4F19A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 4.5
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 115
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f19A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f19A01
2QL3A 3MC2A 2B3FA 2RINA 4GWOA 4DDDA 2QS3A 4PFTA 4DXBA 5H8SA 1N7XA 3JZJA 1Z7NE 2ZMBA 1JEVA 1YAEA 3DP8A 1N7WA 1B51A 3TPAA 3MZ1A 3W15C 1B3GA 2O6AA 4BDNA 3PUVE 1SW1A 1MQDA 3U92A 3I6VA 2CMOA 2DWHA 5FTHA 1ANFA 4KYDA 5DYHA 2F5XA 4X1DA 1NH8A 1EZOA 4ELQA 3SEYA 4OWDA 1B46A 1LAXA 1LBBA 3MVXA 4RJZA 3K1NA 3KZGA 5I56A 1CE2A 4KFQA 1MXWA 1D9YA 3E3KA 4OERA 2H25A 3OEKA 3IAZA 2LAOA 5AA4B 5TPAB 4AB5A 4QFOA 3IX1A 2O69A 3AXFA 3W9WA 1JW4A 3KN7A 3OO7A 5H8HA 1NNFA 5L9MA 5J1DA 3KBRA 1TFAA 1KWHA 3CVGA 1IITA 3OSQA 4G68B 1GR2A 3RTWB 3DM0A 1ATGA 4N6PA 5BWJA 4FEBA 1MXUA 4RY1A 4EXLA 1IZ1A 3O97A 2F36A 4XIGQ 2OZZA 1LFIA 3H03A 5AA4A 3K01A 4XKQA 3THIA 3V8XB 5TPAA 1OMPA 4H67A 4U1ZA 3ECRA 5I59B 4OQOA 1LGBC 4RNSA 3CFZA 1MM6A 1P99A 3G3IA 2P1SA 4R6KA 4G68A 1ZIUA 2V3UA 3KGCA 4Q30B 1O63A 2Z8DA 3EQ1A 1MPCA 1SDXA 4DXCA 4GLIA 5I84A 3T9HB 2V3QA 4F31B 1IXIA 3OO9A 3OEMA 5I57A 4NF6B 2UVIA 1QKAA 3KSJA 1QUKA 3UGWA 2QMXA 4ZEDA 3LSXA 4L17A 3EPEA 3ZKLA 2D3IA 1FCKA 3S9LC 1B5HA 5JTYB 3TFLA 4I62A 2PX1A 2DS9A 1MXYA 1O7TA 4BLAA 1JW1A 4NF4B 1JQFA 1IUDA 5F1QA 1SD3A 1MY3A 1VR5A 4R6HA 4NF6A 2YPNA 3G3GA 4AB6A 1PBPA 4DE8A 2FNCA 3D4GA 1UTBB 1FQBA 4U2RA 2CZLA 4P0IA 4FEDA 3RNNA 2Q88A 2X26A 1B3FA 3B6QA 2OLBA 1OQGA 4C1UA 3IOWA 2R6GE 4ZE9A 4NF4A 4JDFA 3PMWA 2OWTA 4N07A 5CBRA 2X7QA 2HZLA 1IXCA 3MUQA 4YKJA 1MY0A 5TP9A 1SW2A 4U23A 4RK2A 3MQ9A 4FATA 3VLUA 4IY5A 4EDPA 3LR1A 3FATA 1PBQA 1BP5A 4KR5A 3SEXA 1ELJA 2F8DA 1OVBA 4F1VA 2F7CA 3C32A 4QF9A 3PPOA 3E9XA 2V84A 3IB2A 1MPBA 1S7YA 4NF5B 1H45A 3K4UA 1NKXA 2H98A 3K02A 4ND9A 3T9XB 4ELPA 2Y7PA 4LUBA 3FV2A 3RUMA 2F6GA 2VHAA 3TZAA 3C9HA 3HV1A 4FE8A 3EHTA 3A3CA 1M5FA 4EQBA 5TU0A 4RYAA 1SYHA 1URGA 1DMBA 3PUYE 2AL5A 4ZEIA 3VE1B 4DLDA 4TOZA 2I6EA 2Y84A 4NF5A 4OZ9A 4C0RA 3FJGA 3QIMA 1MXXA 2G93A 5I2NB 4M1VA 1Z7ME 5H8QB 4G8MA 2F6PA 3ILTB 4YB6A 3KN8A 1MG1A 2ONRA 3PPPA 2P2AA 3MWBA 4U21A 1MDQA 4RPOA 3K00A 5DEXA 2PT1A 1XHYA 2REGA 1Q35A 1VFDA 1B1HA 1BLFA 2KLFA 3MPKA 1VE4A 5H8NB 2RC7A 3ONMA 1ZJLA 4R6YA 4YKPA 3VLWA 3PPRA 3FD3A 5H8QA 2ZYNA 3G7WA 5HBCA 1XVYA 4F3SA 1B58A 1I6QA 4F3GA 4G8NA 3PGFA 5AA3A 2RCBA 1T0KA 4GVOA 5ITPA 1AL3A 3TQLA 3BKIB 1DOTA 2O51A 5H8NA 1B3HA 1P1UA 3H6UA 4MBPA 3KOTA 3RTFB 4ELOA 3M3FA 3C35A 4RPNA 4UACA 3ZSFA 3H7MA 4Q8RA 2THIA 1US5A 3FVGA 1QUJA 2XXXA 3SDFA 1J1NA 2I3VA 1R1NA 4MFIA 4F19A 3G3FA 4EF1A 2O7IA 2Z8FA 3QK6A 3Q28A 4BDLA 2H5YA 5AA2D 1WDNA 4F29A 3LBSA 4GF8A 1B7UA 3SETA 5K2XA 3G3HA 1POY1 4BDMA 2A5TA 1RYXA 4HS7A 3QUJA 2RC9A 4ELRA 3V83A 1II5A 2QS4A 3E13X 4OVJA 2HFBA 2DP8A 3UORA 3PV0E 1ZBMA 5CBSA 4F3PA 4OETA 3C31A 1B9JA 2VD2A 1M5DA 2DVCA 1B7HA 3RY3A 1AMFA 4XXUA 2UXAA 2XXUA 5BUUA 1UTHB 1B5IA 3PMXA 2ONSA 1H43A 5CC2A 4ZS9A 3QUFA 3H4ZA 1UIVA 4QRZA 2VD3A 3ODBA 2XHDA 2YJPA 4TQUQ 4JSOA 5CMMA 3R26A 1MRPA 4G2ZA 3QAXA 1YTVA 1SYIA 4LZ8A 4EF2A 5CRYA 1OLCA 1UTHA 2NUVA 3MP8A 2F78A 1ZKBA 1DTZA 4OFJA 3PD8A 1AIVA 4I8CA 4WKMA 4JB7A 3KN3A 3TELA 5L8DA 4YMAA 1JW5A 3N6TA 5CI5A 3ZKKA 2GH9A 3DLNA 2B65A 3O6GA 5H8FB 3O6IA 4IB2A 4ECFA 1NNPA 3PU5A 1ZLQA 1MM7A 2ESNA 3A3UA 2NXOA 3MZBA 5CMKA 2UVJA 3KFMA 1OVTA 3LSWA 4QSEA 5I58B 3CSBA 4ISUA 4PQJA 3FV1A 1Y3NA 2I58A 3GXAA 1LAGE 3ZS6A 5KCJB 2ZYOA 3TDJA 3JYRA 4WXJA 2UYFA 5EHMA 2Y7IA 1AH5A 1LCTA 4THIA 1P1QA 4E0XA 3TYHA 4JXIA 4G77A 4I1DA 3K2DA 4BDRA 2Z23A 3K0VA 1S50A 2HQ0A 1B2HA 3UN6A 1BTJA 5AA2B 4R74A 1SQYA 3HHFA 5I58A 4G68C 3PPNA 4UA8A 1Y20A 1DPPA 1QVSA 5KCJA 4RA1A 3N6UA 3O2AA 2I4CA 3CFLA 3B6WA 4F1YA 4H1XA 1PB8A 3UK4A 1QJMA 2RC8A 1GGGA 1UIUA 2ZYKA 3K1MA 1B3LA 1Y1ZA 2I0BA 4C1TA 1P1OA 2O84X 3FASA 4FORA 4E0WA 3N26A 4YB7A 1H3DA 4GL0A 1MXZA 3KOSA 5AA2A 5I59A 4TLLB 2E0SA 1PB9A 4IO5A 2DQVA 3TMGA 1FQFA 4LQ5A 1A8EA 3V5AA 3EHUA 1B40A 2RCAA 4QFLA 3K6UA 4IO3A 3LSFB 4MLVA 1ZU0A 4QHQA 4FAJA 5AA1A 4NWDA 3S4UA 1B0HA 4IGTA 1N84A 2G29A 2F7AA 3OO8A 1CB6A 1P1WA 4FIMA 4GXAA 3G3KA 1B1XA 4GRKA 1FQEA 3GZGA 4QFNA 1A55A 1AOVA 3KSXA 4GIZA 3QSLA 5JTYA 1JVYA 4WEDA 4ZEKA 3SESA 3H6WA 4YKKA 3L6GA 1MQIA 4HCWA 3RN8A 4YAHX 3VVFA 4YMBA 3M3KA 2ZXTA 4XTCQ 5L9SA 2NVUB 3OXNA 1TWYA 1US4A 4LVQA 3IOVA 1LFGA 4YB5A 5DVFA 3SKPA 2NOOA 3O66A 3CSGA 1A40A 2R71A 3Q26A 1UTBA 1DPEA 2OCUA 2O7UA 1PC3A 1FTJA 4KCDA 3FVKA 3FVOA 2HAVA 3TCFA 3LSLA 3MP1A 3GBBA 4YKIA 5HM4B 3SERA 4NMYA 4BDOA 1LAHE 1MY2A 2XXWA 4IO4A 1D9VA 3FIRA 2QMWA 2VGQA 1LB9A 3FVNA 1URSA 3DP4A 3KJTA 3BFTA 3U8QA 1PEBA 1NFTA 3HN0A 3H06B 4U22A 3A09A 1B7ZA 3CG3A 3I3VA 5F7VA 3PPQA 1FW0A 4EQ9A 3DP6A 3FXRA 4LZ5A 3FJMA 4GD5A 4H0WA 2AL4A 2UVHA 3GLBA 1SI0A 1TT1A 3M3LA 2QJEA 3H6VA 4Q5TA 3WAFA 2HEUA 1QUIA 1IEJA 3H3GA 5AE4A 4PFUA 4Z7EA 4KPTA 1MY4A 2DWAA 4U4SA 1B3EA 1RKMA 4Z0IA 1M5BA 3IORA 2OK2A 4OMBA 3EN3A 3K6XA 4QFKA 4JBZA 4F2QA 4F22A 3C33A 4XKNA 3MW0A 1Y4TA 1B32A 1SVXB 5DVJA 1I69A 2ZYMA 3UP9A 3MP6A 1B4HA 4ESWA 5K2YA 2O1LA 3TODA 4H6DA 3RT6B 4GXSB 3TTMA 5ISUA 5DVIA 1R9LA 4NTLA 3FZVA 4BDQA 5I2NA 3W9VA 2RF1A 5JK4A 4R75A 3QYTA 4O3AA 2A5SA 2HZKA 3IB0A 3TAJA 2DE4A 3KEIA 1TFDA 3T66A 1IXHA 4KCCA 4P0GA 4DCXA 4PETA 4ZEBA 3OMBA 3CG1A 3VXBA 1HSEA 4G4PA 4KHZE 2DE2A 3T93B 2W7YA 3Q29A 5KZTA 4IGRA 3U1OA 5B7DA 4JSDA 5L9OA 4H8IA 4NWCA 2IA4A 1B05A 2PBWA 2XXHA 3PUZE 4O3CA 3LC8A 2XD3A 2QPQA 1QKBA 4H5FA 3E4RA 1JETA 3DELB 2Z8EA 4OENA 3IK6B 4GOTA 1B6HA 2Q2CA 4R73A 3GBAA 3TKDA 3IJXB 5ITOA 1IQ7A 1Y3PA 4F2OA 1XS5A 1JEUA 3O29A 5HPQA 3FJ7A 2DE3A 2XXVA 3CR9A 4YU0A 2HXWA 4ZZAA 3P7IA 3EF7A 4OFLA 5I2KB 3O9PA 2UVGA 1B5JA 1N0TA 4P11A 4TLMB 1OLAA 2QRYA 2YLNA 1Q1KA 1D4NA 3PUXE 1ZMGA 2V25A 3U94A 2PYYA 2ALUA 1FTLA 3FXUA 2BJJX 1IXGA 4ESXA 2XD2A 1NNTA 4IO6A 4EXKA 2RKMA 4U4XA 3CFXA 2F7BA 2VOZA 2D5WA 1I6BA 3MVWA 3RPWA 2DWIA 3HPIA 2M8CA 4AQ4A 3VXCA 3HSTA 1FQDA 1POTA 1MDP1 3LUYA 1YCJA 4MLQA 3VLVA 3F11A 1DTGA 3MAMA 4X9TA 5I56B 1R6ZA 1USYE 4KQPA 2I4BA 3BFUA 4N13A 2DOJA 2DVZA 1GV8A 1MY1A 3IJOB 3V89B 3IO6A 4OESA 4R2BA 2PMSA 3TTNA 4OHNA 4I9DA 2Y7WA 5H8HB 4G8HA 4F18A 4DIGA 4ZEFA 4R72A 1JVXA 1FTMA 2Y7KA 4NE4A 1SI1A 2V3TA 2Y7RA 3PUWE 3N94A 4JWXA 3HCQA 1LFHA 1PDAA 3UA8A 1MH4A 3IOTA 4ZE8A 5A5XB 3T9VA 4XKRA 2ONKE 3RQTA 3TTKA 2F34A 2F35A 4KYSA 5H8FA 4X1BA 2PT2A 1MQHA 1SW4A 3HO7A 2ZNSA 1A54A 1QW0A 2PVUA 1N76A 1EU8A 3UIFA 4U1OA 1A7LA 3IO4A 3TEPA 3MVYA 3MZ9A 1VFEA 2UYEA 3K6VA 3OD7A 2DXYA 1YPNA 5A5XA 3WAEA 4WEPA 4RK9A 4R9GA 4PE5B 3TQWA 5I57B 3Q25A 2XXPA 3OSRA 3MPLA 4NF8B 4H5GA 3KG2A 4OXVA 4FJPA 2HCAA 3Q27A 2AYSA 4M4GA 4HW8A 3VVDA 3OENA 4ZECA 4H65A 3MJNA 2HAUA 2DYXA 3QXMA 1A8FA 1FQAA 1M5EA 3ILUB 4OTEA 2DSFA 4ZDMA 3CI8A 1N3WA 3B6TA 3IL1B 4NF8A 1MQJA 3T9UA 3D4CA 2H9BA 2OWSA 2XX9A 2XXQA 5JEIA 1F9BA 2ABHA 5ICTA 2FA7A 2V93A 1RYOA 2XX8A 2O1MA 1LCFA 1D3KA 4Q0CA 1B52A 1QULA 5FTIA 2QS2A 3K6WA 1LBCA 3L6HA 4DCYA 2GHBA 5TP9B 4YICA 1MXVA 1Y4CA 2F97A 3KJ7A 3PMVA 4QFPA 3S9NC 4R2FA 4MH5A 3S2VA 2D21A 3MBPA 4HTGA 1XVXA 5FHNA 3VFJA 4O3BA 2XXIA 5LOMA 2DWJA 3HHGA 3G3JA 3N5LA 4X48A 1NL5A 3C34A 4F3BA 3U72A 3SEVA 5IKBA 1MH3A 1BIYA 5EHSA 1B0LA 1Y9UA 4ONYA 2E1SA 4LP2B 1FTKA 3H6TA 2XX7A 1B4ZA 1WODA 4K3FA 4IO2A 3IB1A 2XXRA 3TTRA 4F1UA 2OBGA 2R9JA 5CMBA 1MPDA 4ZZEA 1O64A 3TCHA 1WVJA 3R7XA 4KI0E 1EZPA 2NWJA 2AIXA 5M2VA 3OO6A 2WKYA 4XKPA 1NMUA 4POWA 3O6HA 4PFWA 3M8UA 2I48A 3EHSA 1GTKA 2GHAA 1GVCA 1XOCA 2H4IA 1IIWA 1H44A 1DSNA 3C4MA 4GFRA 4OEVA 1P1NA 5DTBA 1Y3QA 5DEXB 4F39A 4QSDA 1PB7A 4JWOA 5CM6A 2O68A 3IR1A 2IEEA 1I6AA 5B70A 4LONB 1XC1A 1OIBA 4QSCA 3S9MC 3VV5A 3I5OA 3OOAA 4GQOA 5FHOA 1UQWA 3SEWA 3U93A 2FYIA 1LLSA 4KYEA 3RLFE 5KDTB 1M5CA 2XXYA 4PP0A 4IO7A 3RT8A 1USYH 4RXLA 3TCGA 4DXUA 3TTLA 3B7DA 4NEDA 2ANJA 2ZNTA 2DXRA 3T22A 2GRVA 4EQ7A 3S9EA 1OQHA 2H99A 3CRBA 4MF3A 1JNFA 4FECA 5KDTA 2Q2AA 5ELVA 1LSTA 2Q89A 2Z22A 3TUSA 4OFOA 1VSOA 3R6UA 1EZ9A 1URDA 3RGYA 3CIJA 2I49A 1NNKA 1SBPA 2QS1A 5EYFA 3BBRA 1L5TA 2A5TB 4OEUA 5FHMA 4EUOA 4YZZA 1TXFA 1A99A 3IOUA 1H76A 5DT6A 2P0SA 1BKAA 1HSLA 3JV9A 4OYVA 1FTOA 5CMCA 5ICQA 2VP1A 1SW5A 3FGSA 1ZTYA 1HSJA 1MS7A 1Y1MA 1N3XA 4LA9A 1N04A 4HCYA 2REJA 3T96B 4IY6A 2OJTA 4LZ7A 4POXA 4DZ1A 2XXTA 2Q8JA 3VVEA 2X7PA 3O28A 3OELA 2I3WA 4KD5A 3USDA 4LQ2A 1R9QA 1S9TA 3K1PA 3C36A 4R9FA 4PFYA 3VDFA 2ZNUA 4H8JA 1LB8A 5IAIA 3SEUA 3PD9A 2QSXA 2GFEA 2I0CA 2B3BA 4GL8A 4LATA 5I2KA 1EH3A 2Q9TA 1NH7A 1FQCA 3FUZA 1XT8A 4JWYA 1MQGA 3FXQA 3MVZA 1LAFE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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