4E4AA

Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
Total Genus 75
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
75
Knots found
sequence length
257
structure length
257
Chain Sequence
HWGYGKHNGPEHWHKDFPIAKGERQSPVDIDTHTAKYDPSLKPLSVSYDQATSLRILNNGHAFNVEFDDSQDKAVLKGGPLDGTYRLIQFHFHWGSLDGQGSEHTVDKKKYAAELHLVHWNTKYGDFGKAVQQPDGLAVLGIFLKVGSAKPGLQKVVDVLDSIKTKGKSADFTNFDPRGLLPESLDYWTYPGSLTTPPLLECVTWIVLKEPISVSSEQVLKFRKLNFNGEGEPEELMVDNWRPAQPLKNRQIKASFK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Lyase/lyase inhibitor
molecule keywords Carbonic anhydrase 2
publication title Nucleophile recognition as an alternative inhibition mode for benzoic acid based carbonic anhydrase inhibitors
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 75
structure length 257
sequence length 257
other databases KnotProt 2.0: K +31
ec nomenclature ec 4.2.1.1: Carbonic anhydrase.
pdb deposition date 2012-03-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00194 Carb_anhydrase Eukaryotic-type carbonic anhydrase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.10.200.10 Alpha Beta Roll Carbonic Anhydrase II Alpha carbonic anhydrase 4e4aA00
4RUZA 3PJJA 4YX4A 4YXIA 4WW6A 4Q87A 3HKQA 5JEPB 3V7XA 5FDCA 3K7KA 3SBIA 1YO1A 3IBIA 5DOHA 4RFCA 3FW3A 5FLQA 3DVCA 1I9PA 4Z1NA 1FQRA 1I9MA 4MDGA 5EHWA 3S8XA 1CVCA 1G52A 3M1JA 3CA2A 5FLRA 4MDLA 5SZ4A 4HU1A 4QJOA 3ML2A 3DV7A 3IBNA 2AX2A 9CA2A 4YYTA 4DZ9A 3M2ZA 1DCAA 2ZNCA 1DCBA 5JQTA 1HCBA 4YVYA 3N3JA 5SZ7A 1CRMA 1G4OA 3S77B 5EKJA 2EU3A 4KUWA 1V9EA 1BNMA 1FSRA 4CNWA 3BL1A 1TEQX 3MHCA 4Z0QA 1G3ZA 1MUAA 3BETA 3VBDA 3JXFA 3MNIA 1H9QA 3MNUA 4QK3A 1BNUA 3CYUA 5CJFA 2GD8A 5SZ0A 2FMGA 4JSSA 2POWA 5A25A 1CAYA 4KV0A 3IEOA 1I91A 1A42A 4Q81A 2NN1A 3D93A 4CNVA 1ZSAA 1H4NA 4M2UA 5DSNA 1BN1A 1ZGFA 3V3IB 3T82A 3GZ0A 5E2RA 4LU3A 3K2FA 1BNTA 4Y0JA 5AMLA 2NWZA 1CA2A 4YHAA 5JQ0A 3V2JA 5DSKA 1CNJA 1BNVA 4YGFA 3IAIA 4Q09A 3K34A 1AM6A 2WEHA 1CAIA 3DC3A 1TE3X 3M04A 2FNNA 2POVA 1H9NA 1IF9A 3R17B 5FDIA 4E49A 4YGLA 5IPZA 4Q06A 1CNXA 4PQ7A 3S73B 3RG4A 3MNAA 1CAOA 3RYYA 4BF1A 1BZMA 1BN3A 1CILA 4LP6A 3S76A 4COQA 12CAA 3KS3A 1HEDA 1CA3A 5E2KA 4ZAOA 3KNEA 3SAXA 1CAKA 3T84A 4CNXA 4E3FA 1BN4A 3P55A 3KKXA 4QIZA 1DMYA 3HLJA 2HD6A 1CCUA 4Q99A 4TWMA 2H15A 2F14A 2NXRA 4N0XB 3OKUA 1IF4A 2CBAA 4Q8XA 5EKMA 1CAMA 3RLDA 3MHMA 3V2MA 4RH2A 3HS4A 3DBUA 5E5RA 4HEYA 1CRAA 4KUVA 1CVFA 3JXGA 4HT0A 1V9IC 5JEGB 4PYYA 3V3FA 3M96A 2FOYA 5SZ1A 3RZ0B 1TEUX 1AVNA 1YDCA 3MNKA 4QK1A 2HOCA 4FPTA 2CBDA 1RZCA 1FR7A 4ZWIA 4Q49A 2X7UA 2ABEA 4XIXA 1MOOA 5C8IA 1CINA 1I8ZA 3SBHA 5E5UA 3S72B 3C7PA 1CNYA 3DCSA 4FIKA 4IDRX 4QSBA 1CVAA 2WEGA 3RYJB 3KIGA 1HUGA 1KWRA 4Q6DA 5BRVA 4ZWXA 1G0FA 1IF7A 3OIMA 3QYKA 5FLTA 1G48A 4HT2A 3IGPA 3RG3A 2WD2A 1DMXA 4FVNA 4X5SA 2WD3A 1KWQA 4MTYA 5DSLA 5FLSA 3T5UA 4BCWA 1RJ6A 3P3JA 3W6IA 1BNWA 3M14A 1ZE8A 1IF8A 5L3OA 1IF6A 4HEWA 4PYXA 4JS6A 1CCSA 5G01A 1ZSBA 3B4FA 1F2WA 1BNQA 3P58A 2QP6A 3Q31A 1ZFKA 1FR4A 1UGFA 3D0NA 2NNOA 3N2PA 2Q1BA 3R16A 4MDMA 4Q8YA 2FW4A 2OSFA 3OKVA 3V3GB 5DVXA 1UGCA 1KOPA 5L6KA 4ITOA 3F8EA 3MHOA 4IWZA 4YXUA 3DVBA 6CA2A 1LG6A 1ZSCA 4RUYA 5G0CA 4ZX0A 5JEHB 3DA2A 4FL7A 1Z97A 5FNMA 3BL0A 3MWOA 1JD0A 3M2XA 4M2WA 1URTA 3RYXB 5DSQA 5E2NA 4WL4A 2FMZA 3RYVB 3F7BA 4QSIA 4YXOA 2CA2A 4C3TA 5DSJA 4E9OX 5FNLA 5JG5B 4K13A 3B1BA 4E4AA 4QSJA 3P3HA 4QJXA 3IBUA 1OKMA 4Q7PA 1G6VA 3S71B 4RFDA 4PZHA 4JSWA 3NI5A 5SZ2A 3T83A 4QSAA 3OILA 2ILIA 4Z1EA 1T9NA 1ZH9A 3TVOX 1EOUA 2CBEA 3RJ7A 4QIYA 1CIMA 4QJWA 3DC9A 3S97A 4DZ7A 3M2NA 4BF6A 3MHIA 2NMXA 1G53A 3D92A 4Z1JA 3S75B 1FSNA 4XZ5A 4E5QA 2QO8A 1CNWA 3DD8A 3EFIA 5CACA 4Q83A 1FQMA 2FOQA 1OQ5A 1CAJA 3NJ9A 2NXTA 4L5VA 1THKA 2NNSA 1RZDA 5AMGA 2O4ZA 4L5UA 1G46A 4GL1X 3PYKA 1OKLA 4Q90A 5EH5A 5E28A 1UGGA 1HECA 1J9WA 2NWYA 1ZGEA 4Q78A 2H4NA 2WEJA 4LHIA 1LZVA 2HL4A 3DCCA 5EOIA 3U7CA 1Z93A 3FFPX 5DSMA 3DD0A 4KAPA 1JCZA 1TTMA 4ZX1A 4RIUA 2NWPA 4YGKA 3N0NA 3OIKA 4HBAA 1HEBA 4WW8A 4Q9YA 3S9TA 5DSRA 3FE4A 1XEVA 3ML5A 4UOVA 3MNJA 1TH9A 3HKTA 2HKKA 1G0EA 5BYIA 4YWPA 1HEAA 4Q6EA 4ETQC 3M98A 3M67A 4ZWYA 3DAZA 1TBTX 1KEQA 1G1DA 3M5EA 2NXSA 3ZNCA 2CBBA 5DOGA 3F7UA 3UYQA 1HVAA 4ITPA 3OYQA 3V5GA 1YDBA 3DVDA 1RAZA 4XE1A 1RZBA 2HNCA 1CZMA 3P44A 7CA2A 5J8ZA 3W6HA 4HEZA 3S74B 4R5BA 1ZNCA 4HF3A 4Q7WA 3V3HB 5AMDA 5JESB 3RZ1B 4R59A 2CABA 3EFTA 3M1QA 1I9LA 4CACA 4ILXA 1HCAA 3U47A 5E2MA 5G0BA 1HUHA 3MMFA 5CA2A 1LUGA 4Q07A 1CNGA 3N4BA 3RZ7A 4KP8A 3OYSA 4RN4A 4KNJA 1CNBA 2NNGA 3KONA 1CVHA 5EHVA 1UGEA 4QY3A 1FSQA 1G45A 3MHLA 3ZP9A 3S78B 3HKNA 4N16A 5EZTX 4ZWZA 4KUYA 3CAJA 4XFWA 4KNMA 1YO0A 2NN7A 1CAZA 2GEHA 2X7SA 2Q38A 4Q7VA 4QJPA 2NNVA 3MDZA 1CANA 5EH7A 3HKUA 1CNIA 4R5AA 4CNRA 4G7AA 3M5TA 1CVEA 5FL6A 2FOVA 1TG9A 3CZVA 3LXEA 4Q7SA 3DCWA 4L5WA 3SAPA 3U45X 3U3AX 3M1WA 5JG3B 3KOKA 3M5SA 1CCTA 2AW1A 5A6HA 3V3JA 1I9OA 1RZEA 4JSZA 1CNHA 1I9NA 3M2YA 5SZ3A 5SZ5A 1UGDA 1CALA 1RJ5A 1TB0X 4PXXA 1Z9YA 4QTLA 5CLUA 1RAYA 2EU2A 4MO8A 5FL4A 1IF5A 4MLTA 1BNNA 2Q1QA 1RZAA 2HFWA 2WEOA 4QJ0A 3TMJA 3P4VA 5BRWA 3HFPA 5DSPA 3KWAA 5FNIA 3RZ8A 3RGEA 3D8WA 3KLDB 1G54A 4KP5A 4FU5A 3P5AA 2FOSA 4YGJA 1YDDA 5EKHA 4YGNA 3TVNX 3OY0A 2VVBX 3RZ5A 2FNMA 3M40A 4QK2A 5FNGA 1FLJA 1JV0A 1YDAA 2CBCA 2POUA 3PO6A 5EH8A 3MZCA 1UGAA 3M1KA 3P5LA 4QJMA 4KNIA 5FL5A 1CVDA 5HPJA 4CQ0A 3L14A 1Y7WA 3T85A 1G4JA 4K1QA 5EIJA 4MLXA 1ZFQA 5DSOA 2QOAA 8CA2A 4RIVA 4RUXA 1XPZA 2X7TA 4FVOA 4JSAA 1BICA 3T5ZA 2VVAX 1CNKA 4K0TA 4M2RA 1AZMA 4WUPA 5LMDA 1LG5A 5SZ6A 4CA2A 5FNKA 4Z1KA 5JGSB 5FNJA 4WUQA 5FNHA 3KOIA 5FLOA 5FLPA 1I9QA 4QEFA 4G0CA 4XIWA 3RYZA 1BV3A 5JGTB 4E3GA 1CNCA 4FRCA 2OSMA 5EHEA 3UYNA 4M2VA 1LGDA 1OKNA 4E3HA 2FNKA 1CAHA 2FOUA 5G03A 5E2SA 2IT4A 4Q08A 3MYQA 1CVBA 4K0SA 5JDVB 3M3XA 4Q8ZA 5DRSA 3F4XA 1FQNA 1TG3A 2EZ7A 4TWLA 1XQ0A 3IBLA 4E3DA 1YO2A 2NWOA 5BNLA 1XEGA 4WR7A 4Q0LA 1KOQA 3D9ZA 1BCDA 5BRUA 4K0ZA 2W2JA 1I90A 3MNHA 4KNNA 3NB5A 3JXHC 5DSIA 1FQLA 1UGBA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4RUZ A;  3PJJ A;  4YX4 A;  4YXI A;  4WW6 A;  4Q87 A;  3HKQ A;  5JEP B;  3V7X A;  5FDC A;  3K7K A;  3SBI A;  1YO1 A;  3IBI A;  5DOH A;  4RFC A;  3FW3 A;  5FLQ A;  3DVC A;  1I9P A;  4Z1N A;  1FQR A;  1I9M A;  4MDG A;  5EHW A;  3S8X A;  1CVC A;  1G52 A;  3M1J A;  3CA2 A;  5FLR A;  4MDL A;  5SZ4 A;  4HU1 A;  4QJO A;  3ML2 A;  3DV7 A;  3IBN A;  2AX2 A;  9CA2 A;  4YYT A;  4DZ9 A;  3M2Z A;  1DCA A;  2ZNC A;  1DCB A;  5JQT A;  1HCB A;  4YVY A;  3N3J A;  5SZ7 A;  1CRM A;  1G4O A;  3S77 B;  5EKJ A;  2EU3 A;  4KUW A;  1V9E A;  1BNM A;  1FSR A;  4CNW A;  3BL1 A;  1TEQ X;  3MHC A;  4Z0Q A;  1G3Z A;  1MUA A;  3BET A;  3VBD A;  3JXF A;  3MNI A;  1H9Q A;  3MNU A;  4QK3 A;  1BNU A;  3CYU A;  5CJF A;  2GD8 A;  5SZ0 A;  2FMG A;  4JSS A;  2POW A;  5A25 A;  1CAY A;  4KV0 A;  3IEO A;  1I91 A;  1A42 A;  4Q81 A;  2NN1 A;  3D93 A;  4CNV A;  1ZSA A;  1H4N A;  4M2U A;  5DSN A;  1BN1 A;  1ZGF A;  3V3I B;  3T82 A;  3GZ0 A;  5E2R A;  4LU3 A;  3K2F A;  1BNT A;  4Y0J A;  5AML A;  2NWZ A;  1CA2 A;  4YHA A;  5JQ0 A;  3V2J A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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