4E49A

Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 78
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: S +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4e49A00
3M5SA 5DSIA 3MNIA 1BCDA 1G52A 3KNEA 4RIUA 5DSRA 4K0SA 1DMYA 5E5UA 5G01A 3T82A 1UGEA 1Y7WA 3K2FA 4Q90A 2OSFA 2QP6A 4Q6EA 4KP8A 3D9ZA 3RYXB 2CBAA 5JEGB 2NWOA 1BZMA 3RZ8A 1RZCA 1URTA 1YO0A 1FQMA 3BL0A 4BF6A 3DCSA 5DSNA 4YXOA 1ZSBA 1CNWA 1TH9A 4KNNA 5EKMA 1H9QA 3OKUA 3FW3A 3P5LA 4CACA 3CYUA 3S9TA 3RZ0B 3TVNX 4L5VA 2X7TA 4QJPA 5A25A 5EZTX 4E49A 4QK3A 4Q81A 9CA2A 1I9OA 1YDCA 1XEGA 1MOOA 5L3OA 1HEDA 1TEQX 3M2YA 4Z0QA 4Q7SA 5A6HA 1FSRA 3P58A 3RGEA 3HS4A 3RYZA 5EH8A 1G45A 4M2UA 5DSPA 5DSMA 4QK2A 1I9NA 1FQLA 4KUYA 5CLUA 4RN4A 4ZX0A 1UGBA 3M5TA 4YX4A 3MHCA 1RZEA 3MNAA 2EZ7A 4G7AA 1CAMA 3IBUA 4IDRX 4DZ7A 1IF4A 3MZCA 3F8EA 1IF9A 3OYSA 3DCCA 1CANA 1CAZA 1JV0A 3D92A 2NXRA 4QSBA 1TB0X 3HKUA 3M96A 5DOGA 5DRSA 4BCWA 1UGFA 3DC3A 5DVXA 3PYKA 1I9QA 1CINA 1CNIA 4WUPA 5BNLA 1CNBA 3RZ7A 5BRUA 3HFPA 1ZSCA 1KEQA 1TTMA 3DCWA 4RIVA 1THKA 5L6KA 3N2PA 1CAIA 3U3AX 3MWOA 5FNGA 5J8ZA 5EKHA 3IGPA 4QIZA 4PZHA 5BYIA 3DVBA 4Q08A 3P4VA 2CBBA 3KOIA 4PQ7A 1KOQA 1G48A 1HEBA 3P44A 1CNCA 1CVHA 3IBIA 1IF6A 1CVDA 5JEPB 2NN7A 3V3GB 1HUHA 3JXHC 3V5GA 2Q1BA 3DD8A 1HEAA 2H15A 5EH7A 2QO8A 5JQTA 2FOVA 3SAPA 1RZAA 3MHOA 3NB5A 3M5EA 1V9EA 3U7CA 5JGSB 3M2ZA 2W2JA 3PJJA 1FQNA 3M14A 5LMDA 4KUVA 1XPZA 2FOSA 3EFIA 1T9NA 3JXFA 3RLDA 4Z1JA 3S74B 1LUGA 5AMGA 4TWMA 4QSIA 3T85A 1Z9YA 3M04A 3V3IB 3EFTA 3P55A 1AM6A 4N0XB 3MMFA 1CNKA 4M2RA 1CNXA 4RFDA 3JXGA 3RG3A 5DSKA 2WEHA 5FLPA 6CA2A 5DSJA 2X7SA 3HKQA 4HBAA 4QTLA 2FOQA 5CA2A 2POUA 4HEWA 5JG3B 5SZ2A 1CCTA 4E9OX 3M98A 1FSNA 5G0BA 3B4FA 4WR7A 3DV7A 2Q1QA 3S71B 3V2MA 1BNWA 5SZ6A 3N0NA 4PYXA 1HUGA 2ABEA 2CABA 1CNJA 1LG5A 4KNJA 3MNHA 3UYNA 4Q7PA 3T83A 3D93A 5DSQA 3GZ0A 4YGFA 3RJ7A 5SZ1A 3U47A 4E3DA 1CA2A 2ILIA 3SAXA 2WD3A 1G46A 4YGNA 1JD0A 4ITOA 3RG4A 2CBEA 1CA3A 3D0NA 4E3GA 5DOHA 2NXTA 5FDCA 3DC9A 3SBIA 4Q49A 4WL4A 1CAOA 4JSZA 3QYKA 3S72B 4M2VA 3Q31A 1DMXA 1YDBA 4Q6DA 4R5AA 1IF5A 4JS6A 1XQ0A 1CNYA 1CVBA 1UGCA 2EU2A 4LP6A 5EKJA 1TE3X 1TG3A 1Z97A 1G3ZA 4Q99A 3RYJB 4Q8XA 1CALA 3KOKA 5FDIA 2Q38A 3RYYA 2FNNA 4HU1A 2VVAX 4KV0A 3DVCA 4FIKA 3RZ5A 4K1QA 3HKTA 4BF1A 4Q8ZA 1LG6A 4XIWA 1YDDA 3S8XA 5EOIA 5JGTB 1BICA 4FU5A 1ZGEA 1G0EA 1FR4A 4E4AA 5E2SA 3ZNCA 4CNRA 1BNTA 1BN4A 4Q7WA 1BN3A 4YYTA 2NNVA 3TMJA 2AX2A 4RUXA 4N16A 1BNNA 1CAJA 5SZ3A 5E5RA 2CA2A 3ML5A 1KOPA 2NXSA 4HEYA 4JSAA 4YXIA 3KKXA 4LU3A 4L5UA 4CNVA 5FNMA 5E28A 2FNKA 3DD0A 3KWAA 3F7BA 3M1KA 3MNKA 5JDVB 3MNUA 2GD8A 4KP5A 3SBHA 3P5AA 2FOYA 4QJ0A 5AMDA 5DSOA 5SZ5A 4YHAA 4E5QA 5FNHA 4Q09A 1CVEA 4QJOA 3B1BA 2FNMA 3OKVA 3M2NA 5FNIA 3S77B 4Q83A 5E2NA 4K0ZA 1RAYA 1BNUA 1CAHA 2FMGA 1OKMA 3M1WA 3MYQA 4JSSA 3K7KA 1CAYA 3S76A 3R17B 4Z1NA 8CA2A 1ZFKA 4WW8A 1CIMA 3DA2A 4Q8YA 3UYQA 1G4OA 3RZ1B 3KIGA 3MHMA 4QY3A 2NWYA 2OSMA 5FL4A 3KLDB 3M40A 5BRVA 1G1DA 1YO1A 5FLRA 4RUZA 4QEFA 4CQ0A 5JEHB 4R5BA 3KONA 3R16A 1YO2A 4MDGA 4YWPA 2QOAA 2NNGA 1RAZA 3OILA 4RH2A 2NNSA 3PO6A 2HD6A 2EU3A 3M2XA 1A42A 4XFWA 3DAZA 4FL7A 5FLQA 3ML2A 3W6IA 1I9PA 2FOUA 2X7UA 4HEZA 1FQRA 1TEUX 4YGJA 4COQA 4K13A 5FNKA 1CILA 1I9MA 2F14A 4KUWA 3FFPX 4ILXA 4XZ5A 4Q7VA 3FE4A 3IBNA 3IEOA 4QJMA 4UOVA 1H9NA 4TWLA 1LZVA 4MLTA 3C7PA 4M2WA 3T84A 2WD2A 3S73B 3OY0A 3M1QA 3T5ZA 3K34A 4YGKA 1ZFQA 1CRAA 4MTYA 3TVOX 5SZ7A 4QIYA 5EHWA 1KWRA 2ZNCA 1G54A 4XIXA 4HT0A 4E3HA 1DCBA 4GL1X 4RFCA 5EH5A 3ZP9A 5C8IA 3CZVA 4MLXA 1I90A 5SZ4A 4YVYA 2IT4A 1CAKA 1IF7A 3V3HB 1BNVA 3MHLA 4FVOA 4MDLA 5EHEA 1ZH9A 1CVCA 4KNMA 1HCBA 4WW6A 2GEHA 1HVAA 3MDZA 5JG5B 3BL1A 2HFWA 1UGGA 1CNGA 1RZDA 3D8WA 3N3JA 3P3HA 1G0FA 3M67A 1BN1A 5DSLA 2O4ZA 4JSWA 1OQ5A 1OKNA 4C3TA 3IBLA 3MHIA 4ZWIA 4Q06A 3F4XA 4XE1A 1RZBA 3MNJA 1EOUA 1Z93A 5EIJA 5G0CA 4Z1KA 1ZSAA 4PYYA 4Q87A 5FLOA 4ZX1A 4FVNA 2HL4A 3N4BA 3S75B 4ZWYA 2CBDA 2CBCA 2HKKA 3V2JA 4KNIA 4Z1EA 1UGAA 4YXUA 5JQ0A 3W6HA 2FW4A 1TG9A 12CAA 1HECA 4WUQA 1CZMA 3BETA 1FLJA 1LGDA 1V9IC 3M1JA 1OKLA 1HCAA 5EHVA 3DBUA 1G4JA 1IF8A 1ZE8A 2WEGA 4MO8A 1CNHA 5FLSA 3S78B 5E2KA 3NI5A 1I9LA 1F2WA 1YDAA 3U45X 3V3FA 4E3FA 7CA2A 3S97A 2H4NA 5HPJA 3CAJA 4Q07A 2VVBX 1CCSA 4LHIA 1H4NA 1XEVA 4CNXA 4YGLA 3V7XA 3IAIA 5FNJA 1JCZA 1J9WA 2NWPA 4ZWXA 2POVA 1BV3A 2WEOA 5FNLA 2WEJA 4Y0JA 3VBDA 5FL5A 5CACA 3OYQA 4ZWZA 1FR7A 4QJWA 4ZAOA 4Q9YA 3LXEA 4Q78A 4DZ9A 5FLTA 4IWZA 1ZNCA 4QK1A 1AVNA 3M3XA 4QSJA 5AMLA 2NN1A 3HKNA 4L5WA 5CJFA 3OIMA 5E2RA 4K0TA 4ETQC 2AW1A 1I8ZA 4CNWA 1G6VA 1RJ6A 5IPZA 1CCUA 4G0CA 4X5SA 1DCAA 2POWA 2HOCA 3DVDA 4QSAA 1FSQA 1KWQA 4Q0LA 5E2MA 2NWZA 3RYVB 1ZGFA 5SZ0A 4QJXA 3P3JA 1CVFA 1CRMA 3F7UA 1CVAA 1TBTX 3OIKA 2NMXA 4RUYA 5G03A 5JESB 2FMZA 1RJ5A 4HF3A 4HT2A 5FL6A 4PXXA 4MDMA 4ITPA 3T5UA 3HLJA 4FPTA 4R59A 1UGDA 3KS3A 1BNQA 4CA2A 5BRWA 4KAPA 1I91A 3CA2A 1G53A 3L14A 1BNMA 2HNCA 1MUAA 2NNOA 1AZMA 4FRCA 3V3JA 3NJ9A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3M5S A;  5DSI A;  3MNI A;  1BCD A;  1G52 A;  3KNE A;  4RIU A;  5DSR A;  4K0S A;  1DMY A;  5E5U A;  5G01 A;  3T82 A;  1UGE A;  1Y7W A;  3K2F A;  4Q90 A;  2OSF A;  2QP6 A;  4Q6E A;  4KP8 A;  3D9Z A;  3RYX B;  2CBA A;  5JEG B;  2NWO A;  1BZM A;  3RZ8 A;  1RZC A;  1URT A;  1YO0 A;  1FQM A;  3BL0 A;  4BF6 A;  3DCS A;  5DSN A;  4YXO A;  1ZSB A;  1CNW A;  1TH9 A;  4KNN A;  5EKM A;  1H9Q A;  3OKU A;  3FW3 A;  3P5L A;  4CAC A;  3CYU A;  3S9T A;  3RZ0 B;  3TVN X;  4L5V A;  2X7T A;  4QJP A;  5A25 A;  5EZT X;  4E49 A;  4QK3 A;  4Q81 A;  9CA2 A;  1I9O A;  1YDC A;  1XEG A;  1MOO A;  5L3O A;  1HED A;  1TEQ X;  3M2Y A;  4Z0Q A;  4Q7S A;  5A6H A;  1FSR A;  3P58 A;  3RGE A;  3HS4 A;  3RYZ A;  5EH8 A;  1G45 A;  4M2U A;  5DSP A;  5DSM A;  4QK2 A;  1I9N A;  1FQL A;  4KUY A;  5CLU A;  4RN4 A;  4ZX0 A;  1UGB A;  3M5T A;  4YX4 A;  3MHC A;  1RZE A;  3MNA A;  2EZ7 A;  4G7A A;  1CAM A;  3IBU A;  4IDR X;  4DZ7 A;  1IF4 A;  3MZC A;  3F8E A;  1IF9 A;  3OYS A;  3DCC A;  1CAN A;  1CAZ A;  1JV0 A;  3D92 A;  2NXR A;  4QSB A; 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