4F29A

Quisqualate bound to the ligand binding domain of glua3i
Total Genus 82
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
82
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGTPVNLAVLKLSEQGILDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 3
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein/agonist
total genus 82
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f29A01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f29A02
4OWDA 3FIRA 3OO7A 4WXJA 5AA1A 4G68C 4R2FA 3A09A 4ECFA 5DVFA 4XTCQ 4NF5A 3Q25A 4JWXA 3IOUA 4JBZA 1R9LA 2RKMA 1NNPA 2DWIA 3CI8A 3PUZE 4KCCA 5TPAB 1EZ9A 4OQOA 4RNSA 1A7LA 3TTLA 4HS7A 2D5WA 4F22A 1N7XA 3TQWA 3FJGA 1SYHA 1OIBA 1MQHA 3KJ7A 2LAOA 3R7XA 4F3BA 4P0GA 4F31B 1LFGA 1UIVA 3U92A 4Q5TA 3LSLA 3K1PA 2Y7IA 3V83A 4F1UA 5ISUA 4FEDA 2E1SA 4I1DA 3VLUA 2XXRA 3KZGA 1B51A 4ONYA 5K2YA 2HFBA 2F35A 1UQWA 1JNFA 4PETA 4OHNA 3HSTA 3VVEA 4F29A 3MJNA 3QUJA 1II5A 3TELA 2XD3A 5I84A 4FAJA 1P1OA 4JWOA 4IO5A 3VDFA 4ISUA 3CG3A 1Y3QA 5DTBA 1MS7A 3MP1A 2ZYKA 4RXLA 2WKYA 4C1TA 5CI5A 1AMFA 3IJXB 4E0XA 2AYSA 5I56A 4ZE9A 2H9BA 3DLNA 1MM7A 4POWA 3BKIB 3OOAA 3HHFA 3UGWA 2H25A 3IX1A 2UVGA 3HPIA 1MQDA 1B3HA 3S9MC 4GL0A 1FQDA 1B6HA 1QUJA 3OXNA 1LB8A 2V3UA 4DLDA 3A3CA 4R9GA 2F78A 1N3XA 5KDTB 4GF8A 3Q29A 3RLFE 1N3WA 1B3EA 3H6TA 4R6YA 2XXPA 4RA1A 4RK9A 5CMKA 1MG1A 1WDNA 1Y3PA 2OLBA 4H8IA 1JVYA 2UVJA 1LBBA 4IGTA 1LAGE 1OLCA 3RGYA 4N6PA 4U21A 4H8JA 2I3WA 1HSEA 5ELVA 3RTFB 1USYH 4GQOA 2V93A 1LAXA 1A54A 2Q9TA 3QAXA 1Z7ME 1ZJLA 5I58B 4F1VA 1D4NA 2VD2A 5H8HB 3MAMA 2I49A 2XXTA 2X7QA 4RK2A 1IXCA 4ESXA 5L9OA 3MWBA 5H8FA 3QUFA 2H5YA 5ITPA 3KOTA 4G8NA 2V84A 3P7IA 4KYDA 2THIA 2XD2A 5H8NB 3KSJA 1M5DA 1JVXA 3FVGA 1H3DA 4YAHX 3B6WA 2I6EA 1IXGA 4G68B 1DTZA 4AB6A 4G77A 2B3FA 2A5SA 2DWHA 1MXUA 3GXAA 3T96B 2Y7RA 4H65A 2NWJA 1N0TA 4LONB 4ELOA 4RY1A 5ICQA 1M5BA 1XC1A 1MPBA 3BFTA 2I0BA 1VR5A 2CZLA 3PPNA 5CMMA 3ZKKA 3THIA 2RC8A 2ZYMA 4DCXA 3IAZA 4YB5A 4QRZA 3S9EA 3UK4A 3F11A 4AQ4A 1KWHA 1BLFA 5I59A 1B7ZA 1VFDA 3KG2A 3MVZA 4ELRA 5H8QB 5EHSA 3G3GA 2B65A 4QFKA 4F2QA 1B0LA 4GXAA 4ZS9A 4UACA 3CIJA 1FQCA 1JW5A 4LATA 1PEBA 4F39A 3GZGA 5DEXA 3U72A 4AB5A 1MH3A 2REJA 4C1UA 4OTEA 1IQ7A 2QPQA 1MQIA 3G3KA 4NF4B 4KI0E 1WODA 3KN7A 2I48A 3EQ1A 4GRKA 3ODBA 5CMBA 3SEYA 3KJTA 2AIXA 3FASA 3DP6A 3UORA 2V3QA 1RYOA 3O6GA 4OFLA 2DXYA 1H43A 1RYXA 3VXBA 3HHGA 1OMPA 5CBSA 3O29A 2HZLA 2OJTA 1R1NA 3HO7A 2IA4A 3PD8A 1CB6A 4EQBA 4X9TA 3U94A 1LCFA 3H3GA 5DVJA 2XXIA 2V3TA 4YKJA 3RPWA 2UYFA 1PBQA 1POTA 4F18A 1POY1 4JXIA 1IZ1A 3M8UA 1MPCA 1PC3A 2PYYA 3IJOB 2W7YA 2O51A 3LUYA 4BLAA 1PBPA 5L8DA 5AA2A 2VP1A 1IXIA 3D4GA 4LA9A 3OO6A 3MC2A 1N84A 1XT8A 3CFLA 3PPOA 3AXFA 3C32A 5A5XA 3MVWA 2VD3A 1GV8A 1TT1A 5H8FB 4TOZA 1UTBB 3K2DA 3O6IA 1LB9A 4NF6A 1BP5A 2UVHA 3R6UA 1B3GA 1N7WA 3FVNA 2OWSA 4U23A 4I8CA 1DPPA 3VLWA 3T93B 3IK6B 3IR1A 4FEBA 4H5GA 2XXWA 4O3BA 4Q8RA 3G3JA 4MFIA 4GWOA 1M5FA 1DPEA 3TAJA 4TLMB 5TU0A 3S9NC 2O7IA 4U4SA 2DSFA 4U1ZA 4NEDA 1B46A 4O3AA 4DXCA 3FGSA 1N76A 4U4XA 4OMBA 4KHZE 1S9TA 2QRYA 4QSEA 3H06B 5CC2A 2A5TA 4OFJA 3H6WA 1NKXA 4ZEIA 1LFIA 1FQEA 4JSOA 2E0SA 1URSA 1R9QA 3OSRA 4IO4A 1UTHA 1P99A 4EXLA 2RF1A 1US4A 5JTYB 1B5JA 4GIZA 1JEUA 4U2RA 2XXXA 2HAUA 3CVGA 1NNFA 3SEWA 4OENA 3I5OA 4MLVA 5CRYA 1LSTA 2DE2A 4ND9A 3IO6A 2KLFA 3V5AA 2G29A 4R75A 3U8QA 1FTOA 4OFOA 5KCJA 4NWDA 1M5CA 2XX8A 4H0WA 4ZZEA 4H6DA 1LCTA 3S4UA 1AL3A 3MP6A 3GBBA 4G4PA 4OXVA 3Q28A 4G8HA 2UXAA 4LZ7A 4QFLA 3PPRA 2DVZA 2ZNTA 1MXZA 3MPKA 1H76A 2I4CA 4FE8A 4NF8B 4O3CA 1LFHA 3VXCA 3BBRA 1B4ZA 3KOSA 3FATA 4HCWA 2QSXA 2F36A 4IY5A 4ZZAA 4KYEA 3C4MA 2PVUA 5L9SA 3KN8A 3RN8A 3U93A 3C33A 5ICTA 2QMWA 3TTNA 4LP2B 1TXFA 3SESA 1NL5A 3B6QA 2Q8JA 3HCQA 1IXHA 1Y9UA 1S7YA 4YZZA 1H44A 1FTJA 1YPNA 2QS3A 1TFDA 3EN3A 5TP9A 3ILTB 2GHBA 4X1DA 3JZJA 2Y7WA 5A5XB 2DP8A 1B40A 3PD9A 3FJMA 4NF6B 1TWYA 4MBPA 2ZNUA 1PDAA 2I3VA 5I57A 2DYXA 2NVUB 2Z23A 4OERA 4YMBA 5CM6A 1MDP1 3FUZA 4MLQA 2F5XA 3O97A 3K01A 2R71A 3K02A 3K0VA 3SEVA 1I6AA 2O84X 2FYIA 3OD7A 3ZSFA 4PE5B 1PB8A 1PB7A 1SW5A 4OZ9A 3OSQA 2ESNA 4ELPA 2R9JA 4BDNA 4F3PA 5BWJA 4Q0CA 2O68A 1B32A 2DXRA 1SW2A 5LOMA 4F3GA 3O6HA 1P1QA 1SVXB 3H6VA 2Y84A 3KN3A 4YKIA 5I2NA 1UTHB 2D3IA 1Y1MA 3TTMA 3MZ9A 2ONKE 4XKPA 1Y20A 2NUVA 1B05A 3QIMA 3PV0E 3T9VA 4PFWA 2OZZA 3LC8A 3RQTA 2NXOA 2O1LA 4NF5B 4U22A 4KCDA 4BDMA 1MXWA 3E13X 2I58A 4ELQA 4BDOA 5IKBA 5J1DA 1QVSA 5FHNA 2HXWA 2QL3A 4MH5A 3G3IA 4GD5A 3TKDA 2ZYNA 1MXYA 1QULA 1FTMA 4OEUA 4EUOA 4OETA 3T9XB 1ZMGA 4RPNA 4QFNA 1Q35A 3K6XA 1B1XA 3TPAA 4EF1A 1Z7NE 3O9PA 1MQJA 4HTGA 2OWTA 4KD5A 4NTLA 3JYRA 1NMUA 2H4IA 3CSGA 4ZECA 1SW4A 4PFYA 1ATGA 5I2KA 3VFJA 1D9VA 3M3LA 2GH9A 4RYAA 3SEUA 1MH4A 3C34A 3PUVE 3W9WA 1P1WA 4HW8A 1Y4CA 1F9BA 4R2BA 3TCFA 1Y4TA 4FATA 2XXUA 4IO3A 5F1QA 1CE2A 4QSCA 1MY4A 2XXYA 1O7TA 1XHYA 5I56B 1QJMA 3ILUB 3C31A 1YTVA 2Q2CA 3FD3A 1DSNA 5FHOA 1DOTA 3MP8A 1B3FA 3GLBA 1NFTA 2X26A 1QUIA 3PMVA 3MPLA 2M8CA 3RUMA 1TFAA 1FCKA 4R6HA 1Y3NA 2IEEA 2ZXTA 5EHMA 3JV9A 4JWYA 5BUUA 2I0CA 3HV1A 4IB2A 5B7DA 3VVFA 1EZPA 4DXUA 3PUWE 2V25A 2AL4A 1VE4A 1MXVA 3ONMA 3FZVA 2FNCA 4PP0A 4F2OA 2Y7KA 3FXRA 1LAHE 3WAEA 4FJPA 3OO9A 4IO2A 1SI1A 3G3HA 1EZOA 3MZBA 3FV1A 1QKBA 1IUDA 3CFZA 2VOZA 3CR9A 2DWJA 4H1XA 3TCGA 5AA4A 3VVDA 2XX7A 1B0HA 1ANFA 2F7CA 4G2ZA 1J1NA 1SDXA 3LR1A 3V8XB 2O7UA 2PBWA 4X48A 2HQ0A 1B5IA 3UA8A 4KYSA 4POXA 2Z22A 5HM4B 1ZU0A 1VSOA 3PU5A 4PFUA 3N5LA 5M2VA 4KQPA 3CFXA 1SQYA 5KDTA 5AA2D 2P2AA 3T66A 2RCBA 3FXUA 2RC9A 4THIA 1MM6A 1ELJA 1I6BA 3TDJA 4WKMA 1SBPA 2XHDA 1H45A 2B3BA 4GL8A 3TFLA 1M5EA 4R72A 4GOTA 1OVBA 1R6ZA 1SYIA 3M3KA 5HBCA 4ZEDA 3QYTA 3D4CA 2RCAA 5I59B 1FQBA 4XKNA 3VV5A 4YICA 3N26A 3SERA 2GHAA 4FORA 3H6UA 2QS4A 4NWCA 4I9DA 4P11A 3FVKA 5I2KB 2R6GE 3EHTA 4N13A 2YLNA 3KGCA 1MQGA 2F6PA 4F3SA 3IORA 4FIMA 1I6QA 3OMBA 3IB2A 4DE8A 3TMGA 2CMOA 2PMSA 1O63A 1FTLA 3EHUA 5F7VA 4DDDA 5I58A 5DEXB 3KFMA 1JETA 2QS2A 3G7WA 1LBCA 1ZBMA 2P0SA 3OELA 3OO8A 5H8HA 2YJPA 5H8SA 4DXBA 4QSDA 5KZTA 2FA7A 3G3FA 1US5A 4L17A 4ZDMA 1JW4A 3CG1A 4BDQA 5H8NA 1NNKA 2DE3A 1Q1KA 3LSWA 3S2VA 3IOTA 3EPEA 4G68A 2F6GA 4ZEKA 4YMAA 1B7UA 2HAVA 4G8MA 2DOJA 3TQLA 2UYEA 1AH5A 4Z7EA 1MY1A 4DZ1A 3IO4A 4UA8A 1GVCA 5K2XA 4NE4A 2REGA 1B9JA 4R73A 2DS9A 3PUYE 2Z8FA 3PGFA 3C9HA 2HEUA 2XXVA 5FTHA 3MUQA 2ZNSA 4YB6A 3K6UA 4YU0A 5H8QA 4EDPA 3OEMA 1O64A 4X1BA 1ZKBA 3E4RA 4RJZA 3Q27A 5AA2B 4YKKA 1NH7A 5AA3A 3WAFA 1MDQA 3UN6A 1IITA 1D9YA 4EXKA 2ANJA 1I69A 5CBRA 2RINA 2O69A 1LLSA 3PMWA 4NF4A 2PT1A 3TTKA 3SETA 2Q88A 2ALUA 3KSXA 2XX9A 5AA4B 3MVXA 3FV2A 1URDA 4QHQA 2ONSA 3UP9A 2VGQA 3K1NA 3E3KA 4IO6A 3FXQA 4YKPA 4ZE8A 4EQ9A 5B70A 3IB1A 1YAEA 1FW0A 4Q30B 1MY0A 3K1MA 4LUBA 4TLLB 1MRPA 3SDFA 3EF7A 3L6GA 5CMCA 1DTGA 3N6UA 1EH3A 4C0RA 3ZKLA 1NH8A 2A5TB 4DIGA 3W15C 3FJ7A 4LVQA 2DWAA 3B7DA 1B2HA 1QKAA 4EF2A 3TCHA 2H98A 5L9MA 2PX1A 1P1NA 1QW0A 3OENA 2QJEA 4LZ5A 2VHAA 4N07A 1BKAA 3GBAA 1EU8A 5JK4A 2Z8EA 1BTJA 3O2AA 1QUKA 3QXMA 4MF3A 3TTRA 1VFEA 5IAIA 3U1OA 3E9XA 4JSDA 3TUSA 1B1HA 5ITOA 3RT8A 4F1YA 5KCJB 4KR5A 2ZYOA 1UTBA 4JB7A 4GVOA 3BFUA 3RT6B 4BDRA 1OQHA 2YPNA 2OBGA 4KFQA 4QF9A 1S50A 3QK6A 2O6AA 4OEVA 1IIWA 3MQ9A 1B58A 2NOOA 3I6VA 3B6TA 3DP8A 1LGBC 4Z0IA 3K4UA 1ZIUA 2F7AA 1ZTYA 2OK2A 1T0KA 1RKMA 1MPDA 4HCYA 1GR2A 1PB9A 1HSLA 2D21A 4IO7A 1FQAA 2F97A 1B7HA 1LAFE 3A3UA 4IGRA 1D3KA 4XKQA 3QSLA 2HCAA 5JTYA 3S9LC 4H67A 3H03A 5AE4A 3UIFA 5TP9B 2F7BA 1BIYA 3MZ1A 2RC7A 1IEJA 2UVIA 1DMBA 1B3LA 1JW1A 4F19A 2ABHA 3FVOA 3CRBA 3ECRA 1AOVA 3HN0A 3DM0A 4K3FA 4OYVA 5TPAA 2Z8DA 3IOWA 1MY2A 3C35A 4IY6A 2F34A 3RY3A 2ONRA 4RPOA 2I4BA 4QFPA 3RTWB 2G93A 3PUXE 5I57B 5JEIA 4FECA 2QS1A 3H4ZA 3ZS6A 2AL5A 3KBRA 1Y1ZA 4WEDA 1SI0A 3USDA 1JQFA 1XVYA 3LBSA 4R9FA 3K00A 1UIUA 4JDFA 3PPPA 4NF8A 4XXUA 4XKRA 2OCUA 2GRVA 3T22A 2QMXA 5DYHA 2Q89A 2H99A 4LQ5A 3PMXA 2HZKA 4QFOA 3RNNA 3K6VA 3DELB 1A8FA 4ZEFA 2Y7PA 3N6TA 3H7MA 3TYHA 4ZEBA 5FTIA 1A55A 1L5TA 5I2NB 1ZLQA 5DT6A 2BJJX 3I3VA 3C36A 1P1UA 4GXSB 1OQGA 2PT2A 4I62A 2DVCA 1B4HA 2GFEA 2XXQA 3VE1B 1OVTA 3TZAA 3TODA 3K6WA 2P1SA 4EQ7A 4GFRA 4XIGQ 3MBPA 4NMYA 1A40A 4OVJA 1JEVA 4H5FA 1N04A 3PPQA 4YB7A 5FHMA 1AIVA 5HPQA 2Q2AA 1GGGA 4PFTA 1MXXA 3KEIA 1HSJA 1FQFA 5DVIA 2X7PA 1URGA 3LSFB 4PQJA 4LQ2A 3MVYA 1A8EA 1B52A 1GTKA 3O66A 2O1MA 4U1OA 4GLIA 1XOCA 1B5HA 3VLVA 1XS5A 4OESA 1FTKA 3IOVA 3M3FA 3EHSA 2F8DA 4TQUQ 3R26A 1USYE 4R6KA 4M4GA 1A99A 4M1VA 4WEPA 2XXHA 2ZMBA 3L6HA 2DE4A 2DQVA 3MW0A 3N94A 3TEPA 1XVXA 1YCJA 3DP4A 3T9UA 3SKPA 4R74A 1WVJA 4ESWA 4KPTA 3IL1B 3SEXA 1NNTA 5EYFA 3Q26A 3T9HB 4BDLA 1SW1A 3O28A 3W9VA 1MY3A 3V89B 3LSXA 3CSBA 1SD3A 4DCYA 1OLAA 4E0WA 4LZ8A 4P0IA 3OEKA 3IB0A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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