4ER4E

High-resolution x-ray analyses of renin inhibitor-aspartic proteinase complexes
Total Genus 65
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
65
sequence length
330
structure length
330
Chain Sequence
STGSATTTPIDSLDDAYITPVQIGTPAQTLNLDFDTGSSDLWVFSSETTASEVDGQTIYTPSKSTTAKLLSGATWSISYGDGSSSSGDVYTDTVSVGGLTVTGQAVESAKKVSSSFTEDSTIDGLLGLAFSTLNTVSPTQQKTFFDNAKASLDSPVFTADLGYHAPGTYNFGFIDTTAYTGSITYTAVSTKQGFWEWTSTGYAVGSGTFKSTSIDGIADTGTTLLYLPATVVSAYWAQVSGAKSSSSVGGYVFPCSATLPSFTFGVGSARIVIPGDYIDFGPISTGSSSCFGGIQSSAGIGINIFGDVALKAAFVVFNGATTPTLGFASK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase/hydrolase inhibitor
molecule keywords ENDOTHIAPEPSIN
publication title High resolution X-ray analyses of renin inhibitor-aspartic proteinase complexes.
pubmed doi rcsb
source organism Cryphonectria parasitica
total genus 65
structure length 330
sequence length 330
ec nomenclature ec 3.4.23.22: Endothiapepsin.
pdb deposition date 1991-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
E PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4er4E02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 4er4E01
3APRE 3OQ7A 3SM1A 4Y39A 5P6GA 2V11C 4H1EA 5P52A 3UFLA 5P54A 4Y4BA 3FV3A 3WZ7A 2FLEA 4FIVA 4ACXA 2R43A 2IGXA 1GVTA 4FM8A 5P56A 3OOTA 2VA6A 2NNPA 5AH6A 3S43B 5P6VA 5IE1A 4R93A 3TH9A 2ZGAA 3OU4A 4EJDA 1GVVA 4AA9A 5P68A 3LZYA 4F75A 1UH8A 1G2KA 5P1HA 5ENKA 3UTLA 3T7XA 5P2IA 1AXAA 4J1IA 5P07A 5P8TA 2OF0A 4Y51A 1XN3A 4ZPGA 5P20A 4B70A 2P3CA 3OXXA 3ST5A 3S45A 5KR2A 5COOA 5P1JA 3VYDA 5P7CA 1TCXA 5P03A 1IDBA 4B72A 2O4NA 2NNKA 4YBIA 4HDPA 5P0FA 3BGCA 5P2FA 3MSKA 5P59A 4QLHA 3BXSA 1HOSA 2F3FA 5P8BA 5P4SA 5P12A 2NMYA 2Q55A 2UXZA 5P7LA 3EKYA 1K2BA 5P40A 3UQPA 4YD5A 3PRSA 3OGQA 4UPJA 2OHUA 3QROA 1ODYA 2B8VA 2VA5A 4MC6A 5P89A 5P5LA 5P4DA 3WZ6A 5P3OA 5SZ9A 5OZ2A 3G6ZA 1GKTA 5P0SA 5P74A 2PH6A 4EHCA 2PYNA 1HVHA 2OHSA 5FIVA 3SABA 2O4LA 5P4BA 4EJ8A 4Y3NA 3BUFA 5HE4A 5P6JA 1KZKA 5P62A 4I0HA 2RMPA 5P6HA 3OADA 5P5CA 1BVGA 5P64A 4FRIA 5KAOA 3NDTA 1SGZA 2QHCA 4YOAA 1YTHA 5P6MA 2RKGA 1FQ5A 1SH9A 5P5ZA 5P1UA 4OBGA 1NPVA 1MT8A 2WEDA 4DQHA 3UDKA 1EBKC 3I8WA 4WTUA 3O9DA 5P2BA 1LZQA 1HSGA 3URIA 3OU1A 4TVGA 3LIZA 3PI0A 3D91A 4DQCA 4OBZB 2BPWA 1ZBGA 3DCRA 1AM5A 5P3WA 1IDAA 1ZLFA 4DVFA 3IXOA 5SY2A 5P2XA 2AVOA 5AH9A 1WBKA 1UH9A 1FMUA 4HE9A 4Y3QA 3OK9A 3K4VC 5P50A 5P5YA 1MT7A 5F01A 3HLOA 1B6JA 2ER7E 2PH8A 3TNEA 4APRE 3OQKA 4ZIPA 5P6XA 3ZKXA 1GNOA 3HAWA 3EKQA 5P28A 2JE4A 3O9FA 5P0AA 1XE5A 2QHZA 2QZLA 5OYVA 3CKPA 5P7GA 4Y50A 1FQ7A 4Y3HA 5P1WA 5P8LA 5P3CA 3ZMGA 1HSIA 3FIVA 3INEA 4CPWA 4J1CA 1SBGA 3ZPUA 1DIFA 2IL2A 4J1FA 2PMAA 2FNSA 3OWNA 5P5MA 4JPEA 5P3ZA 4Y3WA 2G21A 5OYXA 3GGVA 1OEWA 3DOXA 4Y48A 4D83A 4Y5NA 5P2KA 5P4RA 5P63A 4Y3LA 1FQXA 5I3YA 3VG1A 3FX5A 5P38A 1B5FB 4GMIA 5P42A 5P0TA 2IKOA 5P1SA 1PPME 2WF3A 3R2FA 3SFCA 5P7FA 2PWRA 3NU3A 3OU3A 1GNNA 4Y5KA 5P5HA 1F7AA 3Q5HA 3NDXA 3ZKNA 1LYAA 4ER4E 6UPJA 1QBUA 1BV7A 1LV1A 5OZ6A 1M4HA 3PBDA 5KQFA 1HTFA 4HZTA 1YTIA 5P6BA 4WY1A 5P7JA 2A1EA 5P09A 4DFGA 4KB9A 1G0VA 3RTHA 3MSLA 4Z4XA 4NJVA 4YE3A 1XDHA 3VLAA 5P4AA 4Y43A 5P3FA 2APRA 3VLBA 4QJAA 4XX3A 4Y3ZA 4LC7A 1LYBA 5P24A 5P6UA 4I11A 4HEGA 1D4HA 4ZPFA 4EXGA 5OYSA 5OZAA 3S53A 1FMBA 3PMYA 4L7HA 4K8SA 5AGZA 5P5VA 3EL4A 4D88A 3KFSA 3L5FA 1K6VA 3LIXA 3ZPTA 5SY3A 5P8DA 4CKUA 4YHQA 3OGPA 5P60A 3OXCA 4Q1YA 1EBWA 2G20A 3UDNA 4FAFA 3L3AA 4ZE6A 2PYMA 5P22A 3SA7A 3HVGA 4B1DA 4DJUA 4J17A 5P61A 3K5CA 4JECA 5OZTA 4RVXA 2HB3A 1EPOE 5DR7A 1C70A 3TPRA 5P4NA 4B00A 5OZOA 1META 3B80A 4RVIA 2WHHA 3G70A 3KFNA 4H3FA 3IXKA 4DJWA 3IVHA 5P19A 2F81A 5BWYA 3SACA 2I0AA 5P8PA 2Z4OA 4HA5A 5P3NA 5P7ZA 4Y38A 4F76A 3NU5A 4CPQA 1ZJ7A 5P5NA 3I7EA 5P88A 1W5VA 3K5FA 1N49A 4ER1E 4OD9B 2I4XA 3R1GB 4Q1NA 2NPHA 2ZHVA 4RLDA 5P7KA 3OU4B 2WL0A 1XN2A 5AH7A 5P5EA 2HS2A 5P2YA 4YDGA 2FNTA 4IVSA 1EPQE 3OQAA 2ZJIA 2AOGA 5P4MA 1CMSA 5P76A 3OOZA 5P3RA 1K6CA 5IVSA 5P7YA 3ZKMA 2QNQA 4H3GA 5P6KA 1D4KA 1VIJA 4K4RA 5P5TA 5HE7A 3VSXA 5OZ5A 2IS0A 2AZ8A 4RVJA 5P3QA 2AVMA 2Q5KA 3LZUA 3JVWA 2J9JA 5P4GA 5C9DA 3WZ8A 5E5JA 5P0GA 2B60A 1EC2A 5OZQA 2G26A 3SKFA 3OHHA 2OHPA 3T11A 1KJ7A 2MIPA 1K1UA 1HVKA 4I8WA 5P6RA 3I25A 1A8GA 4GYEA 4FGXA 3Q4BA 5P8IA 1T6EX 5P1GA 3UDPA 1GVUA 2BQVA 1LF2A 5P0KA 5I70A 3BC4A 4AUCA 5P5WA 2WECA 2RKFA 1FQ4A 4Y3XA 5OZDA 1PFZA 5P8FA 5P8KA 1SMEA 3UFNA 2QNPA 2H6SA 3NLSA 5P4TA 3O9EA 2AOJA 5P06A 3INFA 3MXDA 4RCFA 4Y4GA 1YX9A 2O4PA 3ER5E 3DJKA 5P45A 1EPRE 1W6HA 1ER8E 1FMXA 3NUOA 5P2HA 3TPLA 3OADB 5CONA 2AOIA 4EWOA 4JOOA 2BB9A 3T3CA 4QJ6A 5OZPA 5P4VA 5OZRA 5P48A 2FMBA 2XFKA 5DPZA 2HM1A 4QJ7A 1AVFA 4DJVA 2I4QA 1MVPA 2G69A 5P5IA 2P3BA 5P3DA 3B7VA 1XE6A 5P79A 3PCWA 3NXEA 5OZCA 5OYRA 4EXHA 4Y5GA 5P5RA 2HIZA 3EM6A 1DAZC 3BVBA 5P0DA 4Y4WA 3FKTA 2QAKA 3NR6A 4I0EA 4TRZA 1RQ9A 5OZKA 5P2AA 5P4XA 3SA4A 5P46A 3SPKA 3SA6A 1HWRA 4ZEAA 4DQFA 2ER6E 1RV7A 4A6CA 3VYFA 1E82E 3H5BA 2PSUA 4Y3TA 1YTJA 5C9BA 5P5JA 1D4SA 4YA8A 2Q63A 3LPJA 5P29A 5P8HA 1MSNA 2Q3KA 5P43A 1FKNA 5P3XA 3QAAA 3C9XA 5P1LA 5P31A 4Z2ZA 3BRAA 1K6PA 4GJAA 5DGWA 4OBHA 4Y3AA 2NXMA 2XYEA 5P2TA 4COEA 5P58A 2VJ9A 5P2SA 4BFBA 5P71A 3NWQA 1Z1RA 3EL0A 5P1MA 3O9LA 1E81E 3PMUA 5I3WA 2PC0A 1HPSA 3S56A 1BAIA 5BS4A 3IXJA 1FQ6A 1Z8CA 2V00A 1M0BA 5P1PA 5P1XA 5P6NA 6APRE 2NXLA 5APRE 4KE0A 4DJXA 1EEDP 5P1VA 2IRZA 4XX4A 2G94A 4J0YA 3QRSA 3H0BA 4Y44A 5P1QA 4L7JA 5P11A 4M8XA 1DW6C 4Y5LA 5P5BA 1T3RA 3D1YA 1KJFA 1EC0A 3KMYA 2BPZA 4DV9A 2WF1A 1PPLE 1QS8A 4PZXA 2PK6A 5P33A 3NDUA 2HAHA 1XL2A 4H3JA 3RSXA 1SMRA 4EPJA 5KOSA 2AVVA 5P5AA 5P32A 5COKA 4Q5MA 3OUAA 5OYYA 1FFFC 1W5WA 5P70A 4GJ6A 1BBSA 5P0QA 5P7WA 3GI5A 5HDXA 5JFPA 7HVPA 1T6GA 3S2OA 5P3PA 4Y3MA 5P4EA 3UCBA 2QI5A 5P2OA 3ZL7A 4J0TA 4QJ2A 4LXKA 4YOBA 3EKVA 3HZCA 5P1CA 5P35A 3RSVA 3LZSA 1TZSA 4DJRA 5COPA 5P6CA 5KOQA 1HXBA 4BFDA 3O9CA 4J55A 2AVQA 3OXWA 3VV6A 2QI4A 5OZUA 5P13A 1K6TA 3EBZA 2BBBA 4WY6A 4I8ZA 3KT2A 5P02A 5P2GA 5P5GA 2VJ7A 1FFIC 5P2EA 4RZ1A 3KDDA 1MSMA 1D4IA 4APEA 2WKZA 4Y53A 2G22A 1W50A 5DQCA 4OBDA 4ER2E 4R92A 1DP5A 1ODXA 2FS4A 4U7QA 5F00A 1TQFA 2VJ6A 3QBHA 4RRNA 4Y3YA 4CPRA 5P18A 8HVPA 5P5UA 1XL5A 1B6PA 2V16C 3S7LA 4LAPA 2QU3A 2NMZA 5DR1A 4B1CA 4RCEA 5P0ZA 4PHVA 5OYTA 3TPJA 5P7OA 1HTRB 1APWE 5HTZA 1MEUA 3URLA 2F8GA 1SP5A 3FNUA 3KM4A 1MRWA 3VFBA 1ZSRA 4DJOA 3IVIA 4RYGA 5PEPA 3CKRA 1SDTA 2G27A 3CYWA 5P1EA 5J25A 3TPPA 3UF3A 1W5XA 4B78A 4J1HA 5OZEA 2AZCA 5OZ9A 5TOLA 3TKGA 3L5EA 2ER9E 3HW1A 4L1AA 5P4CA 5P75A 5P41A 3IGBA 5P25A 5P5SA 5P7IA 1EPME 2ZYEA 3LPIA 3O9GA 3PHVA 2V0ZC 5P44A 2OHTA 5DQ4A 3ZKQA 4Y4DA 5P2JA 2FDEA 3PBZA 1FG8C 2P3DA 3QS1A 5P86A 2J9JB 5P4UA 3O9HA 5P27A 2BPXA 4F74A 5SXNA 2CEJA 5AHAA 2VIEA 5HU0A 4DJQA 5OZGA 5P0RA 3O9BA 4R91A 5P4OA 2R8NA 2OAHA 1HXWA 1D4YA 5P8SA 5P55A 4Y4AA 3RU1A 2JJJA 4Y3RA 5OZMA 1MESA 1A8KA 3GI4A 1TSQA 1IIQA 4EYRA 5IVTA 4ACUA 5P1RA 3WB5A 4Y4ZA 5JG1A 3LINA 4OBKA 1EAGA 4K9HA 5EZZA 1BWBA 1TW7A 1HIVA 4NJTA 5AHCA 4R5NA 3K5GA 2NTRA 1C6XA 2UY0A 1IBQA 4J5JA 1AIDA 4J0VA 5BRYA 3S43A 5P69A 3S7MA 1HEGE 1SIVA 2P3BB 3IN3A 1IVPA 5P7RA 5P3YA 4CPUA 5P5PA 5P3KA 2IQGA 4YD3A 1MTRA 5DR8A 3L59A 4Y4JA 1ZPKA 4I10A 3U7SA 5P2MA 3QRMA 5P01A 1ENTE 4LHHA 3PJ6A 5P4ZA 4Y47A 1F34A 3D1ZA 3DCKA 3QIHA 2FDDA 5OZNA 5P4YA 4EQ0A 3LHGA 2Q11A 2SAMA 3EL1A 5P8UA 5P4QA 5P3AA 2FIVA 5P0EA 2A4FA 5HU1A 1AAQA 5P67A 1FF0C 1SDUA 1ZSFA 3KYRA 1LYWB 3PWWA 4KE1A 4Y5CA 5P7UA 3QVIA 3FNSA 4Z22A 4PPHA 4I0IA 3PVKA 5CLMA 5P1OA 3SA8A 4I12A 5P4HA 5P00A 4Y3GA 4AZYA 1BV9A 1HVSA 1GNMA 3O9LB 2QK5A 1QDMA 4GJBA 5OZZA 5HD0A 5OZWA 1NSOA 3UDHA 1IZHA 2WF0A 5DQ1A 5P0HA 4NKKA 2G24A 2QD6A 5P4KA 3KDBA 2I4UA 1OHRA 5KQZA 2AOEA 5KQXA 2BPYA 5EZXA 4ZLSA 4HLAA 3HBOA 5P0UA 4FSLA 1K2CA 3OUBA 3EM4A 5P1AA 1D4JA 1SDVA 4FM6A 3R0YA 1FQ8A 3O9IA 3HVPA 1LF3A 2ZJHA 5P1ZA 1D4LA 1YM4A 2QI1A 2VNMA 3HAUA 4TVHA 1HSHA 4YCKA 2EWYA 1DMPA 3S54A 5P81A 4ZSPA 3QPJA 1G35A 3KFRA 4Y3EA 5P7SA 1B6MA 2FGUA 3GGUA 4GB2A 5P7DA 3CICA 1MTBA 5P0VA 1T7KA 1T7IA 4DJPA 3DM6A 1EPNE 4DQGA 5ISKA 1W51A 1RNEA 2B7FA 5HDUA 5P8RA 2O4KA 1VIKA 3U71A 2P8HA 4K4PA 4X2LA 3I2LA 4NJSA 4GZFA 3IA9A 3M9FA 4QGIA 1YTGA 5P2RA 1RPIA 2FDPA 5DQ2A 5ER1E 3HD8A 4XXSA 4BEKA 4EJKA 5P85A 3PGIA 4YDFA 3PSYA 1HVRA 1IZEA 1MT9A 4JPCA 5P5KA 3SKGA 2HB4A 5OZIA 2JJIA 1HHPA 5OZVA 1QBRA 2WEBA 2HC0A 3OAGA 1SGUA 3TOGA 5P8NA 2HB2A 3Q6YA 2VIZA 1C6YA 3N4LA 4MC1A 5UPJA 1E80E 5KR1A 7UPJA 5ER2E 5P3JA 1IZDA 5P6IA 5P15A 5P0JA 3KN0A 2B42A 3OXVA 3K5DA 5ENMA 5HCOA 4L6BA 2P3AA 5AHBA 5P1FA 4DUSA 5P1YA 3UDRA 3O9AA 1WKRA 2FXDA 4FRKA 3VFAA 3K4VA 1HIIA 3PSGA 3VUCA 3OU1B 3FNTA 5P0WA 4DH6A 5P3UA 1W5YA 4ZPEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3APR E;  3OQ7 A;  3SM1 A;  4Y39 A;  5P6G A;  2V11 C;  4H1E A;  5P52 A;  3UFL A;  5P54 A;  4Y4B A;  3FV3 A;  3WZ7 A;  2FLE A;  4FIV A;  4ACX A;  2R43 A;  2IGX A;  1GVT A;  4FM8 A;  5P56 A;  3OOT A;  2VA6 A;  2NNP A;  5AH6 A;  3S43 B;  5P6V A;  5IE1 A;  4R93 A;  3TH9 A;  2ZGA A;  3OU4 A;  4EJD A;  1GVV A;  4AA9 A;  5P68 A;  3LZY A;  4F75 A;  1UH8 A;  1G2K A;  5P1H A;  5ENK A;  3UTL A;  3T7X A;  5P2I A;  1AXA A;  4J1I A;  5P07 A;  5P8T A;  2OF0 A;  4Y51 A;  1XN3 A;  4ZPG A;  5P20 A;  4B70 A;  2P3C A;  3OXX A;  3ST5 A;  3S45 A;  5KR2 A;  5COO A;  5P1J A;  3VYD A;  5P7C A;  1TCX A;  5P03 A;  1IDB A;  4B72 A;  2O4N A;  2NNK A;  4YBI A;  4HDP A;  5P0F A;  3BGC A;  5P2F A;  3MSK A;  5P59 A;  4QLH A;  3BXS A;  1HOS A;  2F3F A;  5P8B A;  5P4S A;  5P12 A;  2NMY A;  2Q55 A;  2UXZ A;  5P7L A;  3EKY A;  1K2B A;  5P40 A;  3UQP A;  4YD5 A;  3PRS A;  3OGQ A;  4UPJ A;  2OHU A;  3QRO A;  1ODY A;  2B8V A;  2VA5 A;  4MC6 A;  5P89 A;  5P5L A;  5P4D A;  3WZ6 A;  5P3O A;  5SZ9 A;  5OZ2 A;  3G6Z A;  1GKT A;  5P0S A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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