4EAHD

Crystal structure of the formin homology 2 domain of fmnl3 bound to actin
Total Genus 104
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
104
sequence length
368
structure length
356
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHR'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title FMNL3 FH2-actin structure gives insight into formin-mediated actin nucleation and elongation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
source organism Mus musculus
molecule tags Protein binding
total genus 104
structure length 356
sequence length 368
chains with identical sequence F, G, H
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-03-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
D PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4eahD02
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 4eahD03
1V4TA 2P9UA 3LM9A 1NGDA 4FWNA 3CHWA 1DKGD 5BRFA 1RGIA 2Q0RA 3DXMB 4FO0A 4F9OA 2GWJA 2P9KB 2P9NB 2PBDA 4BRKA 3IFRA 3QFUA 2W41A 1H1VA 1X9JA 2GUPA 1BOTO 5E84A 1BA0A 2ASMA 3HM8A 2VWBA 1ATRA 2W40A 4AM7A 4XH1A 4Y0WA 5AQGA 4ISFA 2E1YA 1GLJO 3H3OB 4CBXA 5ADXA 2Q0UA 1XC3A 4H0YB 1LOTB 3B8AX 1NMDA 4PL8A 5JICA 2E2QA 3VERA 5AQKA 4CD1A 5AQJA 1NWKA 3G25A 2CGKA 3EKSA 3VEVA 1QQNA 3JS6A 3SMSA 3CI5A 2Q97A 4GY2B 5LY3A 3ID8A 3O5BA 2A6AA 2E2PA 1QHAA 4BC3A 3R8EA 2GTDA 2ZF5O 4ISEA 3CERA 2E8AA 1EQYA 4CJ7A 1G99A 2QM1A 5AQWA 3VENA 5AQFA 3LDNA 2GEMA 1QZ5A 3H1QA 3ZEUB 3ZX2A 2QWMA 4JHDB 3W0LA 1TYQB 3ENHA 4H5VA 5KPZA 3WQUA 3ZX0A 2A42A 3QICA 1NGHA 1NGAA 4CZFA 1KAZA 3OHRA 4Z94A 2P9PB 1OKJA 5AZIB 3IMXA 2QWPA 3KHYA 2ITMA 4B1VA 3LDLA 3O1WA 4MO5A 2A5XA 3ENOA 4NB4A 4B1WB 5ADXH 3BF3A 1XQSC 3CETA 4K25A 1TUYA 3RSEB 3U9DA 3WXKA 1MWKA 1IG8A 3HBTA 2FSKA 3R6MA 1YXQA 4CZJA 3C7NB 4MO4A 3R9PA 3QBXA 3BP8A 1NGJA 3SMPA 5AQMA 2HF4A 4IO8A 1TUUA 1GLBG 3WQTA 3WXLA 3QB0A 1Z6RA 1NGEA 1LCUA 1WUAA 5AQPA 2I7PA 1R59O 3O08A 2P9SB 4FPBA 3AY9A 5F0XA 1NGGA 4H5RA 1HJOA 1K8KA 3WT0A 2ZWHA 4BROA 4WYBA 2FLOA 4BRPA 4YDUC 5BPMA 5KQDA 1MA9B 2E1ZA 4A2AA 3AAQA 4FWSA 3A5MC 2WUSA 3SJHA 1S3XA 4BR5A 5JLHA 2P9UB 1ZC6A 1Z05A 2FSNA 1CZAN 4EHTA 3L6QA 1X3NA 5E26A 3A5LC 3MN7A 1Q18A 5AR0A 4BQZA 5JLFA 4XEIA 4FPAA 3UE5A 3WEEA 1RFQA 4FSVA 2DPNA 1BDGA 4EAHD 2AA4A 4B9QA 1IJJA 2FF3B 4CI6A 3VESA 3JXUA 2P9IB 4A2BA 3LDQA 3I8BA 4FOEA 3CIPA 5BRHA 2P9LB 4WQ5C 1KAXA 1BUPA 2H3GX 3BF1A 4A61A 3MMVA 3FR0A 3H6EA 4QS7A 2A3ZA 3IDHA 2FF6A 4BRQA 5B8HA 3DXKA 4CD3A 3S41A 2QWRA 3FZFA 3L0QA 4IWVA 5AQRA 1HLUA 2OANA 4XH5A 5AQQA 3QBWA 1ZBSA 1E4FT 4FWPA 2CGJA 4O8KA 3FE1A 5CE3A 2YHXA 4FWOA 1T6CA 3CQXA 5BR9A 1KAYA 5AQXA 3BUZB 1DEJA 3UKUB 2YI1A 3VF6A 5AQUA 4BG8A 3CJBA 4LC9B 4B1XB 2NZTA 3SLCA 4BG9A 2VYPA 2ZGYA 1QQMA 1NGIA 1BU6O 3MDQA 4BREA 2ASPA 4JN4A 1NGBA 3FZMA 3EZWA 3WXJA 4QS9A 4L3QA 1BO5O 4C23A 4H5TA 2Q1NA 1JCGA 1C0GA 3WUHA 3DJCA 4BR0A 1YVNA 4DHYA 1NGCA 1HKGA 5BRDA 3VEOA 3ZETA 2E2OA 3FGUA 3D7EO 3VGLA 5AQIA 3KZBA 4BRHA 5AFUA 2I7NA 4NO7A 2HMPA 3BEXA 3LDOA 1ATSA 4PKIA 3D2FB 3D2EA 2IVOA 2BTFA 1DGKN 2V7ZA 5EY4A 5AZJA 1ATNA 2Q36A 1YUWA 2YJEA 1K8KB 3H45C 4CBUA 4CZKA 3HTVA 4BC2A 1C0FA 4JD2A 2V52B 4QS8A 2QWLA 5TKYA 2YJFA 3J8AA 3TPQA 3IUCA 5BN8A 1JCEA 5AQOA 1V4SA 4BR7A 4EHUA 4BR4A 4EIAA 4I6MA 4BRCA 4JAXA 1GLAG 3VOVA 2CH6A 4CZIA 4EFHA 1BG3A 3M6GA 4PKGA 3M1FA 3CJ7A 5ELZA 1SZ2A 3CJCA 4JHDA 5AFUH 2A41A 3A8YA 3ULEA 5JMVA 4FWMA 3GOIA 3WXIA 5AQVA 5LJVA 1NM1A 4RTFD 2GELA 2E88A 3O4WA 4FL9A 3HZ6A 5AZIA 1NGFA 4BVPA 5BREA 3EL2A 4BR9A 3MN5A 3L4IA 4H0OA 5I9EB 2D0OA 3ATVA 2V7YA 2QW9A 2D1KA 4GNIA 4BR2A 5AQTA 3MN6A 4RCHA 2KHOA 5AQLA 1E4GT 3QFPA 1X3MA 4M7XA 3VEYA 2F9WA 5FPMA 1GLCG 4BRFA 3ZX3A 3UKRA 2QWNA 2QWQA 3EN9A 5BN9A 4BGBA 3DWLA 4IJNA 4WQ5A 4FWRA 1NLVA 2A40A 1SAZA 3HI0A 4WQ4A 4B1ZA 1QQOA 4PL7A 2YCHA 4H5WA 1S22A 3I33A 1QZ6A 3MCPA 4BC4A 3CJ9A 3A0IX 5EVZA 4BC5A 5FPEA 3ZETB 2D0PA 1GLLO 2PAVA 3FLCO 4H5NA 3QMLA 3ATUA 2D4WA 1U2VA 2E20A 2FSJA 4H03B 1XUPO 5AQYA 4DQ8A 2GWKA 4BGAA 5AQZA 4BRGA 2P9IA 4JNEA 1HKCA 3EO3A 1T6DA 3O1BA 1KXPA 3D2EB 2E2NA 2P9LA 1WOQA 2EWSA 4BRAA 1MDUB 4K43A 4A62A 4H0XB 1D4XA 1BWFO 2NLXA 5AZJB 4BVOA 3VEWA 4XH4A 5FPNA 1NBWA 5F2RA 3DXMA 3W3DA 2P9KA 2F9TA 2P9NA 2IVNA 4BRDA 4CZGA 1GLEG 4JD2B 2YHWA 2UYTA 3O8MA 1Y64A 3MK6A 4BRMA 2YHYA 4I6MB 3VGKA 3UKUA 4BRLA 5KPRA 3VEZA 4FWKA 3GL1A 3LL3A 4MLEA 2QWOA 3U4LA 4B1YB 4AM6A 2J4RA 3H3NO 4E1JA 4RWTA 4M63C 1MWMA 3VEXA 5BPNA 1HKBA 3ULEB 3HSCA 4H0VB 4B1UB 5AQHA 3A5OC 5AQNA 5KQ8A 3M3ZA 1RDWX 2Q2RA 3QDKA 3A5NC 5KPTA 1T44A 2QXLA 3VETA 1ZXOA 3MN9A 4CZLA 4FOIA 3GBTA 3TU5A 5AQSA 2ZGZA 1ESVA 3WEEB 5FPDA 2NRHA 1YAGA 4PKHA 4H0PA 3ZEUA 4CBWA 2CH5A 1TYQA 3FZLA 1JCFA 1BA1A 5LJWA 3H1VX 1HX1A 4BRNA 5EX5A 4FWLA 4DB3A 5F1XA 3LM2A 3KVGA 4DCHA 2P9PA 2IIRA 3P4IA 4KBOA 4MLHA 3CJAA 3SK3A 5BPLA 3AAPA 3D2FA 2ASOA 3VF4A 2HF3A 3UKRB 2AP1A 3CQYA 2VCPA 4YDUA 3DXKB 3EKUA 4O5FA 2BUPA 2FXUA 2Q31A 3C0BA 3H46O 5EOYA 4BRIA 3RSEA 1GLDG 1HUXA 2HOEA 4M7YA 4ISGA 3FFKB 4BQLA 4HWIA 4J8FA 3F9MA 1P8ZA 3FZHA 3UB5A 2CGLA 3C7NA 3VPZA 3O6WA 3GE1A 3GG4A 4IZ9A 4CZEA 4H0TB 3VGMA 1GLFO 2V51B 3U9ZA 3VF2A 1SQKA 4IXCA 4FWQA 3GDQA 3LDPA 4IJAA 3CJ1A 3O80A 4CZHA 1HPMA 3U8XA 2P9SA 4K41A 1U2VB 3DAWA 4CZMA 3AARA 1U6ZA 4HTLA 3FZKA 1J6ZA 5EXWA 4K42A 2IVPA 4WQ4C
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1V4TA 1GOBA 4FWNA 1DKGD 4DSKA 4F9OA 2Q3SA 1Q8IA 3IFRA 3QFUA 4JKAA 4YOTA 2JWLA 3LZIA 1JL1A 3PX4A 3T1AA 1DT9A 4IOXA 3HM8A 4LF4K 1VSFA 1NK7A 3ULDA 4DTOA 4GKJK 2E1YA 4CBXA 1XC3A 3OYFA 1T8EA 3O3GA 1NJXA 2FC0A 4PL8A 4FLYA 1S72N 3VERA 3ZT3A 1RDBA 1X9MA 5CHIA 3ZT4A 4FJ5A 5FRMA 3EKSA 3SMSA 3CI5A 1RBRA 2Q97A 3S9HA 2A6AA 1QHAA 3R8EA 2WC9A 4ISEA 1HMVA 1O1WA 5SZTA 1KRPA 3NH2A 3RRHA 4L8RB 5AQWA 1BIUA 1S1TA 3SUPA 5AQFA 4ELVA 4CGGA 2GEMA 3ZEUB 1KTQA 4AHCA 2QWMA 3O4QA 3ENHA 3WQUA 1J5OA 3THVA 3AO1A 3OHRA 4JRPA 3LDLA 3O1WA 4MO5A 1IKWA 1EXQA 4OLBA 4LH4A 4B1WB 5ADXH 5CR4A 4N76A 2DFEA 3BF3A 2XY8A 3CCLN 1XQSC 3CETA 4K25A 1TUYA 3RSEB 3WXKA 3HBTA 2F8SA 3R6MA 1YXQA 2IC3A 3C7NB 3T69A 4KTZA 4MDBA 4KHSA 3WQTA 4IO8A 3KKRA 2F7TA 1RT5A 1L3TA 2I7PA 1R59O 1CXQA 1EETA 4M3TA 4GV3A 4BROA 1VSMA 2VWKA 1NJWA 4BRPA 2HHXA 1MA9B 1REVA 4EZ6A 4NYNA 3KIOA 4X65K 1Z05A 3OYEA 5HOOA 1Q18A 5JLFA 4BQZA 1N32K 3UE5A 3WEEA 1RFQA 3V9WA 1YHQN 4IOAL 3HP9A 1NK8A 1VRTA 4CI6A 3VESA 3WNHA 5M1KA 3J80O 1IBLK 2P9IB 1OH6A 1C0TA 1XMOK 3CXCM 2P9LB 4A61A 1T03A 3AO2A 5M1QA 2E5LK 2A3ZA 3QEIA 2FF6A 3VQ4A 4JEPA 1Q86O 2QWRA 2Z1HA 4IWVA 2OANA 2PFUA 3QBWA 1ZBSA 3ZSRA 3TAGA 1Q9YA 5CE3A 2YHXA 4FWOA 3C94A 1KAYA 3MECA 4DQSA 5AQXA 2XRIA 4FK2A 2YI1A 4FJ7A 3DYAA 4JK8A 4BG9A 3ZT0A 2VYPA 4B3MK 1VSJA 4BREA 2GBZA 3FFIA 3FZMA 3EZWA 3SAFA 4QS9A 4RW9A 1BO5O 5DK5A 4C23A 1TV6A 4DV2K 4FJMA 4KI6A 3OYKA 4CJVA 1TL1A 4CFBA 1JCGA 3HT3A 3WUHA 4DMNA 3ITHA 2KFZA 3P39A 3E1YA 1WSHA 1WNSA 1HKGA 4DTUA 1XC9A 5H1SQ 4FJNA 2WFBA 3FGUA 4NYFA 4CGJA 5AQIA 3LALA 3KZBA 4KO0A 5AFUA 2I7NA 1TK8A 3BEXA 4DQRA 5T7BA 1VQNN 4JLHA 4CJPA 3D2EA 4Z4GA 2IVOA 3K57A 4HUFA 2V7ZA 5EY4A 3DLBA 3HVRA 5AZJA 3O9SA 3L3UA 1S1XA 3PX6A 2Q36A 4FJXA 1YUWA 1IKVA 4BE1A 4OLAA 3T19A 4O44A 1L3VA 4DF4A 4RG8A 1C0FA 4JD2A 4CHYA 3KTQA 3HPGA 4QS8A 3QERA 3R1XA 2OTJN 1S9EA 3SPYA 2YJFA 3J8AA 3TPQA 1JCEA 4CIGA 1IG9A 4I6MA 2W00A 1EWRA 1GLAG 1BG3A 2XY6A 3NH1A 4PKGA 1T3VA 1BL3A 3M1FA 5ELZA 1K6YA 2A41A 2HMIA 1QSSA 3GOIA 3WXIA 5AQVA 2ZJRL 4YORA 4RTFD 1HNIA 1FXXA 2KKZA 2VGMA 4FL9A 4IFVA 4O4GA 3L2QA 1NK5A 3SAGA 4F3OA 4B3OA 5BREA 4KB0A 4YOXA 4EP5A 4BR9A 4OPAA 3L8BA 1IH7A 1NU0A 4FW2A 4H0OA 5I9EB 5CZ2A 1RDAA 4CJTA 3ATVA 3K9KA 5TKWA 4JK7A 3TAMA 1BQNA 2UUBK 2P5OA 3MN6A 1B92A 2KHOA 4E7HA 4RW7A 1C0UA 1TKZA 4OVLA 4LSNA 2G8HA 5FPMA 2YX6A 4CEDA 3KK7A 3D0PA 4AHVA 1NJZA 3EN9A 4V19S 4WQ5A 4FWRA 4JI3K 1RDUA 4KREA 1SAZA 1OH5A 4JS4A 2DY4A 3LPTA 4CEFA 4PL7A 2YKMA 4H5WA 1S22A 4HUGA 2BE2A 3MCPA 3CJ9A 3L2RA 4XJXA 4KH4A 1NJYA 1JLAA 3QIOA 5EVZA 5FPEA 3TARA 1KFDA 3ATUA 2GWKA 4BGAA 4OPJA 5GAHP 1B9FA 1N36K 3D2EB 2BGGA 1D4XA 4JI6K 1BWFO 5DM7L 5AZJB 3NMUA 4QCLA 1VSEA 3DXMA 1BISA 2JLEA 3W3DA 2P9KA 3AA2A 1VQ8N 3CM6A 1RT6A 1CZBA 1QS4A 4JD2B 1TK5A 4CJUA 3K2PA 3BZCA 2YHYA 4WCEL 2DFFA 4I6MB 3UKUA 4HVJA 4FZXC 5KPRA 4CESA 3THYA 3F9KA 1U47A 4DU3A 4MLEA 4JRQA 4YY3K 2QWOA 4M3RA 4DUYK 3RR7A 2J4RA 2YNIA 4XIUA 3AV9A 4CJSA 1MWMA 4HHTA 4G1QA 1IO2A 2XO7A 3ZSOA 1IKYA 4GVEA 3V6DA 3M3ZA 2D0AA 5KPTA 3IG1A 1T44A 2YHAA 1VQON 2GV9A 3VETA 1ZXOA 4DR4K 3L2VA 3BZKA 5C2DA 4AH9A 4JKDA 3DLRA 5HRSA 3N4QA 5FPDA 2NRHA 4CF2A 2KQ2A 4M3XA 3M8PA 1N34K 4KFBA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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