4EHCA

Crystal structure of the c-terminal domain of rv0977 of mycobacterium tuberculosis
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
293
structure length
280
Chain Sequence
GSSHHHHHHSSGTLTNATVPLQLVNTTEPVVFISLNGGQMVPVLLDTGSTGLVMDSQFLTQNFGPVIGTGTAGYAGGLTYNYNTYSTTVDFGNGLLTLPTSVNVVTSSSPGTLGNFLSRSGAVGVLGIGPNNGFPGTSSIVTAMPGLLNNGVLIDESAGILQFGPNTLTGGITISGAPISTVAVQIDNGPLQQAPVMFDSGGINGTIPSALASLPSGGFVPAGTTISVYTSDGQTLLYSYTTTATNTPFVTSGGVMNTGHVPFAQQPIYVSYSPTIGTTT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PE-PGRS FAMILY PROTEIN
publication title Crystal structure of a putative aspartic proteinase domain of the Mycobacterium tuberculosis cell surface antigen PE_PGRS16
pubmed doi rcsb
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 54
structure length 280
sequence length 293
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-04-02
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4ehcA00
3URLA 5FIVA 2ZJMA 1F7AA 5P0NA 3ZPSA 1KJGA 3CKTA 1YTHA 2V16C 5P8VA 3OUAA 6APRE 3FSMA 4L7JA 5P2EA 3SACA 4FM8A 3KMYA 3U7SA 5P47A 3OU4A 3UQXA 3EL0A 1J71A 1PFZA 4F76A 1APVE 2HB4A 1C6YA 1Z8CA 2AOFA 4XXSA 5P13A 3TOFA 4RVXA 3WB5A 1AJXA 4XX3A 2R38A 4LBTA 2H6SA 5P15A 5OZ7A 4DV9A 5OZCA 3SKFA 5P3GA 2NMYA 1AXAA 5OZXA 1K6VA 5SY3A 3ZMGA 1GVTA 3ZKIA 1EPRE 5P5HA 4AUCA 5P61A 3BUGA 3SA9A 1D4YA 4XKXA 4Q1XA 3IN3A 2I0AA 3VV6A 2QHCA 3O9LB 5P4JA 4JPEA 4Y56A 1AZ5A 3PMYA 5P8HA 2RKGA 1HVIA 1MT8A 2H6TA 3NU5A 4YCYA 1YG9A 2VJ7A 3EXOA 3OU3A 2IKUA 5EZXA 1AIDA 5P4FA 1ODWA 5P11A 3KN0A 5P5PA 1SIVA 1M4HA 4QLHA 1W6HA 3D1ZA 3L5FA 2VA6A 2VJ9A 3O9CA 3Q4BA 5P5VA 4EPJA 3ZKNA 2I4XA 2FDEA 3BC4A 5ISKA 3QN8A 4AZYA 5P57A 4K4QA 3GI4A 3NUOA 3PEPA 4I0IA 1OD1A 4EQ0A 5P88A 4Y35A 4YBFA 5P86A 1M0BA 2IENA 2G24A 1FEJC 5P6DA 1C70A 3LIVA 5OZUA 1ZBGA 4R91A 2NXMA 1EPQE 2VA5A 5DGWA 1DPJA 2NXLA 5P7MA 2AZCA 5P0CA 2QCIA 2B7FA 3VLAA 3EM4A 5HDZA 5BS4A 1W5VA 3HAWA 1NPAA 3OOZA 2RSPA 2B60A 4KE1A 3ZPTA 5P3VA 1MRXA 5P3CA 4CPXA 3JVWA 4R92A 4Q1WA 1G0VA 1KJ7A 5J25A 4NJVA 1D4JA 3INFA 3KM4A 4Q1NA 5P4DA 5P2LA 1FMXA 5P8MA 3ZKSA 5P06A 2A1EA 5P6EA 3D20A 3MSKA 1HPXA 5P1XA 4KUPA 4ACXA 3GGUA 3QI1A 4TVGA 4RROA 4Y36A 3ST5A 4K4RA 4Y5EA 3VEUA 3OGPA 5OYQA 1IZDA 4LXMA 3EL4A 2WF1A 4LL3A 5P3YA 3TPRA 4YA8A 1G6LA 3INDA 5P6LA 2ZDZA 1MVPA 3RTHA 1XS7D 1HXBA 4TVHA 3TPJA 3LPIA 3H0BA 5P1IA 2WKZA 4I0FA 2FLEA 5P36A 2ASIA 1BIMA 4QJ6A 3NDWA 5P0QA 3D1XA 4YDFA 3O9LA 4OBDA 5P4SA 1HVJA 4COEA 5P31A 5P8KA 4FGXA 5IVSA 5IS4A 2VNNA 4OBZA 2AQUA 5COPA 1PSOE 4Y58A 2FGUA 3OWNA 5P2BA 4HE9A 4ZIPA 1W5WA 3KYRA 5HE4A 3ZPUA 4DJVA 4DQGA 1BV9A 4I8WA 4RYGA 1B6MA 2IGYA 3I2LA 3CYXA 3O9AA 1FG8C 4ZPGA 2ZJNA 5P07A 2FNTA 4Y5PA 3TTPA 3C9XA 5P12A 5DQ4A 1APUE 5KR1A 4Y43A 2XYEA 5P82A 3AIDA 4XX4A 1HOSA 3SA7A 1HXWA 5OZ0A 2G1SA 4Y5GA 1QDMA 1Z1HA 3HLOA 5P4UA 3UHLA 1FQ8A 5P4PA 3S45A 1EC1A 4J0YA 2WF0A 3PWMA 1PPKE 5P5EA 1UH7A 3DV1A 4LC7A 2BPWA 5P4CA 4J17A 4B77A 5P2HA 1HIHA 5P4YA 3L5EA 5P7FA 3URJA 5OZJA 4Z2ZA 2QD7A 5P6BA 3VLBA 2PYNA 2QI4A 3NU6A 5AH7A 2V12C 4AA8A 4J0PA 1HBVA 3PLLA 5OYVA 5P58A 4Y3RA 1E81E 2QD6A 1B6KA 3KT2A 4I10A 4ER4E 4D8CA 1BAIA 4I1CA 1ODXA 3GI5A 2O4SA 3PJ6A 4OBFA 1BILA 5P5RA 4HZTA 5P7EA 5OYTA 3CKRA 3EMYA 5P0IA 1HVSA 3TKWA 1HIIA 4NJUA 1HPOA 5P8CA 5P14A 3KMXA 3TPPA 2BKTA 3TOHA 4E43A 2QMDA 2R3WA 3UPJA 2AVVA 3O99A 3OQKA 3UQWA 1C6ZA 3HD8A 3TPLA 5P5CA 4ZEAA 4GMIA 1K6TA 5P7OA 1E82E 1GKTA 4Y3AA 3T7QA 5P3ZA 2QI3A 4PZXA 2WEZA 5I3VA 5P32A 3R0YA 1E5OE 5P0VA 5P7VA 5P7PA 2AOHA 3EKWA 1IZEA 4Y3WA 4J0ZA 2PSUA 2JXRA 4MC2A 4B1EA 1EAGA 2PMAA 2G69A 5P1SA 5P8FA 5P5ZA 5P1EA 4DQBA 5P8EA 1MTRA 5P7RA 1BDQA 3DOXA 5P2QA 1CMSA 3TKGA 3MXDA 4MC6A 2BQVA 4Y44A 4YCKA 1IZHA 2ER9E 5P08A 5DR8A 2XFIA 2P8HA 3CIDA 4RZ1A 2RMPA 1YTJA 5OYYA 1HVLA 3FNTA 5P4VA 2F8GA 4BEKA 4H3FA 3PBZA 3IAWA 3R4BA 5P1PA 3PSUA 4ZSRA 5OZMA 2QZXA 5P5FA 5DQ2A 4D88A 2VIZA 5P3TA 4Y3PA 5P2OA 1ZPKA 2I4QA 2ZHRA 5P8LA 2OHRA 5P7WA 3PM4A 2NPHA 1PSAA 3D1YA 1WKRA 1W5YA 3EL5A 5P00A 4EP3A 5P3EA 5P30A 5P7BA 4N00A 2F80A 5OYUA 4DFGA 2IQGA 5P1UA 3EKYA 5P2NA 4Y3YA 1B6LA 3QP0A 3UDMA 5P22A 3K5CA 5P6VA 5DR7A 5AGZA 4ER1E 2QZKA 5P37A 1D4SA 4K4PA 4RLDA 3OUDA 5P49A 5OZ1A 4ZPEA 4Y4WA 1EBZA 1LYBA 3QRSA 5P03A 1LYAB 2MIPA 4CP7A 1XN3A 2QI7A 1FF0C 5OZTA 4J54A 2BB9A 2ER0E 5P5OA 4Y39A 3ZL7A 3BRAA 4B1CA 5P3KA 2R43A 1D4LA 3PHVA 4EYRA 4A6CA 3TLHA 2FGVA 4Y4GA 4KE0A 5P6RA 5P8RA 1PSNA 2VIJA 3VSWA 2NXDA 3K5FA 2IS0A 2QI1A 3HZCA 1T7KA 3SA6A 1A94A 1G35A 1XL2A 4M8XA 3L38A 2QP8A 4FM6A 5OZ8A 3PCZA 1YM2A 5P5AA 5P2CA 5AH8A 3SA5A 3VF5A 3ZKQA 3S43B 3O9HA 1B5FA 2PK5A 1MIQA 2Q55A 3I25A 1NH0A 1ME6A 1MERA 2BPXA 5P8TA 5P8DA 3HW1A 4OBHA 2AZ8A 2QAKA 4DQFA 5P34A 5P5UA 2OHSA 2NMZA 1K1TA 5P4TA 3FV3A 3PGIA 5P72A 4CPSA 2QD8A 5P87A 2HPEA 2F3FA 3IXKA 2I4WA 5IVTA 4Y3EA 5P0OA 3L59A 4YDGA 1AAQA 2QNQA 4ZE6A 4WY6A 4NKKA 5IVQA 4Y9WA 4J1FA 5P16A 1HSIA 1LYWA 1GNNA 2ZHSA 3SFCA 2QI5A 1QBRA 1SBGA 3UDNA 2AZBA 2ZHUA 2QU2A 4Y4DA 1TCXA 1KJ4A 1W6IA 5DQ1A 2WF3A 4J5JA 3VG1A 1MESA 5KOSA 4KB9A 2VA7A 1OEXA 2BJUA 5P7KA 3BGBA 5IE1A 3MXEA 4FAEA 2V10C 5P02A 2PK6A 5P44A 3OADB 2WEDA 4J0TA 5C9FA 3QPJA 3PSYA 3TNEA 5P7SA 4TRZA 3OU1B 4DJXA 5P3OA 4DH6A 3S8IA 3AUPA 4LP9A 4Z22A 2OHTA 5P68A 3VV7A 1IBQA 3EKVA 3QAAA 3EKTA 5P10A 1MT9A 3BVBA 2AOCA 3JW2A 2R8NA 4WTUA 5P8AA 1BV7A 5OZZA 5P83A 2QHZA 1PROA 4L1AA 5P0UA 1LYAA 5P7AA 4GYEA 1QS8A 5P29A 4HDFA 1MSNA 5P6PA 1SGUA 4AMTA 5COOA 4ZSMA 1AVFA 5HU0A 1APTE 1TQFA 2CEMA 3I6OA 3G72A 2Z4OA 5BWYA 5P0XA 5P2VA 5P2ZA 5OZ3A 5P2YA 5OZ6A 2B8LA 5I70A 5P3MA 3JVYA 3O9DA 5HCOA 1EPLE 3OAGA 3R2FA 5P2XA 2V13A 5P1NA 5P3XA 4H3IA 5P28A 3WB4A 4BFDA 5P5TA 4I0ZA 1D4IA 3DM6A 3KFNA 3MWSA 7UPJA 3O9FA 4OC6A 2OHQA 5P04A 4I0HA 2I4DA 4DJQA 1DP5A 1GVWA 2OHMA 2HB3A 2J9JA 5P60A 3MSJA 5P3AA 4YD7A 4FL8A 2FXDA 5P1AA 1YT9A 2R5QA 5AHCA 4EJKA 6UPJA 5P1MA 3DV5A 1EPPE 2G21A 2ZJJA 3L58A 3KDCA 4Y48A 1B11A 3UDRA 5P0MA 4QJ7A 5OZOA 3LZYA 3PBDA 3EL9A 4Y54A 5P1YA 2F3EA 2P3BA 3HDKA 5P1VA 5P2WA 1K6CA 1GVUA 1YTGA 3VYFA 2NR6A 5P1FA 2XFJA 5P2AA 1LZQA 5P70A 4F74A 5OZRA 3PWRA 4CPWA 5P7GA 4JOOA 4F75A 4CPTA 2G27A 3ZOVA 4A6BA 5P4MA 5HCTA 4L7HA 4B78A 2BPZA 2QHYA 3OQFA 5P19A 3LZUA 3GI6A 5P3SA 5P6XA 3VYDA 4QJ2A 4Z50A 4YD4A 3SABA 4D85A 1HWRA 5P4IA 2SAMA 5P1OA 5P5DA 4J1CA 3DJKA 3OU1A 4GIDA 2WF2A 3OQAA 5P67A 1LS5A 5P09A 4RCEA 1WBMA 4Y5MA 5OZIA 2Q64A 2IGXA 5P63A 4FM7A 5P79A 3HVPA 1HPVA 3VF7A 2V00A 5KQXA 4GJAA 5P7QA 2QMGA 1SMRA 2IEOA 3TL9A 4Y41A 4EWOA 4ZSQA 5P18A 1QRPE 4FRSA 3B7VA 3IA9A 1APWE 9HVPA 5P4NA 5P7ZA 3B80A 5P6ZA 1FGCC 5JODA 4Y3TA 5OZPA 3SO9A 3QROA 5P23A 1OHRA 2WEBA 5P7NA 1ZLFA 3K5GA 1HVRA 5JFUA 5DGUA 5P4XA 5OYRA 3U71A 4PZWA 4HDBA 3VFAA 5OZ2A 4DJPA 5P6YA 1D4KA 4Y45A 4I12A 4DVFA 5P3HA 5ENKA 4Y53A 5P56A 3NDXA 1F34A 3OK9A 5P26A 3K5DA 2ER6E 3KDDA 2FIVA 5P6AA 2WL0A 5P39A 5I3WA 5P0GA 4GJDA 3URIA 3CYWA 3I7EA 5P0BA 3FNSA 4TRWA 4RRNA 1EPOE 5P1JA 3NUJA 4X2LA 5COKA 5P25A 3SM2A 1EBWA 1FQ6A 2CEJA 1SDUA 2WHHA 4YBIA 5OZHA 5KQYA 3FNUA 1META 2G1OA 2OF0A 5P7LA 3EBZA 3QRMA 3RTMA 5OYXA 3EM6A 5P2UA 5OZAA 5P69A 5OZEA 5P7UA 4Y47A 4Y4AA 3SA8A 5P6MA 5P2IA 4I0EA 5OZKA 1GVVA 4DQCA 2QZWA 5P8NA 2PH8A 4Y3JA 1SMEA 2JJIA 4Y51A 3EL1A 4J1HA 5E5JA 5P0RA 3VUCA 4I0GA 2G94A 3LPJA 2FS4A 3NXNA 5DR3A 5P59A 5P7HA 4Y5LA 4JP9A 5P78A 3S56A 1XDHA 5ER1E 5OZDA 2F3KA 3SPKA 1KJFA 1QBSA 2ZJLA 1RV7A 1K6PA 5P6GA 4DPIA 5KQFA 3NU9A 4EHCA 3TH9A 2F81A 3OXWA 1Q9PA 4Y6MA 5P4AA 4CKUA 3L5DA 2JJJA 5P7IA 3QBFA 4EQJA 1SDTA 2Q54A 2ZHTA 3N3IA 5P43A 5HDVA 3FIVA 3S7MA 8HVPA 3IXJA 1NPVA 3VFBA 4L6BA 2JE4A 4Y3FA 1VIJA 5P84A 4AA9A 4K8SA 1WBKA 2QU3A 5ER2E 3UDHA 3BUFA 4YE3A 1Z1RA 2FDDA 5B18A 4Y3DA 2HPFA 2APRA 1HSHA 3HVGA 2BBBA 4PHVA 1HIVA 3S7LA 5P3QA 3S53A 5P6NA 2B7ZA 2I0DA 2RKFA 3MSLA 3LIYA 4QJAA 2G1YA 5P5SA 3PI5A 5P46A 3VCMA 4X7IA 3OXVA 5P4KA 5HE5A 3WZ7A 3OOTA 2PC0A 5P8SA 4Y50A 5OZGA 3KFRA 4LXKA 4FCOA 5P0AA 5P1KA 2Q63A 1HEFE 5P1RA 5P01A 5P1CA 2VKMA 5P45A 2B8VA 3WSJA 1ZPAA 3O9GA 1LV1A 3PI0A 5AHAA 5P62A 5P4WA 5P1DA 1ENTE 4R95A 1CZIE 4DUSA 3NSHA 3VSXA 4CMSA 5P41A 1A9MA 4DJYA 5DPZA 2P4JA 5ENMA 4Y5BA 5P76A 5P48A 5P6CA 2FDPA 4B72A 2AVQA 5OZNA 1BXOA 2PQZA 4D89A 3LINA 3VF3A 4PYVA 5P64A 5P42A 2EWYA 4Y5NA 5P8BA 5P2GA 3TOGA 5CLMA 4QJ8A 2A4FA 2BPVA 3ZKXA 2ANLA 2NNKA 5P4RA 5KR0A 1W50A 1B6JA 4HDPA 3OXXA 2Z54A 3R0WA 3PVKA 5E5KA 7HVPA 3OUBA 5P6SA 4I11A 2O4PA 5P6UA 1YTIA 3UQPA 5OYZA 2UPJA 3O9EA 3SM1A 3NYGA 5P54A 4D83A 1G2KA 5F01A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3URL A;  5FIV A;  2ZJM A;  1F7A A;  5P0N A;  3ZPS A;  1KJG A;  3CKT A;  1YTH A;  2V16 C;  5P8V A;  3OUA A;  6APR E;  3FSM A;  4L7J A;  5P2E A;  3SAC A;  4FM8 A;  3KMY A;  3U7S A;  5P47 A;  3OU4 A;  3UQX A;  3EL0 A;  1J71 A;  1PFZ A;  4F76 A;  1APV E;  2HB4 A;  1C6Y A;  1Z8C A;  2AOF A;  4XXS A;  5P13 A;  3TOF A;  4RVX A;  3WB5 A;  1AJX A;  4XX3 A;  2R38 A;  4LBT A;  2H6S A;  5P15 A;  5OZ7 A;  4DV9 A;  5OZC A;  3SKF A;  5P3G A;  2NMY A;  1AXA A;  5OZX A;  1K6V A;  5SY3 A;  3ZMG A;  1GVT A;  3ZKI A;  1EPR E;  5P5H A;  4AUC A;  5P61 A;  3BUG A;  3SA9 A;  1D4Y A;  4XKX A;  4Q1X A;  3IN3 A;  2I0A A;  3VV6 A;  2QHC A;  3O9L B;  5P4J A;  4JPE A;  4Y56 A;  1AZ5 A;  3PMY A;  5P8H A;  2RKG A;  1HVI A;  1MT8 A;  2H6T A;  3NU5 A;  4YCY A;  1YG9 A;  2VJ7 A;  3EXO A;  3OU3 A;  2IKU A;  5EZX A;  1AID A;  5P4F A;  1ODW A;  5P11 A;  3KN0 A;  5P5P A;  1SIV A;  1M4H A;  4QLH A;  1W6H A;  3D1Z A;  3L5F A;  2VA6 A;  2VJ9 A;  3O9C A;  3Q4B A;  5P5V A;  4EPJ A;  3ZKN A;  2I4X A;  2FDE A;  3BC4 A;  5ISK A;  3QN8 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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