4ETEA

Lysozyme, room-temperature, rotating anode, 0.0021 mgy
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
129
structure length
129
Chain Sequence
KVFGRCELAAAMKRHGLDNYRGYSLGNWVCAAKFESNFNTQATNRNTDGSTDYGILQINSRWWCNDGRTPGSRNLCNIPCSALLSSDITASVNCAKKIVSDGNGMNAWVAWRNRCKGTDVQAWIRGCRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Hydrolase
molecule keywords Lysozyme C
publication title High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography.
pubmed doi rcsb
total genus 48
structure length 129
sequence length 129
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2012-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 4eteA00
1G7MC 2Z39A 3A93A 3AGGG 1W08A 4HP0A 5B06A 5J7CA 3AYQA 2IFFY 4GCCA 5F16A 4BAFA 3TMXA 2BQNA 4FJRA 3RZ4A 1GE4A 1VDPA 4YEOA 3K3TA 1GF6A 4NWEA 4ETDA 4NSHA 1JTPL 4WM3A 1GEVA 207LA 4N1CC 1GB9A 1LSFA 1BB3A 4OWEA 1YL0X 1B7MA 1QQYA 2G4QA 5DN5A 4HPIA 4KT3A 5L9JA 1GFTA 3AZ4A 1OUFA 1GBSA 1WQNA 3AZ7A 4YF2A 1HEQA 3CT0A 4DD9A 5HQ1A 2BQBA 2CJLA 2BQEA 1GXXA 1OUBA 2HU1A 3N9AA 3BKVA 1FLUA 1F6RA 5LVIA 1LMNA 1REYA 4G4HA 1LZEA 4YM8A 3N9EA 5IDDA 4WO6A 4OWHA 4WO9A 1LJ4A 1GB0A 154LA 5HNLA 4N1EI 4G4BA 4LYOA 1HEOA 1P2CC 1PS5A 1INUA 5I53A 4DDCA 4WMGA 4H1PA 4B49A 2YBMA 3P64A 3CSQA 1LKSA 3CT5A 1LSYA 1JTTL 5KXOA 1D0MA 1GEZA 3GXKA 1GE0A 2D6BA 4RLMA 4NG8A 1WTNA 4OWAA 1OUEA 1LSZA 1JJ3A 5DLAA 3RNXA 3TXHA 2I25L 3TMUA 1LZ5A 1GBOA 1GF7A 4J7VA 4B1AA 1OUCA 5I5QA 4PPOA 1G7LC 2F4GA 2YDGA 1UIDA 3M3UA 5A3ZA 1TEWA 1YAOA 1QUTA 3WYHA 1LHHA 1LZRA 3ZVQA 2A7FA 2FYCA 4P2EA 5C6JA 1IWZA 4NGLA 2MEDA 5APFA 1LHMA 5F9UA 1LJNA 1WTMA 2DQJY 2YBNA 2ZIJA 3B0OA 1GB3A 4N5RA 2HEAA 4XADA 4DD1A 1G7JC 3EXDA 1GBXA 4DDAA 1YANA 3FE0A 4G4CA 2BQGA 4WOAA 5LA5A 1BGIA 2H9KA 1HSWA 1XGUC 1YAPA 4WLDA 1LZGA 1B9OA 1LAAA 1QSAA 1GD6A 5M1YA 4R6CA 4LT0A 1YAMA 2N5ZA 4FDYA 4LFPA 4MSTA 6LYTA 2C8OA 1CKHA 2F30A 2EPEA 2HTXA 5LVJA 1UIFA 1CJ8A 1GE2A 5LXWA 1OQMA 1LHKA 2BLYA 1T6VL 2MEAA 3B72A 1F10A 1D6PA 3WU9A 2BQMA 4ETCA 4OWCA 4H9EA 3QE8A 1IWVA 1LZTA 1GHLA 5I54A 5KXWA 1AT6A 2B5ZA 2XTHA 1XSFA 3QNGA 7LYZA 3HBDA 3LYOA 4GN4A 1BB5A 4HJZA 1FBIX 2C8PA 4TSCA 5KXNA 1HC0A 4XJIA 4M4OA 1BWIA 2BAAA 3P4ZA 2Z12A 1GF0A 1HENA 5KXRA 1GFKA 2H5ZA 5II3A 5KKIA 1UICA 4DC4A 4E3UA 1LJ3A 1GB6A 1HERA 1LJHA 2D4JA 1JUGA 3A6BY 3A94A 4QY9A 2Z2EA 1UBZA 5LA8A 2YBHA 1B5WA 1W6ZA 2NWDX 4DDBA 4NGJA 1HFZA 1UUZC 2DQDY 5APCA 1WQQA 2XBSA 3AGHA 4W94A 3T6UA 5HLLA 3FI7A 3EMSA 4H9CA 1UIAA 2LYOA 2LZ2A 1LYYA 4NIJA 1IO5A 134LA 5FSTA 2Z38A 1UIBA 3M18B 5I4XA 1GFGA 1REZA 3WUMA 3WW5A 1GFRA 2YBJA 3SP3A 5ILCA 3ZVQB 3T36A 3D9AC 2W1YA 2DQCY 4LYBA 1GF4A 1NBZC 1C43A 1QSWA 3AW6A 1GWDA 3G3AB 1DI4A 1IR8A 1WVUA 3LYZA 1A4VA 3TMVA 4CFPA 1RI8B 4NGVA 5KJ9A 1UA6Y 2LYMA 1IP7A 2YBLA 2XBRA 1V7SA 1SLYA 2HUBA 2Z2FA 1RCMA 3W6EA 1O23A 4TTDA 1C10A 1B7PA 2F2NA 5LVKA 1OUIA 1WQPA 3EBAB 4ZFPA 3TXGA 2CDSA 2DKVA 1BWHA 1LZDA 2DQIY 5F9XA 4WM6A 1HEMA 5IHGA 1JISA 1LZAA 3TXIA 1KXYA 1LSPA 4C5FA 5HMJA 1DI5A 2BQAA 3OJPA 5KXSA 1NF5A 1OUJA 194LA 1VAUA 5C6LA 1B2KA 4DD0A 4U3XB 1LSAA 1IIZA 3WULA 1FLYA 1WQRA 1BB6A 1CJ7A 1LSNA 4QGZA 1YKXX 1AZFA 4B0DA 4EOFA 3W6CA 4CHXA 4NEBA 1C46A 1CKFA 1LMOA 4HV2A 2Y8PA 1VDTA 4DYGA 3TMWA 4TUNA 1TCYA 4XENA 1B7RA 2CGIA 2G4NA 4WM5A 1BB4A 3A3QA 4HTQA 4WG7A 5LYTA 4H9AA 1OUHA 1HFYA 1JSEA 1CKDA 3TXKA 4MR1A 4NGWA 1GF3A 1GF5A 4WLXA 1GB7A 3J6KA 3LN2A 4LYZA 1C7PA 4H9IA 1LZBA 2HU3A 4UWVA 2HECA 3OK0A 3A6CY 4WG1A 1HMLA 1LMAA 1GFVA 1LZ4A 4H9FA 4L41A 4A7DA 1UIEA 132LA 4LFXA 4NGZA 4NGIA 1OUGA 2F4AA 1LZ6A 4N9RA 1LHJA 4ETEA 1HNLA 4TWSA 5APDA 2BLXA 1BVKC 4H8XA 1GBZA 1J1PY 1YQVY 1LSEA 1XGRC 3A8ZA 4KXIA 4NHPA 1YAQA 1AKIA 2MECA 4QEQA 4B4EA 4LT1A 1VDQA 4G49A 4H92A 4Z3MA 4Z46A 2D91A 2LYZA 2BQCA 4LYCA 1LSDA 3WUNA 5FCPA 4TSBA 1DKKA 1NMMA 3A96A 4NHSA 1GFUA 3LYMA 1DI3A 1LZSA 1SQ2L 1IC5Y 4ETAA 1MELL 2G4PA 4O34A 1XFPL 4GCDA 5AMYA 3RW8A 3TXBA 4TX7A 5KXMA 4HJYA 5EBHA 3RT5X 1LHIA 5KY1A 4ET9A 1YKZX 4GN3A 1JJ1A 1LYSA 2FBDA 4GN5C 4OW1A 4PRQA 1LTMA 1LSGA 5APEA 3W6BA 4AGAA 3MGWA 3HBEX 1D9UA 2Q0MX 1JKBA 1GAYA 4LGKA 2MEIA 1IP5A 1OP9B 1UIGA 1C45A 2MEFA 2ZQ3A 1VDSA 2YVBA 1GE1A 1H87A 1ZVHL 4II8A 3A34A 1LSBA 1QDTA 1FLQA 4W96A 3AZ6A 1Z55A 4BS7A 1DZBX 2DQFC 5D5CA 5LVGA 3HBHA 4H90A 5LVHA 4PRUA 5IELA 1JTOL 1B7QA 1BWJA 4RLNA 4LYTA 1YIKA 4J1BA 3WL2A 5B05A 1REXA 4XJDA 1FDLY 1IOTA 4ZIXA 4XJFA 1F6SA 1IEEA 4XJGA 1LJIA 1HF4A 1XGQC 2MEHA 2GV0A 3RU5A 4UWUA 1GB2A 5E4PA 1QUSA 5HNCA 1IX0A 3E3DA 4LT3A 4XN6A 1LMTA 3W3EA 1IC7Y 3AZ5A 4NWHA 1HSXA 1CKGA 1YKYX 4R0FA 1VEDA 2ZIKA 3GXRA 4EMNA 3CSRA 1IWYA 1B7OA 3A92A 4X3BA 1CJ9A 1AM7A 1IWTA 2DQAA 1IWXA 1CJ6A 1ALCA 3AW7A 4NSJA 5FEKA 2BQLA 3ZEKA 5B59A 1IR7A 1C08C 1GBWA 1G7HC 1VATA 5DN4A 2I26L 1B7SA 1FKVA 1QDRA 5B1GA 1LZ8A 3A90A 3HFMY 3WW6A 1GB5A 1LCNA 1LOZA 3CQLA 1IOCA 3W6AA 3F6ZA 3WU8A 1TBYA 2DBTA 1GFAA 4XYYA 1LSMA 1YROA 153LA 3IJVA 3P68A 1IORA 2A7DA 5LIOA 4PJ2C 3WU7A 1KXWA 5A3EA 5I4YA 3IJUA 1LJGA 4DWXA 3G3BB 1NHEA 4HV1A 2DQHY 4NG1A 3TXFA 5D5FA 2BPUA 1GPQC 4GCEA 2Z19A 4I0CA 3AGIA 4G9SA 1TAYA 2HEEA 3W6FA 1LYZA 2YBIA 1B5ZA 4C3WA 1EL1A 4GLAA 5E9RA 1MLCE 4PHIA 4OOTA 5T3FA 4CGEA 5KXXA 1OUDA 4ZEEA 5K7OA 1YILA 3QY4A 6LYZA 1GAZA 2BQOA 5LAGA 1JKCA 3LYTA 4H9HA 4LZTA 5KKJA 1DPXA 1IR9A 4NHQA 1LKRA 1UACY 4XJHA 208LA 2ZYPA 4CFOA 1REMA 1JSFA 1JKAA 2BQIA 4HJVA 4GLVA 3J4GA 4NSGA 2WARA 133LA 1LYOA 3P65A 4BADA 2ZWBA 1WQMA 3A95A 1JWRA 1HEPA 3ATNA 4PGJB 5F81A 2FYDA 5B1FA 4Z41A 4IASA 2EKSC 4D9ZA 1LJKA 2W1LA 1KIPC 1NDGC 1LMPA 1QIOA 5L3IA 3B0KA 4H8ZA 3WXUA 1IC4Y 4RW1A 2EQLA 2MEBA 5KXPA 3IWRA 1ZVYB 1LJFA 1RJCB 5FDJA 5DL9A 1IP4A 1UC0A 1DKJA 2HEDA 4I8SA 1IVMA 2XJWA 4ANRA 2FBBA 1LPIA 3P66A 3TXEA 4WL7A 2VB1A 2YSSC 4LT2A 3WPJA 2LZTA 4WM1A 1IOSA 4H94A 1XGTC 2BQDA 2IHLA 4DD7A 1GF9A 4H9BA 4H93A 2DQEY 5FHWA 1JJ0A 1XGPC 4J0LA 1IWWA 1WVVA 1N4FA 1V7TA 4AXTA 5KXLA 4NGKA 4BAPA 1BHZA 3LZ2A 1JHLA 1HFXA 2H9JA 4XJBA 1YL1X 1QTKA 1D0LA 3KAMA 4WM4A 1LMCA 3WPKA 4ETBA 2ZQ4A 4OWBA 5KXYA 4ML7A 4CJ2A 1LZNA 1EQEA 4GCBA 4NFVA 3W6DA 5I4WA 1GB8A 3CT1A 2D4IA 4ET8A 1I20A 3TXJA 4YOPA 3TXDA 1T3PA 4YEMA 5F14A 1GFEA 1ZMYL 1AT5A 3A67Y 1BVXA 2BQKA 3B0IA 3CSZA 5KXTA 9LYZA 1IP6A 1RFPA 4HPEA 3ULRA 5LYZA 3WH1A 5L3HA 1B7NA 2ZNXY 1PZYA 1GDWA 2MEGA 4RDSA 1NQIA 1IWUA 3A91A 1EQ4A 3WVXA 1QTEA 1IOQA 1HMKA 2I6ZA 1G7IC 4HTNA 5LAFA 1B5VA 1FLWA 2ZNWY 3WVYA 1LJEA 1GDXA 2D4KA 2PC2A 3BKHA 1RE2A 1HHLA 1KIQC 1BB7A 1LJJA 1OUAA 4DD3A 2DQGY 1LZ1A 1F0WA 3EO5A 1JITA 1JIYA 1LHLA 4M6DA 5LINA 1LZ9A 1A2YC 2BQFA 1B5YA 1IP1A 1D6QA 2CWIA 4N0JA 1JKDA 4N8ZA 1DPWA 2Z18A 3A3RX 4H91A 4GCFA 1GF8A 1KXXA 3VWOA 4OOOA 8LYZA 2X0AA 4B4IA 4WLTA 2LHMA 1HELA 1UCOA 4QDNA 5ILFA 5FELA 1NDMC 1B7LA 1IY4A 1B5XA 1DQJC 5KXKA 2RSCA 4Z98A 1I1ZA 1NKHA 1XEIA 1CNSA 4J1AA 4NY5A 1E8LA 1TDYA 2ZILA 3WUAA 2MEEA 2BQJA 3LZTA 1B0DA 4WLYA 1NBYC 3AB6A 3ATOA 1CKCA 1D0KA 4NGOA 1XEKA 5DM9A 3WMKA 4HSFA 1B5UA 1EQ5A 1LZYA 4WL6A 4KPMA 5LYMA 1LMQA 1IP3A 1J1XY 1DXJA 4IJ4A 4WM2A 1J1OY 2HEBA 135LA 3D3DA 1LSCA 2AUBA 2BQHA 4NGYA 1FKQA 1GXV2 1LZCA 4NHTA 4UWNA 1I56A 4H8YA 2W1MA 1KIRC 5JENB 3AJNA 4HTKA 5B07A 1HEWA 1NWGA 5C6IA 1GFJA 1JPOA 4LYMA 1UIHA 1ZV5L 3B6LA 1H6MA 193LA 1WQOA 4IATA 1GBYA 1XEJA 3WXTA 4DT3A 5HMVA 1VFBC 5KXZA 1IP2A 2EIZC 4DD2A 4YENA 3CB7A 4NHIA 1JEFA 3N9CA 2ZYCA 1BQLY 2W1XA 1GFHA 4B4JA 4NSIA 1IY3A 4RW2A 3WPLA 2Z37A 1FN5A 1GE3A 4KL7A 3LHMA 4MCKA 2HEFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Z39A 1W08A 4HP0A 2F2QA 5F16A 1VDPA 1JTPL 4WM3A 3GUJA 4N1CC 3C80A 4OWEA 1BB3A 1B7MA 1OWZA 142LA 1GFTA 5HQ1A 2CJLA 1KNIA 1GXXA 3N9AA 4ARPA 1FLUA 1F6RA 1REYA 4WO6A 4WO9A 1HEOA 1PS5A 1P46A 103LA 1GE0A 1OUEA 1LSZA 3TMUA 4J7VA 1G7LC 1QTZA 5A3ZA 1TEWA 1YAOA 1QUTA 1LHHA 1LZRA 3ZVQA 2Z6BA 1L37A 5C6JA 5F9UA 3NYAA 5APFA 1L54A 1LJNA 1WTMA 2ZIJA 4XADA 1GB3A 2HEAA 4DD1A 3EXDA 215LA 4I7SA 2BQGA 1BGIA 1DYCA 4WLDA 141LA 1ZYTA 3K2RA 1C6LA 1B9OA 5M1YA 110LA 192LA 4FDYA 1CKHA 1UIFA 259LA 152LA 1C6AA 1L04A 2MEAA 1F10A 143LA 3WU9A 236LA 4OWCA 1IWVA 4I7RA 5KXWA 1AT6A 3QNGA 1XSFA 3HBDA 102LA 145LA 1BB5A 1HC0A 2OU9A 104LA 2BAAA 3HUKA 5KKIA 1C64A 1UICA 228LA 4PK0A 1GB6A 1HERA 2D4JA 1JUGA 247LA 3A6BY 5LA8A 4NGJA 1HFZA 1UUZC 3AGHA 3T6UA 1CUPA 1UIAA 1OVHA 2LYOA 4NIJA 182LA 7LZMA 134LA 2Z38A 1GFGA 3WUMA 1QS5A 5ILCA 3T36A 3D9AC 1NBZC 3HH4A 3AW6A 1DI4A 3HT9A 4NGVA 1IP7A 1L94A 1V7SA 2HUBA 1RCMA 1L08A 220LA 200LA 5LVKA 1OUIA 1WQPA 171LA 1L89A 3TXGA 1KY0A 4WM6A 1HEMA 1CV5A 5HMJA 178LA 2BQAA 1L56A 5C6LA 194LA 111LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1G7M C;  2Z39 A;  3A93 A;  3AGG G;  1W08 A;  4HP0 A;  5B06 A;  5J7C A;  3AYQ A;  2IFF Y;  4GCC A;  5F16 A;  4BAF A;  3TMX A;  2BQN A;  4FJR A;  3RZ4 A;  1GE4 A;  1VDP A;  4YEO A;  3K3T A;  1GF6 A;  4NWE A;  4ETD A;  4NSH A;  1JTP L;  4WM3 A;  1GEV A;  207L A;  4N1C C;  1GB9 A;  1LSF A;  1BB3 A;  4OWE A;  1YL0 X;  1B7M A;  1QQY A;  2G4Q A;  5DN5 A;  4HPI A;  4KT3 A;  5L9J A;  1GFT A;  3AZ4 A;  1OUF A;  1GBS A;  1WQN A;  3AZ7 A;  4YF2 A;  1HEQ A;  3CT0 A;  4DD9 A;  5HQ1 A;  2BQB A;  2CJL A;  2BQE A;  1GXX A;  1OUB A;  2HU1 A;  3N9A A;  3BKV A;  1FLU A;  1F6R A;  5LVI A;  1LMN A;  1REY A;  4G4H A;  1LZE A;  4YM8 A;  3N9E A;  5IDD A;  4WO6 A;  4OWH A;  4WO9 A;  1LJ4 A;  1GB0 A;  154L A;  5HNL A;  4N1E I;  4G4B A;  4LYO A;  1HEO A;  1P2C C;  1PS5 A;  1INU A;  5I53 A;  4DDC A;  4WMG A;  4H1P A;  4B49 A;  2YBM A;  3P64 A;  3CSQ A;  1LKS A;  3CT5 A;  1LSY A;  1JTT L;  5KXO A;  1D0M A;  1GEZ A;  3GXK A;  1GE0 A;  2D6B A;  4RLM A;  4NG8 A;  1WTN A;  4OWA A;  1OUE A;  1LSZ A;  1JJ3 A;  5DLA A;  3RNX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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