4F19A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 4.5
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Phosphate-binding protein
source organism Pseudomonas fluorescens
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
total genus 115
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f19A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f19A01
4U4XA 3CSBA 3RGYA 3OXNA 4TQUQ 5L8DA 2I4BA 1B5IA 3FATA 3BFTA 4KQPA 2F34A 1LB9A 3C35A 3SEVA 2DS9A 1QUIA 3BKIB 3KJTA 1IUDA 4Q5TA 4Q8RA 3H6UA 3RTWB 1TXFA 5JTYA 1NH8A 3UK4A 3SEWA 4NWDA 4N13A 1LLSA 4PQJA 3O66A 2ZYMA 3TODA 1SW1A 1MH3A 4AQ4A 3CIJA 4YAHX 4G8HA 1AIVA 1LGBC 3A09A 1JETA 1S50A 2Q89A 1DSNA 1II5A 4NF6A 1TWYA 3LSFB 3Q28A 1GR2A 1I6BA 3ZS6A 4XKQA 1A7LA 3RNNA 4KD5A 2Y7PA 4BDNA 3R7XA 1B58A 4BDLA 1JQFA 1B3LA 2PX1A 5H8HB 4G8NA 4AB5A 3RY3A 4LUBA 4QFPA 2DXRA 4G2ZA 1Q1KA 4IO4A 4GWOA 3MPLA 3USDA 3K0VA 1J1NA 5B7DA 3BFUA 4NF4B 1LCFA 1MQJA 2D5WA 1MPDA 1N3XA 5CMBA 1FTJA 2HXWA 2FYIA 1LFGA 2F78A 5EYFA 4DDDA 2O7UA 2G93A 3CSGA 1Y1ZA 4H8IA 1LB8A 3OOAA 2THIA 4NF8B 1NNKA 3GXAA 3OSRA 4F3PA 4NF5A 3U1OA 1SQYA 3EN3A 4G68A 1P99A 4GXAA 1Z7ME 1B6HA 1JNFA 5CI5A 1EZ9A 1EU8A 1AH5A 2XD3A 4H5FA 4RXLA 3FJGA 2NWJA 4MLQA 2OLBA 1LFIA 2QMWA 1Q35A 3H06B 3VDFA 2H4IA 3PD9A 2NXOA 5H8QA 5K2XA 2F7CA 2RC9A 1SW5A 4HCWA 3H6VA 3TELA 4F3SA 3SDFA 4LP2B 4FE8A 3H6TA 1MH4A 1NH7A 3FJMA 1A55A 4DXBA 4YICA 1XOCA 2PT2A 5F1QA 4IB2A 3OSQA 3TAJA 4OFOA 1URGA 4PFUA 1MG1A 3OEMA 3ONMA 3CFLA 3TTMA 1VFEA 5H8FA 1MY2A 1B9JA 3IAZA 4U2RA 2ANJA 1USYE 3FVKA 3GLBA 1P1UA 3VXCA 4LQ5A 3FD3A 1SYIA 2UVJA 4Z0IA 2H25A 5I59A 1OLAA 1EZOA 4GRKA 2O51A 3IB0A 4ZZAA 2QMXA 1M5FA 4H6DA 4NF6B 2Y7IA 3CVGA 3IOWA 3ILTB 2AYSA 1VE4A 2OBGA 3HHGA 4PFWA 4QFNA 2KLFA 4YMAA 4YMBA 3S9MC 1MXWA 2UYEA 3MW0A 5CBSA 2XXHA 4JDFA 4EF1A 1I6QA 1MRPA 1ZLQA 3CRBA 3OO7A 4JBZA 1B4HA 4FORA 3UP9A 1D4NA 2X7PA 3O6HA 1MY1A 5DTBA 3VV5A 4ZE8A 2ABHA 3K6UA 3KZGA 2F7AA 3O2AA 1B3FA 3O97A 1UTHA 3N5LA 3K00A 3LSWA 4BDOA 4ZDMA 1NFTA 4ISUA 3RT8A 4KYEA 3H7MA 2UVHA 1SW2A 4E0WA 1GV8A 2HCAA 4NF5B 2DOJA 3FGSA 3FJ7A 4G68B 3WAEA 3QYTA 1SYHA 4XKPA 4IGTA 3VFJA 2ZYNA 3MAMA 3IL1B 2CMOA 1D9VA 4JSDA 3S9EA 5AA2A 3EF7A 4OFLA 2UYFA 4MF3A 1NMUA 5AA1A 3MJNA 4GLIA 3RTFB 3UA8A 1P1OA 4QSDA 3MZBA 2GHAA 3JYRA 3KN7A 2ONSA 2WKYA 3A3CA 1LAGE 5H8QB 1IQ7A 1H45A 4R75A 3M3KA 5ISUA 3G3IA 2X26A 1A8FA 4ONYA 2D21A 1UIUA 4ECFA 5TU0A 3TQWA 4EXKA 5ICQA 4F29A 5ITPA 2LAOA 5I57A 1OIBA 1DTZA 3EHUA 2XXQA 5FTIA 2RF1A 1MXUA 1M5DA 1QUKA 3O9PA 1GGGA 4N07A 2I48A 4PE5B 4QRZA 2Z8DA 1B7ZA 3E9XA 1IZ1A 5H8SA 2QJEA 1R9LA 5H8FB 2O7IA 4R2BA 4OFJA 4U1ZA 2HEUA 3AXFA 3DELB 3LR1A 3G3HA 1B7UA 5I56B 2ZNUA 2W7YA 2HAVA 4OEUA 1VFDA 3DM0A 4MH5A 3MBPA 2XXIA 2F97A 1PC3A 4RJZA 3UORA 1GVCA 3TFLA 5A5XA 5I59B 2GRVA 4XTCQ 2I0CA 2NOOA 1F9BA 5IAIA 3ECRA 3O6IA 4R9GA 2ZYKA 4OYVA 1NNFA 3RT6B 1QKAA 5LOMA 4KI0E 1A99A 4ZEKA 1RYXA 2DE3A 1SDXA 2PT1A 5CC2A 2XX8A 1ZMGA 4C1UA 2XD2A 2Z8FA 4LZ8A 2V84A 1H76A 3U72A 4DIGA 3KG2A 4ZEBA 1B3HA 4NTLA 4DE8A 4IO2A 2DSFA 2DVZA 4M4GA 4THIA 2H5YA 3PPPA 1IXGA 4PP0A 4Z7EA 2Z8EA 4IY5A 3QSLA 4F22A 1VSOA 1UTHB 2I0BA 3SEYA 1WDNA 3EHSA 1US4A 4QFKA 3CG1A 1LFHA 3VE1B 1XVXA 4U1OA 4HTGA 4QFOA 5K2YA 1B32A 2A5TA 2V3QA 1MDQA 3IO4A 3VXBA 2DWHA 3TKDA 5ICTA 3PMXA 4RA1A 3W9WA 2OZZA 3FIRA 3TTLA 3TQLA 3V89B 5AA2B 1H44A 1UTBA 2QRYA 3D4GA 1KWHA 3VLUA 3MVYA 2PMSA 1MXXA 1MDP1 3MVZA 2V25A 1AL3A 4ELOA 5ITOA 1FQEA 5CMMA 3LSLA 4LONB 3C36A 1SI0A 1FQFA 1MQHA 4L17A 2QS1A 2F8DA 5I57B 4NE4A 2VD2A 3V5AA 3PPQA 1B1XA 3CFZA 4O3CA 1NNTA 5H8NA 3N94A 3OELA 5HBCA 5KDTA 3FVNA 2XXRA 1LAFE 4MFIA 1ELJA 1MY3A 3TCFA 4R6HA 4BDRA 4FECA 1PB7A 5CMKA 4DXCA 4EQ7A 1FQCA 1SBPA 4MLVA 4RPNA 3OEKA 3THIA 4BDQA 5A5XB 3SEXA 4RPOA 4GVOA 3T66A 4YKPA 1MXYA 3HCQA 4ZEFA 4KCCA 4FAJA 2QPQA 2QS3A 1NL5A 1H3DA 3G3GA 4EQBA 2Z23A 3EPEA 5I84A 2Y84A 2O6AA 3GZGA 4YKJA 3Q27A 4O3AA 2OWTA 3OO8A 1T0KA 4XXUA 1BIYA 4UACA 3CG3A 2ZMBA 2X7QA 2V93A 3FVOA 4UA8A 5CRYA 1FCKA 1URDA 3UN6A 1B05A 3TTKA 2OK2A 5DEXA 1DMBA 4LATA 4GOTA 3R6UA 1MM7A 4F18A 1EZPA 4XKRA 5I2NA 4F1VA 1WVJA 1B52A 4TLMB 3C34A 3EQ1A 2RKMA 3VVDA 2P2AA 3HSTA 1B3GA 1ZIUA 1POTA 3QIMA 3MUQA 1XT8A 4R6KA 3S9NC 4JWXA 3SKPA 3S4UA 2Q2AA 3FVGA 3KFMA 2A5TB 3CFXA 3K6WA 4N6PA 3DLNA 5JTYB 5BWJA 1M5EA 4POXA 3G3JA 2F35A 4QHQA 1B0HA 3RQTA 4R6YA 1USYH 4QSCA 1US5A 2GHBA 4YU0A 2CZLA 2ZNSA 4ELQA 1DPEA 1JVYA 4H5GA 1N84A 2B3FA 1L5TA 5L9OA 3HO7A 4P0IA 4DCYA 3IJXB 1RKMA 3IB2A 2XXWA 3W9VA 4ELPA 4GD5A 3PPOA 2P0SA 5CBRA 2H98A 3SEUA 1CE2A 2DP8A 3PUVE 3PMWA 3IOUA 4F2OA 4RK9A 2XXTA 3N6UA 4KPTA 3H3GA 2IA4A 3V8XB 2XXYA 2QS4A 4WXJA 5H8NB 3B6TA 3VVFA 1S7YA 2IEEA 2OWSA 2O1MA 4X1DA 3MZ1A 3FV2A 1ANFA 5KDTB 3ILUB 2XXXA 3K02A 3MP8A 5DVJA 2XX9A 1DOTA 3MPKA 2RC7A 4NEDA 4YKIA 4G4PA 1B7HA 5AA3A 4F3GA 4PFTA 3TZAA 4H67A 3MQ9A 4U22A 3EHTA 4OERA 4PETA 5M2VA 2AL5A 1B51A 4X9TA 3H03A 3OO9A 1A54A 1Y4CA 3FZVA 3MVXA 3O29A 1N04A 1N76A 1FW0A 3QUJA 5FHOA 4TLLB 1IEJA 4DZ1A 1MXVA 1YPNA 1QULA 3A3UA 3KN8A 5JK4A 5ELVA 4RYAA 2VGQA 2F5XA 5HM4B 4DCXA 3IORA 2UVIA 4QFLA 2HZKA 1TFDA 3H4ZA 2VP1A 3G3FA 4JXIA 1N3WA 1P1QA 3C4MA 3MZ9A 2OCUA 4MBPA 4P11A 3LSXA 2M8CA 2DWIA 1JW1A 2ONRA 4LZ5A 5DEXB 4IO5A 2I6EA 3DP8A 1POY1 1MY0A 4ZZEA 4AB6A 3C33A 4OENA 3I6VA 4I62A 4OZ9A 2UVGA 3KJ7A 3FXQA 2REJA 3KSJA 3DP6A 5H8HA 4OHNA 1I69A 1S9TA 4XIGQ 1HSLA 2HAUA 3L6GA 2V3UA 4GQOA 4P0GA 3PD8A 4U21A 2YPNA 4OETA 4OWDA 3OENA 3TEPA 1VR5A 1HSJA 2Q88A 1BLFA 1A8EA 3TPAA 3IR1A 4WKMA 1LSTA 2ZNTA 1LAHE 2F6GA 4KFQA 3ZKKA 1I6AA 3N6TA 4DXUA 1Y3NA 2RCAA 3VLVA 3LUYA 1OQGA 4HS7A 1O63A 5FTHA 3TTRA 3LC8A 1GTKA 4TOZA 1JVXA 1JW5A 2DE2A 4LQ2A 3KOSA 2RC8A 1FTOA 4KR5A 4OQOA 3T93B 2QSXA 1MY4A 3C32A 5DVFA 1PB8A 1Z7NE 2DQVA 1BP5A 2NVUB 2B3BA 3I3VA 3PGFA 3IB1A 3UGWA 3OD7A 1R6ZA 4HW8A 1ZTYA 1M5BA 4RNSA 4K3FA 2DXYA 4IO3A 3RPWA 5AA4A 3TUSA 1RYOA 2I58A 3PMVA 1MQIA 4YZZA 3FUZA 3K1MA 3S9LC 5DYHA 4LVQA 1N0TA 1M5CA 1IITA 2DE4A 4KHZE 1XHYA 4OESA 2QL3A 1QUJA 4QF9A 1UIVA 4I8CA 3E13X 2E1SA 5CM6A 4X48A 4GL0A 2XXUA 2Q2CA 1MQDA 2REGA 5AE4A 2ESNA 5TP9A 3CR9A 3QXMA 1PDAA 2I3WA 3CI8A 4EQ9A 1ZJLA 2DWAA 2H99A 2D3IA 3ODBA 3U8QA 1ATGA 5F7VA 4R2FA 5TPAA 3O6GA 1FQBA 1B4ZA 3PPNA 3K4UA 1MPBA 3Q26A 3IOTA 1QVSA 4ZS9A 3TCHA 1ZBMA 2I4CA 3BBRA 1MXZA 3M3LA 4BDMA 2NUVA 2V3TA 1HSEA 4ND9A 3RLFE 3QAXA 3T22A 4YKKA 1JEUA 1DTGA 4IO7A 5J1DA 3K1PA 2YJPA 1OMPA 2VHAA 1BKAA 5DVIA 2DVCA 3JZJA 4POWA 5L9MA 2R71A 2F6PA 4GFRA 3MC2A 1LBCA 1AOVA 1D3KA 1QW0A 3HHFA 1D9YA 4F1YA 5FHMA 4F31B 3PUXE 3C31A 1FQDA 1OQHA 3JV9A 4F39A 3WAFA 2I3VA 3T9UA 3HN0A 5I58A 4FATA 1B46A 1A40A 4WEPA 2G29A 4EF2A 4OEVA 2VD3A 1SI1A 1N7WA 2OJTA 3PPRA 1XC1A 1ZU0A 1Y1MA 1AMFA 1Y3PA 3G3KA 3KEIA 4ZEDA 4EUOA 3H6WA 4F2QA 3M8UA 3SERA 5KCJA 5KZTA 1JW4A 1Y9UA 1DPPA 3FV1A 1MS7A 2Y7WA 2ALUA 3B6WA 2GFEA 3U94A 1FTKA 1B5HA 3MP6A 3IX1A 1UQWA 5AA4B 4FEBA 4EXLA 5FHNA 1NKXA 3KOTA 4IY6A 1WODA 4EDPA 4R74A 4DLDA 4G8MA 2XX7A 3G7WA 3TYHA 3PUYE 3U92A 4R73A 4FIMA 4U23A 4FJPA 1IXCA 5IKBA 3V83A 2Z22A 3OMBA 3KN3A 1P1NA 3HPIA 4YB7A 4JWYA 1PBPA 3MVWA 2PVUA 4KCDA 2PYYA 2H9BA 5TP9B 5BUUA 3MP1A 1OVTA 1B0LA 1QJMA 3RUMA 2Q9TA 4RK2A 4H0WA 3K01A 4H1XA 4E0XA 1LCTA 4LA9A 1UTBB 4OVJA 3VLWA 5TPAB 5I56A 4HCYA 3FXRA 1P1WA 4GXSB 3R26A 2ZYOA 3HV1A 3K6XA 1TT1A 2O69A 3B7DA 4YB5A 1Y4TA 2AL4A 4G68C 2HZLA 2A5SA 4M1VA 1O7TA 4H8JA 2BJJX 3C9HA 1SW4A 3GBAA 4ESWA 4C1TA 2Q8JA 3N26A 2UXAA 4GIZA 1NNPA 4IGRA 5AA2D 2DWJA 3RN8A 3B6QA 4YB6A 1CB6A 3D4CA 2AIXA 5JEIA 1LAXA 3SESA 3Q29A 5L9SA 2QS2A 1PBQA 4QSEA 2RCBA 1XVYA 1YAEA 3IO6A 4R72A 4GF8A 1B1HA 5I2KA 4Q0CA 1JEVA 2XXVA 4F1UA 1Y3QA 2GH9A 2ONKE 4WEDA 3QK6A 4Q30B 3IK6B 2Y7KA 4F3BA 5I58B 1R1NA 1TFAA 3LBSA 2XXPA 4ESXA 3T9VA 3M3FA 4LZ7A 2E0SA 1N7XA 4BLAA 2O84X 3E3KA 2RINA 1LBBA 1FTMA 1XS5A 3E4RA 3SETA 1EH3A 5KCJB 3Q25A 2DYXA 3P7IA 2B65A 4ZEIA 3TMGA 2O68A 1FTLA 1FQAA 4R9FA 3T9XB 1ZKBA 3U93A 1URSA 4H65A 4NMYA 1OLCA 4KYSA 4C0RA 3K6VA 3I5OA 1MM6A 4U4SA 3T9HB 1SVXB 3PUZE 4FEDA 3TDJA 5I2NB 4JSOA 4I1DA 2Y7RA 4OXVA 4KYDA 1R9QA 3KGCA 1SD3A 3GBBA 3QUFA 3F11A 3S2VA 3ZKLA 5EHSA 3UIFA 1QKBA 3VVEA 1Y20A 3K1NA 3FASA 4XKNA 2F36A 4NF4A 2P1SA 2FA7A 4OMBA 4PFYA 3ZSFA 3W15C 2YLNA 4RY1A 3TCGA 4JWOA 4OTEA 3DP4A 3PV0E 4ZECA 1PEBA 1O64A 3KSXA 1B2HA 1B40A 5CMCA 2HFBA 4IO6A 1YCJA 4NF8A 4I9DA 5B70A 2FNCA 2I49A 3FXUA 3IOVA 1IXIA 1H43A 3OO6A 1PB9A 4NWCA 3O28A 3PU5A 1MQGA 3KBRA 4GL8A 2PBWA 3PUWE 5DT6A 1IIWA 2F7BA 2O1LA 4JB7A 4ZE9A 4X1BA 5HPQA 1OVBA 5EHMA 4G77A 2ZXTA 1B3EA 4F19A 2VOZA 3TTNA 3MWBA 2R9JA 2HQ0A 3T96B 1BTJA 2R6GE 4O3BA 1MPCA 2XHDA 3IJOB 1B5JA 5I2KB 4ELRA 1YTVA 1IXHA 3K2DA 3L6HA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U4XA 3CSBA 1NUZA 3RGYA 2KR0A 3OXNA 4TQUQ 5L8DA 2I4BA 1IMEA 1B5IA 3FATA 3BFTA 4KQPA 2F34A 1LB9A 3C35A 3SEVA 2DS9A 1QUIA 3BKIB 3KJTA 1FBPA 1IUDA 4Q5TA 4Q8RA 3H6UA 3RTWB 1TXFA 5JTYA 1NH8A 3UK4A 3SEWA 4OVSA 4NWDA 4N13A 1LLSA 4PQJA 3O66A 2Y5LA 2XWOA 2ZYMA 3TODA 1SW1A 1MH3A 4AQ4A 2WEFA 3CIJA 4YAHX 4G8HA 1AIVA 1LGBC 4PDHA 3A09A 1JETA 1S50A 2Q89A 1DSNA 4PGPA 1II5A 4NF6A 1TWYA 3LSFB 3Q28A 1GR2A 1I6BA 4GWWA 3ZS6A 4XKQA 1EYKA 1A7LA 3RNNA 4KD5A 2Y7PA 1FBFA 4BDNA 3R7XA 1IMBA 4LN5A 1B58A 4BDLA 1JQFA 1B3LA 2PX1A 5H8HB 4G8NA 4AB5A 3RY3A 4QFPA 4LUBA 2DXRA 5EYHA 5T3JA 4G2ZA 1Q1KA 4IO4A 4GWOA 3MPLA 3USDA 3K0VA 1J1NA 5B7DA 3BFUA 4NF4B 1LCFA 4NF0A 1RDYA 1MQJA 5IGAA 2D5WA 1MPDA 1N3XA 5CMBA 1EYIA 1FTJA 4OVQA 2HXWA 2FYIA 1LFGA 2F78A 5EYFA 4DDDA 2O7UA 2G93A 3CSGA 1Y1ZA 4H8IA 1LB8A 3OOAA 2THIA 4MNPA 4NF8B 1NNKA 3GXAA 3OSRA 4F3PA 4NF5A 3U1OA 1SQYA 3EN3A 4G68A 1P99A 4GXAA 1Z7ME 1B6HA 1JNFA 4PF6A 5CI5A 1EZ9A 1EU8A 1AH5A 4GWYA 2XD3A 4H5FA 4RXLA 3FJGA 2NWJA 4MLQA 3RPLB 2OLBA 1LFIA 3E79A 2QMWA 1Q35A 3H06B 3VDFA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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