4F2OA

Quisqualate bound to the d655a mutant of the ligand binding domain of glua3
Total Genus 80
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
80
sequence length
258
structure length
258
Chain Sequence
RTIVVTTILESPYVMYKKNHEQLEGNERYEGYCVDLAYEIAKHVRIKYKLSIVGDGKYGARDPETKIWNGMVGELVYGRADIAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLAKQTEIAYGTLASGSTKEFFRRSKIAVYEKMWSYMKSAEPSVFTKTTADGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSALGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The loss of an electrostatic contact unique to AMPA receptor ligand binding domain 2 slows channel activation.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Transport protein/agonist
molecule keywords Glutamate receptor 3
total genus 80
structure length 258
sequence length 258
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-08
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 4f2oA02
3SEWA 1B3LA 3IK6B 1NH8A 3D4GA 4KHZE 5I58A 3DP4A 1B3GA 4F1UA 1T0KA 4ZEIA 3MWBA 3EHTA 1YAEA 1UTBB 4R72A 1SI0A 3VE1B 1ATGA 4JDFA 1RYOA 1YTVA 3IX1A 3K02A 4KI0E 1H44A 1A54A 1TT1A 2P0SA 3K01A 4KCDA 4F3BA 2NWJA 2Y7WA 4DCYA 3KOTA 4ZS9A 4KYDA 4JSOA 1F9BA 1GGGA 1N3XA 3CFZA 1IEJA 5H8FB 3QYTA 3RN8A 3THIA 1FCKA 4RXLA 4NTLA 2I0CA 4I9DA 1SYHA 3GBBA 1VFDA 1B46A 4RYAA 5CI5A 5I56A 3KJ7A 3EHSA 2PVUA 3KN7A 2RF1A 3CFLA 3K6UA 3EF7A 4YKIA 3MQ9A 4JWXA 3IL1B 3KN8A 2E0SA 2IA4A 1N04A 3MP6A 4ZZAA 4IB2A 3WAEA 5I58B 4IO3A 3FIRA 3C33A 4R2FA 1URDA 1B9JA 1FTKA 1MXVA 2F7BA 1UTHA 3FVOA 1UTBA 4PE5B 4R2BA 3DP6A 1II5A 1ZKBA 2O84X 1NNTA 2ESNA 3O6IA 4GIZA 4H5FA 4QFLA 5CRYA 3RQTA 4DXUA 2UVHA 1SW4A 2F36A 4PP0A 5KDTB 2XXQA 4TLLB 1Y4TA 4N07A 4AB6A 2QRYA 4GF8A 1OQGA 1OQHA 1B3FA 4QFOA 4ZECA 2XXVA 5TP9B 1A8EA 1XS5A 1FQCA 5K2XA 1JVXA 1NFTA 5KCJA 2Z22A 3LC8A 4GD5A 4R73A 2OJTA 1JW4A 4NF5B 3N6UA 4YKKA 1IXGA 5I56B 1MXUA 3CR9A 3DLNA 5AA4B 1IITA 3ILTB 3K1PA 3H6VA 3PUXE 4FORA 4QHQA 3S9EA 2I48A 2I4BA 3VDFA 1N7WA 3FD3A 5AA2D 1VSOA 3K6WA 1MXXA 3HO7A 4H1XA 3Q26A 3H03A 4C0RA 4F2OA 2REGA 2QJEA 5L9OA 3IJXB 1UTHB 2DE4A 3LSFB 1TXFA 3Q28A 1YCJA 4X1BA 4P11A 3M3LA 2YJPA 3OEMA 1US4A 2HEUA 4UACA 2XXRA 2O7IA 3ECRA 3FZVA 3QAXA 5KDTA 4U23A 5KZTA 1JNFA 1LFIA 1UQWA 3N6TA 1MRPA 4DXBA 2I3WA 1R6ZA 3FV1A 3H3GA 1MQDA 1NNKA 3MP8A 1CE2A 3IR1A 1OLCA 2KLFA 3OSRA 4QSEA 4C1UA 2CZLA 2R9JA 1JQFA 2B65A 2XXUA 4E0XA 4R74A 2NXOA 3C32A 1LFHA 2UYEA 1D9YA 2XXTA 4M1VA 3U93A 1I69A 1MPCA 4X1DA 4FEDA 4NF8B 1D9VA 4ISUA 4OESA 3V8XB 4ESXA 4QSCA 2O1MA 1NNFA 3CFXA 3K1NA 5H8HB 1AMFA 1B05A 1LB8A 1BP5A 2PMSA 3KGCA 3WAFA 2FNCA 1MPDA 2RC8A 2QS3A 1HSJA 1B1XA 1M5CA 3VVDA 2QS2A 3QK6A 4F18A 1XC1A 4M4GA 4HCYA 4NF6A 1LGBC 1TFDA 3PUWE 2F5XA 3E9XA 3MVZA 3QIMA 3CSGA 3GXAA 4LA9A 4FATA 3I5OA 3O28A 4IGRA 2YLNA 4FE8A 4LUBA 3MJNA 2H98A 2DVCA 3CVGA 3IORA 4U1OA 4ZE8A 1DSNA 4LVQA 5HM4B 5I59A 2VOZA 3FXQA 2UVGA 4WXJA 2GH9A 3PPOA 4Z0IA 3SERA 2XXPA 1IUDA 2VHAA 4RNSA 4BDRA 1Z7ME 3Q25A 4ZEKA 1LCTA 4TOZA 3TUSA 2DS9A 2ZYOA 3EPEA 1QW0A 4WKMA 3G3FA 3LSWA 5DEXA 5B7DA 3CG1A 1QUKA 4MFIA 3BFUA 3FUZA 1SW5A 2F8DA 3G7WA 3IOTA 3LSLA 3N5LA 5AE4A 5CMCA 4NE4A 1R1NA 3K1MA 2QMXA 3PPQA 1H45A 3KBRA 4KYEA 3RPWA 2Y7RA 4QRZA 1JW1A 4IY6A 4RK2A 3PMVA 4NF6B 4OFOA 3TAJA 1GR2A 5H8QB 5I2NB 3IO6A 3MVXA 3C9HA 4Q5TA 3SEUA 2ZMBA 1A7LA 1YPNA 3EQ1A 3VXBA 1JEVA 4G8MA 4IO5A 5IAIA 3OO7A 1DMBA 4F1YA 5I2KA 3MUQA 5I57A 4DDDA 3O6HA 3N26A 3O2AA 1Q35A 4ELQA 1BLFA 4G68A 4MBPA 4AQ4A 1I6QA 1P1NA 2DE2A 3FV2A 2HQ0A 3PUYE 4PQJA 3TKDA 2F6GA 5B70A 5L9SA 2A5SA 4RJZA 3W15C 3S9MC 3PMWA 2HAUA 1VFEA 3UK4A 4YMBA 1N7XA 4I8CA 5K2YA 3PUZE 1Y3QA 1DTGA 2DWAA 3K2DA 3MPLA 4AB5A 1JW5A 1ZU0A 3PPRA 4XIGQ 3BFTA 3OO6A 1B5HA 1B5JA 3TTMA 2PBWA 1QJMA 3IB0A 1RYXA 2F34A 1PB8A 3FVGA 3T66A 3FVNA 4LP2B 4RA1A 1XHYA 3VFJA 4DE8A 1MDQA 1FQAA 1MQGA 3B7DA 5ICQA 5DVFA 2DWIA 3LSXA 5AA2A 2F7CA 4YKPA 4QFKA 3VLVA 4EXKA 4XKQA 4DIGA 5I57B 1M5DA 2P1SA 1P1QA 3G3GA 4OENA 2Q2CA 2ZNUA 4G77A 1TFAA 4QFNA 1A55A 1SYIA 1SDXA 4R6YA 4F3SA 2ANJA 3C35A 4RK9A 4EQ9A 2XXYA 1P1WA 3JYRA 1MY3A 5FHOA 3TQWA 2RC9A 3RTFB 1MQJA 3JV9A 1CB6A 5H8SA 3UA8A 4F22A 4HTGA 3HCQA 1LFGA 2V93A 3R26A 4EQBA 3CI8A 1VR5A 5IKBA 2OCUA 2D5WA 2XX9A 5F1QA 1JETA 4EQ7A 4KR5A 1ANFA 2H4IA 1S9TA 4LONB 3UGWA 2PYYA 3KZGA 4R6HA 1EZPA 2XXXA 1B32A 3ZKLA 1FTOA 1MXZA 3CG3A 5BWJA 3QUJA 1FQDA 4F19A 3PD9A 1Q1KA 2A5TA 2QS4A 3HSTA 4NF4A 5TPAA 4MF3A 4FIMA 4OQOA 1USYE 1NL5A 3MZ1A 4EF2A 1QKBA 2O69A 5M2VA 1B4ZA 1ZTYA 2ONRA 4OEUA 5DVIA 5CM6A 3FJMA 3TDJA 1B3EA 4QF9A 4O3BA 4P0IA 3IOVA 1MH4A 3MBPA 3T22A 1LAFE 4ECFA 4MLVA 1PC3A 4JBZA 1B1HA 1O64A 3FVKA 3H6WA 3U1OA 5FTHA 1B7HA 4QFPA 1US5A 4GVOA 2LAOA 3KN3A 2H9BA 2Z8FA 4JB7A 5DVJA 4OFLA 1Y1ZA 2HCAA 2F6PA 4YAHX 3UIFA 3IB2A 5JK4A 2F97A 4OXVA 1B0LA 5CC2A 1LLSA 1J1NA 4F39A 5H8FA 3TCHA 4EUOA 3OOAA 3O66A 3OMBA 2DXYA 4OHNA 2VP1A 4QSDA 5CMKA 5CBSA 5DT6A 1EZ9A 5JEIA 3V83A 2PT2A 1MXYA 2Y7IA 4G8NA 2Z23A 3RT8A 1MG1A 1JVYA 1OLAA 2A5TB 2V3QA 3B6QA 4HCWA 4ND9A 5AA1A 2HFBA 4GL0A 3ONMA 1POTA 3VLUA 1GV8A 1URSA 2XXWA 2RINA 2F78A 3HHGA 3TTRA 3C36A 1B51A 1EU8A 1H43A 5L9MA 3O97A 3LR1A 1MDP1 4TLMB 3K6VA 1LBCA 2QPQA 3OO9A 1P1UA 1PBQA 1Y9UA 4LQ2A 2V25A 3IO4A 4DLDA 1A8FA 4F29A 1LAXA 2Y7PA 4GFRA 2Z8DA 1OIBA 2ZNSA 3PUVE 3SESA 3U94A 1MH3A 3F11A 3T93B 3KOSA 3KSJA 1FTJA 4F1VA 2GFEA 4EXLA 5TP9A 3O29A 3VV5A 4YICA 5ICTA 4FEBA 2HXWA 4C1TA 5FHNA 3VVEA 3TZAA 4ONYA 1LCFA 3KEIA 3A3UA 1L5TA 3RT6B 3SKPA 2RCBA 1R9QA 3OO8A 2Q89A 1Y3PA 3Q29A 2VGQA 4NF5A 4YU0A 4BLAA 5AA4A 4WEDA 4PFTA 1MM7A 3EHUA 1AOVA 3FXUA 3UORA 3SEVA 1XVXA 4N6PA 1LSTA 2DOJA 1B40A 1BTJA 1MY4A 3FGSA 3JZJA 3H4ZA 4HS7A 3T9VA 1M5EA 3UN6A 3LBSA 1Y1MA 1NNPA 4IO2A 2DVZA 1M5BA 5DYHA 2RCAA 5ELVA 3O9PA 2D3IA 1MY1A 2I58A 4R9GA 4O3AA 1USYH 2QSXA 1LAHE 4JSDA 3PPNA 3QXMA 4LQ5A 4U4XA 5F7VA 2XXHA 4FJPA 4GWOA 3K4UA 3TELA 4LZ7A 1GTKA 3FJGA 5LOMA 4PFWA 3VXCA 4U2RA 3H7MA 1DPEA 2UVIA 1MPBA 2O7UA 4OETA 5DTBA 5EHMA 2UYFA 4HW8A 3D4CA 2NUVA 3Q27A 4H6DA 3EN3A 4X48A 1O63A 4KQPA 3MZ9A 3HHFA 4THIA 2O1LA 1M5FA 2GRVA 2W7YA 3ILUB 2Q8JA 1EZOA 4NF8A 2XX7A 3I3VA 3H6TA 4BDMA 5EYFA 4FAJA 4YMAA 4GXSB 5H8HA 3USDA 1IQ7A 2ALUA 2REJA 4GRKA 1SW1A 3T9UA 4JWOA 1H3DA 4MLQA 3GZGA 1ZLQA 4ZEFA 1IZ1A 3S2VA 4MH5A 5CMBA 4KPTA 3FATA 4Z7EA 2AL5A 2O68A 4ELPA 1GVCA 3TMGA 3S4UA 1SVXB 2QS1A 2RC7A 2V3TA 3PPPA 4POWA 4G4PA 2G93A 4H0WA 3RY3A 3TQLA 4E0WA 2F7AA 3M3KA 2O6AA 4KYSA 1N0TA 5TU0A 3IB1A 1JEUA 1FQBA 4NMYA 2WKYA 1B5IA 1P99A 3LUYA 4YB5A 2Q88A 4U1ZA 1H76A 3KG2A 4OTEA 1ZIUA 4XKRA 2VD2A 3U8QA 5J1DA 5KCJB 2BJJX 3OSQA 2I3VA 4GQOA 2P2AA 2VD3A 3PD8A 4H67A 1MM6A 1PBPA 2CMOA 1B2HA 1XOCA 2AL4A 2G29A 2GHAA 3IAZA 3MVWA 5ITPA 1POY1 1TWYA 4R6KA 1AIVA 1S50A 3OENA 3KSXA 1MQIA 4K3FA 1FW0A 1B3HA 3MAMA 4F31B 4KD5A 3BBRA 2ZYMA 1SI1A 3ODBA 1B6HA 3VVFA 2B3BA 4ELRA 3P7IA 1RKMA 1FQFA 2OWSA 4POXA 1VE4A 2RKMA 1PDAA 2DQVA 3IJOB 1O7TA 3MC2A 3E13X 1D3KA 5HBCA 1B4HA 3TEPA 2QL3A 2I4CA 1I6BA 4OFJA 2DP8A 1DTZA 4PFUA 4G2ZA 2IEEA 1BIYA 3CRBA 5I2KB 1WODA 5L8DA 1XT8A 1OVTA 3OELA 3PMXA 4G68B 2O51A 5FHMA 2H99A 3RUMA 3TFLA 1S7YA 1PEBA 2V84A 3K6XA 2UVJA 3G3KA 2HZKA 5ITOA 3R7XA 2I0BA 4NWDA 2I49A 2PX1A 2H25A 3M8UA 4IO6A 4EDPA 4DXCA 1P1OA 4WEPA 3TTLA 2ZYKA 3TODA 1Y20A 4O3CA 3ZS6A 4OVJA 4P0GA 4FECA 1WVJA 1Y3NA 2OBGA 2XD3A 4G68C 3ZKKA 1WDNA 4YB6A 4GXAA 3MPKA 3T96B 2THIA 1NH7A 4NWCA 2B3FA 4U4SA 3FJ7A 2AYSA 2QMWA 3PGFA 4RPNA 4I62A 1MXWA 3BKIB 4ZEBA 3S9NC 3V5AA 1MY0A 5AA2B 1QUJA 1MY2A 1B0HA 2Q2AA 3CSBA 3K0VA 1Y4CA 3RNNA 4F3GA 2DWHA 3KFMA 1ZBMA 2OK2A 3HPIA 3N94A 4LZ5A 4BDQA 4PETA 3MP1A 1EH3A 4H5GA 4ESWA 5I59B 4GL8A 1FTMA 3L6HA 5H8NB 1MS7A 4XTCQ 2DXRA 3SETA 4R9FA 2F35A 1IXIA 2I6EA 2ONSA 2HAVA 3TYHA 2FYIA 4XXUA 5A5XA 3TTNA 2E1SA 5AA3A 3E4RA 1SQYA 5DEXB 1B7UA 3U92A 2GHBA 1SD3A 1ZMGA 4ZDMA 3GBAA 3HN0A 4OEVA 5JTYA 1QKAA 1AH5A 4ZZEA 1R9LA 5BUUA 2OLBA 2X26A 4Q30B 4X9TA 2DWJA 3DELB 1MQHA 3T9HB 5H8QA 4F3PA 4ZE9A 5I2NA 4H8IA 1IXCA 1DOTA 3HV1A 4LATA 5CBRA 1I6AA 3AXFA 4BDOA 1B58A 1A40A 2UXAA 2ABHA 3KJTA 3OXNA 1HSLA 2AIXA 1D4NA 3RGYA 3SDFA 1LAGE 4BDLA 1HSEA 5FTIA 5H8NA 4F2QA 4L17A 1IXHA 1SW2A 1AL3A 1UIUA 3B6TA 3R6UA 4KFQA 2ONKE 1XVYA 3FXRA 5A5XB 5TPAB 2H5YA 4OZ9A 1N84A 2XHDA 3CIJA 2ZYNA 1A99A 3QUFA 4PFYA 3H6UA 5ISUA 1N3WA 1B52A 4XKPA 5JTYB 3TCFA 2X7QA 3G3JA 2ZNTA 4N13A 3SEYA 2ZXTA 1IIWA 2M8CA 4ZEDA 2XD2A 4JXIA 4GOTA 2XXIA 4EF1A 4XKNA 4Q0CA 3DP8A 3IOUA 2Y84A 2OWTA 3IOWA 4I1DA 4U21A 3TCGA 3MW0A 1QVSA 4IGTA 1B7ZA 4YZZA 4IY5A 4OMBA 1N76A 3PU5A 3UP9A 3C34A 4G8HA 3B6WA 1FQEA 2YPNA 3O6GA 1NMUA 1BKAA 4IO4A 3TPAA 2V3UA 5HPQA 1URGA 3MVYA 4KCCA 4OWDA 3W9WA 3PV0E 3A09A 4OYVA 3OD7A 3ZSFA 2D21A 4RY1A 3T9XB 4H8JA 3G3IA 3I6VA 4R75A 4NEDA 3RTWB 3V89B 3VLWA 1NKXA 4JWYA 3A3CA 1LB9A 5EHSA 3M3FA 5I84A 2Y7KA 4DCXA 4DZ1A 3MZBA 4OERA 3QSLA 3S9LC 2R6GE 2DE3A 1LBBA 2R71A 1Z7NE 3OEKA 4H65A 1FTLA 3H06B 3DM0A 3L6GA 3SEXA 2X7PA 3GLBA 2DYXA 5CMMA 1OMPA 4YKJA 4IO7A 1PB9A 1SBPA 1ZJLA 3C4MA 3G3HA 1QUIA 4ELOA 1KWHA 4U22A 4YB7A 3K00A 3W9VA 2OZZA 2Q9TA 3E3KA 4LZ8A 4BDNA 3U72A 1OVBA 2XX8A 2NVUB 2Z8EA 2HZLA 4UA8A 2DSFA 3C31A 2NOOA 4RPOA 1ELJA 3RLFE 2FA7A 2PT1A 1DPPA 1QULA 4NF4B 1PB7A 3FASA 4GLIA 4TQUQ 3TTKA 1UIVA 4Q8RA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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