4DXUA

Crystal structure of c-lobe of bovine lactoferrin complexed with aminocaproic acid at 1.46 a resolution
Total Genus 118
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
118
sequence length
335
structure length
335
Chain Sequence
b'YTRVVWCAVGPEEQKKCQQWSQQSGQNVTCATASTTDDCIVLVLKGEADALNLDGGYIYTAGKCGLVPVLAENRKSSKHSSLDCVLRPTEGYLAVAVVKKANEGLTWNSLKDKKSCHTAVDRTAGWNIPMGLIVNQTGSCAFDEFFSQSCAPGADPKSRLCALCAGDDQGLDKCVPNSKEKYYGYTGAFRCLAEDVGDVAFVKNDTVWENTNGESTADWAKNLKREDFRLLCLDGTRKPVTEAQSCHLAVAPNHAVVSRSDRAAHVEQVLLHQQALFGKNGKNCPDKFCLFKSETKNLLFNDNTECLAKLGGRPTYEEYLGTEYVTAIANLKKCS'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule keywords Lactotransferrin
publication title Crystal Structure of C-lobe of Bovine lactoferrin Complexed with aminocaproic acid at 1.46 A Resolution
rcsb
molecule tags Metal binding protein
total genus 118
structure length 335
sequence length 335
ec nomenclature ec 3.4.21.-:
pdb deposition date 2012-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00405 Transferrin Transferrin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4dxuA02
2YJPA 3EN3A 1O7TA 2CZLA 2OK2A 2WKYA 3FVGA 3ILTB 1LB8A 4HCWA 2P1SA 2QJEA 2O69A 5FTIA 2HXWA 1QUKA 3VLWA 4U2RA 3C35A 3QK6A 2F97A 1VFEA 4YMAA 1LAFE 3GZGA 1JW5A 1HSLA 1FQBA 1D9VA 5M2VA 3K6UA 3L6GA 4L17A 3OEKA 2Q89A 4H67A 3FZVA 4IO4A 1US5A 3MVZA 1M5CA 4PQJA 1LLSA 4XIGQ 1A8FA 3SEWA 2UXAA 3IO4A 3RGYA 4EXLA 3SDFA 4DXUA 2F7BA 3H06B 5I56A 4GL0A 1N0TA 4KYDA 3HHGA 4LONB 4RPOA 1FQEA 4F31B 5FHOA 3SEYA 4NEDA 1PBQA 3MZBA 5H8FA 4G68C 3H4ZA 3EPEA 4WEDA 4QFNA 4R2BA 2E1SA 1B52A 4FJPA 4PFTA 1R9LA 1NKXA 3RQTA 2D21A 2G93A 4RNSA 3PD8A 2V3QA 3O29A 3F11A 4XKRA 3VLVA 3LC8A 2OJTA 5HM4B 4OEVA 3EQ1A 2DVCA 2XXTA 3MP1A 1Z7ME 2IEEA 2ONRA 4X9TA 4JSOA 1VFDA 4QFLA 1JQFA 2QSXA 1B5JA 2YLNA 4FATA 2I58A 3TPAA 2ZYMA 2IA4A 2RCAA 4MFIA 4NF5B 2RC7A 2M8CA 4Q0CA 4G2ZA 3ONMA 1MY1A 4U1ZA 5AA4B 3MP8A 3TTNA 4JB7A 2QS2A 3E3KA 4MBPA 1NNTA 3RPWA 2PX1A 4FECA 4U4XA 3FUZA 3HV1A 4NTLA 3SERA 4GWOA 1L5TA 4NF4B 1JVXA 2UVHA 4G68B 2I49A 4NF5A 1MY0A 2Q2AA 5AA1A 4Q5TA 4F39A 3TYHA 3FJMA 5B7DA 3K1MA 1ATGA 5TP9A 4F2OA 3PUYE 1TT1A 4X1DA 4C0RA 5CMMA 3FJ7A 4NMYA 1MM6A 2HEUA 4KFQA 5I2NA 4LVQA 3PMXA 1N04A 5ITOA 3UP9A 2V3TA 1O64A 3KFMA 4MF3A 4NF4A 3ZKKA 1YAEA 2OZZA 4XKQA 5DT6A 1HSJA 3EF7A 1B3GA 4LP2B 3ECRA 4OERA 3IO6A 5H8QA 3QUJA 4PETA 3T9VA 1URDA 1JETA 4ZE8A 1D3KA 4OFJA 2ZNUA 3PV0E 4F1VA 4GD5A 3O6GA 3MJNA 4U23A 2H9BA 5I59B 5A5XB 1LFIA 2ZXTA 2CMOA 5L9SA 3OXNA 4ELOA 1J1NA 4GXAA 4BDOA 1TXFA 3T22A 1SDXA 2QS4A 3P7IA 1XHYA 1DPPA 3DP4A 3LSFB 5I2KB 2G29A 3MBPA 5ICQA 4R6HA 3KN8A 5KDTA 4GLIA 2XXQA 3VVDA 2Q8JA 3W15C 1NNKA 5K2XA 2ONSA 5EYFA 1SW1A 2DWJA 2DXRA 1DSNA 4LQ5A 3KOSA 5FHMA 1B05A 1B58A 2UVGA 1A99A 4ELRA 5I59A 2ZYOA 3MW0A 1JVYA 2VD3A 3LSXA 1DTGA 3IB1A 1B3HA 1SW2A 2PVUA 1MQDA 2H5YA 4HCYA 5ELVA 1Y20A 2PYYA 4MLQA 3C4MA 4GVOA 4BDNA 3IK6B 4WXJA 1IITA 3PUZE 1LGBC 2PBWA 3MVWA 5LOMA 4KI0E 1B0HA 1MQHA 4U22A 2F6PA 2I0CA 1OQGA 3DP6A 3PUWE 4EQ7A 3V89B 3CSGA 1MXXA 1FTJA 1Y4CA 2ZYKA 5DTBA 3TQWA 3E9XA 2HFBA 2GH9A 1ZBMA 1P99A 1ANFA 4POXA 3FV1A 4ZEDA 3K6WA 4EDPA 2XXRA 3U72A 4X48A 2VP1A 4QRZA 1B40A 4U1OA 3JYRA 1MH4A 3TTKA 4JSDA 2O1LA 5IKBA 3S4UA 2PMSA 2X7QA 3SEUA 3MQ9A 3T96B 4WEPA 3LUYA 1QKAA 2HQ0A 3UA8A 1MRPA 3HPIA 1LCTA 3O97A 4N6PA 4FEBA 3IB0A 2D3IA 3CG1A 3CG3A 2H25A 5I58A 3N6UA 4H6DA 3O6HA 4EF1A 3HCQA 2A5TB 1T0KA 3ZSFA 1BIYA 3T93B 4N13A 4GOTA 1OIBA 3PPNA 1WVJA 1H3DA 4IGRA 5KZTA 5F1QA 4OESA 3KOTA 5CI5A 3OELA 2D5WA 1P1OA 4FE8A 3VVEA 4GQOA 4EQ9A 1A55A 5I57A 2DWAA 2DWHA 1MY3A 2XXVA 3IOWA 4WKMA 4X1BA 3U1OA 3PPQA 2LAOA 2DQVA 3C33A 3TTLA 3KN7A 3RUMA 2XXHA 4NF8B 1AIVA 3CSBA 1LFGA 1IXHA 4GIZA 3K00A 4YU0A 4NF6B 3LSWA 2NWJA 4ZDMA 2F6GA 3B6WA 5AA2B 4LUBA 3PUXE 1GVCA 1UQWA 4H1XA 3Q28A 1NMUA 3IX1A 1BTJA 3KEIA 1N3XA 3MZ1A 3KBRA 5L9OA 1Q1KA 3FV2A 2I3VA 4XKPA 1USYE 3H6VA 3VDFA 5CMCA 2R71A 4I1DA 1A8EA 1B3EA 2QMXA 4NF6A 5FTHA 3B6TA 1B3LA 4DXBA 3LSLA 2B3BA 2ZMBA 1IUDA 2F36A 3M8UA 4OVJA 4I9DA 2F34A 3O2AA 4DLDA 2XX9A 1B32A 2DVZA 3C9HA 3FGSA 2OBGA 5H8HB 3JZJA 1Y1MA 2Y7KA 3Q27A 3KSXA 3QSLA 1ZJLA 1MXZA 1D9YA 1EU8A 1UIUA 2F35A 3OO8A 5CMKA 1MH3A 2NVUB 1QULA 2GHAA 1UTHB 3K1PA 4I62A 3KZGA 3VFJA 1SI0A 4F3PA 1N76A 4E0XA 5DEXB 1SI1A 3HN0A 3A09A 3UIFA 4F19A 3H3GA 3U8QA 3IJXB 1DOTA 1I6QA 4ECFA 3T9XB 1NNPA 2DXYA 2ANJA 2RC9A 3K02A 1SYIA 1Y9UA 2XXWA 3MAMA 3I6VA 2ABHA 4OQOA 2OWTA 2F7AA 2Y84A 3SESA 2O84X 3TCFA 4P11A 3RT6B 1ZTYA 4IY6A 3B7DA 2I3WA 2I4BA 3WAFA 3KG2A 1S9TA 1IXGA 2Z8FA 5DEXA 3R7XA 3D4CA 1S7YA 3L6HA 4R9FA 5DVFA 2QMWA 3AXFA 4RJZA 3DELB 3M3KA 5I84A 2O1MA 1QUIA 3O66A 4OTEA 1SBPA 3E13X 2E0SA 3T9HB 3Q25A 1NL5A 4K3FA 3MC2A 1NH7A 2P0SA 1MY2A 1UTBB 2VD2A 3IOVA 4YB6A 3IOTA 4KCDA 3CIJA 4YMBA 3O6IA 3PUVE 4H65A 2RCBA 1OLCA 1I6BA 1S50A 1WODA 4ISUA 2Z8EA 3S9LC 3UGWA 4F29A 4JWYA 3RT8A 1MPDA 5DVJA 3USDA 2QPQA 3FIRA 3OMBA 4YAHX 4YB5A 1XC1A 4QSEA 1R1NA 2F8DA 5HBCA 1B3FA 3QXMA 4ZEBA 3K2DA 4OWDA 3TEPA 4R6YA 1B4HA 5AA2D 4OMBA 3N6TA 4YKIA 1H76A 1B51A 2R6GE 1IEJA 5KCJB 1Z7NE 1P1QA 4PP0A 5AA4A 4RA1A 2DSFA 2DYXA 4H5FA 2AL5A 1PEBA 4YKJA 1Q35A 4E0WA 1OVBA 1R9QA 3I3VA 2DOJA 1IXIA 2DE4A 1B7UA 4TQUQ 3OSQA 4QSDA 1IZ1A 4G68A 2AIXA 3PU5A 3IAZA 4QFOA 4RYAA 1MQJA 2H4IA 4BLAA 1XVYA 1M5BA 1MXVA 1RYOA 4JBZA 3TZAA 5EHMA 1AH5A 1M5EA 3SKPA 4M4GA 1POY1 3CFXA 3KJTA 3G3HA 3ODBA 5JTYB 4PFWA 4Z7EA 1FTLA 2DP8A 4GL8A 2GFEA 4MH5A 3TKDA 3UN6A 4ZE9A 4RY1A 3UORA 1B7HA 2ZNSA 2O7UA 4DIGA 1TFDA 1B7ZA 3JV9A 4TLLB 3PMWA 3R26A 2UVJA 4AB5A 3WAEA 1MXYA 4R72A 2I0BA 1DTZA 1FTKA 1VE4A 1Y3QA 2VGQA 4LZ8A 5JK4A 2PT1A 4IO3A 5A5XA 1EH3A 4FORA 4ZECA 2ONKE 1USYH 3KN3A 4IO6A 3QIMA 1IQ7A 4H8IA 4MLVA 1ZKBA 3CFLA 2AYSA 5I2KA 1QW0A 4OYVA 3OENA 1DMBA 3RTWB 2QS3A 1PBPA 1MY4A 5BUUA 3E4RA 3IORA 3MZ9A 5BWJA 4PFYA 1URGA 1URSA 1B9JA 4F1YA 3W9WA 3V5AA 1TWYA 4LA9A 1BP5A 3OD7A 3G3FA 4EUOA 4F3GA 4KR5A 5CBSA 2I48A 3TCGA 1ZLQA 3OSRA 4YB7A 1Y3NA 3IJOB 4DDDA 4O3BA 4FAJA 3KJ7A 2ESNA 3GXAA 4FEDA 4QF9A 1RKMA 1IIWA 4NWDA 1MDP1 1KWHA 1CB6A 3PD9A 1Y1ZA 1MPCA 1SW4A 4RK2A 4OFLA 5ICTA 1XOCA 4ZS9A 1QUJA 3IR1A 1AOVA 4HS7A 3Q26A 3VE1B 4ONYA 4G8MA 4POWA 1JW4A 3K0VA 3TTMA 4HW8A 3SETA 4OEUA 3V83A 1LCFA 3VV5A 4NWCA 3TFLA 1PB9A 2NOOA 4JXIA 1OVTA 1ELJA 3VXBA 1OLAA 1B2HA 1I6AA 2F7CA 4XKNA 3CVGA 2Z8DA 4PFUA 1JNFA 4DCXA 1MQGA 4R2FA 3IL1B 1B5IA 3TDJA 1QVSA 1LAGE 3TTRA 2A5SA 1YTVA 1SD3A 1ZU0A 2A5TA 3GLBA 2O7IA 4F3BA 1YCJA 4ESXA 4F22A 4FIMA 4R9GA 1XS5A 3A3CA 5AE4A 5EHSA 4R74A 3BFTA 3LR1A 1NH8A 3TQLA 4I8CA 3B6QA 2V3UA 4LATA 3LBSA 3A3UA 2AL4A 1Y4TA 4NF8A 3FXUA 4H5GA 4QFKA 1A7LA 1N7WA 2REJA 1FCKA 1OMPA 2XD3A 2RINA 5L8DA 1FQFA 1M5DA 3TMGA 1B4ZA 5AA2A 1VR5A 4PE5B 3FD3A 5ITPA 3MVYA 1MG1A 4F1UA 1POTA 4G77A 3EHUA 3QYTA 5I56B 2UYEA 4GFRA 1GR2A 3TELA 3HO7A 4KHZE 4Q8RA 1EZOA 3OOAA 3V8XB 2XX8A 5CRYA 4IO2A 5H8FB 1H44A 4XTCQ 1OQHA 3EHTA 4KYEA 1EZPA 3U93A 5CMBA 2O6AA 4C1UA 3S9EA 2B3FA 4GXSB 1A40A 2O68A 3M3LA 3PPOA 3DM0A 2V84A 5H8HA 4TOZA 5JEIA 1P1WA 2XX7A 4TLMB 3FXRA 3RY3A 3G3GA 1H45A 3G3JA 1VSOA 3FVKA 4P0GA 3MWBA 2XXPA 5TPAB 3K1NA 4H0WA 4U4SA 2GHBA 4QFPA 3MUQA 2QL3A 3SEXA 1FQAA 1UTHA 1SYHA 1A54A 1BKAA 1HSEA 4QSCA 2H98A 2OLBA 4RK9A 2W7YA 1JEVA 5L9MA 5TU0A 3RN8A 2GRVA 1SVXB 2VOZA 4GF8A 2H99A 1B6HA 1EZ9A 2X26A 3C34A 5K2YA 1LBCA 3KSJA 4EQBA 3THIA 3ZS6A 2HAUA 4LZ5A 1GV8A 3HSTA 5FHNA 3QUFA 1ZMGA 3KGCA 5TPAA 3BFUA 4R73A 1F9BA 3BKIB 2Q2CA 4DE8A 3PPPA 3H6TA 2UYFA 3RLFE 3GBBA 4YICA 4ZEKA 2YPNA 3CR9A 3FJGA 4DZ1A 2QS1A 3K6XA 2XD2A 3VVFA 3FVNA 4U21A 5TP9B 3Q29A 1N7XA 1P1NA 1LSTA 1CE2A 1NFTA 3C31A 1LFHA 2Z23A 5CM6A 4IGTA 2I6EA 4IO5A 3R6UA 2FYIA 4KPTA 1B5HA 5I2NB 1WDNA 4JWOA 4Q30B 1UTBA 2Y7RA 5HPQA 4ZEIA 2R9JA 2XXXA 1H43A 1B1HA 3N5LA 1FTMA 1NNFA 3IOUA 4H8JA 5H8QB 3U94A 1QKBA 4BDQA 4LQ2A 1MPBA 1PB8A 4BDLA 1MXUA 4EXKA 1LAXA 2DE2A 2DWIA 2Q9TA 2DS9A 4GRKA 5H8NB 2XXIA 1I69A 3RTFB 5KCJA 2ZNTA 2F5XA 3S9NC 3I5OA 2VHAA 2RKMA 4LZ7A 4DXCA 3OEMA 2Y7WA 4G8NA 4R6KA 2HZLA 2HZKA 3MPKA 3CRBA 4R75A 3M3FA 4KYSA 2QRYA 4OXVA 5KDTB 4UA8A 1BLFA 5DVIA 2OCUA 1M5FA 2XXYA 1N3WA 4M1VA 4ZEFA 3IB2A 1B46A 1JEUA 2REGA 1GGGA 2FNCA 1IXCA 2HCAA 3QAXA 3VLUA 3FASA 5H8NA 2I4CA 5CBRA 4JDFA 3H03A 3K4UA 3C32A 3CI8A 5AA3A 4EF2A 2UVIA 2ALUA 3OO6A 3ILUB 1ZIUA 1R6ZA 2HAVA 5JTYA 3DLNA 4ELQA 1SQYA 2V93A 2P2AA 4JWXA 4OFOA 1XT8A 3G3IA 1XVXA 1MS7A 4XXUA 3OO7A 2Z22A 4NE4A 3S9MC 4YKPA 3CFZA 1LBBA 2X7PA 4OETA 1II5A 1UIVA 4KD5A 1MQIA 1MM7A 1D4NA 4O3CA 3TAJA 4KQPA 3OO9A 4KCCA 1AL3A 4C1TA 3GBAA 4ND9A 3H6WA 1O63A 4F18A 3DP8A 3T66A 1TFAA 2RC8A 3MPLA 5CC2A 3T9UA 3PPRA 2Y7PA 2OWSA 1Y3PA 3K01A 4O3AA 1SW5A 3FXQA 5F7VA 5H8SA 4OZ9A 3VXCA 1LAHE 1DPEA 2Q88A 2RF1A 3O9PA 3H6UA 3N26A 3C36A 3S2VA 4UACA 1MXWA 4BDRA 1US4A 3UK4A 5I58B 4YZZA 2Y7IA 4AB6A 2ZYNA 3EHSA 4DCYA 2FA7A 3D4GA 3G7WA 3TUSA 4IO7A 4OHNA 4F2QA 1PC3A 2B65A 4QHQA 4N07A 2KLFA 2PT2A 3O28A 3TCHA 4IB2A 1FTOA 1GTKA 1B0LA 2XHDA 5I57B 3SEVA 3H7MA 4IY5A 1FQDA 1JW1A 3K6VA 4OENA 2NXOA 1QJMA 1B1XA 2O51A 3TODA 5J1DA 4ZZEA 1YPNA 1N84A 3MP6A 4P0IA 3W9VA 4G8HA 1FQCA 1AMFA 4G4PA 4HTGA 3ZKLA 4F3SA 5IAIA 4YKKA 4BDMA 3G3KA 3FVOA 2NUVA 4RXLA 2THIA 4THIA 4ESWA 2BJJX 5B70A 3U92A 4AQ4A 5ISUA 1P1UA 3BBRA 4RPNA 1PB7A 1LB9A 3FATA 2DE3A 2XXUA 4ZZAA 3RNNA 3MVXA 3HHFA 3N94A 2F78A 1PDAA 1MDQA 1RYXA 4Z0IA 3PMVA 5DYHA 2V25A 4ELPA 3PGFA 1FW0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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