4EAHD

Crystal structure of the formin homology 2 domain of fmnl3 bound to actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
368
structure length
356
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title FMNL3 FH2-actin structure gives insight into formin-mediated actin nucleation and elongation.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Protein binding
total genus 104
structure length 356
sequence length 368
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4eahD03
3VEVA 4BRGA 5BPMA 2D4WA 2P9LB 4BRCA 3CJ9A 3WQTA 2DPNA 4H03B 1GLDG 3VGLA 3IMXA 4HWIA 3IFRA 4WQ4A 2PBDA 3GBTA 4B1XB 4A61A 2ZWHA 4CZMA 1QZ5A 5JMVA 2KHOA 2Q36A 1ZC6A 2AA4A 1XC3A 3VEWA 4IJNA 3IUCA 3VGMA 2QWRA 1C0FA 5BR9A 3KHYA 3FZFA 5AQHA 3EKSA 1MWMA 4O5FA 2V51B 3UKRB 4DCHA 2A3ZA 1Y64A 3DXMA 4A62A 1QQMA 1GLBG 4BC5A 3SLCA 1JCEA 3W3DA 2P9KB 1R59O 4EIAA 2E2QA 2BTFA 1SAZA 4BC2A 4B1YB 1HPMA 4MO4A 4PKIA 3VETA 5AFUH 4CBXA 4FOEA 5AQMA 4CZFA 4EAHD 1NGAA 4CD1A 1U2VA 5AQOA 5BPLA 3TU5A 1T6CA 3DAWA 1BO5O 3H6EA 2FSKA 3JS6A 4FWOA 5AQXA 2Q31A 5LY3A 1GLAG 3CERA 1NWKA 3R9PA 2QXLA 3OHRA 2P9IA 3GE1A 1TYQA 1T6DA 1NGGA 4FWNA 5AQQA 1RDWX 2E2OA 2VCPA 1ATRA 4JHDB 2YJEA 4BR7A 1NBWA 2A5XA 4BQZA 5BN9A 2P9SB 3G25A 3CJBA 3EL2A 4BG9A 4FWPA 4BRQA 5BN8A 3CJCA 4MLHA 3CI5A 3CJ7A 5JLFA 4JD2A 2CGJA 2E2NA 3A5NC 5AFUA 1NGCA 2BUPA 4FO0A 5AQYA 4ISFA 4BRLA 1X3NA 2YHYA 4CZIA 3MDQA 2QWMA 2W40A 2FXUA 3O4WA 1BU6O 5AZJB 2P9UA 1KAYA 3H1VX 1OKJA 4M7YA 2Q0UA 5EY4A 3BP8A 2IVPA 3AAQA 5EOYA 3GDQA 3CHWA 4XH5A 2FSNA 3D2EA 4YDUC 1GLEG 4MO5A 3A5MC 1QHAA 5AQGA 2A42A 3MN7A 1NLVA 3GOIA 4FWRA 1QZ6A 3EO3A 3O08A 1BUPA 4BRKA 1SZ2A 3QBWA 4I6MA 3LM2A 2YJFA 4NB4A 2Q97A 3WUHA 2E1ZA 3WXKA 2A41A 4AM6A 1ESVA 3SMSA 3D7EO 5AQZA 3VF2A 1BWFO 3W0LA 3DXMB 2CGKA 3HZ6A 2VYPA 3ID8A 1T44A 5KPZA 2CGLA 5LJWA 2GTDA 2H3GX 4BVPA 5AZIA 3ENOA 2VWBA 3EZWA 1TUUA 5ELZA 3R6MA 3I33A 4QS8A 4PL8A 5EVZA 3BEXA 3H3OB 4BRPA 4WQ4C 4J8FA 2E2PA 5FPEA 4H0OA 2I7NA 1NGHA 3VEZA 4DB3A 4RWTA 3UKUB 5FPDA 1V4SA 2P9IB 2YI1A 3BUZB 1CZAN 4H0YB 4F9OA 1DGKN 3VF4A 1KAXA 1YAGA 2ZF5O 3CIPA 3U4LA 1K8KA 3JXUA 1HKBA 3O6WA 3A0IX 2WUSA 4BR4A 3MN9A 4BGBA 5JLHA 5KQDA 1J6ZA 4HTLA 3VPZA 3BF3A 3QICA 3CJ1A 3SMPA 3RSEA 3UB5A 2D1KA 3O5BA 3WEEB 4CBUA 1LOTB 1NGFA 1SQKA 4L3QA 3CETA 1RGIA 3AARA 3HBTA 1DEJA 3UE5A 4H5NA 3M1FA 2Q0RA 3ATUA 4PKHA 3GG4A 5E26A 5KPRA 1BOTO 4H0VB 1G99A 5F0XA 4H5TA 3MN6A 3QDKA 4JN4A 2GWKA 3EKUA 3WXIA 4Z94A 2YHXA 3F9MA 3L0QA 3DJCA 2A6AA 3A8YA 5AQSA 2IIRA 3WT0A 5LJVA 1HUXA 1NM1A 3FZKA 3FZLA 3MK6A 2UYTA 5KPTA 3H46O 3LDLA 2E8AA 3D2FA 1KAZA 1IJJA 4M7XA 4K43A 4RCHA 3I8BA 1V4TA 4FWQA 1YVNA 4H0XB 3EN9A 2GWJA 2NLXA 1BG3A 3ZEUA 4CJ7A 2P9KA 1P8ZA 2P9PB 3SJHA 4CBWA 3ULEB 4GNIA 3C0BA 4WYBA 4RTFD 1HKGA 3CJAA 5AQLA 5E84A 2D0PA 1U6ZA 3FR0A 4B1WB 2E88A 1ATSA 5I9EB 5AQWA 4CZHA 3B8AX 3CQYA 3LDNA 3DWLA 2FF6A 3VF6A 3VEXA 1BA0A 2HMPA 1MA9B 2GUPA 1D4XA 3O1WA 2V52B 1WUAA 4BRNA 4JHDA 4B1VA 1S22A 1X9JA 1NGBA 3L6QA 3LM9A 5CE3A 4A2AA 3MMVA 1Z6RA 3WQUA 3BF1A 2QWNA 2QWLA 5AQFA 3ENHA 2HOEA 2F9TA 2YCHA 5JICA 4JAXA 3ZETA 4FOIA 3FFKB 1YUWA 4B1ZA 5AQIA 3RSEB 3ZX2A 1XQSC 3O80A 5AQKA 3LDOA 3M3ZA 2CH6A 4BREA 2ZGZA 3LL3A 1U2VB 2ASOA 3U9ZA 5BRDA 1ATNA 4XH4A 4K41A 5AZJA 4M63C 2J4RA 4DQ8A 4E1JA 3FZMA 4IWVA 2ZGYA 3FZHA 5FPMA 5AQJA 5FPNA 1TYQB 2F9WA 3HM8A 4PKGA 4FPAA 4BRIA 1NGJA 4A2BA 2FLOA 2I7PA 1HLUA 1Q18A 2FF3B 4FSVA 3H3NO 2GELA 3LDQA 1GLFO 5AR0A 4BROA 4BR9A 4B1UB 1BDGA 2ASMA 5BRFA 1TUYA 1HX1A 1MDUB 2NRHA 4FWKA 4BGAA 3AY9A 5AQNA 3P4IA 2QW9A 3QFUA 4BVOA 2PAVA 1KXPA 4H0TB 1QQOA 4ISEA 3A5LC 4JD2B 4WQ5C 4CZJA 4FWSA 4O8KA 5ADXH 2V7ZA 3H1QA 4WQ5A 4IZ9A 1E4FT 3D2FB 4CZKA 2NZTA 3U9DA 3FGUA 3ATVA 2ASPA 2P9NA 2IVOA 3ZX3A 2QM1A 3HSCA 1XUPO 4JNEA 3DXKA 4IJAA 4AM7A 1YXQA 4BC3A 4H5WA 4DHYA 3L4IA 3ZEUB 1NGDA 2P9UB 1JCFA 1LCUA 2QWQA 4MLEA 3C7NA 1RFQA 4PL7A 2V7YA 4H5VA 3AAPA 1ZXOA 2P9LA 3VEOA 3HTVA 3TPQA 1EQYA 5AQPA 4ISGA 3KZBA 4BRAA 2YHWA 5B8HA 5F2RA 1WOQA 3D2EB 4C23A 3QB0A 1DKGD 1IG8A 3CQXA 2E1YA 3UKUA 4FWLA 2CH5A 5ADXA 1HJOA 2E20A 2OANA 3HI0A 5AQTA 3LDPA 4I6MB 5AQVA 1GLLO 3VOVA 3WXJA 3QFPA 4BRDA 3S41A 3FE1A 4FL9A 5F1XA 3UKRA 3VERA 4LC9B 2HF4A 2Q1NA 3J8AA 4BRHA 3SK3A 4CZEA 3QMLA 5AQUA 5BREA 3QBXA 4BR0A 4CD3A 4H0PA 3ZETB 4EHUA 2D0OA 2AP1A 1GLCG 1Z05A 3WEEA 5AZIB 1H1VA 4K25A 2Q2RA 4BG8A 4BQLA 5AQRA 1HKCA 5KQ8A 4BR5A 2EWSA 2QWPA 4GY2B 3MCPA 4B9QA 1NGEA 4NO7A 3U8XA 3VGKA 2GEMA 4CI6A 2A40A 2FSJA 3O8MA 2IVNA 1ZBSA 3MN5A 4BRMA 3IDHA 4EFHA 1MWKA 1BA1A 2P9SA 2QWOA 1K8KB 4CZGA 4QS7A 4EHTA 4IXCA 3M6GA 4FWMA 3R8EA 3VENA 4CZLA 4YDUA 2ITMA 3VEYA 2HF3A 3FLCO 4FPBA 4XEIA 4BR2A 5BPNA 4XH1A 4KBOA 1X3MA 1NGIA 3GL1A 2P9NB 3WXLA 4BC4A 1S3XA 1GLJO 5TKYA 3DXKB 5BRHA 2P9PA 3ULEA 5EX5A 4H5RA 3ZX0A 1QQNA 3A5OC 4IO8A 1C0GA 4QS9A 4BRFA 3O1BA 4K42A 5EXWA 3C7NB 1JCGA 3KVGA 1NMDA 3VESA 1E4GT 3H45C 4Y0WA 2W41A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3VEVA 4YOYA 3MWTA 3K58A 3CMAN 1KCFA 5HRRA 2PY5A 2IC3A 3CPEA 1GLDG 3TSQA 1FJGK 2QA4N 4WQ4A 3H08A 3ASMA 1U49A 3HK2A 2ZWHA 4CZMA 2HHIA 3OYMA 3CCEN 2KHOA 1S72N 1ZC6A 2AA4A 2NRZA 2QXFA 3IUCA 4W5OA 4CEOA 5BR9A 5HP1A 1RDCA 5AQHA 3C6AA 3EKSA 4B9NA 1LWCA 3LZIA 1GLBG 3IG1A 2YV0X 2P9KB 1OVYA 1R59O 3T1HK 3PSFA 2HHSA 3HYFA 4N47A 2BE2A 4KH4A 1JKHA 3L2WA 1SAZA 1Q86O 4MO4A 3VETA 4FOEA 4CD1A 5AQOA 3O3HA 3TU5A 4KRFA 5CHIA 5AQXA 2VGMA 1HNWK 1FXXA 1VQ7N 3TSUA 3J7ZO 1GLAG 1KLMA 4CFDA 1O1WA 4W5QA 3TTCA 3GE1A 4BE2A 1NGGA 4FWNA 1XI1A 1K6YA 2YX6A 2WTUA 4CEBA 4JK9A 3ZSQA 2VWKA 4NCGA 3CJBA 3EL2A 1T7PA 4MLHA 4FJXA 4JD2A 3A5NC 5AFUA 3SUNA 1OH8A 2BUPA 4JI1K 4FO0A 4XIUA 4DV6K 4CHNA 3HRGA 4O4GA 4CJLA 3ZT4A 1NKCA 1B9FA 1BU6O 1QVGM 3OTOK 1KAYA 3OBYA 3RMAA 1WLJA 1OKJA 2KZMA 4BE7B 4CW7B 4KI6A 3BP8A 3V1QA 4C1NI 3KKRA 3VQDA 5EOYA 4Z4IA 1RDDA 3P5JA 3O9TA 1WNSA 1S1XA 3O4NA 4BECA 4GKKK 3PIOL 1GOAA 4E7IA 2X6SA 4HVJA 1RILA 2Q97A 3K2PA 2D0CA 4X66K 5J2PA 1LWEA 2A41A 1ESVA 4DTOA 1K73O 4IO9L 1HQEA 2HHWA 3DXMB 1CXUA 4DSKA 4EP5A 2CGKA 3C6HA 3HPOA 1SV5A 3THXA 1T44A 3KWGA 4BVPA 5M1QA 1VSFA 5ELZA 3OYGA 5EVZA 3BEXA 4BRPA 1TVRA 4BDZA 2HNZA 3AVJA 3CC4N 2E2PA 3C6UA 3P83D 1ZYQA 5SWMA 1NGHA 1V4SA 2YI1A 4JI7K 3MEGA 1TKDA 3VF4A 3CIPA 3O6WA 3DLBA 3MX5A 3L2VA 4GV3A 4BGBA 5J2NA 1QTMA 2XHBA 1R0AA 1TK5A 3QICA 3VQ5A 3RSEA 1JLGA 1XHXA 4CJEA 4L3QA 1WSHA 1NK0A 4GV9A 4CE9A 3S3MA 4EZ9A 4H5NA 2Q0RA 2D5RA 4CESA 3I56N 3SAHA 2G8VA 4B9MA 3KD5E 3QDKA 2GWKA 3ZT0A 4CEQA 4FM2A 4L8RB 3DJCA 1XMOK 4JKFA 1XNQK 3FZLA 4JS4A 3NF9A 3QO9A 3TAFA 2UYTA 4LSLA 4PUOA 1HNZK 3O9QA 5GAEP 2O8EA 3LDLA 1C6VA 4CERA 4KH5A 3CPWM 2KLAA 3NHGA 1V4TA 1S1TA 4W5NA 1YTAA 5JENA 4H4MA 4FXDA 2HHVA 2FBTA 4PQUA 3V81A 5K14A 3C0BA 4ZHRA 2VG5A 3VQ6A 3CJAA 1IBMK 5AQLA 2ZJPL 5E84A 2D0PA 3HP6A 4BWMA 3KK7A 5E41A 1M90O 3NF8A 5C42A 4JKCA 1X9MA 4BDPA 4NCAA 4CZHA 1RT3A 4YOWA 4JKGA 4RW4A 4IOAL 4FJ5A 3THYB 2BH1A 4KI4A 1OH7A 4W5RA 3J81O 3ZYYX 3J7AP 1NGBA 3LM9A 4CIGA 5CE3A 3T69A 4Q5VA 4B9LA 5AQFA 4BE1A 1QS4A 4FOIA 5IT9O 1YUWA 4OPKA 1W0HA 3VQPA 4DFKA 3ZX2A 3I0SA 1RDBA 2B5JA 4AHTA 3LL3A 3VA0A 4NXNK 2ZQBA 3U9ZA 4UQGA 4K41A 5AZJA 4DQ8A 1WB9A 3CG7A 4IWVA 2ZGYA 4ICLA 3HM8A 1KQSM 4NXMK 4A2BA 3CCQN 2FF3B 1LWFA 4Z4EA 4Y1CA 3L3VA 1Q9XA 1ZBFA 1VQPN 1FKPA 1HRHA 4JKEA 4BR9A 3QERA 5BRFA 1TUYA 1VQ9N 4KAZA 2NRHA 1FK9A 2KKZA 4BGAA 3S3NA 1P90A 1VQNN 4JI4K 4CJVA 4FCYA 3SV4A 1QQOA 4JD2B 1Y97A 1VSIA 4FWSA 4CZJA 2V7ZA 3H1QA 3FGUA 2ASPA 2P9NA 1N5YA 4DV3K 3ZSRA 1IH7A 3ULDA 1BISA 3DXKA 4DFJA 4IJAA 1HR0K 3TR8A 1HNVA 4HUGA 3P38A 4J2EA 3LZJA 2A1RA 2HHXA 3AAPA 1ZXOA 4LFBK 4DR1K 2RHKA 3HTVA 3TPQA 4LH5A 3HO1A 3KZBA 1W9HA 2YHWA 4JKAA 4C23A 2OPSA 5I3UA 4DTMA 1ZBLA 1IG8A 3O4QA 5ADXA 4FWLA 2OANA 3AVAA 3TAGA 3DRRA 3VOVA 1RT4A 4AH9A 3JSMA 4NLCA 1NK9A 3SI6A 4CHYA 3CYGA 2PYJA 2HF4A 2HNDA 4BRHA 4CZEA 5AQUA 3V1RA 1SL1A 4BR0A 3LANA 1QSLA 3THXB 2X6NA 3ZT3A 4YNQA 4EHUA 1ASWA 2AP1A 4WE1A 3OYKA 1Z05A 1X1PA 3WEEA 4CHPA 2Q2RA 3BGRA 4DU1A 4BQLA 4FJ7A 4K0KK 1N34K 1NGEA 1T8EA 4C8LA 3V9SA 3ISNC 4DV2K 2GEMA 1TGOA 1IG9A 1TKXA 3LAMA 3O8MA 2G8KA 3VQ7A 2IGIA 3VN5A 4Z4GA 3PUFA 4DFPA 3QNOA 4KV8A 4DTUA 1C1CA 1A5XA 3QEXA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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