4E3DA

Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 76
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-03-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4e3dA00
5DSJA 2FOSA 5AMLA 3KOKA 1IF7A 4YXOA 2WEOA 1IF9A 3EFIA 3M5TA 4K0SA 4QJPA 3N3JA 2EU3A 2VVBX 1G0EA 3JXGA 2POWA 3RJ7A 1KOPA 4ZX0A 1LG5A 5BRVA 3TVOX 5A25A 1IF8A 3DBUA 3UYQA 4R5BA 2GEHA 3S78B 2HNCA 3ZP9A 4N0XB 5L3OA 4CA2A 1FQMA 4ZWZA 3SBIA 4LU3A 4JS6A 1BNTA 5G03A 1IF6A 3RZ1B 4FL7A 1AZMA 2QOAA 5FLPA 3IBUA 4G7AA 3KIGA 3RZ7A 1ZH9A 3DC3A 2CBEA 1G1DA 1ZFQA 2NNSA 4WUQA 5JQTA 5FNIA 3RGEA 6CA2A 1XEVA 1CAKA 2EZ7A 5JEHB 4CQ0A 1TE3X 4Q6DA 2CBBA 2HFWA 4KNIA 2CA2A 4RUYA 5FNLA 4ETQC 4KNNA 5C8IA 1G54A 4HT2A 5E2NA 5JQ0A 1RJ6A 1Y7WA 4PZHA 1CAOA 5FLTA 3RG4A 2NXSA 1DMYA 4MDMA 4BF6A 4FVNA 3M1QA 3DCWA 3C7PA 4WUPA 4L5VA 4PYYA 2NWYA 2O4ZA 3MNIA 4WL4A 4QK2A 2HL4A 4RIVA 4TWLA 4Q07A 3MWOA 4PQ7A 4KV0A 1TH9A 3PYKA 3S97A 1BICA 5CLUA 3KONA 1Z93A 4Q06A 1FR7A 2NNVA 1AM6A 4LHIA 1BN4A 3P55A 4CNVA 4Q8YA 1CVHA 1T9NA 5DSIA 4Z1JA 3K34A 3Q31A 1KEQA 4Q8XA 1UGEA 2IT4A 1ZFKA 1LG6A 3FE4A 1OKMA 1I9NA 1MUAA 3U7CA 3W6HA 3MHIA 3MDZA 5JEGB 3U45X 4YXIA 5DSPA 4KUVA 1CNYA 2CBAA 5JGSB 2GD8A 4MO8A 3RZ5A 4HEZA 3V3GB 3D8WA 3B4FA 4XIXA 3MNHA 3PO6A 4YGFA 4QIZA 3V2MA 1FQLA 3KLDB 1TEUX 1CVAA 1YDBA 2WEJA 4RUXA 4E4AA 5E2SA 5E2MA 3V3FA 4Q7PA 2FNNA 3F7BA 5FL4A 3M2ZA 1JV0A 4YWPA 5CA2A 1ZGEA 1UGAA 4QJWA 1I90A 4ITPA 1ZGFA 3ZNCA 4ZWYA 1LGDA 3RG3A 1LUGA 3V3HB 1KOQA 3IAIA 3P5AA 3KWAA 1UGGA 3M98A 4Z0QA 1CNJA 1IF5A 5JESB 1YO1A 3DVBA 3RZ8A 5A6HA 3HKTA 3M2YA 1G3ZA 4RIUA 5EOIA 4XIWA 4E9OX 2X7TA 2HOCA 1BNNA 4Q99A 5EKHA 1CINA 5FLQA 4RN4A 5JG3B 1UGCA 2X7SA 1CNKA 4FIKA 4BF1A 1H4NA 4FU5A 1ZE8A 4M2WA 4Q7SA 5FL5A 4ILXA 4LP6A 3KS3A 4Q90A 2WD3A 4JSZA 1CAMA 1YO0A 4KNJA 4COQA 3P3JA 1IF4A 5FLSA 3T82A 4E3DA 4TWMA 4XE1A 1YDAA 3KOIA 3R16A 4G0CA 3R17B 1AVNA 3CYUA 4MDLA 1A42A 1G4OA 4YGKA 3FFPX 3S74B 3JXHC 1BNUA 3M1JA 4GL1X 4Q78A 1ZSCA 4Q7VA 2NNGA 4Q83A 4K0TA 1RZBA 3MHMA 3MNJA 3OKVA 5SZ0A 1G0FA 1CAIA 1ZSAA 2FOQA 4HBAA 1BN1A 1V9IC 4ZX1A 3S77B 4YGNA 3IBNA 3OYQA 1BNVA 1YDDA 4Q49A 4QTLA 4RUZA 3RYVB 2AW1A 2NXTA 5BRUA 3HS4A 5DSMA 2ABEA 1UGDA 4HU1A 5IPZA 2HKKA 3S73B 1I9QA 1RJ5A 4RH2A 1HEAA 1KWRA 4QEFA 3P5LA 1TG3A 2Q38A 12CAA 3NB5A 1FQRA 3NJ9A 1J9WA 1CVCA 3P44A 5EH8A 4QSIA 1HEBA 1CCTA 4K1QA 1G6VA 1BN3A 3MZCA 3F4XA 4YGLA 1CNGA 2POUA 1BV3A 2NNOA 1TG9A 3LXEA 5G0CA 3F7UA 3U47A 4CACA 5CACA 2Q1BA 4KP8A 3M5EA 2H15A 1V9EA 5AMDA 3DC9A 4R5AA 1CANA 3K2FA 5FDCA 4ZAOA 4QJOA 3T5ZA 2QO8A 1G53A 1FSQA 3HKUA 1BCDA 5E2KA 2FNKA 4Q6EA 3ML5A 5EIJA 5BYIA 3CAJA 3M1KA 4KNMA 5EZTX 2W2JA 3DA2A 3HLJA 3T83A 1OQ5A 2QP6A 3F8EA 1TTMA 4JSSA 2FMGA 1HCAA 3OKUA 4QJ0A 3W6IA 3RZ0B 3HKNA 4QSJA 3T85A 1KWQA 4HF3A 4Q09A 3QYKA 1CAZA 1OKNA 2Q1QA 1YDCA 3D9ZA 1HUHA 1I9OA 4KAPA 1G4JA 3DVCA 5JGTB 3V7XA 3P3HA 4UOVA 4CNXA 5FNHA 1I9PA 3M1WA 3BETA 3FW3A 4Q0LA 1XEGA 1RAZA 3IBIA 1CNXA 3S8XA 5FLRA 2OSFA 9CA2A 1BNMA 3N4BA 4L5UA 3T84A 5SZ7A 2FW4A 1I9LA 1CA3A 4Q81A 5SZ6A 3VBDA 5JDVB 4ZWXA 3TMJA 1CNHA 5FNMA 4Q9YA 3GZ0A 4Y0JA 4BCWA 1TBTX 5DVXA 3M14A 1CA2A 2F14A 1G48A 3L14A 4YYTA 3HFPA 1CILA 4Q08A 3B1BA 4YX4A 4FPTA 2HD6A 1BNWA 1CVEA 5SZ3A 3MHCA 2WEGA 5FDIA 3V2JA 5DSOA 5SZ5A 1DMXA 5EHVA 1CAJA 1BNQA 2WD2A 3M40A 5SZ1A 1FR4A 4KP5A 4X5SA 2CBDA 1URTA 2CBCA 4QSBA 1CVDA 1HVAA 1BZMA 1CVFA 1G45A 4YXUA 4ZWIA 5E2RA 3PJJA 2NWZA 4E49A 4WW8A 1RAYA 7CA2A 3M3XA 5FNJA 5J8ZA 3MMFA 5JEPB 3M5SA 5DRSA 1UGBA 4RFDA 1TEQX 5E5UA 3V3JA 5E28A 5DSLA 3M96A 3DCSA 3DCCA 4HT0A 3S9TA 5DSRA 1CIMA 2NWPA 1ZSBA 2OSMA 3CA2A 2WEHA 4IWZA 1XQ0A 4DZ9A 5SZ2A 1DCBA 2AX2A 4QY3A 4PXXA 1CRMA 3BL1A 4KUWA 4M2UA 1CCSA 1I91A 5EKMA 1I8ZA 2FOUA 4HEWA 4R59A 3S76A 3SAXA 4M2VA 4IDRX 2POVA 3OILA 3SBHA 1Z97A 1CZMA 1FQNA 3IEOA 2ZNCA 3M2NA 4M2RA 3OYSA 4Q87A 4XZ5A 2EU2A 3IBLA 3RYJB 3JXFA 5BRWA 3OIMA 3T5UA 1RZAA 4K0ZA 2FNMA 1UGFA 5FNKA 2FOYA 3RYXB 4CNWA 3S75B 1CNCA 2CABA 4FVOA 3UYNA 5JG5B 3D0NA 3SAPA 3DVDA 2NMXA 5DSQA 2FOVA 4RFCA 5EKJA 5G0BA 4E3GA 1ZNCA 4MLXA 3DAZA 4ITOA 4QSAA 1RZDA 1THKA 1FLJA 3MYQA 3HKQA 3DV7A 5FLOA 3RYYA 3MHLA 3DD0A 4HEYA 3KNEA 5HPJA 2VVAX 4Q7WA 2NN1A 5CJFA 5DOHA 3MHOA 3BL0A 3S72B 1JD0A 1XPZA 2NN7A 1CCUA 3P4VA 5LMDA 1RZCA 2H4NA 4YGJA 3D93A 3V3IB 1FSNA 1CAHA 2FMZA 3OY0A 3OIKA 4E3FA 1I9MA 2NXRA 4PYXA 4QK3A 4QJXA 4FRCA 4QK1A 5DSNA 5EHEA 1YO2A 4Z1NA 1CVBA 5EHWA 1DCAA 4MDGA 1RZEA 1Z9YA 4YVYA 1CALA 4CNRA 3MNUA 1CAYA 4Z1EA 5DSKA 4XFWA 3KKXA 5BNLA 1OKLA 1H9NA 1CNIA 1TB0X 1EOUA 3P58A 3TVNX 1CNWA 1JCZA 1HUGA 5L6KA 4L5WA 1F2WA 4Q8ZA 4JSWA 4N16A 3RYZA 4WR7A 2ILIA 4QJMA 4Z1KA 4K13A 4C3TA 3K7KA 3DD8A 1HEDA 1HECA 2NWOA 4MTYA 5E5RA 3V5GA 3S71B 1CRAA 3M04A 4MLTA 3EFTA 5DOGA 3M67A 3U3AX 3D92A 5EH7A 4JSAA 4DZ7A 8CA2A 1G52A 1HCBA 3NI5A 3M2XA 3MNAA 4E3HA 3N2PA 4QIYA 3N0NA 3CZVA 1H9QA 5FL6A 1FSRA 3IGPA 5AMGA 5FNGA 1MOOA 1CNBA 5G01A 1LZVA 3ML2A 4KUYA 4E5QA 3RLDA 2X7UA 4WW6A 5SZ4A 3MNKA 4YHAA 1G46A 5EH5A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5DSJ A;  2FOS A;  5AML A;  3KOK A;  1IF7 A;  4YXO A;  2WEO A;  1IF9 A;  3EFI A;  3M5T A;  4K0S A;  4QJP A;  3N3J A;  2EU3 A;  2VVB X;  1G0E A;  3JXG A;  2POW A;  3RJ7 A;  1KOP A;  4ZX0 A;  1LG5 A;  5BRV A;  3TVO X;  5A25 A;  1IF8 A;  3DBU A;  3UYQ A;  4R5B A;  2GEH A;  3S78 B;  2HNC A;  3ZP9 A;  4N0X B;  5L3O A;  4CA2 A;  1FQM A;  4ZWZ A;  3SBI A;  4LU3 A;  4JS6 A;  1BNT A;  5G03 A;  1IF6 A;  3RZ1 B;  4FL7 A;  1AZM A;  2QOA A;  5FLP A;  3IBU A;  4G7A A;  3KIG A;  3RZ7 A;  1ZH9 A;  3DC3 A;  2CBE A;  1G1D A;  1ZFQ A;  2NNS A;  4WUQ A;  5JQT A;  5FNI A;  3RGE A;  6CA2 A;  1XEV A;  1CAK A;  2EZ7 A;  5JEH B;  4CQ0 A;  1TE3 X;  4Q6D A;  2CBB A;  2HFW A;  4KNI A;  2CA2 A;  4RUY A;  5FNL A;  4ETQ C;  4KNN A;  5C8I A;  1G54 A;  4HT2 A;  5E2N A;  5JQ0 A;  1RJ6 A;  1Y7W A;  4PZH A;  1CAO A;  5FLT A;  3RG4 A;  2NXS A;  1DMY A;  4MDM A;  4BF6 A;  4FVN A;  3M1Q A;  3DCW A;  3C7P A;  4WUP A;  4L5V A;  4PYY A;  2NWY A;  2O4Z A;  3MNI A;  4WL4 A;  4QK2 A;  2HL4 A;  4RIV A;  4TWL A;  4Q07 A;  3MWO A;  4PQ7 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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