4F19A

Subatomic resolution structure of a high affinity periplasmic phosphate-binding protein (pfluding) bound with arsenate at ph 4.5
Total Genus 115
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
115
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MDINGGGATLPQALYQTSGVLTAGFAQYIGVGSGNGKAAFLNNDYTKFQAGVTNKNVHWAGSDSKLSATELSTYASAKQPTWGKLIQVPSVGTSVAIPFNKSGSAAVDLSVQELCGVFSGRINTWDGISGSGRTGPIVVVYRSESSGTTELFTRFLNAKCNAETGNFAVTTTFGTSFSGGLPAGAVAATGSQGVMTALAAGDGRITYMSPDFAAPTLAGLDDATKVARVGKNVATNTQGVSPAAANVSAAIGAVPVPAAADRSNPDAWVPVFGPDNTAGVQPYPTSGYPILGFTNLIFSQCYADATQTTQVRDFFTKHYGASNNNDAAITANAFVPLPTAWKATVRASFLTASNALSIGNTNVCNGIGRPLLEAA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The molecular basis of phosphate discrimination in arsenate-rich environments.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Putative alkaline phosphatase
source organism Pseudomonas fluorescens
molecule tags Phosphate-binding protein
total genus 115
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-06
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f19A02
3.40.190.260 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 4f19A01
1TT1A 3SETA 1P1NA 3Q27A 1FTMA 2ABHA 4F39A 2XXTA 3U72A 3UORA 1FQCA 4M4GA 2OZZA 2BJJX 2F7BA 1N0TA 4U2RA 1LAHE 3ILTB 2I3VA 3K0VA 2YPNA 4DXBA 1OLAA 4F2QA 4G2ZA 3K4UA 5FTHA 1MPDA 4ONYA 3DELB 3JZJA 1XHYA 1Y20A 2H99A 1B7UA 4GVOA 3SESA 3TCGA 4GLIA 1XT8A 4ZS9A 4FECA 3MJNA 4MH5A 3JV9A 4RK9A 1DPEA 1O7TA 4WEDA 2XXPA 3HO7A 1MPCA 5I2KB 4FIMA 1XC1A 1R9LA 3CSGA 3BFUA 1CE2A 2FNCA 3G3KA 4PFUA 2XXIA 3K6XA 3C31A 4PETA 1PEBA 1DPPA 3SKPA 5L9OA 1LB9A 4ELQA 2OWSA 1DSNA 5FTIA 1JW1A 4AQ4A 2Y84A 4YU0A 4G4PA 4EXLA 1SW5A 1SDXA 4JWXA 1IIWA 2Z22A 2DQVA 3G3HA 4GWOA 3OO8A 4KFQA 3IO6A 3S9MC 3B6TA 2Y7KA 3IB0A 4XTCQ 3OEKA 3A3UA 5ICQA 5H8NA 2ZYOA 3IK6B 4KD5A 3ZS6A 1URGA 5K2XA 1OVBA 4RYAA 1ELJA 4K3FA 1ZJLA 2ZNSA 1LFIA 2F7CA 2F78A 3OEMA 1B4ZA 2G29A 3UK4A 4ELOA 1VFDA 1QW0A 1N7XA 4LUBA 1S50A 4BDRA 1PBQA 4OFOA 2RC8A 2F8DA 3U1OA 4ZEDA 1YPNA 3RN8A 3FZVA 2Z8FA 1SD3A 3FATA 2Z23A 2RINA 2GFEA 1MXUA 3FJ7A 3OSQA 3MVXA 2E0SA 3CFXA 3S2VA 3QUFA 3MC2A 2UVGA 3CFLA 3KN3A 4YB7A 1MY4A 1AH5A 3PMVA 2CZLA 1HSJA 5F1QA 1LCFA 2Y7IA 1JW5A 3KN7A 4KYSA 3ILUB 3O2AA 2D21A 2Q8JA 5DT6A 2X26A 1UTHA 2XXUA 3U94A 3ZSFA 3VVFA 3HHFA 1DTGA 1SBPA 3KBRA 4ESXA 4TLMB 2DOJA 4DIGA 2GRVA 1Z7NE 2LAOA 2X7QA 5HBCA 1H44A 4Q30B 3GLBA 3MAMA 1P1WA 1MRPA 3M3KA 3SEVA 1M5EA 1TFAA 1ZLQA 3CG1A 3I5OA 3L6GA 4IO2A 3RT8A 3N6UA 4OENA 1ZTYA 5L9SA 2VD3A 4BDMA 3TKDA 1NKXA 3T9UA 5HM4B 2VP1A 4E0XA 1MQDA 3HPIA 4PP0A 4U1OA 1A99A 3FUZA 1UQWA 4DCXA 1SVXB 4GD5A 2HZLA 4I8CA 5I59B 2E1SA 1MQHA 4IO4A 1MY2A 2O7IA 3G7WA 3LSXA 5ICTA 2DWIA 4R75A 3DM0A 3EHTA 3TZAA 5BWJA 3M3LA 5H8SA 1MXYA 1P99A 1LCTA 4TOZA 5A5XB 4YKJA 2O68A 1B4HA 5I84A 3UP9A 4OFJA 3UGWA 4EQBA 4ZECA 2VOZA 5LOMA 3CRBA 4F3BA 3TYHA 4IO5A 3QYTA 4ISUA 3VLVA 3PPRA 5DYHA 4YB5A 1XOCA 2QMXA 4M1VA 1MQIA 2ONKE 3DP6A 4YB6A 1NH7A 2GHBA 5H8QA 1FQDA 4JXIA 4H8JA 1MPBA 2QS2A 3V8XB 4X1DA 4FORA 3RQTA 2QJEA 1ANFA 2Q9TA 2GHAA 2DWHA 1QUJA 1DOTA 4F1UA 3D4CA 2NWJA 5I2NB 5TPAB 4RJZA 1NH8A 3MZ9A 1GV8A 4OEUA 1B40A 1L5TA 2Y7RA 5FHNA 4MBPA 4U4XA 4ELRA 1D9VA 5ISUA 3VVDA 3G3GA 4WEPA 2DXYA 3KJ7A 3QAXA 4I1DA 3T22A 2XXWA 4L17A 4WXJA 3MZ1A 3MP8A 1Y3NA 5I57A 4F19A 4N07A 1MM6A 5I58B 4U4SA 2VHAA 3FD3A 4Q0CA 5H8FA 1VR5A 3Q28A 1WVJA 3GZGA 4R9GA 3V89B 3TELA 4NF5A 1MH3A 2IA4A 2O51A 1VFEA 3CIJA 4YMBA 5F7VA 3PPOA 4NMYA 4QHQA 2F36A 5DEXA 2O1MA 3K1PA 3G3IA 2WKYA 3PPNA 1US4A 3ZKLA 4PFYA 3UA8A 1FQFA 2HZKA 1A54A 1IXHA 2R6GE 1LAGE 4G68B 5AA2B 1URDA 1LGBC 4Q5TA 3WAFA 1GVCA 1PB8A 1MS7A 3GXAA 3DP8A 4OERA 5KZTA 3FVOA 3TQLA 1SQYA 2O7UA 3S9LC 3RNNA 4G68C 2ZYKA 4NF8A 4R2FA 4R9FA 1FQAA 2YJPA 2Q2AA 3MPKA 5H8HB 2XX7A 4BDQA 1MQJA 4NF4B 2B3BA 4XIGQ 4E0WA 1SW2A 1NNTA 4OFLA 3VV5A 1PBPA 3MUQA 4RNSA 3PD9A 1B9JA 3OD7A 4F31B 3GBAA 1B7HA 4TLLB 1MM7A 4NWCA 2H9BA 3OOAA 2XD2A 1LBBA 1XVXA 3PV0E 3RT6B 4N13A 1BP5A 1B3GA 4XKNA 4OQOA 3EQ1A 3FXRA 5B7DA 2KLFA 1H45A 5IAIA 1M5DA 3O66A 1R1NA 3PMWA 3TTKA 5BUUA 2V84A 3RTWB 5I56B 2DWJA 2H25A 5AA3A 1D3KA 1LBCA 4X9TA 4ZE9A 4R6HA 3CVGA 1H43A 3VXCA 2DS9A 5L9MA 3T66A 1IITA 1XS5A 4DLDA 3H6UA 2DVCA 3I3VA 1N3WA 5M2VA 3UIFA 5I2KA 1CB6A 4WKMA 2V3QA 5JTYB 4RXLA 3K01A 4X1BA 4KYEA 5FHMA 3CI8A 3VDFA 2RC9A 1URSA 2NUVA 3L6HA 4IB2A 3KOTA 5TP9B 3FXQA 3IOUA 2XXYA 1FTKA 3LC8A 1HSLA 1UTBB 4JWOA 4ZEFA 1OMPA 3FJGA 5EHSA 2AIXA 4QFNA 4HCYA 4GFRA 2B65A 3TEPA 4H5FA 2V3UA 1B58A 1P1UA 2Q89A 2FYIA 2I48A 2DSFA 1F9BA 1LAFE 2RF1A 4FE8A 2R9JA 4QF9A 4U22A 5CBRA 2O69A 4HS7A 4KI0E 1QJMA 1Y1MA 3USDA 1Y3QA 2DP8A 1FQBA 4GOTA 1S9TA 2D3IA 3E3KA 4RY1A 5EHMA 3BFTA 2QS3A 4UACA 3Q29A 1N7WA 3KSJA 1QULA 2CMOA 1B0LA 1M5BA 4RK2A 1ZIUA 3FGSA 1FTOA 1IXGA 1HSEA 3KFMA 4JSOA 4N6PA 4BDLA 3IOWA 4THIA 3QUJA 5CC2A 4QFPA 3EF7A 3OMBA 3DLNA 4ZEKA 2Y7PA 1R6ZA 1B52A 3ZKKA 4POWA 4FAJA 4U1ZA 1PC3A 1IQ7A 1SW1A 1JETA 3M3FA 2NVUB 4LONB 4FEBA 3QXMA 1P1QA 4Z0IA 2Z8EA 4POXA 4KQPA 3CFZA 4OZ9A 4LZ7A 1O63A 3K00A 3H06B 4Q8RA 2P1SA 4JDFA 5FHOA 5L8DA 3S9NC 4BDNA 1B1HA 2UYEA 2XX9A 4LZ8A 3RTFB 2OBGA 1WODA 1PDAA 3BBRA 3IAZA 1YCJA 1MDP1 1YAEA 3M8UA 1MY0A 1B32A 1Y9UA 3F11A 4R6KA 1OLCA 3OELA 4RPNA 1FTJA 2H4IA 4QFOA 1WDNA 4TQUQ 4NWDA 2F6GA 4XKRA 3KOSA 3PGFA 1RKMA 1A55A 1LAXA 3RY3A 2OWTA 3K02A 3IL1B 4GXSB 4GL0A 3T9XB 1A8EA 1B1XA 3SEUA 2IEEA 4PFTA 1QKBA 2PBWA 3TPAA 2XX8A 2XXQA 1LLSA 1JVYA 2A5SA 1MXVA 4R2BA 3E9XA 3C4MA 3HN0A 3IOTA 5CRYA 4AB5A 5ITOA 3HV1A 3C9HA 1MY3A 2PMSA 1MY1A 4QRZA 2DXRA 1I6AA 2I4BA 3ONMA 5A5XA 4F22A 3PUVE 1N84A 4OETA 4PE5B 3PU5A 3K1MA 2I0BA 2UYFA 2P0SA 2ZYNA 4OHNA 3IORA 4BLAA 1TWYA 1SYIA 4GL8A 3KSXA 4P0GA 4NF6A 5AA4B 1B5JA 5KDTA 4BDOA 2RC7A 5H8QB 3VXBA 4R74A 1VE4A 4LP2B 1UIVA 3FV2A 4G77A 2VGQA 2VD2A 5J1DA 3VLWA 5AA1A 1M5CA 3LSLA 3IX1A 4EXKA 4GRKA 3S9EA 4O3AA 1USYE 1M5FA 3TTNA 5KCJB 2W7YA 5ITPA 4RPOA 1I6BA 4F18A 2D5WA 4QFKA 1N04A 2NOOA 1IXCA 1I69A 1NNFA 2A5TA 3MW0A 3MVZA 3N6TA 4NE4A 1A7LA 3QSLA 1SYHA 1B3HA 1D4NA 3IJXB 4LZ5A 4OXVA 4H5GA 1NFTA 1GTKA 1USYH 1RYXA 3E13X 2FA7A 4H8IA 4EQ9A 4IGTA 5CI5A 4XKPA 2HAUA 3PD8A 5I57B 3CSBA 3IOVA 2ONRA 5IKBA 4P0IA 2UVHA 1IUDA 4DZ1A 2DE4A 2XXXA 3O97A 1H76A 2OCUA 3N94A 5AE4A 1TFDA 3T96B 1MXXA 3V5AA 3OENA 1IXIA 4F1VA 2OLBA 5I58A 3MWBA 1B51A 1RYOA 3LBSA 2QSXA 3KEIA 3K6VA 5DEXB 1I6QA 3OO9A 1B46A 3OSRA 3R6UA 3Q26A 3H6TA 4ND9A 4FATA 1Q35A 2QMWA 3SEWA 2DE2A 5HPQA 1BLFA 2RKMA 4FJPA 1QKAA 3P7IA 4OWDA 4G68A 3EPEA 3FJMA 3S4UA 4XXUA 4EUOA 3IR1A 3TMGA 4H0WA 3PPPA 4IO7A 4H65A 2ANJA 1TXFA 2F97A 2REJA 4F3GA 2ZYMA 3FXUA 3O28A 4PFWA 4ESWA 4KHZE 1D9YA 4O3CA 2XXHA 2ZNTA 2AL5A 5H8HA 4NF4A 3BKIB 4XKQA 1S7YA 2UVIA 4ZEIA 3T9HB 2PX1A 3OXNA 4RA1A 4IO3A 2I0CA 4PQJA 2PT1A 3KZGA 2F34A 2V25A 3GBBA 3K6UA 3A09A 4LA9A 3PMXA 4GF8A 4GXAA 3A3CA 1JVXA 2I49A 5AA2D 3U92A 2QPQA 1SW4A 1T0KA 4NTLA 2I3WA 1FCKA 2O1LA 3C32A 4KPTA 3O9PA 3H03A 2HCAA 4YZZA 4H67A 2ESNA 3PUYE 5I56A 4F3SA 1MXWA 1ZBMA 2XHDA 3H4ZA 2V93A 4GIZA 4H6DA 1B5HA 3U8QA 3IO4A 5TU0A 1MG1A 3OO7A 1B2HA 3RLFE 1MH4A 4HW8A 4LQ5A 3B6WA 1J1NA 1GGGA 2PVUA 4UA8A 1POY1 1SI0A 1LFGA 1BIYA 1B7ZA 2RCAA 2B3FA 1B5IA 1QVSA 1A8FA 3SERA 4EF1A 1II5A 5JTYA 4C0RA 2DWAA 3OO6A 2HQ0A 3MP6A 2DYXA 4C1UA 5CM6A 2H5YA 4ZEBA 2PT2A 5H8NB 2OJTA 5TP9A 3TODA 4O3BA 3H3GA 1UTBA 3IB2A 4YKIA 3TTRA 4YICA 2REGA 3B7DA 2ZXTA 2I58A 1NL5A 4G8NA 4ZZAA 4QSEA 2R71A 1IZ1A 3MVYA 4IGRA 3IB1A 4HTGA 4DXUA 1A40A 3MP1A 3VFJA 4F3PA 3VLUA 4KCDA 2XD3A 4LATA 4EF2A 4OVJA 4G8HA 3MPLA 1AIVA 1O64A 5CMBA 3C33A 4EQ7A 4FEDA 3U93A 2HEUA 2ALUA 2QL3A 1DTZA 3ODBA 1FW0A 3H7MA 3TCHA 3LSFB 4DCYA 4MLQA 3E4RA 2NXOA 4H1XA 5CMCA 5CMMA 1VSOA 2GH9A 3H6VA 1NMUA 1POTA 3K6WA 3CR9A 1Y3PA 3W9VA 1SI1A 3MVWA 3RGYA 2HFBA 2I6EA 4DXCA 1B6HA 5JK4A 1EZ9A 1UTHB 1N76A 1NNKA 3PUWE 1OVTA 1EH3A 5DTBA 3W15C 3TCFA 3W9WA 2ZMBA 3TAJA 1ZMGA 4QSCA 4R72A 4EDPA 3TUSA 2HAVA 1YTVA 4MFIA 2Z8DA 3FIRA 3FV1A 3JYRA 5CBSA 2UXAA 1IEJA 3T9VA 4OESA 3TTLA 4IY6A 1MDQA 3EHSA 2ONSA 2F35A 2V3TA 3SEXA 1OIBA 1FTLA 3FVNA 1DMBA 1JNFA 3TTMA 2O6AA 4IY5A 1JW4A 3TQWA 3QK6A 3H6WA 3LSWA 4JWYA 5DVJA 1QUIA 1LB8A 1N3XA 4P11A 1Y1ZA 4JBZA 3O6IA 3K2DA 5B70A 3TFLA 3KGCA 4ECFA 4U23A 3RPWA 2P2AA 1KWHA 5I59A 5JEIA 1EZOA 4DE8A 4ELPA 4YKPA 1PB7A 4ZE8A 4OEVA 3PPQA 4AB6A 1Y4CA 1ATGA 3R7XA 4KR5A 3FVGA 2F5XA 2THIA 3IJOB 5EYFA 4NEDA 3C34A 1GR2A 1B3FA 1B3LA 3SDFA 4X48A 4I62A 3K1NA 3QIMA 4DDDA 2XXVA 3TDJA 2I4CA 3R26A 2AYSA 3C35A 4ZZEA 1QUKA 3O29A 2Q2CA 2X7PA 1Y4TA 3RUMA 1BTJA 4NF6B 4F2OA 5KDTB 4F29A 2O84X 1PB9A 3EHUA 1UIUA 1B0HA 1AL3A 3SEYA 1AMFA 5AA4A 3T93B 4U21A 3G3JA 2F7AA 2HXWA 1R9QA 4JSDA 1XVYA 4R73A 3V83A 5K2YA 2AL4A 2OK2A 1MQGA 1LSTA 4GQOA 4MF3A 4I9DA 4R6YA 2F6PA 5I2NA 3O6GA 5TPAA 2XXRA 4C1TA 1EU8A 4YMAA 1H3DA 3THIA 2QS4A 2ZNUA 3KN8A 2DVZA 2A5TB 3C36A 3HSTA 5KCJA 3PUXE 4MLVA 3MBPA 3N26A 4Z7EA 1AOVA 4KYDA 1US5A 1P1OA 4YKKA 1BKAA 1Z7ME 1OQHA 3VE1B 1JQFA 3FASA 3FVKA 4QFLA 5H8FB 4OTEA 5CMKA 3KJTA 3DP4A 2Y7WA 3O6HA 3CG3A 4IO6A 5DVFA 4KCCA 1EZPA 4NF5B 3PUZE 4OMBA 1JEUA 2G93A 1Q1KA 1JEVA 4JB7A 1LFHA 3MZBA 3MQ9A 1MXZA 2UVJA 1FQEA 5DVIA 3G3FA 4ZDMA 3I6VA 3HHGA 1ZU0A 2H98A 4G8MA 2QRYA 4QSDA 2PYYA 4YAHX 5ELVA 2DE3A 3LR1A 4LVQA 2QS1A 2Q88A 2M8CA 5AA2A 3VVEA 3Q25A 3UN6A 1B05A 4NF8B 3LUYA 1NNPA 4F1YA 3KG2A 1B3EA 4HCWA 1ZKBA 3AXFA 3N5LA 4LQ2A 3EN3A 3HCQA 4OYVA 2RCBA 2YLNA 3D4GA 3B6QA 3ECRA 1OQGA 3WAEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3A29A 1TT1A 3SETA 5FBPA 1P1NA 3Q27A 1FTMA 4PDHA 2ABHA 4H46A 4F39A 2XXTA 3U72A 3UORA 2OX3A 1FQCA 1LBYA 2PCRA 4M4GA 2OZZA 2BJJX 2F7BA 1N0TA 4U2RA 2ZZWA 1LAHE 3ILTB 1Q9DA 2I3VA 3E79A 3K0VA 1INPA 4P3LA 2YPNA 4DXBA 1OLAA 4F2QA 4G2ZA 3K4UA 5FTHA 1MPDA 2HHMA 4OVSA 4NG7A 4ONYA 3DELB 3JZJA 1XHYA 1Y20A 2H99A 1B7UA 4GVOA 3SESA 3TCGA 1FBHA 1XT8A 4GLIA 4ZS9A 2Q8MA 4FECA 3MJNA 4MH5A 3JV9A 4RK9A 1DPEA 1O7TA 4WEDA 2XXPA 4P1LA 3HO7A 1MPCA 5I2KB 4FIMA 1XC1A 1R9LA 3CSGA 3BFUA 1CE2A 2FNCA 3G3KA 4PFUA 2XXIA 3K6XA 3C31A 4PETA 1PEBA 1DPPA 4O8MA 3SKPA 5L9OA 1LB9A 4ELQA 2OWSA 1DSNA 5FTIA 1JW1A 4AQ4A 2Y84A 4YU0A 4G4PA 4EXLA 1SW5A 1SDXA 1RDYA 4XF5A 4JWXA 1IIWA 2Z22A 3RPLB 2DQVA 3G3HA 4GWOA 3OO8A 4KFQA 3E78A 3IO6A 1FPKA 3S9MC 3B6TA 2Y7KA 3IB0A 4NHBA 4XTCQ 3OEKA 3A3UA 5ICQA 1EYJA 5H8NA 2ZYOA 3IK6B 4KD5A 4PAKA 3ZS6A 1URGA 5K2XA 1OVBA 4RYAA 1ELJA 4K3FA 4MCOA 1ZJLA 2ZNSA 4GX4A 1LFIA 4GWZA 2F7CA 4QBAA 2F78A 3OEMA 1B4ZA 5IZ1A 2G29A 3UK4A 4ELOA 1YYZA 1D9QA 1VFDA 1QW0A 1N7XA 4LUBA 1S50A 4GBVA 4BDRA 1PBQA 4OFOA 5A5LA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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