4F3IA

Crystal structure of the first bromodomain of human brd4 in complex with ms417 inhibitor
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
127
structure length
127
Chain Sequence
b'SMNPPPPETSNPNKPKRQTNQLQYLLRVVLKTLWKHQFAWPFQQPVDAVKLNLPDYYKIIKTPMDMGTIKKRLENNYYWNAQECIQDFNTMFTNCYIYNKPGDDIVLMAEALEKLFLQKINELPTEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Down-regulation of NF-{kappa}B Transcriptional Activity in HIV-associated Kidney Disease by BRD4 Inhibition.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Bromodomain-containing protein 4
source organism Homo sapiens
molecule tags Signaling protein/inhibitor
total genus 44
structure length 127
sequence length 127
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-05-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00439 Bromodomain Bromodomain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.20.920.10 Mainly Alpha Up-down Bundle Histone Acetyltransferase; Chain A Bromodomain-like 4f3iA01
2YW5A 1WUGA 4O71A 4QSQA 4QSUA 4ZC9A 5EWWA 4QNSA 5ENGA 4DONA 5ETBA 4NR9A 4NR5A 5CQ4A 1F68A 4O7CA 4UIVA 4OUFA 5HFRA 4FLPA 4LRGA 5E3DA 5COIA 4OGIA 4O76A 1JM4B 3HMFA 3AQAA 3O34A 4TZ8A 5F62A 4UIYA 5II1A 3RCWA 4CUPA 5I40A 5F60A 3G0LA 3O35A 5EI4A 1EQFA 2D82A 4O7FA 5HENA 4Z6IA 4ALGA 3IU5A 4QR4A 4YAXA 4XUBA 5DKHA 5ETDA 4A9OA 5EP7A 5KHMA 5DY7A 5A5OA 5ENIA 5II2A 5FE5A 4MENA 5F1LA 5CUAA 5A85A 5DKDA 4A9IA 5IIDA 5DW1A 5CQTA 3UV4A 3MB3A 5D3JA 5F36A 3SVGA 5E9YA 4YC9A 1WUMA 4LYWA 4Z1SA 4HBXA 4N4IA 5E9VA 4NUEA 4C66A 4YBSA 5FG6A 3HMHA 4J3IA 5HRXA 3AADA 5CU8A 2OO1A 4TS8A 4UIXA 4CFLA 4Q0OA 4KCXA 4UYGA 5BT4A 5AD3A 4NQNA 3MQMA 4E96A 2OUOA 3LQJA 5EA1A 4MEQA 4NRAA 4QYDA 4CFKA 4PCIA 2DVRA 4CUQA 5A5NA 5FE8A 5D3HA 4UIWA 5D3SA 5CUCA 4LDFA 4YY4A 2DVVA 4CUTA 5HRVA 2RI7A 5I7XA 5D26A 3GG3A 2DWWA 4NS5A 4PS5A 5JWMA 5ENHA 5EU1A 5DYXA 5D3NA 5EVAA 2NXBA 4PTBA 4YBTA 5A5RA 4O70A 5EPRA 3U5KA 4NRCA 4UITA 3UVWA 5A82A 5HQ6A 3O36A 3LXJA 5F25A 5EWCA 5TB6A 5C7NA 3ZYUA 5CQ5A 5LKUA 5LKZA 5FE9A 3IU6A 5F2PA 5F1HA 4YBMA 2WP1A 3LJWA 3S91A 4LR6A 4HXRA 5FB1A 4UYHA 2YEMA 2F6JA 4HXPA 5IGNA 4TT4A 4IOQA 4RVRA 3U5PA 5AMFA 4YABA 5DLZA 4HXKA 4UIUA 4XY8A 5ENFA 3NXBA 4O7BA 5H1UA 3LQIA 5FG4A 5G4SA 5EV9A 4NUCA 3UV5A 4QSWA 5E0RA 5A81A 2R0VA 4YY6A 2WP2A 2YELA 4YYHA 4A9LA 4J0RA 5EWVA 5A5PA 5FB0A 4XY9A 3UV2A 4HXLA 4Z6HA 3U5MA 5ACYA 5FE2A 5FFWA 4HXMA 4BW3A 2F6NA 3UVYA 2I7KA 4YYDA 5CQ3A 5EISA 5DX4A 4BW1A 5D3TA 4QSRA 5TCMA 3P1DA 4QY4A 5CZGA 5LKTA 4HBYA 2G4AA 4X2IA 5EWDA 2FSAA 4LC2A 5L98A 3S92A 5HM0A 5FDZA 5FFYA 3QZVA 2RNWA 5J0DA 5CQ6A 5DLXA 4NR8A 4LZSA 5JI8A 5I29A 4O72A 5DYCA 4OGJA 4TZ2A 5D24A 2YQDA 4YYNA 4IR4A 4LZ2A 5CPEA 1E6IA 5HCLA 2RO1A 5E9MA 4NQMA 3QZTA 4F3IA 5A7CA 5KU3A 5L99A 4KV4A 4A9KA 3JVMA 4QC1A 4QYLA 4QSVA 4O7EA 5E9LA 3SVFA 4A9MA 2DKWA 3U5LA 5AMEA 4YATA 5FG5A 5EGUA 4CLBA 2YEKA 4PY6A 5AD2A 5ENCA 3U5NA 4O75A 4HBWA 4LZRA 5IG6A 5CTLA 4MR5A 4Y03A 4QEUA 4J1PA 4QR5A 3UVXA 5CRMA 5E3GA 4QUUA 5IGKA 4LYIA 4A9NA 4MR6A 4BJXA 4NXJA 4YADA 5EICA 4N4HA 4HXSA 5CRZA 2KTBB 2L84A 5CQ7A 5ENBA 3MB4A 5ENEA 3DAIA 4IR6A 2E7OA 4TT2A 5DYUA 3I3JA 4AKNA 3Q2EA 4TU6A 4GPJA 4IR3A 2R0YA 2E3KA 5BT5A 4O77A 4QC3A 4HXOA 3UVDA 4NYWA 5FE3A 4Z1QA 4IR5A 5DFCA 3JVJA 3P1CA 4Z93A 5FH6A 4CUSA 2DVSA 4TYLA 5LUUA 5FE1A 3U5OA 3K2JA 5L8TA 4NYVA 5CY9A 5LJ0A 4NYXA 4YYJA 5FBXA 5C85A 4J0SA 2DVQA 4CURA 4HBVA 4PKLA 5FFVA 4YK0A 4YH4A 4C67A 5FH7A 3P1EA 5G4RA 5KO4A 5CFWA 5A5SA 5DKCA 5IGMA 4CUUA 4CL9A 5DYAA 4MR3A 4N3WA 4KV1A 5I88A 2YDWA 4TQNA 4UYFB 5CQ8A 5F63A 2R10A 4WIVA 4NR7A 5H1VA 4QEWA 5KTWA 2RNXA 3LQHA 2E7NA 5CP5A 4A9FA 5IGLA 5HEMA 5D0CA 4XYAA 4ZQLA 4O74A 5EPSA 5HLSA 3MXFA 5HRWA 4NRBA 4MEPA 5C87A 5I1QA 4XUAA 2RNYA 3O37A 4UYEA 4IOOA 4WHUA 2N9GA 3DWYA 3ONIA 5HQ5A 4A9HA 3G0JA 4QR3A 5IBNA 4N4GA 5LVRA 2MJVB 5HQ7A 5EK9A 4QEVA 4UYDA 5C4QA 4TU4A 5CQAA 5D3PA 5E7DA 5LJ2A 4HXNA 4MEOA 3O33A 2R0SA 5I86A 4YYKA 5L97A 5E9IA 3HMEA 4NR6A 4YYMA 3MUKA 2I8NA 4O78A 5I83A 4IORA 2GRCA 2YYNA 5E74A 5D3RA 5BT3A 5LVQA 5DFDA 2H60A 2L5EA 2L85A 5L96A 4A9EA 5DFBA 3D7CA 5K29A 5FE0A 5CS8A 5EQ1A 4BHWA 5EWHA 4YH3A 5L8UA 5FE6A 5CUGA 4NR4A 1JSPB 5DW2A 2D9EA 5A83A 3MULA 5C89A 5H85A 4O7AA 4QSSA 5D25A 5E9KA 4QSTA 5CGPA 2RS9B 3UW9A 4PCEA 2DATA 4A9JA 3FKMX 3JVLA 4UYFA 5D7XA 4TTEA 3JVKA 5I89A 4BW2A 2RFJA 1N72A 4QBMA 3Q2FA 4QUTA 5KTUA 5CUDA 4QSXA 3P1FA 5F5ZA 4QZSA 4UIZA 4QSPA 5EM3A 5FE4A 5A5QA 5F61A 3TLPA 5FE7A 4ALHA 5C8GA 5F3AA 4N4FA 4Q0NA 4TT6A 4WHWA 5I80A 5D3LA 5CUBA 5HELA 5ENJA 1X0JA 5HFQA 3U5JA 5E73A 1ZS5A 5DBMA 5H1TA 5LJ1A 2OSSA 4QB3A 4YYGA 4BW4A 5LKXA 3QZSA 4NUDA 2LSPB 3P5OA 5HJCA 5FH8A 5KTXA 4LYSA 4YYIA 4ZW1A 5I7YA 3SVHA 5EPBA 4MR4A 5CUEA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2YW5A 1WUGA 4O71A 4QSQA 4QSUA 4ZC9A 5EWWA 4QNSA 5ENGA 4DONA 3D1BA 5ETBA 4NR9A 4NR5A 5CQ4A 1F68A 4O7CA 4UIVA 4OUFA 5HFRA 4FLPA 4LRGA 5E3DA 5COIA 4OGIA 4O76A 1JM4B 3HMFA 3AQAA 3O34A 4TZ8A 5F62A 4UIYA 5II1A 3RCWA 4CUPA 5I40A 5F60A 3G0LA 3O35A 5EI4A 1EQFA 2D82A 4O7FA 5HENA 4Z6IA 4ALGA 3IU5A 4QR4A 4YAXA 4XUBA 5DKHA 5ETDA 4A9OA 5EP7A 5KHMA 5DY7A 5A5OA 5ENIA 5II2A 5FE5A 4MENA 5F1LA 5CUAA 5A85A 5DKDA 4A9IA 5IIDA 5DW1A 5CQTA 3UV4A 3VKHA 3MB3A 5D3JA 4AKGA 5F36A 3SVGA 5E9YA 4YC9A 1WUMA 4LYWA 4Z1SA 4AKHA 4HBXA 4N4IA 3ERRA 5E9VA 4NUEA 4C66A 4YBSA 5FG6A 3HMHA 4J3IA 5HRXA 3AADA 5CU8A 2OO1A 4TS8A 4UIXA 4CFLA 4Q0OA 4KCXA 4UYGA 5BT4A 5AD3A 4NQNA 3MQMA 1PUOA 4E96A 2OUOA 3LQJA 5EA1A 4MEQA 4NRAA 4QYDA 4CFKA 4PCIA 2DVRA 4CUQA 5A5NA 5FE8A 5D3HA 4UIWA 5D3SA 5CUCA 4LDFA 4YY4A 2DVVA 4CUTA 5HRVA 2RI7A 5I7XA 5D26A 3GG3A 2DWWA 4NS5A 4PS5A 5JWMA 5ENHA 5EU1A 5DYXA 5D3NA 5EVAA 2NXBA 4PTBA 4YBTA 5A5RA 4O70A 5EPRA 3U5KA 4NRCA 4UITA 3UVWA 5A82A 5HQ6A 3O36A 3LXJA 5F25A 5EWCA 5TB6A 5C7NA 3ZYUA 5CQ5A 5LKUA 5LKZA 5FE9A 3IU6A 5F2PA 5F1HA 4YBMA 2WP1A 3LJWA 3S91A 4LR6A 4HXRA 5FB1A 4UYHA 2YEMA 2F6JA 4HXPA 5IGNA 4TT4A 4IOQA 4RVRA 3U5PA 5AMFA 4YABA 5DLZA 4HXKA 4UIUA 4XY8A 5ENFA 3NXBA 4O7BA 5H1UA 3LQIA 5FG4A 5G4SA 5EV9A 4NUCA 3UV5A 4QSWA 5E0RA 5A81A 2R0VA 4YY6A 2WP2A 2YELA 4YYHA 4A9LA 4J0RA 5EWVA 5A5PA 5FB0A 4XY9A 3UV2A 4HXLA 4Z6HA 3U5MA 5ACYA 5FE2A 5FFWA 4HXMA 4BW3A 2F6NA 3UVYA 2I7KA 4YYDA 5CQ3A 5EISA 5DX4A 4BW1A 5D3TA 4QSRA 5TCMA 3P1DA 4QY4A 5CZGA 5LKTA 4HBYA 2G4AA 4X2IA 5EWDA 3VKGA 2FSAA 4LC2A 5L98A 3S92A 5HM0A 5FDZA 5FFYA 3QZVA 2RNWA 5J0DA 5CQ6A 5DLXA 4NR8A 4LZSA 5JI8A 5I29A 4O72A 5DYCA 4OGJA 4TZ2A 5D24A 2YQDA 4YYNA 4IR4A 4LZ2A 5CPEA 1E6IA 5HCLA 2RO1A 5E9MA 4NQMA 3QZTA 4F3IA 5A7CA 5KU3A 5L99A 4KV4A 4A9KA 3JVMA 4QC1A 4QYLA 4QSVA 4O7EA 5E9LA 3SVFA 4A9MA 2DKWA 3U5LA 5AMEA 4YATA 5FG5A 5EGUA 4CLBA 2YEKA 4PY6A 5AD2A 5ENCA 3U5NA 4O75A 4HBWA 4LZRA 5IG6A 5CTLA 4MR5A 4Y03A 4QEUA 4J1PA 4QR5A 3UVXA 5CRMA 5E3GA 4QUUA 5IGKA 4LYIA 4A9NA 4MR6A 4BJXA 4NXJA 4YADA 5EICA 4N4HA 4HXSA 5CRZA 2KTBB 2L84A 5CQ7A 5ENBA 3MB4A 5ENEA 3DAIA 4IR6A 2E7OA 4TT2A 5DYUA 3I3JA 4AKNA 3Q2EA 4TU6A 4GPJA 4IR3A 2R0YA 2E3KA 5BT5A 4O77A 4QC3A 4HXOA 3UVDA 4NYWA 5FE3A 4Z1QA 4IR5A 5DFCA 3JVJA 3P1CA 4Z93A 5FH6A 4CUSA 2DVSA 4TYLA 5LUUA 5FE1A 3U5OA 3K2JA 5L8TA 4NYVA 5CY9A 5LJ0A 4NYXA 4YYJA 5FBXA 5C85A 4J0SA 2DVQA 4CURA 4HBVA 4PKLA 5FFVA 4YK0A 4YH4A 4C67A 1ZKRA 3P1EA 5FH7A 5G4RA 5KO4A 5CFWA 5A5SA 5DKCA 5IGMA 4CUUA 4CL9A 5DYAA 4MR3A 4N3WA 4KV1A 5I88A 2YDWA 4TQNA 4UYFB 5CQ8A 5F63A 2R10A 4WIVA 4NR7A 5H1VA 4QEWA 5KTWA 2RNXA 3LQHA 2E7NA 5CP5A 4A9FA 5IGLA 5HEMA 5D0CA 4XYAA 4ZQLA 4O74A 5EPSA 5HLSA 3MXFA 5HRWA 4NRBA 4MEPA 5C87A 5I1QA 4XUAA 2RNYA 3O37A 4UYEA 4IOOA 4WHUA 2N9GA 3DWYA 3ONIA 5HQ5A 4AKIA 4A9HA 3G0JA 4QR3A 5IBNA 4N4GA 5LVRA 2MJVB 5HQ7A 5EK9A 4QEVA 4UYDA 5C4QA 4TU4A 5CQAA 5D3PA 5E7DA 5LJ2A 4HXNA 4MEOA 3O33A 2R0SA 5I86A 4YYKA 5L97A 5E9IA 3D1DA 3HMEA 4NR6A 4YYMA 3MUKA 2I8NA 4O78A 5I83A 4IORA 2GRCA 2YYNA 5E74A 5D3RA 5BT3A 5LVQA 5DFDA 2H60A 2L5EA 2L85A 4AI6A 5L96A 4A9EA 5DFBA 3D7CA 5K29A 5FE0A 5CS8A 5EQ1A 4BHWA 5EWHA 4YH3A 5L8UA 5FE6A 5CUGA 4NR4A 1JSPB 5DW2A 2D9EA 5A83A 3MULA 5C89A 5H85A 4O7AA 4QSSA 5D25A 5E9KA 4QSTA 5CGPA 2RS9B 2EJNA 3UW9A 4PCEA 2DATA 4A9JA 3FKMX 3JVLA 4UYFA 5D7XA 4TTEA 3JVKA 5I89A 4BW2A 2RFJA 1N72A 4QBMA 3Q2FA 4QUTA 5KTUA 5CUDA 4QSXA 3P1FA 5F5ZA 4QZSA 4UIZA 4QSPA 5EM3A 5FE4A 5A5QA 5F61A 3TLPA 5FE7A 4ALHA 5C8GA 5F3AA 4N4FA 4Q0NA 4TT6A 4WHWA 5I80A 5D3LA 5CUBA 5HELA 5ENJA 1X0JA 5HFQA 3U5JA 5E73A 1ZS5A 5DBMA 5H1TA 5LJ1A 2OSSA 4QB3A 4YYGA 4BW4A 5LKXA 3QZSA 4NUDA 2LSPB 3P5OA 5HJCA 5FH8A 5KTXA 4LYSA 4YYIA 4ZW1A 5I7YA 3SVHA 5EPBA 4MR4A 5CUEA
chains in the Genus database with same CATH topology
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