4ECBA

Chimeric gst containing inserts of kininogen peptides
Total Genus 70
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
70
sequence length
225
structure length
202
Chain Sequence
SPILGYWKIKGLVQPTRLLLEYLEEKYEEHLYERDLEFPNLPYYIDGDVKLTQSMAIIRYIADKHNMLGGCPKERAEISMLEGAVLDIRYGVSRIAYSKDFETLKVDFLSKLPEMLKMFEDRLCHKTYLNGDHVTHPDFMLYDALDVVLYMDPMCLDAFPKLVCFKKRIEAIPQIDKYLKSSKYIAWPLQGWQATFGGGDHP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Chimeric glutathione S-transferases containing inserts of kininogen peptides: potential novel protein therapeutics.
pubmed doi rcsb
molecule keywords chimeric protein between GSHKT10 and domain 5 of kininogen-1
source organism Schistosoma japonicum
molecule tags Transferase, protein binding
total genus 70
structure length 202
sequence length 225
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.5.1.18: Glutathione transferase.
pdb deposition date 2012-03-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02798 GST_N Glutathione S-transferase, N-terminal domain
A PF14497 GST_C_3 Glutathione S-transferase, C-terminal domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.1050.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 Glutathione S-transferase Yfyf (Class Pi); Chain A, domain 2 4ecbA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 4ecbA01
2L57A 1S3DA 2C4JA 3TJKA 3C71A 1ERTA 3TUEA 5GAPD 4MZWA 2PVOC 1YEPA 2YANA 5H5SA 1AAZA 2OE3A 4TXOA 3U6VA 2BTOT 5ECSA 1M0UA 3F9UA 1GTIA 2R2JA 1IYIA 1SKWB 4JEDA 3D22A 3QOUA 1FOVA 2IPAA 2WULA 2HSMA 2HQTA 2ALBA 4PQ1A 4PGTA 5ECIB 3CMIA 1KNGA 5INYA 3S9FA 4JR6A 2H70A 4OWYA 2CX4A 1AW9A 5L71A 3WD6A 4EDYA 4JRRA 4ZL9A 2ON5A 3RDWA 2JSYA 2AJQB 3UBKA 2WGRA 2C1YA 4POLA 1A24A 3Q6OA 1ZOFA 3ZLPA 2H6YA 1TK8B 4OO4A 5JWOB 2ZNMA 2RM5A 3LORA 2LJKA 1GULA 2V32A 4LL4B 4TKYA 4Q5FA 1FVKA 1HD2A 2L4CA 2YWMA 3D6IA 4BWQA 3IOSA 2QSIA 4RQXA 1FO5A 3DGQA 1EV4A 3KP8A 3L9SA 4MPFA 2YV9A 2DJ3A 1EGOA 3FR3A 1M2AA 3DEXA 1T4ZA 3KGKA 1J9BA 2REMA 3G7JA 3C7MA 1SL2B 3TOTA 5GSTA 2B5YA 1B8XA 2LKUA 3WT1A 1O73A 4DSSA 4G10A 5ECRB 1V2AA 1Q98A 4K9ZA 3QDNA 3L9UA 4LLRA 4DSRA 2LS5A 2RLIA 2FGXA 2GTUA 3GKMA 1TRVA 2VM1A 3J7Yk 1XWKA 5G31A 2JL4A 2QC7A 1GP1A 4WBRD 3TKRA 1SK1A 2F3MA 2VCQA 5IMFA 1ZYQB 4BVYB 1GUMA 2YWIA 4KF9A 4L8EA 4OCEA 4IJ3A 3KTLA 3DRNA 4KB3A 4MF7A 3MNGA 2CVKA 2ES7A 3FEUA 2GSRA 1M7TA 5LD0A 3IPZA 16GSA 2H1GA 4FH8A 3F0IA 4RI7A 4IBPA 2R3XA 3VI7A 4JU5A 4OD7A 1G7OA 2GSTA 3MAKA 1BAYA 2FD3A 4I97A 3ZIVA 1ZGNA 3HYPA 2H0GA 3HA9A 3TKSE 1V98A 1YZXA 4EF0A 2H0IA 4X1UA 3D21A 2YP6A 4EO3A 1XFLA 5IQYA 2L4QA 3HJPA 1TDIA 3QPMA 2L5LA 2N5AA 1HNAA 1ON4A 1NM3A 1YQ1A 4MABA 4KX4A 4X0XA 1QUWA 3DKSA 1YKCA 3MSZA 5LCZA 3FKFA 2DMMA 4AJ6A 3R3EA 4NWYA 1HNCA 3APOA 1SL0B 3IC8A 2VOCA 2PBJA 2WCIA 5AIVA 3HVSA 5F8BA 1QXHA 2YOIA 1BX9A 1ABAA 4HEA2 3GL3A 4HJMA 2VUPA 2I1UA 2C3NA 3HJOA 4IW9A 1YF0A 2IMDA 2O87A 1ML6A 3GRXA 3ZIJA 3DXBA 6GSYA 1OC9A 2JZRA 3RBTA 4AJ7A 1Z3EA 3GTUA 5FT3A 5JWRB 5IPGA 2BJXA 2EC4A 2H0HA 3E3EA 3LGCA 4TR1A 3IC4A 5F05A 1J08A 4WXTA 2YWOA 1OE7A 2OADA 3M0FA 3EYTA 5J9CA 3A5WA 1SJIA 5H5QA 1XPVA 2FWFA 1F3BA 8GSSA 2OE0A 1PSQA 3P8WA 4PQIA 2CZ2A 4YAVA 4K7NA 2HZEA 4ZB9A 5GAND 5HR2A 3KJYA 2HRKB 1XOBA 3ERGA 2PPTA 2OACA 3IHQA 1FHEA 1T1VA 5ECQB 3GKXA 4V2LA 4Z7XA 4PQHA 2MMZA 5IO0A 1V40A 4HZ2A 1F2EA 1PRXA 4KA0A 2VLUA 3ZRDA 4NV5A 3KTBA 1XXUA 4PUAA 3FY7A 1DE2A 1T4YA 5JCUA 4FYCA 2CAIA 3LYKA 3F4TA 3GSTA 3FRCA 4XRDA 3GV1A 4ZILA 5D9TA 2R4VA 2MMNA 3F6DA 2GZZA 4NHWA 1K3LA 3TRXA 2JU5A 5G2ZA 2WS2A 3I69A 1GNEA 2N5FA 2GZYA 2E2GA 4ML6A 3IBHA 4D73A 2X8CA 4GSSA 5FHIA 2CX3A 3EU3A 4G19A 2ZUPA 5B8AA 2OE1A 2IMKA 2MMOA 4XRAA 2C80A 1V58A 1ST9A 4QQ7A 1M2BA 3TJFA 2DJ0A 5EY6A 4GWRA 1GNWA 5IO2A 1A23A 4XTSA 5IMZA 5B6NA 3EE2A 1TI1A 5AN1A 2BMXA 3ZFBA 1QMVA 1TI3A 2V41A 19GSA 4N0ZA 5ABRA 3W8SA 2YZHA 4KCAA 5IOXA 4XS4A 3TCOA 4LL1B 1V9WA 2FUG2 4K7OA 5IMDA 2GZPA 5J5NA 4RQRA 4MF5A 4XS6A 4MK3A 2OBKA 3VI5A 3QAWA 1LBKA 1R5AA 5HFKA 1WIKA 4OCFA 2PN8A 5B8BA 4EC0A 1K3OA 4USSA 2GVPA 3GH6A 3FZ9A 1PQNA 3EWLA 2RM6A 2VCTA 2VL2C 1SL1B 2V6OA 5DDLA 3IAS2 3GL5A 2VCXA 1JHBA 3KMOA 4F03A 3UVHA 4J56E 2XBQA 3QFAC 4IELA 2PUKC 5DQSA 4G0LA 2B1KA 5F06A 3EVIA 4BVXA 3TJJA 1GSYA 4BL7A 3ZREA 4KH7A 4POBA 2LQOA 4FYUA 3QAVA 3KH9A 5DJMA 3L0HA 5G1LA 5EL8A 3C73A 1XW9A 1THXA 5H5RA 4EVMA 2D2ZA 3QR6A 4CW9A 1X0RA 2B7KA 2H76A 2VLVA 4HOJA 2IN3A 1Z7RA 1TRUA 3CTGA 2P31A 3KP9A 1TKDB 4WF4A 4MP4A 2DIZA 2H73A 2KP1A 3N9JA 1JZDA 1TOFA 1NHOA 1T3BA 4WKWA 5D93A 5ELAA 1K0OA 4AGSA 2DMLA 1U3AA 3GX8A 3CRUA 4N0VA 1EZKA 4HDEA 4EE0A 4F9ZA 2HE3A 3I43A 1MEKA 5E59A 3DVWA 1SK0A 2IIYA 3TGZA 1FG4A 14GSA 4NXIA 1BJXA 3APSA 1WPIA 1FB6A 5G1KA 3KIJA 4KDYA 3UBLA 5JCGA 5IM9A 4QL9A 2RUEA 3UARA 2H1AA 1U88A 3P7XA 1ERUA 2HSMB 3BBYA 4KAEA 4KSMA 4LA1A 5B7CA 1K0DA 4ECBA 2XPDA 1SD8A 4WEYA 2X8HA 3UOMA 3TKPA 3ZMKA 1GUKA 3MDKA 4YQVA 2R37A 2AAWA 2VM2A 1AUCA 5G30A 1UC7A 1SU9A 2IWTA 3HJMA 3ED3A 1GSEA 2NDOA 3H8QA 4IQ1A 3J7Yb 1USBA 2OA7A 3G7IA 1YY7A 1VF1A 1GSSA 2P5RA 5AISA 2GQKA 4FYBA 4GSTA 2FCHA 1W4VA 3CTFA 3CSJA 3FHKA 3D4TA 3IK9A 3K8NA 2JSZA 2WZ9A 1V57A 3HY2A 1SENA 1FW1A 4KW6A 1XBSA 2FLSA 1R5PA 4H86A 4J2FA 4V2NA 1AXDA 5ECHB 2H1BA 2G2QA 2PWJA 3IR4A 2GT5A 1K0AA 1G6WA 3UAPA 3CSIA 5DCGA 4ECIA 1XWAA 3NOFA 3W6GA 4PX1A 1AIUA 1XOAA 2FA8A 5DVBA 5EPFA 4OFMA 4IN0A 5B6MA 3UMAA 2EIRA 3L78A 2LQQA 3QD9A 3I9V2 3RAZA 5ECKB 2I4AA 4FO5A 2WRTA 2F51A 2K6VA 3I6AA 1B9YC 4E8EA 1A2MA 4L5OA 4MJEA 1LJRA 3M3MA 5F0GA 1O81A 2MZCA 1GTUA 1UA5A 2C8UA 1OKTA 3EMXA 2GS3A 3CBUA 5COHA 3F3RA 2GGTA 3GH9A 4KSOA 2H6XA 4WBJA 1Z6MA 1ZCPA 4YQUA 3IA1A 3F3QA 1QQ2A 1GLQA 4TR3A 1DE1A 2PGTA 1O7UA 3F63A 4ILFA 1CQHA 2N5BA 1AQXA 3FZ4A 1NW2A 5J4UA 2UZ8A 3NIVA 1I5GA 2C0EA 4KUNA 4IQAA 2OBIA 1GH2A 2I81A 4Q5QA 2FWEA 2DLXA 2HSNB 4PNFA 3WYWA 4ZIJA 2P0GA 4N11A 3TB2A 3UEMA 5E4WA 4YQMA 2XHFA 3KH7A 3A2VA 3GKNA 4GCIA 4MZCA 1VGLA 5KEJA 3LEFA 3VURA 2Z9SA 3TRPA 4GXZA 2LRTA 3Q18A 1K0NA 1PA3A 1XWBA 1AQWA 3RHCA 2GT6A 4TR0A 3FYGA 3LSZA 2AYTA 2E7PA 1TP9A 2NPBA 2C0GA 2KHPA 4FQUA 3UJ1A 4I2TA 2KUCA 17GSA 2HT9A 4K1FA 4XHMA 4IJIA 3M8NA 3TKSC 1OC9B 4AF2A 1GL8A 3TDGA 2AB6A 4RI6A 3HCZA 3ZTLA 2MBSA 3GTUB 1A0FA 1R7HA 2TIRA 3ZVJD 4TR1B 3HDCA 3AY8A 2EIOA 2TRXA 1O8XA 4O7HA 5ENUA 3FZ5A 1OC8A 3GYKA 2QGVA 3KD0A 1Z5YE 2ON7A 2XC2A 2P5QA 3QCPA 1J0FA 2GSSA 1M2DA 3PR8A 4K0GA 5CAXA 1A8LA 1JLVA 1K0BA 2C0DA 5EVOA 3JCML 2FWHA 1VRSD 2HZEB 2VLTA 2H74A 2VCZA 2HZFA 2YV7A 5J9BA 4K6XA 4AJ8A 5IPHA 1N8JA 2O89A 2CVBA 4Q5RA 3BCIA 5IMAA 1E6BA 2CAQA 2H6ZA 1DSBA 3IE3A 1TXXA 1GSDA 2CQ9A 4ACSA 1F9MA 1ZL9A 2L6CA 5IOWA 6GSWA 4NPBA 2H75A 4F0BA 1OYJA 1O6JA 1YJ6A 2KP2A 1RW1A 1GUHA 1GSFA 3V1WA 1AQVA 12GSA 4EXJA 5ID2A 3RHBA 1PL1A 4PXOA 2C3TA 5HR3A 5G5FA 1PKWA 3LXZA 1GTBA 3M9JA 3ZMLA 2HRKA 1K0CA 5CRHA 1PKZA 1B4PA 2K8VA 3DVXA 2YCDA 4TR4A 3LFLA 5J3RA 5ECMB 2MMAA 4D73B 2B5XA 1Z7PA 5HR0A 2TRCP 2VD1A 1EEMA 1GLPA 2DJ1A 3IRAA 1LU4A 5DAKA 4EDZA 4FIWA 4EL1A 4KE3A 2HFDA 1EWXA 2H71A 1DBYA 4IHUA 5JCWA 2DJJA 3FW2A 1PMTA 2H30A 2E0QA 3IV4A 2O85A 1Y6EA 1TRWA 1JZRA 5ELGA 4JE1A 4NHZA 3KM6A 2FHEA 4ECJA 4G9HA 4XS4B 4ML1A 1G0TA 5KN0A 4XS1A 5KN1A 2C0FA 2R5GA 5A5KA 1W89A 2X64A 2VCVA 4GQFA 1SJ6A 3EURA 2YN1A 4DVCA 1EP7A 3VLNA 1WE0A 1NHYA 13GSA 1R26A 2X8GA 3DIEA 5ECPB 3GFKA 5KN2A 3FZAA 7GSSA 1JFUA 4HQSA 2X99A 1NSWA 3EINA 3UIWA 4O5RA 3SBCA 1BG5A 1X9MB 4MDCA 1X5DA 3EMPA 4GRFA 3CYNA 5D8IA 4BA7A 1RK4A 4IKHA 4ZXGA 3O76A 4K7IA 1WRYA 2VL2A 1SD9A 4BVXB 1WOUA 3HKRA 2J23A 5DJLA 2MBTA 4PUFC 4ZB6A 4L0WA 4ZBAA 4BL7B 1ERVA 5CRGA 4EUYA 2HRAA 2OJLA 4IS0A 3HHVA 2L59A 4MZBA 4IP6A 2ZCTA 3C8EA 2VL9A 1B9XC 2GQLA 2IFQA 2LUSA 2PERA 1MDJA 1YKAA 2VAFA 4MA9A 2H8LA 3DD3A 2G0FA 5IMVA 4JBBA 4KGIA 3GSSA 3ME8A 2V6KA 2EIQA 4HU7A 2F8AA 4HU9A 5LNKe 3GIXA 1OKDA 1TU7A 4K2DA 3MWHA 3A2XA 4LMVA 3BOAA 4MPGA 3DWVA 2C3QA 3PPUA 1H75A 1ILOA 2GQMA 4POKA 3TKQA 1N2AA 5A4WA 2DIYA 3Q19A 2MYGA 5HFIA 4BWSA 3ZL5A 2DBCA 3KZQA 1VF3A 2LTKA 4MCUA 3BD2A 2JZSA 2K9FA 2QKEA 1FVJA 2VCWA 1ZYEA 4OFTA 2WDUA 1GSQA 3GA4A 1BYEA 4TXOB 5DALA 5BMUA 5F07A 1SKSB 1K3YA 2B5EA 2XBIA 1GWCA 2KOKA 3GHAA 1C72A 4K0NA 4TXVA 1URMA 4MMMA 3UVTA 3H93A 2HLSA 2NBSA 3WGDA 3QMXA 4K8MA 3VPTA 1RQMA 1PN9A 4HUAA 4TRXA 3UL3A 1ZMAA 1R4WA 3GNJA 4GF0A 1Y25A 3KMNA 1S3AA 1XWCA 2B6MA 5C00A 2DC5A 4IGJA 2YNXA 3R2QA 3PGTA 3FR6A 4L5LA 3F4SA 2VL3A 3ISOA 3CXGA 2K8SA 5AGYA 2O7KA 2R6KA 4HI7A 1X9WB 5J41A 4I2UA 2A4VA 4I6XA 4XCSA 5CO3A 3GURA 1OVNA 1XVWA 2I3YA 4I8BA 2OKAA 2GDRA 1A0RP 2RIIA 3P2AA 2M80A 2IL3A 1XWGA 2B1LA 4DSQA 4OFNA 1M99A 4KDUA 2DSAA 3E9JB 4HQZA 4PTSA 2XPEA 4MJBA 2H72A 3KCMA 4G0IA 1EEJA 1O85A 1U3IA 4KNDA 2L5OA 4DSSB 22GSA 2PMTA 4ISDA 4JZQA 4RUVA 3ERFA 18GSA 4F82A 6GSXA 4MLYA 3TJBA 1OE8A 4TOPA 1SYXA 20GSA 3F4RA 4IP1A 2IMEA 3O6TA 4ECCA 3US3A 10GSA 1T00A 4P3YB 2JADA 11GSA 1KEBA 2GLRA 3TRQA 1VF4A 2HRNA 3OR5A 3F6FA 3LQ7A 1PX6A 3Q74A 5CREA 2IJYA 3LXTA 4G0KA 3H1NA 2F9SA 1GSUA 3CSHA 2VIMA 1ERWA 1XW5A 5FWGA 2IMIA 5A4VA 1K0MA 1B4QA 4GLTA 1TK5B 3TJGA 4MF6A 4F2IA 6GSVA 1HYUA 4MJCA 2PU9C 1E2YA 2LNTA 4BVYA 4DEJA 2FY6A 3PH9A 1SKRB 1BEDA 2YZUA 4O92A 2HNLA 3HVXA 1KTEA 5JWQB 3H79A 1PGTA 1Z6NA 2NVLA 4X43A 3L9VA 3FR9A 3RPPA 1SJZA 1YF1A 1EP8A 2HRFA 4CHSA 1QGVA 2LEGA 3D5JA 3GKKA 4YH2A 2LV3A 5KN3A 3QAGA 1CQGA 3LJRA 3CRTA 2LRNA 2WJUA 1EGRA 3IXRA 5AIXA 1JZWA 3HVVA 2KLXA 1F3AA 1T7PB 4QL7A 2IMFA 4IVFA 3SWLA 5DCHA 4OO5A 3ZITA 4N30A 3VWWA 3ZZXA 2DJ2A 2I9HA 3TKSA 2YJ7A 1DUGA 3BJ5A 1I9DA 5CYYA 3H4KA 2FWGA 1F6MC 4PNGA 2HI7A 2LJRA 3FK8A 1MD4A 3QFBC 1TRSA 1U87A 4LMWA 1PL2A 1F37A 5CNWA 4HZ4A 3O3TA 4I5QA 5CRWA 3LWAA 4V1Ag 1XCCA 3D0ZA 2NTOA 3M1GA 5IIZA 1A8YA 1THOA 4MH2A 1PX7A 4ULXA 4CDOA 3HXSA 1Q4JA 1U6TA 4TN8A 3VWUA 6GSUA 4L0UA 1OC3A 4MH3A 3WGEA 5DBQA 4PURA 5IMCA 2HSHA 5DQYA 1UN2A 1WWJA 5G5EA 3ZFLA 1UVZA 3C1RA 2CZ3A 2V2GA 4NAXA 5ID2B 3HZ8A 4NV2A 2GSQA 3KXOA 2M72A 2AHEA 2LNSA 3VFIA 4G2EA 9GSSA 5HQPA 3TOUA 4O32A 1YDKA 4ZBDA 4NMUA 1HQOA 3GMFA 1M9AA 1GTAA 2H1DA 5GSSA 1XVQA 3VPQA 1FAAA 5D9VA 4E8HA 3M9KA 1JLWA 4ZB8A 1M9BA 5DAKB 3IDVA 2JACA 3APQA 1PD21 2JZTA 6GSTA 5D96A 1XW6A 3ME7A 2LRCA 3ZVJA 1MTCA 1A2LA 1QK8A 1XIYA 4YAPA 3ERWA 4WR4A 5ECNB 1MDIA 3EC3A 1SK2A 3NZNA 4ZL8A 3VK9A 3WGXA 1YEXA 1SYRA 2FA4A 2CV4A 4MJAA 1X5EA 2L6DA 1ZZYA 2E2MA 2A2SA 1TJDA 1FB0A 2AV4A 2HXKA 2RUFA 2V1MA 1TU8A 2AUVA 2LJAA 5GZZB 1T8EB 5D73A 3RPNA 1TK0B 3VWXA 3KEBA 2PVQA 1TW9A 1EOHA 3C1SA 3WT2A 2CVDA 4V2MA 1WJKA 3IAM2 5CP1A 4HJ2A 4ZL7A 2DJKA 3G7YA 1QFNA 2H19A 6GSSA 1Z9HA 1XZOA 3L4NA 3DMLA 4J57E 4N10A 3A3TA 1A2JA 1BQ7A 5A4UA 2H66A 1G6YA 4KCEA 3W8JA 5ECLB 1EV9A 4GSNA 4JR4A 2LSTA 4ZBBA 3GUSA 1TTZA 1GRXA 5D9WA 1X9SB 3GX0A 4TW5A 3A2WA 4ID0A 3BCKA 3N5OA 5CRDA 2WB9A 5HFGA 1HNBA 2FNOA 3P90A 3IK7A 3HZ4A 1X5CA 4TVEA 2IFQB 3LYPA 2B3SA 2HSYA 5C04A 2O8VB 1JZOA 2H01A 4EKZA 2CT6A 4WF5A 3EU4A 3ZYWA 2J9HA 1WMJA 1MDKA 4XIHA 1VF2A 4Q5NA 2B7JA 2A2RA 1G7EA 3GN3A 1S3CA 3F8UA 5D9XA 2F8FA 2YJHA 1MD3A 3D4MA 1KBNA 2VO4A 2HYXA 2WFCA 1EOGA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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