4F9OA

Crystal structure of recombinant human hexokinase type i with 2-deoxy-glucose 6-phosphate
Total Genus 335
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
335
sequence length
899
structure length
899
Chain Sequence
b'DDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKGAALITAVGVRLRTE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Inhibitor Sites of Unequal Affinity Linked by Binding Synergism in Mutant Forms of Recombinant Human Hexokinase Type-I
rcsb
molecule keywords Hexokinase-1
source organism Homo sapiens
molecule tags Transferase
total genus 335
structure length 899
sequence length 899
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.7.1.1: Hexokinase.
pdb deposition date 2012-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00349 Hexokinase_1 Hexokinase
A PF03727 Hexokinase_2 Hexokinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA04
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 4f9oA02
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA01
3.40.367.20 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Hexokinase; domain 1 Hexokinase; domain 1 4f9oA03
2ITMA 1YVNA 3CIPA 4M7YA 1RFQA 2QWRA 3LM2A 2D4WA 3VPZA 3A5OC 2ZWHA 4JN4A 3ZX3A 3R9PA 3O1BA 3CI5A 1ESVA 1GLFO 4CBXA 3ZEUB 3MN9A 4FWQA 3CJCA 2E2QA 1E4GT 3LDOA 3H1VX 3FZHA 1Y64A 1QQNA 1XC3A 2CGJA 4H5WA 4AM7A 3GE1A 3WUHA 4CBUA 2A6AA 2QW9A 3KHYA 3MCPA 1XQSC 3WXJA 4EFHA 2NZTA 1MWKA 1NGJA 2V51B 4XH1A 2H3GX 3O5BA 4H0VB 2QWNA 5KPTA 4JD2A 4MO4A 4EHUA 4ISGA 2BTFA 3MN6A 1EQYA 4GY2B 2FSNA 4FWOA 3ZX2A 4WYBA 2J4RA 4JD2B 1K8KA 1Z6RA 5BRHA 3D2FA 4H5RA 2Q1NA 3A0IX 4J8FA 4FO0A 2QXLA 2QWOA 2A5XA 2FSKA 1ATRA 1K8KB 4K43A 3D2FB 1MA9B 1H1VA 4CZHA 5FPDA 5ADXH 4CZGA 1ZC6A 3M6GA 5AQTA 5LJVA 4FWNA 2A42A 2E2PA 4PKGA 3WXKA 4DCHA 3O08A 3VESA 3KZBA 4WQ5C 4B1WB 3RSEA 1QQOA 4H0PA 3HSCA 3QBXA 3WQUA 5AFUA 1SZ2A 3L0QA 1NGDA 2V7YA 3VENA 1P8ZA 3B8AX 1S3XA 1DKGD 3RSEB 3QB0A 3EL2A 3I8BA 4EHTA 2VYPA 5AQYA 5BRDA 4YDUA 4FWSA 1GLEG 3ULEA 4QS9A 2Q2RA 4HWIA 5FPEA 2FXUA 3EN9A 4JNEA 1C0FA 2E2OA 4CZLA 1C0GA 3ZX0A 4FOEA 3R6MA 4I6MA 4FWLA 2HF3A 1BU6O 3ULEB 2YHWA 5AZIA 4BRLA 3O4WA 4K41A 3WT0A 5F2RA 4CZJA 3EZWA 2D0PA 4BRNA 3HBTA 4I6MB 4WQ5A 1QZ6A 1HKGA 1D4XA 4BROA 1NWKA 3VF4A 3FZMA 1NLVA 5AZIB 1IJJA 1QQMA 4B1XB 1BA0A 3QDKA 1JCGA 3M3ZA 1R59O 4IZ9A 4BQLA 1SQKA 2VWBA 3DXKA 3EO3A 4A2AA 1JCFA 5JLHA 1BUPA 2CH6A 5EVZA 3VGMA 1YUWA 1DEJA 2A41A 2QWMA 3FZFA 2P9PA 3VF2A 4FPAA 2UYTA 3JS6A 4CJ7A 4DB3A 4L3QA 2HF4A 3U9DA 4BR9A 2GELA 5E84A 3VEWA 3H3OB 3DXKB 3ENOA 3H3NO 4Y0WA 2GUPA 2P9IA 2P9PB 3MDQA 1QZ5A 4KBOA 4BRAA 2FSJA 4Z94A 2IVOA 4BRFA 1V4SA 1ATSA 3A8YA 3D7EO 2P9IB 3QMLA 4WQ4C 5F1XA 2IVPA 3EKSA 3VGKA 4BRMA 5AQGA 1Q18A 4BRCA 1G99A 2WUSA 2YJFA 4NO7A 4BR7A 4CZFA 4FWRA 1KAZA 2FF3B 3G25A 4BQZA 3H1QA 3LL3A 4B1UB 5ELZA 2W41A 2V52B 3A5MC 3LM9A 3LDNA 5AQIA 5AQWA 2KHOA 4BRGA 3VEOA 4XH5A 2A40A 4PKIA 4BRDA 5AQPA 3SJHA 2V7ZA 1BOTO 5AQSA 1TUYA 4O5FA 4RWTA 1CZAN 4BG9A 1BO5O 4BR4A 3HTVA 3BF3A 4EAHD 3C0BA 3D2EA 4WQ4A 3UKRA 1WOQA 1BG3A 2GTDA 1HPMA 1NGGA 2Q31A 4IXCA 2A3ZA 4FOIA 3DXMA 3CHWA 3D2EB 5AQHA 3UKRB 5KPZA 3MN5A 5BN9A 3S41A 2QWPA 1BWFO 2IIRA 5AQVA 1RDWX 3H6EA 4H0XB 3DXMB 4IJAA 2YHXA 4MO5A 5F0XA 1KXPA 4BRKA 2E2NA 4A2BA 1NM1A 3FR0A 4H5NA 4IO8A 5TKYA 2YCHA 3AAQA 5BPNA 4BRHA 2ZF5O 2I7NA 2ASPA 2D0OA 3FLCO 3VERA 3H46O 4MLHA 3WXIA 3UB5A 5AZJA 3A5NC 3U8XA 4FPBA 4CZIA 4CZEA 5AQOA 4BGAA 3U4LA 4EIAA 1GLBG 3FFKB 2ASOA 3SK3A 3O80A 5LY3A 1ZBSA 1X3NA 3CJ7A 3VEYA 4QS7A 2NRHA 1T6CA 5AZJB 1E4FT 2D1KA 2ZGZA 4CZMA 1ATNA 3GDQA 2F9WA 1NBWA 1HKBA 2CGKA 5ADXA 2Q97A 3ZETA 3CJBA 3L6QA 3HM8A 3SMPA 4BGBA 2AA4A 4RTFD 5KQDA 5JLFA 5JMVA 5BPMA 4F9OA 3ZETB 3O6WA 1T6DA 4K25A 3TU5A 1YXQA 5AQFA 4CBWA 3UKUA 3VGLA 2AP1A 2CGLA 2PAVA 3U9ZA 1TUUA 3IDHA 4ISFA 5FPMA 5I9EB 1DGKN 3CQXA 2P9UA 4B1ZA 1HJOA 4C23A 4H5VA 3UKUB 1NGBA 4M7XA 2BUPA 3MN7A 1TYQA 4B1VA 2E8AA 4BR0A 5BPLA 3OHRA 3ID8A 3HZ6A 2P9UB 3BP8A 2NLXA 5KPRA 1HX1A 3I33A 3LDQA 2P9NA 4AM6A 3IMXA 4QS8A 1NGHA 1TYQB 3QICA 3ENHA 4H03B 5AQXA 5AQMA 5BRFA 3A5LC 2HMPA 2IVNA 4ISEA 3WEEA 1MDUB 3ATVA 3FZLA 4BVOA 2YJEA 2GWKA 2CH5A 4PL8A 2P9NB 4CZKA 3CERA 1NGAA 3HI0A 3CETA 3WEEB 1JCEA 2VCPA 1GLCG 2QWQA 3GL1A 1U2VA 5AQLA 2P9SA 2ASMA 1XUPO 3MK6A 3BUZB 3O8MA 1HUXA 1LOTB 4A61A 2QWLA 2Q0UA 3VETA 4XEIA 2E1YA 1U2VB 2P9SB 1OKJA 1HLUA 2FLOA 4BC5A 5LJWA 4K42A 1NMDA 4JAXA 3UE5A 1NGEA 3JXUA 5BR9A 3AY9A 2E1ZA 5AQZA 5AR0A 1GLAG 3AARA 3LDPA 1X3MA 1BDGA 3BEXA 4FWMA 4JHDA 5JICA 2OANA 4RCHA 3IUCA 4LC9B 2E88A 1KAYA 3CJAA 3O1WA 3WXLA 5B8HA 5AFUH 3DAWA 4A62A 4JHDB 4E1JA 1MWMA 3VEVA 3VF6A 4BG8A 1J6ZA 1IG8A 2F9TA 2QM1A 5AQRA 5EX5A 1LCUA 4BC2A 3TPQA 2P9LA 1NGCA 5FPNA 3J8AA 4YDUC 5E26A 3WQTA 5BREA 3GOIA 1WUAA 5KQ8A 3F9MA 4IJNA 5BN8A 4GNIA 2GEMA 4H0TB 2P9LB 3AAPA 2FF6A 2YHYA 1U6ZA 2DPNA 3CQYA 4H5TA 4IWVA 2GWJA 3H45C 4M63C 3SLCA 1Z05A 4CD3A 1ZXOA 4BRIA 3M1FA 1HKCA 3SMSA 3CJ1A 2Q36A 5AQQA 4O8KA 3FE1A 4BR2A 3KVGA 5AQJA 1V4TA 3VEXA 4CI6A 4DQ8A 1KAXA 1S22A 3DWLA 1X9JA 5EOYA 4CD1A 2EWSA 4PL7A 1YAGA 3P4IA 4B9QA 2E20A 4BC4A 5AQNA 1QHAA 2Q0RA 1GLDG 2P9KA 3W0LA 3DJCA 4H0OA 3ATUA 2I7PA 3W3DA 4PKHA 4FSVA 2ZGYA 3MMVA 2W40A 3IFRA 1NGIA 5AQKA 5EY4A 4XH4A 3BF1A 2P9KB 3VOVA 2HOEA 3GBTA 1GLJO 4NB4A 3GG4A 5EXWA 2YI1A 3QFUA 4BC3A 1GLLO 2PBDA 4BREA 4FWPA 1RGIA 3C7NA 3FZKA 3L4IA 4HTLA 4B1YB 4BR5A 4DHYA 4FWKA 3QBWA 4H0YB 3FGUA 1SAZA 3LDLA 3QFPA 3EKUA 5AQUA 4BRPA 1NGFA 5CE3A 3C7NB 4BRQA 3CJ9A 3VEZA 4MLEA 4BVPA 1BA1A 3ZEUA 4FL9A 3R8EA 1T44A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IV0A 1YVNA 3CIPA 1RFQA 3LDSA 1IKYA 1SL0A 4G1QA 2Z1JA 3ZSQA 3RWUA 3MN9A 4AHVA 5C25A 3LDOA 3ZSYA 1VAZA 1S72N 4GV3A 3K5LA 1BQMA 4MQ3A 3GE1A 2F4VK 1KC8O 3WUHA 1XQSC 3WXJA 1T8EA 3OS0A 2F8SA 4JI4K 1W9HA 1MWKA 1NGJA 3DLRA 2QWNA 3EE8A 4E0DA 3BZCA 4EHUA 3KKRA 4IFYA 4B08A 5KRSA 3PV8A 4X64K 5LMUK 1EQYA 3THYB 4GY2B 3ZX2A 4FWOA 4JI1K 1UWBA 4N5SA 1HR0K 4CF8A 2O8BB 1QHTA 3CC7N 5M1OA 5HP1A 4M3WA 4DS5A 3O9TA 3JYTA 1M1KO 4IDHA 4DQIA 1RTIA 3CD6N 4IFEA 1K8KB 2FC0A 4IFVA 3D2FB 4CZHA 4M3XA 1NK9A 1RBVA 1LV5A 5LJVA 2OTJN 2KTQA 2O8CA 2E2PA 2UUCK 3EE9A 4B1WB 4DTUA 3RSEA 1S1TA 4FJIA 3F2KA 3TR8A 3QBXA 3VQ4A 4E89A 3L0QA 1HJRA 1L5UA 1KVCA 1S3XA 1X1PA 3B8AX 4CIEA 1ZBIA 4OKKA 2UUAK 3Q7BA 3EL2A 3I8BA 4EHTA 1XI1A 1SL2A 4YDUA 4DTOA 3ULEA 4CJPA 2XY8A 3O9SA 5GINA 4HWIA 2FXUA 4JNEA 3QERA 2IGIA 3ZX0A 4FOEA 3R6MA 4JKFA 1JLEA 1YTAA 4FWLA 2HF3A 3V9WA 4PUOA 2NRZA 2E6MA 1FXXA 1DTTA 1S1WA 3O4WA 3K5NA 2HHWA 1GOBA 1NLVA 3S3MA 3VN5A 1JCGA 4WFBL 3CCVN 4IZ9A 2VWBA 5JVGL 3EO3A 4O4GA 3VGMA 2DFEA 1YUWA 1DEJA 2A41A 2P9PA 3VF2A 2XHBA 4DB3A 1A5VA 4DV7K 4R79A 4BR9A 2O8EB 3QNNA 3VEWA 3DXKB 3O9QA 2GUPA 2YKMA 2HNYA 1QSLA 1L3VA 1EO1A 3QETA 4Z94A 3RTVA 3MX2A 4BRFA 4KHNA 4F8RA 1U04A 3TSQA 1RDCA 3MAQA 4CGIA 3QMLA 4WQ4C 4CHNA 2RHKA 4BRMA 2Y1IA 5AQGA 5C0YA 4BRCA 1NJWA 3HJFA 1QVGM 3LL3A 4KPYA 1XHXA 1IBKK 1RBRA 3K5MA 4JRPA 3CCEN 2O8FB 3A5MC 1XWLA 1WBBA 3VQ5A 4BRGA 3CCQN 2HHSA 1TKDA 4OGCA 4DFMA 2ZM6K 3G6EN 2AJQA 3HP6A 2F8TA 1QQCA 2OZSA 3HRGA 3VQ7A 1BO5O 1J5EK 3DMJA 3KLHA 3C0BA 2PFUA 4X66K 3UKRA 1NJZA 1EWQA 4CJTA 4CJLA 4B3MK 3CHWA 1D8YA 1NKBA 3SI6A 1J54A 1BIZA 2YKNA 2Z1GA 3DXMB 4ID1A 5DK5A 1RILA 3V1OA 4MO5A 2QK9A 4A2BA 4B9MA 1NM1A 2Y1JA 3FR0A 3WNGA 4FJGA 3AAQA 3SAGA 3AVGA 3DLHA 4BRHA 5BR8K 3I55N 3S9HA 5AJ3K 2WOMA 5AZJA 1VQON 4KTQA 4NYFA 4DMNA 4FPBA 4CZEA 3RMAA 4KHPK 3R1XA 5AQOA 3U4LA 4LF6K 4ILHA 1GLBG 3KLEA 4FJLA 3OYGA 2ZGZA 4CZMA 5TKWA 3AVBA 2F9WA 3LAMA 2RN2A 1Q7YO 4LH5A 1S1VA 3SCXA 3CJBA 1SKSA 4ELVA 3OYMA 1NNEA 5C24A 1YJWN 3LP3A 3AVKA 5J1EA 4E7HA 2OTLN 3IKMA 5JMVA 1MU2A 3K57A 3QEVA 2RE2A 4DR1K 3N4PA 4K25A 3TU5A 1WBDA 5AQFA 4CBWA 3CG7A 1C1CA 4FJNA 2AP1A 4OPJA 3U9ZA 3ENBA 1RDDA 4PWDA 3QINA 5HRNA 3L2UA 4CGFA 3E66A 3LWLA 1VSFA 1HNVA 2BUPA 1JLBA 3ID8A 3K9JA 1U4BA 2JGUA 1HX1A 5CY4A 4PHTX 3LDQA 4JI6K 1NGHA 3QICA 3S3NA 5CYQA 4CJWA 5AQMA 5BRFA 3V6DA 1TAUA 3KK3A 4ISEA 1MDUB 3FZLA 3K5OA 4CGGA 2CH5A 3TTDA 4PL8A 4JKEA 2KQ2A 4WFAL 2JWLA 3CERA 3ZT4A 4CK2A 3V1QA 1JCEA 1OH6A 3GL1A 4OLAA 3TSPA 3N4QA 2WFBA 3PX4A 3BZKA 4A61A 2QWLA 3PLAA 4XEIA 3HOSA 3O3GA 4NCGA 1VQNN 4W5NA 3HVTA 1FKPA 2P51A 1NMDA 4Y1DA 2E1ZA 5AQZA 4JKDA 4HUGA 3SUNA 4IOCL 2OA8A 3ZSWA 3F73A 4YOXA 4C8LA 1JXEA 3LDPA 4C8MA 1BI4A 3BEXA 1BDGA 4JKAA 4JHDA 3D6RA 1RTJA 4RCHA 3MXMA 4LC9B 3CJAA 3D0PA 1HYSA 2B4JA 3K58A 1RTDA 4FJ8A 3SPYA 3MECA 3OS1A 3VEVA 3VF6A 2NNWA 4DTPA 2F9TA 3CF5L 4BC2A 1GOCA 5BREA 3GOIA 4UQGA 5J2QA 4GV9A 4EZ6A 2D5RA 5BN8A 4YHHK 4F2RA 4H0TB 1ASUA 3KJVA 3AAPA 3E9LA 1ITGA 3G0ZA 1TL3A 3I0RA 3CQYA 3OJUA 4Z4HA 1TKZA 1OVQA 3NE6A 4YOUA 2G8VA 1HRHA 3VQCA 4JKGA 3CCUN 1Y97A 3SMSA 3CJ1A 2OZMA 5E41A 5AQQA 2VGMA 4BR2A 3PUFA 3HM9A 4M3ZA 1RT7A 4DQ8A 4JKBA 1U45A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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