The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
44
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sequence length |
110
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structure length |
110
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Chain Sequence |
MVNWAAVVDDFYQELFKAHPEYQNKFGFKGVALGSLKGNAAYKTQAGKTVDYINAAIGGSADAAGLASRHKGRNVGSAEFHNAKACLAKACSAHGAPDLGFAIDDILSHL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Oxy structure of His100Phe Cerebratulus lacteus mini-hemoglobin
rcsb |
| molecule tags |
Oxygen transport
|
| source organism |
Cerebratulus lacteus
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| molecule keywords |
Neural hemoglobin
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| total genus |
44
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| structure length |
110
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| sequence length |
110
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2012-05-14 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PMB A; 5D1V A; 3ZJS A; 2MGK A; 1HCO A; 2GDM A; 1CIK A; 1HDA B; 4WCH D; 2VLX A; 3IA3 B; 1CO8 A; 5CMV A; 1X46 A; 1VXH A; 2BLI A; 5CNF A; 5SW7 B; 1T1N A; 3QJE B; 3PI8 B; 1F65 A; 1K1K B; 4ROM B; 1MYG A; 2ZSX A; 1AZI A; 1OUT A; 3K8B A; 1NWN A; 1S6A A; 5B85 A; 4MQG A; 1Y4F B; 3ZOL A; 1BJE A; 3D4X A; 1JZL A; 1V4X A; 3QZX A; 1RVW A; 2RI4 B; 4KJT A; 1J7S B; 1G0B A; 3WCU A; 1YGF B; 3MYM A; 2Z6T A; 1CH5 A; 3NMM A; 5EUI B; 3A5G A; 3OVU C; 1DKE A; 2R1H B; 1K0Y B; 2R4X A; 2GRF A; 1QI8 B; 1YEU B; 2VEE A; 2FRJ X; 2MGA A; 3OO4 A; 3ZH0 A; 1HV4 A; 3HRW A; 1YE2 A; 1ECA A; 1O16 A; 1MYI A; 2HBF B; 3ECZ A; 3WFW A; 3E5O A; 1SI4 B; 2GTL A; 1O1O B; 1Y4R A; 2AUO A; 3HEP A; 1DXT A; 1HBR A; 3EOK B; 1SHR B; 4NS2 A; 3WCU D; 3HEO A; 1LFQ B; 1THB A; 5KER A; 1J40 A; 5CHQ A; 3CIU A; 3S1I A; 1MZ0 A; 4N7N B; 1Y85 A; 4G51 B; 1KD2 A; 3O7N A; 3M3B A; 1U7S A; 3PIA A; 1YE0 A; 1ABW A; 1Y31 A; 1Y4G B; 1RSE A; 3ED9 A; 4NK1 A; 1NXF A; 2V1E A; 1MLG A; 1DXC A; 2ZLU B; 1SDL B; 3NML A; 2GTL D; 1A3N B; 5EQM A; 3ASE A; 3DUT B; 1VXF A; 5CNG A; 1ABY A; 1MKO A; 3QMA A; 1MWB A; 1Y0D A; 2NRL A; 1LH1 A; 2GLN A; 2MHB B; 1MLL A; 1LHT A; 2IG3 A; 4HRR A; 4QAU A; 1JZK A; 3AQ7 A; 3WFU A; 4H2L B; 2BW9 M; 2H35 B; 1Y4V A; 3R0G A; 3UHS A; 1R1Y A; 2DN3 B; 2C0K A; 1A6M A; 4NI0 B; 1V5H A; 2SPO A; 4O35 A; 2DN1 A; 1MTI A; 2HZ3 A; 1JEB B; 2W72 B; 1VXA A; 3GQG B; 4M4B B; 1HGA B; 3S48 C; 1JP8 A; 3MJP B; 2AA1 B; 1G09 B; 3QJC A; 4OF9 A; 2ZS0 A; 2MGB A; 1QXD A; 1BBB B; 1S5Y B; 1O1N B; 1Y09 B; 1HHO A; 1DXD A; 1IOP A; 3SDN A; 2RAO A; 2GNW A; 3ARJ A; 5EE4 C; 1DWS A; 1G0A A; 1HBB A; 1MOD A; 1O1J A; 4HSX A; 2HCO B; 3VRG A; 2HBS A; 1V75 A; 2QLS B; 3OK5 A; 3KMF C; 1RQA B; 1GDJ A; 1MBS A; 1HAB B; 1NZ2 A; 1YOI A; 3V2V A; 2W72 C; 1YDZ B; 3G46 A; 1S56 A; 3PI3 A; 1JY7 A; 1V4U B; 1URY A; 2QU0 A; 1I3E A; 2ZS0 D; 5EU2 A; 2B7H A; 5M3S A; 1CPW A; 3HF4 B; 3GQP A; 2V1F A; 3QJD B; 3ZJL A; 2D5X B; 2D2M B; 3S66 B; 2HBC A; 2ZT1 A; 4NK2 A; 2NRM A; 1UMO A; 1FCS A; 1MLQ A; 1FDH A; 3WCP A; 1ECN A; 1A4F A; 1DO3 A; 4NI1 B; 1O1I A; 5IKS A; 3SZK B; 1G9V B; 1MLO A; 2H8D A; 2V1H A; 3GYS A; 1Y7C B; 1VRF A; 2W31 A; 3MOU A; 4MAX A; 1YFF A; 3MJU B; 1LFZ B; 1YGD A; 1YEV A; 1UVY A; 4O4T A; 4IRO B; 1FAW B; 1Y0W B; 1Y22 B; 1Y8K B; 3ARL A; 1MWC A; 2D2M C; 1XZU B; 1V4W A; 3MN0 A; 2PEG A; 1J7Y A; 3AQ8 A; 1IT3 A; 1YHU A; 2ZLT B; 4MQC B; 2HBD A; 1XZ5 A; 1TES A; 4YU3 B; 4UUR A; 1LH3 A; 3P5Q A; 3UHZ A; 3AT5 B; 2JHO A; 3D17 B; 1MLR A; 4WJG 1; 1NS6 B; 1N9X A; 3VRE B; 3D1K A; 3NL7 A; 5CN6 A; 1Y5J B; 1Y7G A; 1RQ3 A; 2FAL A; 1IRD A; 1YHU D; 1YVT B; 4MQJ B; 1Y7Z A; 3D7O B; 4F6F A; 1RPS B; 1MOB A; 1A6K A; 1Y4Q A; 3QZZ A; 2EKT A; 3ONZ A; 3BJ2 A; 3PT8 A; 2ZSO A; 3WHM A; 3LB2 A; 4F68 A; 3HHB B; 1Y5K A; 1GLI B; 2O58 X; 2NSS A; 2MYE A; 2ZLV A; 1CG5 A; 1FN3 B; 1LTW A; 3BJ1 A; 2HZ2 A; 1UFP A; 1EBT A; 2BMM A; 1XQ5 B; 2HBG A; 2YRS A; 1HDS B; 1HDA A; 1MYZ A; 3LB1 A; 3UH5 A; 2OHA A; 1RTE A; 5SW7 A; 2O5M X; 2BKM A; 3PI8 A; 1DXU A; 1K1K A; 3IC0 A; 1YIE A; 3IC2 B; 5JDO C; 1C40 B; 2QSS B; 1DO4 A; 1ABS A; 3E5I A; 3G4Q A; 1MBI A; 2LH1 A; 1CLS B; 1O1M B; 3LR9 A; 4MPM A; 5CNC A; 4NXA A; 3UHQ A; 1Y4F A; 3A5A A; 3SDH A; 1KFR A; 2QSP A; 1MLK A; 1MGN A; 2G0Z A; 1SWM A; 1J7S A; 2ZFO B; 3BOM B; 1YGF A; 1VXG A; 2V1G A; 1H97 A; 5EUI A; 2BLH A; 1IRC A; 1A9W E; 2R1H A; 1K0Y A; 5HLX A; 1YVQ B; 1QI8 A; 2W6V B; 1BVC A; 3UHN A; 2ZSY A; 1OUU A; 2XKI A; 1NWI A; 3WI8 A; 1BAB B; 4FWY A; 3UHE A; 1Y8I B; 3UBC A; 1HBG A; 2G14 A; 1NAZ A; 3QM5 A; 1AJG A; 1LH2 A; 1SI4 A; 3PI9 B; 4L7Y B; 1GVH A; 2ZFO C; 2R4Z A; 3EOK A; 1SHR A; 1NEJ B; 1LFQ A; 1LJW B; 2OH9 A; 2FRF A; 4F6J A; 4G51 A; 1FSL A; 2ZT4 A; 2MGM A; 4XS0 B; 1LA6 B; 3WR1 B; 2MGE A; 1QSH A; 3PT7 A; 3UH6 A; 3A59 A; 3QJB B; 2ZLU A; 1MYM A; 1SDL A; 3UHD A; 2MGG A; 1B0B A; 2H8F B; 1YOG A; 3DUT A; 4ESA A; 1Y83 B; 1MNO A; 1MYH A; 1HAC B; 4F4O B; 1R1X A; 1MLN A; 2MHB A; 1Y4P B; 1EBC A; 2MGD A; 5B84 A; 1D8U A; 3PI2 A; 1CG8 B; 1ITH A; 1MLJ A; 6HBW B; 4H2L A; 3OO5 B; 5JGG B; 1SDK B; 3KMF A; 3ZJR A; 1O1K A; 1VRE A; 1Y0C A; 4NI0 A; 1VHB A; 3GQG A; 4M4B A; 4AVD A; 3MJP A; 1BZP A; 1G09 A; 4M4A B; 3GKV B; 2W6W A; 1Y46 B; 1S5Y A; 3E55 A; 1GBV B; 1Y45 B; 5EE4 D; 2DHB B; 1NIH A; 2EB8 A; 5D5R A; 1UVX A; 2HCO A; 1S5X B; 3HXN A; 3QM7 A; 2D5Z B; 1MOH A; 1HAB A; 106M A; 3GLN A; 4PQB A; 2NX0 A; 1MBD A; 3UHY A; 2V1I A; 1FHJ B; 5CN9 A; 1BVD A; 3EU1 B; 3M3A A; 1Y0A B; 1IBE A; 1LFT B; 1V4U A; 1HSY A; 1JF3 A; 3KUO A; 3HF4 A; 3UHB A; 1NQP B; 1LFV B; 3QJD A; 2D2M A; 4IT8 A; 2Z6N B; 1YHR B; 2D6C A; 3A5B A; 3S66 A; 3A0G B; 4PNJ A; 1O1P A; 3AT6 B; 5EYJ A; 1J3Z A; 4TWV A; 3WCV A; 2MYB A; 101M A; 1UX8 A; 3K3U A; 4NI1 A; 2FRK X; 3AQ6 A; 3SZK A; 1G9V A; 1V07 A; 1PBX A; 2ZLX A; 3G4Y A; 1Y4B B; 5CHR A; 1YMA A; 1MOA A; 2ZSR A; 1YCB A; 3MJU A; 2MYC A; 1DUO A; 4MBN A; 2HZ1 A; 3G52 A; 3ODQ B; 4ODC A; 1MBO A; 1XY0 B; 3GQR B; 1ECO A; 1F63 A; 1IWH B; 3G4V A; 5CN8 A; 2O5L X; 2R4W A; 1Y8K A; 1FSX B; 3G53 A; 1O1L B; 2D2M D; 1XZU A; 1XZ4 A; 1CIO A; 1Y8W B; 2G12 A; 3WCW B; 1M9P A; 3WCV D; 2FRI X; 1IDR A; 3A2G A; 1M6M A; 2LHB A; 1BZ1 B; 2ZLT A; 5E6E B; 4FWZ A; 1QPW B; 1A3O B; 1J3Y B; 4YU3 A; 1C7B B; 3DHT B; 1LH7 A; 3WTG B; 1X3K A; 4H07 A; 1A0U B; 4H0B A; 1HLM A; 3FH9 A; 2O5T X; 1MDN A; 5AB8 A; 2MB5 A; 4HHB B; 2QMB B; 3WCT B; 1Y7D A; 1BZR A; 2E2Y A; 3UH7 A; 2WY4 A; 4YU4 B; 3ZJJ A; 1YVT A; 4MQJ A; 1XXT B; 1YEO B; 3OZW A; 2HHE A; 3D7O A; 1RPS A; 1KR7 A; 1OFJ A; 3EDB A; 3IXF A; 1UX9 A; 1YH9 A; 1HBA A; 2WTH A; 3ZJP A; 5JOM A; 3HHB A; 4ZVB A; 1GLI A; 1DM1 A; 3BCQ B; 2EB9 A; 1I3D A; 3GOU B; 1YCA A; 1CQ2 A; 4L2M A; 1JL6 A; 1SPG B; 1XQ5 A; 3WCT C; 1MLF A; 2VYW A; 4MQI A; 1HBH B; 1UT0 A; 1WMU A; 2M6Z B; 4HRT A; 4G1V A; 2PGH A; 4VHB A; 3WFT A; 110M A; 1J7W B; 5HAV A; 3IC2 A; 2D60 B; 4O2G A; 1Y0T A; 4JYQ A; 3CY5 B; 3NFE A; 1O1M A; 3HYU B; 4DWT A; 4JAC A; 1GCV A; 1AJ9 A; 1QXE B; 1FDH G; 2HHB B; 1NS9 A; 2ZS1 A; 7HBI A; 1GZX B; 2AUR A; 5ILM A; 1VWT B; 103M A; 5EOH A; 2ZFO A; 3V2Z A; 2ZSP A; 3MBA A; 3BOM A; 1LFL A; 4XDI A; 3UHH A; 5HU6 B; 1YVQ A; 1CH1 A; 1A9W A; 5HY8 B; 5CNE A; 111M A; 4MXL A; 1RVW B; 1BIJ B; 1LFY B; 2SPL A; 1YZI B; 4UZV A; 3GDJ A; 2OLP A; 1XZ7 A; 2ZS1 D; 1LHS A; 1EMY A; 2OHB A; 2O5O X; 1OJ6 A; 4L7Y A; 1VXD A; 2ZFO D; 3R5I A; 2DC3 A; 3M38 A; 3UHW A; 1NEJ A; 3UHX A; 1LH5 A; 3ZJI A; 4ROL B; 2ZFB A; 1CMY B; 1LH6 A; 2GKN A; 1B86 B; 1HDB B; 5C6Y A; 5ILE A; 1LA6 A; 1OFK A; 1G08 B; 5CN5 A; 2GTL B; 3WR1 A; 1DO1 A; 1DXT B; 1JL7 A; 1HBR B; 2OIF A; 1ECD A; 1THB B; 1HJT A; 4F6B A; 5KER B; 3QJB A; 1FLP A; 1A00 B; 1Y01 B; 1C7C B; 1Y31 B; 4FH7 A; 2GNV A; 1Y83 A; 1HAC A; 2V1J A; 2Z6S A; 2DN2 A; 4F4O A; 1GCW B; 1Y4P A; 2R50 A; 1JP6 A; 2GTL C; 5JDO E; 1CG8 A; 5C6E B; 4FC3 B; 2ZT3 A; 1Y35 A; 3OO5 A; 1UIW B; 3B75 B; 5JGG A; 2W6X A; 1LUE A; 2HBE B; 4FH6 A; 3TM9 A; 2O5B X; 1RTX A; 2ZSZ A; 1Y5F B; 1J3F A; 4ZVA A; 4M4A A; 1N9F A; 3GKV A; 1XCH A; 1CH9 A; 1GBV A; 1SPE A; 1R1Y B; 1Y45 A; 3A9M A; 2DHB A; 2VYZ A; 3G4R A; 3RJ6 A; 3QJE A; 4O4Z A; 4C0N A; 3VHB A; 1OR6 A; 3LB3 A; 2ZS0 B; 4ROM A; 1MBA A; 1QXD B; 1UFJ A; 1HHO B; 3MKB B; 3PI1 A; 1FHJ A; 3QM8 A; 4F6D A; 1N9H A; 3EU1 A; 1HBB B; 5CNB A; 5KDQ B; 3VRG B; 3W4U B; 2RI4 A; 1XZ2 B; 1NQP A; 3BA2 A; 3FS4 B; 5EV5 A; 2GKM A; 5ILR A; 2Z6N A; 3A0G A; 3AT6 A; 1V9Q A; 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2QLS A; 2YRS B; 4DC7 A; 3CY5 A; 1JPB A; 1RQA A; 3PEL B; 3HYU A; 1S0H B; 3TM3 A; 4TWU A; 2G0X A; 1QXE A; 2HHB A; 1YDZ A; 1BZ0 B; 3ZJO A; 1GZX A; 1EWA A; 1DXU B; 3IC0 B; 1F5P A; 1VWT A; 1YIE B; 1MNK A; 2VLY A; 1GJN A; 2D5X A; 1DWT A; 4B4Y A; 1GDL A; 1AJH A; 4MXK A; 1HBI A; 5HU6 A; 1DWR A; 1HBS B; 5MBA A; 2QSP B; 3DHR B; 1Y8H B; 2LH2 A; 5HY8 A; 2HHD B; 1BIJ A; 1LFY A; 1Y7C A; 1UC3 A; 1YZI A; 1MYF A; 1NGK A; 5EYS A; 1YIH B; 1OR4 A; 1LFZ A; 4IRO A; 2OH8 A; 1MNJ A; 1FAW A; 1TU9 A; 4F6G A; 1Y0W A; 1JP9 A; 1Y22 A; 1MLH A; 3NG6 B; 2QFN A; 1A0Z B; 1OUU B; 3UGY A; 3ZOM A; 4ROL A; 1YEN B; 4KMW A; 1CMY A; 4PQ6 A; 4U8U B; 3S65 B; 1B86 A; 1HDB A; 1HGB B; 1G08 A; 5F0B A; 4LPI A; 1A01 B; 3AQ5 A; 2G10 A; 1C7D B; 4MQC A; 2AUP A; 2ZSN A; 2ZT2 A; 5HBI A; 3EDA A; 4N7O B; 3U3E A; 2ZLW B; 1A00 A; 3H57 A; 3AT5 A; 3D17 A; 4GZG A; 104M A; 1M6C A; 2MGL A; 1C7C A; 1MLM A; 1QSH B; 3PT7 B; 1NS6 A; 3VRE A; 3WCW C; 1Y5J A; 5E83 B; 3QM6 A; 1HRM A; 3A59 B; 1GCW A; 1Y2Z B; 4U8U C; 2ZSQ A; 2FAM A; 4PQC A; 3OZU A; 1N9I A; 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