4EAHD

Crystal structure of the formin homology 2 domain of fmnl3 bound to actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
368
structure length
356
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title FMNL3 FH2-actin structure gives insight into formin-mediated actin nucleation and elongation.
pubmed doi rcsb
source organism Mus musculus
molecule tags Protein binding
total genus 104
structure length 356
sequence length 368
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4eahD03
3VETA 1QZ5A 3UKUA 3ATUA 5AQWA 4FL9A 1T6CA 3DXKB 3DXMA 4FSVA 3UB5A 5F1XA 3WEEB 5AQFA 3R8EA 3JXUA 4FWKA 3D2FB 1U2VB 2FXUA 3A8YA 3EL2A 3H3NO 5JLFA 4H0OA 1TUYA 1WUAA 4CZMA 3C7NB 4H0XB 4EHUA 5BRFA 1QQOA 2F9TA 2YI1A 1Z05A 3GG4A 3H6EA 3C0BA 4BRCA 3CJ9A 3DWLA 3O5BA 4JD2B 2FLOA 2A5XA 3ULEA 5AQXA 3FR0A 4I6MA 5BPNA 4O5FA 3UKUB 5BREA 3KZBA 4BROA 4CZLA 5EXWA 1XUPO 2ASPA 2CGLA 4BRIA 4H0VB 5AQLA 1NGIA 3UKRB 4QS8A 4CZEA 1GLBG 3GBTA 2ZGZA 3CJ1A 1BO5O 4B9QA 1LOTB 3L0QA 2DPNA 1Z6RA 2Q2RA 3J8AA 3U9ZA 3LDLA 1V4SA 4XH1A 1KAZA 4BRKA 4BREA 3MN6A 1GLCG 3LM2A 3WQTA 1XQSC 3I8BA 1DEJA 3S41A 5BPLA 4I6MB 2QWQA 3EKUA 3LDOA 1KXPA 1NGFA 4BRFA 2EWSA 4PKHA 4CD1A 4WQ4A 2E2NA 4CZHA 1H1VA 2I7PA 5ADXA 1ATNA 3H1VX 1LCUA 2YHYA 2GELA 1XC3A 2A40A 5AQHA 1BU6O 3O1BA 2Q0UA 3QBXA 3UE5A 3MN9A 5AQIA 4J8FA 2YCHA 4XH4A 1DKGD 2E20A 3IMXA 2P9LB 4FOIA 3JS6A 2HF4A 2J4RA 3HSCA 2OANA 1NGEA 4JN4A 3D2EB 4PKIA 3A0IX 4FWQA 3MDQA 4BRLA 3WUHA 3BF1A 5AQJA 4CZJA 1P8ZA 2P9PB 3ID8A 5AQZA 2HF3A 4ISFA 3EN9A 2BTFA 5CE3A 3BF3A 1YVNA 3IUCA 1T44A 2ZF5O 3ENHA 4BVOA 3WXIA 5I9EB 3QFPA 2YJFA 3DXKA 1S22A 3ZX3A 5KPZA 1C0FA 2A41A 4IJAA 2KHOA 2NRHA 4RCHA 3WEEA 2VYPA 4FWLA 3SJHA 1U2VA 4CZGA 2VCPA 4H5WA 1MWKA 2V7ZA 1BG3A 3C7NA 5AQUA 1MWMA 2ASOA 2P9SB 3VENA 3VERA 3AY9A 4FPAA 4WQ4C 5E84A 5AZJB 5AQVA 4MLHA 1GLAG 3VEZA 3VOVA 1NGGA 1GLDG 4JD2A 4H5RA 3EKSA 2QWNA 2W40A 3FGUA 4ISGA 1K8KB 3DAWA 2QXLA 1ZC6A 4F9OA 4BRHA 5FPDA 1SZ2A 3FZMA 2QW9A 3H1QA 2P9UB 3UKRA 1Y64A 3CJ7A 4NB4A 4C23A 3H46O 5AQQA 4YDUA 4B1VA 1NGCA 2Q1NA 4A2AA 3WQUA 2BUPA 2ITMA 2D0PA 3QFUA 4H5VA 3GDQA 4IXCA 5BPMA 1NGDA 5FPMA 4BR0A 5AQYA 2AA4A 4FO0A 3CERA 4K43A 3FFKB 3ATVA 4BC3A 1NGBA 1QZ6A 1ZBSA 3U8XA 3VGLA 4CZKA 5AQMA 3MMVA 5BR9A 3BP8A 1BDGA 5JICA 1SAZA 4AM7A 4JNEA 4Z94A 5BRDA 2HMPA 5EY4A 5TKYA 5B8HA 4EIAA 1DGKN 1JCEA 1X3NA 3QICA 2YHWA 4BR5A 4FOEA 2Q0RA 1T6DA 3P4IA 5AQOA 2Q97A 4ISEA 3MN5A 5BN8A 1ESVA 2P9NB 1NGAA 1IJJA 1GLJO 2CH6A 4K41A 3M6GA 4B1UB 4M7XA 3H45C 4FWNA 2P9LA 4K25A 3WT0A 2HOEA 2QWPA 3D2EA 4LC9B 4XEIA 5FPEA 3M3ZA 5ELZA 4B1YB 2P9PA 3QMLA 3HI0A 5KQDA 3MCPA 4YDUC 1Q18A 1KAYA 3CHWA 3D7EO 5AR0A 4BRGA 4MO4A 3ZETB 4DHYA 4DQ8A 3KVGA 1WOQA 4BQZA 2NLXA 2V51B 4IJNA 4EAHD 3VF6A 2P9IB 3EZWA 4MLEA 3EO3A 3HZ6A 2GTDA 4Y0WA 1ATSA 2P9SA 5AQRA 2E2QA 4K42A 3LDNA 1SQKA 2YHXA 4B1ZA 5AZJA 3L6QA 1HPMA 4DCHA 2PBDA 3HBTA 3B8AX 2QWMA 4FPBA 2GWKA 3ZEUB 1X3MA 3VGKA 1K8KA 3VF4A 3O8MA 1HUXA 1BOTO 3O4WA 1BA1A 2WUSA 1TUUA 4BC5A 3OHRA 4BR4A 2ZWHA 4FWOA 4BC4A 3O1WA 1EQYA 2P9UA 1J6ZA 3FZHA 2PAVA 3L4IA 1JCFA 4JHDA 4NO7A 4RWTA 3LM9A 3CETA 3SMSA 4RTFD 3FZLA 3A5LC 3BUZB 3VPZA 2D0OA 2FSNA 3HTVA 4BR9A 3W0LA 3IFRA 3QB0A 4BRQA 3FLCO 1YXQA 1ZXOA 2GEMA 1CZAN 5AQSA 3AAPA 2QWRA 5AZIB 5KPRA 3R6MA 1V4TA 3RSEB 5LJVA 4CJ7A 2NZTA 1RGIA 2V7YA 2E1ZA 4H0TB 1QHAA 4QS7A 3VESA 2ZGYA 4JHDB 4GNIA 1TYQB 2YJEA 2AP1A 4CBUA 4WQ5A 3O6WA 3I33A 2P9NA 2E2OA 2QM1A 5AQPA 4DB3A 5LY3A 3CQYA 1NBWA 4IO8A 2QWLA 2F9WA 2H3GX 1QQNA 3QBWA 4H5TA 4H03B 1NMDA 3GOIA 3QDKA 4JAXA 3R9PA 1ATRA 3U4LA 4BVPA 1HX1A 2FF3B 3CIPA 5F0XA 1NM1A 1G99A 5FPNA 3VEXA 1BA0A 1OKJA 2ASMA 4FWSA 4HTLA 4AM6A 3U9DA 3AARA 5KPTA 4B1WB 3ZETA 1C0GA 3ENOA 4FWPA 4H0PA 3VEVA 5EX5A 3MK6A 3VEOA 1RDWX 1NGHA 2D1KA 2E1YA 3ZX2A 2P9IA 4CBWA 2IVOA 2FSKA 3VF2A 2CGJA 3GL1A 1E4FT 3O80A 3DXMB 1KAXA 2Q36A 3GE1A 3TPQA 4A62A 1IG8A 2A42A 1BUPA 1HJOA 1HKGA 3WXKA 3A5OC 2IIRA 4H5NA 2D4WA 3KHYA 4BRDA 4BRPA 3CQXA 5AQGA 5AFUA 3TU5A 5BRHA 2E88A 3ZEUA 2GWJA 3CJCA 1HKBA 4WQ5C 5AQKA 4PL8A 3LDQA 3DJCA 4M63C 1MDUB 4BC2A 3ULEB 5KQ8A 2CH5A 3IDHA 2A6AA 4CI6A 4CBXA 4BGAA 3CJBA 3FE1A 3SLCA 3A5MC 1GLLO 4M7YA 2UYTA 4O8KA 4BG9A 2CGKA 3AAQA 4KBOA 4XH5A 4E1JA 3M1FA 3WXJA 4L3QA 4BGBA 2V52B 4BRMA 3LDPA 2GUPA 5E26A 5AFUH 3W3DA 4H0YB 5BN9A 1S3XA 3MN7A 3F9MA 4BR2A 1MA9B 4MO5A 1R59O 3BEXA 1X9JA 4FWRA 3A5NC 2IVPA 3VEWA 4BRAA 4EHTA 2IVNA 5AQNA 5F2RA 3O08A 5JLHA 5AZIA 3VEYA 1YAGA 3RSEA 3SK3A 2P9KA 3WXLA 4IWVA 4A2BA 2Q31A 3ZX0A 3H3OB 1GLEG 3LL3A 4FWMA 1NGJA 1HKCA 1TYQA 4PL7A 5ADXH 1GLFO 2I7NA 4BR7A 5EVZA 4CZIA 1RFQA 1NLVA 2VWBA 3G25A 1JCGA 4IZ9A 1YUWA 1BWFO 3VGMA 4WYBA 4PKGA 3CJAA 3SMPA 2QWOA 1U6ZA 4BRNA 3HM8A 2FF6A 4CD3A 5JMVA 2E2PA 2FSJA 3D2FA 3CI5A 4CZFA 4QS9A 3FZFA 4BQLA 1QQMA 2P9KB 2W41A 5EOYA 3FZKA 4EFHA 1E4GT 1D4XA 4A61A 1HLUA 2A3ZA 5LJWA 5AQTA 2E8AA 4B1XB 4HWIA 4BG8A 1NWKA 4GY2B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VG6A 3PX0A 3UKUA 4DTPA 3DXKB 1RBRA 1IKWA 4FSVA 3UB5A 3WEEB 4YNQA 1UA1A 4FWKA 4DR5K 1U2VB 4CIGA 4DSEA 3CC7N 4RW9A 3H3NO 3THXA 1Z26A 2D0BA 4DSJA 3F73A 3CG7A 4CERA 4CZMA 3U3GA 3K9JA 4EHUA 2BH1A 1NK8A 4BY9C 3ENBA 3HPGA 3HM9A 3UIQA 2IDOA 4E72A 3BY5A 2A5XA 3Q7BA 4O5FA 4CIEA 1T8EA 1VQON 1WLJA 1S1VA 4CGFA 4JI4K 2FBXA 4DTMA 5AQLA 1NGIA 5KGXA 1BO5O 3TAQA 3NMUA 3LDLA 4WCEL 4GV9A 1V4SA 4XH1A 2I5JA 4CESA 3V9UA 4JKGB 3MECA 4B3TK 1KCFA 3MN6A 1NJZA 3O3FA 4FJLA 1VQKN 5KRSA 1DEJA 4KV8A 3ZSWA 2KZZA 2W6KA 4I6MB 5FRMA 2QWQA 3EKUA 4GKJK 4FLTA 3TTCA 3T1AA 1KXPA 4E7IA 1QVFM 2E2NA 4JKDA 4CZHA 1LCUA 3AVBA 1RT2A 1NJYA 4KHNA 2A40A 4DR3K 5HRRA 3O1BA 2Q0UA 3UE5A 5CY4A 2DFHA 1CZ9A 3JS6A 1LWFA 3HSCA 4NXMK 4JRQA 3CYGA 4DTRA 3D2EB 4BRLA 1WSEA 5FRNA 4M42A 3K59A 3AVGA 1U04A 4Q0BA 2DTUA 3OYGA 3T3FA 1IKXA 1FJGK 2HHUA 1YVNA 4C8KA 2ZF5O 4B08A 3WXIA 4DQIA 1S22A 3ZX3A 2G8WA 4FJIA 4IJAA 3HT3A 4E7JA 3AVJA 2O8BB 3KJVA 4CJ4A 2F4VK 5EU7A 1D9FA 1SS6A 2VWJA 3RRGA 1T3VA 5AQUA 3VQBA 1U48A 3AY9A 4WQ4C 2HHWA 4LH4A 1GOBA 3VOVA 1NGGA 1GLDG 4FJ8A 4H5RA 5J1EA 1A5WA 3QEIA 4ISGA 4F9OA 4FLYA 3SNNA 4DR4K 4N56A 5T7BA 3LPUA 4CK1A 4A2AA 4DFPA 3U6FA 2D0PA 3V4IA 4H5VA 2OZMA 2NRTA 4J2BA 1LWCA 5BPMA 3ZSRA 1NGDA 5AQYA 3T1YK 2HSTA 3FFKB 4L8RB 1BCOA 1WSHA 4DU4A 1VQ5N 4GKKK 4CZKA 2HHIA 3O4NA 4F8RA 4AHCA 4ELVA 5C24A 4OKKA 5BR9A 4YOXA 1BDGA 4CEOA 3LZIA 4JNEA 5BRDA 4DSFA 4K8ZA 2A1SA 4FJHA 4QAGA 1N5YA 1W97L 2Z1JA 1TKTA 3EEQA 4CHZA 1F21A 1XWLA 4LSLA 4IKFA 2Q97A 4ISEA 5BN8A 4MDAA 4WE1A 4FJGA 3QEPA 4FM2A 4E7KA 1IBLK 3M6GA 2UXDK 1TVRA 4B3RK 3SBTA 3MEDA 3H08A 4DV5K 4FCYA 2HOEA 1SUQA 3JYTA 3M5RA 4YDUC 4JK9A 1JKHA 1Q18A 2G8HA 3CHWA 5AR0A 4MO4A 1XNQK 2QEXN 2C1IA 4J2EA 4BQZA 4CJUA 1HYSA 4EAHD 2JWKA 2GV9A 3EZWA 4MLEA 4LFAK 3HZ6A 2GTDA 5AJ3K 1TAQA 2P1JA 3K5OA 4EP5A 2WTUA 2GUIA 4UQGA 1KQSM 2VGMA 2HVIA 3DLHA 3LDNA 4B1ZA 3HBTA 3B8AX 2QWMA 4KO0A 4LF7K 2GWKA 2UUBK 4FYDA 1IH7A 3MEGA 1X3MA 1K8KA 3O8MA 4X65K 3THYB 4OKEA 1BA1A 3OHRA 4CK2A 4BR4A 2ZWHA 4FWOA 1U4BA 3S9HA 3O1WA 1EQYA 3NH1A 1J6ZA 4F4KA 1REVA 3CCQN 1JCFA 3OYHA 1KVBA 3HJFA 3I55N 4BE2A 4ZTFA 2G8VA 1S1TA 3OVNA 1SL0A 4GV3A 2PZSA 2FSNA 3OS1A 3W0LA 3ZT3A 1CZAN 2AJQA 4OGCA 1J54A 3R6MA 1V4TA 4CJ7A 3L3UA 4CIFA 1QHAA 4H4OA 4QS7A 2ZGYA 4NYNA 4GNIA 1TYQB 4KB0A 4WQ5A 4FJMA 2P9NA 5E41A 3QEWA 1HPZA 2IS3A 3CQYA 4IEEA 3WXMB 1HR0K 1ZBHA 2QWLA 1TL3A 1ZBFA 2H3GX 2XRIA 3SYZA 1OH6A 1C1BA 3QBWA 4H5TA 3RMAA 2HBMA 3U4LA 2JLEA 3O3HA 4GV6A 3E01A 5F0XA 3VTHA 1NM1A 1OKJA 2Q3SA 4BDYA 4OGEA 3AVMA 4FWPA 4H0PA 1J53A 4DU1A 4FW1A 5GADP 1YI2N 4IBNA 1RDWX 2D1KA 1RNHA 3J7YP 3ZX2A 5M1PA 2UUCK 3NVMA 3VF2A 1X1PA 2ZJRL 4KI6A 3O80A 1E4FT 1KAXA 4B9TA 3F5TA 1YITN 1BUPA 1HJOA 2IIRA 3LANA 3DLLL 5KGWA 3LAKA 1JLCA 5AFUA 2E88A 3ZEUA 3VQDA 2X78A 2O8EB 3DJCA 1MDUB 4BC2A 1K9MO 1TAUA 3SQ0A 2CH5A 3B6OA 2A6AA 2IC3A 1ITGA 4CI6A 3QERA 3SLCA 1HYZA 2G8UA 1GLLO 3TARA 4CJLA 4KH6A 2OTLN 3OYBA 3IAYA 5E26A 3W3DA 5AFUH 3K9KA 1S3XA 4YFUA 3DOKA 2YNGA 4MO5A 3WNGA 1X9JA 3A5NC 1VK0A 2IVPA 4BRAA 1SKSA 3TAGA 3CPEA 1C0TA 4Z0UA 1ZYQA 3QESA 2E6LA 2KKZA 3RSEA 1BI4A 3CQ8A 4IG0A 3WXLA 4HCBA 2VGNA 3KWGA 5LMUK 4KHYA 4DTUA 3NH2A 4B8CA 1YF5L 4JK8A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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