HSJA 4GRKA 2I3WA 4OFLA 1UTBA 2QMWA 3R26A 3IB2A 4ELRA 2F7CA 4AQ4A 1A8FA 4G8HA 5I59A 1FQAA 4OTEA 2Z22A 1FTMA 1BLFA 5L8DA 4HCYA 4GFRA 4DXUA 3LR1A 2Z8FA 4F3SA 1Y9UA 1B2HA 4TLMB 2THIA 3HHGA 1P1QA 1SVXB 2Q2AA 1QJMA 4M4GA 2KLFA 3M3FA 3TUSA 4BDNA 4IO5A 3ZKKA 3IB1A 4MLQA 1SW5A 4E0XA 3TZAA 1TWYA 2H99A 2UVGA 5F1QA 1DPPA 1MDP1 5IKBA 3G3FA 4KCCA 2RC8A 2DE3A 3MZ1A 5AE4A 2DE4A 3VXBA 1B7ZA 2ONSA 2P1SA 5ELVA 5H8HB 2Z23A 4NF6B 1Q35A 3MZ9A 3SDFA 3USDA 1MG1A 1URSA 1P99A 2QMXA 1MQDA 4H6DA 3W9VA 1EZ9A 4LZ5A 3C4MA 1JW1A 4F19A 4NEDA 2Y7KA 3B6QA 4Q30B 4OMBA 5CMBA 3H6TA 2UVJA 4HCWA 3PMWA 3GZGA 4ESWA 4GOTA 5L9MA 2I6EA 3OENA 1HSLA 4X9TA 1XS5A 3K02A 2VGQA 2RCAA 4QFOA 3Q26A 4OENA 2GRVA 5TP9A 3MVXA 4MLVA 1ZLQA 2OLBA 3THIA 5TU0A 4LVQA 4QFNA 4X1DA 5FHOA 2XXUA 3N6UA 3G3GA 1Y1ZA 1GV8A 4BDLA 4THIA 1YCJA 1FTJA 3N6TA 5EHMA 4PE5B 4G68C 4EDPA 4P11A 4ZEBA 2NOOA 4JWXA 4HW8A 3S9NC 4TLLB 4DCYA 4YB7A 3FVGA 4GVOA 3MBPA 3VLUA 3KEIA 1JVXA 4IO7A 3O66A 3FV2A 3KN7A 1XT8A 4IO3A 4FIMA 2O7IA 4IY5A 1D9YA 3ZKLA 3U93A 1H3DA 1MY2A 3U72A 1Y3NA 4Q0CA 1XHYA 4F39A 4O3CA 1UIVA 4K3FA 2I0CA 4NF4B 2OWSA 4ECFA 1AH5A 3TMGA 2ANJA 4LP2B 1US5A 3C9HA 2X7PA 4U2RA 2ONKE 4EQ9A 2H9BA 4OVJA 3K2DA 5KCJA 4YMAA 1S9TA 1J1NA 1MQHA 3PUYE 2XD3A 2HAUA 1ZIUA 1QKBA 3G3JA 2Q8JA 4JSOA 5DT6A 4ESXA 3ZSFA 1OQHA 2HQ0A 1R6ZA 4XKNA 2BJJX 1DTGA 1LGBC 1USYE 3U94A 1IZ1A 2DYXA 3TTLA 2XXVA 4ELQA 3K1PA 1FTOA 3T22A 1I6AA 4U4XA 1MPBA 1QUIA 3A3UA 1Y3PA 1MS7A 2ZYNA 2F7BA 3OSQA 4DIGA 1IEJA 2P2AA 3LSLA 4YMBA 2H98A 2Z8DA 3SEYA 3D4GA 3JV9A 4KI0E 4JBZA 1IUDA 3KOTA 4R2BA 2P0SA 4GQOA 5IAIA 4KHZE 2DXYA 5M2VA 1Y4CA 1MQJA 3UIFA 3TAJA 3S2VA 3IL1B 4JWYA 1ZKBA 3VV5A 3IK6B 3V83A 4R9FA 4Q5TA 1B3FA 3S9LC 1P1UA 4OETA 1OQGA 4NF8B 4H0WA 3JYRA 3LSWA 1MDQA 1URGA 1CB6A 4NF6A 3GBBA 3IB0A 3HHFA 3MC2A 2V3UA 3MW0A 3PPPA 4L17A 1IIWA 3CFLA 3FXUA 3HN0A 5KZTA 3RLFE 2ESNA 3GLBA 1M5DA 3H06B 2X7QA 1XVXA 4H65A 3UN6A 1PB7A 3KOSA 5DVJA 2VD3A 1MXVA 4RYAA 2I0BA 1US4A 3G3HA 3T93B 3RY3A 3O29A 2XXHA 3OEMA 4F22A 1DOTA 4HS7A 3U8QA 3C31A 4OXVA 3K01A 1LLSA 3DLNA 4U1ZA 2DWHA 5FTIA 4ONYA 1D4NA 4YAHX 3T9UA 3UP9A 2PT1A 3FD3A 1O64A 2HFBA 3N5LA 3TTNA 5HM4B 2VOZA 2I4CA 2HCAA 1NKXA 4I9DA 4PP0A 2DSFA 3JZJA 1IXIA 3TCHA 5EYFA 2PT2A 4OEVA 5I57B 4R9GA 1B40A 3FVOA 4IGTA 3ZS6A 4OFJA 4U22A 1Y20A 2D3IA 1B7UA 4N07A 3IOUA 1R1NA 3E3KA 5H8FB 1POY1 3VVDA 4R2FA 3A09A 1VFEA 2O1LA 5DTBA 4NF4A 4LQ2A 3B7DA 1SYIA 5B70A 4DDDA 5B7DA 3AXFA 2Q89A 1QVSA 3FASA 1R9QA 4RPOA 4OERA 4U4SA 5DYHA 1OVBA 1LBCA 3I3VA 1FW0A 1M5BA 2RF1A 3QIMA 1QULA 3PUZE 3QXMA 3WAEA 3KFMA 1NL5A 3R6UA 3RQTA 3C32A 3MP1A 4ZZEA 4KYSA 5TPAB 1B3EA 3MVYA 3DP4A 1B0HA 3P7IA 2REGA 3TCGA 3KGCA 3VLWA 4RJZA 4X48A 1BP5A 4FEDA 2XXYA 4JXIA 1NH7A 4IB2A 1PDAA 1MXUA 4POXA 3FATA 3VLVA 1B5HA 2V3QA 4WEDA 3S9MC 1B5JA 1IXCA 4H67A 3O9PA 4YZZA 4LATA 5KCJB 5FHNA 4ZEDA 4EQBA 4R73A 1JNFA 1A99A 1RKMA 1B9JA 1SW2A 1N0TA 4UA8A 3FJGA 4F18A 1H45A 1AOVA 3K00A 1A8EA 3OO9A 4PFUA 5DVIA 1M5CA 1IXHA 3OD7A 2DS9A 1MH4A 4NF8A 4KPTA 4YICA 3RPWA 3SETA 4ZEIA 4NWDA 1POTA 3IR1A 2VD2A 2ZYKA 3K6XA 3PD8A 3G3KA 3K4UA 3RNNA 1YPNA 3CFZA 1MQIA 1PBQA 1MPDA 2XX8A 4ZEFA 4GL8A 1RYXA 1ZMGA 2H25A 3MPLA 2XXXA 4H5GA 2QJEA 4F31B 1IXGA 1M5EA 4OESA 3PUXE 1A7LA 3PPQA 4G4PA 1M5FA 1A40A 5ICTA 3VFJA 3SERA 3FXRA 3EN3A 4NMYA 5H8QB 1S50A 3MP6A 3D4CA 4DXCA 3FVKA 4NWCA 1UQWA 2R71A 4IO2A 1D9VA 3V8XB 3DELB 1S7YA 4QFLA 2V3TA 3GBAA 1LSTA 4Z0IA 4F3PA 5KDTA 4POWA 3OOAA 4F3BA 4BDOA 3CG1A 4QSCA 2QRYA 2DVZA 3PPOA 5I57A 1FQDA 4HTGA 1QUKA 2OCUA 3MVWA 5H8NB 5H8FA 2DWAA 4IY6A 2ABHA 1LAHE 3ILUB 4G2ZA 2W7YA 4KD5A 2PX1A 1GTKA 2Y84A 1BTJA 4I1DA 2D21A 5ITOA 2X26A 2V93A 4JSDA 1JW4A 1I6BA 3ECRA 2Y7RA 3H6UA 3QUFA 3CR9A 4R6KA 5FTHA 4OQOA 4RY1A 3KSXA 5BUUA 2HZKA 3EHUA 4PFYA 3VXCA 1FTKA 1TXFA 1LFIA 2V25A 5TPAA 4H1XA 4G68B 3TKDA 4ISUA 4BDRA 4PFWA 3T9VA 4EXKA 2GFEA 4QFKA 4RK9A 3ODBA 5ITPA 1WDNA 2AL4A 2Z8EA 3W9WA 2VP1A 4R72A 2O69A 4ND9A 1LB9A 3T66A 1AMFA 4KFQA 4OWDA 2QPQA 5AA2D 2DOJA 1TT1A 2AL5A 2RC7A 3G3IA 3CIJA 1Q1KA 5CMCA 4FAJA 3H7MA 4F1VA 4JB7A 3CVGA 4X1BA 5CMMA 2WKYA 2OWTA 4C0RA 1MY4A 4YB5A 1ZBMA 3G7WA 4UACA 1NH8A 1NNPA 1Y4TA 2YJPA 3HO7A 1MY0A 4GXAA 3E13X 5AA1A 3ILTB 2HZLA 4ZZAA 1HSEA 2I58A 3TPAA 5CM6A 4OEUA 3MZBA 4RPNA 4DZ1A 3QK6A 2DXRA 3U92A 4IGRA 2ZNTA 3HCQA 4NF5B 1MRPA 1LFGA 3MPKA 1AIVA 1DMBA 3QUJA 1GGGA 3H6WA 1LAFE 2OK2A 2YPNA 2DE2A 3I6VA 4BDQA 1JVYA 3PMXA 4Q8RA 2R9JA 1VSOA 4ZECA 5H8QA 1LCTA 3C34A 4QRZA 4MFIA 2XXIA 2H4IA 3L6GA 1MXXA 1FQFA 2XXQA 2CMOA 3LSFB 1Y3QA 3VVFA 3K1MA 3WAFA 1SW4A 3MVZA 1T0KA 1MM7A 5JTYB 2UYFA 2D5WA 2NVUB 4TOZA 2XXRA 5H8NA 3M8UA 3BBRA 3W15C 1LFHA 2B3FA 2OBGA 5I58A 2O7UA 4XKQA 3LC8A 1SQYA 4XIGQ 3PPNA 4R75A 4DE8A 4F2QA 1B32A 3BFUA 1VR5A 4ZDMA 3KG2A 4EF1A 2ZNSA 1RYOA 3UA8A 3V89B 1MH3A 5KDTB 4MBPA 1JEVA 4P0IA 4C1TA 3O97A 3OO7A 1OMPA 4Z7EA 3OSRA 3F11A 3MUQA 1MY3A 3PPRA 4ELPA 4LQ5A 3ONMA 3OEKA 4G77A 4G68A 3HSTA 3PD9A 4EQ7A 2ALUA 2I3VA 2ZYMA 4QSEA 4MH5A 1JETA 1N3XA 1B5IA 5CI5A 3N26A 3EF7A 3FGSA 1SD3A 2H5YA 4FJPA 1MY1A 2F6GA 4NTLA 1IQ7A 1MM6A 1LCFA 2NWJA 1QW0A 2F78A 2FYIA 1MXYA 1BIYA 4XTCQ 3O6IA 3RTFB 3SEUA 1EU8A 3MWBA 3KN8A 5EHSA 4F29A 4WXJA 3E9XA 3RGYA 4GD5A 1KWHA 2V84A 3RT6B 1FCKA 1MPCA 3IO6A 1GR2A 1O7TA 1NFTA 1ZU0A 1DSNA 4U23A 2DVCA 4YKPA 3BKIB 4ZEKA 4TQUQ 1B4HA 4RXLA 3H4ZA 3TTRA 4QF9A 4QSDA 1FQEA 1XC1A 2ZMBA 5J1DA 1B4ZA 2RC9A 2I48A 3B6TA 2NUVA 4N13A 4I8CA 2XXTA 4PETA 1ZJLA 1B0LA 4NF5A 3RUMA 2Q9TA 2F6PA 2I4BA 4XXUA 5ICQA 1WODA 3IJOB 2UYEA 2XD2A 4LZ8A 2ZYOA 3I5OA 1N84A 1D3KA 2B3BA 1OIBA 1N04A 4R6HA 2GH9A 4KQPA 4M1VA 4PQJA 2O51A 1FQCA 3DP8A 2XXWA 3KBRA 5ISUA 2F36A 1F9BA 3R7XA 3H03A 3K6WA 5CMKA 2O1MA 2PVUA 3CSBA 3QSLA 4IO4A 1PB8A 4GWOA 2Q2CA 4H8IA 3SEVA 3C35A 1LAGE 1USYH 5JTYA 4R6YA 1A55A 2A5TA 4H8JA 4JWOA 1P1WA 1PB9A 5I2KA 1DPEA 3BFTA 2QS4A 4YKIA 1Z7ME 2HEUA 3CFXA 4I62A 3S4UA 3C33A 3VVEA 1MXWA 2REJA 3PUWE 3VE1B 3TTKA 4PFTA 4QFPA 1R9LA 3S9EA 3RT8A 3EPEA 3CG3A 3K0VA 4BLAA 3KJTA 1WVJA 2LAOA 4XKPA 4DXBA 2QS1A 1I6QA 3Q27A 1PBPA 5AA2B 1B58A 4OFOA 3VDFA 3M3LA 4O3AA 3PU5A 4QHQA 3PV0E 3IX1A 2M8CA 5F7VA 2QL3A 1SDXA 3FV1A 3IAZA 2G29A 4FEBA 2O6AA 3UORA 3TODA 1B3LA 2B65A 1SI1A 1B52A 1SI0A 5I58B 2NXOA 5HPQA 3OO6A 5DVFA 3TEPA 1B3GA 2YLNA 1OLCA 2R6GE 3FUZA 1GVCA 2F8DA 1URDA 3SEWA 1AL3A 4RNSA 3TFLA 1YAEA 5AA4B 3LBSA 2F34A 3O2AA 3CI8A 4FECA 2XX9A 2ZXTA 1VE4A 5I2NA 5I56B 1XVYA 3EHSA 2AIXA 2PYYA 1O63A 3LSXA 1MXZA 2GHBA 2OZZA 3V5AA 1A54A 1JW5A 1UTHB 1Y1MA 3FZVA 2Y7PA 3OO8A 4F2OA 5L9SA 2F5XA 3HV1A 3GXAA 2XHDA 5I84A 2IA4A 3M3KA 5DEXB 3TELA 2F7AA 3QYTA 3FJMA 1ELJA 3MP8A 4KR5A 4LONB 5K2XA 1LAXA 1H43A 4E0WA 3EHTA 1B3HA 2QS3A 2DP8A 3A3CA 1I69A 4JDFA 3RTWB 4BDMA 3TTMA 1NMUA 1OLAA 3N94A 1B1XA 1P1OA 1ANFA 2DWJA 1IITA 3K6UA 4FORA 5CBRA 2PBWA 1NNKA 4AB5A 3IORA 2QSXA 3TDJA 5H8SA 1ZTYA 1NNFA 4GXSB 2XXPA 3DP6A 1B6HA 1JQFA 4F1UA 2FA7A 3K6VA 5A5XB 3MAMA 4YB6A 1EH3A 3FIRA 3KN3A 2RCBA 2E1SA 3CSGA 3IOTA 4EXLA 1UIUA 3TQWA 1II5A 4GL0A 3PUVE 2UVHA 2ONRA 4RA1A 4WEPA 5FHMA 5CRYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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