4E2BA

High resolution crystal structure of the old yellow enzyme from trypanosoma cruzi
Total Genus 141
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
141
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
MATFPELLRPLKLGRYTLRNRIIMAPLTRCQATEDGHVPRTESMLKYYEDRASAGLIIAEATMVQPNYTGFLTEPGIYSDAQIEEWRKIVDAVHKKGGLIFLQLIHAGRAGIPEKILQQPKSDQDPLAGRLLAASAIPIKDHRIPAYFAASGEKETYGVPEELTDDEVRNGIIPLFVEGAKNAIFKAGFDGVEIHGANGYLLDAFFRESSNKRQSGPYAGTTIDTRCQLIYDVTKSVCDAVGSDRVGLRISPLNGVHGMIDSNPEALTKHLCKKIEPLSLAYLHYLRGDMVNQQIGDVVAWVRGSYSGVKISNLRYDFEEADQQIREGKVDAVAFGAKFIANPDLVERAQHDWPLNEPRPETYYTRTAVGYNDYPTYN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma cruzi
publication title High resolution crystal structure and in solution studies of the old yellow enzyme from Trypanosoma cruzi: Insights into oligomerization, enzyme dynamics and specificity
rcsb
molecule keywords Old Yellow Enzyme
total genus 141
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00724 Oxidored_FMN NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 4e2bA00
1TPEA 4FB7A 1K8YA 1YDNA 1VLIA 1OFAA 1WOAA 4X2RA 3BG9A 4UFMA 5AC7A 3FA5A 1TREA 4M19A 5FF7A 3Q58A 2RHGA 5AYZA 2NV1A 2HTMA 4UR7A 3W2NA 4KWVA 5TBOA 1LDCA 1LROA 1OFOA 5BW6A 2DZSA 1QPOA 1F76A 1M5WA 1SO4A 3C56A 3N34A 3TSDA 4P2VA 1SFJA 3HGOA 2Q8LA 1A5SA 1H7OA 3TXZA 3NQGA 1IIGA 1H7RA 4GFSA 3S5ZA 1WQ5A 3S42A 2OT0A 4N2YA 4LVFA 1SSDA 1H51A 3FJLA 2Y89A 3SFKA 2E77A 2WNNA 1F2JA 3W1PA 5FI8A 3HPZA 4EIVA 4JYFA 3MHUA 3DHFA 1G4EA 1TPB1 3W74A 3CQ0A 1PE1A 2V82A 1EUAA 4HHPA 4ZQMA 4QJ1A 1VZWA 3PUDA 1KTBA 3DZ1A 3CM4A 2VFEA 4AF0B 4K38A 3ZR4A 1JCXA 2CLOA 3CEPA 2E5BA 2WSQA 2B7PA 5DELA 3ABOA 3W85A 4UIOA 2A7RA 1OFDA 3SGZA 4RXGA 2A5HA 2JK2A 1FWRA 2VXNA 1TTPA 1FDYA 1ZCOA 3MI6A 3LCWA 2E5CA 3JS3A 1MSSA 3W86A 2A6LA 1WBJA 2B7OA 3P62A 4UCGA 3OVPA 3GKFA 3BV4A 4MY9A 1I2QA 2V30A 4HNNA 3OBKA 4R53A 5AOUA 5HWMA 5CKSA 1KM2A 1D3GA 3UXAA 1IGSA 2PE4A 2GPTA 2YYUA 3PBYA 4FX6M 1FWSA 2EKCA 4JEQA 1H60A 4LT9A 4MFDA 3USBA 1JVNA 2FPVA 4AWSA 4PA8A 3BW2A 2CLLA 4O53A 3CU2A 4MZ1A 5AHLA 3BW3A 1QDSA 3TMQA 1VHNA 3LBMA 3W7OA 4YWIA 4FNTA 5D30A 1K7XA 4O1AA 1KM5A 3OVQA 1TPH1 1UASA 3UWQA 4A3UA 3QSRA 3NPVA 3TSBA 2CLIA 3SJ3A 1FCQA 1FBAA 1XDMA 3W7PA 4HKPA 4M6VA 2FPYA 3M5ZA 5HWJA 3TE9A 4LUJA 2QKFA 5D32A 5F2MA 3W2LA 2JGQA 1D9EA 2Z6JA 4TIMA 2ZFAA 4DPQA 4DPPA 1JCNA 4RCXA 1VH7A 4RX0A 1XFBA 2WV8A 2NV2A 1A5AA 5LSMA 5HNRA 2W79A 3C2OA 4D2JA 2DZVA 4L4LA 3FKKA 1P1XA 3A23A 4G1KA 2NUXA 4BFAA 5C54A 1L6WA 3H55A 1MXSA 1TIMA 4FNSA 3L9CA 3NZRA 1XBYA 3T40A 3MP3A 2QCNA 2YXGA 4UTMA 3A24A 1SPQA 3EX3A 3N3MA 3VCRA 3KRZA 1FY6A 3TQ0A 2NXHA 3KVKA 1KFJA 2V9DA 3QMTA 4FNRA 2V2DA 3KOFA 4MLJA 3QC3A 4PEKA 4HPJA 4DELA 1RR2A 2ZTJA 3HG5A 1YTKA 1IXQA 1PL9A 2QEZA 4JD4A 1LOLA 3L65A 5TQLA 5HMSA 4Q32A 4R7JA 1V5XA 4IOTA 1SZFA 1VYPX 3W1QA 3P84A 3QRHA 2XN0A 3E49A 1B3OA 5C2XA 4BI6A 3WK1A 3UD6A 4MYAA 5AHMA 3P5YA 4GUFA 4WY0A 3S1VA 3H54A 1VRDA 5CZTA 1KM6A 1XXXA 3W7CA 3TFCA 4N6EA 3PB0A 4UTLA 1TSIA 2CW6A 3LGEA 1EP1A 2BZNA 1WBHA 3OIXA 3PBUA 5AYYA 4UTKA 3W75A 3ANYA 2V5BA 2C1HA 1JCLA 4WQ6A 1OABA 4BK9A 1GOXA 1KFEA 1GG1A 4DO4A 3PB2A 3HPSA 4RLIA 3SZ8A 4N9BA 3I7QA 3MI2A 4AVFA 1HUVA 3NQFA 3QYQA 4Z1CA 4M7TA 1F74A 4J9JA 3W70A 2QF7A 3SW6A 3KFTA 1WAUA 1Q3NA 2FTPA 3A9IA 2GQ8A 5IM51 5C6MA 3M5VA 2J6XA 1KBIA 1AL8A 2AGKA 3UXDA 1I45A 3W07A 1A53A 4UTHA 3KX6A 4PL2A 1M6JA 4UR8A 1Z48A 1K3UA 3NAVA 4GE8A 4O4WA 3GXTA 3MYOA 2CU0A 2X1UA 4IMCA 4RKAA 3GAYA 3C2EA 3LLFA 1YLVA 2VFFA 1ALDA 4NJJA 5CZSA 5D38A 3LCHA 2G97A 5G2IA 3W2JA 1W37A 1ZAJA 1SW3A 3EX6A 1U83A 3M41A 3QQ1A 3LHZA 4FIQA 1X1ZA 1LOSA 1I2RA 3W3OA 3T7VA 5FEXA 2PRMA 3E02A 2YFOA 2E5DA 1DORA 3W7DA 4QM1A 2ZDRA 1XC4A 3MYPA 3OVRA 1VGAA 3SGUA 2AQWA 3NQCA 4ML9A 3FIGA 1JRBA 1AW5A 2R94A 4MUZA 3GAKA 2Y85A 1M7OA 3MW7A 1XUUA 3ZWSA 4O50A 1KFCA 5CPLA 2FPTA 3MP5A 4N9DA 4PL1A 2QJHA 3W73A 3LI0A 4UMBA 2P1FA 3PBWA 1SU5A 1E51A 1C9DA 5D2WA 3GVGA 1UB3A 3HB9A 4FX8A 1A50A 1IIHA 1HFBA 2CZFA 3KVLA 2DZXA 3OG3A 1S5TA 3WK3A 3MP4A 2HMCA 1IF2A 4JX4A 5G4EA 1NF7A 2QUTA 3UWWA 3C6CA 2HSAA 3EXSA 3Q94A 5DLCA 3S5OA 1BTMA 4LY8A 4CQAA 1H50A 3TFXA 4FEZA 3BO9A 4NXSA 4XKYB 4RR4A 2FB3A 3O05A 1DQXA 1IXOA 2YX0A 1VC4A 1VR6A 1L2UA 1X6UA 4PH6A 4X3ZA 1RVGA 3W1AA 4YXGA 1KW1A 3K30A 4O12A 2YW4A 3SSJA 4O16A 3W72A 3BK0A 3KRUA 4JX5A 3N19B 1GT8A 4AMAA 1K8XA 2H8XA 4DO6A 1SZEA 3UPWA 1JCMP 5FEPA 5CSRA 2B4GA 5CZ0A 1K03A 1M7PA 1TV8A 3DXIA 4HNUA 1YXCA 4ALDA 4UNKA 2YZRA 1WDWA 4I9AA 3EKZA 1ML1A 3G0UA 3TU9A 1GPWA 3IVSA 2NUWA 3LXCA 3SECA 3W7IA 3OEXA 2QCDA 4RV8A 3GDRA 1GTEA 3JR2A 3G1VA 4NQ1A 3GB6A 1D3HA 1VCVA 4W9TA 5U4NA 2P10A 2WSRA 4I7VA 2VC6A 4XBSA 3T78A 1DJQA 2ABAA 2Z6IA 3L0KA 5DBUA 1H7PA 4YL2A 4FX7A 2DJLA 3FJ6A 3S9YA 1OG0A 4O4VA 5D05A 1TV7A 3TX9A 3NQ8A 2FIQA 4MVAA 4JX6A 1TJRA 4HSOA 2ZZ7A 1VPXA 4NU7A 2E1DA 1EIXA 3O15A 4JTUA 3NQAA 3W7EA 4E38A 1FCUA 3DI1A 5I3FA 4MJZA 2ZTKA 1JR1A 1EWEA 1VYRA 3NVTA 1YPFA 1RQHA 3PS7A 2OT1A 2ZRUA 1C29A 3PG8A 3I68A 1OFRA 4O1BA 3B03A 3NQ2A 2A2IA 4JTJA 3O63A 5G4WA 1EX5A 2A4AA 2DZPA 3LOTA 1GZGA 5CZJA 3IIOA 1LLZA 4JTLA 4DBDA 4NNBA 4K8EA 3OA3A 2QCFA 5E0KA 4K6AA 3KAOA 2QCMA 1K7FA 3O1NA 3G8EA 3O6DA 4C1KA 3NQVA 1LTDA 5K9DA 1LRTA 4P61A 4O28A 1JQXA 1DQWA 4QNWA 3I6RA 3PM6A 5DXXA 2QAPA 4A2RA 1EA0A 2C13A 1W1ZA 3HG4A 4O1DA 4A22A 4DO5A 2FDSA 4JICA 2PURA 1P5BA 2VOMA 5SWUA 4JTTA 3UYCA 4XTDA 3TA6A 4OHQA 2V8ZA 1G7VA 3O06A 2NXIA 1RPXA 1WX0A 4JS3A 4IGHA 3SR7A 2ATSA 2XFWA 2A85A 1HTIA 2R14A 3MWAA 3GKAA 3GXNA 1KM3A 3CEUA 3WJWA 2E6YA 2V2CA 3IGXA 4BR1A 1H61A 3ZS4A 5KMYA 3UY8A 5L6UA 1S3HA 3KVJA 4MY8A 1X1OA 5FF2A 4GBUA 1DBTA 4FF7A 4WOQA 2QCCA 3P82A 4Y8FA 2A7PA 3W7KA 1DKWA 1OFEA 2TPSA 3FS2A 3BLFA 3DI0A 1UJPA 3EB2A 3N9SA 3G1YA 3O6CA 3B05A 1BWLA 2GJNA 3HOJA 3PVFA 4K36A 3W1LA 3L5LA 4NXKA 5D2TA 5DY2A 3RK8A 3O8AA 2BWGA 3W71A 3M5XA 3EKLA 2EPHA 4Z1DA 3STGA 1H7XA 3IIVA 5D2YA 2BLEA 3IEBA 3BW4A 3NL5A 3EWXA 3TROA 2GQ9A 4IMFA 3IIZA 4LC6A 4WUIA 3TSMA 2QDGA 3ELFA 3V1PA 3EXRA 4N4QA 4RK8A 1TMHA 2FJKA 3FYOA 1W31A 4ADTA 1GYLA 3HGJA 4LOCA 4R34A 2QUVA 5LNSA 4AWTA 4MZ8A 3PUEA 3QQ0A 3S5NA 2X2GA 3L21A 1F73A 4S2BA 1TQXA 3MHFA 3MI3A 4HNVA 1LOQA 2BSLA 4CCCA 1OX5A 1AG1O 1NAL1 1LM1A 2Y70A 3DBPA 2O7SA 3LERA 1JJKA 5BMWA 1KTCA 1P0KA 3QH2A 4UUIA 3CC1A 3NM3A 1YADA 1PV8A 5K3VA 1KM0A 3TK7A 3W1MA 2H8ZA 2OCZA 1H63A 5CPNA 1R46A 1DHPA 3PAJA 4M6PA 4WJEA 3DFSA 5LNVA 4HT3A 5KTLA 4LC8A 4FXSA 4ORMA 1OFPA 4CLMA 3MBDA 4WOZA 2HS8A 4IMDA 4QNEA 1L6SA 5LHEA 3MUXA 1AK5A 1HG3A 1B57A 2V2HA 3W1NA 1JULA 4BWLC 3MBFA 1ICQA 2ZYFA 3LI1A 2LLEA 4HPXA 1EWDA 1PHWA 1GVOA 4K7VA 4AEOA 5BNKA 1TPDA 3UQNA 2QJIA 3M7WA 4YLWA 4BI5A 5KZEA 4O52A 3KRSA 4MOZA 2ATMA 3CT7A 4LW7A 5KINA 4TU1A 4JIQA 3EWUA 1OX4A 5AHEA 4LV4A 1XCFA 2RDUA 1YPIA 3GDKA 5LGZA 3KHJA 2WPBA 3I7RA 4OE7A 3TC6A 3G0XA 3UNDA 2Y63A 2WNQA 1QO5A 4IJBA 2C14A 3GR7A 1Z41A 3D0CA 3W7LA 5MHBA 1YYAA 3LHTA 1TPUA 5LHFA 4NJHA 1B4EA 2Q3OA 4RZ6A 3FLUA 3P67A 1I8JA 1OYBA 3HGSA 3BLIA 4UFLA 3C52A 3W2UA 4FXRA 1T99A 3IIPA 2ZA2A 1UBSA 2NLIA 3SIZA 1ZHAA 1WV2A 4WXYA 2G96A 3HG2A 3UZ5A 4I7WA 5C5YA 4MLRA 4Y90A 3BG5A 4Y96A 5L9FA 3CLMA 2OJPA 1R2SA 4OT7A 1ONRA 3QZEA 2IQTA 5EA9A 3IGSA 1KM1A 4FNPA 4QAIA 5D04C 3LHWA 4TX9A 3JRKA 3LHVA 2Y7GA 5FF4A 3LRKA 1MO0A 5D03A 3G8RA 3TW6A 2NXGA 3QM3A 2FLIA 3PR2A 1W3TA 2F84A 3YPIA 3NO5A 3BLEA 3QPYA 2Q8ZA 3FYPA 3G3MA 4Z08A 3ABQA 1LORA 6ALDA 2DU2A 1JRCA 1G4SA 1CI1A 1XDLA 4JIPA 4K8HA 4QSHA 4N4PA 5F4WA 2CLHA 1F7BA 3QEZA 1W3NA 2CWNA 3B4UA 5HWNA 4L4MA 3LXBA 2E6AA 3M9YA 5DCBA 4NNAA 1JUKA 3LHUA 3O6YX 3DHDA 2YFNA 3TNOA 3EX2A 1SW0A 2QCHA 3A5FA 3G1DA 4A2SA 3B04A 1GVFA 2G95A 3GZ3A 3NYZA 3P81A 4JTFA 1TYGA 4HN4A 4LU0A 4OWGA 2VEKA 3UWYA 2ZBTA 1LZOA 5E93A 4TR9A 3TQVA 1K02A 3CWOX 4JTSA 2GUUA 3C3NA 3W7JA 3W23A 3M1ZA 4ZQNA 4O18A 4PFMA 4H3DA 2ISVA 3LDVA 3L0NA 1F6PA 1OF8A 3KVMA 3LCFA 4O15A 1GEQA 1XBXA 5D02A 1AW2A 3TJXA 3MO7A 3P74A 4B5NA 3W1TA 3LX9A 4ICNA 1SO6A 1KBJA 1H1YA 5EY5A 1UUMA 1GJPA 5DN1A 2KZHA 3THQA 1Z44A 4OGZA 2E6FA 2GQAA 4MFEA 2BTMA 4E2BA 1EPXA 5KZMA 2ZRWA 1H1ZA 2WOQA 5HINA 2YSWA 2C18A 2ZQ0A 4LUIA 2ZZ1A 4WY0B 1OVDA 1TTQA 2Y7DA 3T44A 3NQDA 1PCKA 3NXFA 3ATZA 2R91A 1JCYA 3FOKA 4GWEA 3EX1A 2J24A 2QCEA 2A7NA 2XN1A 3C4UA 3E0IA 5G1YA 1R47A 2W0UA 1OF6A 2Q3RA 4K37A 3GYEA 3CTLA 4Z0SA 4JY9A 2VEPA 2E09A 3W22A 4JTHA 3N2MA 1N7KA 1GTHA 4IMGA 1OFQA 5HUOA 1ZJIA 4U4MA 3R8RA 2VFIA 5I3KA 2J9XA 4DF0A 4XZ9A 1N55A 4OBTA 2ZZ2A 3F03K 1SO5A 1JCJA 4LS2A 1W5QA 2ZRZA 5H91A 4GRSA 4POCA 1W5MA 2D73A 2QDHA 4EF9A 1A5CA 2HS6A 3ABRA 4E2DA 3OHIA 1LCOA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2HIS A;  1WOA A;  1WXY A;  3BG9 A;  4WLC A;  2HTM A;  3G77 A;  3WL0 A;  4EAM A;  2VWS A;  3GR4 A;  3VGD A;  4MKS A;  3C56 A;  1A0D A;  1ISY A;  1LL6 A;  1XYL A;  3AS2 A;  3TXZ A;  4ZSU A;  3NQG A;  2GK1 B;  1EA9 C;  1JAK A;  3B97 A;  4URI A;  3S5Z A;  3S42 A;  1J10 A;  5JXQ A;  5CGM A;  2WNN A;  3W1P A;  2ZX8 A;  1VB9 A;  3GC4 A;  1LQA A;  1G4E A;  1BF6 A;  1TPB 1;  3W74 A;  3WH7 A;  1EUA A;  4HHP A;  4CVW A;  1VZW A;  2HXT A;  3PUD A;  3V35 A;  4AWE A;  2R1L A;  3W6M A;  4AF0 B;  2CXG A;  1R85 A;  4XBJ A;  3W00 A;  3OGV A;  2PDL A;  2R1K A;  3ABO A;  1XS2 A;  4UIO A;  3D46 A;  1JG9 A;  5EMY A;  1OFD A;  2OSW A;  2A5H A;  4H04 A;  3VIK A;  3AUJ A;  8RUC A;  5D4Y A;  1JIB A;  1S5M A;  4GI4 A;  2B7O A;  5JIW A;  4EP8 C;  5HOS A;  2I17 A;  4MY9 A;  1OGS A;  3OBK A;  1XLH A;  4OOU A;  5CKS A;  5AZ1 A;  3UXA A;  1IGS A;  4C6F A;  2PE4 A;  4IG2 A;  2GPT A;  2YYU A;  3DFH A;  4AYS A;  2PP3 A;  3PBY A;  1XYB A;  1Y5W A;  1CLX A;  4JEQ A;  1UIO A;  2D2O A;  4CUC A;  2NW0 A;  4MZ1 A;  5AHL A;  3TMQ A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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