4F2OA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 3
molecule tags Transport protein/agonist
source organism Rattus norvegicus
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA02
1LFGA 2HXWA 1N3WA 1ZLQA 2F7BA 4IO2A 5A5XA 1VSOA 4FEDA 3PUXE 3V8XB 1D9VA 2W7YA 5L9SA 4G8MA 1GR2A 3TTMA 1MXWA 2DWHA 1SDXA 3IJXB 3ILTB 2ONSA 3IOTA 3DLNA 2Y7IA 2B3FA 5KZTA 4TQUQ 4Q30B 1SYHA 4MLVA 2FYIA 1MQGA 5HM4B 1BIYA 3G3FA 1MDQA 1QUIA 3UORA 2H9BA 3OO8A 3Q29A 3N94A 3FVOA 3OO9A 4EXKA 5B7DA 5JK4A 3MUQA 1XC1A 5I2NB 1NMUA 3T96B 1B5HA 1JNFA 2XX7A 3PPPA 5AE4A 2DE4A 3K2DA 1MY1A 3CIJA 4P0IA 5AA1A 4KD5A 4XKPA 2QS2A 1XS5A 3HHFA 4OENA 5BWJA 1LBBA 3KSXA 1P1WA 4EQ9A 5A5XB 4NF5A 3G3IA 1B6HA 4JXIA 3D4GA 2XXXA 4F1UA 3TUSA 1B7HA 4THIA 1ATGA 1QKAA 3FVNA 2YPNA 3TCHA 1O63A 1POTA 2V3QA 1FTOA 2ALUA 2DXYA 1IXCA 4JWOA 3H7MA 1SD3A 4RPOA 5ICQA 2GHAA 3OD7A 4RK9A 3VVEA 4Q8RA 2V84A 4H8JA 2QS3A 5H8NA 3SDFA 3G3GA 3HCQA 5I59A 1QVSA 1L5TA 5I84A 3VDFA 1PBQA 2OCUA 3IOVA 2YJPA 4OVJA 4R9GA 1EZ9A 1XVYA 3WAFA 2UYEA 4KQPA 4F3BA 3KN8A 4DIGA 3N6TA 4G2ZA 1UQWA 4FEBA 4HCYA 4TLLB 4HCWA 3K1NA 3M3KA 3H3GA 3IOUA 3GXAA 4C1TA 5H8FA 1FW0A 4NF5B 1ZKBA 4R2BA 1MDP1 1MQDA 4AB6A 1MXXA 2OBGA 3T9XB 3E13X 2DE2A 1LFIA 1YAEA 4XKQA 3CR9A 1EZOA 1HSJA 1PEBA 1EZPA 3EF7A 1S50A 4RNSA 1Y4TA 4H0WA 3QAXA 2ZYMA 2REGA 1EU8A 1MPBA 1URDA 2I4CA 2QSXA 2D21A 4KHZE 4OXVA 5H8NB 1SI0A 5I59B 1D3KA 1TFAA 4OZ9A 3C33A 3EQ1A 4Q0CA 4DLDA 3IB2A 2VGQA 3FASA 4I8CA 1OLCA 2RCBA 3TKDA 1JEVA 2M8CA 3LC8A 1US5A 4E0XA 3OXNA 4KPTA 2VD2A 3Q28A 1IITA 1DMBA 1Y3QA 4YKIA 1XOCA 3MZBA 3O6IA 4OEUA 3QSLA 3T66A 4KCDA 5H8FB 4IB2A 3OOAA 1SW4A 5CBRA 4U4XA 1Y4CA 4YB6A 4H65A 2I3VA 1H45A 4BDQA 4QFOA 1WVJA 4IO7A 4YMAA 4K3FA 3VLUA 2AIXA 1NNFA 2UVJA 3PV0E 3TTKA 1UIUA 3C35A 2R9JA 4N6PA 3FGSA 4GXAA 1IZ1A 5LOMA 3BKIB 4FJPA 4F3PA 4G77A 2VOZA 2Z8EA 4DXCA 4R75A 4FATA 4LATA 4F29A 1VR5A 1YPNA 1I6QA 3SEUA 4ELRA 4YMBA 4RY1A 4R6KA 4YKKA 1OQGA 2DVCA 3QIMA 3MVWA 4BDOA 3MP6A 1A7LA 4GXSB 1N0TA 3I3VA 3O28A 2B3BA 2PX1A 1O64A 4OERA 3IK6B 1CB6A 4GFRA 4F31B 3OELA 2DWIA 2RC9A 3LR1A 4DDDA 4PP0A 4RPNA 2XXUA 1SI1A 5HBCA 2Q8JA 3QUJA 2XXIA 3LUYA 3B6TA 1FTJA 3T22A 4X1BA 4RXLA 4KCCA 4JSOA 3FATA 2Q2AA 3V89B 4F1YA 1N84A 3OEMA 4C1UA 5FTIA 2RCAA 1SVXB 1SYIA 1TWYA 3VXCA 3THIA 3MVXA 1XHYA 3FV1A 4YU0A 4DXUA 5TU0A 4X1DA 3TCFA 2Q2CA 3MC2A 3SEYA 2RC7A 3RGYA 5CBSA 3DP8A 1Y3NA 1AIVA 4EDPA 2ZNSA 4ZEBA 3R7XA 1S9TA 3Q27A 5DYHA 2H98A 2DS9A 3E3KA 5DEXA 2ONRA 2QL3A 2XX9A 2GFEA 1OLAA 1Q1KA 3CSGA 2I4BA 1YTVA 2Z8FA 3D4CA 3TELA 1Y9UA 1A55A 5JEIA 1PB9A 1MH4A 1JW1A 4EF2A 4PETA 1QJMA 3EHUA 4ISUA 3LSFB 3SERA 1OVTA 4JWXA 4FIMA 1II5A 1NNTA 3HHGA 1URGA 2A5TB 4QFKA 4XTCQ 3MQ9A 2H5YA 1ANFA 4MH5A 1JW5A 3EHTA 2FNCA 3K1PA 3IORA 3VVFA 1S7YA 3RUMA 3EHSA 2V25A 5DTBA 3BBRA 2CMOA 2VP1A 3G3KA 3A09A 1P1QA 2B65A 3KJ7A 4F22A 5ICTA 2F7CA 3GLBA 2NWJA 1JVXA 1LCTA 4GF8A 5DEXB 1QUKA 5I56A 5M2VA 4LZ7A 2R6GE 4NWDA 4F39A 4IY5A 4BDNA 2IEEA 2RINA 2NVUB 1BTJA 1SBPA 3PD9A 3RT6B 5L9MA 4IO4A 1MQHA 3VV5A 3H6TA 2IA4A 4NMYA 3MWBA 3MBPA 5TP9A 1MQJA 1AL3A 1URSA 1BKAA 1Y1ZA 1MG1A 1B5JA 4NEDA 4MF3A 4Q5TA 3R6UA 1UIVA 1ZMGA 4WXJA 4QF9A 1QULA 1IEJA 1R9LA 3M8UA 2DP8A 2HAVA 4H5GA 1IXIA 2E0SA 3JV9A 2I48A 4U21A 5I56B 1HSEA 5HPQA 3TCGA 5DVFA 4KI0E 1HSLA 3CG1A 5EYFA 1UTHA 3IB1A 3C36A 4OFLA 3QYTA 4F18A 3H06B 1RYXA 2F6GA 3K0VA 5CI5A 2XXYA 3IO4A 4ELQA 4ZEDA 3KGCA 2QMWA 2PYYA 4AQ4A 3SEXA 3MJNA 5TP9B 1LSTA 3OSQA 1LGBC 3PUZE 5CMCA 4F1VA 3K02A 1DPPA 2CZLA 4JB7A 1BP5A 4X9TA 5TPAA 3N6UA 4O3BA 4G8NA 1PBPA 2Q88A 4YZZA 3PPQA 1B7UA 1NNPA 1N04A 3V5AA 1SW2A 3CVGA 3FIRA 4OTEA 4OHNA 3OMBA 3M3LA 4ZZEA 4R6YA 4YKPA 4EQBA 3U8QA 4FE8A 1D4NA 1M5EA 3IR1A 2PT2A 2X7QA 2ONKE 4TOZA 2NXOA 1UTHB 4G4PA 5ITPA 3I6VA 4OETA 4IY6A 2Y84A 1A40A 4DE8A 3TZAA 3W9VA 3FXRA 1B58A 4NF8B 4PQJA 5ELVA 2O1MA 4GL8A 4PFWA 4OWDA 2V93A 3K00A 3SEVA 5I2KA 4JWYA 1IUDA 3MPLA 4O3AA 4ZEKA 1Z7NE 1M5DA 3IJOB 2HZKA 3RPWA 3E9XA 1N7WA 5TPAB 1OVBA 2G93A 1MM7A 1H43A 1KWHA 4Z7EA 1RYOA 4KYDA 2ZYKA 3JZJA 3G3HA 2ESNA 2PT1A 4FAJA 1FQCA 3JYRA 3S9EA 3SESA 2ZNTA 2DWAA 3K6WA 1A54A 4U4SA 5ITOA 3U94A 1B05A 3A3UA 4RJZA 2XXHA 3T9UA 1MPDA 1LAHE 3S9MC 1GTKA 2QS4A 2ZNUA 3IX1A 1A99A 1F9BA 3QXMA 1M5BA 1WODA 5B70A 5IKBA 5FHNA 4PE5B 1DTZA 1XVXA 5FHOA 5I2KB 2I3WA 3UIFA 4F3GA 2F97A 1USYE 2VHAA 2F7AA 3LSLA 2R71A 2ZXTA 1P1OA 4I62A 3A3CA 1B0HA 2PBWA 1MXUA 3H6WA 2REJA 5CMBA 4U22A 4GRKA 3UA8A 4ZEIA 3L6HA 3I5OA 1FQEA 2F34A 3TYHA 1PC3A 4EQ7A 2F5XA 5CMKA 4MFIA 2XXRA 1B3HA 3C32A 4HTGA 2O7UA 1N3XA 3IAZA 4R73A 3O2AA 3IL1B 4R6HA 2F8DA 1Y20A 3K6UA 3H4ZA 1AMFA 5JTYB 1MXVA 1VFEA 2HQ0A 1OQHA 1TT1A 1B1HA 4IO3A 3U93A 3ZS6A 3U72A 5CC2A 3HPIA 2Y7RA 1B3LA 1JW4A 1Z7ME 2GHBA 1NH8A 1LAGE 4NWCA 3FXQA 2DSFA 3FJGA 5EHMA 3FJ7A 1SW1A 1USYH 3TODA 4P0GA 3KOTA 5CRYA 3CI8A 3O6GA 3BFUA 2H99A 1NH7A 5L9OA 5AA3A 2Y7PA 4I1DA 1B51A 2HFBA 3VLWA 2A5TA 1LAXA 2WKYA 1J1NA 3MP8A 3MAMA 4BDRA 4KYSA 3H6UA 3O66A 2O6AA 3PMVA 4U1ZA 1MPCA 5K2XA 3L6GA 4QSDA 3KZGA 4LZ8A 4N07A 1R9QA 2Z22A 3K6VA 2QJEA 1SQYA 4GIZA 3FVKA 2OWTA 2XD2A 4KYEA 3E4RA 5FTHA 5I57A 3RTFB 1JVYA 1FQBA 3UP9A 1ZTYA 2H4IA 3DP6A 1LAFE 3O97A 4M4GA 1P99A 2OLBA 4QFLA 3PUVE 2QRYA 4XKRA 3TTLA 3VLVA 1B1XA 1B3FA 2DOJA 2HCAA 3GBBA 3W15C 4R2FA 2LAOA 2X7PA 2OWSA 1NFTA 2O68A 4OEVA 2YLNA 3HO7A 3UK4A 3USDA 3UGWA 2P2AA 4F2OA 3DP4A 2RKMA 4G8HA 2X26A 1IIWA 3TTRA 4H8IA 4H1XA 3RQTA 3ILUB 4AB5A 1WDNA 1FCKA 3HSTA 3WAEA 1LLSA 4MLQA 4YKJA 4U1OA 3PPRA 1MY3A 4XXUA 1MY4A 1B2HA 2I49A 5I57B 3KFMA 1DTGA 1YCJA 4EUOA 3P7IA 3MZ9A 2Z23A 3FUZA 2HEUA 4MBPA 4GL0A 1M5FA 3O6HA 3LBSA 2NUVA 3OO7A 2A5SA 4GVOA 2NOOA 4U2RA 3RT8A 5H8SA 3RLFE 1AH5A 4EXLA 1R6ZA 3ECRA 1B0LA 2XX8A 1Y3PA 4GD5A 3MVYA 4BLAA 2ZMBA 2FA7A 4ZS9A 2GRVA 1I6AA 5EHSA 3C9HA 1DOTA 5I58A 1US4A 1IQ7A 3M3FA 4PFTA 3TQWA 3OO6A 1B4HA 1JETA 2DQVA 4OQOA 4KFQA 3KN3A 1B4ZA 4BDLA 3LSWA 1ELJA 3G7WA 3SKPA 5H8HA 4ECFA 4ND9A 4G68A 2F78A 3KEIA 4JBZA 1P1NA 1FTKA 1UTBA 3Q26A 3U1OA 4L17A 4R9FA 1B52A 1P1UA 1I69A 4HS7A 5F7VA 3OSRA 4NF6A 3T9HB 3C4MA 2P0SA 4X48A 2UVHA 4NF8A 4QFNA 1MH3A 3KSJA 4JSDA 3OEKA 2D3IA 3KBRA 1A8EA 1ZIUA 1FQAA 3IB0A 1NKXA 2DE3A 1IXHA 3T9VA 1B5IA 2QMXA 2AL5A 5I58B 5J1DA 3VXBA 2D5WA 1NNKA 5IAIA 4Z0IA 1B46A 3PMXA 1MY0A 3BFTA 2I0BA 3K6XA 1B7ZA 4RK2A 3U92A 1EH3A 1JQFA 4PFUA 5H8HB 4C0RA 1B3EA 3O29A 3DM0A 4G68B 1LB8A 3K01A 4IGRA 3VE1B 4WKMA 4ELOA 2HAUA 2F36A 1UTBB 3F11A 2I6EA 4YICA 3ONMA 1N7XA 1LBCA 3RNNA 4I9DA 3FXUA 3PMWA 3R26A 4LA9A 4GLIA 4F2QA 2UYFA 2Y7KA 1MXYA 3IO6A 4ESWA 2O7IA 4IO6A 1PB7A 2OJTA 4NF6B 3PGFA 1D9YA 3S9LC 4ZEFA 1I6BA 4IO5A 4RYAA 4LZ5A 1PB8A 4E0WA 1H3DA 2ZYOA 2DYXA 3MPKA 4POXA 1B3GA 4XIGQ 4TLMB 5AA4A 3CFXA 2OK2A 4QFPA 5BUUA 4YB5A 4G68C 3T93B 1LB9A 5F1QA 1ZBMA 2ZYNA 4NE4A 3ODBA 2XXQA 3QUFA 3QK6A 3OENA 1RKMA 2PVUA 5DT6A 1MXZA 4DXBA 1OMPA 1MM6A 3KOSA 3GZGA 2Q9TA 3C31A 2ABHA 2KLFA 4QRZA 5JTYA 3TEPA 1MY2A 1H44A 2O84X 3B6QA 3UN6A 4LONB 1FQFA 4NTLA 3S2VA 1ZU0A 4N13A 3W9WA 3EPEA 3C34A 1M5CA 3N5LA 3TQLA 3B6WA 3KN7A 5K2YA 3TMGA 4FORA 3MW0A 4JDFA 4ZDMA 1ZJLA 3FV2A 3TPAA 5KCJA 1SW5A 2QPQA 4GQOA 3PPNA 3TAJA 3ZKKA 2QS1A 1T0KA 5AA4B 4ZECA 1N76A 5H8QA 3GBAA 2I0CA 1IXGA 1R1NA 3RN8A 2VD3A 2HZLA 3H6VA 2UVGA 2V3TA 4DCYA 3MZ1A 5CMMA 4ELPA 1MS7A 4FECA 3HV1A 3O9PA 3PUWE 2F35A 2ANJA 2O51A 1B40A 2XXTA 3V83A 4IGTA 1B9JA 3TTNA 1DPEA 3CSBA 1QKBA 1GGGA 3DELB 3SETA 4UA8A 4XKNA 4LUBA 3AXFA 3VFJA 3ZSFA 2PMSA 5CM6A 5L8DA 4OESA 2OZZA 3Q25A 4HW8A 4ZE9A 4H5FA 2F6PA 3CRBA 3CFLA 4OYVA 4LQ2A 3PD8A 3RY3A 4YB7A 4GWOA 5KCJB 3KG2A 4F19A 4OMBA 1FQDA 4PFYA 4DZ1A 5H8QB 2I58A 2UVIA 5DVJA 4P11A 1FTLA 3FJMA 4DCXA 3KJTA 1A8FA 1B32A 2AYSA 1VE4A 3S4UA 3IOWA 2Z8DA 5AA2A 4NF4A 4U23A 1XT8A 2XD3A 5FHMA 2XHDA 4LVQA 2H25A 3K1MA 5DVIA 3FD3A 3SEWA 2O69A 4LP2B 4OFOA 2RC8A 3RTWB 4F3SA 3FZVA 2XXWA 4GOTA 3VVDA 3ZKLA 2G29A 3TFLA 2GH9A 1DSNA 3HN0A 1Q35A 2V3UA 3LSXA 5KDTA 2AL4A 4POWA 1Y1MA 2P1SA 4WEPA 4M1VA 1H76A 1O7TA 1LCFA 3MVZA 3TDJA 1LFHA 1QW0A 1PDAA 1GVCA 1OIBA 1FTMA 1POY1 4YAHX 4R74A 3MP1A 3CG3A 4RA1A 4ONYA 4H67A 3B7DA 3K4UA 3PU5A 3N26A 1GV8A 3G3JA 3PUYE 5AA2B 4NF4B 1TFDA 4EF1A 4ZE8A 4ZZAA 3PPOA 4WEDA 4ESXA 3S9NC 1BLFA 4BDMA 4H6DA 2O1LA 2UXAA 2BJJX 2XXPA 4R72A 3EN3A 3CFZA 3FVGA 4KR5A 1MRPA 4O3CA 2THIA 2RF1A 2Q89A 4OFJA 5KDTB 3H03A 4LQ5A 1TXFA 1QUJA 2XXVA 1JEUA 1AOVA 1VFDA 2E1SA 5I2NA 2Y7WA 2DXRA 2DVZA 1NL5A 4QHQA 2DWJA 4QSEA 1MQIA 4QSCA 5ISUA 4UACA 1CE2A 5AA2D
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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